Eestis kuuluvad looduskaitse alla 261 taimeliiki, neist 215 soontaime- ja 46 samblaliiki. Lisaks  neile kuuluvad looduskaitse alla veel 46 seeneliiki ja 51 samblikuliiki. Vastavalt leiukohtade arvule ja ohustatuse astmele jagunevad kaitstavad liigid kolme kaitsekategooriasse.