W lutym 2005 r. minister obrony Shaul Mofaz postanowił nie przedłużać służby Ya'alona jako szefa sztabu przez kolejny rok. To było punktem kulminacyjnym napięć między Mofaz i Ya'alon, które powstały częściowo z powodu sprzeciwu Ya'alona wobec planu rozłąki z Gazą.
- Co? W dniu 1 czerwca 2005 r. Ya'alon przeszedł na emeryturę z armii, a Dan Halutz, jego następca na stanowisku szefa sztabu, nadzorował wycofanie.