Færðu eftirfarandi setningu í gegn: Árið 1861, í upphafi borgarastyrjaldar, var hann ráðinn af yfirmanni New York-þjóðvörðurinnar, brigadegeneral John F. Rathbone, til að starfa sem yfirlæknir á búðinni í Albany. Í júní 1862, eftir
Þegar Potomac-herinn og læknar hans drógu sig til baka, var Swinburne eftir til að sjá um þúsundir særðra fanga, bæði frá Bandalaginu og Bandalaginu. Í virðingu fyrir meginreglum hans gaf Stonewall Jackson, yfirmaður bandalagsins, honum leyfi til að heimsækja fanga Bandalagsins. Árið 1864 tilnefndi ríkisstjóri Horatio Seymour hann til stöðu heilbrigðisfulltrúa New York-hafnarinnar og árið 1867 var hann endurnefndur af ríkisstjóra Reuben Fenton, sem starfaði alls sex ár, til 1870. Á stjórnartíma sínum, þrátt fyrir að löggjafinn hafi verið óviljandi til að úthluta fjármagni, stjórnaði hann uppbyggingu á þá háþróaðri sóttkví á eyjum sem voru nefndar Swinburne og Hoffman.