Tulis kelanjutan untuk paragraf ini - Pada tanggal 5 November 1981, Paus Yohanes Paulus II menunjuk Micallef sebagai Vikaris Apostolik ketiga Kuwait. Ia ditahbiskan oleh Paus sendiri pada hari raya Epiphany 1982. Pada tanggal 15 Januari tahun yang sama, ia secara resmi diangkat sebagai Vikaris Apostolik Kuwait dan Uskup Titular Tinis di Proconsulari. Micallef tetap berada di Kota Kuwait selama invasi Irak tahun 1990
, salah satu dari sedikit orang Barat untuk melakukannya.