Kirjoittaminen "Shoku Nihongi", ensimmäinen seuraaja "Nihon Shoki" alkoi noin 760 Fujiwara ei Nakamaro, mutta kärsi useita takaiskuja ennen sen julkaisemista vuonna 797, kuten Nakamaron kuolema Fujiwara ei Nakamaro kapina
Vuonna 764 julkaistun kolmekymmentä luonnosjulkaisua arvosteltiin siitä, että se keskittyi anekdoottisiin faktoihin ja jätti huomiotta joitakin merkittäviä tapahtumia. Keisari Kōnin herätti hankkeen, mutta se pysyi vielä luonnoksena. Vuosina 794 ja 797 annetut asetukset mahdollistivat hankkeen loppuun saattamisen. "Shoku Nihongin" neljäkymmentä osaa kattavat ajanjakson 697-791. Lopullinen teos erottuu uusien lähteiden, kuten buddhalaisten temppelien rekistereiden tai verotulojen, käytöstä. Kuten "Kojiki", se on kirjoitettu kielellä, joka perustuu klassiseen kiinaan ja kiinalaisten merkkien äänenmuotoiseen käyttöön. "Shoku Nihongi" kuvaa myös tiettyjä Japanin yhteiskunnan näkökohtia tuolloin, kuten rakennustyömaiden työntekijöiden olosuhteita pääkaupungissa Heijō-kyōssa (nykyinen Nara). Kiinalaisten mallien mukaisesti runouden asema on huomattavasti vähentynyt.