Wypełnij następujące zdanie: Prkačin był członkiem chorwackiej drużyny juniorskiej do 22 lat. Jego debiut w głównym turnieju w reprezentacji Chorwacji nastąpił podczas EuroBasket 1997. Następnie zagrał z Chorwacją w następujących głównych turniejach FIBA: EuroBasket 1999, EuroBasket 2001, EuroBasket 2003, EuroBasket 2005 i EuroBasket 2007.
Letnie Igrzyska Olimpijskie 2008 i EuroBasket 2009. Prkačin był dwukrotnie kapitanem chorwackiej drużyny.