Mortier þjónaði í frönsku byltingarstríðunum í herferðum 1792 og 1793 á norðausturlandamærunum og í Hollandi, og síðar á Meuse og Rín. Mortier fékk það verkefni af hershöfðingjanum Jacques Maurice Hatry að semja um að Mainz-festingin myndi gefast upp, sem hann kláraði með góðum árangri og sneri síðan aftur til Parísar. Á meðan á stríði annarrar samfylkingar stóð árið 1799 var hann kynntur til hershöfðingja og síðan að deildarhershöfðingja. Á seinni Slaginu við Zurich
Hann leiddi 8.000 manna her í árás á Zürich frá Dieticon. Með frönsku landnáminu í Hannover og Artlenburg-samningnum fékk Napóleon að setja Mortier á fyrsta listann yfir marshals sem var stofnaður árið 1804.