Í stríđinu var hann yfirmaður vopna í Potomac-hernum, Ohio-hersins og Cumberland-hernum. Hann var virtur í bardaga við Fort Pulaski, Georgia, í bardaga við Chickamauga, í bardaga við Wilderness og í seinni bardaga við Ream's Station.
(New Market Heights). Þann 26. júní 1902 eða 8. júlí 1902 hlaut Porter heiðursmerkið fyrir bardaga við Chickamauga eins og nánar segir í tilvitnuninni hér að neðan. Síðasta árið stríðsins starfaði hann í starfsliði Ulysses S. Grant hershöfðingja og skrifaði síðar líflegar minningar um reynslu sína, "Campaigning With Grant" (1897).