D'Escoto czuł się powołany do służby jako ksiądz i wstąpił do seminarium Maryknoll Missionary Society w 1953 roku. W 1961 roku został wyświęcony na kapłana Towarzystwa, zanim zaangażował się w politykę. W następnym roku uzyskał tytuł magistra nauki w Columbia University Graduate School of Journalism i był kluczową postacią w założeniu wydawnictwa Maryknoll, Orbis Books, w 1970 roku. Pełnił funkcję urzędnika Światowej Rady Kościołów. Jako zwolennik teologii wyzwolenia potajemnie przyłączył się do sandinistów. D'Escoto założył Nikaragujską Fundację na rzecz Zintegrowanego Rozwoju Społeczności (FUNDECI) w styczniu 1973 r. w celu promowania pozarządowej reakcji na przesiedlenie tysięcy osób w grudniu 1972 r.
- Co? Do śmierci w 2017 r. pełnił funkcję prezesa FUNDECI, która działa w kilku departamentach w Nikaragui.