Pada tanggal 13 Mei 2011, Toyota memperkenalkan Prius α di Jepang dengan target penjualan 3.000 unit per bulan. Prius Alpha tersedia dalam model lima kursi, dua baris dan model tujuh kursi, tiga baris, baris ketiga yang diaktifkan oleh baterai drive lithium-ion hemat ruang di konsol tengah. Model lima kursi menggunakan baterai NiMH. Pengiriman Alpha tertunda karena efek gempa dan tsunami 2011
pada produksi. Toyota mengumumkan telah menerima 25.000 pesanan untuk model wagon dan minivan hibrida Prius Alpha di Jepang sebelum dimulainya penjualan. Versi lima kursi dimulai pada (), dan tujuh kursi dimulai pada (). Sejak diperkenalkan, total 111.500 Prius α telah dijual di Jepang hingga April 2012, mewakili 80,8% dari penjualan global model Prius α / v. Sejak Mei 2011 total 289.000 Prius α telah terjual hingga Desember 2013. Pada tanggal 8 April 2013, Daihatsu mulai menjual versi OEM dari Prius α untuk pasar Jepang dengan nama Mebius. Penjualan di Jepang telah kuat meskipun tidak sesuai dengan peraturan dimensi pemerintah Jepang dalam kategori lebar, dan pembeli Jepang bertanggung jawab atas pajak tahunan tambahan.