Saatuaan huonoa onnea ja Mansellin ollessa McLarenissa vuodeksi 1995, Brundle ajoi jälleen kerran Ligierissä sinä vuonna, vaikkakaan ei koko kauden. Mugen-Hondan rauhoittamiseksi hänen täytyi jakaa toinen paikka Aguri Suzukin kanssa, mikä sai monet kommentoijat ja fanit tuomitsemaan. Hän teki kuitenkin vaikutuksen Magny-Coursissa, jossa hän sijoittui vahvasti neljänneksi, ja hänen viimeinen F1-podiuminsa Spassa oli kohokohta. Vuonna 1996 hän teki tiimin Rubens Barrichellon kanssa Jordaniassa ja nautti hyvästä kaudesta, huolimatta hitaasta aloituksesta ja upeasta kaatumisesta Melbournen avajaisissa GP:ssä, säännöllisin pistein, neljänneksi hänen paras tuloksensa. Hän tuli viidenneksi.
1996 Japanin Grand Prix, joka oli hänen viimeinen Grand Prix Formula 1.