1940. aastal  sulges Nõukogude võim kõik kohalikud kultuurharidusseltsid. Sidemed Grebenštšikovi nimelise kogudusega katkesid. Enamik kohalikke vene kultuuritegelasi represseeriti, nende seas oli palju kooliõpetajaid. 1944. a. hävis sõjategevuses palju elumaju Mustvees ja Raja külas. Põlesid maha Raja ja Kükita palvemajad, Tartu palvehoone, hävis raamatukogu.