Andika mwendelezo wa aya hii - Jokubaitis alicheza kwa Lithuania katika 2016 FIBA U16 Ulaya katika Poland. Alipata wastani wa alama 10 na kuisaidia timu yake kushinda medali ya fedha. Jokubaitis alikuwa mchezaji mchanga zaidi katika Kombe la Dunia la FIBA Under-19 la 2017 nchini Misri, akiwa na wastani wa pointi 10 na usaidizi wa 5.3 kwa mchezo kwa timu ya sita. Katika 2018 FIBA U18 michuano ya Ulaya katika Latvia, yeye wastani 12.9 pointi na 5.6 rebounds kwa mchezo kama timu yake kumaliza tano. Jokubaitis aliongoza Lithuania hadi nafasi ya nne kwenye Kombe la Dunia la FIBA Under-19 la 2019
katika Ugiriki, ambapo alikuwa na wastani wa pointi 11.3 na misaada 5.6 kwa mchezo.