Í lok árs 1944 var þýska herinn hringt aftur til Þýskalands af Sovétríkjunum. Í byrjun árs 1945 flúði Gordian ásamt öðrum þýskum hermönnum og borgurum frá Gdingen til Danmerkur þar sem stríðið lauk.
Hann var orđinn stríđsfangur. Haustið og haustið 1945 var hann fluttur í breskt herfangabúð við Lütjenburg, nálægt ströndinni norðan Hamborgs. Í maí 1946, eftir um það bil ár í fangelsi, gat hann snúið aftur til sín í Düsseldorf þar sem hann byggði sér fljótt upp nafn sem sérlega árangursríkur prestur.