W maju 1846 roku Buckner zrezygnował ze stanowiska nauczyciela, aby walczyć w wojnie meksykańsko-amerykańskiej, wstępując do 6. pułku piechoty. Jego wczesne obowiązki obejmowały rekrutację żołnierzy i doprowadzanie ich na granicę Teksasu. W listopadzie 1846 r. otrzymał rozkaz dołączenia do swojej kompanii w polu; spotkał je w drodze między Monclovą a Parras. Firma dołączyła do John E. Wool w Saltillo. W styczniu 1847 roku Buckner został skierowany do Vera Cruz z dywizją Williama J. Worth'a. Podczas gdy gen. major Winfield Scott
Oblegając Vera Cruz, jednostka Bucknera zaatakowała kilka tysięcy meksykańskich kawalerzystów w pobliskim mieście Amazoque.