W maju 1861, 2nd Lt Heywood został awansowany na pierwszego porucznika, i jako taki wylądował z Marines w Hatteras Inlet
, gdzie był obecny podczas zajęcia Fort Clark i Fort Hatteras. W listopadzie tego roku awansował na kapitana i zimą 1861-62 aktywnie uczestniczył w wielu ekspedycjach łodziowych na rzece James.