Kirjoita jatko tähän kappaleeseen - Tughlugh Timur ei pystynyt täysin alistamaan heimojen hallitsijoita. Hänen kuolemansa jälkeen vuonna 1363 mogulilaiset jättivät Transoxianan, ja Qara'uniden johtaja Amir Husayn otti Transoxianan haltuunsa. Tīmur-e Lang (Timur Lahja), tai Tamerlane, Transoxianan muslimi, joka väitti olevansa Tšingis-Khanin jälkeläinen, halusi hallita khania itse ja vastusti Amir Huseiniä. Hän valloitti Samarkandin vuonna 1366, ja hänet tunnustettiin emiriksi vuonna 1370, vaikka hän jatkoi virallisesti toimimista Chagatai-khanin nimissä. Yli kolmen vuosikymmenen ajan Timur käytti Chagatai-maita laajamittaisten valloitusten tukikohtana, valloittaen Afganistanin Heratin, Persian Shirazin, Irakin Bagdadin, Intian Delhin ja Syyrian Damaskoksen hallitsijat. Ottomaanien turkkilaisten kukistamisen jälkeen Angorassa
Timur kuoli vuonna 1405 marssiessaan Ming-dynastian Kiinaa vastaan. Timuridien dynastia jatkui hänen poikansa Shah Rukhin alaisuudessa, joka hallitsi Heratista kuolemaansa asti vuonna 1447.