Do 1943 roku baza lotnicza w Townsville była wspólną operacją Australijczyków i Amerykanów. W czerwcu tego roku władzę przejęli wyłącznie Amerykanie, co trwało do początku 1945 roku. Zagrożenie japońską inwazją, jednakże, ustąpiło pod koniec 1942 roku, po bitwie o Morze Koralowe i
W połowie drogi. Baza lotnicza w Townsville i budynek operacyjny na Green Street straciły na znaczeniu, gdy operacje wojenne przeniosły się na północ, a bazy lotnicze w Townsville stały się dużymi obszarami warsztatów w późniejszych latach wojny. Istnieje niewiele zapisów dotyczących Green Street i budynku operacyjnego w czasie wojny. W czerwcu 1947 roku złożono wniosek do Departamentu Spraw Wewnętrznych o oficjalne nabycie terenu na Green Street. Commonwealth nabył tytuł do tego miejsca w 1951 roku. Baza RAAF w Townsville zawsze była uważana za stałą bazę, a po wojnie została zmniejszona do pierwotnie planowanej przed wojną.