Eftir atburđana í fyrri leikjum er töfrandi landið Gensokyo aftur í friđi, en enn og aftur er ūađ ekki.
Auðvitað er flóknari útgáfa setningarinnar "Eftir atburði fyrri leikja er töfrandi landið Gensokyo aftur í friði þar til yōkai byrjar að herja á Hakurei helgidóminn og gríðarlegur kraftur fer frá neðan vatni hátt í fjöllunum. "