Japönar gerđu inn í stríđiđ í desember 1941 og ūegar ūeir rķgu suđur í átt ađ Pápúu, lenti 49. herflokkurinn í loftárás. Í gegnum Kokoda Track herferðina
Á árinu 1862 var reynt að fljúga hluti af herflokknum til Kokoda til að styðja 39. herflokkinn í bardaga við Kokoda, en það reyndi árangurslaust. Síðar bættust hermenn frá 49. sveitinni við Honner Force, ad hoc einingu sem hafði það hlutverk að fara með langdistanseftirlit meðfram Goldie River til að koma í veg fyrir að Japanir skeri brautina, en restin af sveitinni stofnaði stöðugt eftirlit á milli Goldie og Laloki River. Þrátt fyrir að engin samskipti hafi verið gerð við Japanana, hjálpaði bardagarhlutverkið að bæta horfur hermanna og andrúmsloftið batnaði. Á undanförnum mánuðum hafði styrkur sveitarinnar verið aukinn og í september 1942 hafði það styrk 37 embættismanna og 818 annarra röð, þar á meðal drög að 12 embættismönnum sem höfðu verið sendir frá reynslumiklum einingum Second Australian Imperial Force í ágúst. Flokkurinn hélt áfram að stækka í október og nóvember, og þá hafði meira en helmingur starfsmanna hans boðið sig fram til að flytja til AIF. Þjálfunartækifærin voru þó takmörkuð, jafnvel þótt undirbúningur væri gerður til að senda eininguna í bardaga. Um þetta leyti var vélbyssufyrirtæki hersins aðgreitt og í tengslum við nokkur önnur vélbyssufyrirtæki var það notað til að mynda 7. vélbyssuherlið.