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  台湾的原生种,分布于由海平面至海拔三千米以下的地区。在日本则为外来种,分布于伊豆大岛(伊豆群岛),大根岛(静冈县南伊豆町),和歌山县北部。从1940年起陆陆续续从动物园等观光设施逃脱,成为日本的外来种。

  台湾猕猴的前肢比后肢短,各肢具有五趾。头圆,脸扁,额裸出,颜面呈淡紫色,或深或淡,随个体的不同而有差异,所以台湾原住民将其分为白脸与红脸,脸颊上并长有粗杂的长须,尾粗状多毛,全身被厚而软的毛,冬季呈棕灰色,夏季呈棕绿色,四肢较黑故有黑肢猿之称。股间有显著的红棕色的大斑。一般而言,雌猴体型较雄猴小,颜色也较淡。

  种小名cyclopis来自希腊神话的独眼巨人。 独眼巨人英文为「Cyclops」(希腊文:;复数:),语意是圆眼。

  台湾猕猴属于昼行性活动且群体生活的动物。分布地区遍及3000米以下之低至高海拔,如高雄寿山,彰化县二水乡设有二水台湾猕猴生态教育馆(原名二水弥猴自然保护区)。另外,在新北福山、恒春垦丁有台湾猕猴做为过夜地域。  根据记录,台湾猕猴食用的植物包含85科300种,以果实为主,其他还有昆虫、甲壳类和软体动物等。对于食用植物的部位,会因季节月份和干湿季变化而有所不同,以十至五十只一群。  台湾猕猴虽然是保育类动物,原有的天敌为台湾云豹及大型猛禽,但台湾云豹早已绝迹大型猛禽也渐稀少,加上台湾猕猴适应力强,在立法保育之下族群数量大幅回升,在高雄、屏东等地区的台湾猕猴,因栖息地与人类接壤而不会怕人,经常发生抢夺游客食物、入侵民宅房舍取食以及破坏农作物等事件,造成居民及游客困扰。因受归类为保育类动物,目前尚未有统一且有效的解决方针。  人类于其居住范围应避免将食物外露,即可避免人猴冲突。唯露食被取事件层出不穷,积怨已久,以至使用毒饵,登山杖,弹弓、捕兽夹等凶器等事件发生,致猕猴死伤。目前于高雄柴山仍可见到弹弓与BB枪等制猴器具以及使用民众。2015年11月,仅两周间于高雄地区便有十来只死伤之猕猴,皆明显外伤。  2014年行政院农委会依据「野生动物保育法」第21条的紧急条款内容,认为特定状况下猎杀猕猴具法律正当性;然而,此条款之适用,仅限于农民在生命财产受到紧急威胁之情况下,主张「正当防卫」猎杀野生动物,以保障生命、财产作物安全。但衡量法律保护利益与野生动物保育,其限定以「人道方式」为之,在最短时间内给予最小痛苦。。

  已公告除名正式离开保育类名录。

  美国食品药品监督管理局(Food and Drug Administration;FDA)于2013年8月发表台湾猕猴具有「猴泡沫病毒」(Simian Foamy Virus, SFVmcy-2),是反转录病毒(retrovirus)的一种 。  台湾猕猴亦有第四类法定传染病「疱疹B病毒」(Herpes B virus,正式学名,猴疱疹病毒), 玉山塔塔加首起猴群主动攻击, 抓咬伤10游客。疱疹B病毒感染症是一种会造成中枢神经系统疾病的人畜共通传染病,主要是经由罹患猴疱疹的猿猴抓咬伤而感染,人若被感染的猿猴抓咬伤,通常在3天至3星期的潜伏期后,会出现急性发烧、头痛、水泡病灶、淋巴性脑脊髓液内细胞增多和不同型态的神经症状等。人类罕见疱疹B病毒感染个案,目前全球约仅有40名报告病例。疱疹B病毒一旦感染发病,死亡率非常高,病患如未接受妥适医疗,死亡率超过70%,存活者常会伴随有严重的后遗症。
台湾猕猴,又称黑肢猴,台湾特有种,珍稀野生动物,属旧世界猴。也是除了智人外台湾唯一的灵长类动物,和日本猕猴、普通猕猴有血缘关系。