Skrifaðu framhald fyrir þessa málsgrein - Aftur í Kongó-Brazzaville þjónaði Mondjo sem herforingi og hann var forstöðumaður kennslu og náms við Marien Ngouabi hernámsskólann í Brazzaville frá 1987 til 1993. Hann var með uppreisnarleiðtoga Denis Sassou Nguesso í borgarastyrjöldinni frá júní til október 1997.
Stríðið endaði með því að Sassou Nguesso náði aftur völdum og felldi forseta Pascal Lissouba. Í desember 1997 var Mondjo ráðinn sem yfirmaður herdeildar 1, sem innihélt efnahagslega höfuðborg landsins, Pointe-Noire; hann var í því starfi í fimm ár. Hann var ráðinn aðalstjóri herforingjanna í Kongó 20. desember 2002 og var efldur í röð herforingja ("général de division").