SeqA on DNA replikatsiooni initsiatsiooni negatiivne regulaator, mis seondub oriC-le enne initsiatsiooni. oriC sisaldab GATC saite, mis on metüleeritavad. Initsiatsioon toimub ainult täielikult metüleeritud DNA-lt. Pärast replikatsiooni initsiatsiooni jääb oriC 1/3 rakutsükli vältel ainult ühest DNA ahelast metüleerituks. Võimalik, et GATC saite aitab hemimetüleerituna hoida SeqA. Nimelt on näidatud, et SeqA-defektsetes mutantides toimub GATC saitide metüleerimine oriC piirkonnas varem kui metsiktüüpi bakterites.