Długi okres szkolenia nastąpił na Atherton Tablelands, ponieważ polityka między sojusznikami spowodowała ograniczone możliwości zatrudnienia australijskich żołnierzy przez cały 1944 i do 1945 roku. W rezultacie dopiero w połowie 1945 roku 2/32 podjęła ponowną walkę. Kampania na Borneo ostatecznie okazała się ich ostatnim zaangażowaniem w wojnę. Podczas pierwszych operacji do przejęcia Labuan
, batalion pozostał w rezerwie i dotarł na brzeg dopiero 12 czerwca. Batalion został przetransportowany z Labuan do zatoki Padas Bay w ciągu czterech dni, 16 czerwca, za pośrednictwem jednostek desantowych, a następnie wziął udział w zdobyciu Weston następnego dnia. Następnie 2/32nd patrolowała w kierunku Beaufort, przeprowadzając atak na miasto w porozumieniu z &lt;a href="2/43rd%20Battalion%20%28Australia%29"&gt;2/43rd Battalion&lt;/a&gt; w dniu 26 czerwca, aby zabezpieczyć linię kolejową Weston <unk> Beaufort. Na początku lipca batalion ruszył w kierunku Papar. Główny postęp został dokonany wzdłuż linii kolejowej, a ruch flankowy został zapewniony przez jedną kompanię, która przeprowadziła lądowanie amfibijne na południe; po tych ruchach miasto zostało następnie zajęte 12 lipca 1945 r.