Andika maelezo zaidi kuhusu fungu hili - Mnamo Januari 14, 2012, Flanagan alishinda mbio za masafa marefu za majaribio ya Olimpiki ya Marekani huko Houston, akisimamisha rekodi ya mbio hizo kwa muda wa saa 2:25:38. Aliendelea kuwakilisha Timu ya Marekani katika mbio za Olimpiki za wanawake za marathon huko London, akimaliza nafasi ya 10 kwa muda wa 2:25:51. Yeye alishinda uwanja wa darasa la juu katika Lisbon Half Marathon mnamo Machi, akirekodi wakati wa 1:08:52. Alikuja wa 25 katika 2012 IAAF World Half Marathon Championships
.. na