Wilhelmshaveni piirkonda asustasid friisid. 1853. aastal ostis Preisimaa Oldenburgi suurhertsogilt 313 hektarit maad sõjasadama rajamiseks. 1869. aastal nimetati sadam kuningas Wilhelm I järgi Wilhelmshaveniks. 1873. aastal osteti 109 hektarit juurde ja samal aastal sai asula linnaõigused. 1918. aastal toimunud madruste ülestõusust sai alguse novembrirevolutsioon.