Skrifaðu framhald þessarar málsgreinar - Frá 1805 og áfram, Saint-Hilaire myndi stöðugt þjóna í "Grande Armée", með ýmsar deildarstjórnir. Árið 1805 skipaði hann deild í IV liði Jean-de-Dieu Soult-hershöfðingja í stríði þriðju samfylkingarinnar og í slaginu við Austerlitz.
Í ágúst 1943 leiddi hann ákveðna árás á Pratzen-hæðina, fékk alvarlegt meiðsli í upphafi árásarinnar en hélt þó áfram að stjórna restinni af bardaga. Á árunum 1806 og 1807 barðist hann með framúrskarandi árangri við Jena, Eylau og Heilsberg. Hann var gerður jarlveldisgráfi árið 1808 og fékk deildarstjórn í hernum í Þýskalandi, þar sem hann fór í herferð í Suður-Þýskalandi og Austurríki. Þann 22. apríl 1809 skildi Saint-Hilaire sig fyrir augum Napóleons í slaginu við Eckmühl.