Skrifaðu framhald á þessari málsgrein - Federer spilaði í Hopman bikarnum
og Australian Open í janúar 2017. Aðdragandi hans frá meiðslinum hafði áhrif á tímabilið 2016 og leiddi til þess að hann varð í 17. sæti á Opna-keppninni í Ástralíu, lægsta sæti hans í yfir fimmtán ár. Í Opna Ástralíu vann hann á topp 10 leikmönnum Tomáš Berdych og Kei Nishikori á leið sinni í undanúrslit, sem gerði Federer að elsta manni til að keppa í Grand Slam undanúrslitum síðan Jimmy Connors árið 1991. Í undanúrslitunum sigraði hann Stanislas Wawrinka í fimm settum og varð þá elsti leikmaðurinn sem keppti í úrslitum Grand Slam síðan Ken Rosewall árið 1974. Federer sigraði Rafael Nadal og vann Australian Open, sem var einnig hundraðasti leikur Federer á Australian Open. Þetta var í fyrsta sinn sem Federer vann leik gegn Nadal í Grand Slam síðan í úrslitakeppni Wimbledon árið 2007 og einnig var þetta fyrsti sigur Federer á Grand Slam gegn Nadal utan grasið á Wimbledon. Með þessum sigri komst hann aftur inn í topp tíu.