Pada tahun 1944, Arafat mendaftar di Universitas Raja Fuad I dan lulus pada tahun 1950. Di universitas, ia terlibat Yahudi dalam diskusi dan membaca publikasi oleh Theodor Herzl dan Zionis terkemuka lainnya. Pada tahun 1946 ia adalah seorang nasionalis Arab dan mulai pengadaan senjata untuk diselundupkan ke bekas Mandat Inggris Palestina, untuk digunakan oleh orang-orang yang tidak teratur di Arab Komite Tinggi dan Militer Militer Perang Suci. Selama Perang Arab-Israel 1948, Arafat meninggalkan Universitas dan, bersama dengan Arab lainnya, berusaha untuk masuk ke Palestina untuk bergabung dengan pasukan Arab yang melawan pasukan Arab dan penciptaan negara Israel. Namun, alih-alih bergabung dengan jajaran Palestina, Arafat berjuang bersama Ikhwanul Muslimin, meskipun ia tidak bergabung dengan organisasi tersebut. Ia mengambil bagian dalam diskusi di Gaza pada tahun 1956.
Tahun 1949