Matri byrjaði næsta tímabil með því að vinna Supercoppa Italiana 2012
yfir Napoli. Hann skoraði sitt fyrsta mark í Evrópu á tímabilinu og skoraði einnig sitt fyrsta mark í Meistaradeild Evrópu í 3 - 0 útileigu gegn Celtic í 16-liða úrslitum. Hann skoraði annað mark í keppninni þegar Juventus náði í undanúrslitin, en var útrýmt af Bayern München. Matri lauk þriðja tímabili sínu með félaginu með því að vinna annað Serie A titil sinn í röð. Hann vann sitt annað Supercoppa Italiana með Juventus í byrjun næsta tímabils, þann 18. ágúst 2013, þegar Juventus sigraði Lazio 4 × 0, áður en hann yfirgaf félagið síðar sama mánuði.