Pada musim panas tahun 1944 di Cold Spring Harbor Laboratory, McClintock memulai studi sistematis tentang mekanisme pola warna mosaik benih jagung dan pewarisan tidak stabil dari mosaik ini. Dia mengidentifikasi dua loci genetik dominan dan berinteraksi baru yang dia namakan Dissociation (Ds) dan Activator (Ac). Dia menemukan bahwa Dissociation tidak hanya memisahkan atau menyebabkan kromosom pecah, tetapi juga memiliki berbagai efek pada gen tetangga ketika Activator juga hadir, yang termasuk membuat mutasi stabil tertentu tidak stabil. Pada awal 1948, dia membuat penemuan mengejutkan bahwa baik mutasi dan Activator bisa berdiri, atau posisi, pada kromosom. Dia mengamati efek transposisi Ac dan D dengan mengubah pola warna dalam mosaik benih jagung dan modulasi tidak stabil dari mosaik ini. Dia mengidentifikasi dua loci genetik yang dominan dan berinteraksi yang dia namakan Dissociation (Ds) dan Activator (Ac). Dia menemukan bahwa transposisi tidak hanya disebabkan oleh dissociation atau menyebabkan kromosom pecah, tetapi juga memiliki berbagai efek pada gen tetangga ketika Activator juga hadir, yang termasuk membuat mutasi stabil tertentu tidak stabil. Pada awal 1948, dia membuat penemuan mengejutkan bahwa baik mutasi dan Activator
Suppressor-mutator