Szkoła została założona w 1993 roku, na polecenie Geshe Lharampa Nagri Choszed (1920-1998), pochodzącego z Tybetu, który przybył do Phuktal w 1959 roku po chińskiej inwazji na Tybet.
- Co? Nagri Choszed przyniósł ze sobą wysoki poziom buddyjskiej edukacji filozoficznej i szkolenia, do których odizolowani mnichowie z Phuktal praktycznie nie mieli dostępu przez kilka wieków. Przywrócił starożytną tradycję nauki i uczoności w Phuktal i pouczał mnichów w filozofii, tradycyjnych systemach rytualnych i moralnej dyscyplinie. Wysłał również wielu mnichów do celu zaawansowanego uczenia się w innych instytucjach, którzy wrócili do Phuktal i zaczęli uczyć.