Í rússneska-japönsku stríði 1904-1905 átti sér stað sjóbarátta við Korsakov í ágúst 1904. Árið 1905 réđ Japan Sakhalín.
Í lok stríđsins var Suđur-Sakhalína, ásamt Korsakovski, afhent Japan árið 1905 eftir ađ Rússar misstu í stríđinu. Rússar brenndu tréborgina fyrir afhendingu. Á ösku Korsakovsky-herstöðvarinnar byggðu Japanir steinklædda nútímaborg með steyptum götum og rafmagni, og kölluðu hana "Ōtomari" (大泊), þýðing á Ainu-orðum "Poro-an-tomari" (stóra höfn). Bærinn var tímabundið höfuðborg Karafuto-héraðs á árunum 1905 til 1907. Á meðan hann var í höndum Japana vaxaði bæinn verulega. Á Ōtomari, sem var refsilandi undir stjórn Rússlands, var unnið með þvinguvinnu. Japanir fluttu þúsundir Kóreumanna til Ōtomari sem verkamenn. Núverandi Kóreumenn í Korsakov eru aðallega afkomendur þeirra verkalýðsþyrftu.