Kun Vilsack oli vetäytynyt kilpailusta, hän kannatti senaattori Hillary Clintonia 25. maaliskuuta 2007. Hän toivoi saavansa hänet Iowaan. Entinen kuvernööri sanoi Clintonin olevan ehdokas, jolla on parhaat ideat, eniten energiaa, arvoja ja näkemystä johtaa maata. Pian sen jälkeen Clinton nimitti Vilsackin vaimon Christien Iowan kampanjan puheenjohtajaksi. Clintonin kampanja ilmoitti auttavansa Vilsackia maksamaan 400 000 dollarin velkansa. Vilsack kampanjoi Clintonin puolesta koko maassa kampanjan puheenjohtajana ja keskittyi auttamaan häntä voittamaan Iowan kokoukset. Clinton oli kolmanneksi Barack Obaman ja John Edwardsin jälkeen.
Obama presidenttiyden puolesta 15. heinäkuuta 2008. Hän nimitti Obaman "ainoaksi ehdokkaaksi" äänestäjille "puolueellisuutta vastaan" "muuttaakseen sävyä Washingtonissa"