Setelah pemilihan November 2008, ia diminta untuk menjadi fotografer resmi Gedung Putih untuk kedua kalinya untuk Presiden terpilih Obama. Pada tanggal 14 Januari 2009, potret presiden baru dirilis; ini adalah pertama kalinya potret presiden resmi diambil dengan kamera digital. Seminggu kemudian Souza hadir pada pelantikan
dan keesokan harinya dia adalah satu-satunya fotografer yang hadir untuk sumpah kedua Obama pada hari kerja pertama Obama di Kantor Oval.