在1939年9月,德国和苏联入侵波兰后,该市被德国占领,这导致了第二次世界大战的开始. 1939年12月14日,德国人在帕尔米里大屠杀中杀害了46名普鲁斯科夫的波兰人. 在入侵之前,这座城市有大量的犹太人口. 1940年,德国占领当局
在普鲁斯科夫建立了一个犹太隔离区,以限制犹太人口的迫害和剥削. 1941年1月31日,该犹太人区被清算,当时所有1400-3000名居民被运送到牛车上到华沙犹太人区,这是整个纳粹占领欧洲最大的犹太人区,有超过40万犹太人挤进一个面积为1.3万平方公里. 大多数受害者从那里被送往特雷布林卡灭绝营.