Na początku kwietnia 1945 roku, kilka tygodni przed zakończeniem wojny
, i zmagając się z desperackim niedoborem wykwalifikowanej siły roboczej dzięki rzezi wojny, władze wojskowe pobrali Iwana Katza z obozu koncentracyjnego do pracy jako lekarz wojskowy dla jednostek w mieście. Nie jest jasne, czy kiedykolwiek nabył jakiekolwiek praktyczne doświadczenie medyczne do tego momentu, ale medycyna była jednym z przedmiotów, które studiował na uniwersytecie trzy i pół dekady wcześniej. 20 kwietnia 1945 roku awansował na stanowisko głównego lekarza niemieckich jednostek stacjonujących w Mauthausen. Źródła oddają hołd jego roli w zapewnieniu, że kiedy amerykańskie wojska przybyły na początku maja 1945 roku, twierdza Mauthausen została przekazana bez jednego strzału z obu stron. Katz pozostał lekarzem w okresie od 6 maja do 7 czerwca 1945 r., opiekując się swoimi współocalałymi z ogromnego obozu koncentracyjnego, teraz zatrudnionego nie przez niemiecką armię, ale przez amerykańską armię okupacyjną.