Fedorov var valinn af Tampa Bay Lightning í sjöttu umferðinni, 182 í heild, í 1999 NHL Entry Draft. The Lightning skrifaði ekki undir innan tveggja ára frá því að hann eignaðist réttindi sín, þannig að hann kom aftur inn í NHL draftið í
Árið 2001. Hann var valinn af Vancouver Canucks í þriðju umferð (66. í heild).