Hublin bjó í Alsír þar til fjölskylda hans flúði landið á síðasta ári sjálfstæðisstríðsins.
Árið 1961. Hann var unglingur á húsnæðisbótum í norðurhverfi Parísar. Hann lærði síðar til jarðfræðings og fornleifafræðings við Pierre og Marie Curie háskólann í París, þar sem hann fékk doktorspróf árið 1978 undir stjórn B. Vandermeersch prófessor. Hann hlaut doktorspróf í mannfræði árið 1991 við Háskólann í Bordeaux. Hublin býr nú í Leipzig í Þýskalandi með Svetlanu eiginkonu sinni.