Badoglio var yfirmaður herforingja frá 1925 til 1940 og það var hann sem hafði síðasta orðið um alla uppbyggingu herforingjanna, þ.m.t. kenningar, val á yfirmönnum, vopn, á því tímabili, sem hafði áhrif á allt herumhverfi. Badoglio var ekki hlynnt ítalsk-þýska stálsamningnum og var óvæntur um möguleika Ítalíu á árangri í evrópsku stríði. Þrátt fyrir slíka óvissu - andmælti hann ekki ákvörðun Mussolini og konungs um að lýsa yfir stríði gegn Frakklandi og Bretlandi. Eftir slæma árangur ítalska hersins í
Eftir innrásina í Grikkland í desember 1940 lét hann af störfum í herforingjastofnuninni. Badoglio var skipt út fyrir Ugo Cavallero.