Tammikuusta 1798 maaliskuuhun 1799 Zach oli armeijan päällikkö. Hän otti uudelleen päällikön roolin heinäkuusta 1799 kesäkuuhun 1800. 9. kesäkuuta 1799 hänet ylennettiin kenraalimajuriin. Itävallan hallituksen avatussa yksityisessä kirjeessä Venäjän suurlähettiläälle armeijan komentaja Aleksandr Suvorov kuvaili Zachiä "terveeksi, hienovaraiseksi ja ammattimaiseksi, mutta erinomaiseksi "Unterkunftin" (logistiikan) harhauttajaksi juuri silloin, kun haluan syttyä tuliseen toimintaan". Vaikka Suvorov käytti sanaa "Unterkunft" halveksuttavana, Zach sai enemmän kutinauksia kuin loukkauksia, kun hänelle näytettiin kirje. Zach esiintyi taitavasti Novin taistelussa.
15 päivänä elokuuta. Kiitollinen keisari myönsi hänelle 13. lokakuuta 1799 Maria Teresian sotilasjärjestyksen ritarikreistin. Taitava matemaatikko, Zach oli enemmän kotona sotilasinsinöörinä kuin taistelujohtajana tai operatiivisessa roolissa.