Napisz kontynuację do tego akapitu - Podczas drugiego roku studiów Latimera wybuchła wojna domowa i Latimer opuścił VMI, by służyć Konfederacji Południowej. Po raz pierwszy służył jako kadet wiertniczy dla artylerii Richmond Hampden podczas wiosny i lata 1861 roku. Jesienią otrzymał dowództwo pierwszego porucznika i uczestniczył w akcji z dywizją generała majora Richarda S. Ewella w kampanii doliny Shenandoah w 1862 roku. Po wyróżnieniu się swoją baterią w takich bitwach jak Pierwszy Winchester
Latimer został awansowany na dowódcę batalionu, który wcześniej należał do A. R. Courtney'a. Po dowodzeniu batalionem w Fredericksburg w grudniu 1862 Latimer został awansowany na majora w marcu 1863. Ewell określał go jako "młodego Napoleona", ale jego współcześni zauważyli jego młodość i niewielki wzrost nazywając go "Boy Major". Został oficerem w batalionie majora Richarda Snowdena Andrews z dywizji majora generała Edwarda "Allegheny" Johnsona.