W czerwcu 1992 Avila dołączył do Florida Marlins jako asystent dyrektora operacji w Ameryce Łacińskiej. Po dwóch sezonach z Marlins, został awansowany na dyrektora operacji w Ameryce Łacińskiej. Pod kierownictwem Avili Marlins podpisali 1997 NLCS
i MVP serii światowej Liván Hernández, podczas wyścigu Florydy.