IndiGo var stofnað árið 2006 sem einkafyrirtæki af Rahul Bhatia frá InterGlobe Enterprises og Rakesh Gangwal, NRI frá Bandaríkjunum. InterGlobe átti 51,12% hlut í IndiGo og 47,88% var í eigu Caelum Investments, fyrirtækis Gangwalls í Virginia. IndiGo gerði fasta pöntun á 100 Airbus A320-200 flugvélum í júní 2005 með áætlun um að hefja starfsemi um miðjan árið 2006. IndiGo tók afhendingu fyrstu flugvélarinnar 28. júlí 2006, næstum ári eftir að pöntun var gerð. Það hóf starfsemi 4. ágúst 2006 með þjónustu frá New Delhi til Imphal í gegnum Guwahati.
Fyrirtæki Gangwal í Virginia, Caelum Investments.