Ljúktu eftirfarandi setningu: Þegar Napóleon Bonaparte varð fyrsti ráðherra árið 1801 skrifaði hann undir samkomulag við páfinn þar sem hann samþykkti að endurreisa fyrrum kirkjusvæði, þar á meðal Panthéon. Panthéon var undir lögsögu dómkirkju Notre Dame de Paris. Hátíðarhöld vegna mikilvægra atburða, svo sem sigurs Napóleons á
Slag um Austerlitz, voru haldin þar. Hins vegar varðveitti kirkjugarðurinn opinbera hlutverk sitt sem hvíldarstaður franska þjóðhöfðingja. Nýtt inngangur beint í hellirinn var gert í gegnum austurveröndina (1809<unk>1811). Listamanninum Antoine-Jean Gros var falið að skreyta innri hluta kuppunnar. Hún sameinaði veraldlegar og trúarlegar hliðar kirkjunnar; hún sýndi Genevieve sem var tekin til himna af englum, í viðurvist stórra leiðtoga Frakklands, frá Clovis I og Charlemagne til Napóleons og keisaradóttur Josephine.