Negosiasi perdamaian dengan Austria tidak berhasil pada musim semi 1799, dan Direktori memutuskan untuk meluncurkan serangan baru ke Jerman, tetapi kedatangan tentara Rusia di bawah Alexander Suvorov dan pasukan Austria baru di bawah Archduke Charles untuk sementara mengubah keseimbangan kekuatan. Pasukan Danube Jourdan menyeberangi Rhine pada tanggal 6 Maret tetapi dikalahkan oleh Archduke Charles, pertama di Pertempuran Ostrach
dan kemudian di Pertempuran Stockach pada tanggal 25 Maret 1799. Pasukan Jourdan menarik diri sementara Jourdan sendiri kembali ke Paris untuk memohon lebih banyak tentara.