Vuonna 1992 Nordiques teki kaupat hänelle New York Rangersin ja Philadelphia Flyersin kanssa. Lopulta välimiehen, Larry Bertuzzin (Todd Bertuzzin isoisoisoisoo), päätettiin Flyersin hyväksi, jolle hän pelasi vuosina 1992-2000, useimmiten joukkueen kapteenina. Nordiquesin ja Rangersin välisessä kaupassa, jonka tuomari hylkäsi, Lindros vaihdettiin Doug Weightiin, Tony Amonteen, Alexei Kovaleviin, John Vanbiesbrouckiin ja kolmeen ensimmäisellä kierroksella (1993,
1994 ja 1995) ja 12 miljoonaa dollaria.