Ljúka eftirfarandi setningu: Í annað sinn á ferlinum var Costa ónotaður varamaður þegar Atlético vann UEFA Super Cup þann 1. september 2012. Þann desember var Costa þátttakandi í nokkrum átökum á vellinum í tveimur aðskildum leikjum. Fyrsti leikurinn var í 0<unk>2 heimamótinu gegn Real Madrid þar sem hann komst undan agalegum aðgerðum eftir að hafa spottað á milli hans og Sergio Ramos. Hann var sendur út í næsta leik á Viktoria Plzeň í UEFA Europa League fyrir að höfuðklofa andstæðinginn David Limberský, og fékk fjögurra leikja bann frá UEFA. Þetta hindraði þó Diego Simeone þjálfara ekki frá því að halda áfram að byrja hann og hann svaraði með því að skora þrjú mörk í tveimur heimaleikjum, gegn Deportivo de La Coruña í deildinni (6<unk>0) og Getafe í
Copa del Rey keppnistímabilsins (3<unk>0).