في أوائل يونيو، "ياماتو" و "موساشي" تم طلبها مرة أخرى لنقل القوات، وهذه المرة لتعزيز الحامية والدفاعات البحرية لجزيرة بيك كجزء من
عملية كون. المهمة ألغيت عندما وصلت كلمة إلى مقر أوزاوا من هجمات الناقلة الأمريكية على جزر ماريانا. بدلًا من ذلك، أعادت البحرية الإمبراطورية اليابانية تنظيمها، وركزت على غالبية قوتها القتالية المتبقية على أمل تحقيق نجاح حاسم ضد الأمريكيين. لكن في هذا الوقت، البحرية اليابانية بأكملها كانت أقل من عدد وتجربة أسطول المحيط الهادئ الأمريكي. في الفترة من 19 إلى 23 يونيو 1944، رافقت ياماتو قوات أسطول أوزاوا المتنقل خلال معركة بحر الفلبين، والتي أطلق عليها الطيارون الأمريكيون اسم "The Great Marianas Turkey Shoot". خسر اليابانيون ثلاث حاملات طائرات و426 طائرة؛ المساهمة الكبيرة الوحيدة لـ "ياماتو" كانت إطلاق النار عن طريق الخطأ على الطائرات اليابانية العائدة.