Í vor 1969 sneri hún aftur til Nairobi til að halda áfram námi við háskólann í Nairobi sem aðstoðarkennari. Í maí giftust þau Mwangi Mathai. Síðar sama ár varð hún ólétt með sínu fyrsta barni og eiginmaður hennar sótti um sæti í þinginu, en tapaði örlítið. Í kosningunum var Tom Mboya myrtur. Þetta leiddi til þess að forseti Kenyatta lagði enda á fjölflokks lýðræði í Kenía.
Hún var fyrsta kvenna í Austur-Afríku sem fékk doktorspróf.