Schreift eng Fortsetzung fir dëse Paragraph - Am Joer 1861, um Ufank vum Biergerkrich, gouf hie vum Kommandant vun der New Yorker Nationalgarde, Brigadegenerol John F. Rathbone, ernannt, fir als Chefmedizinesche Offizéier am Albany Depot ze déngen. Am Juni 1862, no der Schluecht vu Savage's Station
Wéi d'Arméi vum Potomac, zesumme mat hire Dokteren, sech zréckgezunn huet, ass de Swinburne bliwwen fir sech ëm d'Dausende vu blesséierte Prisonéier ze këmmeren, souwuel vun der Unioun wéi och vun der Konfederatioun. Fir seng prinzipiell Haltung ze respektéieren, huet de Konfederéierte Kommandant Stonewall Jackson him e Pass ginn, mat enger begleet perséinlecher Notiz, déi Visite bei Gefaangenen vun der Unioun erlaabt huet. Am Joer 1864 huet de Gouverneur Horatio Seymour hien zum Posten vum Gesondheetsbeamten vum Hafen vun New York nominéiert an am Joer 1867 gouf hien vum Gouverneur Reuben Fenton nei nominéiert, a war insgesamt sechs Joer, bis 1870. Wärend senger Administratioun, trotz der Réckzuch vun der staatlecher Legislatur fir d'Finanzéierung ze verdeelen, huet hien de Bau vun de sougenannten State-of-the-Art Quarantänanlagen op Inselen iwwerwaacht, déi Swinburne an Hoffman genannt goufen.