Katika Januari na Februari 1554, uasi wa Wyatt ulizuka; hivi karibuni ulikandamizwa. Elizabeth aliletwa mahakamani, na kuhojiwa kuhusu jukumu lake, na mnamo 18 Machi, alifungwa gerezani katika Mnara wa London. Elizabeth alipinga kwa bidii kutokuwa na hatia yake. Ingawa haiwezekani kwamba alikuwa amepanga njama na waasi, baadhi yao walijua kumkaribia. Rafiki wa karibu wa Mary, balozi wa Charles V, Simon Renard, alisema kwamba kiti chake cha enzi hakingekuwa salama wakati Elizabeth alikuwa hai; na Kansela, Stephen Gardiner, alifanya kazi ya kumshtaki Elizabeth. Wafuasi wa Elizabeth katika serikali, pamoja na Bwana Paget, walimshawishi Mary kuokoa dada yake kwa kukosekana kwa ushahidi mgumu dhidi yake. Badala yake, mnamo Mei 22, Elizabeth alihamishwa kutoka Woodstock Tower, ambapo alifungwa karibu mwaka mmoja chini ya malipo ya Sir Henry Bedingfield.
Mnara wa London