Ljúktu eftirfarandi setningu: En emirinn hafði aðeins fengið tímabundið hlé. Þegar borgarastyrjöldin í Rússlandi minnkaði sendi Moskva styrktarliði til Mið-Asíu. Þann 2. september 1920 kom her af vel agaðum og vel búnuðum Rauðaherliðum undir stjórn Mikhail Frunze, hershöfðingja bolsjevíka.
réđust á borgina. Eftir fjögurra daga átök var örk Bukhara eyðilögð, rauði fáninn hækkaður ofan af Kalyan Minaretinu og Emír Alim Khan neyddist til að flýja til grunnstöðvar sinnar í Dushanbe (í Tajikistan í dag) og loks til Kabúl í Afganistan, þar sem hann lést árið 1944. Hann er grafinn á Shuadoi Solehin kirkjugarðinum.