1. nóvember 1864 var José Luís skipaður yfirmaður 2. deildar í aðalher Brasilíu, sem þá var kallaður "Herinn í suðri" og stjórnað af frænda sínum, feldmarshal João Propício Mena Barreto (síðar baróninn í São Gabriel). Her Suðurlands réðst inn í Úrúgvæ 1. desember. José Luís tók þátt í umsátri
af uruguayanska bænum Paysandú, sem féll 2. janúar 1865. Brasilíski herinn og bandamenn Colorados lögðu síðan höfuðborgina í Úrúgvæ, Montevideo, í umsátur. Áður en hægt var að ráðast í árás á borgina, gáfu Blancos upp og stöðvuðu átökin.