Assamblee otsustas liituda EECCSga (Euroopa Oikumeeniline Komisjon Kirik Ühiskonnas), mis sai teoks alates 1999. a 1. jaanuarist. Uue komisjoni ülesanne on  haarata kirikuid Euroopa integratsiooniprotsessi, teostada poliitiliste institutsioonide ja organisatsioonide monitooringut (nagu Euroopa Liit, Euroopa Nõukogu, Julgeoleku ja Koostöö Organisatsioon Euroopas, ÜRO jt), pidada regulaarseid kontakte nendega nii EKK kui selle liikmeskirikute ülesandel.