Komendy obu flot zmieniły ręce po Notium. Ze względu na ograniczenia kadencji na stanowisku navarcha, Lysander został zastąpiony przez Kallikratydasa; po stronie ateńskiej upadek Alkibiada również obalił jego przyjaciół Thrasybula i Teramena, a ogólne dowództwo zostało nadane Kononowi. W ciągu następnego roku floty zderzyły się dwukrotnie, najpierw w bitwie, w której Kallikratidas z dwukrotnie większą liczbą statków niż Conon pokonał Ateńczyków i uwięził ich w Mitylenie; ateńska flota ratunkowa zdecydowanie pokonała i zabiła Kallikratidasa w Arginusae. Te zwycięstwa ateńskie okazały się jednak bezużyteczne, ponieważ w 405 r. p.n.e. Lisander powrócił do nieoficjalnego dowodzenia i zniszczył ateńską flotę w bitwie pod Aegospotami.
, kończąc tym samym wojnę peloponeską ze zwycięzcą Spartą.