Allen lahir pada tanggal 21 Januari 1953, di Seattle, Washington, dari keluarga Kenneth Sam Allen dan Edna Faye (née Gardner) Allen. Allen bersekolah di Lakeside School, sebuah sekolah swasta di Seattle, di mana ia berteman dengan Bill Gates yang dua tahun lebih muda, dengan siapa ia berbagi antusiasme untuk komputer. Mereka menggunakan terminal Teletype Lakeside untuk mengembangkan keterampilan pemrograman mereka pada beberapa sistem komputer time-sharing. Mereka juga menggunakan laboratorium Departemen Ilmu Komputer Universitas Washington, melakukan penelitian pribadi dan pemrograman komputer; setidaknya satu kali pada tahun 1971 mereka dilarang dari laboratorium karena penyalahgunaan hak istimewa mereka di sana. Menurut Allen, pada masa remaja mereka, ia dan Bill Gates akan pergi ke tempat pembuangan sampah karena kode komputer.
Harvard