Den 14. Januar 2012 huet de Flanagan den U.S. Olympic Trials Marathon zu Houston gewonnen, an huet de Rekord vun 2:25:38 gesat. Si huet d'Team USA beim olympesche Fraenmarathon zu London representéiert, wou si den 10. mat enger Zäit vun 2:25:51 fäerdeg bruecht huet. Si huet en héije Klassfeld um Lissabon Halleft Marathon am Mäerz besiegt, eng Zäit vun 1:08:52 opgeholl. Si koum op der 25th bei der 2012 IAAF World Half Marathon Championships
.