Í september 1800 fékk hann stjórn yfir herdeild í konunglega vörninni. Árið 1803 varð hann fulltrúi 10. fótgönguliðsflokksins, sem hann leiddi í herferðum 1805 og 1806-1807.
, bardagar í Austerlitz, Jena og Eylau. Í febrúar 1807 var Pouzet kynntur til hershöfðings de brigade og árið 1808 leiddi hann hershöfðingsdeild í deild Sebastiani í Spáni. Hann starfaði tímabundið sem stafstjóri hjá gömlum vini sínum, Marshal Lannes og barðist við Tudela áður en hann sneri aftur til herstjórnar. Í október 1808 var hann gerður að barón.