Na początku portugalskiej wojny restauracyjnej (1640-1668), fort został oblężony po raz drugi przez wojska lojalne księciu Braganzy, który został królem Portugalii w 1640 roku. Pod jego panowaniem przeprowadzono dalsze prace remontowe w fortecie, w tym budowę koszar i kwater dla garnizonu oraz dalszą obronę przed atakami z lądu. Dalsze ulepszenia zostały wdrożone w 1751 roku, ale w 1755 roku fort został uszkodzony w wyniku trzęsienia ziemi w Lizbonie.
, najpoważniejszym z nich jest zawalenie się wieży latarni świetlnej w centrum placu. Latarnia wznowiła działalność w 1761 roku.