Í 1805 gekk Rússland í bandalag gegn Napóleon. Eftir fall Austurríkjanna í Ulm í október 1805 vann Bagration hrós fyrir vel heppnaða vörn sína í Schöngrabern-baráttunni
(nóvember 1805) sem leyfði rússneskum styrkjum að draga sig til baka og sameinast helstu rússneska her Mikhail Kutuzov. Í desember 1805 varð sameiginlegur rússneskur og austurrískur herinn fyrir ósigri í Slaginu við Austerlitz, þar sem Bagration skipaði bandamönnum hægri vængnum gegn Frökkum undir stjórn Jean Lannes. Síðar skipaði hann rússneskum hermönnum í Finnstríði (1808-1809) gegn Svíþjóð og í öðru stríði gegn Tyrkjum (1806-1812) við Dóná.