Lipuvärvide tähendus1881. aastal valisid üliõpilased enda tunnusvärvideks sinise, musta ja valge. See värvikombinatsioon  pidi väljendama eesti rahva iseloomu ja aateid ning peegeldama Eesti loodust. Värvide tähendust aga kirja ei pandud, kuid kaasaegsed on selgitanud värvide tähendust järgmiselt:Sinine väljendab helget tulevikku ja tähistab põhjamaist taevast. Must meenutab rahva minevikku ja tähistab mullapinda. Valge märgib rahva püüdlusi vaimuvalguse poole ning tähistab talvist valget lund ja suviseid valgeid öid.