Salapärase manuskripti ajalugu on siiski pisut pikem. Juba 1666. aastast on pärit Praha ülikooli rektori Johannes Marcus Marci kiri Rooma õpetlasele Athanasius Kircherile. Kirja järgi saadab rektor manuskripti õpetlasele deifreerida. Kiri viitab, et manuskripti on ülikool ostnud 600  kuldtukati eest ning autoriks võib pidada 13. sajandil elanud Inglise filosoofi Roger Baconit, keda peetakse üheks esimeseks tänapäeva mõistes teadlaseks Euroopas.