Mayorkas var meðlimur í forsetaskip Barack Obama áður en hann tók við embætti.
Í janúar 2009, ūar sem hann stķr fyrir liđinu sem var ábyrgt fyrir glæpaafsviđ Bandaríkja- dómsmálaráðuneytisins. Mayorkas var ráðinn af Obama forseta sem forstöðumaður ríkisborgararéttar og innflytjendastofnunar Bandaríkjanna (USCIS). Þann 20. maí 2009 var tilnefningin borin til þingsins; þann 7. ágúst 2009 var tilnefningin staðfest af þinginu með atkvæðagreiðslu. Sem forstöðumaður USCIS leiddi Mayorkas ríkisborgararétt Bandaríkjanna með skilvirkni stjórnsýslu og fjárhagslegri ábyrgð og varðveitti hollustu innflytjendakerfisins. Hann setti í framkvæmd frestaða aðgerð vegna barna sem komu til landsins (DACA) á sextíu dögum. Hann stýrði viðleitni Bandaríkjastjórnar til að bjarga munaðarlausum börnum eftir jarðskjálftann á Haítí í janúar 2010 og leiddi framfarir brotaþolaeiningar sem í fyrsta sinn leiddi til þess að stofnunin gat veitt lögboðinn hámarksfjölda vegabréfsáritun til brotaþola.