Namun, masalah flutter kecepatan tinggi yang sangat parah hanya dapat diselesaikan dengan memasukkan penimbang uranium yang terkuras sebagai ballast di nacelles mesin luar pesawat 747 awal. Langkah ini menyebabkan kecemasan ketika pesawat-pesawat ini jatuh, misalnya El Al Flight 1862 di Amsterdam pada tahun 1992 dengan 282 kilogram (622 lb) uranium di tailplane (stabilisator horizontal). Program uji terbang ini terhambat oleh masalah dengan mesin JT9D 747. Kesulitan termasuk yang disebabkan oleh gerakan throttle mesin yang cepat dan distorsi casings turbin setelah periode singkat layanan. Masalah ini teratasi sebagian dengan mengurangi kekakuan beberapa komponen sayap. Namun, masalah yang lebih serius ini tidak pernah terjadi pada pesawat Boeing 747 pada tanggal 28 Desember 1969, ketika pesawat tersebut mengalami beberapa masalah saat uji coba pesawat terbang di Bandara Renton, Paris.
lima pesawat uji mengalami kerusakan serius selama upaya pendaratan