Kamilisha sentensi ifuatayo: Lithuania ilipopelekwa na Muungano wa Sovieti mnamo Juni 1940, Aukštuolis pamoja na wakuu wengine walimsalimu Vladimir Dekanozov, naibu wa Vyacheslav Molotov, kwenye Uwanja wa Ndege wa Kaunas. Alikaa Lithuania ingawa mkewe alikimbilia Argentina na alitumia mawasiliano yake ya kidiplomasia kumsaidia Martynas Yčas kutoroka kwenda Berlin. Baada ya ushindi wa Urusi, Aukštuolis alipoteza kazi yake katika wizara lakini kwa pendekezo kutoka kwa Justas Paleckis (walifanya kazi pamoja katika ubalozi wa Kilithuania huko Riga) alipata kazi ya kufundisha lugha ya Kirusi katika Shule ya Sekondari namba 1 huko Panevėžys. Alikuwa mmoja wa Walithuania 17,500 waliohamishwa kwenda Siberia wakati wa
Mhamisho wa Juni 1941. Pamoja na watu wengine kadhaa maarufu wa Kilithuania, pamoja na rais wa zamani Aleksandras Stulginskis na waziri Stasys Šilingas, Aukštuolis aliishia Kraslag katika Krasnoyarsk Krai. Mnamo 1942, yeye na watu wengine 16 wa Lithuania walikamatwa tena na kushtakiwa kwa shughuli za kupinga Sovieti. NKVD ilipendekeza hukumu ya kifo, lakini hukumu ya mwisho ya miaka 25 gerezani ilitangazwa tu mnamo Februari 1952 - karibu miaka mitatu baada ya kifo cha Aukštuolis kutokana na kifua kikuu na utapiamlo huko Dubravlag.