Hann byrjaði vel á tímabilinu 2012/13 og vann gegn Tony Drago og Robert Milkins til að komast í úrslit Australian Goldfields Open.
í Bendigo; þar vann hann staðbundinn villtkort James Mifsud 5<unk>0, áður en hann fór úr mótinu með sömu skorlínu gegn Ding Junhui. Á Welsh Open árið 2013 náði McManus í fyrsta fjórðungs úrslit sitt síðan Grand Prix árið 2006 með 4-2 sigri á númer 16 sæti Barry Hawkins, ásamt dramatískum endurkomu til að vinna Joe Perry 4-3 eftir að hafa verið á eftir 0-3. Hann var slegið í undanúrslitum 3×5 af landsmanninum Stephen Maguire. Á næsta mót, Haikou World Open, vann McManus þrjá leiki í undankeppninni til að komast á síðari stig mótsins. Hann sigraði síðan Lin Shuai 5<unk>3, áður en hann mætti landsmanninum John Higgins. McManus gerði góða frammistöðu; hann tapaði að lokum 3<unk>5, en tók upp verðmæt stig í röðunarferlinu.