Po inwazji niemieckiej na Grecję w 1941 roku nazistowscy Niemcy przenieśli go do obozu koncentracyjnego w Dachau, skąd został uwolniony w maju 1945 roku. Po powrocie do Grecji ponownie przejął kierownictwo KKE od Georgiosa Siantosa, pełniącego obowiązki sekretarza generalnego KKE od stycznia 1942 roku. Cholerny Dekemvriana.
Wydarzenie zakończyło się komunistyczną klęską. Zachariadis ogłosił teraz swój polityczny zamiar walki KKE o demokrację i władzę ludową poprzez wybory.