Árið 2003 varð Barbour annar repúblikanismaður í embætti ríkisstjóra Mississippi frá endurreisn þegar hann sigraði demókrata Ronnie Musgrove. Sem ríkisstjóri hafði hann umsjón með viðbrögðum ríkisins við fellibylnum Katrina og olíuflóðinni í Deepwater Horizon árið 2010.
Ūær eru tvær verstu umhverfisslysin í fylkinu síđan Mississippi-flķđin árinu 1927. Barbour átti að vera frambjóðandi til forseta árið 2012, en tilkynnti að hann myndi ekki bjóða sig fram í apríl 2011.