Vegna þess að Boston er staðsett í flatri, láglendi, nálægt sjónum, hefur borgin alltaf verið í hættu á flóðum. Styrkurinn á suðvesturhorni turnins hefur verið notaður síðan á átjándu öld til að skrá hæðir og dagsetningar á flóð kirkjunnar af ánni Witham. Flóðavarnir voru bættar eftir flóðið í Norðursjó árið 1953
Ég veit ūađ ekki. Kirkjan var flóðað árið 1978 og aftur 5. desember 2013, þegar flóð Norðurhafsins árið 2013 leiddi til vatnsflots innan og utan byggingarinnar.