Kun suuri osa Ranskan valtakunnan joukkoista oli nyt sekaantunut veriseen niemimaalliseen sotaan, Itävallan valtakunta uskoi, että paras tilaisuus kostaa 1805 häpeällinen tappio oli vihdoin tullut. Itävaltalaiset halusivat voittaa Ranskan ja saada takaisin entisen vaikutusvaltansa Italiaan ja Saksaan. Vuoden 1809 alussa Itävallan sotavalmistelut olivat niin intensiivisiä, että Napoleonin oli pakko lähteä Espanjasta ja palata Pariisiin uudelleenorganisoimaan pääarmeijansa Saksassa. Keväällä Nansouty kutsuttiin takaisin 1. raskaan ratsuväen divisioonan johtoon, joka tällä kertaa oli marsalkka Jean-Baptiste Bessièresin alaisuudessa. Viidennen liittouman sodan syttyessä Nansoutyn divisioona erottiin varalta ja liitettiin väliaikaisesti marssali Louis Nicolas Davoutin III-joukkueeseen, joka sai vaikeimmat tehtävät tämän sodan varhaisten sotilasoperaatioiden aikana. Kun Napoleon sitten määräsi armeijan keskittymään Ratisbonissa, Nansoutyn diviisiota asetettiin jälleen kerran Bessièren komennon alaisuuteen ja lähetettiin palvelemaan Baijerin armeijan kanssa. Ensimmäisten voittojensa jälkeen Abensbergissä
Napoleon keskitti suurimman osan armeijastaan, Nansoutyn miehet mukaan lukien, Eckmühliin, jossa Davout odotti.