Ülejäänud Eesti ala jagati ordu ja piiskoppide vahel. 1229. aastal loodi Saare-Lääne piiskopkond, mis hõlmas Lääne-Eesti saari ja Läänemaad, juba  varem oli olemas Tartu piiskopkond, mille all oli Kagu-Eesti (endine Ugandi maakond).