17-vuotiaana kapteeni Folger teki Rodgersista kauppalaivan "Harmony" ykkösmiehen. Kun Rodgers valmistui viideksi vuodeksi oppisopimuskoulutukseen vuonna 1793, Folger suositteli häntä erittäin paljon "Jane" -nimisen kauppalaivan komentajaksi, jota käytettiin säännöllisesti eurooppalaisessa kaupassa ja joka oli kuuluisa Baltimoren kauppiaiden Samuelin ja John Smithin omistuksessa. Rodgers toimi tämän aluksen kapteenina neljästä viiteen vuoteen, ja se purjehti Baltimoresta eri Euroopan satamiin. Hänen ensimmäinen matkansa vei hänet Espanjan Cadizin satamaan vuoden 1793 alussa, ja hän palasi kotiin mukanaan suolaa. Rodgersin seuraava matka lähetti hänet Saksan Hampuriin, mutta Pohjoismerellä vallitsevien vaikeiden olosuhteiden vuoksi hän joutui jäämään talveksi Englantiin eikä päässyt määränpäähänsä ennen seuraavana keväänä. Syyskuussa 1795 hän lähti Liverpoolilta Baltimoriin ja saapui kotiin kolmen kuukauden matkan jälkeen. Monet tapahtumat hänen komennossaan "Jane" -aluksella voidaan selvittää aluksen laivakirjoista, jotka kattavat kauden heinä-elokuu 1796, jolloin Ranska ja Englanti olivat vielä sodassa.
- Mitä? Rodgers oppi laivan johtamisen "Jane" -aluksella, ja hän oppi sen helposti.