Í desember 1941 var skólanum lokað vegna innrásar Japana í Malaíu.
og opnuð aftur 1945 eftir japanska landnám Malaya. Á þeim tíma starfa stofnanirnar sem heild (统筹统办). Grunnskólinn Jit Sin og nokkrir aðrir skólar voru undir almennum skilningi stofnunarinnar, Chung Hwa School ((中华学校), sem hafði nokkra skóla á öðrum stöðum í svæðinu. Fyrir Grunnskóla Jit Sin var það staðsett í mjólkurpakkaverksmiðju í Aston Road, sem var á bak við Han Chiang Association-húsið. Vegna frátæktar menntunar í stríðstíma var fræðslan ókeypis og fjöldi nemenda var gríðarlegur. Í Jit Sin voru yfir 1000 nemendur. Í lok ársins 1945 fóru skólarnir aftur í upprunalega stöðu sína. Grunnskólinn Jit Sin var opnaður árið 1946.