11. ágúst 2015 byrjaði hann tímabilið fyrir Sevilla í 2015 UEFA Super Cup
5 fyrir 4 tap gegn Barcelona, og varð fyrir brotnu rifbeini en spilaði samt 120 mínútur. Hann byrjaði sem miðvörður í upphafsleiknum á tímabilinu og hélt áfram að spila í varnarstöðu miðjunnar. Í kjölfarið hóf klúbburinn viðræður við Krychowiak um nýjan samning. Stjórnandi Unai Emery hrósaði frammistöðu hans og kallaði "fórn hans og hollustu gagnvart liðinu setur þá alltaf í þjónustu þeirra". Hinn 5. nóvember 2015 skrifaði Krychowiak undir framlengingu á samningi við Sevilla og hélt honum í félaginu til ársins 2019. Skömmu síðar var hann fyrirliði félagsins í nokkrum leikjum það sem eftir var af árinu. Eftir að hafa verið dæmdur í einn leik skoraði hann sitt fyrsta mark á tímabilinu, í 2 - 0 sigri gegn Real Betis í fyrri leik Copa del Rey síðustu 16 keppninnar. Þremur dögum síðar, þann 9. janúar 2016, varð hann fyrir hnémeiðslum sem gerðu að hann var frá í tvo mánuði. Þann 20. mars 2016 kom Krychowiak aftur í byrjunarliðið gegn Real Madrid en félagið tapaði 3-2. Eftir að hann kom aftur í fyrsta liðið, lagði hann síðar tvær stoðsendingar í tveimur leikjum í UEFA Europa League fjórðungi úrslita og hálfleik gegn Athletic Bilbao og Shakhtar Donetsk, til að senda Sevilla í úrslit UEFA Europa League í þriðja sinn í röð. Hann byrjaði í úrslitum UEFA Europa League gegn Liverpool og spilaði allan leikinn þar sem þeir unnu 3<unk>1, og unnu mótið í þriðja sinn í röð.