Kahden kauden 28 ottelun jälkeen Linden oli tehnyt vain neljä maalia ja kolme syöttöä. 10. marraskuuta 2001 Capitals vaihtoi Lindenin ja toisen kierroksen draftin.
Hänet siirrettiin Canucksille vaihdossa heidän ensimmäisen kierroksen valintaansa vuonna 2002 (jossa valitsi Boyd Gordonin) ja kolmannen kierroksen valinta vuonna 2003 (myöhemmin vaihdettu Edmonton Oilersille, joka valitsi Zack Stortinin). Linden teki 34 pistettä Vancouverin kanssa 64 pelissä, joihin kuului hänen 1000: n säännöllisen kauden ottelunsa 26. maaliskuuta 2002 Los Angeles Kingsia vastaan. Ensimmäisessä playoff-sarjassa Vancouverin kanssa kuudessa vuodessa hän teki maalin ja neljä ohjausta kuudessa pelissä.