Napisz kontynuację do tego paragrafu - Ze względu na strategiczne położenie wzdłuż ważnych linii infrastrukturalnych, a także z powodu kwitnącego handlu, miasto wzbogaciło się. Pozwoliło to na pewien stopień wolności (zwłaszcza na terytoriach kontrolowanych przez Habsburgów i) w Konfederacji Szwajcarskiej, która zakończyła się utworzeniem kantonów szwajcarskich przez Napoleona w 1799 roku. W latach 1656 i 1712 (pierwsza wojna pod Villmergen i wojna pod Toggenburg)
, lub Druga wojna w Villmergen), Rapperswil był zaangażowany w wojny między kantonami katolickimi i reformowanymi Starej Konfederacji Szwajcarskiej. Rapperswil był początkowo częścią Helwety i kantonu stolicy Linth. Po ustawie o mediacji z 1803 r. dołączyła do kantonu St. Gallen, a dawne "Herrschaft Rapperswil" zostało podzielone na gminy Rapperswil i Jona.