Fylltu út eftirfarandi setningu: 31. ágúst 2010 samdi hann við Bologna í ítalska Serie A fyrir 2,1 milljónir evra (þar á meðal 5% samstöðuframlag til unglingadeildarfélaga). Ekki var áætlað að greiða gjald þann dag, en áætlað var að greiða tvær jafnar greiðslur þann 31. desember 2010 og 30. júní 2011. Í Bologna hefur hann unnið með öðrum uruguayskum landsliðsmönnum, Henry Damián Giménez, Gastón Ramírez og Miguel Britos, áður en þessi yfirgaf liðið til að ganga til liðs við S.S.C. Napoli. Í fyrsta tímabili Pérez í
Serie A, Bologna náði 16. sæti og endaði sex stigum frá niðurfellingu, sem staðfestir fjórða tímabilið í röð í ítölsku efstu flugi. Hann náði einnig þremur stoðsendingum á meðan á keppninni stóð, sem er jafn flest í liðinu ásamt Riccardo Meggiorini.