Baada ya kuondoka, Mahathir alipewa jina la "Tun" na kuahidi kuondoka siasa "kikamilifu", kukataa jukumu la emeritus katika baraza la mawaziri la Abdullah Abdullah. Abdullah mara moja alifanya alama yake kama waziri mkuu wa kimya na chini ya mpinzani. Kwa sifa za kidini kali zaidi kuliko Mahathir, aliweza kupiga nyuma ongezeko la PAS katika uchaguzi wa 1999, na kuongoza Barisan Nasional katika uchaguzi wa 2004 kwa ushindi wake mkubwa kabisa, kuchukua viti 219 vya bunge. Mahathir alikuwa Mkurugenzi Mtendaji na Mwenyekiti, na kwa hivyo mshauri mwandamizi, kwa kampuni nyingi za bendera za Malaysia kama vile Protonship, Protonship Malaysia na Kampuni ya gesi inayomilikiwa na serikali na uhuru wa Mahathir Petron. Mahathir alikuwa ameahidi kuacha siasa "kikamilifu", kukataa jukumu la emeritus katika baraza la mawaziri la Abdullah Abdullah. Abdullah mara moja aliweka alama yake kama waziri mkuu wa kimya na chini ya mpinzani.
Tun