Na początku 1942 roku, część personelu KNIL uciekła do Australii. Niektórzy rdzenni mieszkańcy zostali uwięzieni w Australii pod zarzutem sympatii dla Japończyków. Reszta rozpoczęła długi proces regrupowania. Pod koniec 1942 roku, nieudana próba lądowania na Timorze Wschodnim, w celu wzmocnienia australijskich komandosów prowadzących kampanię partyzancką
zakończyła się utratą 60 holenderskich żołnierzy.