Silas Kiplagat voitti Mwangangin Prisons Cross Country -kilpailussa vuonna 2011, mutta hän palasi nostamalla virallisen miesten seniorititelin vuonna 2011 pidetyssä Afrikkalaisessa Cross Country -kilpailussa. Samana kuukautena hän juoksi Lissabonin puolimaratonissa ja tuli toiseksi Zersenay Tadesen jälkeen, joka juoksi silloin toiseksi nopeimman ajan koskaan. Hän puolusti titteliään Rabatin puolimaratonissa kuukautta myöhemmin. Kauden toisella puoliskolla hän tuli kolmanneksi Dam tot Damloopissa parhaan ajan 45:13 minuutissa. Hän voitti toisen kerran peräkkäin Pariisin 20 km: ssä, sitten suoritti saman suorituksen Valencian puolimaratonilla, jossa hän paransi parhaintaan 59:45 minuuttiin. Joulukuussa hän tuli kolmanneksi Montferland Runissa. Hän oli Zersenay Tadesen jälkeen kakkosmestari Lissabonin puolimaratonissa maaliskuussa 2012. Hän oli yksi vuoden 2012 Rotterdamin maratonin tahdistimista, ja kaksi parasta juoksijaa lopetti alle kahdessa tunnissa ja viidessä minuutissa. Seuraavaksi
Vuoden 2012 puolimaratonin maailmanmestaruuskilpailussa Kavarnassa Bulgariassa hän voitti pronssimitalin 1:01:01 tunnissa ja auttoi joukkuetovereitaan voittamaan joukkuetitelin. Hänen viimeinen matkansa oli Valencia.