Mõne aja pärast hakkavad valgud lagunema ning seejärel hakatakse uusi valgumolekule tootma. Seega on nö bioloogilise kella valkude tase hallitustes ööpäeva jooksul erinev. Teoreetiliselt saab nende valkude hulga põhjal öelda, mis aega seene  sisemine kell näitab.