1 listopada 1937 roku Mustafa Kemal Atatürk mianował Bayara premierem 9. rządu Turcji po tym, jak İsmet İnönü opuścił rząd. Kontynuował pełnić funkcję premiera po śmierci Atatürka, a İnönü został prezydentem w 1938 roku (10 rząd Turcji). Różnice zdań z Inönü doprowadziły go do rezygnacji z stanowiska 25 stycznia 1939 roku.
Różnice z Inönü