Pavlyuchenko alifanya kwanza kwa klabu, kuja kama mbadala, katika kupoteza 1-0 dhidi ya Moscow tarehe 5 Aprili 1999. tarehe 15 Mei 1999, Pavlyuchenko alitoa msaada mara mbili katika ushindi wa 2-1 dhidi ya Chita. Katika msimu wake wa kwanza, Pavlyuchenko alifanya maonyesho 31 na kufunga mabao 11. Hata hivyo, klabu bado ilichezwa kwa Divisheni ya Pili baada ya klabu kuwa nafasi ya mwisho. Licha ya hili, Pavlyuchenko aliitwa 'Timu ya kazi ya juu' kwa gazeti la kwanza la vijana la Gazeti la Sport Express. Swali: Pavlyuchenko alianza wapi soka yake?
Dynamo Stavropol