Sodan alussa hänet siirrettiin Itämeren laivaston kolmanteen hävittäjädivisioonaan. Neuvostoliiton laivaston evakuoinnin aikana
Tallinnasta Kronstadtiin operaatio Barbarossa -hetkessä "Yakov Sverdlov" oli lippulaivaan saattajana. Operaation aikana se osui miinaan ja upposi Cape Jumindan lähellä 28. elokuuta 1941. Romu löydettiin ja tunnistettiin 16. kesäkuuta 2018. Alus on rikki kahteen osaan.