Kamilisha sentensi ifuatayo: Siku tano tu baadaye, na kuzuka kwa Vita vya Boer, Knox alipewa amri ya 13 Infantry Brigade juu ya uhamasishaji wa mgawanyiko wa 6 chini ya Jenerali Kelly-Kenny, ambayo iliunda sehemu ya Afrika Kusini Field Force. Kufuatia Msaada wa Kimberley, alishiriki katika
Vita ya Paardeberg Februari 1900, na alijeruhiwa vibaya na risasi katika kifua. Mnamo Machi 1902, aliteuliwa kuwa kamanda wa kambi ya Bloemfontein katika koloni la Mto Orange. Kufuatia mwisho wa vita mwezi Juni mwaka huo, Knox alirudi Uingereza katika "SS Dunottar Castle", ambayo iliwasili Southampton mwezi Julai 1902. Kwa huduma zake wakati wa vita, alikuwa mara tatu zilizotajwa katika Despatches, tuzo Malkia wa Afrika Kusini Medal na Mfalme wa Afrika Kusini Medal, kukuzwa substantive mkuu mkuu (tarehe 4 Desemba 1899), na knighted kama Knight Commander wa Order ya Bath (KCB) katika Aprili 1901 Afrika Kusini Honours orodha (amri ilikuwa tarehe 29 Novemba 1900, na yeye alikuwa tu imewekeza kama vile baada ya kurudi nyumbani, na Mfalme Edward VII katika Buckingham Palace tarehe 24 Oktoba 1902).