Pari gbolohun ti o tẹle: Ọkan ninu ẹgbẹ kan ti awọn mẹta, ti a mọ ni "Thugut's Benjamins" (awọn oluranlọwọ ti o gbẹkẹle si Minisita Ajeji Johann Amadeus Francis de Paula, Baron of Thugut, lakoko ipolongo ti 1799, Weyrother ṣiṣẹ bi olori ti oṣiṣẹ si Feldzeugmeister Pál Kray, nibiti o ti ṣe iyatọ ara rẹ ni Legnago (Oṣu Kẹta Ọjọ 26), Magnano (Oṣu Kẹrin Ọjọ 5) ati, bayi n ṣiṣẹ bi oṣiṣẹ asopọ pẹlu Russian Field Marshal Alexander Suvorov, ni
Novi ní ọjọ́ kẹèdínlógún oṣù kẹjọ. Lẹ́yìn náà, ó ṣètò bí àwọn ọmọ ogun ilẹ̀ Rọ́ṣíà tí Alexander Suvorov ń darí ṣe máa rìnrìn àjò tó kàmàmà gba Ọ̀nà Àlàjá Saint Gotthard kọjá. Ti a gbega si "Oberst" (olori) ni ọjọ 5 Kínní 1800, a fun Weyrother ni aṣẹ ti Infanterie-regiment Nr. 7 "Schröder", eyiti o jẹ apakan ti ogun ni Germany labẹ Pál Kray, ṣugbọn ọgbẹ siwaju ati awọn okunfa ti ipolongo mu ki o fi ogun silẹ lati ṣe imularada. Nígbà tí Olú Ọba Francis Kejì pè é padà ní ìwọ́wé ọdún 1800, ó yàn án ṣe olórí àwọn òṣìṣẹ́ fún Archduke John ti Austria, ẹni ọdún méjìdínlógún, tó jẹ́ olórí àwọn ọmọ ogun tuntun ní Bavaria, àti "Adlatus" (olórí agbani-nímọ̀ràn) Franz von Lauer. Ní ìgbàgbọ́ pé àwọn ọmọ-ogun ilẹ̀ Faransé ti Jean Moreau ti fẹ̀yìn tì, Weyrother ṣètò ìlépa lílepa nípasẹ̀ àwọn igbó tí ó pọ̀ ní àgbègbè náà nípa àwọn ọ̀págun mẹ́rin tí wọn kò ṣe àtìlẹ́yìn ara wọn. Kàkà bẹ́ẹ̀, ńṣe ni Moreau dúró gbọn-in, ó bẹ̀rẹ̀ sí í gbéjà kò wọ́n, ó sì gba apá òsì àwọn ọmọ ogun Austria. Ìjà Hohenlinden tó wáyé nígbà náà wá di àjálù fún àwọn ará Austria, ó sì fòpin sí Ogun Àjọṣe Kejì. Bí ó tilẹ̀ rí bẹ́ẹ̀, wọ́n yan Weyrother gẹ́gẹ́ bí olùrànlọ́wọ́ ológun fún Minisita Àjèjì tuntun, Graf Ludwig Cobenzl nínú ìjíròrò lẹ́yìn Armistice of Steyr, èyí tó yọrí sí Àlàáfíà Luneville ní 1801.