26. júní 1861 skráði Baxter sig í bandaríska borgarastyrjöldina og gekk í 12. sjálfboðaliðasveitina í Massachusetts sem læknir. Hann þjónaði þar til í apríl 1862, þegar hann var ráðinn sem sveitarlækni í Potomac-hernum. Hann tók þátt í herferðinni á hálendis, þar á meðal í slaginu við Yorktown, Hannover Court House og Seven Pines.
Ég veit ūađ ekki.