Bayern memulai Bundesliga mereka pada 9 Agustus melawan Borussia Mönchengladbach dengan kemenangan 3-1 dan selesai pada 10 Mei dengan kemenangan 1-0 melawan VfB Stuttgart. Bayern mengalahkan Schwarz-Weiß Rehden 5<unk>0 di babak pertama DFB-Pokal. Bayern memasuki Liga Champions di babak penyisihan grup. Mereka mengalahkan CSKA Moskow dengan skor 3-0 dalam pertandingan pembuka kompetisi pada 17 September. Mereka pergi ke Piala Dunia Klub FIFA pada bulan Desember mengklaim gelar Juara Dunia Klub setelah menang melawan Guangzhou Evergrande dan Raja Casablanca. Bayern juga bermain di DFL-Supercup dan UEFA Super Cup
Aku tahu. Mereka kalah dari Borussia Dortmund di DFL-Supercup dan mengalahkan Chelsea dalam shoot<unk>out di UEFA Super Cup, membuat 2013 menjadi tahun paling sukses dalam sejarah klub dengan jumlah turnamen yang dimenangkan (lima).