Hann fékk sitt fyrsta leik í vináttuleik gegn Spáni 12. september 1990 og spilaði sparsamlega fyrir Brasilíu í byrjun níunda áratugarins og komst á leikmannalista HM 1994 sem varamaður. Hann lék í úrslitakeppninni gegn Ítalíu, eftir meiðsli Jorginho á 22. mínútu. Eftir það var Cafu fljótlega fastur í byrjun ellefu þegar Brasilía vann Copa América árið 1997.
og 1997 FIFA Confederations Cup og komst í úrslit HM 1998.