Pada tanggal 26 Desember 2006, Jose Mourinho menyatakan bahwa kaptennya mungkin memerlukan operasi untuk memperbaiki masalah tersebut. Dalam ketidakhadiran Terry, Chelsea bermain imbang 2-2 di kandang melawan Reading dan Fulham pada Natal, hasil imbang yang akan terbukti sangat penting dalam nasib gelar Liga Premier untuk musim itu. Pada tanggal 28 Desember, Chelsea merilis sebuah pernyataan pers mengatakan Terry telah menjalani operasi punggung: "Operasi untuk menghapus disk intervertebral lumbar yang disekresikan berhasil". Meskipun ia diharapkan untuk kembali dalam pertandingan melawan Wigan Athletic, yang memenangkan 3-2 berkat gol terlambat dari pemain sayap Chelsea Arjen Arben, Terry sekali lagi absen, karena masalah punggung yang berulang.
£131.000 dan £135.000 per minggu