1. mars 1862 skráði Timrod sig í herinn sem hermaður í B-hóp, 20. herflokki Suður-Karólínu, og var settur í sérstaka þjónustu sem skrifari í höfuðstöðvum herflokksins, en kveðjan hans kom í veg fyrir mikla þjónustu og hann var sendur heim. Eftir blóðuga bardaga Shiloh
Ári síðar reyndi hann aftur að lifa lífinu í herbúðinni sem vestrænn stríðsfréttamaður fyrir "Mercury" í Charleston, en þetta var einnig skammlíft þar sem hann var ekki nógu sterkur til að takast á við þetta erfiða verkefni.