Hän oli jatkuvasti huolissaan vallankumouksen positiivisesta voimasta ja omistautui paljon energiaa ja resursseja hyväntekeväisyyteen ja humanitaarisiin hankkeisiin. Hän tuki raamattuyhteisöä ja protestanttista vähemmistöä yleisemmin, sitoen resursseja köyhien koulutukseen ja hyvinvointiin. Sillä välin hän kiinnostui vilpittömästi tapahtumista kotimaassaan. Ranskan vallankumoukselliset armeijat hyökkäsivät jatkuvasti Preussiin. Napoleonin menestyksekkään vallankumouksen jälkeen vuonna 1799 Ranskan sotilaallinen koneisto muuttui yhä tehokkaammaksi. Vuonna 1806 Preussin hallitus joutui hylkäämään Berliinin. Kuningas pakeni Itä-Preussiin. Samalla von Schlabrendorf käytti runsaasti rahaa parantaakseen Pariisissa Ranskan sotajoukkojen vangittamien maanmiehiensä oloja. Vuonna 1803 hän sai Preussin hallitukselta "kutsun" palata "kotiin" Sileesiassa, koska hän oli Preussin kuninkaan Sileesian vasalli. Kun hän ei suostunut, häntä uhattiin takavarikoimalla hänen merkittävät Silesian maanomistuksensa. Seitsemäntenä syyskuuta 1803 Silesian viranomaiset, jotka olivat tällä hetkellä Glogaussa, tekivät virallisen takavarikoinnin sodan aiheuttamien häiriöiden vuoksi.
- Mitä? Wilhelm von Humboldtin päiväkirjat kertovat, että koko tämän ajan hän kiinnitti tarkkaa huomiota ajankohtaisiin kysymyksiin ja kehitykseen, osallistui jatkuvasti intensiivisiin poliittisiin keskusteluihin, antoi inspiraatiota ja osoitti loputtomasti ystäville ja vierailijoille yhtälailla ainutlaatuista kykyä löytää odottamattomia vasta-argumenteja.