Merkle- rótinn gefur ekki vísbendingu um dýpt trjánna.
Auðvitað er flóknari útgáfa af setningunni "Hash rót Merkle bendir ekki á tré dýpt, sem gerir mögulegt annað formynd árás þar sem árásarmaður skapar skjal annað en upprunalega sem hefur sömu Merkle hash rót. "