بسبب معاداة السامية والاضطهاد في عشرينيات وثلاثينيات القرن العشرين، كان عدد سكان كونيغسبيرغ اليهود يتناقص بحلول الوقت الذي سيطر فيه الحزب النازي من خلال "Machtergreifung" في عام 1933. في تلك السنة كان هناك فقط 3500 يهودي يعيشون في المدينة. التشريعات المعادية لليهود في ألمانيا النازية قبل الحرب، التي فرضها إريك كوخ، قامت بقيود على الأعمال التجارية ودفعت العديد من يهود كونيغسبيرغ إلى الهجرة، معظمهم إلى الولايات المتحدة وبريطانيا العظمى. كتب مايكل ويك عن التمييز الذي عانى منه من شباب هتلر. في افتتاح معرض Ostmesse عام 1935، انتقد هيلمار شاخت الاضطهاد دون جدوى. قادت الاضطهاد المجتمع اليهودي إلى إنشاء مدرسة يهودية منفصلة لـ 82 طالبًا في أبريل 1935؛ نمت لتشمل 180 طالبًا في 6 فصول مع 4 معلمين بحلول أكتوبر 1935. في فبراير 1938، نشرت ورقة الدعاية "دير ستودنت دير أوستمارك" أسماء 201 من رجال الأعمال اليهود، و 38 من الأطباء، و 22 من المحامين المتبقين في المدينة، والتي استخدمها Sturmabteilung خلال ليلة الزجاج المكسور
في نوفمبر 1938. تم حرق الكنيس الجديد، وتم تخريب كنيس Adass Jisroel الأرثوذكسي ومقبرتين. تم مهاجمة المدرسة اليهودية ولكنها أعيدت فتحها بعد ذلك، وكذلك الكنيس الأرثوذكسي، حيث أصبح مايكل ويك بار ميتزوا في منتصف عام 1941. كثير من اليهود الذين سكنوا هناك تم نقلهم إلى معسكرات الاعتقال النازية داخل ألمانيا.