Kamilisha sentensi ifuatayo: Kuzuka kwa Vita vya wenyewe kwa wenyewe, Capehart aliacha mazoezi yake ya matibabu katika Bridgeport na kujitolea kwa Jeshi la Muungano. Aliteuliwa kuwa daktari wa upasuaji wa Regiment ya 1 West Virginia Cavalry mnamo Septemba 18, 1861. Katika nusu ya pili ya 1863, alishiriki katika vita vya Gettysburg, Bristoe Station, na
Msafara wa Mine. Kwa mapendekezo ya Jenerali Judson Kilpatrick na wengine, Capehart alifanywa mkuu na kufanikiwa Nathaniel P. Richmond, ambaye alijiuzulu kwa sababu ya masuala ya afya, kama kamanda wa jeshi la Februari 22, 1864.