Luongo valittiin ensimmäisenä kierroksena New York Islandersille. Valitse alun perin kuului Toronto Maple Leafs mutta vaihdettiin Islanders vaihdossa Wendel Clark, Mathieu Schneider ja D. J. Smith. Luongo oli draftin aikaan NHL:n historian korkeimmin valittu maalivahti, ylittäen Tom Barrassonin, John Davidsonin ja Ray Martynuikin viidennen kokonaistason valinnat vuosina 1983, 1973 ja 1970 (Luongon valinta ylitti myöhemmin Rick DiPietron ensimmäinen kokonaistunnus vuonna 2000
)