Menuliskan kelanjutan untuk paragraf ini - Saat menjadi komandan Angkatan Darat, ia menyarankan untuk menyatukan kelompok-kelompok hak asasi manusia, Gereja Katolik dan Angkatan Darat untuk membentuk "panel rekonsiliasi" untuk mengetahui keberadaan "desaparecidos". Namun demikian, ia dikritik berat karena membela penindasan dan tindakan ilegal militer
dari pemerintah militer, karena diduga melindungi para perwira yang terlibat, dan untuk menunda proses rekonsiliasi yang telah dimulai oleh pendahulunya, Martín Balza. Brinzoni memikat kontroversi lebih lanjut ketika terungkap bahwa pengacaranya selama periode ini, Juan Enrique Torres Bande, adalah anggota Partai Kemenangan Baru neo-Nazi.