Braves przegrali z Florida Marlins w 1997 NLCS
i San Diego Padres w 1998 NLCS. Braves wrócili do World Series w 1999 roku, ale przegrali z New York Yankees w czterech meczach z rzędu. Drużyna Coxa z 2001 roku wygrała tytuł dywizji i rozczarowała faworyzowanych Houston Astros w trzech kolejnych meczach w serii dywizyjnej. Jednak Arizona Diamondbacks pokonał Braves w pięciu meczach w NLCS.