Í sögunni hafa ýmsar kínverskar konungsættir stjórnað hluta af Xinjiang nútímans. Svæðið varð undir stjórn Kínverja í nútímanum í kjölfar útbreiðslunnar til vesturs.
Manchu-leiðsögn Qing ættkvísl á 1700s, sem einnig sá sigra Tíbet og Mongólíu. Xinjiang var umdæmishluti Qing-veldisins og fékk sjálfstæði aftur í stutta stund í uppreisn Dungan (1862-1877).