Aubry útskrifaðist frá Háskólanum í Ottawa árið 1978. Hann stofnaði heimilislæknastofu í Hull í Quebec 18. september 1981. Frá og með árinu 2018 er hann framkvæmdastjóri í Ottawa Sport Medicine Centre og er liðslæknir fyrir Ottawa Senators. Aubry starfaði áður sem liðslæknir fyrir Ottawa 67's frá 1996 til 2005, Ottawa Rough Riders, Ottawa Renegades og Ottawa Lynx. Hann var þjálfari í smærri íshokkí liðum frá 1989 til 2000, yfirlæknir (CMO) fyrir kanadíska liðið á
Vetrarólympíuleikarnir 1991 og CMO Kanada á vetrarólympíuleikunum 1992 í Albertville.