Francisco Javier Arana Castro urodził się 3 grudnia 1905 roku w Villa Canales w Gwatemali. Jego rodzice, Ángel María Arana i Margarita Castro, pochodzili z rodziny niższej klasy średniej. Miał oba hiszpańskie
i dziedzictwo rdzennych mieszkańców, a ta ostatnia cecha była wizualnie bardziej widoczna. Nie miał formalnego wykształcenia, ale był stosunkowo dobrze wykształcony, a jego współcześni opisali go jako sprytnego i inteligentnego, a także jako charyzmatycznego i towarzyskiego człowieka. Był opisywany jako kiepski mówca publiczny, ale jako bardzo przekonujący człowiek w intymnych rozmowach. W 1946 roku, podczas rewolucji w Gwatemali, pracownik ambasady Stanów Zjednoczonych opisał jego politykę jako nacjonalistyczną, a także lekko proamerykańską.