Kirjoita jatko tämän kappaleen - Ensimmäisen Fitnan aikana
, Kalifi Ali (r. 656<unk>661) nimitti Muhammad ibn Abi Bakrin Egyptin kuvernööriksi, mutta Amr johti hyökkäyksen kesällä 658, joka kukisti Ibn Abi Bakrin ja turvasi maan Umayyadeille. Amr toimi sitten kuvernöörinä kuolemaansa saakka vuonna 664. Vuodesta 667/8 vuoteen 682 saakka maakuntaa hallitsi toinen Umayyad-puolueen kannattaja, Maslama ibn Mukhallad al-Ansari. Toisen Fitnan aikana Ibn al-Zubayr sai tukea Kharijiteilta Egyptissä ja lähetti oman kuvernöörinsä Abd al-Rahman ibn Utba al-Fihrin maakuntaan. Kharijittien tukema Zubayridin hallinto oli hyvin epäsuosittu paikallisten arabeiden keskuudessa, jotka kutsuivat Umayyad-kaliifia Marwan I:ää (r. 684 <unk>685) tuen osalta. Marwan hyökkäsi joulukuussa 684 Egyptiin ja valloitti sen suhteellisen helposti. Marwan asetti poikansa Abd al-Azizin kuvernööriksi. Abd al-Aziz hallitsi maata 20 vuoden ajan "jundin" läheisten suhteidensa ansiosta, nauttien laajasta itsenäisyydestä ja hallitsemalla "de facto" varakuninkaana. Abd al-Aziz valvoi myös Pohjois-Afrikan muslimien valloituksen loppuun saattamista; hän nimitti Musa ibn Nusayrin Ifriqiyan kuvernööriksi. Abd al-Aziz toivoi, että hänen poikansa seuraa hänet, mutta kun hän kuoli, kalifi Abd al-Malik ibn Marwan (685 <unk> 695) lähetti oman poikansa Abdallahin kuvernööriksi, jotta hän voisi vahvistaa hallinnan ja estää maan muuttumisen perinnölliseksi alueeksi.