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  虽然蛋白质的三维结构是由它自身的氨基酸序列决定的,但并非所有蛋白质都能自然折叠到其自然状态(英文:Native Status,即蛋白质能发挥其功能的最终状态),很多蛋白质的折叠或者是在高温失活后(即所谓的热休克,英文:Heat shock),都通常需要分子伴侣的协助达到或恢复到其自然状态。其实,分子伴侣并不是只在热休克时才出现的,它们一直存在于细胞内。蛋白质在折叠时,总体来说是朝着降低能量的方向进行的。不过有时候它会进入所谓的“能井”中(见图2)。这些状态并非其能量最低状态,但是蛋白质却因为缺乏外源能量而不能越出能井,或者是要很长的时间才能做到。这时分子伴侣会发挥其作用,帮助蛋白质折叠回正确状态并加速这一过程。从另一个角度看,所有的分子伴侣都能识别疏水性区域。因为自然状态下的蛋白质会隐藏其疏水性区域,只有在不正确折叠的情况下才暴露出这些区域。分子伴侣便依靠疏水性作用与其底物结合,发挥作用。  而分子伴侣Asf1则有着另外的功能。法国一个由Genevieve Almouzni带领的研究小组通过遏制该蛋白,使用细胞分裂抑制剂和添加过量的组蛋白来研究该分子伴侣的功能。他们发现,如果细胞内该蛋白被遏制,细胞周期会停滞于S期。不过DNA复制的起始无碍,而复制的过程也不会受到任何检查点(英文:Checkpoint)的阻挠。该小组人员怀疑该蛋白和解螺旋酶的活性有关。当Asf1不存在时,解螺旋酶功能失常。当细胞受到分裂抑制剂处理后,细胞分裂停止,而Asf1的含量也上升。另外,当细胞内被人工添加过量的组蛋白时,Asf1因忙于接载这些外源的组蛋白而不能处理母链上的组蛋白,细胞周期因此而停止。因此研究人员推测,Asf1传递母链上的组蛋白到子链,完成染色质的组装。

  分子伴侣中很大一部分是热休克蛋白(反过来也未必成立,就是说,并非所有热休克蛋白都是分子伴侣)。这些蛋白在所谓的压力源的刺激下,如高温,葡萄糖供应不足,身体受到感染和癌症被激活。下面根据Ranford, J.C. et al.列出主要的分子伴侣。
分子伴侣(英语:Chaperone,又见称为:molecular chaperone,中文又可译为侣伴蛋白。英文单词原意是指姆,即负责监管、教育年轻未婚少女的行为的老年妇女。)是一类协助细胞内分子组装和协助蛋白质折叠的蛋白质。注意分子伴侣与伴侣素(英文:Chaperonin)的区别:后者只是分子伴侣中的一种,前者还包括热休克蛋白Hsp60和Hsp10两个家族。另外,使用ATP协助蛋白质折叠只是一部分分子伴侣的功能,分子伴侣如Asf1者,能在细胞分裂过程中提升DNA解螺旋酶的活性并且将母链的组蛋白传递到子链。