Dowiedział się o chininie w Londynie, Castro Sarmento opracował lek znany jako Água de Inglaterra, który stał się popularny w Portugalii, gdzie w południowej części kraju nadal była szeroko rozpowszechniona malaria. W roku 1731 opracował plan ogrodu botanicznego w Coimbrze. Castro Sarmento korespondował z wieloma uczonymi, między innymi z prof. João Mendes Sachetti Barbosa z Lizbony, który poinformował go o straszliwym trzęsieniu ziemi
Zniszczyła stolicę Portugalii w 1755 roku i z jezuitą B. Soaresem, który przekazał mu swoje obserwacje astronomiczne dokonane w portugalskiej kolonii Brazylii. Był zdecydowanym zwolennikiem newtonianizmu i starał się włączyć go do teologii żydowskiej. Opublikował "Theorica verdadeira das marés, conforme à philosophia do incomparable cavalhero Isaac Newton" (Traktat o prawdziwej teorii pływów, zgodnie z filozofią niezrównanego dżentelmena Izaaka Newtona), pierwszą książkę w języku portugalskim, która opowiadała się za ideami Newtona (Londyn, 1737).