Menulis kelanjutan untuk paragraf ini - Dia mencetak kemenangan mencolok di 2006 IAAF Road Running World Championships
di Debrecen, Hongaria, menyelesaikan perlombaan 20 km dalam waktu 56:01 <unk> waktu yang kedua hanya untuk rekor dunia Haile Gebrselassie dan empat puluh detik lebih cepat dari peraih medali perak Robert Kipchumba. Ini adalah pertama kalinya seorang Eritrea memenangkan gelar dunia utama dalam olahraga. Karena Zersenay tidak memiliki finish sprint yang kuat (penting untuk sukses di lintasan), para komentator menyarankan bahwa pindah ke jarak maraton tampaknya merupakan kemajuan karir yang jelas, tetapi ia meremehkan gagasan itu, menyatakan bahwa ia tidak akan mengubah jarak dalam waktu dekat. Ia menutup musim dengan berlari di perlombaan jalan 10 km Malam Tahun Baru: San Silvestre Vallecana di Madrid. Zersenay dan Eliud Kipchoge dianugerahi waktu yang sama dari 26:54, tetapi Kipchoge diumumkan sebagai pemenang balapan. Meskipun ini lebih cepat dari rekor dunia Haile Gebrselassie yang berdurasi 27:02 pada saat itu, itu tidak dapat diratifikasi karena para pelari mendapat manfaat dari sirkuit perlombaan yang menuruni bukit.