Lengkapi kalimat berikut: Lyons berada di Boston College hanya untuk waktu yang singkat, sebelum ditunjuk sebagai rektor Gonzaga College. Ia mengambil posisi pada tanggal 27 Desember 1908, menggantikan Joseph J. Himmel. Tak lama setelah ia menjabat,
Sebuah gempa bumi melanda Messina, Italia, dan sekolah menyelenggarakan misa requiem tinggi untuk para korban, yang dirayakan oleh Uskup Diomede Falconio dan dinyanyikan oleh Bonaventura Cerretti. Yang hadir adalah Uskup Denis J. O'Connell, Jaksa Agung Charles Joseph Bonaparte, duta besar Italia di Amerika Serikat, Joseph Himmel, dan para imam dari Ordo Dominikan, Fransiskan, dan Paulus. Sebuah perjamuan diadakan untuk menghormati presiden baru pada tanggal 10 Februari, yang dihadiri oleh anggota Kongres William Bourke Cockran. Masa jabatan Lyons berakhir pada tanggal 8 Juli 1909, ketika ia digantikan oleh Eugene DeL. McDonnell.