Hän on mennyt vasektomiaan. Kun hän mainosti elokuvansa 12 Roundsia vuonna 2009, Cena ilmoitti kihlautuneensa Elizabeth Huberdeau'n kanssa. He menivät naimisiin 11. heinäkuuta 2009. 1. toukokuuta 2012 Cena jätti avioeronsa, joka saatiin päätökseen 18. heinäkuuta. Myöhemmin samana vuonna hän alkoi seurustella painijaisen Nikki Bella Cenan kanssa, kun Cena koski häntä WrestleMania 33 -tapahtumassa 2. huhtikuuta 2017, mutta heidän suhteensa päättyi huhtikuussa 2018.
11. heinäkuuta 2009