Agron oli syntynyt Georgian Savannahissa ja kasvanut Kalifornian San Antoniossa ja Kalifornian San Franciscossa, Mary Barnesin ja Ronald S. Agronin, Hyatt-hotellien pääjohtajan, tyttärenä. Agronin mukaan hän ja hänen perheensä asuivat eri hotelleissa. Hänellä on nuorempi veli, Jason. Hänen isänsä syntyi juutalaisessa perheessä, kun taas hänen äitinsä kääntyi juutalaisuuteen. Agron kävi heprealaisessa koulussa ja hänellä oli Bat Mitzvah. Hänen isänsä esi-isät olivat juutalaisia Itä-Euroopasta, joiden alkuperäinen sukunimi "Agronsky" oli hänen mukaansa muuttunut Ellis Islandin maahanmuuttoviranomaisten mukaan, mutta se näyttää muuttaneen perheen nimen saapumisen jälkeen Yhdysvaltoihin.
Hepreankielinen koulu