Schumacher oli kolmanneksi kuljettajien mestaruudessa vuonna 1996 ja auttoi Ferraria toiseksi valmistajien mestaruudessa entisen Benettonin edelle. Kauden aikana autolla oli luotettavuusongelmia; Schumacher ei päässyt maaliin seitsemässä 16 kilpailusta. Schumacher otti pole position, mutta kärsi moottorin vikaantumisesta muodostumiskierroksella. Hän voitti kuitenkin kolme kilpailua, enemmän kuin joukkueen kokonaismäärä vuosina 1991-1995. Hän voitti Ferrarin ensimmäisen voiton Espanjan Grand Prix -kilpailussa, jossa hän kiersi koko kentän kolmanneksi märällä. Hän oli johdossa 19. kierroksella, ja hän kiersi jatkuvasti viisi sekuntia nopeammin kuin muut kentällä vaikeissa olosuhteissa. Belgian Grand Prixissä
Schumacher käytti hyvin ajoitettuja pit-stoppeja - torjuttaakseen Williamsin Jacques Villeneuve'n. Schumacher voitti myös ensimmäisen sijan Monzassa Tifosin edessä.