Jednocześnie, odmowa Portugalii zobowiązania się do systemu kontynentalnego, i hiszpańska niepowodzenie w utrzymaniu doprowadziły do wojny półwyspowej i wybuchu wojny Piątej Koalicji. Francuzi zajęli Hiszpanię i utworzyli królestwo hiszpańskie, kończąc sojusz między tymi dwoma krajami. Wkrótce nastąpiło silne zaangażowanie Brytyjczyków na Półwyspie Iberyjskim, podczas gdy brytyjski wysiłek zdobycia Antwerpii zawiódł. Napoleon nadzorował sytuację w Iberii, pokonując Hiszpanów
, i wydalenie Brytyjczyków z Półwyspu. Austria, pragnąca odzyskać terytoria utracone podczas wojny Trzeciej Koalicji, zaatakowała państwa kliencki Francji w Europie Wschodniej. Napoleon pokonał piątą koalicję pod Wagram.