Na drodze do olimpiady w Sydney Wouda brała udział w mistrzostwach Europy w dziedzinie sportów wodnych w 2000 roku
w Helsinkach w Finlandii, gdzie zdobył brązowy medal w biegu swobodnym 4×200 m wraz z Martijnem Zuijdwegem, Markiem van der Zijdenem i Pieterem van den Hoogenbandem. Wouda zdobył brązowy medal w zawodzie 4×200 m swobodnego stylu na Letnich Igrzyskach Olimpijskich 2000 w Sydney wraz z Martijnem Zuijdwegem, Johanem Kenkhuisem i Pieterem van den Hoogenbandem. Indywidualnie zajął piąte miejsce na 200 m indywidualnej medley i 13 miejsce na 100 m piersiowym. W drużynie 4×100 m medley zajął czwarte miejsce, tracąc medal wraz z Klaasem-Erikem Zweringiem, Jorisem Keizerem i Pieterem van den Hoogenbandem. Po olimpiadzie w Sydney Wouda zrezygnował z pływania. Sześć miesięcy później dziennikarz holenderskiego dziennika NRC Handelsblad, Mark Hoogstad, napisał książkę opisującą zmartwychwstanie holenderskiego pływania z pomocą kariery Woudy.