Carlin var yfirmaður 2. sveitardeildar 1. deildar XX liðs í eitt og hálft ár. Hann tók þátt í herferðinni í Tullahoma og síðar í bardaga við Chickamauga. Haustið 1863 barðist hann á
Lookout Mountain og Missionary Ridge í átökunum um Chattanooga. Sumarið 1864 leiddi hann herflokk sinn í Atlantaherferðinni og tók sér stutta leyfi á meðan á herferðinni stóð til að snúa aftur til Illinois til að giftast. Hann var kynntur sem deildarforingi fyrir bardaga við Jonesboro í september. Hann tók síðan þátt í herferð Shermans til sjávar og tökum á Savannah í Georgíu.