Ljúktu eftirfarandi setningu: Þrátt fyrir að stuðningsmenn Vilhjálms réðu ríkistjórninni, var ennþá töluvert fylgjendur Jákups, einkum á hálendinu. Ástæða hans, sem varð þekkt sem Jakobítisma, eftir latneska "Jacobus" fyrir Jakob, leiddi til röð uppreisna. Fyrstu hernaðartilraun Jakobíta var undir forystu John Grahams, viskóts Dundee. Herir hans, nánast allir Highlanders, sigraði herir Vilhjálms á
Barátta við Killiecrankie árið 1689, en þeir töpuðu mikið og Dundee var drepinn í átökunum. Án forystu hans var her Jakobíta fljótt sigrað í Dunkeld-baráttunni. Í kjölfar ósigurs Jakobíta þann 13. febrúar 1692, í atviki sem síðan er þekktur sem Sláturmálið í Glencoe, voru 38 meðlimir MacDonald-ættarinnar í Glencoe drepnir af meðlimum fótherherherherherherflugs jarlsins af Argyll, á þeim forsendum að þeir hefðu ekki verið fljótir í að sverja hollustu við nýja konungana.