Ljúktu eftirfarandi setningu: Þegar borgarastyrjöldin hófst í Bandaríkjunum árið 1861 tók Fesler höndum sambandsríkjanna. Þann 30. ágúst 1861 skráði hann sig í Union Army í Morgantown í Indiana. Fesler var gerður að skipstjóra G-liðsins í 27. Fesler skipaði liðinu sínu á
Fyrsta bardaga við Winchester og í bardaga við Cedar Mountain. Árið 1862 var Fesler-herherherflokkurinn settur í 12. herliðshópinn, þar sem hann yrði áfram allt árið 1863. Fesler skipaði síðan liðinu sínu í slaginu við Antietam, nálægt Sharpsburg í Maryland, 17. september 1862. Flokkur hans var veturinn 1862-1863 í Stafford Courthouse í Virginia og 13. febrúar 1863 var Fesler orðinn liðsforingi í 27. Indiana. Í mars 1863 fékk 12. liðið, sem 27. Indiana var hluti af, stjörnu sem merki liðsins. Þann 5. maí 1863 var Fesler særður í átökunum í bardaga við Chancellorsville í Spotsylvania County í Virginia. Hann skipaði svo tímabundið 27. Indiana-herflogi frá 2. til 3. júlí 1863 meðan á Gettysburg-baráttu stóð, þegar fulltrúi regimentsins var settur í stjórn herflugsins. Fesler og herlið hans tóku síðan þátt í að bæla uppdrætti í New York síðari hluta mánaðarins.