Kirjoita jatko tämän kappaleen - Vuonna 1963 valtio perusti liittovaltion tasavallan, jonka ensimmäiseksi presidenttinä oli Azikiwe. Vaali- ja poliittisen prosessin epätasapaino ja havaittu korruptio johtivat kahteen sotilasvallankaappaukseen vuonna 1966. Ensimmäinen vallankaappaus tapahtui tammikuussa 1966.
Sen johdossa olivat lähinnä majorit Emmanuel Ifeajuna ja Chukwuma Kaduna Nzeogwu. Vallankaappaussuunnittelijat onnistuivat murhaamaan Sir Ahmadu Belon ja Abubakar Tafawa Balewan pohjoisen alueen merkittävien johtajien ja myös Länsi-alueen pääministerin Samuel Akintolan kanssa, mutta vallankaappaussuunnittelijat kamppailivat keskushallinnon muodostamiseksi. Senaatin puheenjohtaja Nwafor Orizu luovutti hallituksen hallinnan armeijalle toisen igbo-upseerin, kenraali Johnson Aguiyi-Ironsin johdolla. Myöhemmin vuoden 1966 vastavallankaappaus, jota tukivat ensisijaisesti pohjoisen sotilasupseerit, helpotti Yakubu Gowonin nousua sotilaspäämiehenä. Pohjoisen ja etelän välinen jännitys kasvoi; pohjoisten kaupunkien igboja vainottiin, ja monet pakenivat itäiseen alueeseen.