Í F1 var 1966 lélegt ár fyrir Stewart eftir lofandi byrjun hans á fyrra ári; 3 lítra H16 BRM voru óáreiðanleg, þó að Stewart hafi unnið Monaco Grand Prix í 2 lítra vél bíl. Mikilvægasti atburðurinn á árinu var slys hans á Belgíska Grand Prix- keppninni.
í Spa-Francorchamps, sem kveikti í átaki hans til að bæta öryggi í F1 og varð til þess að hann missti af Franska Grand Prix í Reims.