Setelah invasi Swedia ke Polandia pada tahun 1655 selama Perang Utara Kedua, Czerniecki memulai karir militernya di bawah komando Jan "Sobiepan" Zamoyski. Dia mengambil bagian dalam pertempuran Gołąb dan Warsawa
Pada tahun 1656. Setelah perang dengan Swedia, ia melanjutkan dinas militernya dengan berperang dalam pertempuran Chudnov melawan pasukan Moskow pada tahun 1660 dan dalam pertempuran Brayiliv melawan Tatar Krimea dan Cossacks (Perang Tatar Polandia-Cossack) pada tahun 1666.