Sagt er að stjórnsýslunni hafi verið skipað af fimm fylkjum: Austur-Bengal (sem síðar varð að Bangladess), Vestur-Punjab, Balochistan, Sindh og North-West Frontier Province (NWFP). Hvert fylki hafði sinn eigin landstjóra, sem var ráðinn af General Governor of Pakistan. Auk þess, á næsta ári, voru höfuðríki Pakistans, sem náðu til umtalsvert svæði í Vestur-Pakistan, aðild að Pakistan. Þeir voru meðal annars Khairpur, Bahapur, Swat, Dir, Hunza, Chitral, Khanate of Kalat.
Aðalstjóri Pakistan