Í ágúst 1940 var York settur í Miðjarðarhafsflotann, og gekk í hóp með 3. krossbátaflotann í Alexandríu í lok september, eftir að hafa fylgst með fylgi um Góðrar vonarhöfn. Tveimur dögum síðar tók hún þátt í aðgerð MB.5, þar sem Miðjarðarhafsflotinn fylgdi léttum krossfaraskipum og þegar þau fluttu hermenn til Möltu. Á meðan
Í orrustunni við Passero-höfðið sökk York skipið þann 13. október eftir að skipið lenti í átökum við léttan krossinn kvöldið áður. Mánuði síðar framkvæmdu York og Miðjarðarhafsflotinn aðgerð MB8, flókna röð aðgerða, þar á meðal aðgerðina Judgment, þar sem skipið fylgdi flugvélaskipinu þegar flugvélar hennar réðust á ítalska flotann í Taranto á kvöldin 11.-12. nóvember. Nokkrum dögum síðar flutti York breska hermenn frá Alexandríu í Egyptalandi til Píreusar í Grikklandi. Þann 26. nóvember var York og restin af 3. skátrónunni farin til Möltu.