Marraskuussa 2008 järjestettyjen vaalien jälkeen hänet pyydettiin toistamiseen Valkoisen talon valokuvaajaksi uudelle presidentti Barack Obamalle. Uusi presidentin muotokuva julkaistiin 14. tammikuuta 2009; se on ensimmäinen kerta, kun virallinen presidentin muotokuva on otettu digitaalisella kameralla. Viikkoa myöhemmin Souza oli läsnä virkaanastujaisissa.
Seuraavana päivänä hän oli ainoa valokuvaaja Obaman toisessa valanottotilaisuudessa.