Preston jest jedną z kilku osób określanych jako "Piąty Beatle". W pewnym momencie podczas sesji "Get Back" John Lennon zaproponował pomysł, aby dołączył do zespołu (na co Paul McCartney odpowiedział, że osiągnięcie porozumień z czterema osobami jest wystarczająco trudne). Preston grał na organach i fortepianie elektrycznym dla The Beatles podczas kilku sesji "Get Back"; niektóre z tych sesji pojawiły się w filmie "Let It Be" i na jego towarzyszącym albumie. Preston również towarzyszył zespołowi na fortepianie elektrycznym przez
Koncert na dachu, ostatni występ grupy. W kwietniu 1969 roku ich singiel "Get Back" został przypisany do "The Beatles z Billy Prestonem", jedynym razem, gdy takie wspólne uznanie zostało udzielone na oficjalnym wydaniu zatwierdzonym przez Beatlesów (w odróżnieniu od niezatwierdzonej ponownej publikacji niektórych nagrań z epoki Hamburga, w których byli grupą wspierającą Tony'ego Sheridana). Pochwała została przyznana przez Beatlesów, aby odzwierciedlić zakres obecności Prestona na utworze; jego fortepian elektryczny jest widoczny w całym utworze i gra rozszerzone solo. Preston pracował również, w bardziej ograniczonej roli, na albumie "Abbey Road", przyczyniając się do utworów "I Want You (She's So Heavy) " i "Something".