Í ágúst 1945 hunsaði japanska ríkisstjórnin kröfur um að gefast upp eins og tilgreint var í Potsdam-yfirlýsingunni. Með stuðningi flestra aðstoðarmanna sinna samþykkti Truman áætlun hersins um að varpa atómsprengjum á borgirnar Hiroshima og Nagasaki í Japan. Hiroshima var sprengd 6. ágúst og Nagasaki þremur dögum síðar, og þar létust um 135.000 manns; 130.000 fleiri létu lífið af geislaveiki og öðrum sjúkdómum tengdum sprengjunum á næstu fimm árum. Japan samþykkti að gefast upp.
10. ágúst, á þeim einu skilyrði að Hirohito keisari yrði ekki neyddur til að víkja; eftir nokkur innri umræðu samþykkti stjórnsýsla Truman þessi skilyrði um uppgjöf.