Eftir að Sovétmenn tóku Litháen í júní 1940 flúði Alantas til Þýskalands. Kona hans og sonur voru áfram í Litháen og voru fluttir til Síberíu í júní-flutningnum.
Árið 1941. Í Þýskalandi var honum boðið að vera í forystu menningarnefndar Litháenska virkjunarfrontarinnar, hreyfingar Litháenskra útlegðamanna sem leit að því að frelsa Litháen með stuðningi nasista Þýskalands. Alantas tilheyrđi hægri vængnum í LAF og studdi stofnun LAF. Þrátt fyrir að hafa verið boðið til að stjórna menningarnefnd í menntamálaráðuneytinu í bráðabirgðarríkisstjórn Litháen var ráðning hans hindruð af flokki Litháenskra þjóðernissinna og hann var ráðinn sem forstöðumaður leiklistarinnar í Vilnius í staðinn. Á þremur starfsárum skrifaði Alantas þrjú leikrit og voru tvö þeirra sett á svið. Árið 1944 flúði Alantas til Þýskalands vegna nálgandi sovéska hersins og varð flóttamaður í kjölfar síðari heimsstyrjaldarinnar. Árið 1949 fluttist Alantas til Detroit í Bandaríkjunum þar sem hann vann sem láglaunaður verkalýður í bílaverksmiðju Ford Motors þar til hann hætti störfum árið 1968. Hann þekkti frönsku og þýsku en átti erfitt með ensku. Hann helgaði restina af lífi sínu bókmenntaverki og gaf út nokkrar skáldsögur, smásögur og ljóðasafn. Hann var formaður Litháenskra tímarita á árunum 1967-1971 og fékk tilboð um störf í ritstjórn litvískra tímarita en hann neitaði.