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  和大部分的巴赫风琴作品一样,此曲没有任何原作手稿留存至今,Johannes Ringk手抄本虽无标注日期,但为历史最悠久的版本。Ringk除了创作少量作品,他亦因抄录不同著名作家的作品而著名,如乔治·波姆、约翰·帕海贝尔、迪特里克·布克斯特胡德等。在Ringk的手抄本中已使用「托卡塔与赋格()」的标题,及使用意大利速度用词和音乐记谱法(如断音、延音)。其后一些18世纪的手抄本皆在不同程度上参考上述版本。

  此曲有简单的北德风格,具开放式的开首及结尾,除了曲中长长的宣叙调可能是参考约翰·海因里希·布茨特的创作手法。曲中部分的旋律则取自约翰·帕海贝尔的D小调幻想曲等曲目,而在赋格中使用其他人的旋律是巴赫时期中常用的创作手法。

  此曲第一部分为托卡塔,开首为一组平行的八度音和减七和弦琶音,其后形成D大调平行键。然后是三段短促的八度旋律,再以减七和弦的琶音转回D小调。接着是一连串较随意的乐段,并以A小调的踏板音作辅。最后以连续的三连音过渡到慢板结尾乐段。

  此曲第二部分为四声部赋格,主题以十六分音符组成。第二声部比第一声部高四度,而不是巴赫作品中寻常的五度,但高四度能令此曲变得更自然。当四个声部全部呈现后,乐曲转入降B大调,后又奏出结尾的装饰奏,最终以慢板和弦作结。

  一般来说,此曲的作者皆被认为是巴赫本人,但一些学者却质疑此说法。彼得·威廉在1981年发表文章指出此曲具有一些当时未出现或极少出现的作曲手法,如: 以上理论被其他学者加以推演,他们认为作者最早应在18世纪初出生,在1730年代后(甚或1750年代后)才作此曲,令此曲的风格能得以解释。学者大卫·韩福瑞提出作者可能是约翰·彼得·克尔纳,他与巴赫家关系密切。  1981年的文章中彼得·威廉提出另一个可能性,此曲改编自一首没有留存至今的小提琴作品,这可解释作者为何没为乐曲加入适合风琴演奏的和音。现今已知巴赫为两首小提琴独奏曲编风琴作品,如G小调第一奏鸣曲和E大调第三组曲。彼得·威廉尝试用此曲还原成小提琴曲,并加以出版和举行演奏 (彼得·威廉(A小调)小提琴曲的开首部分与赋格部分)。 此外也有其他人此曲还原成小提琴曲,亦有人认为此曲编自五弦大提琴作品。其他学者也曾作出详细的研究,但现在仍未有一致的结论。
D小调托卡塔与赋格, BWV 565为巴赫著名的作品,同时也是风琴作品中最杰出的作品之一。但自1980年代起有学者质疑此曲是否由巴赫本人所作。此曲亦有多个改编版本,如法国号、钢琴、交响乐、弦乐四重奏等,也出现于各流行媒体中,包括迪士尼的幻想曲。