Skrifaðu framhald fyrir þessa málsgrein - Samfylkingin skapaði hins vegar mótstöðu meðal nokkurra hópa í báðum löndum sem voru ósáttir við þynningu þjóðernisþekkingar og nágrannalöndum. Margir peruverskir stjórnmálamenn sem voru andvígir hugmyndinni um Samfylkinguna flúðu til Chile, þar sem þeir fengu stuðning og þetta leiddi til stríðs Samfylkingarinnar
Chile lýsti yfir stríði þann 28. desember 1836 og Argentína gerði það sama þann 9. maí 1837. Chileanska herferð gegn Santa Cruz, undir forystu Manuel Blanco Encalada, misheppnaðist og varð að undirgefa undirritun Paucarpata-samningsins þann 17. nóvember 1837.