Í framhaldi af þessari málsgrein - Á seinni tímabili musterisins héldu sambönd Gyðinga og Samverja áfram að vera spennuleg. Árið 120 f.Kr. eyðilagði Hasmonean konungur Yohanan Hyrcanos I musterið í Samaríu á Gerizim-fjallinu, vegna gremju milli tveggja hópa yfir deilum um hvort Moriah-fjall í Jerúsalem eða Gerizim-fjall í Shekem væri raunverulegur staður Aqedah, og valinn staður fyrir heilaga musterið, uppspretta ágreinings sem hafði verið vaxandi síðan húsin tvö fyrrverandi sameinaða konungsríkisins fyrst klofnaði í sundur árið 930 f.Kr. og sem hafði loksins sprungið í stríð. 190 árum eftir að musterið í Samaríu og nágrenni Sikem var eyðilagt hóf hershöfðingi og síðar keisari Rómverja, Vespasianus, herferð til að bæla uppreisn Gyðinga.
66 CE, sem leiddi til eyðileggingar á gyðinglega musterinu í Jerúsalem árið 70 CE af syni hans Titus, og eftirfarandi útlegð Gyðinga frá Júdeu og Galíleu árið 135 CE í kjölfar Bar Kochba uppreisnarinnar.