Í nóvember 1956 var Dulles ákaflega andvígur innrás Englendinga og Frakka í Suesjargöngusvæðið til að bregðast við
Stađnýting Egyptalands á rásinni. Á mikilvægustu dögum var Dulles innlagður á sjúkrahús eftir aðgerð og tók ekki þátt í ákvarðanatöku stjórnar Bandaríkjanna. Árið 1958 var hann orðinn opinbera andstæðingur Gamal Abdel Nasser forseta Egyptalands og kom í veg fyrir að ríkisstjórn Nasser fengi vopn frá Bandaríkjunum. Þessi stefna gerði Sovétríkjunum kleift að ná áhrif í Egyptalandi.