Nie mogąc uzyskać wysokiej jakości jazdy w 2001 roku, Gené zdecydował się podpisać kontrakt z Williamsem jako kierowca testowy. Prowadził trzy Grand Prix dla zespołu jako tymczasowy zastępca. Pierwszym z nich był Grand Prix Włoch w 2003 roku, gdzie Ralf Schumacher nie był w stanie ścigać się z powodu wstrząsu mózgu. Gené dobrze zastąpił swojego kolegę z drużyny, zdobywając cztery punkty za piąte miejsce, ale Schumacher wrócił do samochodu na następny wyścig w USA. Po kontuzji pleców Schumachera na USGP 2004 Gené jechał w francuskich
i Grand Prix Wielkiej Brytanii, ale później stracił miejsce w wyścigu z Antônio Pizzonią i nie ścigał się ponownie w F1.