Od października 1863 do czerwca 1865, Brannan był szefem artylerii Departamentu Cumberland, gdzie nadzorował obronę w Chattanooga. Brał udział w bitwie pod Missionary Ridge i w kampanii pod Atlantą, gdzie uczestniczył w bitwie pod Resaca, bitwie pod Dallas i bitwie pod Kennesaw Mountain. Był też na oblężeniu i kapitulacji Atlanty.
- Co? Został mianowany generałem brytyjskim zarówno w armii regularnej, jak i w siłach wolontariuszy za odwagę i zasługi w kampanii w Atlancie i na polu podczas buntu.