26. maaliskuuta Farah sai pronssimitalin vuoden 2016 IAAF:n puolimaratonin maailmanmestaruudessa.
Hän ehti Cardiffissa 59:59, alle sekunnin edellä Abayneh Ayeleä. 20. helmikuuta Farah voitti Glasgow Indoor Grand Prix -kilpailun 3000 metrin päähän. 5. kesäkuuta 2016 Farah rikkoi 34-vuotiaan brittiläisen 3000 metrin ennätyksen, jonka asetti Moorcroft voittamalla Diamond League -kilpailun Birminghamissa, voiton, jonka hän omisti hiljattain menehtyneelle nyrkkeilijälle Muhammad Alille. Heinäkuussa 2016 Farah saavutti maailmanmestaruuden 5000 metrin juoksussa voittaessaan Diamond League -kilpailun Lontoossa. Hän voitti 10 000 metrin Diamond League -kilpailun Eugene'ssa 26:53,71-ajassa, joka pysyi toiseksi nopeimpana ajanjaksona maailmassa.