Ljúkaðu eftirfarandi setningu: FK Vardar og FK Rabotnički eru tvö vinsælustu fótboltaliðin sem spila í fyrstu landsdeildinni. Leikir þeirra eru haldnir á Philip II Arena, eins og landsliðsins. Í borginni eru einnig mörg smærri knattspyrnufélög, svo sem: FK Makedonija Gjorče Petrov, FK Gorno Lisiče, FK Lokomotiva Skopje, FK Metalurg Skopje, FK Madžari Solidarnost og FK Skopje, sem spila í fyrstu, annarri eða þriðju landsmóti. Önnur vinsæl íþrótt í Norður-Makedóníu er körfubolti, sem einkum er fulltrúi liða MZT Skopje og Rabotnički. Handbolti er lýst af RK Vardar PRO og RK Metalurg Skopje, einnig kvennaliðinu ŽRK Metalurg og ŽRK Vardar. Bærinn hýsti Evrópumeistaramótið í handknattleik kvenna 2008 ásamt Ohrid og var gestgjafi
2017 UEFA Super Cup, leikur milli tveggja risana í evrópskum fótbolta Real Madrid og Manchester United