Kemudian dalam perang, ia membawa pasukan ke India dan mengambil bagian dalam pendaratan di Madagaskar, Afrika Utara
, Italia dan Azores. Pada tahun 1945 ia digunakan sebagai kapal markas untuk Winston Churchill dan delegasi Inggris di Konferensi Yalta. Pada akhir perang di Eropa, "Franconia" melakukan beberapa perjalanan melintasi Atlantik membawa kembali pasukan AS dan pengungsi. Setelah Hari Kemenangan, ia dipekerjakan untuk memulangkan pasukan Inggris, termasuk Tahanan Perang yang dibebaskan, dari India. Selama pelayanannya di pemerintahan, ia telah menutupi dan membawa 189.239 personel militer.