Pada 1 Februari 1944, "Fusō" berangkat Truk dengan "Nagato" untuk menghindari serangan udara Amerika, dan tiba di Palau pada 4 Februari. Mereka pergi pada tanggal 16 Februari untuk melarikan diri dari serangan udara lain. Kapal-kapal itu tiba pada tanggal 21 Februari di Pulau Lingga, dan "Fusō" dipekerjakan di sana sebagai kapal pelatihan. Seminggu kemudian, Kapten Masami Ban menggantikan Tsuruoka. Kapal ini diperbaiki di Singapura antara 13 dan 27 April, dan kembali ke Lingga. Dia dipindahkan ke Tawi-Tawi pada tanggal 11 Mei dan memberikan perlindungan bagi konvoi yang gagal untuk memperkuat Pulau Biak.
di akhir bulan. "Fusō" dipindahkan ke Pulau Tarakan di lepas pantai Borneo untuk mengisi bahan bakar pada awal Juli sebelum kembali ke Jepang dan melarikan diri dari serangan kapal selam. Pada awal Agustus di Kure, ia diperlengkapi dengan radar tambahan dan senjata AA ringan. "Fusō" dan kapal adiknya dipindahkan ke Divisi Kapal Perang 2 dari Armada ke-2 pada 10 September, dan "Fusō" menjadi kapal andalan divisi di bawah komando Wakil Laksamana Shōji Nishimura pada 23 September. Mereka berangkat dari Kure pada tanggal 23 September menuju Lingga, melarikan diri dari serangan kapal selam pada hari berikutnya, dan tiba pada tanggal 4 Oktober, di mana Nishimura memindahkan bendera ke "Yamashiro". Kapal-kapal itu kemudian dipindahkan ke Brunei untuk mengisi bahan bakar sebagai persiapan untuk Operasi "Shō-Gō", upaya untuk menghancurkan armada Amerika yang melakukan invasi Leyte.