Jako kapitan dwunastego Connecticut Volunteers, De Forest brał udział w wojnie domowej w Luizjanie w 1862 roku i w
Kampania w dolinie Shenendoah w 1864 roku, zanim został zwolniony z powodu problemów zdrowotnych. W 1867 opublikował "Konwersję panny Ravenel z secesji na lojalność" jako krytykę społeczeństwa niewolniczego Południa.