Yamamoto aloitti uransa vuonna 1990 TV Asahin satelliitti-kanavan Asahi Newstarin toimittajana, josta lopulta tuli videojournalisti ja dokumentti- ja uutisohjelmien ohjaaja. Hän jätti kanavan vuonna 1995 liittyä Japan Press, Tokiossa sijaitseva riippumaton mediaryhmä, joka kattaa uutisia ja tuottaa dokumentteja TV-lähetyksille ja lehdille, jotka keskittyvät Lähi-itään ja Lounais-Aasiaan. Yamamoto työskenteli Japan Pressin toimittajana kriittisillä alueilla, kuten Kosovossa, Bosniassa, Tšetšeniassa, Indonesiassa, Afganistanissa vuonna 2001, Irakissa vuonna 2003 ja Ugandassa. Hän raportoi Afganistanin naisten tukahduttamisesta Kabulissa ja haastatteli Talibanin jäseniä Afganistanissa. Hän työskenteli Nippon TV:n erikoiskorrespondenttina Irakissa. Hän jäi henkiin 3. huhtikuuta 2003 Bagdadissa Palestiinan hotellissa koalitsion panssarivaunujen ampumasta, jossa kuoli kaksi Reutersin journalistia ja espanjalainen lähetysyhtiö. Yamamoto siirtyi työskentelemään uutislähettilään Nippon TV -uutistoiminnassa vuosina 2003 ja 2004, ja hän sai Vaughn-Uyeda Memorial Award -palkinnon Irakissa käydylle sodalle. Hän oli myös erikoisopettaja Wasedan yliopiston journalismin koulussa ja Tsurun yliopistossa, jossa hän opiskeli. Hänen luennoissaan käsiteltiin sodan vaikutuksia tavallisille kansalaisille ja journalismin roolia sota-aikana. Itä-Japanin maanjäristyksen jälkeen
Yamamoto vieraili 11. maaliskuuta 2011 kärsineillä alueilla rekisteröidäkseen aiheutuneet vahingot. Marraskuussa 2011 hän aloitti riippumattomana neuvonantajana hallituksen elvyttämisyksikössä, jolla oli vastuu Japanin hallituksen tarpeettomien menojen vähentämisestä. Yamamoto oli Syyriassa Nippon TV:n toimistossa raportoimassa käynnissä olevasta sisällissodasta ja sen vaikutuksesta Syyrian siviiliväestöön, kun hän kuoli.