Faktor transkripsi adalah protein regulasi yang mengikat DNA, baik mempromosikan atau menghambat transkripsi gen. Dalam genom bakteri Escherichia coli, misalnya, ada serangkaian gen yang diperlukan untuk sintesis asam amino tryptophan. Namun, ketika tryptophan sudah tersedia untuk sel, gen ini untuk sintesis tryptophan tidak lagi diperlukan. Kehadiran tryptophan secara langsung mempengaruhi aktivitas molekul tryptophan untuk menekan tryptophan (repressor), mengubah umpan balik yang ada dalam struktur tryptophan, dan menciptakan banyak gen repressor yang mengikat.
Ribuan