"Philadelphia" ja sen miehistö saatiin valloitettavaksi, ja se sai presidentti Jeffersonin lähettämään entisen armeijan upseerin William Eatonin, joka oli tunnettu rohkeudestaan ja uhmaavasta diplomatiastaan, Tripoliin vuonna 1805 vapauttamaan 300 amerikkalaista panttivankia. Se oli ensimmäinen Yhdysvaltain salainen operaatio ulkomaisen hallituksen kukistamiseksi. William Eaton perusti noin 20 kristittyä ryhmän (joista kahdeksan oli Yhdysvaltain merijalkaväen sotilasta) ja ehkä 100 muslimi-palkkasoturia aloittamaan Tripolin valtauksen alkaen Dernasta. Presley O'Bannon ja hänen palkkasoturinsa johtaman pienen merijalkaväen kanssa hän onnistui matkalla yli 800 kilometriä. Eaton johti hyökkäystä Dernan taistelussa.
27. huhtikuuta 1805. Kaupungin valloittaminen, joka muistettiin "Marines' Hymn" -kuuluisessa linjassa "Tripoliin rannikolle" ja Tripoliin kohdistuvan edistyksen uhka, olivat vahvoja vaikutuksia rauhaan, jonka Tobias Lear ja kommodori John Rodgers neuvottelivat kesäkuussa 1805 Tripoliin pashan kanssa.