Stöðin, sem upphaflega var nefnd Messina, var opnuð 12. desember 1866 sem endabraut járnbrautarinnar til Taormina, fyrsta hluta Messina-Catania-Siracusa línunnar. Mjög skemmd eftir jarðskjálftann 1908
Hún var lagfærð nokkrum árum síðar. Árið 1939 var það loksins endurnýjað og skipt út fyrir nútíma "Messina Centrale", með stöðvarhúsi sem var hannað af arkitektanum Angiolo Mazzoni.