在公元前58年,克里奥帕特拉可能陪伴她的父亲,托勒密十二世奥利特斯,在埃及 (罗马的客户国) 发生起义后被流放到罗马,允许他的女儿贝雷尼西四世夺取王位. 伯利尼西在公元前55年被杀,当时托勒密斯在罗马的军事援助下返回埃及. 在公元前51年他去世时,克里奥帕特拉和她的兄弟托勒密十三的联合统治开始,但他们之间的冲突导致了公开的内战. 在公元前48年,在希腊的法萨洛斯战役中,在凯撒的内战中输给了他的竞争对手尤利乌斯·凯撒 (罗马独裁者和领事),罗马政治家庞培逃往埃及. 庞培是托勒密十二世的政治盟友,但托勒密十三世在凯撒到达并占领亚历山大之前,在他的宫廷太监们的敦促下,伏击了庞培并杀了他. 然后,凯撒试图调和对手的托勒密兄弟姐妹,但托勒密的首席顾问波泰诺斯认为凯撒的条件有利于克利奥帕特拉,因此他的军队在宫殿围困了她和凯撒
没有. 围攻后不久被援军解除,公元前47年,托勒密十三世在尼罗河战役中丧生;克里奥帕特拉的半妹妹阿尔西诺伊四世因在围攻中扮演的角色而最终被流放到以弗所. 凯撒宣布克里奥帕特拉和她的兄弟托勒密十四共同统治,但与克里奥帕特拉保持私人关系,生下了一个儿子,凯撒里昂. 克里奥帕特拉在公元前46年和44年作为一个客户女王前往罗马,在那里她住在凯撒的别<unk>. 在公元前44年暗杀了凯撒和 (在她的命令下) 托勒密十四之后,她任命凯撒里昂为共同统治者.