Huntington ja Hurdle olivat päättäneet olla aggressiivisia vapaassa agenttiasemassa, lisäämällä pelaajia ja veteraanijohtoisuutta, joka estäisi Pittsburgh Piratesin romahduksen vuonna 2013. Kesäkauden aikana joukkue sopii veteraanin Russell Martinin kanssa kahden vuoden, 17 miljoonan dollarin sopimuksesta. Martin oli hyvä hyökkääjä, mutta se oli puolustuksen parannus edellisen vuoden joukkueeseen nähden. Vuonna 2012 Barajas ja McKenry olivat yhdessä heittäneet ulos 19 173 pelaajasta, mikä oli 11 prosentin saalisprosentti, kun taas Russell Martinilla oli 30.25 prosentin saalisprosentti kaudella 2013. 26. joulukuuta 2012 Pirates vaihtoi vakiintuneen sulkijan Joel Hanrahanin ja sisäpiirin pelaajan Brock Holtin Boston Red Soxiin vaihdossa pelaaja Mark Melanconin ja mahdolliset pelaajat Jerry Sands, Iván DeJesús Jr. ja Stolmy Pimentel. Tällä siirtymällä Pirates allekirjoitti uudelleen Jason Grillyn kahden vuoden sopimukseen, jonka arvo on 4,5 miljoonaa dollaria, tullakseen uudeksi Piratesin sulkijaksi. Melancon, joka oli aliarvostettu surkean, loukkaantuneiden 2012 kauden jälkeen, korvasi Grillin Piratesin asennusmieheksi. Grilli ja Melancon asettaisivat Shark Tankin MLB:n parhaaksi kenttäksi.
Hanrahan pelasi Red Soxille vain yhdeksässä pelissä, ennen kuin hän loukkaantui syöttökäseen ja joutui Tommy John -leikkaukseen, kun hänen sopimuksensa päättyi kauden lopussa. Lopulta Hanrahan ei enää koskaan syöttäisi.