Voegelin var fæddur í Köln árið 1901, foreldrar hans fluttust til Vínar árið 1910 og Eric Voegelin stundaði nám við Háskólann í Vín. Hans Kelsen og Othmar Spann voru ráðgjafar hans í ritgerð hans. Eftir habiliteringuna árið 1928 kenndi hann stjórnmálafræði og félagsfræði. Á Austurríki hóf Voegelin langvarandi vináttu við Alfred Schütz og F. A. Hayek. Vegna Anschluss Austurríkis við Þýskaland árið 1938 var Voegelin rekinn úr starfi.
Árið 1920