Eftir að Fahreddin Pasha var handtekinn var hann fluttur í herbúðirnar í Kaíró í Egyptalandi. Síðar var hann fluttur til Möltu, þar sem hann bjó sem stríðsfangur til ársins 1921. Eftir að hann var látinn laus gekk hann til liðs við tyrkneska hersveitina undir stjórn Mustafa Kemal Atatürk og barðist gegn grískum og frönskum hersveitum.
að taka Anadólíu. Eftir sjálfstæðisstríð Tyrklands var hann sendiherra Tyrklands í Kabúl í Afganistan frá 1922 til 1926. Árið 1936 var hann færður í röð Ferik (liðsforingi) og hættur í herinn. Fahreddin Pasha lést 22. nóvember 1948 eftir að hafa fengið hjartaáfall í lestferð í nágrenni Eskişehir. Samkvæmt óskum hans var hann grafinn á Aşiyan kirkjugarðinum í Istanbúl.