Í 1. öld f.Kr. settist Sequani ættkvísl (meiri "Gaulish of Gauls" samkvæmt sagnfræðingnum Henri Martin), sem var miðstöðvar í kringum Besançon, í Sundgau. Frá árinu 70 f.Kr. voru þeir í sífelldu stríði við nágranna sína, Aedui, og kallaði á þýska leigumenn, undir forystu Ariovistus. Þegar átökin voru lokið settust Þjóðverjar inn í svæðið og Sequani, til að fjarlægja þá höfðaði til Rómverja. Júlíus Caesar sigraði Ariovistus árið 58 f.Kr. nálægt Cernay, og löng yfirráð Rómverja hófst. Þetta endaði skyndilega árið 405, þegar Alamani yfir Rínan og réðu Sundgau. Þeir voru í kjölfarið fylgd af Franks eftir sigur þeirra í Baráttu Tolbiac
Í 496. Sundgau var tekið upp í konungsríki Austur-Asíu og kristnin var kynnt undir Merovingium.