Bonaga gerði sitt fyrsta leik fyrir Panama í undanúrslitum UNCAF Nations Cup 2009 sem kom inn sem varamaður á síðustu stundu gegn Honduras þann 30. janúar 2009 og hefur frá 1. maí 2015 unnið alls 23 landsleiki og skorað 1 mark. Hann mætti í 2 undankeppni fyrir HM og spilaði á HM 2011 á Íslandi.
og 2013 CONCACAF gullbikar. Þann 10. janúar 2013 skoraði hann gegn Gvatemala í vináttuleik á 67. mínútu.