Á tímum nasista Þýskalands (1933-1945) voru þrír undirbúðir í Stutthof-fangabúðunum nálægt bænum: "Elbing", "Elbing (Org. Todt) og "Elbing (Schinau) ". Þeim var lokað og margir þýsku íbúanna í Elbing neyddust til að flýja þegar Rauði herinn nálgaðist borgina í lok síðari heimsstyrjaldarinnar (sjá Útflytja Austur-Prússíu
) Um 65% af mannvirkjum borgarinnar var eyðilagt, þar á meðal mestan hluta af sögulegu miðbænum. Bærinn var tekinn af Rauða hernum á nóttinni 9. - 10. febrúar 1945. Fyrstu dagana í umsátri flúðu flestir íbúa landsins, sem voru um 100.000 manns. Eftir endalok stríðsins, vorið 1945, varð svæðið ásamt bænum Elbing hluti af Póllandi í kjölfar Potsdam ráðstefnunnar og svæðið var búið af Pólverjum eftir að eftirlifandi Þjóðverjar voru annað hvort fluttir eða flúðu til Þýskalands. Frá 1. nóvember 1945 voru 16.838 Þjóðverjar eftir í bænum.