Þrasíbulus var aftur í stjórn herflokks af atneska flotanum í Slaginu við Cyzicus, stór sigur Atheninga. Í þessu bardaga, hins vegar, Atheningar dró Spartan flotanum út til að elta lítið afl undir forystu Alcibiades; þegar Spartans hafði fengið góða fjarlægð frá landi, tveir herflokkar undir forystu Thrasybulus og Theramenes birtist í bak til að skera af afturhaldi þeirra. Spartans voru neyddir til að flýja til nálægri strönd, þar Alcibiades landaði menn sína í tilraun til að grípa Spartan skipum. Spartans, þó með aðstoð persneska her, byrjaði að keyra þetta atneska afl í sjó; sjá þessa afl, Thrasíbulus landflótta tímabundið til að létta eigin flotu undir forystu Alcibiades, og Thrasíbulus varð undir forystu Atheninga.
Taka skipin frá Spartanum.