Juni 1944 gouf d'Entscheedung getraff, de No. 61 Wing aus dem Darwin-Bereich op Neie Guinea ze transferéieren, wou et den Alliéierten an d'Philippinnen ënnerstëtze géif. Dëst gouf vum Air Officer Commanding North-Western Area, Air Vice Marshal Adrian Cole, widderholl, deen de Flügel wollt un enger Operatioun deelhuelen, déi geplangt war fir d'Insel Selaru an Holland Ostindien (NEI) ze erfaassen; dës Operatioun gouf effektiv am 7 Juni annuléiert. No. 61 Wing huet Darwin am August verlooss an ass den 18 September op Morotai an der NEI ukomm, dräi Deeg nodeems d'US-Arméi d'éischt op der Insel an der Schluecht vu Morotai gelant war.
. No. 14 Airfield Construction Squadron landéiert op Morotai den 18 September an huet den nächsten Dag ugefaang d'Aarbecht um Bau vun de Fluchhafen. Kuerz ier dës Operatioun ugefaang huet, gouf d'No. 12 Survey and Design Unit am No. 61 Wing's Headquarters op 12 September absorbéiert.