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  在整个6、7世纪,东罗马帝国四面受敌,萨珊帝国从东部的叙利亚、埃及与安纳托利亚方向向帝国施加压力。斯拉夫人与阿瓦尔人在定居巴尔干的同时侵扰着希腊地区。伦巴第人占领了北意大利,在亚平宁半岛几无敌手。为了应对持续升高的国防压力,莫里斯皇帝在查士丁尼大帝新近夺回的西部行省成立了拉文纳和阿非利加总督府,并将军权与行政权合并委于当地总督,而这也直接颠覆了作为戴克里先改革基础的军、政两权分授制度。就其根本意义而言,这是一种在安全状况堪忧的行省中,承认并且确定当地将领拥有高于民政官员的突出地位。在5世纪查士丁尼一世治下,这种行政改制的趋势就以日臻明朗。查士丁尼将军权赋予了饱受兵燹的小亚细亚诸省总督。更重要的是,他也创建了兼具军事权限与行政权限“军务监区”(quaestura exercitus),并且废除了作为行政区划的埃及管区,在原先的各行省重新任命身受军、政大权的最高长官(Dux)。尽管如此,在帝国的大多数区域,旧行省制度一直沿用到640年代,直到穆斯林的帝国对边境地带展开了大规模攻势。穆斯林很快征服了埃及和叙利亚,并旋即导致了东罗马帝国在领土和人口上的巨大损失,这也意味着帝国业已处在生死存亡的边缘。为了应对空前的生存危机,帝国开始了彻底的改革重组,在小亚细亚的残留领土首先被分割成了四个军区,尽管早前的行政制度得以延续,但总督将军(stratēgos)拥有了最高的地区管理权。

  军区制的起源与早期特征在学术界中存有广泛争议,“Thema”一词的词源亦有待考证。但多数学者均认同君士坦丁七世的记录,即“军区”(Thema)一词起源于希腊语“thesis”,即“部署配置”。军区的具体建立时间也未在学界达成一致。在20世纪的多数时候,人们都认为军区制由赫拉克略(610-641在位)建立在拜占庭-萨珊战争时期。该论点最引人瞩目的支持者当属乔治·奥斯特洛格斯基,他的观点基于《告解者狄奥法恩斯编年史》中,在622年“赫拉克略驾临在军区的土地上”这一处记载。据奥斯特洛格斯基的说法,这至少表明了在小亚细亚的一些地区,军区的设立已经开始。但这一观点也遭到了其它学者的反对,近年的研究更倾向于将军区制的创立后推到君士坦斯二世在位期间(640年代至660年代),与奥斯特洛格斯基认为军区制从最开始就作为独立且定义清晰的军政合一区划而存在的观点相反,Thema最初可能单纯指军队本身,且直到7、8世纪相交之时,才转指驻有该军队的地区。  与年代问题相关的部分同样对应着社会与军事改制。奥斯特洛格斯基所持有的传统观点认为,军区制的建立同样意味着新型军队的形成,不同于以往过度依赖外国雇佣军,军区制下的拜占庭士兵多为在国家分配的军用庄园中从事农耕的兵农。但更多近年的学者们认为,军区制的形成并未形成冲击性的社会影响,它不过是对6世纪以来的既存趋势进行了合理的拓展。

