Kesällä 1808, kun suhteet Itävaltaan heikkenivät, III armeijakunta siirrettiin Franconiaan vartioimaan rajaa. Morand oli asemalla Neumarktissa. Kun Viidennen liittouman sota puhkesi huhtikuussa 1809, hänen divisioonansa siirrettiin väliaikaisesti marsalkka Lannesille, joka taisteli Abensbergissä, Landshutissa
, ja Eckmühl 20.-22. huhtikuuta. Hän taisteli Wagramin taistelussa, jossa haavoittui.