Penangkapan "Philadelphia" dan krunya juga memotivasi keputusan Presiden Jefferson untuk mengirim William Eaton, seorang mantan perwira Angkatan Darat, yang dikenal karena diplomasi yang berani dan menantang, ke Tripoli pada tahun 1805 untuk membebaskan 300 sandera Amerika dalam apa yang merupakan misi rahasia AS pertama untuk menggulingkan pemerintah asing. William Eaton mendirikan sekelompok sekitar 20 orang Kristen (delapan di antaranya adalah Marinir AS) dan mungkin 100 tentara bayaran Muslim untuk memulai pengambilalihan Tripoli dimulai dengan Derna. Dia berhasil melakukan perjalanan dengan detasemen kecil Marinir yang dipimpin oleh Presley O'Bannon dan pasukannya lebih dari 500 mil. Didukung di laut oleh Isaac Hull, Kapten dari, dalam "operasi gabungan" yang efektif, Eaton memimpin serangan dalam Pertempuran Derna
tanggal 27 April 1805. Penangkapan kota, yang diingati dalam "Marines' Hymn" baris terkenal "ke pantai Tripoli" dan ancaman kemajuan lebih lanjut di Tripoli, adalah pengaruh kuat terhadap perdamaian, dinegosiasikan pada bulan Juni 1805 oleh Tobias Lear dan Komodor John Rodgers dengan Pasha Tripoli.