Menulis kelanjutan untuk paragraf ini - Pada tahun 1798, Barron ditempatkan di komando dan mengambil bagian dalam Quasi-Perang dengan Perancis. Selama Perang Barbary Pertama
, ia memerintahkan dan dibebaskan Edward Preble dekat Tripoli. Sepanjang musim dingin 1804-1805, Barron terbaring dengan penyakit hati yang menyakitkan, akibat demam kuning. Bagi para perwira skuadron, kesehatan Barron adalah subyek kekhawatiran dan frustrasi yang terus-menerus...dan pada awal November 1804, ia pindah ke darat - namun ia menolak untuk menyerahkan komando dan tidak pernah berhenti berharap bahwa ia akan sembuh.<unk> Pada tahun 1805 ia menyerahkan komando skuadronnya kepada John Rodgers dan kembali ke Amerika Serikat karena kesehatan yang buruk. Dia kemudian ditugaskan sebagai komandan Gosport Shipyard di Virginia. Kesehatannya tidak pernah sepenuhnya pulih dan pada tanggal 29 Oktober 1810 Letnan Robert Henley, perwira eksekutifnya, melaporkan kepada Menteri Angkatan Laut "Saya memiliki tugas yang menyakitkan untuk memberi tahu Anda tentang kematian Komodor Samuel Barron. Dalam kesehatan yang baik, dia diserang saat makan malam kemarin di Hampton dengan serangan apoplektik dan meninggal sekitar jam 10 pagi ini. " Komodor Barron dimakamkan di Hampton Virginia pada usia 45.