Jako kapitan dwunastego oddziału wolontariuszy z Connecticut, De Forest brał udział w wojnie domowej w Luizjanie w 1862 roku i w kampanii w dolinie Shenendoah w 1864 roku.
przed zwolnieniem ze względu na problemy zdrowotne. W 1867 opublikował "Konwersję panny Ravenel z secesji na lojalność" jako krytykę społeczeństwa niewolniczego Południa.