Í deildarkeppninni mættu Cubs Atlanta og Prior byrjaði leikinn gegn Greg Maddux. Prior leyfði tveimur höggum og einu hlaupi, kastaði fullum leik og sló út sjö þegar Cubs unnu 3<unk>1. Með fimm leikja sigri á Braves mættu Cubs Florida Marlins í NL Championship Series. Prior kastaði inn í áttundu inning í leik 2, leyfði þrjú hlaup (tveir unnir) og sló fimm út í 12<unk>3 sigri, áður en hann tók túninn aftur í leik 6. Í sjö umferðir kastaði hann markalausu bolta og leyfði aðeins þremur höggum þar sem Cubs tóku 3<unk>0 forystu. Ūegar Mike Mordecai flaug út á móti honum í áttunda byrjunarhringnum voru Cubs fimm út frá ūví ađ spila í fyrstu World Series-keppni sinni síđan 1945. Svo skorađi Juan Pierre tvöfaldan leik og kom Luis Castillo, sem skorađi brotlega bolta niđur vinstri víglínu sem Moisés Alou var ađ elta. Boltinn kom niður á kantinum á stúkunni, og Steve Bartman
, viftu, náði í hann og hindrađi Alou í ađ ná í hann. Castillo hélt áfram ađ ganga og Prior og Cubs náđu sér aldrei eftir atvikið. Prior glímdi við stjórn sína og gaf upp forystu með hjálp lélegrar varnarleikja, einkum með skallaðri jarðbolta af stuttleikjum Alex Gonzalez sem gæti hafa leitt til tvöfaldra leikja. Eftir að Derrek Lee sló RBI tvöfalt frá honum sem jafnaði leikinn og setti hlaupara í annað og þriðja sæti, var Prior fjarlægður úr leiknum og skipt út fyrir Kyle Farnsworth. Marlins skoruðu átta ræsir og Prior var ákærður fyrir tapið í 8-3 tapinu. Cubs töpuðu í sjöunda leik og 94 ára þurrka þeirra í World Series hélt áfram.