أكمل الجملة التالية: في 16 يناير 2013، أعلن أن غوارديولا سيشغل منصب مدرب نادي البوندسليغا بايرن ميونخ بعد موسم 2012-13، ليحل محل جوب هاينكيس للموسم التالي. خطاب في أول مؤتمر صحفي كمدرب بايرن، في 24 يونيو 2013، باللغة الألمانية، وكان له أول جلسة تدريبية بعد يومين. أول مباراة رسمية له كانت في كأس السوبر الألماني ضد بوروسيا دورتموند، حيث خسر بايرن 4-2. أول كأس له مع بايرن كان
2013 كأس السوبر، هزم خصمه القديم خوسيه مورينيو، الذي عاد لتوه لتدريب تشيلسي. بايرن هزمت تشيلسي بعشرة رجال بعد ان مانويل نيور انقذ ركلة روميلو لوكاكو.