Andika mwendelezo wa aya hii - Lima alipata umaarufu baada ya kuteuliwa kuwa mji mkuu wa Viceroyalty ya Peru na tovuti ya "Real Audiencia" katika 1543. Katika karne iliyofuata, ilifanikiwa kuwa kituo cha mtandao mkubwa wa biashara ambao uliunganisha Ufalme wa Makamu na sehemu nyingine za Amerika, Ulaya na Mashariki ya Mbali. Hata hivyo, jiji hilo halikuwa bila hatari; kuwapo kwa maharamia na watekaji-nyara katika Bahari ya Pasifiki kuliongoza kwenye ujenzi wa Kuta za Lima kati ya 1684 na 1687. Tetemeko la dunia la mwaka wa 1687 huko Peru
iliharibu majengo mengi ya mji; tetemeko hilo la ardhi liliashiria hatua muhimu katika historia ya mji huo, kwani iliambatana na mtikisiko wa biashara na ushindani wa kiuchumi unaokua na miji kama vile Buenos Aires.