W 1943 roku Friedman dołączył do Wydziału Badań Wojennych na Uniwersytecie Kolumbijskim (na czele z W. Allenem Wallisem i Haroldem Hotellingem), gdzie spędził resztę II wojny światowej pracując jako statystyk matematyczny, koncentrując się na problemach projektowania broni, taktyki wojskowej i eksperymentach metalurgicznych. W 1945 roku Friedman złożył do Kolumbii jako swoją dysertację doktorską "Rozchody z niezależnej praktyki zawodowej" (współtworzone z Kuznetsem i ukończone w 1940 roku). Uniwersytet przyznał mu doktorat w 1946 roku. Friedman spędziłł rok akademicki 1945-1946 na Uniwersytecie Minnesoty (gdzie pracował jego przyjaciel George Stigler).
1945 r.