Að óttast ógn frá Imperial Japan í seinni heimsstyrjöldinni, þá hlutlaus Bandaríkin byrjaði að styrkja Dutch Harbor árið 1940, sem leiddi til byggingar Dutch Harbor Naval Operating Base og Fort Mears sem var lokið í heild í september 1941 þremur mánuðum áður en óvart árás á Pearl Harbor sem olli því að Bandaríkin fóru í stríð. Þann 3. júní 1942 réðust japanskir loftstyrkir á bæinn í bardaga við Dutch Harbor.
, hluti af Aleut-eyjum herferðinni. Eftir árásina og japönsku landnámina á Kiska og Attu voru nánast allir innfæddir íbúar Amaknak eyjar rýmdir. Margir voru geymdir, undir vondum aðstæðum, í herbúðum í Suðaustur-Alaska meðan á stríðinu stóð; töluverður fjöldi þeirra dó meðan á fangelsinu stóð.