Vastavalt Eesti arengukoostöö ja humanitaarabi arengukavale 2011-2015 on koostöö keskmes eelkõige prioriteetsed partnerriigid - Afganistan ja idapartnerluse riigid: Armeenia, Aserbaidžaan, Gruusia, Moldova, Ukraina ja Valgevene. Lisaks nimetatud riikidele jätkab Eesti koostööd ka teiste arenguriikidest projektipartneritega, kes tunnevad huvi mõne Eesti spetsiifilise kogemuse vastu, näiteks Valgevene, Palestiina, Armeenia ja Iraak.