Komatsu lést 26. júlí 2011 í Osaka af völdum lungnabólgu í 80 ára aldri. Fimm dögum fyrir dauða hans gaf ársfjórðungsblaðið hans, "Sakyo Komatsu Magazine", út útgáfu með grein um hugsanir hans um sjóvarpið 2011.
Ég veit ūađ ekki. Í greininni lýsti Komtasu von um að land hans myndi þróast eftir hörmungina. "Ég hélt að mér væri sama hvort ég deyði á hverjum degi... en nú finnst mér ég vilja lifa aðeins lengur og sjá hvernig Japan mun halda áfram eftir þetta", skrifaði hann.