Kirkyard oli osallisena Covenantereiden historiassa. Liike alkoi allekirjoittamalla kansallisen liiton Greyfriars Kirkissä 28. helmikuuta 1638. Covenantersin tappion jälkeen Bothwellissa.
Vuonna 1679 noin 1200 liiton jäsentä vangittiin - hautausmaan eteläpuolella olevalle pellolle. Kun 1800-luvulla osa tästä kentästä yhdistettiin hautausmaaksi, alue tuli tunnetuksi nimellä "liittolaisvankila".