Ljúktu eftirfarandi setningu: Eftir að hann kom aftur til Ástralíu var Wilton skipaður aðalstjóri stjórnsýslunnar í höfuðstöðvum austurlands, hans fyrsta stjórnsýslustöðu. Í nóvember 1955 var hann settur í aðalstöðvar AHQ, þar sem hann var ábyrgur fyrir upplýsingaþjónustu, aðgerðum og áætlunum og tók þátt í undirbúningi ástralska SEATO æfinga. Hann var færður í hershöfðingi 24. mars 1957 og varð yfirmaður konunglega herháskólans í Duntroon. Þrátt fyrir að vera ekki mjög trúaður taldi Wilton sig ábyrgan fyrir andlegri og siðferðilegri þróun yngri kadétta. Hann lagði áherslu á að mæta reglulega í kirkjusýningu og árið 1959 hóf hann persónulega áskorun um opinber fjármuni til að byggja Anzac Memorial Chapel háskólans, sem yrði opnaður árið 1966. Aðalmarkmið hans var hins vegar akademískt: áhyggjufullur um að útskrifaðir menn væru í hættu á að falla á eftir jafnaldrum sínum í iðnaði og opinberri þjónustu, sem voru sífellt hæfari í framhaldsskóla, vann hann markvisst að því að gera háskólann að menntastofnun sem veitti gráður; þetta varð að veruleika árið 1967. Frá júní 1960 til 1962 var Wilton yfirmaður hernaðaráætlunarskrifstofunnar í SEATO höfuðstöðvum í Bangkok. Hann taldi að Taíland væri strategískt mikilvægt og lýsti yfir "ef þú vilt halda Suðaustur-Asíu, þá þarftu að halda Taílandi". Staða hans leyfði honum að fylgjast náið með
Versnandi ástand í Laos, sem ógnaði að renna yfir í Taíland, og vestræna öflun áherslu á Suður-Vietnam. Hann var skipaður Companion of the Order of the Bath (CB) í afmælishátíð drottningarinnar árið 1962, einkum fyrir "áberandi hollustu sína við skyldur og einlægni í markmiðum" sem hershöfðingi Duntroon. Þann 21. janúar 1963 var Wilton kynntur sem hershöfðingi og varð yfirmaður hershöfðingsins (CGS) og tók við af hershöfðingi Sir Reginald Pollard. Hann var skipaður riddari í Order of the British Empire (KBE) á nýárshátíðinni 1964.