Kun Yhdysvaltain sisällissota alkoi, Sedgwick toimi eversti ja apulaisinspektori Washingtonin sotilasministeriössä. Hän ei osallistunut sodan alkuvaiheeseen Bull Runin ensimmäisessä taistelussa, kun hän oli toipumassa kolerasta. Hänet ylennettiin prikaatiksenraaliksi 31. elokuuta 1861. Hän komensi kenraalimajuri Samuel P. Heintzelmanin armeijan 2. prikaattia Potomacin armeijassa, sitten omaa diviisiotaan, joka nimitettiin II armeijakunnan 2. diviisioksi niemimaalla. Virginiassa hän taisteli Yorktownissa ja Seven Pinesissa.
- Mitä? Seitsemän päivän taistelun aikana Sedgwickin diviisiota taisteltiin Savagen asemalla ja Glendalessa, ja se haavoittui jälkimmäisessä taistelussa. Seitsemän päivän taistelujen jälkeen hänet ylennettiin kenraalimajuriin. II armeijakunta ja Sedgwickin divisioona eivät osallistuneet Pohjois-Virginiaan.