Kirjoita tämän kappaleen jatko - Neuvostoliitossa perustettiin sortohallitus; useimmat korkean tason siviili- ja sotilasvirkamiehet, älymystöt ja teollisuusmiehet pidätettiin ja teloitettiin yleensä pian sen jälkeen. Neuvostoliiton sorron huipentuma oli 14. kesäkuuta 1941 noin 11 000 ihmisen joukko- karkottaminen Siperiaan, joista yli puolet kuoli epäinhimillisissä olosuhteissa. Kun Saksan Barbarossa-operaatio, jota seurasivat Viron partiolaissotilaat nimeltään "Metsan veljekset", alkoi Neuvostoliittoa vastaan 22. kesäkuuta 1941 ns. "Kesäsota" (), noin 34 000 nuorta virolaista miestä pakotettiin Punaiseen armeijaan, joista alle 30 prosenttia selvisi sodasta. Neuvostoliiton hävittäjäpataljoonat aloittivat poltetun maan politiikan. NKVD teloitti poliittiset vangit, joita ei voitu evakuoida. Monet virolaiset lähtivät metsään ja aloittivat Neuvostoliittoa vastaan geriilakampanjan. Heinäkuussa saksalainen Wehrmacht saavutti Etelä-Viroon. Neuvostoliitto evakuoi Tallinnan.
Itä-Venäjä voitti Itä-Venäjän elokuun lopulla valtavilla tappioilla, ja Saksan joukot valloittivat Viron saaret lokakuussa.