Í 1691 var Churchill skipaður liðsforingi í hestvörðum og skipaði 96 byssu HMS "St. Andrew" í Barfleur og La Hogue.
í júní 1692. En Torrington-málið skiptist í flotanum og þegar Russell varð fyrsti lord hafnarmálaráðuneytisins árið 1693 sagði hann af sér. Hann varðveitti sæti sitt sem þingmaður og hélt áfram náinni tengslum sínum við Georg prins. Þegar Russell hætti störfum árið 1699 var hann ráðinn sem lord framkvæmdastjóri hjá admiralitetinum.