Hernandez byrjaði feril sinn hjá Atlético Madrid þar sem hann lék meira en 100 leiki og komst í úrslit UEFA Meistaradeildarinnar 2016. Hann vann einnig Evrópudeildina 2018 og Super Cup.
á sama ári. Hann skrifaði undir hjá Bayern árið 2019 og vann Bundesliga, DFB-Pokal og Meistaradeildina á sínu fyrsta tímabili sem hluti af þrígangi. Hernandez er landsliðsmaður Frakklands frá árinu 2018 og var hluti af sigurliðinu á HM 2018 og tók einnig þátt í UEFA Euro 2020.