Burnett aloitti uuden kauden vahvasti, kun hän pääsi kahteen ensimmäiseen ranking-tapahtumaan, Wuxi Classic ja Australian Goldfields Open
- Mitä? Vuoksissa hän voitti Neil Robertsonin 5<unk>1 ensimmäisessä kierroksessa, ennen kuin hävisi Mark Davisille 3<unk>5.&lt;ref name="2012/13"&gt;&lt;/ref&gt; Australiassa Burnett voitti maailman ykkösnumeron Mark Selbyn 5<unk>3, mutta poistui turnauksesta toisessa kierroksessa jälleen 1<unk>5 tappion jälkeen Marco Fulle, kun Burnett valitti pelissään johdonmukaisuuden puutetta. Siitä huolimatta hän melkein voitti ensimmäisen ammattilaismestaruutensa Gdynia Openissa, joka oli osa Players Tour Championship -sarjaa, pääsemällä finaaliin, jossa hän kohtasi Neil Robertsonin. Hän oli jäljessä 0<unk>3 parhaan seitsemän kuvan ottelussa, mutta palasi tasapainottamaan ottelun 3<unk>3. Päättävä peli kesti 52 minuuttia, jolloin Burnettin mustan pelitili ei ollut paikallaan ja punaisen jäljellä oli 3<unk>4. Hänen juoksunsa finaaliin kuitenkin auttoi häntä pääsemään finaaliin, kun hän pääsi 12. sijalle PTC: n arvostusjärjestyksessä. Lopussa hän kohtasi Robertsonin jälleen kerran ja hävisi jälleen, tällä kertaa 2 × 4 pisteellä. Burnett pääsi myös kansainväliseen mestaruuskilpailuun, mutta hävisi Stephen Maguire'ille ensimmäisellä kierroksella. Joulukuusta 2012 kauden loppuun asti Burnett ei voinut voittaa enää yhtään ottelua, mikä huipentui tappiolla 6:10 Yu Delulle World Championship Qualifying -ottelun kolmannessa kierroksessa. Hän päätti kauden samassa paikassa kuin aloitti sen, maailman 39. sijalla.