W 1691 roku Churchill został mianowany podpułkownikiem w Gwardii Konnej i dowodził 96-brojowym HMS "St. Andrew" w
Barfleur i La Hogue w czerwcu 1692 roku. Jednak afera Torrington podzieliła flotę, a kiedy Russell został pierwszym lordem Admiralicji w 1693 roku, zrezygnował z służby. Utrzymał swoje miejsce w parlamencie i kontynuował bliskie związki z księciem Jerzym; kiedy Russell przejął emeryturę w 1699 roku, został mianowany lordem komisarzem admiralicji.