Rani Mukherjee fæddist í Mumbai 21. mars 1978. Faðir hennar, Ram Mukherjee (fæddur í fjölskyldu Mukherjee-Samarth), er fyrrverandi leikstjóri kvikmynda og einn af stofnendum Filmalaya Studios. Móðir hennar, Krishna Mukherjee, er fyrrverandi leikstjóri söngvari. Eldri bróðir hennar, Raja Mukherjee, er kvikmyndaframleiðandi og leikstjóri. Móðir hennar, Debashree Roy, er bengalska kvikmyndaleikkonan og frændi hennar, Kajol, er hindí kvikmyndaleikkonur og samtímamaður hennar. Annar frændi hennar, Ayanruz Mukerji, er handritshöfundur og leikstjóri. Þrátt fyrir að foreldrar hennar og flestir ættingjar hennar séu meðlimir í indversku kvikmyndaiðnaðinum, hafði Rani Mukherjee ekki áhuga á að stunda kvikmyndaferil. Hún sagði: "Það voru nú þegar einhverjir leikkonur á Hindu leiklistinni og ég vildi vera einn af stofnendum Filmalaya Studios.
Krishna Mukherjee