Skrifaðu framhald fyrir þessa málsgrein - Þótt stuðningsmenn Vilhjálms réðu yfir stjórnvöldum, þá var enn mikil fylgd með Jakob, einkum á hálendinu. Ástæða hans, sem varð þekkt sem Jakobítisma, eftir latneska "Jacobus" fyrir Jakob, leiddi til röð uppreisna. Fyrstu hernaðartilraun Jakobíta var undir forystu John Grahams, viskóts Dundee. Her hans, sem var nánast allur Highlanders, sigraði her Vilhjálms í bardaga við Killiecrankie
1689 en ūeir fengu mikinn tap og Dundee var drepinn í bardaga. Án forystu hans var her Jakobíta fljótt sigrað í Dunkeld-baráttunni. Í kjölfar ósigurs Jakobíta þann 13. febrúar 1692, í atviki sem síðan er þekktur sem Sláturmálið í Glencoe, voru 38 meðlimir MacDonald-ættarinnar í Glencoe drepnir af meðlimum fótherherherherherherflugs jarlsins af Argyll, á þeim forsendum að þeir hefðu ekki verið fljótir í að sverja hollustu við nýja konungana.