Í Grand Prix Þýskalands 2010 var Ferrari rannsakað vegna skipulags liðsins þegar Massa tók forystuna snemma, fyrir Fernando Alonso í öðru sæti og Sebastian Vettel á eftir í þriðja sæti. Á meðan á keppninni stóð voru þessar stöður viðhaldar þar til Massa fékk leiðbeiningar frá Rob Smedley, verkfræðingi Ferrari, sem sagði: "Fernando er hraðari en þú. Geturðu staðfest að þú hafir skilið skilaboðin?" Skömmu síðar, í 49. hring, leyfði Massa Alonso að taka forystuna og vinna keppnina. Smedley bætti svo við eftir fyrirgjöfina "Ok félagi góður strákur, haltu þig við hann núna, afsakið". Atvikið gaf sterklega til kynna að skipun liðsins hefði verið gerð til Massa að láta Alonso ná, og keppnisstjórar samþykktu það. Þrátt fyrir neitun liðsstjóra Stefano Domenicali var Ferrari sektað um 100.000 dollara fyrir að brjóta reglugerð um íþróttir og var málið vísað til FIA World Motor Sport Council. Massa varð fjórði í Ungverjalandi og Belgíu og þriðji í Ítalíu. Í Singapúr komst hann síðastur í undankeppni vegna gírkassa, en endaði keppnina í áttunda sæti. Massa lenti í árekstri við Vitantonio Liuzzi á fyrsta hring Japanska Grand Prix
en hafđi lokiđ í þriðja sæti í Kóreu. Hann endađi í 15 sæti í Brasilíu og í 10. sæti í Abu Dhabi. Massa endaði tímabilið í sjötta sæti í riðlaraflokki.