"Peleliu" var sent aftur til Vestur-Kyrrahafsins í janúar 1990. Skipið, ásamt Amphibious Ready Group (ARG), tók þátt í fjölþjóðlegum æfingum, þar á meðal æfingu Team Spirit með styrkjum frá Lýðveldi Kóreu og æfingu Cobra Gold í Taílandi. Peleliu sneri heim til Long Beach í júlí og síðar sama sumar komst hún inn í skipasmíðastöðina í tæpt ár. Svar Bandaríkjanna á innrás Íraka í Kúveit
Í ágúst 1990 fækkaði skipasmíðastöðvunum og neyddi Peleliu í hraðvirka þjálfun fyrir ráðningu, en hún var ekki ráðinn í Desert Shield/Desert Storm. Hún fór til Long Beach í maí 1991 til að styðja við áframhaldandi aðgerðir Bandaríkjanna í Mið-Austurlöndum. Í júní 1991 var hún á leiðinni til Persaflóans en var skipt frá áætluðu höfn í Hong Kong til Filippseyja, þar sem hún tók þátt í rýmingu Bandaríkjamanna frá herstöðinni Subic Bay í kjölfar eldgosi Pinatubo-fjallsins. Við brottflutninginn voru flestir sjúklingar flutt úr fæðingardeild sjóhjúkrahússins í Subic Bay og því voru nokkrar fæðingar um borð. Þetta útbrot var eitt það stærsta á síðustu 100 árum og fjallaði um stór svæði á Filippseyjum og olli miklum skaða á bandarískum herstöðvum á svæðinu, þar á meðal herstöðinni Subic Bay, herstöðinni Cubi Point og Clark Air Force Base.