اكتب استمرار لهذه الفقرة - خلال الاحتلال الالماني النازي للبولندا
في الحرب العالمية الثانية، جذبت أبحاث وايجل انتباه النازيين. لما احتلوا لفيف، طلبوا منه ان ينشئ مصنع لإنتاج لقاح التيفوس في معهدته. وظف وايجل عدد من الاصدقاء اليهود والكليات في مصنع الانتاج. حوالي ألف شخص عملوا هناك. وايجل وظف وحميت المثقفين البولنديين واليهود وأعضاء السرية البولندية. كثير من هؤلاء الناس الذين استأجرهم ساعدوه في أبحاث التيفوس والتجارب مع القمل. كثير من اصدقائه اليهود ساعدوا في الاساس في تغذية القمل وفي المقابل، حصلوا على الطعام والحماية وجرعات من اللقاح عندما تم تطويرها بالكامل. تطعيماته تم تهريبها إلى الأحياء اليهودية في لفيف ووارسو ومختلف معسكرات الاعتقال وحتى بعض سجون الجستابو. اتوقع ان وايجل استطاع انقاذ حوالي 5000 حياة خلال حكم النازيين. مؤسسته اغلق بعد ذلك من قبل الاتحاد السوفييتي بعد هجومهم ضد الالمان عام 1944.