Myöhemmin sodassa hän vei joukkoja Intiaan ja osallistui maihinnousuun Madagaskarissa.
Pohjois-Afrikka, Italia ja Azoreilla. Vuonna 1945 se käytettiin Winston Churchilin ja Britannian edustajien päämajaksi Jaltan konferenssissa. Euroopan sodan lopussa "Franconia" teki useita matkoja Atlantin poikki kuljettamalla palaavia Yhdysvaltain joukkoja ja pakolaisia. VJ-päivän jälkeen hän palkattiin palauttamaan brittijoukkoja, mukaan lukien vapautetut sotavankeja, Intiasta. Hallituksen palveluksessaan se oli kuljettanut 189 239 sotilashenkilöä.