Ljúka eftirfarandi setningu: Aðstoðarstjórinn Jimmy Murphy tók við sem stjórnandi meðan Busby jafnaði sig eftir meiðsli sín og bráðabirgðalið félagsins náði í úrslit FA Cup, sem þeir töpuðu fyrir Bolton Wanderers. Í viðurkenningu á harmleik liðsins bauð UEFA félaginu að keppa í Evrópukeppninni 1958/59 ásamt endanlegum meisturum deildarinnar, Wolverhampton Wanderers. Þrátt fyrir samþykki Knattspyrnusambandsins ákvað Knattspyrnudeildin að félagið ætti ekki að taka þátt í keppninni þar sem það hafði ekki náð að komast í keppnina. Busby enduruppbyggði liðið á sjötta áratugnum með því að fá leikmenn eins og Denis Law og Pat Crerand, sem sameinuðust næstu kynslóð unglinga leikmanna - þar á meðal George Best - til að vinna FA bikarinn árið 1963. Á næsta tímabili enduðu þeir í öðru sæti deildarinnar og unnu síðan titilinn 1965 og 1967. Árið 1968 varð Manchester United fyrsta enska (og annað breska) félagið til að vinna Evrópukeppnina, þar sem þeir unnu Benfica 4-1 í úrslitakeppninni með liði sem innihélt þrjá evrópska knattspyrnumenn ársins: Bobby Charlton, Denis Law og George Best. Þeir fulltrúuðu síðan Evrópu í
1968 Intercontinental Cup gegn Estudiantes frá Argentínu, en tapaði jafnteflið eftir að hafa tapað fyrsta beinni í Buenos Aires, áður en 1<unk>1 jafntefli á Old Trafford þremur vikum síðar. Busby lét af störfum sem knattspyrnuþjálfari árið 1969 áður en hann var skipt út fyrir varaliðsþjálfarann, fyrrverandi leikmann Manchester United, Wilf McGuinness.