Põhierinevus käibemaksu tagastamisel ühendusevälise riigi maksukohustuslasele ja teise liikmesriigi maksukohustuslasele on see, et ühendusevälise riigi puhul lähtutakse vastastikuse käibemaksu tagastamise printsiibist, s.t käibemaks tagastatakse ühendusevälise riigi maksukohustuslasele juhul, kui vastav riik tagastab käibemaksu  ka Eesti maksukohustuslasele.