Tulis kelanjutan untuk paragraf ini - Segera setelah pendudukan, otoritas Soviet mulai Sovietisasi cepat Lithuania. Semua tanah dinasionalisasi. Untuk mendapatkan dukungan bagi rezim baru di kalangan petani yang lebih miskin, peternakan besar didistribusikan kepada pemilik tanah kecil. Namun, sebagai persiapan untuk kolektivisasi akhirnya, pajak pertanian meningkat secara dramatis dalam upaya untuk membuat semua petani bangkrut. Penasionalisasi bank, perusahaan-perusahaan besar, dan real estat mengakibatkan gangguan dalam produksi yang menyebabkan kekurangan besar-besaran barang. Litas Lithuania secara artifisial diremehkan dan ditarik pada musim semi 1941. Standar hidup menurun. Semua organisasi keagamaan, budaya, dan politik dilarang, hanya Partai Komunis Lithuania dan cabang kaum mudanya yang tersisa. Diperkirakan 12.000 "musuh rakyat" ditangkap. Selama deportasi Juni
kampanye 1941, sekitar 12.600 orang (kebanyakan mantan perwira militer, polisi, tokoh politik, kaum intelektual dan keluarga mereka) dideportasi ke Gulags di Siberia di bawah kebijakan penghapusan elit nasional. Banyak orang yang dideportasi tewas karena kondisi yang tidak manusiawi; 3.600 orang dipenjarakan dan lebih dari 1.000 orang dibunuh.