Nõukogu tööd juhatatakse kordamööda erinevate liikmesriikide poolt. Iga liikmesriik on järjestikku kuus kuud nõukogu eesistuja. Nii vastutab iga liikmesriik teatud perioodil nõukogu töökorralduse eest, olles ühtlasi otsuste tegemisel liikmesriikide vahel kompromisside leidjaks. Eestist saab eesistujamaa 2018. aastal.