1643年1月16日,托马斯·格雷爵被任命为中陆县协会的总司令,然后被命令在第二次内战期间特别照顾诺丁汉. 他于1643年6月带着大约6000人的部队在那里设立总部. 在1643年3月5日给他的儿子托马斯的一封信中,亨利·格雷 (托马斯的父亲) 描述了一场横扫全国的战斗,经过了卢特沃思,欣克利,巴韦尔,利奇菲尔德和纽瓦克等城镇. 1643年8月29日,在艾尔斯伯里,他加入了埃塞克斯伯爵的游行,以减轻格洛斯特. 围困解除后,他参加了第一场纽伯里战役
他对此表示感谢. 在1644年,他在德比郡减少了地方,因此得到了更多的赞赏. 由于误解,他离开莱斯特,但在1645年,他被要求回来,以应对皇家主义者的攻击. 1648年,格雷<unk>爵在莱斯特郡发动了军队. 在普雷斯顿战役中击败苏格兰人后,他追赶汉密尔顿公爵和他的马到乌托克塞特,并为他的俘<unk>而自称,尽管汉密尔顿公爵声称他投降了. 在8月之前,格雷在民兵中担任了各种指挥. 在1651年,他被派到莱斯特,诺丁汉,北安普顿和鲁特兰县的总司令委员会,以招募志愿者,以应对苏格兰的入侵. 在9月,爱德华·马西爵士在伍斯特战役后向格雷<unk>爵投降.