Keskarhiivi tegevuse esimesed viis aastat olid keerulised. Asuti võõra katuse all, kus iga muudatus tuli  kooskõlastada omaniku - Tartu Ülikooliga. See tekitas bürokraatlikke viivitusi arhiivi sisseseadmisel. Olukorra raskust aitab hinnata teadmine, et tulevane arhiivihoone oli ehitatud 150 üliõpilase ühiselamuks. Seega tuli kogu maja täielikult ümber kujundada.