16. sajandi keskel toimunud Liivi sõja järgselt läksid endise Tartu piiskopkonna alad Poola alluvusse. Tollal nihkus ka selle põhjapiir, hõlmates enda alla Torma, Laiuse ja Kursi kihelkonna alasid. Tollal kinnistunud põhjapiir - Liivi sõja järgne Poola ja Rootsi alade piir - jäi Tartumaal kehtima kuni 20. sajandi alguseni. Alates 1620test aastatest olid Tartumaa alad Rootsi alluvuses. Alates 18. sajandi alguses toimunud Põhjasõjast kuulus Tartumaa koos ülejäänud eesti aladega aga Vene impeeriumisse.