Hann opnaði aftur 22. mars 2000 sem Phoenicia Inter-Continental Beirut, eftir 100 milljóna króna endurreisnarverkefni eftir hönnun Hellmuth, Obata + Kassabaum arkitekta. Inter-Continental Hotels var endurskipulagt sem InterContinental Hotels Group árið 2003 og nafn hótelsins var breytt lítillega, missti af tengibrautinni og varð Phoenicia InterContinental Beirut. Í júlí 2003 var opnað þriðji turninn, Phoenicia Residence, sem samanstendur af 35 glæsilegum íbúðum. Phoenicia varð fyrir skemmdum í sprengjuárásinni á Rafik Hariri árið 2005 í götunni fyrir framan og lokað í þrjá mánuði vegna viðgerða. Árið 2011 var það endurnýjað fyrir 50 milljónir Bandaríkjadala sem féll saman við 50 ára afmæli þess. Árið 2012 var það endurnefnt sem Phoenicia Hotel Beirut, þó að það sé ennþá hluti af InterContinental keðjunni. Hótelið lokaði 5. ágúst 2020 vegna skemmda vegna sprengingarinnar í Beirút árið 2020
fyrri daginn.