Meskipun bukti diperoleh dari sisa-sisa manusia berusia 4.500 tahun. Menurut studi tahun 2018, genom virus yang diperoleh dengan sekuensing shotgun menjadi yang tertua yang pernah ditemukan dari sampel vertebrata. Juga ditemukan bahwa beberapa strain virus hepatitis kuno masih menginfeksi manusia, sementara yang lain punah. Ini menyangkal keyakinan bahwa hepatitis B berasal dari Dunia Baru dan menyebar ke Eropa sekitar abad ke-16. Studi lain tahun 2018 dari sisa-sisa seorang anak yang dimumifikasi yang ditemukan di Basilika San Domenico Maggiore di Naples menyimpulkan bahwa anak itu, yang telah hidup pada abad ke-16, memiliki bentuk HBV, dan bahwa virus itu terkait erat dengan varian modern. Catatan awal dari epidemi penting yang disebabkan oleh virus hepatitis B oleh David Baruchman pada tahun 1885. Menurut penelitian yang diterbitkan oleh National Health Institute (NIH) pada tahun 1947, sejumlah orang yang diduga menderita virus hepatitis B telah didiagnosis dengan virus hepatitis yang sama, tetapi tidak terinfeksi oleh virus tersebut, dan kemudian dinyatakan sebagai infeksi.
Tahun 1909