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  20世纪初,“贤者”(Philosophers)组织成立,后筹集了一笔数额庞大的资金,“贤者的遗产”(Philosophers' Legacy)。  1942年8月,美国陆军技术总部曼哈顿计划开始,宅代(Otacon)的祖父被安排参与此计划,实验却使得自己的儿子也就是宅代的父亲休伊(Huey)双腿残废。同年传说中的战士「The Boss」成立眼镜蛇(Cobra)部队,1947年该部队解散。  1950年,约翰(John)也就是后来的「Big Boss」成为「The Boss」的学生。  1960年,索可洛夫博士在OKB-754研究所开始进行代号为“Shagohod”的研究。  1962年,古巴导弹危机发生。The Boss在Tselinoyarsk的任务中被迫杀死他过去的情人The Sorrow。  1963年,电影《第三集中营》上映(该片与《合金装备3》剧情有关)。

  CIA为应付冷战时期的形势需要,组建一支以单独潜入手段完成特殊任务的作战部队,该部队命名为FOX小队。表面上作为该部队的实战试验,FOX参与贞洁任务。  1964年8月24日贞洁任务开始。作为FOX小队的一员,化名为裸蛇(Naked Snake)的John(CIA时改称Jack)在汤姆上校(Major Tom)指挥下潜入Tselinoyarsk救援索可洛夫(Sokolov)。索可洛夫是苏联的科学家,研发了名为Shagohod的秘密武器却害怕它的力量,打算转投美国。裸蛇在行动中初次认识奥塞罗特(Ocelot)。裸蛇救出了索可洛夫,撤退途中索可洛夫却被The Boss抢去,裸蛇不敌被推下悬崖。眼镜蛇(Cobra)小队成员重聚,作为移动的导弹发射装置开发出来的Shagohod被沃尔金上校(Volgin)用直升机运走,沃尔金却以The Boss送来的无后座力核弹发射装置发射了一枚美国制核弹以致事态变得严重。  8月30日食蛇者作战(Operation Snake Eater)开始,汤姆上校代号改为瑟罗(Zero)。史内克再次潜入Tselinoyarsk,任务是救援索可洛夫,摧毁Shagohod,并消灭眼镜蛇小队、沃尔金上校和The Boss。蛇结识了中国派来的特务EVA,以及后来登场的Metal Gear的发明者葛拉宁(Granin)。裸蛇从事件中了解到“贤者的遗产”的存在,沃尔金想要拿到这笔钱。经过一番波折,史内克打败了眼镜蛇小队,消灭了Shagohod和沃尔金,并在最后决战中杀死了恩师The Boss。任务结束后,EVA离开了他,留下的信件告诉他整个事件其实是“贤者”在幕后操纵,The Boss不过是任务中发生意外,美国和苏联方面双方谈判决定牺牲她以证明美国清白。最后裸蛇受到政府嘉奖获得「Big Boss」称号,却决定退隐离开FOX小队。  Sokolov被FOX小队的Gene救回美国,同时带上了Granin的Metal Gear设计图。Gene获得了部分“贤者的遗产”。CIA获得Metal Gear设计图后命令Sokolov开发新型武器,命名为Metal Gear。1970年代,苏联和美国的冷战军备竞争导致双方军费大增,双方签署和平协议并开始裁减军备。CIA害怕苏联裁减军备后军力削弱会加快冷战结束而导致自己地位下降,打算将Metal Gear送给苏联以维护军事均衡。另一方面五角大楼由于CIA的地位巩固以及战略上的一些小动作感到不满,希望削弱CIA,便设计引发事端。  1970年11月2日,Big Boss被叛变的FOX小队抓获并囚禁在San Hieronymo Peninsula(实际上是五角大楼的计划),结识Roy Campbell。得知FOX小队被指派到此执行任务,却叛变并获得了政府的秘密武器Metal Gear。其首领Gene是所谓的“Successor”(继承者)计划的产物,目的在于培养The Boss的继承者领导士兵。Big Boss俘虏美国及苏联士兵,组建自己的部队。行动中认识了Elisa,NULL(也就是后来的Gray Fox)等人。Elisa是贞洁任务中核弹爆炸的受害者,因此十分憎恨核弹,但同时又是一个双重性格的人,并有预知未来的能力。Elisa的另一人格驾驶Metal Gear RAXA攻击Big Boss,被Big Boss击毁。