Ljúktu eftirfarandi setningu: Lucerne var einstaklega vinsæll meðal vaxandi borga sambandsins í að laða að sig nýja íbúa. Lúsern var enn að mestu kaþólsk og hýsti sína eigin árlegu ástríðuleik frá 1453 til 1616, tveggja daga leikrit með 12 klukkustunda sýningu á dag. Eftir 1520 urðu flestar nærliggjandi borgir mótmælendur en Lucerne var enn kaþólsk. Eftir sigur kaþólskra manna á mótmælendum í Kappelsbaráttunni árið 1531 voru kaþólskir bæir ríkjandi í sambandinu. Það var á þessum tíma sem jesúítar komu fyrst til Lúserns árið 1567 og fékk þeir talsverðan stuðning frá kardináli Carlo Borromeo, erkibiskupi Mílanó. Svæðinu var þó ætlað að vera undir stjórn mótmælendaborga eins og Zürich, Bern og Basel, sem sigruðu kaþólsku hermennina árið 1712.
Toggenburgarstríð. Fyrrverandi áberandi staða Lúserns í sambandinu tapaðist að eilífu. Á 16. og 17. öld fækkuðu styrjöld og faraldrar jafnt og þétt og í kjölfarið fjölgaði íbúum landsins mjög.