Tulis kelanjutan untuk paragraf ini - conquistadores Spanyol yang dipimpin oleh Hernán Cortés menaklukkan ibukota Aztec Tenochtitlan
(di lokasi Kota Meksiko saat ini) pada tahun 1521, dan misionaris Fransiskan mengikuti tidak lama setelah itu pada tahun 1524. Sahagún tidak berada dalam kelompok pertama dari dua belas biarawan, yang tiba di Spanyol Baru pada tahun 1524. Sebuah catatan, dalam bahasa Spanyol dan Nahuatl, tentang perdebatan yang dilakukan para biarawan Fransiskan ini di Tenochtitlan segera setelah kedatangan mereka dibuat oleh Sahagún pada tahun 1564, untuk memberikan model bagi para misionaris di masa depan. Berkat reputasinya yang akademis dan religius, Sahagún direkrut pada tahun 1529 untuk bergabung dengan upaya misionaris di Spanyol Baru. Dia akan menghabiskan 61 tahun berikutnya di sana.