Í nóvember 1842 giftist McClernand Sarah Dunlap frá Jacksonville í Illinois, en hún var náin vinkona Mary Todd Lincoln. Sarah var dóttir James Dunlap, sem starfaði sem quartermaster í Union Army í borgarastyrjöldinni, og var á endanum útnefndur í röð brevet major general. Sonur John og Sarah, Edward John McClernand, var þekktur sem herforingi í bandaríska hersins í indíánustríðum og síðar á Filippseyjum.
Ég veit ūađ ekki. Eftir dauða Söru giftist McClernand systur hennar, Minerva Dunlap.