Jako doradca rządu Manchukuo w czasie wojny, z siedzibą w Dairen, Yasue coraz mniej angażował się w Plan Fugu w jakiejkolwiek oficjalnej roli. Utrzymał jednak kontakty i zaangażował się w społeczność żydowską w Szanghaju, która powstała w wyniku jego działań. Kiedy Związek Radziecki zaatakował Mandżuko
W sierpniu 1945, tuż przed kapitulacją Japonii i końcem wojny, Yasue nie próbowała uciec z kontynentu. Zorganizował uroczyste pożegnanie ze swoją rodziną, w którym wyraził pogląd, że całe jego pokolenie jest winne wojny i jej wyników. Nie uznał za honorowe uciec od odpowiedzialności, więc pozwolił się złapać sowieckiej armii.