Pari gbolohun ti o tẹle: Ni ọjọ 17 Oṣu Karun ọdun 2017, Werner ni a darukọ ni ẹgbẹ agbabọọlu Germany fun 2017 FIFA Confederations Cup ti o waye ni Russia. O farahan bi oluranlowo fun Sandro Wagner ni ere ṣiṣi ẹgbẹ ti idije naa lodi si Australia, ṣaaju ki o to gba awọn ibi-afẹde kariaye meji akọkọ rẹ nigbati o yan lati bẹrẹ ni idije ẹgbẹ ikẹhin ti Germany lodi si Cameroon ni Oṣu Karun ọjọ 25. Ní ọjọ́ mẹ́rin lẹ́yìn náà, Werner gba góòlù kẹta fún Germany nínú ìṣẹ́gun 4 sí 1 tí wọ́n fi ṣẹ́gun Mexico. Ní ọjọ́ kejì oṣù keje ọdún 2017, Werner ṣe ìrànlọ́wọ́ fún Lars Stindl láti gba góòlù tí ó jẹ́ kí wọ́n gba ìdíje náà.
2017 FIFA Confederations Cup Final lòdì sí Chile. Pẹlu awọn ibi-afẹde mẹta ati awọn iranlọwọ meji, Werner ni a fun ni Golden Boot ti idije naa.