Jak komunistyczne powstanie zbliżało się do końca, proklamacja Malezji zjednoczyła federację Malezji z Sarawak i Sabah, tworząc niezależny kraj Malezji. Warunki wywołane kolejnym komunistycznym powstaniem
Wojna przeciwko nowo niepodległemu państwu malezyjskiemu doprowadziła do stłumienia sprzeciwu w swoich szeregach przez MCP, powodując podział wielu frakcji, które zaczęły walczyć między sobą. To doprowadziło do ostatecznego rozwiązania Partii Komunistycznej Malezji w 1989 roku, gdy radykalna lewica w kraju zaczęła szukać alternatyw dla marksizmu-leninizmu.