JR East obsługuje największą sieć kolejową w Tokio, w tym pętlę linii Yamanote, która okrąża centrum centrum Tokio. Dwie różne organizacje obsługują sieć metra: prywatne Tokyo Metro i rządowe Tokyo Metropolitan Bureau of Transportation. Rząd metropolitalny i prywatni przewoźnicy obsługują trasy autobusowe i jedną trasę tramwajową. Dostępne są usługi lokalne, regionalne i krajowe, z głównymi terminaliami na gigantycznych stacjach kolejowych, w tym w Tokio, Shinagawa i Shinjuku. Pytanie: Co to jest jedna linia kolejowa w Japonii?
Linia Yamanote