Po inwazji niemieckiej w 1939 roku Wielka Polska została włączona do nazistowskich Niemiec, stając się prowincją nazwaną później Reichsgau Wartheland (niemiecka nazwa rzeki Warta). Polska i żydowska populacja została sklasyfikowana przez nazistów jako nieludzka i poddana zorganizowanemu ludobójstwu, obejmującemu masowe mordowanie i czystki etniczne, z wieloma byłymi urzędnikami i innymi uważanymi przez nazistów za potencjalnych wrogów, którzy zostali uwięzieni lub straceni, w tym w słynnym obozie koncentracyjnym Fort VII w Poznaniu. Poznań został uznany za miasto-fortece (miejskie twierdzę) w końcowych etapach wojny, zajęte przez Armię Czerwoną w bitwie pod Poznańem
, która zakończyła się 22 lutego 1945 r.