波提诺斯认为,这项协议实际上有利于克里奥帕特拉而不是托勒密十三,而后者的2万人的军队,包括加比尼亚尼,很可能会击败凯撒的4000名无人支持的军队. 他决定让阿基拉斯带领他们的军队前往亚历山大攻击凯撒和克里奥帕特拉. 宫殿的围攻
凯撒和克里奥帕特拉被困在里面, 持续到公元前47年. 这包括凯撒在港口烧毁船只, 造成火灾蔓延, 凯撒成功地处决了波泰诺斯, 亚西诺伊四世与阿基拉斯联手,并被宣布为女王. 很快之后,她让她的导师甘尼米德杀死阿基拉斯, 接替他担任她的军队指挥官. 甘尼米德随后欺骗凯撒要求他曾被俘的托勒密十三作为谈判代表,但他却加入了阿尔西诺四世的军队. 由于他对宫殿的详细了解, 甘尼米德通过水管将海水抽入水库, 但克里奥帕特拉和凯撒通过建造淡水井来抵制这一点.