Nielseni süsteem põhineb morfoloogilistel andmetel. Seoses molekulaarsete andmete (põhiliselt 18S rRNA geeni järjestused) laialdase kasutamisega fülogeneesi uurimisel, on väga populaarseks muutunud Lophotrochozoa-Ecdysozoa hüpotees (vastandudes Spiralia-Cycloneuralia hüpoteesile).