Greeley studdi ekki Lincoln í upphafi til tilnefningar í 1864, en valdi aðra frambjóðendur. Í febrúar skrifaði hann í "Tribune" að Lincoln gæti ekki verið kjörinn í annað kjörtímabil. Engin frambjóðandi var þó alvarleg áskorun á Lincoln og Lincoln var tilnefndur í júní, sem "Tribune" hrósaði örlítið. Í ágúst, þar sem Greeley óttaðist sigur Demókrata og samþykki Samfylkingarinnar, hóf hann samsæri um að fá nýja þing að tilnefna annan frambjóðanda, með Lincoln að draga sig frá. Áætlunin tókst ekki. Einu sinni.
Þegar Atlanta var tekin af liðinu 3. september varð Greeley ákafur stuðningsmaður Lincoln. Greeley var ánægður með endurkjör Lincoln og áframhaldandi sigra sambandsins.