سيلفستر بونافون الابن في سن التاسعة عشر سجل للخدمة العسكرية في فيلادلفيا، بنسلفانيا في 14 ديسمبر 1861، وتم تجميعه هناك في نفس اليوم كجندي مع الشركة الأولى من مشاة بنسلفانيا التطوعية التاسعة وتسعين. تم نقله إلى شركة جي في الفوج نفسه في 18 ديسمبر، ثم تم ترقيته إلى رتبة العريف في 1 أبريل 1862 و إلى رتبة الرقيب بعد شهر (في 1 مايو). تم تكليفه كنائب ثان في 1 أغسطس من نفس السنة، بعد ذلك شارك مع فوجه في العديد من أعنف أعمال الحرب الأهلية الأمريكية كجزء من جيش الاتحاد في بوتوماك، بما في ذلك معركة بول ران الثانية في عام 1862 (أغسطس 28-30) ومعركة شانتيلي.
(1 سبتمبر) وفريدريكسبيرغ (11 ديسمبر) ؛ 1863's Chancellorsville Campaign (30 أبريل - 6 مايو) ، معارك جيتيسبرغ (1 يوليو - 3 يوليو) ووايبينغ هايتس (23 يوليو) ، حملة بريستو و معركتها الأولى في أوبورن (13 أكتوبر) و معركة رافاهانوك الثانية (7 نوفمبر) ، وحملة رين مين (27 نوفمبر - 2 ديسمبر) ؛ ومعارك البرية في عام 1864 (5 مايو) ، قصر سبوتسيلفانيا (مايو 821), شمال آنا (23 مايو) ، و كولد هاربور (31 مايو - 12 يونيو). شارك مع فوجه في حصار بطرسبرغ، بما في ذلك معارك القاع العميق الأولى والثانية (يوليو 27-29، 1864 وأغسطس 14-20) ، ثم تمت ترقيته في الرتبة مرة أخرى مع ترقية إلى ملازم أول في 27 سبتمبر.