Mitteorgaanilist hüpersomniat on võimalik eristada kindlate orgaaniliste faktorite (entsefaliit, meningiit, ajutrauma või muu neuroloogiline haigus, ainevahetushäired, toksilised seisundid, endokriinsüsteemi häired, kiiritusjärgne sündroom) põhjustatud hüpersomniast vastava faktori identifitseerimisega kliiniliste avalduste ja sobivate laboratoorsete uuringute põhjal.