30. janúar 2013, Varane gerði "El Clásico" debut sinn gegn Barcelona í 2012-13 Copa del Rey
Ég veit ūađ ekki. Hann stöðvaði hættulegar tilraunir frá Barcelona, þar á meðal skot frá Xavi sem hann hreinsaði frá marklínunni. Hann lagði mark á leikinn með höfuðmarki í leiknum, sem lauk 1<unk>1. Hann varð einnig annar yngsti erlendur leikmaðurinn til að skora fyrir Real Madrid í Clásico leik. Varane skoraði þriðja markið í leiknum á Camp Nou þann 26. febrúar 2013 með höfuðspyrnu frá hornspyrnu Mesut Özil. Varane hlaut lof frá fyrrum heimsmeistara Bixente Lizarazu eftir frammistöðu sína gegn Barcelona og Manchester United. Hann sagði: "Við erum að tala um strák í Real Madrid sem hefur dregið Pepe úr sæti og Pepe, með öllu sínu, er enn frábær miðvörður. Framkoma hans gegn Manchester United og Barcelona var frábær". Varane hélt áfram að vekja athygli í fjórðungs úrslitaleiknum gegn Galatasaray, þar sem hann hjálpaði Madrid að halda hreinu blaði í 3 <unk> 0 sigur. Allar 27 sendingar hans fundu liðsfélaga sína án þess að vera fyrir, og allar tæklingar hans náðu árangri, flestar á Didier Drogba.