W swoim pierwszym wyścigu z Alpine'em, Alonso został zmuszony do wycofania się po tym, jak plastikowe śmieci weszły w jego kanał hamulcowy. W
W Grand Prix Emilii Romagni 2021 ukończył P11 po kwalifikacji P15, a jego kolega z zespołu Ocon zajął pierwsze miejsce w P10, ale obaj awansowali o jedną pozycję po karze Kimi Räikkönen, co dało Alonso jego pierwsze punkty w sezonie. Na Grand Prix Węgier 2021 Alonso tymczasowo prowadził wyścig, zanim wylądował w boxie i spadł na czwarte miejsce, wyprzedzając Lewisa Hamiltona. Współzawodnik Ocon przyznał, że obrona Alonsona przed Hamiltonem umożliwiła mu osiągnięcie pierwszego zwycięstwa w wyścigu. W sierpniu 2021 roku Alonso skorzystał z opcji przedłużenia kontraktu na ten sezon.