Hann tók við skipunum eftir John F. Shafroth yngri sem skipstjóri herskipsdeildarinnar átta í júní 1945 og tók síðar þátt í sjóverkefnum nálægt strönd Kyushu í Japan. Eftir að Japan gafst upp tók Sowell þátt í
uppgjörs athöfn um borð í stríðsskipinu "Missouri" 2. september 1945 í Tókýó Bay og var síðan í japönskum sjóum til upphaf október 1945. Hann leiddi síðan deild sína aftur til Bandaríkjanna og kom til San Diego í Kaliforníu 22. október 1945.