Po śmierci Józefa Stalina Komisja stała się znana jako "Wysoka Komisja ZSRR w Niemczech". Były doradca polityczny generała Czujkowa, Władimir Semionow, został mianowany wysokim komisarzem. Urząd Wysokiego Komisarza odegrał decydującą rolę w stłumieniu antyrządowych protestów, które rozpoczęły się w Berlinie Wschodnim i obejmowały całe terytorium NRD w czerwcu 1953 r. (zob. Powstanie wschodnio-niemieckie z 1953 r.
)