Hügieenihüpoteesi toetavad uurimused, mis on näidanud, et enne ja pärast sündimist lemmikloomade, taluelu ning vanemate õdede-vendadega kokku puutunud lapsed kannatavad vähem allergiate käes. Kuna aga teadlased alles hakkavad mõistma kasulike bakterite rolli inimese soolestikus ning nende mõju immuunsüsteemi arengule, lisandub hügieenihüpoteesile uus vaatenurk. Võib olla mõjutavad keskkonnafaktorid vastsündinud lapsi  koloniseerivaid mikroobe, kes omakorda mõjutavad immuunsüsteemi väljakujunemist ja allergiariski.