W drugiej połowie 1926 roku Berek służył w 83 Pułku Piechoty w Kobrynie. W grudniu 1926 został przeniesiony z powrotem do 9 Pułku Piechoty Legionowej, a w okresie od maja 1929 do września 1931 roku uczęszczał do Wyższej Szkoły Wojennej w Warszawie. Po ukończeniu kursu oficerskiego był szefem sztabu 4. Dywizji Piechoty stacjonującej w Toruniu (1931 - 1934), a w latach 1934 - 36 dowodził 1. Batalionem Strzelców w Chojnicach. W dniu 1 stycznia 1935 r. awansowany do stopnia podpułkownika, Berek służył w Polskim Sztabie Generalnym (październik 1936 - lipiec 1939). Kilka tygodni przed inwazją na Polskę został wysłany do Jarosława, do dowodzenia III Pułkiem Piechoty Legionów. Berek pozostał na stanowisku aż do kapitulacji twierdzy Modlin, 29 września 1939 r. (patrz Bitwa pod Modlinem
)