Hän siirtyi Kanadan alle 20-vuotiaiden joukkueeseen, jossa hän pelasi ensimmäisen kolmesta juniori-maailmanmestaruuskilpailusta vuonna 2009. Hänet nimitettiin joukkueeseen 17-vuotiaana. Hän oli yksi kolmesta pelaajasta, jotka olivat draftissa.
Hän oli klubilla John Tavaresin ja Evander Kanen kanssa. Päävalmentaja Pat Quinn oli valmentanut Ellisiä aiemmin U18-maailmanmestaruuskilpailussa. Hän valitsi Ellisin joukkueeseen kahdeksanneksi puolustajaksi perinteisen 13. hyökkääjän sijasta, koska hänellä oli kyky voimaa pelata. Semifinaalissa Venäjää vastaan Ellis auttoi tasapainottamaan ottelun viisi sekuntia jäljellä ollessa. Kaksi kertaa hän esti kiekon poistumisen hyökkäysvyöhykkeeltä, mikä mahdollisti Jordan Eberlen tasapelin. Kanada voitti Venäjän ja voitti Ruotsin finaalissa. Ellis teki seitsemän pistettä kuudessa pelissä ja pääsi neljänneksi turnauksen puolustajien joukossa. Se oli myös 17-vuotiaan puolustajan kanadalaisennätys.