26. júní 2018 skrifaði Nainggolan undir samning við Inter Milan fyrir 38 milljónir evra (24 milljónir evra auk Davide Santon og Nicolò Zaniolo, verðmæti 14 milljónir evra) til júní 2022. Hann skoraði í deilukeppni sinni 1. september og hjálpaði gestunum að sigra Bologna 3<unk>0.
26. júní 2018