Í lok árs 1945 voru bandarískir kafbátar sendir á eyjuna með austurlenskum kommandoliðum og sérstaka einingu bandamanna sem stundaði leyniþjónustu og þjálfaði þúsundir heimamanna til að berjast gegn Japönum í gerillamótum í Borneo herferðinni í undirbúningi fyrir komu helstu frelsunarherferða bandamanna. Í kjölfar landninga á Norður-Borneo og á Labuan
Frá og međ 10. júní 1945 var eyjan Borneo frelsuð af sameiginlegum herjum Ástralíu og Bandaríkjanna. Breska herstjórnin tók formlega við af Japönum 12. september 1945.