Täytä seuraava lause: Skotlannissa tapahtui myös joukko jakobiteja, joissa viikontti Dundee kohotti ylämaan joukkoja ja voitti 27. heinäkuuta 1689
Killiecrankien taistelussa, mutta hän kuoli taistelussa ja kuukausi myöhemmin skotlantilaiset Cameronian joukot kukistivat kapinan Dunkeldin taistelussa. Vilhelm tarjosi skotlantilaisille klaaneille, jotka olivat osallistuneet kapinaan, armahdusta edellyttäen, että he allekirjoittivat uskollisuuden määräaikaan mennessä, ja hänen hallituksensa Skotlannissa rankaisi viivytystä Glencoen verilöylyllä vuonna 1692, josta tuli pahamaineinen jakobiteiden propagandassa, kun Vilhelm oli vastannut käskyjä. Kun Vilhelm taipui yleiseen mielipiteeseen, hän erotti joukkomurhaan syyllistyneet, vaikka he silti pysyivät hänen puolellaan; historioitsija John Dalberg-Actonin sanoin "yhden heistä tuli eversti, toisen ritari, kolmannen pari ja neljännen kreivi".