Sprague został awansowany na kontradmirała w czerwcu, dowodził 22. Dywizją Lotnicą, która obejmowała atak na Guam od lipca do sierpnia i
Morotai we wrześniu. Sprague dowodził grupą operacyjną 77.4 i jednostką operacyjną 77.4.1 ("Taffy 1") podczas bitwy o zatokę Leyte od 24 do 25 października, a następnie dowodził lotniskowcami szkoleniowymi na Pacyfiku pod kierownictwem dywizji lotniskowców 11, zanim od kwietnia do czerwca 1945 r. dowodził dywizją lotniskowców 3 u wybrzeży Okinawy. Dowodził Task Force 38.1 podczas ostatnich operacji powietrznych przeciwko Japonii pod koniec wojny.