Kuten Ateenalaisessa demokratiassa monille huomattaville henkilöille tapahtui, Themistoklen kansalaiset olivat kateellisia hänen menestyksestään ja mahdollisesti kyllästyneet hänen kerskailuunsa. On todennäköistä, että varhain vuonna 479 eaa. Themistokles riisuttiin komennostaan; sen sijaan Xanthippus oli komennettava Ateenalaista laivastoa ja Aristides maajoukkoja. Vaikka Themistocles oli epäilemättä poliittisesti ja sotilaallisesti aktiivinen lopun kampanjaa, hänen toimintaansa vuonna 479 eaa. ei mainita muinaisissa lähteissä. Tuon vuoden kesällä peloponnesialaiset hyväksyivät vihdoin, kun he olivat saaneet ateenalaisilta ultimatumin, kokoamaan armeijan ja marssimaan Mardoniuksen, joka oli miehittänyt Ateenan uudelleen kesäkuussa, vastaan. Liittoutuneet tuhosivat persialaisen armeijan ratkaisevassa Plataea-taistelussa, kun taas ilmeisesti samana päivänä liittoutuneiden laivasto tuhosi persialaisen laivaston jäännökset Mykalen taistelussa
- Mitä? Nämä kaksinkertaiset voitot täydensivät liittoutuneiden voiton ja lopettivat persialaisen uhan Kreikkaan.