Ýmsar kínverskar konungsættir hafa í gegnum söguna haft mismunandi áhrif á hluta þess sem nú er Xinjiang. Svæðið varð undir algerri stjórn Kína vegna útbreiðslunnar til vesturs.
Qing-ættin undir forystu Manchu, sem sigraði einnig Tíbet og Mongólíu. Þessi landvinnsla, sem markaði upphaf Xinjiang undir stjórn Qing, lauk um 1758. Þó að það hafi verið nafnlega lýst yfir að vera hluti af kjarna landssvæðis Kína, var það almennt litið á sem fjarlæg land til síns eigin af keisarastólnum; árið 1758 var það tilnefnt refsilandi og útlegðarsvæði, og í kjölfarið var það stjórnað sem hernaðarverndarsvæði, ekki samþætt sem hérað.