Í 1939 skrifaði Danmörk undir tíu ára óárásarsamning við nasista-Þýskaland en Þýskaland réðst inn í Danmörku.
9. apríl 1940 og dönsku ríkisstjórninni gafst fljótt upp. Önnur heimsstyrjöldin í Danmörku einkenndist af efnahagslegum samstarfi við Þýskaland til 1943, þegar dönsk stjórnvöld neituðu frekari samstarfi og flotinn sökkvaði flest skip sín og sendi marga af öldungunum til Svíþjóðar, sem var hlutlaus. Danska andstæðisflokkurinn framkvæmdi björgunaraðgerð sem tókst að flytja nokkur þúsund Gyðinga og fjölskyldur þeirra til öryggis í Svíþjóð áður en Þjóðverjar gátu sent þá í dauðaföll. Sumir Danir studdu nasisma með því að ganga í danska nasistaflokkinn eða bjóða sig fram til að berjast með Þjóðverjum sem hluti af Frikorps Danmark. Ísland skar tengsl við Danmörku og varð sjálfstæð lýðveldi árið 1944; Þýskaland gafst upp í maí 1945. Árið 1948 fengu Færeyjar sjálfstjórn. Árið 1949 varð Danmörk stofnfélagi NATO.