Andika mwendelezo wa aya hii - Mnamo Juni 26, 1861 Baxter alijiandikisha kwa ajili ya Vita vya wenyewe kwa wenyewe vya Marekani, akijiunga na 12th Massachusetts Volunteer Infantry kama daktari wa upasuaji wa jeshi. Alitumikia hadi Aprili, 1862, wakati aliteuliwa kuwa daktari wa upasuaji wa kikosi katika Jeshi la Potomac. Alishiriki katika Kampeni ya Peninsula, ikiwa ni pamoja na vita vya Yorktown, Hanover Court House, na Seven Pines
.. na