Wilson dążył do zacieśnienia stosunków z Ameryką Łacińską i miał nadzieję stworzyć panamerykańską organizację arbitrażową w sporach międzynarodowych. Negocjował również traktat z Kolumbią, który zapłaciłby temu krajowi odszkodowanie za rolę USA w secesji Panamy, ale Senat pokonał ten traktat. Jednak Wilson często interweniował w sprawy Ameryki Łacińskiej, mówiąc w 1913 roku: "Uczę republiki Ameryki Południowej, by wybierały dobrych ludzi". Republika Dominikańska była de facto amerykańskim protektoratem od prezydentury Roosevelta, ale cierpiała na niestabilność. W 1916 roku Wilson wysłał na wyspę wojska, które zajęły ją, a amerykańscy żołnierze pozostaną na wyspie do 1924 roku. W 1915 roku USA interweniowały.
w Haiti po powstaniu, które obaliło rząd Haiti, rozpoczynając okupację, która trwała do 1919 roku. Wilson upoważnił również do interwencji wojskowych na Kubie, Panamie i w Hondurasie. Traktat Bryan-Chamorro z 1914 roku przekształcił Nikaragwę w kolejny de facto protektorat, a Stany Zjednoczone stacjonowały tam żołnierzy podczas prezydentury Wilsona.