Juni 1940 huet d'Sowjetunioun Litauen besat, an d'Schützen, wéi och de Rescht vum Militär, goufe bestallt, sech net ze widderstoen. Den Aleksandras Barauskas, e Schützen an e Grenzgardist, gouf vun de Routarméi-Zaldoten am fréie Moien vum 15. Déi nei sowjetesch Volleksregierung vu Litauen huet direkt Schrëtt gemaach fir d'Gewerkschaft ze liquidéieren. Säin Kommandant, de Colonel Pranas Saladžius, gouf den 19 Juni 1940 entlooss, an de Chef vun der Verteidegung Divisioun Generol Vincas Vitkauskas, deen mat de Sowjets kooperéiert huet, huet d'Schützen bestallt hir Waffen dem Militär den 25 Juni 1940 ze iwwerginn. Juli 1940 gouf e sowjeteschen Uerder erausginn, fir d'Gewerkschaft ze liquidéieren. An de folgende Méint goufen eng Rei vun den aktivsten Schützen als "Feinde vum Vollek" festgeholl an a verschidde Gulag Lager geschéckt. Am Juni 1941 hunn d'Sowjeten eng Masse-Deportatioun ugefaangen
déi "anti-sowjetesch Elementer" gezielt huet, dorënner och d'Schützen. Ënnert de deportéierte waren LRU Kommandant Colonel Pranas Saladžius, Éiere Kommandant vun der Fraen Sektioun Emilija Putvinskienė, Kommandant vum Utena Regiment Lt. Col. Pranas Bronevičius, Chef vun der Kultur Sektioun Vincas Daudzvaras, an anerer.