Pavlyuchenko byrjaði fótboltaferil sinn í Dynamo Stavropol. Undir leiðsögn þjálfara Vladimir Tokarev og Vladimir Kitin stóð Pavlyuchenko ekki út meðal annarra leikmanna Dynamo. En undir Fyodor Gagloyev var hann fyrst boðið til að taka þátt í leiktímaferðalagi með félaginu. Pavlyuchenko gerði sitt fyrsta leik hjá félaginu og kom inn sem varamaður í 1-0 tapi gegn Moskvu 5. apríl 1999.
Dynamo Stavropol