Hata hivyo, kuna wakati mwingine kutofautiana kati ya molekuli na uchunguzi wa morphological; hizi zinaweza kuainishwa katika aina mbili: (i) moja ya morphology, vizazi vingi (kwa mfano, mchanganyiko wa morphological, aina cryptic) na (ii) moja ya lineage, morphologies nyingi (kwa mfano, phenotypic plasticity, hatua nyingi za mzunguko wa maisha). Kwa sababu protists kwa ujumla ni mifumo ya paraphyletic, mara nyingi ni rahisi kuachana au kugawanyika ufalme, badala ya kutibu vikundi vya protist kama mistari tofauti ya euktic.
si monophyletic