D'Klassifikatioun vun Protisten ass nach ëmmer am Wandel. Méi nei Klassifikatioune probéieren monophyletic Gruppen ze presentéieren baséiert op morphologesch (besonnesch ultrastrukturell), biochemesch (chemotaxonomesch) an DNA Sequenz (molekular Fuerschung) Informatioun. Allerdéngs ginn et heiansdo Diskordanzen tëscht molekulare a morphologeschen Untersuchungen; dës kënnen als zwou Aarte kategoriséiert ginn: (i) eng Morphologie, verschidde Lineagen (z. B. morphologesch Konvergenz, kryptesch Arten) an (ii) eng Lineage, verschidde Morphologien (z. B. phänotypesch Plastizitéit, verschidde Liewenszyklusstadien). Well d'Protisten als Ganzt paraphyletic Systemer sinn, dacks méi einfach nei oder opgedeelt Kinn, anstatt d'Protisten als separat eukotesch Linnen ze behandelen.
net monophylesch