او در مشورت با برخى پزشكان به اين نتيجه رسيده كه بايد زانوى مصدومش را عمل كند، به همين دليل قصد دارد هرچه سريع تر اين كار را انجام دهد.  گفته مى شود خليلى در حين يا پس از پايان اردوى تيم ملى در اسپانيا به كشور آلمان سفر خواهد كرد و زير نظر متخصصان اين كشور تحت عمل جراحى قرار خواهد گرفت. از پزشكى كه نكونام را مورد عمل قرار داد به عنوان جراح خليلى ياد مى شود. اين مهاجم احتمالا ۲ ماه در آلمان خواهد بود و پس از آن براى پشت سر گذاشتن نقاهت به كشورمان باز خواهد گشت. معمولا كسى كه رباط پاره مى كند و تحت  عمل جراحى قرار مى گيرد حداقل ۶ ماه بايد دور از ميادين باشد. با اين حساب خليلى احتمالا تا اواخر سال جارى نمى تواند در ميادين فوتبال حاضر شود. اين مى تواند بدترين خبر براى پرسپوليسى ها باشد. آنهايى كه به گل هاى او عادت كرده اند،      بايد فعلا دور اين موضوع را خط بكشند و افشين قطبى كه علاقه خاصى به خليلى داشت بايد فكرى به حال خط حمله تيم اش كند. شايد در غياب خليلى، توره بتواند خلأ خط حمله پرسپوليس را پر كند اما به هرحال محسن خليلى مهاجمى با ويژگى هاى خاص و منحصر به فرد است، بازيكنى كه نزد  هواداران پرسپوليس به خاطر گلزنى به استقلال محبوب است و آنها لقب «محسن رفت و برگشت» را به او داده اند. محسن اما اين بار رفت تا ۶ ماه ديگر به ميادين فوتبال بازگردد.