Probleemliigid on Eesti looduslikud liigid, kelle arvukus on erinevatel põhjustel suurenenud ja nad põhjustavad teistele looduslikele liikidele, inimese tervisele või varale kahju. Põhjusteks võivad olla nii inimese sekkumine ja tegevus kui ka looduslikud muutused ning  populatsioonidünaamika.