اكتب استمرار لهذه الفقرة - في حملة 1796
جوبرت اصبح جزء من القيادة العامة لنابليون بونابرت. قاد لواء تحت قيادة بيير أوجرو في معركة ميلسيمو وتحت قيادة أندريه ماسينا في معركة لودي. قاتل ايضا في معركة كاستيليون في أغسطس. سرعان ما لفت انتباه نابليون بونابرت، الذي جعله جنرالا في ديسمبر 1796، واختاره مرارا لقيادة فصائل مهمة. ولهذا قاد قوة الاحتفاظ في وادي نهر أديج في معركة ريفولي. في حملة ربيع 1797 (غزو النمسا) قاد الجناح الأيسر من جيش بونابرت في تيرول مع تمييز كبير، وقاتل في طريقه عبر الجبال للانضمام إلى زعيمه في ستايريا. تدخل الجنرال جوبير ضد شركات الطيارين في تايرول، مع رسالة غاضبة في 15 فبراير 1797، لسحق مقاومتهم: "أعلن أنني أعتبر أعداء الفرنسيين، كل الآباء، الذين يتم تسجيل أطفالهم في شركات الطيارين في تايرول، سيتم سجنهم وممتلكاتهم مصادرة لصالح الجمهورية".