Mejía spilaði sitt fyrsta leik fyrir Hondúras í janúar 2011 í UNCAF Nations Cup leik gegn Kosta Ríka og hefur frá janúar 2013 unnið alls 15 landsleiki og skorað 1 mark. Hann hefur fulltrúað landi sínu á 2011 UNCAF Nations Cup sem og á
2011 CONCACAF gullbikarinn.