Guarnieri byrjaði æskulýðsferil sinn með Codogna og hann gerði atvinnumennskudebut sinn fyrir Como árið 1957, spilaði einnig fyrir Internazionale, Bologna, Napoli og endaði feril sinn með Cremonese 1973. Hann spilaði mest fyrir Inter Milan liðið sem þekkt er sem La Grande Inter undir stjórn Helenio Herrera, á árunum 1958 og 1967, og snögglega aftur í klúbbinn til að gera 3 leiki á tímabilinu 1969-1970. Hann var hluti af sigrum Inter á Evrópukeppni 1964 og 1965 og vann einnig þrjá Serie A titla, tvo Intercontinental Cups árið 1964.
og 1965. Þrátt fyrir að hann hafi ekki getað unnið Coppa Italia á ferlinum náði hann í úrslitin á tímabilinu 1964-65, og missti af þríleik með Inter.