Po kapitulacji bastionu Konfederacji 4 lipca 1863 roku 106. został przeniesiony do Helena, Arkansas, pod dowództwem generała Fredericka Steele'a. Uczestniczył w ataku na Little Rock i bitwie pod Bayou Fourche.
10 września 1863 roku, który zabezpieczył Little Rock i większość Arkansas dla Unii. Przez resztę wojny 106. został przydzielony do straży w całym Arkansas, utrzymując pokój i strzegąc przed ewentualnymi kontratakami Konfederacji w tym regionie. W sprawozdaniu z Illinois Adjutant General podsumowuje krótko służbę 106. Illinois: "Z wyjątkiem oblężenia Vicksburg, pułk nie brał udziału w żadnej z najbardziej znanych bitew, ale mimo to dobrze spełnił swoją rolę w stłumieniu rebelii i poniósł wiele utrat i trudności, maszerując przez bagna i bagna, strzegąc kolei, własności rządowej, walcząc i szukając pożywienia, o czym świadczy długa lista ofiar".