Watson byrjaði feril sinn á sviði og gekk í Royal Shakespeare Company árið 1992. Árið 2002 lék hún í framleiðslum af Twelfth Night og Uncle Vanya á Donmar Warehouse og var tilnefnd til Olivier-verðlauna 2003 fyrir bestu leikkonu fyrir síðari. Aðrar kvikmyndir hennar eru The Boxer (1997), Angela's Ashes (1999), Gosford Park (2001), Punch-Drunk Love (2002), Red Dragon (2002), The Life and Death of Peter Sellers (2004), Corpse Bride (2005), Miss Potter (2006), Synecdoche, New York (2008), Oranges and Sunshine (2010), War Horse (2011), The Theory of Everything (2014) og Kingsman: The Golden Circle (2017).
á sviði