Kagu-Eesti paikneb kontinentaalsema kliimaga Sise-Eesti kliimavaldkonnas. Läänemere otsest mõju seal praktiliselt enam tunda ei ole. Kliima kujuneb välja üldiste kliimategurite (geograafiline laius, Atlandi ookean, õhu läänevool) ja kohalike maastikuliste iseärasuste toimel.