Japan huet néng Forstökoregionen, déi d'Klima an d'Geographie vun den Inselen reflektéieren. Si reichen vun subtropeschen naass breedbleiche Bëscher op de Ryūkyū an de Bonin Inselen, bis zu temperéierten breedbleiche a gemëschte Bëscher an de mëllen Klimaberäicher vun den Haaptinselen, bis zu temperéierten Nadelbeem an de kalen, Wanterdeeler vun den nërdlechen Inselen. Japan huet iwwer 90.000 Arten vun der Fauna, dorënner de braune Bär, de japanesche Makak, de japanesche Rakhunhund, déi grouss japanesch Feldmaus, an de japanesche Riese Salamander. E grousst Netzwierk vu Nationalparken ass gegrënnt fir wichteg Beräicher vun der Flora a Fauna ze schützen, souwéi 37 Ramsar Feuchtgebieder. Véier Siten goufen op d'UNESCO Welt Patrimoine-Lëscht fir hire grousse natierleche Wäert ageschriwwen.
d'Inselen Ryūkyū a Bonin