Mwandishi wa habari Yosri Fouda wa kituo cha televisheni cha Kiarabu cha Al Jazeera aliripoti kwamba mnamo Aprili 2002 Khalid Sheikh Mohammed alikiri kuhusika kwake katika mashambulio hayo, pamoja na Ramzi bin al-Shibh. Ripoti ya Tume ya 9/11 iligundua kuwa uadui kuelekea Merika uliohisiwa na Mohammed, mbuni mkuu wa mashambulio ya 9/11 ulitokana na "kukosana kwake kwa vurugu na sera ya kigeni ya Merika inayopendelea Israeli". Mohammed pia alikuwa mshauri na mfadhili wa bomu la 1993 la World Trade Center na mjomba wa Ramzi Yousef, mshambuliaji mkuu katika shambulio hilo. Mohammed alikamatwa mnamo Machi 1, 2003, huko Rawalpindi, Pakistan, na maafisa wa usalama wa Pakistan wanaofanya kazi na CIA. Kisha aliwekwa kizuizini katika magereza kadhaa ya siri ya CIA na Guantanamo Bay ambapo alihojiwa na kutumia mbinu pamoja na maji.
mashambulizi ya Septemba 11, 2001