Þriðji St. Ignatius College fékk miðlungs skemmdir í jarðskjálftinum 1906 í San Francisco
, en var algjörlega eytt í eldinum sem fylgdi. Háskólasvæðið fluttist vestur, á horn Hayes og Shrader Streets, nálægt Golden Gate Park. Það tók hratt byggð uppbyggingu sem þekkt er sem skyrtuverksmiðjan (vegna líkingar við svipaðar framleiðsluhúsnæði tímabilsins) næstu 21 ár. Háskólinn fluttist á núverandi stað á Fulton Street árið 1927, á staðnum sem áður var kirkjugarður frímúrar.