Pada puncak karirnya, pada tahun 1982, Khan yang berusia tiga puluh tahun mengambil alih kapten tim kriket Pakistan dari Javed Miandad. Namun, sebagai kapten, Khan bermain 48 pertandingan Test, di mana 14 dimenangkan oleh Pakistan, 8 kalah dan 26 sisanya bermain imbang. Dia juga bermain 139 ODI, menang 77, kalah 57 dan berakhir satu di seri seri. Dalam pertandingan kedua tim, Khan memimpin mereka untuk kemenangan Test pertama mereka di tanah Inggris selama 28 tahun di Lord. Tahun pertama Khan sebagai kapten adalah puncak legasi sebagai bowler cepat serta all-rounder. Dia mencatat bowling Test terbaik dalam karirnya saat mengambil 8 58 wickets untuk lari melawan Sri Lanka di Lahore pada tahun 1981.
Khan memainkan 48 pertandingan Test, di mana 14 dimenangkan oleh Pakistan, 8 kalah dan 26 sisanya imbang