Eksoribonukleaasid RNaas II ja PNPaas degradeerivad mRNA molekule 3' otsast kuni nende 5' otsa lähedale. Järelejäänud 10 - 20 nt pikkuseid oligonukleotiide degradeerib tsütoplasmaatiline RNaas I või tema periplasmas asuv vorm RNaas I*. Tsütoplasmaatiline vorm degradeerib lisaks oligonukleotiididele ka polümeerseid RNA molekule.