Kavaguti/Smirnov aloitti kauden 2015/16 kullalla Challenger Series -tapahtumassa, Mordovian Ornamentissa 2015, ja sitten kullalla kauden ensimmäisessä Grand Prix -tapahtumassa, Kiinan 2015 Cupissa, jossa he järkyttivät kotiseurakunnan suosikkeja Wenjing Sui / Han Congia. He asettivat henkilökohtaisen parhaan kokonaispistemäärän 216,00 pistettä ja saivat kaksi nelinkertaista heittoa Kiinassa. Seuraavassa GP-tapahtumassa, 2015 Rostelecom Cupissa, he voittivat hopeamitalin joukkuetoverinsa Ksenia Stolbova / Fedor Klimovin jälkeen ja pääsivät Grand Prix -finaaliin. Joulukuussa he voittivat pronssimitalin GP-finaalissa Barcelonassa, kun he olivat toisella sijalla lyhyessä ja kolmannella vapaassa luistelussa. Kuun lopussa he saivat hopean vuoden 2016 Venäjän mestaruudesta.
Hän oli toiseksi molemmissa sarjoissa. 20. tammikuuta 2016 Kavaguti kärsi harjoituksissa murtuneesta jänteestä, mikä johti parin vetäytymiseen vuoden 2016 Euroopan mestaruudesta.