Í 1528 flúði Jón frá Ungverjalandi til Póllands, þar sem hann dvaldist hjá Jan Amor Tarnowski prins. Árið 1529 nálgaðist Jón Ottomannana og samþykkti að gera Ungverjaland að vasalríki í skiptum fyrir viðurkenningu og stuðning. Sultani Suleiman hinn magnaði samþykkti og sendi ósmanska hersveitir til að ráðast inn í Austurríki (sem fól í sér umburð á Vínarborg
), stríð sem stóð yfir til 1533. Þetta gerði Jóhannesi kleift að endurheimta stöðu sína í Ungverjalandi árið 1529, með viðleitni Frater George Martinuzzi, þrátt fyrir sambandið við Ottomans sem spillti hann á þeim tíma. Martinuzzi varð gjaldkeri konungs og trúverðugasti ráðherra Jóns.