24. aprillil 1938 valiti Konstantin Päts Eesti Vabariigi esimeseks presidendiks. Tegevusaasta algul oli Riigikantselei sekretariaat kohustatud täitma ka presidendi kantselei ülesandeid. Umbes poole aasta pärast -  19. septembrist 1938 -, muudeti presidendi kantselei eraldi asutuseks, misjärel Riigikantseleile jäid täita ülesanded, mis olid seotud peaministri ja valitsuse tegevusega.