Opnað var árið 1898 og tók við staðinn fyrir forvera byggðar á sama stað árið 1875. Hinn vel byggði styrktarbygging með bogamótum sínum lifði bæði 1906
og jarđskjálftunum 1989 međ litlum tjóni. Það var áfangastaður fyrir farþega til San Francisco frá East Bay, sem keyrðu ferjuflotana í Suður-Kyrrahafinu og Key System. Það þjónaði einnig sem tenging við San Francisco fyrir transcontinental járnbrautalínur Suður-Kyrrahafssvæðisins, Santa Fe og Vestur-Kyrrahafssvæðisins sem endaði í Oakland, og fyrir Norður-Vestur-Kyrrahafssvæðið sem liggur norður frá Marin County. Ferju bryggjur norðan klukkuturninn þjónaði Key System, Santa Fe, og Northwestern Pacific, en bryggjur sunnan turnins þjónaði Suður- og Vestur- Kyrrahafi. Hringbraut fyrir framan bygginguna gerði það að verkum að hægt var að flytja um í lestina. Stór göngubrú var á Embarcadero fyrir framan Ferjubygginguna til að auðvelda öruggan farveg yfir upptekna torgið og umferðarmiðstöðina. Á fjórða áratugnum var brúin rifin niður til að veita skraut fyrir seinni heimsstyrjöldina.