Í janúar 1941 var sveitin lögð í Vestræna eyðimörkurherferðina og fór í fyrsta sinn í aðgerðir í kringum Bardia.
, sem var tekinn af Ítölumönnum í nokkra daga. Síðar í mánuðinum var Tobruk tekin, þar sem 16. breska herflokkurinn var áfram á meðan hinir tveir breskarnir í 6. deildinni, 17. og 19. breska herflokkurinn, tóku þátt í öðrum aðgerðum í kringum Derna og Benghazi. Í mars einbeitti deildin sér í kringum Amiriya þegar hún undirbjó sig til að ráðast til Grikklands, í viðbrögð við væntanlegri þýskri innrás. Á meðan á Grískubaráttu stóð tók 16. breska herflokkurinn Seria áður en hann settist að í Veria-passinum. Þegar þýska árásin hófst var 2. 1. liðsflokkurinn að veita bakvörður á meðan herflokkurinn dró sig til baka ásamt 4. herflokki Nýja-Sjálands. Þjóðverji náðu innrás í Tempe-klofanum sem varð til frekari afturköllunar þar sem 2. og 2. og 3. hersveitir stóðu að öryggi eftirliðsins þegar Anzac-liðið dró sig aftur í gegnum Larissa. Eftir þetta var breska herliðinu skipað að rýma, og hluti þeirra var dreginn til baka með sjó á Kalamata. Meirihluti sveitarinnar var fluttur aftur til Egyptalands og stofnaður aftur í Palestínu, en hluti sveitarinnar lenti á Krít. Þriðja og þriðja herflokkurinn var settur í land sem heild og settur til að verja flugvöllinn í Retimo, en hluti af 2. og 3. herflokki var skipaður í samsettan herflokk 16. herflokksins. Á meðan á átökunum stóð var 2/1 í stórum hluta eyðilagð í stuttu orrustunni við Krít, en meirihluti var tekinn í fangelsi.