Ljúktu eftirfarandi setningu: Þótt Portúgal hafi verið hlutlaust í seinni heimsstyrjöldinni var Portúgalskt Tímor tekið yfir af litlum breskum, áströlskum og hollenskum liðum í desember 1941 til að koma í veg fyrir innrás Japana. En Japanir réðust inn í Tímor í febrúar 1942. Undir japönsku landnám voru landamæri Hollendinga og Portúgalar yfirsýnd með því að Timor-eyja var gerð að einni stjórnsýslu svæði Imperial Japanese Army (IJA). 400 austurrískir og hollenskir hermenn sem voru fastir á eyjunni vegna innrásar Japana fóru í skæruliðaherferð, sem bundu japanska hermenn og olli yfir 1.000 mannfalli. Timorsar og Portúgalar aðstoðuðu gerillurnar en eftir að bandamennirnir voru að lokum rýmdir var hefnd Japana frá hermönnum sínum og timorska milísunni sem var stofnuð í Vestur-Timor alvarleg. Í lok stríðsins höfðu áætlað 40-60.000 Timórar látist, efnahagslífið var í rústum og hungursneyð var útbreidd (sjá
Barátta við Timór).