Gene却说这不过是试验品,引发士兵自残后逃去。Big Boss潜入导弹井,从敌人口中得知这次事件是CIA以及他们背后的“贤者”策划的。在最后的控制室里,Gene打算启动Metal Gear(ICBMG)时被之前被认为已经死去了的Elisa阻止,Gene杀了她然后用备用开关启动了Metal Gear。最终Big Boss打败了Gene,Gene把用于建立“Army Heaven”的财产的胶卷交给了Big Boss,相信他日后会用到(后用于建设世外桃源(Outer Heaven))。但是ICBMG的启动无法停止,Big Boss与士兵一起攻击火箭,令火箭发生故障偏离航道,ICBMG在大气层中销毁。Big Boss回国,瑟罗也解散了FOX。  1971年,基于FOX特种部队的行动特点,Big Boss成立FOXHOUND部队。同年,Big Boss在越南河内救出EVA。  瑟罗和奥塞罗特铲除了美国方面的“贤者”势力,利用部分“贤者的遗产”成立了“爱国者们”(The Patriots)组织,以实践The Boss的理念。在奥塞罗特的极力推荐下Big Boss被引荐进入爱国者们,其余的成员还有EVA、SIGINT、PARA-MEDIC。但Big Boss的理念和瑟罗日渐产生分歧。1972年,瑟罗执行「恐怖之子计划(/Les Enfants Terribles)」,目的是制造一个Big Boss的代替品,固蛇(Solid Snake)和液蛇(Liquid Snake)即是这个计划的产物(但是Big Boss的完美克隆体中Solidus Snake却并不是这个计划的产物),固蛇和液蛇的母亲是EVA。“恐怖之子计划”加深了Big Boss和瑟罗的矛盾,Big Boss脱离“爱国者们”,以他所理解的“The Boss的理念”建立起“无国界军队”。瑟罗在Big Boss离开后,变得对一切都感到怀疑,不再相信别人。  1974年,冷战因美苏两国的力量平衡而暂时平静下来。带领其组建的“无国界军队”驻扎在哥伦比亚的Big Boss和和平·米勒(Kazuhira Miller),迎来了两位客人:自称是哥斯达黎加国联和平大学教授,代表政府前来谈判的贾维兹(Ramón Gálvez Mena),以及名为帕兹(Paz)的学生。贾维兹以类似"The Boss"声音的录音为引诱,让Big Boss答应帮助他驱逐驻扎在哥斯达黎加的CIA资助的部队。  史内克从FSLN的亚曼达(Amanda)和齐可(Chico)口中得知敌人基地的位置及其中的“守护神”。潜入基地的史内克遇上名为寇曼(Coldman)的CIA长官,以及二足步行兵器的开发者休伊(Huey)博士。休伊告诉史内克他开发的「和平行者」(Peace Walker)是由AI控制的可移动核威胁力量,最大特点是可移动性以及完全理性的判断。但是「和平行者」还有AI部分未完成。在帕兹的朋友瑟西尔(Cécile Cosina Caminades)的指引下,史内克找到了AI的开发者奇爱博士(Dr.Strangelove)以及“The Boss”---由奇爱博士开发,参照The Boss的人格思考制造出的AI。一番恶斗后AI再次逃脱,Big Boss追踪AI至和平行者的工场被抓住。后来他逃出来却发现和平行者已经完成,未能击败和平行者并让寇曼带着人质帕兹和和平行者逃跑出国。  Big Boss为阻止核弹发射来到尼加拉瓜的美军基地,发现这里被苏联军队控制着。站在他面前的寇曼声称将会给和平行者输入假资料,让它误以为苏联发射核弹然后对苏联展开“反击”。贾维兹这时候突然出现,原来他实际的名字是Vladimir Alexandrovich Zadornov,是KGB的间谍;他假意投降CIA,利用美国的技术开发和平行者然后据为己有。贾维兹命令帕兹射死寇曼,但帕兹并不愿意这样做。贾维兹打伤寇曼,打算利用寇曼输入指令,将目标改为古巴,让全世界以为美国主动攻击共产主义国家并借机控制中美洲。FSLN和无国界军队及时赶到将敌人一网打尽。被俘虏的寇曼临死前启动了和平行者,将假资料发送到美军司令部让美国误以为苏联发射核弹,然后让忠于任务的和平行者发动反攻。Big Boss击败了和平行者却无法阻止其资料传送。这时模拟The Boss的AI作出了自杀的决定,控制和平行者走向大海以阻止信号传送。  