Í 1805 varð hann prófessor í læknisfræði í Kiel (sem þá var í Danmörku og hluti af hertogalandi Holstein) með titilinn dómsmálaráðherra og síðar ráðherra ríkisins. Þetta voru erfiðir ár fyrir Danmörku, sem hafði gengið á hlið Frakklands í Napóleonastríðunum.
gegn Englandi (og bandamönnum hennar) til að varðveita sjóveldi hennar. Peningar voru vandamál og Wiedemann notaði eigin auðlindir til að stofna ljósmæðraklinikina sem hann lagði til sem einn af skyldum sínum sem prófessor.