Kwa mfano, spishi ya kipekee ya Nanoarchaeum equitans, ambayo iligunduliwa mnamo 2003, imepewa phylum yake mwenyewe, Nanoarchaeota. Mifumo ya sasa ya uainishaji imekusudiwa kupanga archaea katika vikundi vya viumbe ambavyo vinashiriki sifa za kimuundo na mababu wa kawaida. Uainishaji huu unategemea sana utumiaji wa mlolongo wa jeni za ribosomal RNA kufunua uhusiano kati ya viumbe (phylogenetics ya molekuli). Aina nyingi za utamaduni na zilizochunguzwa vizuri za archaea ni wanachama wa phyla mbili kuu, Euryarchaeota na Crenarchaeota. Vikundi vingine vimeundwa kwa muda mfupi. Kwa mfano, spishi ya kipekee ya Nanoarchaeum equitans, ambayo iligunduliwa mnamo 2003, imepewa phylum yake mwenyewe, Nanoarchaeota. A phylum mpya ya Korarchaeota pia imependekezwa.
Euryarchaeota na Crenarchaeota