Japońskie siły (zwane "Zjednoczoną Flotą") w rzeczywistości składały się z dwóch różnych flot, które zostały podzielone na dwie odrębne operacje, mianowicie Operację AL.
(dla Aleutów) i Operacja MI (dla Midway). Poniższa lista przedstawia wszystkie statki przypisane do operacji MI, jednak tylko Pierwsze Siły Uderzające Nagumo i Siły Wsparcia Midway Kurity były rzeczywiście zaangażowane w bitwę pod Midway.