Í lok 13. aldar urðu Palestína og Sýrland aðalfronturinn gegn hratt vaxandi Mongólska keisaradæminu, en her hans náði til Palestínu í fyrsta sinn árið 1260, og hófst með árásum Mongóla á Palestínu undir stjórn kristins hershöfðingja Kitbuqa. Hulagu Khan, leiðtogi Mongóla, sendi Lúís IX Frakklandi skilaboð um að Jerúsalem hefði verið afhent kristnum mönnum undir franska-Mongólska bandalaginu; þó þurfti hann fljótlega eftir það að snúa aftur til Mongólíu eftir dauða Mongke, og lét Kitbuqa eftir með minnkaðan her. Kitbuqa barst síðan við Mamluks undir stjórn Baibars í mikilvægu bardaga við Ain Jalut.
í Jesreel-dalnum. Hinn afgerandi sigur Mamluksmanna í Palestínu er talinn einn merkusti bardaga heimsins, og var það hápunktur Mongólska landvinninga. Mongólum tókst þó að ráðast í nokkrar frekari stuttar árásir árið 1300 undir stjórn Ghazan og Mulay, sem náðu allt að Gaza. Jerusalem var í höndum Mongóla í fjóra mánuði (sjá Níunda krossferðina).