Mengapa tanaman seperti Arabidopsis thaliana mengekspresikan beberapa homolog dicer RNA yang khusus untuk bereaksi berbeda ketika tanaman terkena virus yang berbeda. Bahkan sebelum jalur RNAi dipahami sepenuhnya, diketahui bahwa penghentian gen yang diinduksi pada tanaman dapat menyebarkan tanaman dalam efek sistemik dan dapat ditransfer dari stok ke tanaman keturunan melalui grafting. Fenomena ini sejak itu telah diakui sebagai fitur dari sistem kekebalan tubuh tanaman adaptif dan memungkinkan seluruh tanaman untuk menanggapi virus setelah pertemuan awal. Dalam respon, banyak tumbuhan telah mengembangkan mekanisme yang rumit untuk menekan respon RNAi.
mencegah penyebaran diri dari transposon