Napisz kontynuację tego paragrafu - Po komunistycznym zamachu stanu
W 1978 Ahmadzai wrócił do Afganistanu, by dołączyć do mudżahedinów. Był bliskim współpracownikiem Burhanuddina Rabbani, był zastępcą jego partii Jamiat-e Islami, ale następnie opuścił ją i dołączył do partii Islamskiej Organizacji Dawah Afganistanu Abdul Rasul Sayyaf w 1992 r., w roku, w którym zakończyła się komunistyczna władza. Służył jako minister w postkomunistycznym rządzie afgańskim, różnie jako minister spraw wewnętrznych, budownictwa i edukacji, a później został premierem w latach 1995-1996, chociaż bagatelizował znaczenie tych stanowisk, biorąc pod uwagę chaos spowodowany walkami w tym czasie.