Í október 1861 varð Scott liðsforingi í 68. Ohio-herfylkingunni og yfirmaður í þeirri herfylking árið 1862. Hann þjónaði í Tennessee, þar sem hann skipaði framgangi deildar hershöfðings John A. Logan á leiðinni inn í Mississippi. Hann var trúlofađur í Port Gibson.
Raymond og Champion Hill.