Eftir að þriðji kalífinn Uthman var myrtur árið 656 af uppreisnarmönnum í héraði, féll kalífatið í borgarastyrjöld
sem Mu'awiya ibn Abi Sufyan, ættingi Uthman og landstjóri Sýrlands, hafnaði lögmæti nýs kalifa Ali. Ákveðna bardaginn milli þeirra tveggja í Siffin endaði með gerðardómssamningi í júlí árið 657. Að fullyrða að mannleg skilyrði væri ógilda þar sem skipun Guðs var skýr að uppreisnarmenn (í þessu tilfelli Mu'awiya) þurftu að berjast og sigrast, yfirgáfu sumir hermenn Ali hersins. Þeir voru kallaðir Kharijites eftir þessa aðskilnað. Síðar börðust þeir gegn Ali í Nahrawan-stríðinu í júlí 658 og voru krossfestir af kalifanum. Eftir að Ali var myrtur árið 661 af Kharijite, varð Mu'awiya eini stjórnandi og stofnaði Umayyad Kalifatið. Á valdatíma hans blómstraði Kharijítar í borginni Basra í suðurhluta Írak. Kharjítar flúðu til Arábíu um 680 en þeir voru harðlega kúgaðir af Ziyad ibn Abih og síðar Ubayd Allah ibn Ziyad.