لي كانت في علاقة مع المغني الرئيسي شون مورغان من فرقة سيثر من عام 2003 إلى عام 2005. بعد انفصالهم بسبب إدمانه على المواد، كتبت لي "اتصل بي عندما تكون عاقلاً" عنه؛ تم إصدار الأغنية كأول أغنية من The Open Door. كشفت لي خلال البث الحي لموسيقى MuchMusic في 9 يناير 2007، حلقة من Live at Much أنها خُطبت في الليلة السابقة. أكدت في وقت لاحق على EvThreads.com أن جوش هارتزلر، المعالج وصديق طويل الأمد، عرض عليها الزواج. أشارت في مقابلة أن أغاني "Good Enough" و "Bring Me to Life" كانت مستوحاة منه. تزوج الزوجان في 6 مايو 2007، وذهبوا في شهر العسل بالقرب من جزر البهاما. أعلنت لي عن طريق وسائل التواصل الاجتماعي في 18 يناير 2014 أنها حامل. ولد أول طفل للزوجين، جاك هارتزلر، في 24 يوليو 2014.
قرب جزر البهاما