W maju 1942 roku, porucznik Shiga przejął dowództwo nad grupą myśliwską na lotniskowcu "Jun'yō", stanowisko, które zajmował do grudnia 1942 roku. W tym czasie Shiga dowodził myśliwcami lotniskowca w bitwie pod Dutch Harbor.
i wyspy Santa Cruz. W tej ostatniej bitwie zaatakował amerykańskie lotniskowce, w której pierwszy został później zatopiony, podczas gdy "Enterprise" został mocno uszkodzony. Następnie dowodził grupą myśliwską lotniskowca "Hiyō's" od grudnia 1942 do stycznia 1943 roku, podczas gdy lotniskowiec był w porcie w Japonii.