تزوّج الزوجان في مقاطعة مونرو بولاية فلوريدا في مارس 1997، ولهما ابنة قبل ان ينفصلوا في عام 2008. انتقل ويلز إلى سان دييغو في عام 1998، وبعد أن أصابته خيبة أمل في سوق الإسكان هناك، انتقل في عام 2002 إلى سان دييغو بولاية فلوريدا. كان ويلز في علاقة قصيرة مع الكاتبة الكندية راشيل مارسدن في عام 2008 التي بدأت بعد أن اتصل مارسدن ويلز حول سيرة حياتها في ويكيبيديا. بعد اتهامات بأن علاقة ويلز تشكل تضارب في المصالح، ذكر أنه كان هناك علاقة ولكن قال أنها كانت متأثرة وأنه لم يكن هناك أي نزاع في أي أمور شخصية، كما قال كاتب ويكيبيديا توني ويلز في لندن في 6 أكتوبر 2012: كيف تزوجت في لندن؟ كما قال وزير الفلسفة جيمي ويلز في مقابلة مع كاتب ويكيبيديا توني ويلز في 6 أكتوبر 2012: كيف تزوجت في لندن؟ كما قال وزير الفلسفة جيمي ويلز في مقابلة
ثلاث مرات