  可以肯定的是,在7世纪中叶时候,东罗马帝国疆界已经收缩到了安纳托利亚,这也使得其成为了帝国最后一块完整的核心地域,因此也被重新划分成了几个区域,也即是后来的军区。从地域上来看,每一个军区都包含了数个旧行省,只有少数例外沿袭了原有界线。第一批的四个军区分别为:亚美尼亚军区(, Thema Armeniakōn,“亚美尼亚驻军”)、安纳托利亚军区(,“东方驻军”)、色雷斯西亚军区(,“色雷斯驻军”,切勿与后来设置的“色雷斯地区军区”混淆)、扈从军区(英语:Θέμα Ὀψικίου, Thema Opsikiou,“扈从军团”)。亚美尼亚军区于667年被首次提及,由亚美尼亚驻军移驻地发展而来,管辖范围包括了本都、小亚美尼亚和北卡帕多西亚,军区首府驻于阿马西亚。安纳托利亚军区为东方管区驻军移驻地发展而来,辖区包括小亚细亚中南部,军区首府为阿莫里姆。这两大军区构成了拜占庭安纳托利亚防线,并分别于穆斯林亚美尼亚和叙利亚接壤。色雷斯军区晚至740年代才被提及,由色雷斯驻军移驻地发展而来,管辖范围包括了小亚细亚的西海岸中段(爱奥尼亚——吕迪亚——卡里亚),军区首府可能在(Chonae)。扈从军区在680年被首次提及,由皇帝扈邑建立而成,辖区主要包括西北小亚细亚(比提尼亚、帕夫拉哥尼亚以及部分加拉太),军区首府位于尼西亚。值得一提的是,该军区将军仍保留了伯爵(komēs)头衔。  需要补充的一点是,具有海军军区性质的“海员”军事省(拉丁语:Carabisians 希腊语:Kαραβισιάνοι)在680年首次见于文献。可能由来自伊利里库姆省(Illyricum)或者军务监区(quaestura exercitus)的残余军队组成。“海员”军事省从未正式地建立军区,其管区主要包含了小亚细亚的南部海岸和爱琴海诸岛,将军驻地很可能在萨莫斯。在东罗马帝国与阿拉伯帝国的海上冲突中,“海员”军事省提供了大多数的海上力量用以抗衡在马斯兹战役后开始与帝国争夺东地中海霸权的阿拉伯舰队。事实结果证明,“海员”军事省难以胜任如此重任,并最终在720年遭到裁撤并由正式的“海员”海军军区()取而代之。  尽管有一段时间色雷斯地区的军政权力掌握在扈从军区将军手中,但在680年代,该区独立为一个新的军区“色雷斯地区军区”(θέμα Θρ<unk>κης,Thema Thrakēs),以期应对来自保加尔人的威胁。赫拉克里安王朝数位皇帝在希腊取得了一系列成功的军事行动也在相当大的程度上抵御了斯拉夫人对中部希腊的入侵,并且最后促成了赫拉斯军区的建立。在7世纪末,西西里也同样建立了军区,但意大利本土的控制权依旧在拉文纳总督的手中,并直到迦太基陷落为止,非洲总督亦具有同等权力。与此同时,在克里特岛和克里米亚南部飞地克尔森(Cherson)则建立了独立的殖民总督府(archontiai)。  综上所述,在该世纪的末尾,军区制已成为帝国的主要行政区划制度,但面积广阔的军区和高度集中的权力让军区将领愈发具有叛变倾向,例如图布伦特时代(695-715)叛乱与阿尔塔兹瓦德叛乱(741-742)。阿尔塔瓦兹德叛乱的平息昭示着安纳托利亚军区制度的第一次重大改革:权力过于集中的扈从军区被拆分出两个新军区——首府在安卡拉的布瑟拉里安军区(θέμα Βουκελλαρίων, thema Boukellariōn,“布瑟拉里军团”,得名于同名精锐近卫骑兵团),和首府在尼科米底亚的选拔军区(θέμα Ὀπτιμάτων, thema Optimatōn,“选拔军团”,得名于同名精锐哥特人兵团)。

  且不论军区的突出地位,在其正式成为帝国基本行政单位前,仍有一段较长的过渡时期。尽管在8世纪时军区就已与固定的地域联系在一起,财政军务直到该世纪末才不再沿用旧行省制度,而以军区为单位各自运行。这一进程在9世纪中叶趋于成熟,并导致军区将军身兼军政大权。比较经典的军区制范式在《拜占庭军论》(Klētorologion)和《帝国行政志》(De Administrando Imperio)中均有提及。  同时,在8世纪晚期至9世纪早期,为了在安纳托利亚中心地带防范来自阿拉伯人的侵攻和袭扰,一系列的小规模前线防区得以建立,称之为「要冲区」(kleisourai)。该词本指一些具有重要战略意义的筑堡壑谷,后转指兼具进行游击作战与抗击中小规模敌袭任务的独立作战指挥单位,并随后逐渐升级为全编制的标准军区。

