Helmikuussa 1943, heti liittolaisten Pohjois-Afrikan valloituksen jälkeen.
, kenraalimajuri Terry Allenin johdolla, hän valmisti raportin, joka sisälsi ehdotuksia hyökkäysdivisioonien tehtävän järjestämiselle, ja hänen suosituksensa hyväksyttiin operaatio Husky -operaation valmistelujen aikana, joka oli liittoutuneiden Sisilian hyökkäyksen koodinimenä. Hänet ylennettiin yhden tähden kenraaliluokkaan ja lähetettiin nopeasti Yhdistyneeseen kuningaskuntaan, jossa hän toimi amerikkalaisena neuvonantajana Euroopan operaatiokentän yhdistetyille operaatioille. Cota osallistui amfibian laskeutumisoperaatioiden harjoitteluun.