Malhotra loukkaantui nilkkaansa marraskuussa. Toipumisensa jälkeen joukkueen johto arvioi hänen pelinsä kärsineen ja hän alkoi olla penkillä. Kanadan juniorijoukkue halusi Rangersin lainaavan hänet vuoden 2000 juniori-mestaruuskilpailuihin.
- Mitä? 12. joulukuuta 1999 pääjohtaja Neil Smith palkkasi Malhotran kansainväliseen turnaukseen. Hänet lähetettiin sitten kahden viikon kuntoutustoimintaan Rangersin American Hockey League (AHL) -liiton Hartford Wolf Packin kanssa. 14. maaliskuuta 2000 hänet lähetettiin takaisin OHL:ään säilyttääkseen kelpoisuutensa AHL:ään myöhemmin kaudella. Malhotra oli pukeutunut vain neljään peliin kahden kuukauden aikana hänen paluunsa jälkeen World Junior Championships tammikuun alussa ja hänen juniori uudelleenmääräyksen. Hän oli hyödytön 27 ottelussa, jotka hän pelasi Rangersin kanssa.