Na początku 1942 roku Imperium Japońskie zaatakowało Morotai w ramach kampanii w Holenderskich Indiach Wschodnich. Siły amerykańskie i ich sojusznicy rozpoczęli bitwę pod Morotai.
bombardowanie wyspy w sierpniu i inwazja we wrześniu. Japońskie siły cesarskie utrzymały się na Morotai aż do 1945 roku, ale nie zdołały wypędzić oddziałów aliantów. W drugiej połowie 1944 roku na Morotai wylądowało 61 tys. żołnierzy. Dwie trzecie z nich to inżynierowie, którzy szybko stworzyli obiekty, w tym porty i dwa pasy startowe oraz rozległe magazyny paliwa.