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  1809年8月16日普鲁士教育改革中,由当时国王受命威廉·冯·洪保特创立「柏林大学」(Universität zu Berlin),拉丁文名称 「Alma Mater Berolinensis」。于1810年开始运作校务。1810年至1945年间,全名为「腓特烈-威廉-大学」(Friedrich-Wilhelms-Universität)。1949年更名为「柏林洪堡大学」(Humboldt-Universität zu Berlin)。  柏林洪堡大学是依据创校者洪保特「研究与教学合一」的精神所创立,于1810年所创立的新制大学,他也希望柏林洪堡大学能成为「现代大学之母」(Mutter aller modernen Universitäten)。根据洪堡的理念,现代的大学应该是「知识的总和」(Universitas litterarum),教学与研究同时在大学内进行,而且学术自由,大学完全以知识及学术为最终的目的,而非实务人才的培育。洪堡认为大学兼有双重任务,一是对科学的探求,一是个性与道德的修养。他说的科学指纯科学,即哲学。而修养是人作为社会人应具有的素质,是个性全面发展的结果,它与专门的能力和技艺无关。根据纯科学的要求,大学的基本组织原则有二:寂寞和自由。寂寞意味着不为政治、经济社会利益所左右,与之保持距离,强调大学在管理和学术上的民主性。在洪堡看来,自由与寂寞是相互关联、依存的,没有寂寞(独立)就没有自由。大学全部的外在组织即以这两点为依据。在此之前,不论欧洲或美国的大学,都还是沿袭修道院教育的传统,以培养教师、公职人员或贵族为主,较不重视研究。此后洪保特的理念传递至欧、美各地,也成为许多大学仿效的对象。

  

  洪保特大学起初名为腓特烈-威廉-大学(,1810年),在普鲁士国王腓特烈·威廉三世的支持下设立。成立初期分别有法律、医学、哲学与神学等4个学院,学校老师共有52名教师及256位学生,而哲学院的黑格尔、法学院的萨维尼、古典语言学家柏克(德语:)、医学院的胡费兰及农学家特尔,则象征了当时洪保特大学各学院的精神。在过去的两个世纪,洪保特大学是德国最著名的思想家的诞生地,其中包括唯心主义哲学家费希特;神学家施莱尔马赫;哲学家黑格尔、叔本华、谢林、文化批评家本雅明以及著名的物理学家爱因斯坦和普朗克。 马克思主义奠基人马克思和恩格斯也求学于洪堡大学。诗人海涅、德国统一首相俾斯麦、德国共产党创建人李卜克内西、欧洲议会主席舒曼都是该校毕业生。在过去的200多年中,洪保特大学诞生了55位诺贝尔奖获得者(包括任职教师、研究人员和毕业校友)。洪保特大学的办学模式为世界上的许多大学,如日本的东京大学、美国的约翰霍普金斯大学和州立大学所效仿。  除了传统的学科,如科学、法律、哲学、历史、神学和医学,洪保特大学大力发展了许多其它新兴学科。在19世纪下半叶,洪保特大学的自然学科诞生了许多伟大的学者,如化学家霍夫曼;物理学家亥姆霍兹;数学家库默尔、克罗内克、维尔斯特拉斯;内科医生缪勒、葛雷、菲尔绍、科赫(德语:Robert Koch)等。在这段迅速发展的时期,洪保特大学逐渐合并了柏林其它一些独立的学院,比如夏里特(Charité)医学院等。在20世纪20年代,洪保特大学成为欧洲乃至世界的学术中心,这一时期也被称为「黄金柏林1920年代」。洪保特大学从建校时起就开始进行自然博物馆的建设和藏品的搜集,至今,大学博物馆尤为著名。

  与欧美大部分大学一样,大学最早并没有女性的空间,一直到1908年,洪保特大学才开始收女学生,但不久之后就开始有女的助理与兼任女教授,著名的核分裂学者迈特纳就曾于1926年以特聘教授的身份任教于洪保特大学,不过大学真正颁发教授教席给女性,则是1945年之后的事情。

  在1933年之后,像其他的德国大学一样,柏林大学被纳粹法西斯政权严重影响,校图书馆内20000余册图书因“腐化堕落”和由纳粹政权反对者所著,被在3月10日被焚烧。250名教授和学校犹太裔雇员在1933年到1934年被迫害开除。大量的学位被撤销。持有不同政见的教职工和学生被拒收、开除和勒令退学,这期间共有三分之一的学校人员被开除。

