صعود السلالة إلى السلطة بدأ في عام 1510 عندما تم إعلان محمد القائم زعيم قبائل وادي سوس في مقاومتهم ضد البرتغاليين الذين احتلوا أغادير والمدن الساحلية الأخرى. ابن القيم، أحمد العراج، سيطر على مراكش بحلول عام 1525، وبعد فترة من التنافس، استولى شقيقه محمد الشيخ على أغادير من البرتغاليين وأخيراً استولى على فاس من الوطاسيد، مما أتاح له السيطرة على كل المغرب تقريبًا. بعد اغتيال محمد الشيخ من قبل العثمانيين في عام 1557، تمتع ابنه عبد الله الغالب بحكم سلمي نسبيًا. خليفه، ومع ذلك، حاربوا مع بعضهم البعض، وبلغت ذروتها في 1578 معركة كسار الكبير
(أو "معركة الملوك الثلاثة") ، حيث تمت هزيمة تدخل عسكري برتغالي نيابة عن محمد الثاني المتوقل من قبل القوات السعودية. في أعقاب هذا النصر، أصبح أحمد المنصور سلطانًا ورأس ذروة القوة السعودية. في النصف الأخير من حكمه، شن غزوًا ناجحًا لإمبراطورية سونغهاي، مما أدى إلى إنشاء باشاليك مركزًا على تمبكتو. بعد وفاة المنصور في عام 1603، خاض أبنائه صراعاً داخلياً طويلاً على الخلافة الذي انقسم البلاد وأضعف من قوة السلالة وسمعتها. في حين تم توحيد المملكة السعودية في نهاية الصراع في عام 1627، ارتفعت فصائل جديدة في المنطقة لتحدي السلطة السعودية. السلطان السعودي الأخير، أحمد العباس، اغتيل في عام 1659، مما وضع نهاية للسلالة. مولاي الرشيد غزا مراكش في 1668 وقاد سلالة العلويين للسلطة على المغرب.