Dengan rekan setimnya Neymar keluar karena sakit, Rafinha mulai di sebelah kiri serangan Barcelona di Piala Super UEFA 2015
melawan Sevilla di Tbilisi, mencetak gol ketiga dalam kemenangan 5 lawan 4. Pada tanggal 16 September ia menderita ligamen cruciate anterior kanan robek selama pertandingan tandang 1×1 melawan Roma untuk fase grup Liga Champions, meninggalkan pertandingan di atas brankas setelah berada di ujung penerima tantangan berat dari Radja Nainggolan; setelah operasi, ia diharapkan akan absen selama sekitar enam bulan.