في عام 2004، كان هناك ثلاثة جراحين فقط يخدمون جنوب السودان، مع ثلاثة مستشفيات مناسبة، وفي بعض المناطق كان هناك طبيب واحد فقط لكل 500،000 شخص. وباء فيروس نقص المناعة البشرية / الإيدز في جنوب السودان موثق بشكل رديء ولكن انتشار المرض يعتقد أنه حوالي 3.1%. وفقًا لدراسة أجريت في عام 2013، جنوب السودان "ربما يكون أعلى عبء الملاريا في أفريقيا جنوب الصحراء". جنوب السودان هو واحد من البلدان القليلة التي لا تزال تحدث فيها المرض. في وقت اتفاقية السلام الشاملة في جنوب السودان في عام 2005، كانت احتياجات التمويل الإنساني في جنوب السودان هائلة. ومع ذلك، فإن الاحتياجات الإنسانية في جنوب السودان في ظل قيادة الأمم المتحدة للاطفاء هي الأعلى في العالم عند 2,053.9 لكل 100،000 ولادة حية. في كانون الثاني/ديسمبر 2007، زادت تدريجيًا أعداد القتلى من 100،000 في السودان الجنوبي، على الرغم من أن التدخلات الإنسانية
جنوب السودان