W traktacie ustalono harmonogram przeniesienia kanału, co doprowadziło do całkowitego przekazania Panamie wszystkich gruntów i budynków w okolicy kanału. Najbardziej bezpośrednią konsekwencją tego traktatu było to, że Strefa Kanałowa
, jako jednostka, przestała istnieć 1 października 1979 r. Ostatnia faza traktatu zakończyła się 31 grudnia 1999 roku. W tym dniu Stany Zjednoczone zrzekły się kontroli nad Kanałem Panamskim i wszystkimi obszarami w strefie Kanału Panamskiego.