لكن زومالاكارريغي، والذي اشتهر بمزاجه الجاد والصامت ومبادئه الدينية القوية، كره الحياة الفوضوية للمقاتلين، وعندما تم تنظيم القوات النظامية في الشمال، دخل في الكتيبة الأولى في جيبوزكوا كضابط. خلال بقية الحرب خدم في الجيش النظامي. كان شقيقه ميغيل أنطونيو دي زومالاكارريغي في قادس في الوقت الذي أقرت فيه الكورتيس دستور عام 1812، ثم انتخب نائبا رئيسيا لجيبوكوا. ثم تم إرسال توماس مع رسائل إلى الوصاية في كاديز، وتلقى مهمته كقبطان. في هذه الرتبة كان حاضر في معركة سان مارسيال
في أغسطس 1813. بعد استعادة فرديناند السابع، استمر في الجيش، ويقال إنه درس بعناية نظرية الحرب.