Aguilar teki debyyttinsä Panaman maajoukkueessa lokakuussa 2005 pelatessaan FIFA:n MM-kilpailukelpoisuusottelussa Trinidadia ja Tobagoa vastaan ja on 15. maaliskuuta 2015 saakka pelannut yhteensä 33 maalia ja tehnyt 10 maalia. Hän osallistui vuoden 2005 FIFA:n nuorisokilpailuun ja oli joukkueen jäsen, mutta ei pelannut.
2007 CONCACAF Gold Cup. Aguilar oli myös osa joukkuetta, joka voitti vuoden 2009 UNCAF Nations Cupin Hondurasissa.