Árið 1860 var Young á borð í steypufregatinu sem starfaði í Mexíkóflóa, Miðjarðarhafsflotnum og meðfram austurströnd Bandaríkjanna. Hann var um borð í "Susqehanna" þegar bandaríska borgarastyrjöldin braust út í apríl 1861 og tók þátt í blokkingu sambandsríkjanna. Hann tók einnig þátt um borð í Susquehanna í handtöku
Hatteras Inlet, Norður-Karólína, 28. ágúst 1861 og Slag við Port Royal í Port Royal, Suður-Karólína, 7. nóvember 1861. Frá nóvember 1861 til júní 1862 var hann framkvæmdastjóri á slúpp-of-stríð, sem var í blokkingu á Wilmington, Norður-Karólínu, og frá júní 1862 til nóvember 1862 var hann framkvæmdastjóri á hliðarhjóla gufu fregat á blokkadeild frá Charleston, Suður-Karólínu, og var kynntur sem liðsforingi 16. júlí 1862.