Catania var fyrsti opinbera samkynhneigði í D.C. ráðinu og einn af fáum opinbera samkynhneigðum repúblikönskum embættismönnum. Þetta leiddi til átaka innan flokksins þegar George W. Bush forseti talaði fyrir breytingu á stjórnarskrá Bandaríkjanna til að banna hjónabönd samkynhneigðra. Catania var andvígur breytingunni og var andstæðingur endurkjöri Bush árið 2004. Í viđbrögđum hafnađi Repúblikananefndin í District of Columbia honum sem fulltrúa í
Þjóðarsáttmálinn hjá Repúblikönum 2004. Catania tilkynnti um stuðning sinn við forsetaframbjóðanda demókrata, John Kerry, viku fyrir þingið. Í september 2004 yfirgaf Catania flokkinn og varð sjálfstæðismaður, þar sem hann nefndi óánægju sína með stefnu hans í þéttbýlis- og félagslegum málefnum. Hann var endurkjörinn árið 2006 og 2010 sem óháður.