"Paul Jacobi" spędził większość 1943 roku nieaktywny w Arktyce przed powrotem do Niemiec we wrześniu dla kolejnego refit. Został poważnie uszkodzony w wyniku ataków lotniczych aliantów na Kiel i nie był ponownie operacyjny do końca 1944 roku. Spędził większość wojny eskortując statki podczas ewakuacji Niemców z Prus Wschodnich.
i bombardowanie sił radzieckich. Statek został schwytany przez aliantów w maju 1945 roku i spędził resztę roku pod kontrolą brytyjską, ponieważ alianci zdecydowali, jak pozbyć się schwytanych niemieckich statków.