Enn vegna Achilles vandamál hennar, Vlašić gerði aðeins eitt útliti í tímabilinu 2016 í Split þann 29. janúar þar sem hún tók sigurinn með 1.95 m, stökk yfir hæfi staðall (1.93 m) fyrir Ólympíuleikana 2016. Þann 3. febrúar var hún skurðað í Turku í Finnlandi. Þrátt fyrir að hafa ekki keppt á útivistartímabilinu (hún afbókaði þátttöku sína á Evrópumótaröðinni og í London Diamond League) var hún valin af Króatíska sambandinu ásamt Ana Šimić til að vera fulltrúi Króatíu í
hástökk á Ólympíuleikunum.