Ljúktu eftirfarandi setningu: Pantano var búinn að gera Formula One deibút sinn fyrir Jaguar, en tveimur dögum áður en hann átti að skrifa undir með liðinu sem þeir gerðu samning við Christian Klien, sem var fær um að koma $ 10 milljón fjármögnun frá Red Bull. Ítalinn skrifaði í staðinn fyrir Jordan Formula One liðið snemma árið 2004 og eftir lágmarks prófun reyndi tímabilið vandræðalegt. Hann endaði síðastur í fyrsta keppni sinni í Melbourne, en reynslumeiri liðsfélagi hans, Nick Heidfeld, hætti með flutningsvandamál. Hann hélt áfram að keppa, náði aldrei að komast í undankeppni eða klára hærra en í bakhlið vallarins og dró sig í burtu í nokkrum tilvikum og náði ekki að grípa mikla athygli. Hann var skipt út fyrir einn-off af þýska frumsæknum Timo Glock (vegna fjárhagslegra ástæða) á
Kanada Grand Prix, sem skorađi tvö stig og endađi í sjöunda sæti, fyrir framan liđfélaga sinn Nick Heidfeld sem var í áttunda. Pantano kom aftur í sæti sitt í liðinu fyrir næsta keppni í Indianapolis, en fór út í fyrsta beygju eftir að hafa lent í árekstri við aðra ökumenn. Hann hélt áfram með meira vonbrigðum árangri þar til Ítalska Grand Prix á Monza, eftir sem hann var skipt út fyrir Timo Glock fyrir þrjú keppnir sem eftir voru á tímabilinu. Pantano upplýsti síðar að það hefði verið eigin val hans að hætta að keppa með Jordan vegna fjárhagslegrar byrði sem var lögð á fjölskyldu hans og eigin tilfinningar hans að liðið væri að greiða félaga sinn Heidfeld yfir hann. Pantano var tengdur við að snúa aftur til Formúlu 1 með Campos Meta en liðið staðfesti að Bruno Senna og Karun Chandhok myndu ganga í hópinn.