Fadrique var mjög nálægt kaþólskum konungum. Faðir hans hafði barist í
Í stríðinu um arftöðu Kastillíu tók hann þátt með konungskonunni Ísabellu I af Kastillíu gegn systkinabarninu hennar, Juana la Beltraneja, og móðir hans var yngri hálfsystur Juana Enríquez y Fernandez de Cordoba, sem gerir hann að frænda Ferdinands II af Aragón.