Tuliskan kelanjutan untuk paragraf ini - Pada musim 2016, Shoji memulai musim ketika ia membantu Kashima Antlers menjaga dua clean sheet di dua pertandingan liga pertama musim ini. Sejak awal musim ini, Shoji terus mendapatkan kembali tempat di tim utama, bermain di posisi bek tengah. Pada 6 April 2016 ia mencetak gol pertamanya di musim ini, dalam kemenangan 3-1 melawan Nagoya Grampus di Piala J.League. Pada akhir tahap pertama J.League, kontribusi Shoji untuk tim utama membantu tim finis di puncak klasemen. Setelah menjalani suspensi satu pertandingan, ia kembali ke starting line-up, karena Kashima Antlers kalah 3-1 dari Gamba Osaka pada 2 Juli 2016. Shoji terus membantu tim tetap berada di puncak klasemen untuk sebelas pertandingan berikutnya. Pada 16 September 2016 ia mencetak gol kedua musim ini, dalam kemenangan 3-0 atas Júbilo Iwata. Pada beberapa titik sekitar bulan ini, dia menandatangani kontrak dengan klub. Setelah kualifikasi klub untuk menempati posisi ketiga di akhir tahap kedua J.League, Shoji kemudian membantu klub memenangkan liga setelah bermain kedua leg untuk mengalahkan Urawa Red Diamonds 2<unk>2 pada agregat melalui gol tandang. Shoji memainkan semua empat pertandingan di Piala Dunia Klub FIFA
, saat ia membantu Kashima Antlers mencapai final, hanya untuk kalah 4-2 melawan Real Madrid. Meskipun kalah di final, kemitraan bek tengah Shoji dan Naomichi Ueda dipuji oleh media, baik di dalam maupun di luar Jepang. Shoji juga membantu klub mencapai Final Piala Kaisar dengan mengalahkan Kawasaki Frontale 2<unk>1. Pada akhir musim 2016, ia membuat empat puluh lima penampilan dan mencetak dua kali di semua kompetisi. Untuk penampilannya di musim 2016, Shoji dinobatkan sebagai J.League Best XI.