Borno hefur verið miðstöð íslamista hópsins Boko Haram síðan það hóf uppreisn sína.
á árinu 2009. Ágreiningurinn í Borno vakti athygli fjölmiðla árið 2009 eftir átök milli Boko Haram og öryggisliða ríkisins þar sem stofnandi Boko Haram, Mohammed Yusuf, var greint frá að hafa verið handtekinn ásamt 300 meðlimum þess. Nokkrum dögum seinna var Mohammed Yusuf tilkynnt látinn eftir að hann hefði reynt að flýja fangelsi.