回到无国界军队基地的史内克,多次出动将逃亡的贾维兹抓回,最后发现原来这是为了让帕兹将Metal Gear Zeke改造成可以手动驾驶所制造的空档;而后帕兹驾驶Metal Gear Zeke想要毁灭无国境军队,说出自己其实是「CIPHER」派来的间谍,姓名、身份通通是伪造的;之后与史内克展开了战斗,最后帕兹战败坠海。另一方面,瑟罗利用奇爱博士的AI技术开发出“爱国者们”的AI系统,并逐渐渗透控制世界经济、政治、军事等领域。  1975年,坠海的帕兹以及无国界军队的齐可被神秘部队“XOF”抓获,帕兹被虐待后,体内装上了追踪器和炸弹。同时,联合国检查人员到达无国界军队基地检查。为免Zeke的事情败露,Big Boss潜入XOF基地救出二人,回到自己的基地后发现自己的基地受到袭击,无国界军队几乎全灭。救出米勒的Big Boss勉强撤退,帕兹表示自己体内还有炸弹后,在炸弹爆炸前跳海。而他们的直升飞机发生空难。BIG BOSS陷入昏迷。  1976年,“恐怖之子计划”被遗弃。  1980年,休伊和奇爱的儿子哈尔(Hal)出生。  1984年,BIG BOSS的替身毒蛇(Venom Snake)从昏迷中苏醒,在奥塞罗特的帮助下从医院逃离了追杀。与米勒和奥塞罗特一起建立钻石犬(Diamond Dog)部队,向XOF复仇;BIG BOSS则回到了美国,当上了FOXHOUND的主管并暗中策划世外桃源(Outer Heaven)。

  某年,Grey Fox收养了一个在战争中失去亲人的小女孩,也就是后来的Naomi Hunter。  1990年,为SAS工作的液蛇(Liquid Snake)在伊拉克执行摧毁移动的飞毛腿导弹发射器的任务,后宣称在任务中失踪。  1994年,液蛇返回美国。  1995年,佣兵团建立的军事组织“世外桃源”(Outer Heaven)逐渐浮出水面,美国方面收到情报,“世外桃源”正在生产一种能改变世界战局的武器。FOXHOUND负责潜入任务的特工Grey Fox在探索任务中失去联络,在Big Boss指挥下FOXHOUND成员固蛇(Solid Snake)负责继续追查该事件,在基地中发现代号为Metal Gear TX-55的武器并发现幕后主脑正是Big Boss(实际上是毒蛇,Big Boss的幻影)。最后他击败Big Boss,炸毁了Metal Gear TX-55并逃出“FOXHOUND”。  1997年,中东发生军事叛乱,赞给巴尔(Zanzibar)立国  1999年,Kio Marv博士发明了炼制高度纯净的天然石油的微生物“OILIX”,却被赞给巴尔绑架。固蛇在FOXHOUND指挥官Roy Campbell的指挥下潜入赞给巴尔,却发现赞给巴尔的领导者竟然是失踪了的Grey Fox。最后他打败了Grey Fox,Metal Gear D和曾被认为在前次事件中被击败的Big Boss。任务结束后固蛇退休居住在阿拉斯加。Big Boss成为植物人,被瑟罗“保管”起来。Gray Fox则被救回,身体被改造为忍者。  2000年,液蛇加入FOXHOUND,成为地面作战分队的首领。Naomi Hunter加入FOXHOUND的医疗小组,并开始了在士兵身上的DNA理论研究和实验。  2002年,关塔纳摩湾建立起一个专门关押敌人的“X光基地”。  2002年,开发中的Metal Gear Gander,于南美进行演习时被由叛乱将军Augustine Eguabon指挥的Gindra Liberation Front(简称Gilif)抢走,开发人员被绑架并带回Gindra,也就是以前的世外桃源(Outer Heaven)。在Roy Campbell指挥下,固蛇潜入该基地,途中从幸存的Delta Force队员姬丝·珍纳(Chris Jenners)得知潜入部队已全部死亡,而叛乱的美军特种部队Black Chambers也在基地,首领是Viper。固蛇救出开发者Jimmy Wizard,得知Metal Gear已经装上了核弹。Viper威胁美国政府如果不放弃进攻就会用核弹攻击美国的任一城市。固蛇炸毁发电站打算阻止轨道炮发射,却被告知核弹依然可以发射,Jimmy Wizard也被炸死。固蛇潜入地下一百层,终于找到Metal Gear。这时Viper现身,告诉固蛇:Black Chambers叛乱的原因是不想一直做FOXHOUND的影子,希望能够帮CIA夺回Metal Gear争回面子。