Skrifaðu framhald á þessari málsgrein - Eftir kommúnistahrun
Ahmadzai snũst aftur til Afganistan í 1978 til ađ ganga til liđs mujahideen. Hann var náinn samstarfsaðili Burhanuddin Rabbani og var oddviti Jamiat-e Islami flokks hans, en yfirgaf hann síðan og gekk til liðs við Abdul Rasul Sayyaf Islamic Dawah Organisation of Afghanistan flokkinn árið 1992, árið sem kommúnistastjórnin lauk. Hann starfaði sem ráðherra í eftir-samfylkingarstjórn Afganistan, ýmsir sem innanríkis-, byggingar- og menntamálaráðherra, og síðar varð forsætisráðherra á árunum 1995 og 1996, þó að hann hafi dregið úr mikilvægi þessara stöðu í ljósi óreiðu vegna átaka á þeim tíma.