Filipiny po raz pierwszy wzięły udział w Młodzieżowych Igrzyskach Olimpijskich podczas pierwszych Igrzysk Olimpijskich w 2010 roku. Filipiny uczestniczyły w każdej edycji Letnich Igrzysk Olimpijskich dla Młodzieży i dwóch edycjach Zimowych Igrzysk Olimpijskich dla Młodzieży, 2012
i Igrzysk w 2020 r.