打败Viper后固蛇救回姬丝,姬丝告诉他她是陆军参谋长柏加下命令来的,目的是杀死将军和抹去一切和“Project Babel”相关的人和物。这时将军驾驶Metal Gear Gander出现,告诉他们一切都是自己的安排。固蛇打败将军,将军临死前告诉他真相:世外桃源是美国政府暗中援助的要塞国家,非正式地提供反美军事力量。当年Big Boss失控,美国将世外桃源推翻。后来世外桃源成了Gilif,美国想要让非洲出现反美势力,借战争派遣部队进驻,以维持冷战后美国的全球布局。这就是Project Bable。将军和陆军参谋长都是负责人。这时Viper再次出现并打算发射核弹,原来Metal Gear还是太空中装有核弹的卫星的指挥站。幕后的间谍Brian也被查出。最终固蛇击败Viper,阻止了核弹的发射。  2003年,克拉克博士(Dr.Clark、即PARA-MEDIC,FOXHOUND的医疗组长)死于想要逃跑的Gray Fox制造的实验室爆炸中。Naomi Hunter掩盖了事实并接手克拉克博士的工作。  2005年2月底,暗影摩西岛(Shadow Moses)上做演习的Metal Gear被叛乱的FOXHOUND队员夺走,借以勒索美国政府。固蛇再次被召回执行任务。史内克潜入基地,认识了Otacon和Campbell的侄女(实际上是女儿)Meryl。他发现军方秘密开发的是Metal Gear的最新型号REX。作为叛乱的主脑,液蛇打算利用Metal Gear威胁政府交出赎金和Big Boss以研究解决自己DNA缺陷的方法。史内克途中遇上成了改造忍者的Grey Fox,Meryl则在战斗中被敌人俘虏。史内克后来也被俘获,后被Grey Fox救出。史内克潜入地下基地,Grey Fox牺牲自己帮助史内克击败REX,液蛇也被史内克打败(这里有两种结局,救出Otacon或者救出Meryl)。液蛇在最后的追击战中死于Fox-die,其手臂后来被移植到奥塞罗特的断臂上。而FOXHOUND也被遣散。  2005年3月:George Sears(Solidus)辞去了美国总统的职务,他被James Johnson取代(实情是他被迫辞职,身体被改造)。  2006年,固蛇和Otacon组成了NGO“Philanthropy”,目的是阻止Metal Gear的生产及发展。  2007年4月30日:Jack(Raiden)和Rose第一次见面。8月8日,U.S.S. Discovery事件(曼哈顿外海油轮沉没事件、Manhattan Tanker Incident)发生。当时史内克打算潜入油轮获得新的Metal Gear Ray的情报并公之于世,但途中苏联佣兵团进入油轮打算抢回Ray,爱国者们派来的奥塞罗特趁机开枪打死佣兵团团长并夺走了Ray,并将事件责任嫁祸给史内克。油轮在战斗中沉没,对外公开消息指史内克已死。  2008年4月,特种部队DeadCell的成员Chinaman和Old Boy在意外中身亡("根据访谈,这两个角色原本设定为游戏合金装备2中出现,后戏份被删,其技能也延续到其他角色如Vamp身上")。  2009年:在名义上负责清理曼哈顿外海上沉没的油轮造成的油污而建成的Big Shell工场里,总统James Johnson被恐怖分子,也就是原来的特殊部队DeadCell成员挟持,Raiden作为“FOXHOUND”的成员前去营救总统,再遇被认为在2年前已经死去的史内克。在任务中他发现恐怖分子的目的并不在于赎金,而是工场下面的超级武器“Asenal Gear”。在总统James Johnson的“强迫”下死于Raiden枪下。Otacon随同史内克营救他的妹妹Emma,一方面是因为她有阻止Asenal Gear的电脑病毒,另一方面是出于个人感情。Raiden途中遇到恐怖分子首领Solidus,他自称自己的计划叫“自由之子”。后来Emma被杀,史内克通过“俘虏”Raiden得以潜入Asenal Gear,并和Raiden一起杀出一条血路。Raiden击败了数台Metal Gear Ray,最终不敌。这时候Emma的病毒生效,Asenal Gear停止运作。在场人员被奥塞罗特告知所有一切都不过是“爱国者们”背后操纵的一场演习。Asenal Gear撞向纽约,Raiden在华盛顿纪念堂屋顶上打败Solidus。  