3. Kladistilise analüüsi tulemusena saadakse reeglina mitte üks, vaid suur hulk erinevaid võimalikke fülogeneesi rekonstruktsioonipuid. Süsteemi aluseks valitakse neist sellised, mille koostamiseks on kulunud kõige vähem samme e. vajalikke tunnuste muutusi. Seda põhimõtet nimetatakse säästuprintsiibiks e. parsimooniaks.