Katika Septemba 1939, Uingereza aliingia katika Vita Kuu ya Pili ya Dunia. Bwana Hailsham alipendekeza kwamba wawili princesses lazima kuhamishwa kwa Canada ili kuepuka mara kwa mara mabomu ya angani. Hii ilikuwa kukataliwa na mama Elizabeth, ambaye alitangaza, "watoto si kwenda bila mimi. Mimi si kuondoka bila Mfalme. Na Mfalme kamwe kuondoka. "Princesses Elizabeth na Margaret alikaa katika Balmoral Castle, Scotland, mpaka Krismasi 1939, wakati wao wakiongozwa na Sandringham House, Norfolk.
Ngome ya Windsor