Ketika Jerman menginvasi Uni Soviet Kuznetsov, atas permintaannya sendiri, dikirim untuk bergabung dengan unit partisan Soviet di Ukraina yang diduduki Nazi. Pada tahun 1942, tahun yang sama ia menjadi anggota Partai Komunis, ia bertempur sebagai anggota kelompok gerilya "Victors", yang dipimpin oleh Dmitry Medvedev, di Ukraina tengah dan barat. Kuznetsov bertanggung jawab atas beberapa operasi kompleks yang melibatkan pembunuhan dan penculikan pejabat tinggi Nazi di wilayah Rivne dan Lviv, seperti operasi yang sukses terhadap hakim kepala Ukraina yang ditunjuk Jerman, wakil gubernur Galicia, penasihat Reichskommissar Ukraina, tiga jenderal Jerman dan lainnya. Kuznetsov juga agen intelijen pertama untuk mengungkap rencana Jerman untuk meluncurkan serangan tank besar-besaran
di wilayah Kursk, dan informasi tentang roket V-2 Jerman, serta tentang Operasi Long Jump, rencana Hitler untuk membunuh kepala Uni Soviet, Amerika Serikat dan Inggris Raya selama Konferensi Teheran. Kuznetsov beroperasi di Rivne (ibukota Reichskommissariat Ukraina) menggunakan identitas Jerman palsu "Oberleutnant Paul Siebert". Kuznetsovlah yang memperoleh informasi tentang lokasi markas "Werwolf" Hitler, dekat kota Vinnitsya.