Pol Pot muutti Kambodžan yksipuoluevaltioksi nimeltään Demokratinen Kampuchea. Pol Potin hallitus pyrki luomaan maataloussosialistisen yhteiskunnan, jonka hän uskoi kehittyvän kommunistiseksi yhteiskunnaksi, ja siirsi väkisin kaupunkien asukkaat maaseudulle työskentelemään kollektiivisilla tiloilla. Täydellisen tasa-arvon tavoittelussa rahan käyttö lopetettiin, ja kaikki kansalaiset pakotettiin käyttämään samoja mustia vaatteita. Pol Pot oli Kambodžan kansanmurhan takana oleva moottori, - Kambodžan järjestelmällinen vainoaminen ja tappaminen, joita punaiset khmerit pitivät vihollisina. Kansanmurha, aliravitsemus ja huono terveydenhuolto tappoivat 1,5 - 2 miljoonaa ihmistä, noin neljänneksen Kambodžan väestöstä. CPK:n toistuvat puhdistukset synnyttivät kasvavaa tyytymättömyyttä; vuoteen 1978 mennessä kambodžalaiset sotilaat aloittivat kapinan idässä. Useiden vuosien rajakohtausten jälkeen
Uusi yhdistetty Vietnam hyökkäsi Kambodžan kimppuun joulukuussa 1978, kaatoi Pol Potin ja asetti marxilais-leniniläisen hallituksen vuonna 1979. Punaiset khmerit vetäytyivät viidakkoon lähellä Thaimaan rajaa, josta he jatkoivat taistelua. Terveyden heikkenessä Pol Pot vetäytyi monista rooleistaan liikkeessä. Vuonna 1998 punaisten khmerien komentaja Ta Mok asetti Pol Potin kotiarestiin, ja hän kuoli pian sen jälkeen.