Í byrjun desember 2013 tilkynnti Harper að hann myndi "algerlega kjósa nei" í þjóðaratkvæðagreiðslunni 2014 um sjálfstæði Skotlands
, og hélt áfram að segja að hann væri ánægður með að hjálpa Better Together herferðinni og að það væri "mikill minnihluti" af grænum sem voru á móti sjálfstæði.