Koolituskeskuse tööd juhib juhataja koos Koolituskeskuse nõukoguga. Oma tegevuses on Koolituskeskus allutatud Kodukandi juhatusele ja on Kodukandi tegevjuhiga tihedas koostöös. Koolituskeskusel on Kodukandi võrgustikus ja Kodukandi meeskonnas lektorid, kellega tehakse koostööd, samuti kaasatakse vajadusel lektoreid väljastpoolt.