Anson mengawasi Angkatan Laut untuk sebagian besar Perang Tujuh Tahun, dan mendirikan skuadron permanen di Devonport yang dapat berpatroli pendekatan barat ke Inggris dan Prancis. Ia sangat prihatin dengan prospek invasi Prancis ke Kepulauan Inggris yang menyebabkannya untuk menjaga kekuatan besar di Selat Inggris. Pada tahun 1756 ia dikritik karena tidak mengirim cukup kapal dengan Laksamana Byng untuk membebaskan Minorca
Karena dia ingin melindungi Inggris dari invasi yang mengancam, hanya untuk melihat Byng gagal menyelamatkan Minorca sementara tidak ada upaya invasi yang terwujud. Dia meninggalkan Admiralty ketika kementerian Newcastle jatuh pada bulan November 1756 dan kemudian menjabat lagi sebagai Lord Pertama ketika kementerian Pitt-Newcastle dibuat pada bulan Juni 1757.