Andika mwendelezo wa fungu hili - Waddell aliendelea na utumishi wake wa kijeshi na Huduma ya Matibabu ya India. Alikuwa nchini China wakati wa Boxer Uasi (1898<unk>1901), ikiwa ni pamoja na Relief ya Peking
Mnamo Agosti 1900, alitajwa katika ujumbe, alipokea medali ya Vita ya China (1900) na kifungo, na mnamo 1901 aliteuliwa kuwa Mwenzake wa Amri ya Dola la India (CIE). Kufikia mwishoni mwa 1901 alikuwa amehamia Mkoa wa Frontier ya Kaskazini-Magharibi na alikuwapo wakati wa kizuizi cha Mahsud-Waziri, 1901<unk>1902. Alikuwa katika Malakand katika 1902 na walishiriki katika Tibet Mission kwa Lhasa 1903 <unk> 04, ambayo alikuwa tena zilizotajwa katika despatches, kupokea medali na clasp na aliteuliwa Companion wa Amri ya Bath (CB). Waddell kisha akarudi Uingereza, ambapo kwa muda mfupi akawa Profesa wa Tibet katika Chuo Kikuu cha London (1906-1908).