Í 1862 fékk Schenck stjķrn á Vestur-Golf-Blokkadeildinni. Schenck skipaði einnig og 3. deildin af aðmiráli David Dixon Porter flotnum í aðgerðum gegn Fort Fisher
, og var nefndur fyrir gallantry í aðgerðaskýrslu Porter. Hann var síðar kynntur til bakviðmirála 21. september 1868 og dró sig úr starfi 11. júní 1869.