Po zdobyciu Okinawy, Trzecia Flota skoncentrowała się na operacjach przeciwko samej Japonii. Od 10 do 29 lipca 1945 roku "Merrimack" wspierał naloty o przytłaczającej sile na japońskie cele, co przyspieszyło zakończenie wojny. Następne
Po kapitulacji Japonii 15 sierpnia 1945 roku "Merrimack" odbył kilka rejsów między zachodnim wybrzeżem Stanów Zjednoczonych a Azją Wschodnią, przynosząc ropę dla statków wspierających okupację Japonii i działających wzdłuż wybrzeży Chin i Korei. Został przydzielony do Military Sea Transportation Service (MSTS) w październiku 1949 r., krótko przed rozpoczęciem remontu przed inaktywacją. "Merrimack" został wycofany z eksploatacji 8 lutego 1950 r. i wszedł do Atlantyckiej Floty Rezerwowej w Orange w Teksasie.