1944. a. septembris andis füürer Skorzenyle uue ülesande. Ungari riigiasetäitja Horthy oli nii lääneliitlaste kui ka venelastega kõnelusi alustanud ja valmistas ette oma riigi kapituleerumist. Skorzeny pidi selle ära hoidma. Ta koondas oma üksused Viini lähedale, korraldas nende varustamise uute materjalidega ja sõidukitega ja asus oma tsiviilriietes meestega Budapesti luurele. Viis  nädalat uuris ta kohalikke olusid. Selgus, et Horthy saadikuna oli tema poeg Niklas Jugoslaavia partisanijuhi Tito kaudu venelastega ühendust võtnud ja valmistas ette vaherahu. 15. oktoobril 1944 arreteeriti Niklas Horthy SS-meeste poolt ajal, millele oli plaanitud kohtumine Tito saadikuga. Mõni tund hiljem kuulutas ungari ringhääling, et Horthy olevat venelastega vaherahu sõlminud. Skorzeny andis seepeale välja käsu 16. oktoobri varajasel hommikutunnil hõivata Budapesti kindlus, kus Horthy ametikoht asus.  Kesköö paiku piiras osa üksustest kindluse ümber, ülejäänutest moodustas Skorzeny marsikolonni, kellega ta kindluse peale marssima pidi, jättes nii mulje, et tegu on kokkulepitud toiminguga. Plaan õnnestus; ungarlaste ülesseatud kahurid ei tulistanud ja ungari kindral kapituleerus. Järgmisel päeval vannutati ungari armee uue valitsuse, mis jätkas venelaste vastast võitlust saksa poolel, poolt sisse. Suur oht saksa üksustele oli seega tänu Skorzenyle ja ta meestele kõrvaldatud. Kui Skorzeny füürerile oma  missioonist Budapestis rääkis, ütles füürer talle: "Te saite sellega hästi hakkama, kulla Skorzeny. Ma edutasin teid 16. oktoobril 1944 SS-Obersturmbannführeriks ja andsin teile Saksa Risti kullas." Pärast seda seletas ta Skorzenyle ta järgnevat ülesannet.