Ṣẹ̀kún gbólóhùn yìí: Ní July 1999, wọ́n yan Jacoby gẹ́gẹ́ bí olùdarí fún ìwádìí (J2) nínú Ẹgbẹ́ Àwọn Òṣìṣẹ́ Àpapọ̀. Iṣẹ́ rẹ̀ bẹ̀rẹ̀ pẹ̀lú dídarí iṣẹ́ ìwádìí láti ṣàyẹ̀wò àwọn iṣẹ́ ní Balkans àti Kosovo. Awọn iṣẹ Northern ati Southern Watch tẹsiwaju lati mu awọn agbegbe ti ko si-Fly ati awọn ijẹniniya lodi si Iraq. Pẹlupẹlu, ọkọ ofurufu idanimọ US Navy EP-3 ni awọn ara ilu China mu ni erekusu Hainan lẹhin ijamba pẹlu jagunjagun ara ilu China lakoko awọn iṣẹ lori Okun South China ati ikọlu lori
USS "Cole" wáyé ní Aden, Yemen. Iṣẹlẹ ikẹhin yii mu iyipada ipilẹ ni ọna si itupalẹ ipanilaya ati atilẹyin si awọn agbara ṣiṣe eyiti o jẹ ẹya ninu Igbimọ Iṣẹ Iṣẹ Iṣiṣẹ Iṣọkan, Ijakadi Ipanilaya (JITF-CT) ti a dabaa ti n ṣiṣẹ labẹ itọsọna ti Igbimọ Iṣọkan J-2 gẹgẹbi apakan ti Ile-iṣẹ Iṣiro Iṣakoso. Jacoby ń jà fún owó tí ó pọ̀ sí i fún JITF-CT ní ọ̀sán ọjọ́ 10 oṣù Kẹsán ọdún 2001 pẹ̀lú àwọn òṣìṣẹ́ àgbà ní Ilé Ìgbìmọ̀ Alákòókò-Kíkún fún Ìwádìí. Ó wà nínú ilé ìṣọ́ Pentagon nígbà tí wọ́n gbéjà kò ó ní September 11, 2001. O dari iduro ti JITF-CT, o ṣiṣẹ ni igbimọ oye fun Ogun Agbaye lori Ipanilaya ati awọn iṣẹ ologun ni Afghanistan, ṣe abojuto awọn iṣẹ J-2 lakoko ipele akọkọ ti awọn iṣẹ ija ni Afghanistan ati pe o ṣe pataki ni idagbasoke ati igbega imọran iṣiṣẹ ti a pe ni "2 Plus 7" eyiti o di aaye aarin fun awọn iṣẹ AMẸRIKA lati fọ awọn agbari Al-Qaeda ati kọlu awọn iṣẹ oludari ati iṣeto iṣakoso rẹ. Ìsapá náà dá lórí àwọn ìṣẹ̀lẹ̀ lòdì sí àwọn olórí méjèèjì àti àwọn olórí méje tó ń gbèrò ìgbòkègbodò. Àbájáde rẹ̀ ni pé agbára ètò àjọ náà bẹ̀rẹ̀ sí í dín kù gan-an. Jacoby parí ìmúgbòòrò ọdún kan rẹ̀ gẹ́gẹ́ bí Òṣìṣẹ́ Àpapọ̀ J-2 ní July 2002.