Eftir að hún kom heim í mars 1801 fékk hún fyrirmæli um að undirbúa sig fyrir árlega siglingu á Miðjarðarhafi í liðsflokki undir stjórn Richard Dale. Að eigin ósk var Decatur leystur frá stjórn Philadelphia af Samuel Barron skipstjóra. Skáttan kom til Gibraltars 1. júlí, með Commodore Dale í fregatinu. "Philadelphia" fékk fyrirmæli um að sigla um sundinn og loka ströndinni við Tripoli, þar sem í maí 1801 hafði Pasha Yusuf Karamanli hótað að hefja stríð
á Bandaríkin og hafði handtekið bandaríska kaupskip fyrir lausnargjald.