Næsta stóra framfarir var á fjórða áratugnum, þegar Linus Pauling staðfesti lok-og-lykill kenninguna sem Ehrlich lagði til með því að sýna að samspil milli mótefna og mótefna var meira háð lögun þeirra en efnasamsetningu þeirra. Árið 1948 uppgötvaði Astrid Fagreaus að B-frumur, í formi plasmafrumna, væru ábyrgar fyrir að búa til mótefni. Fleiri rannsóknir einbeittu sér að því að einkenna mótefnaprótein.
sem einkennir uppbyggingu mótefnapróteina.