Banyak sejarawan mengaitkan beberapa kelemahan Konfederasi dengan kepemimpinan Davis yang buruk. Keprihatinan terhadap detail, keengganan untuk mendelegasikan tanggung jawab, kurangnya daya tarik populer, perselisihan dengan gubernur dan jenderal negara bagian yang kuat, favoritisme terhadap teman-teman lama, ketidakmampuan untuk bergaul dengan orang-orang yang tidak setuju dengannya, mengabaikan masalah-masalah sipil yang mendukung militer, dan perlawanan terhadap opini publik semuanya bekerja melawan dia. Sejarawan setuju bahwa dia adalah pemimpin perang yang jauh lebih kurang efektif daripada rekan Uni, Presiden Abraham Lincoln. Setelah Davis ditangkap pada tahun 1865, ia dituduh melakukan pengkhianatan dan dipenjara di Fort Monroe di Hampton, Virginia. Dia tidak pernah diadili dan dibebaskan setelah dua tahun. Meskipun tidak dipermalukan, Davis telah terlantar di mantan Konfederasi setelah perang oleh jenderal Robert E. Lee.
Tahun 1881