  1810年柏林大学创校,校区原址位于菩提树下大街。到第二次世界大战结束为止,柏林原本只有一个「柏林大学」,而大学师生也很骄傲地以拉丁文校名「柏林大学」()自称。冷战期间,柏林大学被划入东柏林境内,部分师生从原校出走,并在美英等西方阵营的支持下,1948年于西柏林成立了「自由的柏林大学」(即今柏林自由大学),成为西德学术重镇。「真理、公平、自由」()是柏林自由大学建校以来的校训。柏林大学分裂之后,位于东柏林的原址校区则于1949年改名为现今的柏林洪保特大学,以纪念大学创办人、德国著名教育改革家洪保特兄弟。  在华文世界中,「柏林大学」一词在1948年之前专指今天的柏林洪保特大学(例如小说围城中所称的柏林大学)。冷战结束前,「柏林大学」则普遍又指的是柏林自由大学。这两所「柏林大学」如今是各自独立的大学,但由于政府预算吃紧,两所「柏林大学」逐渐开始在较多领域合作、合并。例如两校的医学院就于2003年合并成柏林大学夏里特医学院()。

  柏林洪保特大学位于柏林市中心菩提树下大街,所在地为原先的海因里希王子宫(),是普鲁士国王腓特烈二世为其弟弟亨利亲王修建的宫殿。两德统一后,洪堡大学在柏林市东南部的科技园区兴建了新校区,并在1998年以后将该校的自然科学系陆续迁往本区。  目前共有9个学院、11个交叉研究中心、18个研究生院、2百多个专业或科系,学生3万多人。  其它两个独立的研究机构:  联合研究中心:

  洪保特大学从2000年开始,为了配合旨在衔接欧洲诸国高等教育的“波隆纳进程”(Bologna Agenda),开始设立拥有学士学位及硕士学位的英美制的学系,例如统计学学士、统计学硕士、跨大西洋区域研究硕士、高分子硕士等科系。

  柏林洪保特大学在二次世界大战之前,可以说是世界学术的中心。许多知名学者、政治家都在这边留下了他们的身影,柏林洪保特大学也产生过55位诺贝尔奖得主,成就惊人。

  柏林洪保特大学的教师阵容十分强大,包括物理学家爱因斯坦、普朗克、亥姆霍兹、薛定谔、赫兹、韦恩等,生物化学之父费歇尔,20世纪最伟大的数学家之一诺伊曼,化学家拜耳,哲学家费希特、谢林、黑格尔、叔本华、地理学家李希霍芬、李特尔,神学家施莱尔马赫、法学家萨维尼、李斯特、历史学家兰克都曾在此任教。

  共产党理论的创始者马克思、恩格斯都曾就读过柏林洪保特大学,其他曾在此就读的还包括欧洲议会主席舒曼、哲学家费尔巴哈、著名诗人海涅、铁血宰相俾斯麦、火箭专家布劳恩及作家图霍尔斯基等。  柏林大学也吸引了不少中国留学生,中央大学老校长罗家伦、美学家宗白华、书画家溥心畬、哲学家陈康、物理学家王淦昌、气象学家吕炯、地球物理学家赵九章、兽医学家盛彤笙、历史学家陈寅恪、傅斯年、韩儒林以及周恩来、马君武、顾孟余、朱家骅、谷正纲、关吉玉、章伯钧、张君劢、俞大维和包尔汉等人曾在此就读。
柏林洪堡大学(德语:Humboldt-Universität zu Berlin,HU Berlin),是德国首都柏林目前四所公立大学中最古老的大学,在城中区中央,于1809年由普鲁士王国文教部长威廉·冯·洪保特、哲学家费希特及神学家施莱尔马赫以「柏林大学」之名所创立,并与1810年秋天开学,是第一所新制的大学,拥有十分辉煌的历史,是世界著名的顶尖学府,也是欧洲顶尖大学之一。从1810年建校,它的正式名称为“弗里德里希-威廉-大学”(德语:"Friedrich-Wilhelms-Universität"),被世人简称为柏林大学。在1949年,为了纪念学校的创始人著名的洪堡兄弟,而重新命名为柏林洪堡大学。