Roy var kjörinn í miðstjórn Krishak Samiti og kommúnistaflokksins árið 1968. Á þessu tímabili hélt hann sig í felum fyrir lögreglunni og hjálpaði til við að skipuleggja mótmæli gegn Ayub Khan forseta. Hann vann kosningabaráttu fyrir frambjóðanda kommúnistaflokksins í kosningum í Pakistan árið 1970. Eftir upphaf frelsisstríðsins í Bangladesj árið 1971 flutti hann til Indlands og þjálfaðist sem meðlimur í Mukti Bahini. Hann hjálpaði til við að skipuleggja þjálfun í Mukti Bahini Balat herbúðinni í Meghalaya í Indlandi. Hann hjálpađi til viđ ađ skipuleggja gerillustyrk sem samanstķđu af vinstri flokkinn pólitískum stuðningsmönnum til ađ berjast gegn Pakistan-hernum í
Frelsunarstríð í Bangladesh.