Kuandika mwendelezo kwa aya hii - juu ya kujisalimisha katika York Town katika Oktoba 1781, Johnson akarudi nyumbani na kubaki ajira mpaka amani. Baadaye aliamuru jeshi la 17 huko Nova Scotia na Newfoundland. Mwanzoni mwa vita na Ufaransa
aliteuliwa kuwa Inspekta Mkuu wa kuajiri wa taasisi ya Kiingereza huko Ireland, na alichukua nafasi hiyo hadi 1798. Wakati wa uasi katika mwaka huo alikuwa detached na watu elfu tatu kwa kuchukua New Ross, na kushindwa waasi wakati wao kushambuliwa mahali tarehe 5 Juni 1798. Ilikuwa pigano gumu zaidi wakati wa uasi. Bwana Cornwallis alikuwa na maoni ya kutojali ya Johnson, na aliandika juu yake kama "mtu mwenye kichwa kibaya".