Pada tanggal 10 April 2017, seorang juru bicara yang diduga untuk Pasukan Elite mengklaim bahwa kelompok itu bukan bagian dari SDF, akan bekerja sama dengan SDF dan Rojava Peshmerga untuk merebut Deir ez-Zor, dan menolak federalisme. Pada tanggal 15 April, pernyataan ini dibantah oleh Muhammad Khalid Shakir, juru bicara resmi Pasukan Elite. Dia membantah adanya perselisihan antara Pasukan Elit dan SDF dan mengatakan bahwa "Kami berada dalam kerangka koalisi internasional. Kepemimpinan koalisi mengelola operasi di lapangan. Pasukan kita tidak mundur. Kami telah menyelesaikan fase ketiga dari Operasi Wrath of Euphrates, dan kami akan berpartisipasi dalam semua tahap sampai Raqqa dan Deir ez-Zor dibebaskan. " Sementara Pertempuran Raqqa (2017)
Pada bulan Agustus 2014, setelah perang sipil masih berlangsung, Pasukan Elit secara resmi meninggalkan SDF, meskipun unsur-unsur kelompok terus bekerja sama dengan SDF.