Skrifaðu framhald fyrir þessa málsgrein - Þótt stuðningsmenn Vilhjálms réðu yfir stjórnvöldum, þá var enn mikil fylgd með Jakob, einkum á hálendinu. Ástæða hans, sem varð þekkt sem jakobítisma, eftir latnesku (Jacobus) fyrir Jakob, leiddi til fjölda uppreisna. Fyrstu hernaðartilraun Jakobíta var undir forystu John Grahams, sem er nú viskuti Dundee. Her hans, sem var nánast allur Highlanders, sigraði her Vilhjálms í bardaga við Killiecrankie
1689 en ūeir fengu mikinn tap og Dundee var drepinn í bardaga. Án forystu hans var her Jakobíta fljótt sigrað í Dunkeld-baráttunni. Algjörn ósigur Jakobs í Írlandi fyrir Vilhjálmi í orrustunni við Aughrim (1691) endaði fyrsta áfanga hernaðaraðgerða Jakobíta. Í kjölfar ósigurs Jakobíta þann 13. febrúar 1692 í atvikum sem þekkt er sem Sláturmálið í Glencoe, voru 38 meðlimir MacDonald-ættarinnar í Glencoe drepnir af meðlimum fótherherflugs Argyll-héraðsins, sem höfðu tekið við gestrisni þeirra, á þeim forsendum að þeir hefðu ekki verið fljótir í að sverja hollustu við nýja konungana.