W listopadzie 1943 roku Baker został przydzielony jako dowódca lotów w 493 Eskadrze myśliwskiej, 48 Grupie myśliwskiej, w Tullahoma, Tennessee. Na początku 1944 roku udał się na europejski teatr operacyjny z grupą, która została przydzielona do Dziewiątych Sił Powietrznych. Latał samolotami P-47 Thunderbolt w kampaniach ofensywnych w Europie, Normandii i Nadrenii.
- Co? Został odznaczony Srebrną Gwiazdą za odwagę w akcji, a także otrzymał dębowy list klastra do Distinguished Flying Cross. Do końca drugiej europejskiej służby przeleciał w sumie 523 godziny na 272 misjach bojowych na brytyjskich samolotach Spitfire i Thunderbolt.