Ljúktu eftirfarandi setningu: Eftir að hafa verið sigrað í uppreisninni flúði Caldas til Popayán af ótta við hefndir, en þegar hann fann að það hafði verið náð af konunglegum hermönnum undir stjórn framtíðar viceroy Juan Sámano, fór hann síðan til héraðs Antioquia. Antioquia hafði lýst yfir sjálfstæði sem "ríki Antioquia" eða "frjálst og fullvalda ríki Antioquia". Antioquia ríkið hafði skipað Juan del Corral sem einræðisherra og del Corral bauð Caldas velkominn og skipaði hann til að stofna herskóla og sem framkvæmdastjóri riffilverksmiðja og yfirverkfræðingur, auk þess að gefa honum röð fulltrúa. Sem verkfræðingur var Caldas ábyrgur fyrir uppbyggingu bygginga, púðursmiðja og byssuverksmiðja auk þess að prenta mynt. Hann kenndi einnig í verkfræðistofnuninni í Medellín árið 1814. Á árunum 1813 og 1814 tók hann að sér styrktarverkin við Cauca-á og uppsetningu riffil- og púðursverksmiðju. Í lok árs 1814 var Nariño sigraður og handtekinn af spænsku krúnunni og Bolívar og herinn hans höfðu neytt Cundinamarca til að falla undir sameinaða héraðin. Alríkisstjórn sambandsmanna, sem hafði verið stofnuð í Santafé, með vaxandi áhyggjur af möguleika á
Spænska endurvinna eftir að herferð Morillo hófst, þá kallaði Caldas til að skipa hann með því að stofna svipaðan herskóla og byggja brúar, skurði og festingar í kringum borgina. Hann var sendur í norðurherinn og til að styrkja vegi í Quindío.