Keyes näki toimintaa Lee's Millissä, Yorktownissa, Bottom's Bridgessä, Savage's Stationissa, Seven Pinesissa.
(Fair Oaks), Charles City Cross Roads, Malvern Hill ja Harrison's Landing. Fair Oaksissa osoittamansa urhoollisuuden ansiosta Keyes sai viran prikaati kenraali säännöllisessä armeijassa. Seitsemän päivän taistelujen jälkeen McClellan ylentää kaikki hänen joukkojensa ja divisiooniensa komentajat kenraalimajuriin, lukuun ottamatta Keyesia, joka ei saanut ylennystä ja pysyi prikaattigeneraalina. Kun armeija palasi Washingtoniin elokuun alussa, Keyes ja yksi kahdesta IV-joukon divisioonista jäivät pysyvästi niemimaan puolella osana kenraali John Dixin Jamesin osastoa. 12. maaliskuuta 1863 presidentti Abraham Lincoln nimitti Keyesin ylennykseksi majurigeneraalin, Yhdysvaltain vapaaehtoisten, asemaan 5. toukokuuta 1862 ja Yhdysvaltain senaatti vahvisti palkinnon 13. maaliskuuta 1863. IV-joukon lisäksi hän komensi Yorktownin piirikuntaa, VII-joukkoa ja Suffolkin divisioonaa. Keyesin muiden toimien joukossa oli hyökkäys Valkoiseen taloon, Virginiaan, 7. tammikuuta 1863 ja retki West Pointiin, Virginiaan, 7. toukokuuta 1863.