26. júní 2009 svaraði Obama aðgerðum íranskra stjórnvalda í garð mótmælenda í kjölfar forsetakosninganna í Íran árið 2009.
Með því að segja: "Ofbeldið sem beitt er gegn þeim er ógeðslegt. Við sjáum það og við fordæmum það". Á meðan hann var í Moskvu 7. júlí svaraði hann ummæli varaforseta Biden um mögulegt hernaðarárás Ísraels á Íran með því að segja: "Við höfum sagt beint við Ísraelsmenn að það sé mikilvægt að reyna að leysa þetta í alþjóðlegum aðstæðum á þann hátt að skapa ekki stór átök í Mið-Austurlöndum".