Am August 2015 gouf de Frederiksen als Manager vun der dänescher U21-Equipe ernannt, wouduerch hien en Zwee-Joer-Kontrakt ënnerschriwwen huet. An sengem éischte Match huet hien 1<unk>2 géint Däitschland an engem Frëndschaftsmatch um Stadion Lohmühle zu Lübeck, Schleswig-Holstein verluer. Ënnert dem Frederiksen huet Dänemark sech 2017 fir d'UEFA-Europameeschterschaft ënner 21 Joer qualifizéiert
an 2019, wou si an der Grupp Etapp ausgeschloen goufen, déi op der drëtter an zweeter Plaz waren.