Í seinni heimsstyrjöldinni réðst japanska herinn inn í Malasíu, Norður Borneo, Sarawak og Singapúr í meira en þrjú ár. Á þessum tíma vakti þjóðernisspennan og þjóðernisstefnan jókst. Alþýðubækur fyrir sjálfstæði jókst eftir að Malasíu var endurheimtuð af bandamönnum. Eftir stríðið voru breskir áætlanir um að sameina stjórnsýslu Malasíu undir einu krúnubúaríki sem kallast "Malayan Union" mætt sterka andstöðu frá Malaysum, sem andmæltu veikingu Malasíu stjórnenda og veitingu ríkisborgararéttar til kynþátta Kínverja. Malays Union, sem var stofnuð árið 1946 og samanstóð af öllum breskum eignum í Malay hálendis nema Singapúr, var fljótt leyst upp og skipt út 1. febrúar 1948 af Samfylkinginni Malasíu, sem endurreisti sjálfstæði stjórnenda Malasíu undir vernd breskra Malay-ríkjanna.
Tun Abdul Razak