To doprowadziło do najbardziej niebezpiecznego momentu w karierze Ferdynanda, w 1529 roku, kiedy to Suleiman wykorzystał wsparcie Węgier do masowego, ale ostatecznie nieudolnego ataku na stolicę Ferdynanda: oblężenie Wiednia
, który wysłał Ferdinanda do schronienia w Czechach. Kolejna inwazja osmańska została odepchnięta w 1532 roku (patrz Oblężenie Güns). W tym roku Ferdinand zawarł pokój z Turkami, dzieląc Węgry na sektor Habsburgów na zachodzie i domenę Jana Zápolyi na wschodzie, ten ostatni był faktycznie państwem wasalem Imperium Osmańskiego.