Kun Lippert palasi Irakista, hän toimi ulkoministeriön neuvonantajana.
Vuoden 2008 presidenttikampanjassa. Hän oli vastuussa siitä, että Obama sai tietoa uusista ulkopoliittisista kysymyksistä koko kampanjan ajan. Hän auttoi Obamaa valmistumaan ulkoministeriön väittelyihin. Myöhemmin Lippert toimi Obama-Bidenin siirtymähankkeen ulkopolitiikan apulaisjohtajana.