W następnym sezonie klub nie był w stanie zakwalifikować się do Ligi Mistrzów po przegranej z Arsenalem, ale awansował aż do szesnastki w Lidze Europy UEFA 2011/12, zostając wyeliminowany przez holenderską drużynę AZ. Zakończyli 2011<unk>12 Serie A
na trzecim miejscu, najlepszym wynikiem w historii klubu, równającym się sezonowi Alberto Zaccheroniego w latach 1996-97, ponownie zdobywając miejsce w rundzie kwalifikacyjnej do Ligi Mistrzów UEFA 2012-13. W swoim trzecim sezonie w Udinese, Guidolin ponownie nie udało się dotrzeć do Ligi Mistrzów właściwe, przegrywając na karnych do Bragi, ale tym razem również skończył na dole swojej grupy w 2012-13 UEFA Europa League. W klasyfikacji Serie A klub zajął piąte miejsce, osiągając po raz trzeci rundę kwalifikacyjną do Ligi Europy.