Ranskan vallankumouksen ja myöhemmin Napoleonin Ranskan nousun jälkeen Genovan tasavallan poliittinen tilanne muuttui yhä kestämättömämmäksi. Vaikka Genova oli virallisesti puolueeton Ranskan vallankumoussotien aikana, sen läheisyys Ranskaan mahdollisti suuremman maan jatkuvan painostuksen tasavaltaan. Vuoden 1795 Genovan taistelun aikana
Ranskalainen laivasto Genovan tukemana kukisti brittiläisen laivaston kaupungin rannikolla. Tämä johti siihen, että kuninkaallinen laivasto asetti vuosia kestäneen Genovan saarron, joka vaikutti merkittävästi tasavallan talouteen.