Eftir kosningarnar árið 1986 myndaði Sadiq samfylkingarstjórn sem samanstóð af Umma-flokknum (sem hann leiddi), National Islamic Front (leiðstýrður af tengdabróður hans, Hassan Al-Turabi), Democratic Unionist Party (leiðstýrður af Mohammed Uthman al-Mirghani al-Khatim) og fjórum litlum flokkum í Suðurríkjum. Samfylkingin reyndist hins vegar óstöðug og hindraði Sadiq frá því að uppfylla loforð sín um að ljúka seinni borgarastyrjöldinni í Súdán og leysa áframhaldandi efnahagskreppu. Þann 30. júní 1989 var ríkisstjórn hans felld í valdarás.
undir forystu Omar al-Bashir. Þá var embætti forsætisráðherra Súdans afnumið.