Andika mwendelezo wa aya hii - Mnamo Agosti 28, 1941, zaidi ya miezi miwili baada ya operesheni ya Barbarossa, uvamizi wa Ujerumani wa Umoja wa Kisovyeti ulianza, Pukhov aliamriwa kuchukua nafasi ya kamanda wa Idara ya 304 ya Bunduki ya Jeshi la 38; hii ilikuwa amri yake ya kwanza ya uwanja tangu jeshi la bunduki karibu miaka 15 mapema. Mwanzoni mwa Septemba ilihamishiwa eneo la Kozelshchyna, ambapo hadi Septemba 17 ilipata hasara kubwa katika mapigano makali ya kinga, ikirejea mashariki hadi eneo la Sanzhery, Reshetylivka, na Poltava. 304 kisha kupigana katika Donbass Defensive Operesheni wakati wa Oktoba, kisha aliondoka kwa hifadhi katika eneo la Snezhny Kut. Pukhov alishikilia nafasi hii hadi Januari 20, 1942, wakati alipewa amri ya Jeshi la 13, ambalo alichukua hadi katikati ya 1946. Hadi katikati ya 1942 jeshi, sehemu ya Bryansk Front, uliofanyika nafasi ya ulinzi juu ya mstari wa Skorodnoye na Kolpny. Jeshi hilo lilipigana katika Vita vya Voronezh
katikati ya 1942 na Voronezh-Kastornensk operesheni ya uvamizi katika mapema 1943. Mnamo Februari 14, kufuatia mwisho, Pukhov alipandishwa cheo kuwa Luteni Jenerali. Wakati wa vita vya Kursk mwezi Julai, jeshi, kushikilia nafasi juu ya uso wa kaskazini ya Kursk bulge, repulsed siku sita ya mashambulizi ya Ujerumani katika mapigano makali, kuzuia kuvunja Ujerumani na kupunguza mbele ya Ujerumani kwa 10 × 12 kilomita. Wakati vikosi vya Urusi ilibadilisha juu ya mashambulizi baada ya ushindi mkubwa wa jeshi la Ujerumani, 13 jeshi kupigana katika operesheni Kutuzov.