Setelah Amerika Serikat memasuki Perang Dunia II, Ballentine menjabat sebagai perwira kedua kapal induk pengiring USS "Long Island" dari 26 Desember 1941 hingga 18 April 1942. Dia dipromosikan menjadi kapten pada 30 Juni 1942. Ballentine menjabat sebagai kepala staf untuk Komandan Task Group 34.2 Laksamana Besar Ernest D. McWhorter di kapal selama invasi Sekutu ke Afrika Utara Prancis
pada bulan November 1942.