Í 480 f.Kr. fór Xerxes persneski konungur 1.000 nautgripi í helgidóminum Athena Ilias á meðan hann gekk í gegnum Hellespontine svæðið í átt að Grikklandi. Í kjölfar persnesks ósigurs árið 480-479 varð Ilion og yfirráðasvæði þess hluti af meginlandareignum Mytilene og var undir stjórn Mytileneans þar til misheppnaða Mytileneans uppreisn.
í 428 á 427. Aþenur frelsaði borgirnar sem voru kallaðar Aktaear, þar á meðal Ilion, og skráði þessi samfélög í Delian-sambandið. Áhrif Aþeninga á Hellespont minnkaði eftir ólígarkiskuppinn árið 411, og það ár fór spartanlegur hershöfðingi Mindaros eftir Xerxes með því að fórna sömuleiðis til Athena Ilias. Frá c. 410 <unk> 399, Ilion var innan áhrifasviðs staðbundinna dynasta í Lampsacus (Zenis, kona hans Mania og Meidias sem réði svæðinu fyrir hönd persíska satrapsins Pharnabazus.