Ljúkaðu eftirfarandi setningu: Staður hennar í Kenyan World Cross Country liðinu virtist óviss árið 2009 þar sem aðalþjálfari Julius Kirwa vísaði líkum hennar frá, sagði að hún hefði hlaupið of mörgum keppnum á tímabilinu. Cherono svaraði með því að taka forystuna strax í Kenyan Trials og vinna yngri keppnina með þrettán sekúndna mun. Á
Á heimsmeistaramótinu í langrennsli 2009 í Amman, Cherono tók þátt í keppni með Genzebe Dibaba í yngri keppninni. Cherono tók forystuna á lokastiginu en erfitt strekk með 40 metra klifra gerði Dibaba kleift að ná henni og Cherono endaði með silfurverðlaunin. Á afrísku unglingameistaramótinu 2009 náði Cherono 3000 m titlinum með 13 sekúndum en fannst sig aftur slá af Genzebe Dibaba í 5000 m hlaupi og endaði með silfurverðlaun. Hún keppti á æðstu brautinni það ár og var þriðja á Rieti IAAF Grand Prix, og skráði persónulegt besta 8:44.67 fyrir 3000 m. Hún varð þriðja í annað sinn á Memorial van Damme í september, og setti persónulegt met í 1500 metra og 2000 metra hlaupi og var aðeins skorað af heimsmeisturum Gelete Burka og Vivian Cheruiyot.