Eftir að hann sneri aftur til Bandaríkjanna um miðjan 1942 sótti Wilkes námskeið í hernámsbraut sjóvarpsins og varð síðan yfirmaður nýrrar léttrar krossboðs, sem hann fór með til Miðjarðarhafs til að taka þátt í innrásinni á Sísíu í júlí 1943. Frá og með ágúst 1943 hafði Wilkes yfirráð yfir landflögum í Englandi og Frakklandi og gegndi mikilvægu hlutverki í undirbúningi innrásarinnar í Normandíu í júní 1944 og innrásarinnar í Suður-Frakklandi.
Tveimur mánuðum síðar. Þegar jarðafyrirrás bandalagsins fór inn í Þýskaland var Wilkes í forsvari bandarískra hafna og herstöðva í Frakklandi og aðstoðaði ofbeldið með stjórnun á lóðfræði.