Júlio César hóf fjórða tímabilið sitt hjá Inter þann 24. ágúst 2008 með því að spila í Supercoppa Italiana
leik gegn Roma; venjulegur leikur og framlenging endaði í jafntefli 2×2. Í vítaspyrnukeppninni stöðvaði hann tilraun liðsfélaga síns frá Brasilíu, Juan, sem braut Inter leið til sigurs þar sem "Nerazzurri" unnu 8 til 7. Mánuði síðar spilaði hann í 100. leik sínum í Serie A þegar Inter vann 1:0 gegn Lecce í Serie A viku 4. Inter endaði meistaratitilinn aftur í fyrsta sæti með 84 stig, 10 fleiri en Juventus í öðru sæti, með Júlio César sem stuðlaði að 17 hreinum skjölum í 36 leikjum og jafnaði persónulegt besta sett hans á fyrra tímabili.