Frelsisviðræður við Austurríki fóru ekki neitt í vor 1799, og stjórnin ákvað að hefja nýja árás á Þýskaland, en komu rússneska hersins undir forystu Alexander Suvorov og nýrrar austurrísku hersins undir forystu Karls erkihertoga breytti valdahlutfalli um tíma. Her Danúbuher Jourdan fór yfir Rín þann 6. mars en var sigrað af Karl erkihertoga, fyrst í Slaginu við Ostrach
og svo í Slaginu við Stockach 25. mars 1799. Her Jourdans dró sig til baka á meðan Jourdan sjálfur sneri aftur til Parísar til að biðja um fleiri hermenn.