بعد ثلاث سنوات في عام 1159، وضع يوشيتومو وفوجيوارا نو نوبويوري جو شيراكاوا تحت الإقامة الجبرية وقتلوا خادمه، الباحث فوجيوارا نو ميشينوري، في ما يسمى تمرد هيجي. في النهاية، تايرا نو كيوموري، بدعم جو شيراكاوا، هزم يوشيتومو. أثناء الهروب من كيوتو، أُجبر يوشيتومو على قتل ابنه توموناغا. في وقت لاحق، تم خيانة يوشيتومو وقتله في حمامه. ثلاثة من أبنائه، يوريتومو، مينيتسيو يوشونيو مينيموتو نو نوريووري، تم إعدامهم في وقت لاحق ونفيدهم من قبل كيوموري. ومع ذلك، تم إعدام يوشيتومو ونوبويوري. قبرة في مقاطعة أيتشي محاطة من جميع الجوانب بسيوف خشبية (بوكوتو) ، كما تقف كلماته الأخيرة "لو كان لدي فقط أسطورة بوكوتو...
سيوف خشبية