Agron lahir di Savannah, Georgia, dan dibesarkan di San Antonio, Texas, dan San Francisco, California, putri dari Mary (née Barnes) dan Ronald S. Agron, seorang manajer umum hotel Hyatt. Karena karir ayahnya, Agron mengatakan dia dan keluarganya tinggal di hotel yang berbeda tumbuh. Dia memiliki saudara laki-laki yang lebih muda, Jason. Ayahnya lahir dari keluarga Yahudi, sementara ibunya berkonversi ke agama Yahudi. Agron bersekolah di sekolah Ibrani dan memiliki Bat Mitzvah.
Sekolah Ibrani