Pada tanggal 8 April 2009, empat bajak laut yang berbasis di FV Win Far 161 menyerang kapal. Keempat bajak laut tersebut berusia antara 17 dan 19 tahun, menurut Menteri Pertahanan AS Robert Gates. Anggota awak Maersk Alabama telah menerima pelatihan anti-cy dari sekolah pelatihan serikat pekerja, dan telah melakukan latihan di atas kapal sehari sebelumnya. Mereka termasuk penggunaan senjata ringan, anti-teror, keamanan, pertolongan pertama, dan kursus terkait keamanan lainnya. Ketika alarm bajak laut terdengar pada awal 8 April, Chief Engineer Mike Perry membawa 14 anggota awak ke dalam sebuah ruang pelatihan utama "yang mengamankan" para insinyur yang telah berada di rudal dasar kapal untuk tujuan tersebut. Sebagai tambahan, Kapten Perry dan anggota awak lainnya yang tersisa telah mengambil alih kontrol dari kapal. Kapten Perry dan anggota awak lainnya yang tidak dapat mengendalikan kapal untuk tujuan tersebut, kemudian menembak kapal. Kapten Perry dan anggota awak lainnya yang tersisa hanya beberapa menit setelah kapal itu mendekat, menyebabkan kapal tersebut terkunci. Kapten Perry dan anggota awak lainnya yang tersisa, Matt Fisher, mengatakan bahwa mereka telah mengambil alih kendali dari kapal.
Perry