Roosevelt ætlaði að byggja kanálinn, og notaði fyrri samning við Kólumbíu sem gaf Bandaríkjunum umferðarréttindi í tengslum við Panama járnbrautina. Hay spáði "uppreisn á landnámssvæðinu [í Panama] gegn þeirri heimska og spilltu stjórn... í Bogotá". Bunau-Varilla fékk fundir við báða mennina og fullvissaði þá um að bylting og panamask stjórnvöld væru vináttulegri við kanálinn. Í október skipaði Roosevelt skipum hersins að vera staðsett nálægt Panama. Panamáar gerðu uppreisn í byrjun nóvember 1903 en aðkomu bandarískra hersveita hindraði Kolumbíu í að blanda sér inn. Bunau-Varilla var skipaður fulltrúi nýfæddrar þjóðar í Washington og var fljótur að semja um Hays-Bunau-Varilla-samninginn sem undirritaður var 18. nóvember og gaf Bandaríkjunum rétt til að byggja kanálinn á svæði sem var ekki undirritað áður.
vítt, yfir sem Bandaríkin myndu beita fullri lögsögu. Þetta var ekki fullnægjandi fyrir Panamaska diplómatana sem komu til Washington fljótlega eftir undirritun, en þeir þorðu ekki að afsala sér henni. Samningurinn var samþykktur af báðum ríkjunum og var framkvæmdum við Panama-rásina hafist árið 1904. Hay skrifaði stríðsráðherra Elihu Root og hrósaði "fullkomlega reglulega leið sem forsetinn fylgdi" sem miklu fremri en vopnuð landnám á landnámi.