战争结束后,赫兹菲尔德和他的妻子回到华沙,在那里他建立了一个以弗兰克福埃里希实验治疗研究所为模式的血清研究所. 他很快就成为华沙国家卫生研究所的副主任和科学负责人,并在1924年成为教授. 1931年,他被任命为华沙大学的常任教授,并担任许多国际董事会. 波兰被占领后
希尔兹菲尔德被德国军队解雇为"非雅利安人"从卫生研究所,但通过朋友的保护,设法在家里做进一步的科学工作,直到1941年2月;然而,他几乎不可能发表.