Toisen maailmansodan aikana Imperial Airways ja myöhemmin British Overseas Airways Corporation jatkoivat lentoliikennettä Lyddaan aina Ranskan kukistumiseen saakka kesäkuussa 1940. Kun japanilaiset hyökkäsivät Birmaan ja Malayaan
Helmikuussa 1942 KLM lyhensi reittiä Bataviaan ja teki Liddasta reitin itäisen päätepisteen. Misr Airwork, joka oli keskeyttänyt lennot Britannian sodanjulistuksen jälkeen, aloitti viikoittaisen Kairon-Lyddan-Nicosia-palvelun toukokuussa 1940.