Igapäevaste otsuste tegemine on juhatuse pädevuses. Juhatus koosneb kuuest liikmest  presidendist, asepresidendist ja neljast lihtliikmest, keda nimetab ametisse EL Nõukogu. Seni kuni kõik liikmesriigid ei ole eurot kasutusele võtnud on ametis ka üldnõukogu, kuhu kuuluvad ECB president ja asepresident ning ELi liikmesriikide keskpankade juhid. Üldnõukogu ülesanne on valmistada liikmeid ette euro kasutusele võtmiseks.