Á háskólanum tók hann þátt í umræðum um Gyðinga og las útgáfur Theodor Herzl og annarra áberandi Zionists. Árið 1946 var hann arabískur þjóðernissinnaður og byrjaði að afla vopna til að smyglast inn í fyrrverandi breska Mandate Palestínu, til notkunar af óreglulegum í Arab Higher Committee og herinn heilaga stríðs milísium. Á meðan á 1948 Arab<unk>Israeli stríð, Arafat yfirgaf háskólann og, ásamt öðrum Arabar, leit að koma til Palestínu til að taka þátt í arabískum styrkjum sem berjast gegn herjum og sköpun Ísraelsríkis.
Árið 1949