11. ágúst 2012 lyfti Buffon fyrsta bikarnum sínum sem nýr fyrirliði Juventus, eftir að Alessandro Del Piero fór þegar Juventus sigraði Napoli 4<unk>2 í framlengingu í Supercoppa Italiana 2012.
Í Peking. Buffon varð fyrir smávægilegum meiðslum og missti af fyrsta leiknum í Serie A á tímabilinu 2012-13 gegn Parma 25. ágúst 2012. Hann sneri aftur í byrjunarliðið fyrir næsta leik gegn Udinese í Udine þann 2. september, með liðstjórans armband; Juventus vann leikinn 4<unk>1. Þann 20. september, í fyrsta leik Juventus í Meistaradeildinni á tímabilinu gegn Chelsea, gerði Buffon 400. leik sinn fyrir Juventus. Leikurinn endaði með jafntefli 2-2. Buffon náði sínu fyrsta hreinu yfirborði á tímabilinu í 2 - 0 heima sigri gegn Chievo þann 22. september.