Na świt 3 czerwca, wystrzelił dziewięć B5N, eskortowanych przez sześciu Zero, by zaatakować Dutch Harbor.
Na wyspie Unalaska. Jeden B5N rozbił się podczas startu, ale sześć B5N i wszystkie Zero były w stanie przetrwać złą pogodę, niszcząc dwa PBY i wyrządzając znaczne uszkodzenia zbiorników do przechowywania ropy i koszar. Drugie nalot rozpoczęto później tego samego dnia, aby zaatakować grupę niszczycieli odkrytych przez samoloty z pierwszego ataku, ale nie udało im się znaleźć celów. Jeden Zero z "Ryūjō" z drugiego ataku został uszkodzony przez Curtissa P-40 i rozbił się na wyspie Akutan. Samolot, nazwany później Akutan Zero, pozostał w dużej mierze nienaruszony i później został uratowany i przetestowany. Następnego dnia dwa lotniskowce rozpoczęły kolejny atak powietrzny, składający się z 15 Zero, 11 D3A i 6 B5N, które z powodzeniem zbombardowały Dutch Harbor. Wkrótce po wystrzeleniu samolotów, Amerykanie zaatakowali lotniskowce, ale nie zdołali wyrządzić żadnych szkód. Bombowiec Martin B-26 Marauder i PBY zostały zestrzelone przez Zero, a bombowiec Boeing B-17 Flying Fortress został zestrzelony przez flak podczas ataku.