Setelah Jacobites mencapai keberhasilan yang cukup besar pada tahap awal 1745 Pemberontakan, Royal Écossais dikirim ke Skotlandia pada bulan November; kapal yang membawa MacDonell dicegat dan ia bergabung dengan ayahnya John di Menara London. Saudaranya Aeneas mendirikan sebuah resimen klan dan berperang di Falkirk
Pada bulan Januari 1746 tapi secara tidak sengaja terbunuh setelah pertempuran.