Kirjoita tämän kappaleen jatko - Saksan ja Neuvostoliiton yhteisen Puolan hyökkäyksen jälkeen, joka aloitti toisen maailmansodan syyskuussa 1939, kaupunki oli Saksan miehittämä
, joka toteutti kansanmurha-kampanjaa paikallista puolalaista ja juutalaista väestöä vastaan. Chełmża oli yksi puolalaisten teloituspaikoista, jotka Saksa suoritti vuonna 1939 osana "Intelligenzaktionia". Monet paikalliset puolalaiset, erityisesti opettajat, tapettiin Barbarkan metsässä nykyisessä Torunissa osana "Intelligenzaktionia". Saksan valtio piti tuolloin puolalaisia ja juutalaisia "alle-inhimillisinä" ja suunnitteli niiden hävittämistä kansallisryhminä. Paetakseen tämän kohtalon monet paikalliset puolalaiset ottivat Volkslisten III ja IV ryhmän. Alkuvuodesta 1945 Chełmzhassa saksalaiset pakottivat pakkotyöläiset, jotka evakuoitiin Jajkovosta, pakkotyöhön Todt-järjestöön, mutta jotkut onnistuivat pakenemaan. Saksalaisten hävittämisen ja sorron seurauksena kaupungin väkiluku laski 10 000:een maaliskuussa 1945.