كتب استمرار لهذا الفقرة - بوثينوس، حكم أن هذا الاتفاق في الواقع فضل كليوباترا على بطليموس الثالث عشر وأن جيش الأخير من 20,000، بما في ذلك غابينياني، يمكن على الأرجح هزيمة جيش قيصر من 4,000 جنود غير مدعومين. قرر ان يقود اكيلاس قواته الى الاسكندرية لمهاجمة كل من قيصر وكليوباترا. حصار القصر الناتج
مع قيصر وكليوباترا محاصرين بالداخل استمر الى العام التالي 47 قبل الميلاد. شملت حرق قيصر للسفن في الميناء الذي نشر النيران وربما احرق جزء من مكتبة الإسكندرية. تمكن قيصر من إعدام بوتينوس بعد أن حاول التخطيط لقتله. ارسينو الرابعة اتحدت مع اكيلاس و اعلنت ملكة. بعد فترة وجيزة، جعلت معلمه غانيميدس يقتل أكيلاس ويأخذ مكانه كقائد لجيشها. ثم خدع غانيميدس قيصر في طلب وجود أسيره السابق بطليموس الثالث عشر كمفاوض، فقط ليشاركه في جيش أرسينو الرابع. مع معرفته التفصيلية بالقصر، ضخ جنيميديس مياه البحر في الخزانات عن طريق أنابيب المياه، لكن كليوباترا وقيصر ردوا على هذا من خلال أمر ببناء آبار المياه العذبة.