Ljúktu eftirfarandi setningu: Þegar borgarastyrjöldin braust út var Kirkland í fyrstu ráðinn skipstjóri í her Bandalagsins og síðan kjörinn fulltrúi 11. sjálfboðaliða Norður-Karólínu, síðar 21. Norður-Karólínu, í júní 1861. Hann skipaði herflokki sínu í Fyrsta Manassas sem hluti af herflokki Milledge Bonham, en var ekki verulega þátttakandi. Í október var 21. Norður-Karólína-herflokkurinn settur í lið Isaac Trimble og næsta vor tók hann þátt í herferð Stonewall Jackson í Shenandoah Valley. Kirkland var skotinn í gegnum báđa leggin á
Fyrsta bardaginn við Winchester, sem kom honum úr leik í nokkra mánuði. Á meðan Kirkland var að jafna sig var hann yfirmaður Patrick Cleburne í herferðinni í Murfreesboro í desember 1862.