Innri hluti kirkjunnar er blöndu af pólskum gotískum og áhrifamiklum pólskum barokk arkitektúr með byggingarþætti eins og stórum gullnuðum barokkaltari, bátaformum prédikustól (1750) og orgel. Kirkjan var rænd hrein og innri hluti var gjörsamlega eyðilagt af hermenn 1655 sænsk innrás (Flóðin
), sem útskýrir ríkjandi barokk í núverandi skreytingu. Í kirkjunni er að sögn einn fallegasti barokkskór í Mið-Evrópu. Bartolommeo Berrecci, listamaðurinn frá endurreisnartímann, sem hannaði Sigismundskápelluna á Wawel, er grafinn þar.