Ketika Letnan Gubernur Thomas W. Wallace meninggal pada tanggal 17 Juli 1943, Hanley kembali menjadi wakil gubernur. Pada pemilihan negara bagian New York tahun 1943, ia mengalahkan Demokrat William N. Haskell dalam pemilihan khusus untuk wakil gubernur. Ia terpilih kembali pada tahun 1946 dan tetap menjabat sampai akhir tahun 1950. Dia adalah delegasi pada Konvensi Nasional Republik 1944 dan 1948
s.