Steriliseerimise all mõeldakse meetodit, millega hävitatakse kõik eluvõimelised mikroorganismid (viirused, bakterid, seened ja nende eosed). Need vahendid, mis on kokkupuutes limaskestaga, kuigi ei läbista seda, peavad olema steriliseeritud (näiteks jäljendlusikas). Parim meetod (kiirem, vähem instrumente rikkuv) steriliseerimiseks on autoklaavimine. Steriliseerimise aeg autoklaavis sõltub temperatuurist, rõhust, steriliseeritavast materjalist ja autoklaavi tüübist (vt. tabel 1). Nii kulub pakendamata instrumentide jaoks 134° C ja 206 kPa (2,1 atm) juures steriliseerimiseks 7 minutit.