Saluran ini menelusuri sejarahnya kembali ke perpanjangan Rampart Barat Kopenhagen setelah Serangan Kopenhagen
pada tahun 1659 yang telah terjadi di sana. Untuk lebih melindungi Slotsholmen, yang pada waktu itu merupakan rumah bagi istana kerajaan dan armada, Rampart Barat diperpanjang jauh ke laut. Daerah perairan dangkal antara benteng yang diperpanjang dan Slotsholmen diisi untuk membentuk sebuah distrik yang diberi nama Frederiksholm. Kanal Frederiksholms digali pada tahun 1681.