在1916年6月, 共和党全国代表大会选择休斯作为保守派和进步派之间的妥协. 休斯在大会的第三次投票中击败了约翰·W·维克斯,埃利胡·鲁特和其他几位候选人. 虽然保守派和进步派共和党人在1912年大选中分为现任总统威廉·霍华德·塔夫特和前总统西奥多·罗斯福的候选人,但他们在休斯的努力中大多团结在一起,试图推翻威尔逊. 休斯仍然是唯一一位当前或前最高法院法官担任主要政党的总统候选人. 威尔逊在1916年民主党全国代表大会上再次被提名
几天后, 没有任何反对. 虽然威尔逊的副总统托马斯·R·马歇尔被重新提名,但休斯的竞选副总统是查尔斯·W·费尔班克斯,他是西奥多·罗斯福第二任期的副总统.