在2000年欧洲杯之后,内斯塔仍然是意大利新教练乔瓦尼·特拉帕托尼的首选中<unk>,并在2002年世界杯预选赛中广泛出场. 在2002年世界杯期间,他与法比奥·卡纳瓦罗 (Fabio Cannavaro) 在中防中合作,在对阵厄瓜多尔的首场胜利中保持清洁,但再次受伤使他无法参加第二轮比赛,并且内斯塔没有在争议性的第二轮比赛中输给联合主办国韩国. 意大利队在2004年欧洲杯预选赛中以突出表现领先. 意大利在主要比赛中的失望在2004年欧洲杯上继续
然而,在与丹麦和瑞典的三局五分赛后,他们在第一轮被淘汰,只是在直接比赛中被淘汰. 尼斯塔在三场小组赛中打了90分钟,帮助意大利在对阵丹麦的首场比赛中保持清洁.