Í 4. leik 2016 í National League Division Series gegn San Francisco Giants með Cubs með 2<unk>1 forystu í seríunni, keyrði Zobrist í Kris Bryant til að skora fyrsta hlaupið efst í níunda og skoraði síðar jafntefli á tveggja hlaupa einleik Willson Contreras. Cubs skoruðu annað hlaup seinna í hringnum og sendu þá í National League Championship Series. Eftir sigur Cubs í 7. leik í World Series 2016
, eftir að keyra í fyrsta af tveimur fara-ahead rekur í toppnum af 10. inning, hann var kallaður World Series Most Valuable Player og fékk annað World Series hring.