Andika mwendelezo wa aya hii - Mnamo Agosti 1985, baada ya kucheza zaidi ya michezo 150 kwa Lincoln, Thompson alihamia Charlton Athletic. Katika mchezo wake wa mwisho kwa Lincoln alikuwa kushuhudia ndoto mbaya wakati 56 watazamaji waliuawa katika moto kutisha kusimama
wakati wa kucheza Bradford City. Akawa nahodha wa Charlton na kuwaongoza kwa kukuza kwa Daraja la Kwanza na fainali ya Kombe la Simod.