Í framhaldi af þessari málsgrein - Í mars 1991 fór spennan milli Króata og Serba upp í sjálfstæðisstríð í Króatíu. Í kjölfar þjóðaratkvæðagreiðslu um sjálfstæði, sem var að mestu boykottað af kroatískum Serbjum, samþykkti króatíska þingið sjálfstæði opinberlega 25. júní. Lýðveldi Serbska Krajina (RSK) lýsti yfir áformum sínum um að segja sig úr Króatíu og ganga til liðs við Lýðveldi Serbíu en ríkisstjórn Lýðveldis Króatíu lýsti því yfir uppreisn. Á árunum ágúst 1991 og febrúar 1992 hóf RSK þjóðernisþvottarherferð til að reka hróata og ekki-serbíska íbúa úr svæði sem RSK hélt, og að lokum vísaði allt að 250.000 manns út samkvæmt Human Rights Watch. Króatískir hermenn tóku einnig þátt í þjóðhreinsun gegn Serbjum í austur- og vestur-Slavóníu og hluta af Krajina í takmarkaðri mæli. Þann 4. ágúst 1995 hóf her Króatíu (HV) aðgerðir Storm
Hann tók aftur Krajina svæðið sem var lokið með góðum árangri 7. ágúst. Aðgerðin varð til þess að um 200.000 Serbar flúðu frá Krajina en þeir Serbar sem gátu ekki eða vildu ekki yfirgefa heimili sín, fyrst og fremst aldraðir, urðu fyrir ýmsum glæpum. ICTY segir að fjöldi serbneskra borgara hafi dáið 324.