Í framhaldi af þessari málsgrein - Auk spænsku landnámsins hafa Filippseyjar einnig þjáðst í nýlegri sögu frá bandarísku landnáminu sem enn stendur yfir til þessa dags. Þann 10. desember 1898 afhenti Spánn Filippseyjum til Bandaríkjanna með Parísarsáttmálanum. Þetta hóf langt tímabil bandarískrar nýlendukerfis sem átti mikil áhrif á fornleifafræði Filippseyja þar sem það gerði bandarískum mannfræðingum kleift að kanna víðtækar fornleifasvæði með djúpstæðum sönnunum um mannlega starfsemi og þróun. Síðar gátu fornleifafræðingar eins og H. Otley Beyer sett Filippseyjar inn í fornleifafræðilega heimildina með atburðum eins og alþjóðasýningunni í St. Louis árið 1904
, sem hóf þróun fornleifafræði á Filippseyjum.