TEMPUSe algaastail said individuaalstipendiume taotleda ka üliõpilased, see võimalus jätkus magistri- ja doktoriõppe üliõpilastel. Stipendiumide abil said end täiendada ka õppejõud ja administratsioonitöötajad. Kõige enam said Eestis stipendiume TÜ ja TTÜ õppejõud.