Salah satu bidang minat Dyukov adalah sejarah penindasan Soviet, terutama di negara-negara Baltik dan Ukraina, dan baru-baru ini, ia telah menulis makalah kontroversial yang meremehkan pembantaian di Kurapaty di Belarus. Sementara Dyukov menggunakan arsip terbuka seperti dari Arsip Negara Federasi Rusia (GARF) dan Arsip Sejarah Kontemporer Negara Rusia (RGANI), ia juga mengutip arsip FSB, yang akses para peneliti terbatas. Arsip-arsip FSB inilah yang digunakan Dyukov, misalnya, untuk mengklaim dalam bukunya baru-baru ini, "The Genocide Myth", bahwa ingatan Estonia tentang penindasan Soviet termasuk deportasi dibesar-besarkan. Mengenai deportasi Juni 1941
, yang terjadi sebelum invasi Jerman pada 22 Juni 1941, Dyukov berpendapat bahwa orang-orang Estonia yang dideportasi sebagian besar adalah kolaborator Jerman atau terkait dengan mereka.