Borobudur er byggður sem einn stór stupa og þegar horft er frá ofan tekur hann mynd risa tantriska búddísku mandala, sem á sama tíma táknar búddísku alheimsfræði og eðli hugans. Upprunalegur grunnurinn er ferningur, um 118 metra (387 ft) á hvorri hlið. Hann hefur níu vettvangar, þar af eru neðstu sex ferningur og efri þrír eru hringlaga. Efri vettvangurinn er með sjötíu og tveimur litlum stupa sem umkringja einn stóran miðlægur stupa. Hver stupa er bjöllulaga og með fjölmörgum skreyttu opnum.
níu