Napisz kontynuację do tego akapitu - Aktywny uczestnik Soboru Watykańskiego II (1962-1965), Liénart był wiodącym głosem liberalnym w radzie i zasiadał w zarządzie prezydencji. Kiedy Kuria Rzymska, złożona głównie z konserwatywnych prałatów, opublikowała listę kandydatów na członków komisji soborowych, Liénart sprzeciwił się, że nie uwzględniono żadnych kwalifikacji kandydatów. Liénart, wspomagany przez kardynałów Bernardus Johannes Alfrink i Giovanni Colombo, wygłosił jedno z orędzi końcowych soboru w dniu 8 grudnia 1965 roku. Był również jednym z kardynałów elektorów w konklawie papieża w 1963 roku
, który wybrał papieża Pawła VI.