Saksan antautumisen jälkeen marraskuussa 1918 suurin osa korkeanmeren laivastosta oli internatoitava kuninkaallisen laivaston tukikohdassa Scapa Flow'ssa. Bayern oli listattu yhdeksi luovutettaviksi tarkoitettuista laivoista. 21. marraskuuta 1918 alukset, joita oli määrä internatoida, olivat peräamiraali Ludwig von Reuterin komennossa, purjehtivat saksalaisesta tukikohdasta viimeisen kerran. Laivasto tapasi brittiläisen kevyen risteilijän Cardiffin, ennen kuin se tapasi 370 brittiläisen, amerikkalaisen ja ranskalaisen sota-aluksen laivaston Scapa Flow'ssa. Laivasto pysyi vankeudessa neuvottelujen aikana, jotka lopulta tuottivat Versaillesin sopimuksen.
Vuosi 1918