Ale te oświeceniowe reformy okazały się nieproduktywne, albo być może zbyt późne, by stłumić żądania kolonii. Cała historia tego wicekrólestwa była naznaczona rosnącymi niepokojami wewnętrznymi i niestabilnością polityczną. W latach 1780-1782 powstanie Túpaca Amaru II
Zainspirował gwałtowny powstanie Aymara na górze Peru, demonstrując wielką niechęć do władz kolonialnych zarówno przez mieszaniec i rdzennych mieszkańców. Dwadzieścia pięć lat później Criollos, rdzenni mieszkańcy pochodzenia hiszpańskiego, z powodzeniem bronili się przed dwoma kolejnymi próbami podboju przez Brytyjczyków Buenos Aires i Montevideo. To wzmocniło ich poczucie autonomii i władzy w czasie, gdy hiszpańskie wojska nie były w stanie im pomóc.