بالرغم من ان المياه موجودة في اعماق الغلاف الجوي، إلا ان تركيزها المقيس بشكل مباشر منخفض جداً. وفرة النيتروجين والكبريت والغازات النبيلة في الغلاف الجوي للمشتري تتجاوز القيم الشمسية بعامل ثلاثة تقريباً. غلاف جوي للمشتري يفتقر إلى حدود أدنى واضحة ويتحول تدريجياً إلى داخل الكوكب السائل. من أدنى إلى أعلى طبقات الغلاف الجوي هي الغلاف الاستوائي، والطبقات الطرفية، والطبقات الحرارية. كل طبقة لها تدرجات درجات حرارية غير مميزة. على الرغم من ان طبقة الغلاف الجوي لها نظام معقد من الغيوم الاستوائية، والغلافات الكهربائية، والغلافات البيضاء، والغلافات الحمراء، والغلافات البيضاء، والغلافات الحمراء، والغلافات البيضاء، والغلافات البيضاء، والغلاف الجوي تظهر أيضًا تدرجية. ما ي
الحدود السفلية واضحة والانتقال التدريجي للداخل السائل للكوكب.