Po upadku Filipin, dywizja rozpoczęła szkolenie do ataku na Japonię, ale
Poddanie się było najważniejsze. Dywizja przeniosła się do Japonii, gdzie przez kilka miesięcy zajęła wyspę Honshū. 41 Dywizja Piechoty została unieruchomiona w Kure-Hiro w Japonii 31 grudnia 1945 roku.