Baada ya Adolf Hitler alikuja madarakani, kuanzisha Reich ya Tatu, Deutsche Bank kufukuzwa wake wajumbe watatu wa bodi ya Wayahudi mwaka 1933. Katika miaka iliyofuata, Deutsche Bank walishiriki katika arianization ya biashara ya Kiyahudi inayomilikiwa; kwa mujibu wa wanahistoria wake mwenyewe, benki ilikuwa kushiriki katika 363 kama misamaha na Novemba 1938. Wakati wa vita, Deutsche Bank kuingizwa benki nyingine kwamba akaanguka katika mikono ya Ujerumani wakati wa uvamizi wa Ulaya ya Mashariki. Deutsche Bank zinazotolewa benki vifaa kwa Gestapo na kukopeshwa fedha kutumika kujenga kambi Auschwitz na karibu IG Farben vifaa. Wakati wa Vita Kuu ya II, Deutsche Bank akawa wajibu wa kusimamia Bohemian Union Bank katika Prague, na matawi katika Protectorate na katika Slovakia, Benki ya Credinverein katika Yugoslavia (ambayo sasa imegawanywa katika makampuni mawili ya fedha, moja katika Serbia na moja katika Amsterdam Croatia), Benki ya Barry de Bucharest katika Bucharest, Benki ya Kitaifa ya Bergarten katika Bulgaria, Benki ya Kijerumani ya Kiuchumi katika Urusi, Benki ya Kiuchumi katika Ugiriki, Ben
Reich ya Tatu