N'Doye memenangkan medali emas bersama Prancis di Kejuaraan FIBA Eropa U-16 2014 di Latvia, dengan rata-rata 5,8 poin, 3,4 rebound dan 2,3 assist per pertandingan. Dia memenangkan medali emas lain dengan Prancis di Kejuaraan Eropa FIBA U18 2016 di Samsun, Turki. N'Doye juga berkompetisi di Piala Dunia FIBA U-19 2017
di Kairo dan 2018 FIBA U20 Kejuaraan Eropa di Chemnitz, Jerman, tetapi timnya gagal meraih medali.