Í 1616 kvæntist hann Camilla Faà di Bruno, sem hann skildi við sama ár. Sonur þeirra, Francesco Giacinto Teodoro Giovanni Gonzaga, var þó samþykktur við höllina en var ekki gerður erfingi Ferdinanda. Hann lést af pestinni í umsátri Mantuu árið 1630.
Ég veit ūađ ekki. Þann 16. febrúar 1617 giftist hann Katrín de' Medici (1593-1629), dóttur Ferdinands I, stórhertoga af Toskana.