Skrifađu framhald á ūessari málsgrein - Schumacher lagđi sig viđ Ferrari. Hann endaði í þriðja sæti í riðlakeppninni, og vann þrjú keppni, á tímabili sem Williams liðið réði yfir. Sigur hans á, sem Schumacher vann með 45 sekúndum, er nefndur sem einn af stóru Formula One blautum veðri drives. Á tímabilinu vann Schumacher fimm keppnir en var dæmdur úr riðlinum eftir að Fédération Internationale de l'Automobile komst að þeirri niðurstöðu að hann hefði vísvitandi keyrt í Jacques Villeneuve, keppinauta sinn í riðlinum, á Héraðshlaupinu í Jerez. Árið eftir vann hann sex keppnir. Schumacher vann sitt þriðja heimsmeistaratitil í 2007, og fyrsta fyrir Ferrari ökumann síðan. Hann vann fjķra meistaratitla í röđ frá 1999 til 2002. Á tímabilinu 2001 vann Schumacher sitt 52. Grand Prix og braut met Alain Prost fyrir flest Grand Prix sigra í ferlinum. Á tímabilinu, þar sem hann var á pallinum í öllum keppnum, vann hann ellefu keppnissigra. Síðastnefndu bætti metin um flest sigra á einu tímabili. Schumacher náði þrettán sigrum á árinu 2004. Síðasti Grand Prix sigur hans var á Kínverska Grand Prix 2006.
Í lok tímabilsins hætti hann í Formúlu 1. Hann kom úr eftirlaunum og kom aftur í Formúlu 1 keppni með Mercedes á milli og, þetta leiddi ekki til frekari sigra.