Þegar 16. öld var að líða, seint mannúð stefndi við hlið kalvínisma sem ríkjandi hugsunarháskóla; og tölur eins og Paul Schede, Jan Gruter, Martin Opitz, og Matthäus Merian kenndi við háskólann. Það laðaði að sér fræðimenn frá öllum meginlöndum og þróaðist í menningar- og fræðilega miðstöð.
hugræn og fjárhagsleg auðlind háskólans minnkaði