Skrifaðu framhald fyrir þessa málsgrein - 20. janúar 2007, eftir að Maaouya Ould Sid'Ahmed Taya forseti var rekinn úr völdum í ágúst 2005 í hernaðarlegu "ríkistyrjöldinni"
, Boulkheir tilkynnti um framboð sitt í forsetakosningunum í mars 2007. Í kosningunum, sem haldnar voru 11. mars, varð hann fjórði, með 9,79% atkvæða. Þann 19. mars studdi hann Sidi Ould Cheikh Abdallahi í annarri umferð þrátt fyrir að hann væri hluti af Samfylkingu öflanna fyrir lýðræðislegar breytingar ásamt öðrum frambjóðanda í annarri umferðinni, Ahmed Ould Daddah. Abdallahi vann kosningarnar og 26. apríl 2007 var Boulkheir kjörinn forseti Þjóðfundarins og hlaut 91 atkvæði af 93 þingmönnum.