Í seinni heimsstyrjöldinni flutti hún Franklin D. Roosevelt yfir Atlantshafið til Mers El Kébir í Alsír á leið til mikilvægs fundar í Teheran árið 1943 með Winston Churchill forsætisráðherra Bretlands og Joseph Stalin leiðtoga Sovétríkjanna. Þegar hún var færð til Kyrrahafsflotans árið 1944 skaut Iowa strandþyrpingar við Kwajalein og Eniwetok fyrirfram landgang Samfylkingarmanna og varði flugvélaskip sem starfaði í Marshall-eyjum. Hún þjónaði einnig sem flaggskip þriðja flotans og flaug undir fána William F. Halsey við uppgjöf Japana í Tókýó-flóa.
47