当现代奥林匹克运动会于1896年开始时, 发起人和组织者正在寻找一个伟大的普及活动, 提醒古希腊的荣耀. 马拉松赛的创意来自于米歇尔·布雷尔,他希望这项赛事在1896年雅典举行的第一届现代奥运会中出现. 这一想法得到了现代奥运会创始人皮埃尔·德·库伯<unk>和希腊人的强烈支持. 1896年3月22日,希腊人举办了一场奥运马拉松选拔赛 (格雷戈里亚式),由卡里拉奥斯·瓦西拉科斯 (Charilaos Vasilakos) 在3小时18分钟内获胜 (奥运会马拉松的未来获胜者斯皮里顿·"斯皮罗斯"·路易斯 (Spyridon "Spyros" Louis) 在两周后的第二场比赛中获得第五名). 1896年4月10日,第一场奥运马拉松比赛的冠军是希腊水运人斯皮里顿·路易斯 (Spyridon Louis),他以2小时58分50秒的时间完成了比赛. 2004年夏季奥运会马拉松赛
在马拉松到雅典的传统路线上, 结束在帕纳西奈科体育场, 1896年夏季奥运会的场地. 男子马拉松比赛由意大利的斯蒂凡诺·巴尔迪尼 (Stefano Baldini) 赢得,时间为2小时10分55秒,这是该路线的纪录时间,直到2014年非奥运会雅典经典马拉松赛,当时菲利克斯·坎迪 (Felix Kandie) 将赛道纪录降至2小时10分37秒.