Í janúar 2012 hófst uppreisn Tuaregs í norðurhluta Mali, undir forystu Alþjóðafrelsishreyfingarinnar fyrir Azawad (MNLA). Í mars tók herforingi Amadou Sanogo völdin í valdarás.
, þar sem nefnt er að Touré hafi mistekist að bæla uppreisnina og að það hafi leitt til refsiaðgerða og sóttvarna frá efnahagssamtökunum Vestur-Afríku. MNLA tók fljótt yfir norðan og lýsti yfir sjálfstæði sem Azawad. En íslamískir hópar, þar á meðal Ansar Dine og Al-Qaeda í íslamska Maghreb (AQIM), sem höfðu hjálpað MNLA að sigra ríkisstjórnina, snéru sér gegn Tuareg og tóku stjórn á norðri með það að markmiði að innleiða sharia í Mali.