之后Raiden从“爱国者们”手上救出Olga的女儿Sunny,交由史内克和Otacon收养。Rose被释放,和Raiden一起生活,但Raiden得知自己的儿子流产了(实际上是Rose故意隐瞒)后整日酗酒,Rose离开Raiden改嫁Roy,由他帮忙保护Raiden的儿子。  20XX年(据考证可能是2014年):战争已经转由专业的PMC(私人雇佣兵)参与,PMC全部安装以Nano machine组成“SOP系统”(Sons of the Patriots,以Big Shell事件收集的数据构建的系统),以降低战争成本及控制士兵情感。Liquid Ocelot组建了最大的雇佣兵组织,并策划完全控制“爱国者们”AI系统。另一方面,史内克由于基因缺陷出现早衰,却决定再次投入阻止Liquid的战斗中。史内克在战场上重遇Naomi、Meryl以及改造成忍者身体的Raiden。通过重重波折,史内克找到了自己的亲生母亲EVA,得知“爱国者们”的真相,却亲眼看着她死去。Liquid得手控制了“爱国者们”的部分机能。Naomi以出卖史内克等人为代价,在Liquid那里获得消灭“爱国者们”的办法,最终放弃Nano machine的保护死去。史内克潜入Outer Haven,用电脑病毒破坏了“爱国者们”AI系统。最后从Liquid口中得知他其实就是奥塞罗特,只不过是用药物及心理暗示扮成液蛇。他本来的目的就是打算破坏“爱国者们”建立新的世界体制。史内克与Liquid Ocelot决战,将其击败。史内克在墓园遇见通过手术复生的Big Boss以及还在世的瑟罗上校(Major Zero),两人与史内克对话后死去。意识到自己不久于人世的史内克决定和Otacon环游世界。

  1998年潜龙谍影系列于PS平台上发表新作《Metal Gear Solid》,得益于PS机能相对先前的开发平台有大幅度跃进,作品首度以3D型态完成并在主流市场获得了优良的口碑,全球累计销量超过600万套,为系列作人气大幅提高的关键。2001年于PS2平台上的续作《潜龙谍影2 自由之子》更是立下了系列中的最高销量,全球累计卖出超过700万套。截至2019年,全系列作的累计销量已超过5500万份。  Metal Gear系列发展已超过了30年,其主干设定可以说是追加拼凑所得。例如初期的作品里一直没有提及固蛇自Big Boss的基因继承,在PS上的MGS才开始阐述。但是小岛本人在创作该系列之初并未料想到作品会如此受欢迎并长远发展,因此设定上的不完整仍然是可以理解的,虽然存在部分让人感到违和的内容,但小岛构建出的世界观仍然十分具有魅力。

  

  作为知名游戏的主角,虚拟角色Snake也曾代言多个产品广告。2004年,Snake曾代言大冢制药的食品CalorieMate,丛林背景中的Snake手上拿着CalorieMate。2008年6月10日,日本方面开始上市以《合金装备4》中主角Snake做代言的饮料Regain,广告中Snake喝过会变年轻。  《合金装备4》游戏中曾出现索尼爱立信W62S手机、Triumph摩托车、苹果iPod等产品,这也作为游戏代言产品的一个典型范例。  另外,合金装备也有对别的公司的游戏协助性地进行宣传。比如《合金装备4》中有一种道具可以让主角看起来像《刺客信条》中的主角,这样通过自家公司的游戏推广别的公司游戏,合金装备也可算是特例之一。

  2008年,由专业DIY小组Morpheon Mods制作的《合金装备4》限定版周边包,以17100美元的天价在网上拍出。其内容包括改装过的由游戏开发者亲笔签名的限定版主机,游戏中的鸭子闹钟,4种Regain 24功能饮料,《合金装备4》特别版主题T恤;游戏关键角色Otacon的自制刺绣补丁,自制猎狐犬主题贴纸,硬皮版《合金装备4》官方攻略,主角固蛇板画,《合金装备4》世界巡回活动首发日纪念狗牌。此外还特别赠送小岛秀夫在首发活动上的搞笑表情照片。该次拍卖的部分收益捐赠给一个慈善机构Child's Play。
是由日本科乐美公司发行,小岛制作的小岛秀夫主导开发的动作隐蔽类游戏系列及相关产物。系列自1987年的首作即由小岛长期担任游戏制作人,但由于小岛在2015年底从科乐美离职,故他所参与的作品也止于同年发行的《潜龙谍影V 幻痛》。截至2019年,全系列作的累计销量已超过5500万份。