Hubungan antara pemerintah Paoli dan Inggris tidak pernah didefinisikan dengan jelas, namun, mengakibatkan banyak pertanyaan otoritas; khususnya, ketegangan muncul dari konflik antara kesetiaan Sir Gilbert kepada monarki Inggris, dan kecenderungan republikan Paoli dan keinginan untuk mempertahankan otonomi Korsika. Ada juga perpecahan yang jelas antara Corte, ibukota tradisional dan benteng pedalaman, dan Bastia di pantai, di mana Sir Gilbert memindahkan ibukota pada awal 1795, dan yang merupakan pusat bagi kaum royalis Prancis dan Korsika. Dengan Spanyol yang berada di sisi Prancis, Inggris menyadari posisi mereka di Mediterania tidak aman dan menarik pasukannya dari pulau itu pada Oktober. Mahkota mengundang Paoli untuk mundur dan kembali ke pengasingan dengan pensiun, yang tidak memiliki alternatif, ia dipaksa untuk bergabung dengan Inggris, dan pada Oktober 1796, Bastia pindah dari ibukota Prancis ke departemen Perancis.
Sir Gilbert