Nakajima tók þátt í 80 keppnum í Formúlu 1, en hann var fyrstur í Grand Prix Brasilíu 12. apríl 1987 og kom með Honda vélar til Lotus liðsins. Hann var 34 ára gamall í fyrsta keppni sinni, sem gerir hann að einum elsta frumkvöðla Formúlu 1 í nútímanum. Hann endađi í sjötta sæti og skorađi stig í annarri keppni sinni, San Marino Grand Prix 1987.
Ég veit ūađ ekki. Á fyrsta tímabili sínu var Nakajima yfirburðaður af liðsfélaga sínum, Ayrton Senna, og margir efast um stað Nakajima í F1, þar sem hann segir að ef ekki væri fyrir Honda hefði hann ekki verið þar á verðleikum.