Neli parlamentaarset komisjoni valmistavad ette plenaaristungi töö partnerluse kõige tähtsamates poliitikavaldkondades. Need komisjonid on poliitiliste küsimuste, julgeoleku ja inimõiguste komisjon, majandus-, rahandus-, sotsiaal- ja hariduskomisjon, elukvaliteedi  parandamise, kodanikuühiskondade ja kultuuride vaheliste vahetuste komisjon (kuhu kuulub 70 liiget), samuti 2008. aastal loodud uus komisjon, mis tegeleb naiste õigustega Euromedi piirkonnas (50 liiget).