Pada tahun 1644, kota ini dirampas dan dijarah oleh pasukan Royalist setelah Pertempuran Aberdeen dan dua tahun kemudian diserang oleh pasukan Royalist di bawah komando Marquis of Huntly. Pada tahun 1647 wabah wabah bubon membunuh seperempat dari populasi. Pada abad ke-18, sebuah Balai Kota baru dibangun dan layanan sosial pertama muncul dengan Infirmary di Woolmanhill pada tahun 1742 dan Asylum Lunatic pada tahun 1779.
1644