Majungasaurus er flokkuð sem meðlimur theropod klade Abelisauridae, sem er talin fjölskylda í Linnaean taxonomy. Ásamt fjölskyldu Noasauridae, abelisaurids eru innifalin í yfirfjölskyldu Abelisauroidea, sem er aftur undirdeild af infraorder Ceratosauria. Abelisaurids eru þekkt fyrir háa höfuðkúpunum sínum með blunt snouts, víðtæka skúlptúr á ytri yfirborðum andlitsbeina (samræmi við carcharodontosaurids), mjög minnka (atrophied) forlimbs (samræmi við tyrannosaurids), og stocky hindlimbs, meðal annarra eiginleika. Eins og með mörgum risaeðlum, þá eru kerfisbundnar (breytingarfræðilegar) tengsl innan fjölskyldunnar Abelisauridae. Margir rannsóknir hafa sýnt fram á að flestir Majungasaurids eiga náið samband við Caratosaurus frá Vesturríki í Suður-Ameríku, en nýlegar upplýsingar um það eru óþekktar, eins og Caratosaurus frá
Afríka