W czasie wojny rosyjsko-japońskiej w latach 1904-1905 "Yaeyama" brała udział w bitwie morskiej pod Port Arthur i następnej blokadzie tego portu. Pomimo niewielkich rozmiarów i przestarzałości, był również obecny w bitwie nad Żółtym Morzem.
i ostatecznej decydującej bitwie pod Cusimą, jak również japońskiej inwazji na Sachalin, gdzie jej duża prędkość uczyniła ją przydatną do przenoszenia wrażliwych rozkazów i wiadomości między statkami i z statku na brzeg.