Pada tanggal 21 Januari 2013, diumumkan bahwa Bautista sekali lagi akan menjadi atlet sampul edisi Kanada dari "". Bautista mencetak homerun ke-200 dalam karirnya dalam pertandingan melawan Boston Red Sox pada 29 Juni. Pada tanggal 6 Juli, ia terpilih untuk keempat berturut-turut All-Star Game
, dan yang ketiga sebagai pemain lapangan kanan awal untuk Liga Amerika. Pada saat seleksi, ia memukul.264 dengan 20 HR dan 52 RBI. Di All-Star Game, ia merekam RBI yang memenangkan pertandingan pada lemparan pengorbanan di babak keempat saat Liga Amerika menang 3-0.