Maaliskuussa Massénan armeija miehitti Sveitsin ja valmisteli hyökkäystä Tyrollia vastaan Vorarlbergin kautta. Ranskan armeijan tappiot Saksassa ja Italiassa pakottivat hänet kuitenkin palaamaan puolustuskannalle. Hän otti Jourdanin armeijan haltuunsa ja veti sen takaisin Sveitsiin. Arkkiherttua Kaarle ajoi hänet takaa ensimmäisessä Zürichin taistelussa. Kun Kaarle lähti Sveitsistä Alankomaihin, liittoutuneilla oli jäljellä pienempi armeija Korsakovin johdolla, jolle oli määrätty yhdistyä Suvorovin armeijaan Italiasta. Masséna hyökkäsi Korsakovia vastaan ja murskasi hänet toisessa Zürichin taistelussa.
Suvorov pakotettiin perääntymään. Venäjä hylkäsi toisen koalition pian tämän epäonnistumisen jälkeen.