Í 1986 voru Colón de Carvajal og persónulegi ökumaður hans drepnir af baska aðskilnaðarhópi Euskadi Ta Askatasuna (ETA), sem hafði opnað eld á bílinn sem þeir voru í og kastað handsprengju inn í, nálægt Paseo de la Castellana í Madrid, Spáni. Ásamt morđinu á Carrero Blanco
Árið 1973 var hann frægasta manneskjan sem var myrtur af samtökunum.