Andika mwendelezo wa aya hii - Katika 1940, kama matokeo ya Molotov-Ribbentrop Mkataba, Romania ililazimika kutoa
sehemu ya eneo lake kwa Urusi, ikiwa ni pamoja na Chișinău, ambapo Moldova SSR iliundwa. Mamlaka mpya zilifunga taasisi ya Kotsovsky. Taasisi ilifunguliwa tena wakati, baada ya kuzuka kwa Vita vya Kidunia vya pili, Chișinău ilichukuliwa na vikosi vya Mhimili. Kotsovsky aliendelea na kazi yake ya kisayansi wakati wa Vita vya Pili vya Ulimwengu. Wakati huo, kazi yake ilichapishwa hasa katika majarida ya kisayansi ya Ujerumani na Austria.