W czasie II wojny światowej zarówno australijskie, jak i japońskie bomby spadły na więzienie. Po japońskiej inwazji na Portugalijski Timor
W 1942 roku budynki więzienia, które przetrwały ulewy, zostały przekształcone przez Japończyków w stanowisko dowodzenia. Po zakończeniu II wojny światowej zniszczone budynki nie zostały odrestaurowane.