Á þriggja ára aldri var Suharto skilað til móður sinnar, sem hafði giftast staðbundnum bónda sem Suharto hjálpaði í hrísgrjónum. Árið 1929 fór faðir Suharto með hann til að búa hjá systur sinni, sem var gift landbúnaðarstjóra, Prawirowihardjo, í bænum Wuryantoro í fátæku og lágu ræktunarsvæði nálægt Wonogiri. Á næstu tveimur árum var hann tekinn aftur til móður sinnar í Kemus Daruhiri af móður sinni og síðan aftur að lifa í Wuryantoro af föður sínum.
Á meðan ég bjó hjá Hardjowijono