Pada tanggal 9 Mei 1967, ia terpilih sebagai Uskup Verapaz, menjabat pada tanggal 11 Agustus berikutnya. Dalam posisi ini, ia menekankan pekerjaan pastoral di antara masyarakat adat suku Maya. Selama perang saudara yang sedang berlangsung di negara itu
Pada tahun 1970-an, Gerardi adalah pendukung kuat untuk pengakuan resmi bahasa-bahasa pribumi Guatemala, untuk meningkatkan status masyarakat pribumi. Ia berperan penting dalam mendapatkan izin bagi dua stasiun radio untuk menyiarkan dalam bahasa Maya.