Skrifaðu framhald fyrir þessa málsgrein - Kosið í aðalstjóra árið 1903, Shirakawa sneri aftur til að ráða IJA 21. fótgönguliðnum í rússnesku-japönsku stríðinu. Á meðan á stríði stóð var hann fluttur til starfsmanna 13. deildar IJA. Þessi deild fékk sjálfstætt verkefni um að taka Sakhalin
áður en Portsmouth-samningurinn var gerður, landflutningur á Sakhalin 7. júlí 1905, aðeins þrjá mánuði eftir að þeir voru stofnaðir, og að tryggja eyjuna fyrir 1. ágúst 1905. Í kjölfar árangursríkrar aðgerðar sinnar hlaut Japan suðurhluta Karafuto í Portsmouth-samningnum, einn af fáum landvinningum Japans í stríðinu. Eftir stríðið var Shirakawa settur í starfsmannaskrifstofu hermálaráðuneytisins frá október 1905. Hann var kynntur í liðsforingi 1907, liðsforingi 1909, og yfirmaður IJA 34.