Ljúka eftirfarandi setningu: Czisny varð þriðji á Skate Canada International 2008 í Grand Prix seríunni 2008-09 á eftir Joannie Rochette og Fumie Suguri. Á
2009 bandarískt meistaramót, hún vann stutta forrit með yfir fimm stigum. Hún varð þriðja í langhlaupinu en vann gullverðlaunin vegna forystunnar í stutthlaupinu. Czisny vann sinn fyrsta landsmeistaratitil, á undan Rachael Flatt og Caroline Zhang. Hún vann sína aðra ferð til Fjórra heimsálfa og heimsmeistaramótsins, þar sem hún endaði níunda og ellefta.