Perang Karonga kecil dalam hal jumlah pejuang dan korban dibandingkan dengan Perang Matabele Pertama atau Kedua di Rhodesia Selatan tetapi memiliki signifikansi besar bagi sejarah Malawi, terutama utara negara itu, karena memaksa perubahan dalam kebijakan pemerintah Inggris. Ini awalnya adalah untuk memastikan bahwa tidak ada kekuatan lain yang mengendalikan daerah barat dan selatan Danau Malawi, tetapi tanpa Inggris menganggap kedaulatan apa pun atas daerah itu. Itu berubah menjadi salah satu di mana Inggris merasa perlu untuk menyatakan protektorat. Seperti pemberontakan Abushiri yang hampir bersamaan
di Afrika Timur Jerman, perang itu mewakili akhir dari pengaruh politik pedagang Swahili yang mengakui otoritas Sultan Zanzibar di Afrika Timur dan Tengah, dan akhir dari upaya perusahaan Chartered untuk mengambil alih atau mempertahankan kendali di tempat pemerintah rumah mereka.