PWS er af völdum epigenetic fyrirbæri þekkt sem imprinting, sem stafar af eyðing föður eintök af SNRPN og NDN necdin genum ásamt hópi af snoRNAs: SNORD64, SNORD107, SNORD108 og tvö eintök af SNORD109, 29 eintök af SNORD116 (HBII-85) og 48 eintök af SNORD115 (HBII-52). Þetta eru á litli 15 staðsett í svæðinu 15q11-13. Þetta svokallaða PWS / AS svæði getur verið glatað af einum af nokkrum erfðafræðilegum aðferðum, sem í flestum tilvikum gerist í gegnum tilviljun stökkbreytingar. Önnur, minna algengir aðferðir fela í sér uniparental disparomy, sporadic stökkbreytingar, litli translocations, og eyðingar af genum. Vegna imprintally, erfða eintök þessara gena eru nánast þögull og aðeins föður eintök af litli RNAs: SNORD64, SNORD107, SNORD108 og tvö eintök af SNORD109, 29
fyrirbæri sem kallast imprinting