Francis gekk síðan til Wisconsin, þar sem hann hóf doktorsnámið sitt, þar sem hann einbeitti sér að áhrifum olíuleikja. Á meðan hann var í námi, varð Exxon Valdez-slysinn
Það vakti athygli á rannsóknum hans. Eftir að hafa lokið námi fór hann til Washington D.C.