Chelsea teki paluunsa kapteeninsa Terry Mourinhon kanssa, joka saattoi tarvita leikkausta ongelman korjaamiseksi. Terry Terry veti 2<unk>2 kotona sekä Readingia että Fulhamia vastaan jouluna, tasapeli, joka osoittautui ratkaisevaksi Premier League -mestaruuden kohtaloksi tuona kaudella. 28. joulukuuta Chelsea julkaisi lehdistötiedotteen, jossa sanottiin, että Terry oli saanut leikkauksen: "Sequestrated lumbar intervertebral disc -leikkaus onnistui". Vaikka hänen odotettiin palaavan ottelussa Wigan Athleticia vastaan, jossa Chelsea voitti 3<unk>2 kiitossivu Arjen Arbenbenin myöhäisen maalin ansiosta, Terry puuttui jälleen kerran toistuvan selkäongelman vuoksi. Hän palasi kapteeninsa Terry Mourinhon 1-0 voittoon Charltonia vastaan 3. helmikuuta 2007, kun hän oli tulossa ongelman korjaamiseen.
131 000 ja 135 000 puntaa viikossa