Fontàs gerði sitt fyrsta landsliðsdebut þann 31. ágúst 2009, í staðinn fyrir Gerard Piqué á síðustu sex mínútum í 3<unk>0 La Liga sigri gegn Sporting de Gijón. Fyrr á tímabilinu 2009/10 var hann kallaður af Pep Guardiola í spænska Supercup og UEFA Super Cup.
leikjum gegn Athletic Bilbao og FC Shakhtar Donetsk, en komst loks ekki á bekkinn í hvoru sinni. Hann eyddi langflestum af sínum fyrstu árstíma skráður með varaliði.