16. júlí 1862 var hann færður í stöðu liðsforingja og skipaði skrúfuþjóni í blokkadeild Austur-Golfans. Chandler var fluttur á gufubaðabát Norður-Atlantshafsflotans og barðist með skipi sínu við árásina og fallið á Fort Fisher.
Hann varð yfirmaður í hernum og tók Wilmington í byrjun árs 1865. Hann varð yfirmaður 25. júlí 1866.