Dua tahun kemudian, pada tanggal 22 Januari 1862, William H. Paul mendaftar untuk dinas militer Perang Saudara di Philadelphia, Pennsylvania. Dia kemudian secara resmi bergabung di Camp McClellan di lingkungan Nicetown-Tioga Philadelphia pada hari yang sama sebagai seorang pribadi dengan Perusahaan E dari Infantri Pennsylvania ke-90. Catatan militer pada saat itu menggambarkan dia sebagai penduduk Philadelphia berusia 20 tahun yang tinggi 5 <unk> 3-1 / 2 <unk> dengan rambut coklat, mata hazel dan kulit terang. Pada akhir Maret, setelah pelatihan dasar, ia diangkut dengan resminya dengan kereta api ke Baltimore, Maryland, ditempatkan di Patterson Park Barracks, dan dilengkapi dengan musket bor halus yang diubah sebelum dipindahkan lagi, melalui Washington, D.C., ke Aquia Creek Landing, dan ditugaskan dengan resminya ke Brigade ke-2, Divisi ke-2 dari Korps 1 Angkatan Darat AS di bawah komando Jenderal Irvin McDowell. Berbaris ke berbagai situs untuk mendukung operasi Angkatan Darat Uni selama beberapa bulan berikutnya, Paul dan rekan-rekannya dari 90th Pennsylvania melihat aksi besar pertama mereka di Pertempuran Cedar Mountain, Virginia (9 Agustus 1862) selama pembukaan Kampanye Virginia Utara. Diperintahkan untuk menghancurkan jembatan kereta api di Stasiun Mitchell pada tanggal 15 Agustus, mereka selanjutnya menjaga bagian belakang Angkatan Darat Uni saat mundur melintasi Sungai Rappahannock, dan kemudian memberikan dukungan kepada baterai artileri Uni selama Pertempuran Pertama Stasiun Rappahannock (22 Agustus - 25 Agustus) sebelum melanjutkan operasi yang terkait dengan Pertempuran Thoroughfare Gap (28 Agustus). Setelah bertempur di Pertempuran Bull Run Kedua (28 Agustus 1830) dan Pertempuran Chantilly
(1 September), mereka ditugaskan kembali ke Kampanye Maryland di bawah Mayor Jenderal Joseph Hooker, dan kemudian bertempur lagi dalam Pertempuran South Mountain (14 September).