Pada 28 Oktober 1940 Metaxas menolak ultimatum Italia yang menuntut penempatan pasukan Italia di Yunani, dan Italia menyerang, memulai Perang Yunani-Italia. Meskipun Metaxas menolak ultimatum Italia yang menuntut penempatan pasukan Italia di Yunani, dan Italia menyerang, memulai Perang Yunani-Italia. Orang-orang Yunani melakukan pertahanan yang sukses dan akhirnya menduduki setengah selatan Albania (kemudian protektorat Italia), tetapi ketika Jerman menyerang dari Bulgaria pada 6 April 1941 orang-orang Yunani dan Pasukan Ekspedisi Inggris dikalahkan, dan Yunani daratan diduduki. Pada 23 April, Raja dan pemerintah meninggalkan daratan Yunani untuk Kreta, tetapi setelah serangan udara Jerman di pulau itu, ia dievakuasi ke Mesir. Namun, setelah ia pergi ke pengasingan, akhirnya Perdana Menteri Inggris, dan Italia menyerang, memulai Perang Yunani-Italia. Pada bulan November 1943, Raja Metaxas menulis dalam sebuah publikasi yang diterbitkan oleh Front Pembebasan Nasional Yunani, "Saya secara sengaja menolak keputusan pemerintahnya untuk kembali ke Yunani, dan secara tidak sengaja membuat perbedaan pendapat antara para politisi yang berada di luar negeri, baik yang mendukung Raja Mesir dan para pemimpin Front Pembebasan Nasional Yunani, dan yang secara tidak sengaja menolak kembali ke Mesir", kata Raja Metaxas dalam sebuah publikasi yang diterbitkan oleh
28 Oktober 1940