Kirjoita jatko-osa tähän kappaleeseen - Krakės mainitaan ensimmäistä kertaa 1400-luvulla. Krakėsin kartano oli Samogitian piispojen omaisuus vuosina 1421-1842. Krakėsin ensimmäinen kirkko rakennettiin 1500-luvulla. Krakės mainitaan kaupunkina vuonna 1579. Pyhän Katariinan luostari perustettiin Krakėsissa vuonna 1615 ja toimi vuoteen 1945 saakka (puinen luostari paloi tuolloin). Se perustettiin uudelleen vuonna 1997. Krakėsille myönnettiin markkinaetu vuonna 1790. Vuonna 1863 Krakės oli tärkeä tammikuun kansannousun keskus.
, 28. huhtikuuta oli taistelu Venäjän keisarillista armeijaa vastaan. Vuosina 1863 ja 1914 Krakės tuhoutui tulipaloissa.