Eftir að hann sneri aftur til heimaríkis síns í Georgíu, var Khangoshvili yfirmaður georgískrar herdeildar gegn hryðjuverkum í Suður-Ossetia í stríðinu árið 2008
, en eining hans var aldrei sett. Árið 2016 leitaði Khangoshvili og fjölskylda hans, eiginkona og fjögur börn, skjóls í Þýskalandi eftir nokkrar tilraunir til að drepa hann í Georgíu sem bróðir hans telur að hafi verið skipulögð af rússneskum leyniþjónustu, þó að ásakan hafi verið hafnað af rússneskum yfirvöldum.