Ljúka eftirfarandi setningu: Sovétríkin stofnuðu kúgunarstjórn. Flestir æðstu opinberir og hernaðarlegir embættismenn, greindarfólk og iðnaðarmenn voru handteknir og yfirleitt teknir af lífi fljótlega eftir það. Sovétríkin náðu hámarki sínu 14. júní 1941 með
fjöldaflutningi um 11.000 manna til Síberíu, þar sem meira en helmingur fórst í ómannúðlegum aðstæðum. Þegar þýska Barbarossa-herförin, ásamt estneskum skæruliðum sem kölluð voru "skógarbræður", hófst gegn Sovétríkjunum 22. júní 1941 í svokölluðu "sumarkriginu" () voru um 34.000 ungir estneskir karlar þvingaðir inn í Rauða herinn, en færri en 30% þeirra lifðu stríðið af. Sovétríkin héldu upp á stefnu um að brenna jörðina. Pólitískir fangar sem ekki var hægt að flytja voru teknir af lífi af NKVD. Margir Eistlendingar fóru út í skóginn og hófu gerilluherferð gegn Sovétríkjunum. Í júlí náðu þýsku hersveitirnar Suður-Estlandi. Sovétríkin rýmdu frá Tallinn í lok ágúst með miklum tapi og þýsku styrkjunum tókst að ná í eyjurnar í Eistlandi í október.