Rikyū er fæddur í Sakai í Osaka-héraði í dag. Faðir hans var vöruhúseigandi að nafni Tanaka Yohei (田中与兵衛), sem síðar í lífinu notaði einnig ættarnafnið Sen, og móðir hans var Gesshin Myōchin (月<unk>妙<unk>). Barnaheitið hans var Yoshiro. Sem ungur maður, Rikyū lærði te undir bæjarmanni S sem heitir Kitamuki Dōchinakai (1504<unk>62), og í nítján ára, í gegnum kynningu Dōchin, byrjaði hann að læra te undir Takeno Jōō, sem er einnig tengdur við þróun á wabi fagurfræði í teathöfn. Hann er talið að hafa fengið nafnið Sekiō (易inza) frá prestinum Ririn Zen Sōtoku Daji (1480-1568) sem giftist Nanji.
Daitoku-ji