Ljúka eftirfarandi setningu: 15. febrúar 2006 skipaði Benedikt XVI páfi hann postulaða sendiherra í Egyptalandi og fulltrúa til Arabíulíðsins, fyrsta diplómatíska stöðu hans. Hann var einn af fáum nuntium sem ekki höfðu stundað nám í kirkjulegum akademíunni. Í frétt BBC segir: "Ákvörðun hinnar þýska páfa hefur vakið uppnám. Vatíkanskoðarar eru að reyna að komast að því hvort að þetta sé niðurlæging eða viðurkenning á sérstökum hæfileikum erkibiskupsins". Fitzgerald sagði: "Fundarbakgrunnur minn í arabísku og íslamskum fræðum er líklega talinn gagnlegur á þessari stundu til að þróa samskipti við Egyptaland og restina af íslamska heiminum". Einn fréttamaður í Vatíkaninu sagði að endurupptöku Fitzgeralds væri "versta ákvörðun páfa til þessa" og blaðamenn tóku eftir fjarveru hans þegar Benedikt páfi móðgaði múslima með
Fyrirlestur í Regensburg í september 2006. Framsal Fitzgerald reyndist vera hluti af endurskipulagningu Benedikt um curial deildir til að endurskoða milli trúarbragða umræður með ekki-kristnum með því að sameina hlutverk forseta PCID með því að Pontifical Council for Culture, endurskipulagningu sem Benedikt hóf í mars 2006 og snúið í júní 2007.