Meie olümpiakomitee esimese esimehe elutee lõpp oli traagiline nagu paljudel teistelgi EOK liikmetel. Pärast Eesti okupeerimist 1940. aasta suvel sattus dr.  F. Akel kohe uute võimumeeste põlu alla. Teati teda ju kui sirgjoonelise välispoliitika poolehoidjat. Sama aasta 17. oktoobril dr. Friedrich Akel arreteeriti. Pea aasta vältasid KGB ülekuulamised, mis lõppesid esimesel sõjasuvel. 3. juulil 1941 lasti EOK esimene esimees dr. Friedrich Akel Tallinnas maha.