  在10世纪三位“士兵皇帝”尼基弗鲁斯二世、约翰一世、巴西尔二世的率领下,新占土地上成立了新一批的军区,其平均面积要小于在7、8世纪建立的军区。与此同时,出现了一种被称为“小军区”(μικρὰ θέματα)或“亚美尼亚式军区”(ἀρμενικὰ θέματα)的新型军区。根据拜占庭方面的原始资料,该种军区明显区分于“大”的或“罗马式”的军区。多数小军区仅由一座堡垒及附近地域构成,由“初等将军”(阿拉伯人称其为zirwar,亚美尼亚人称其为zoravar)率领的一千人(多为步兵)负责驻守。正如其名,其驻防军队多为亚美尼亚人,或者本地土著,抑或是从由他地强行迁移而来。小军区的一大特征便是高比例的军官数量,仅在charpezikon一区就计有22名资深军官和47名见习军官。  小军区在被设置成适于守备的同时,亦被赋予了回击大型侵扰和进行持久进攻作战的能力。正因如此,从9世纪60年代起,愈来愈多从重装骑兵改编或新建立的营团被部署在边境地带。为了指挥协调为数众多的前线小军区,在地区督军(Dux,δούξ )领下的区域性指挥部得以建立。在东方,三个最初的指挥部分别为:安条克(Antioch)、喀尔狄亚(Chaldia)、美索不达米亚(Mesopotamia)。随着在7世纪东罗马帝国扩张至大亚美尼亚,三个指挥部被扩建或更替为:伊比利亚(Iberia)、瓦斯普拉肯(Vaspurakan)、艾德萨(Edessa)、阿尼(Ani)。而亚美尼亚军区似乎也是在同样的经纬下于11世纪中期被划在了一位将军的管辖下。  数位“士兵皇帝”展开的攻势在巴西尔二世时达到巅峰,在1025年时东罗马帝国比她的任何一个敌人都要更强盛。同时,极具机动性的职业军人——(Tagmata)的地位迅速跃居于各内戍军区部队之上,而后者也很快地遭到了忽略。事实上,从11世纪早期开始,越来越多的应征兵都选择用缴纳现金的方式来逃避服役。而此时前线将领都有能力来应对大多数的本地安全威胁,这样一来军区系统就难免遭到事实上的削弱,旧军区制度的瓦解也导致了东罗马帝国在战略纵深防御能力上的崩坏,再加上日渐增长的对雇佣兵和附庸国军队的依赖,以及因君士坦丁堡官僚集团和手握重镇的军事精英间的裂隙扩大而导致的暴乱和内战,在1071年的曼齐刻尔特战役之后,拜占庭军队遭遇了一次严重的危机,并在战役过后完全地崩溃。

  “军区”一词本身就暧昧模糊,它既指一种军事占据、亦指一种行政区划。军区事实上是一种将小块土地委任给士兵耕种的屯田体制。这些务农士兵从严格意义上讲仍是军事单位,且其耕作土地仍归属国有。正因其运作特征,士兵薪饷得以降低,并且士兵个人一旦接受了屯田协议后,即代表同意他们的后代仍在军区中同时承担军事与农务工作,这也同时减少了对不受欢迎的征兵制的需求,也能更加节省地维持军队。军区制也能保证在新征服的土地上进行垦殖作业,因为在征服战争中总是有大量土地被并入公共土地。  军区将军事实上不仅拥有在军事层面上的指挥权,同时还建有行政与军事司法权。正因如此,戴克里先确立的军政分属政策遭到了废止,帝国也回到了一个更像罗马共和国的寡头政治体系——彼时行省总督同时也号令着当地的军队。
军区(希腊语:,拉丁转写:themata,单数形式:thema)为东罗马帝国中期的行政区划制度。7世纪中叶,在穆斯林征服了部分拜占庭领土后,军区制度得以建立并取代了由戴克里先和君士坦丁一世建立的行省制度。最初的军区是从驻屯军的的驻扎营地发展而来,军区亦与该驻营单位的名称相对应。随着旧军区遭到分割、帝国获得新的领土,军区制在9至10世纪达到了顶点。在11至12世纪,军区制经历了巨大的变化,但直到帝国灭亡,军区制始终统辖着行省级地区的行政与财政。