Daginn eftir tók Bego þátt í öðru keppni sinni, 200 metra fiðrildi. Hann synti í þriðja hita mótsins og varð í sjöunda sæti og þrjátíu og sjöunda í heild með tveimur tíunda sekúndu (0,20) fyrir Jeremy Knowles frá Bahamaeyjum með tíma 2:01.28, en endaði utan eigin landsmetis hans. Eftir að hafa tekið þrjá daga frí frá heats, keppti Bego í þriðja og síðasta viðburði sínum, 100 m fiðrildi
, sem var aðeins stjórnað af Phelps. Hann lauk hlaupinu með hraðasta hreyfingu, en varð aðeins í öðru sæti með aðeins þremur tíunda sekúndu (0,30) fyrir Shaune Fraser frá Cayman-eyjum, með tíma í 54,38 sekúndur. Bego var í fimmtíu og fjórða sæti af sextíu og sex sundmönnum í keppninni og komst ekki áfram í undanúrslitin. Eftir Ólympíuleikana gerði Bego óviðjafnanlegt átak á heimsmeistaramóti FINA 2009 í Róm, Ítalíu, þar sem hann braut þrjú landsmet í fiðrildi.