N'Doye vann gullverðlaun með Frakklandi á FIBA Evrópumeistaramóti U-16 árið 2014 í Lettlandi með 5,8 stig, 3,4 fráköst og 2,3 stoðsendingar á leik. Hann vann annað gullverðlaun með Frakklandi á 2016 FIBA U18 Evrópumótaröðinni í Samsun, Tyrklandi. N'Doye keppti einnig í 2017 FIBA Under-19 World Cup
í Kaíró og 2018 FIBA U20 Evrópumótaröðinni í Chemnitz, Þýskalandi, en liðið hans náði ekki að verðlaun.