Andika mwendelezo wa aya hii - Real Madrid ilianza msimu wa 2012/13 kwa kushinda Supercopa de España, ikishinda Barcelona kwa mabao ya nje. Hata hivyo, Kombe la Super likawa tu tuzo lao la msimu, licha ya kuwa karibu kushinda zote. Real ilimaliza mbio za pili kwa Barça katika La Liga, kukusanya alama 85, na ilifikia nusu fainali ya Ligi ya Mabingwa ya UEFA kwa mwaka wa tatu mfululizo, ambapo waliondolewa na Borussia Dortmund 3 kwa 4 kwa jumla. Madrid pia iliingia Copa del Rey
katika raundi ya 32, wakiendelea na mbio ya kukumbukwa hadi fainali, ambayo iliwaona wakishinda Barcelona katika nusu fainali kabla ya kupoteza kwa Atlético Madrid 1<unk>2 a.e.t. Uhamisho mkubwa wa msimu ulikuwa kusaini Luka Modrić kutoka Tottenham Hotspur kwa ada katika eneo la pauni milioni 33. Baada ya kushindwa na Atlético Madrid katika fainali ya Copa del Rey, Pérez alitangaza kuondoka kwa José Mourinho mwishoni mwa msimu kwa "makubaliano ya pande zote".