Vuonna 2011 museo suljettiin turvallisuussyistä Libyan sisällissodan jälkeen.
ja sen jälkeisiä levottomuuksia. Museo pysyi suljettuna vuodesta 2020 lähtien. Vuoden 2011 sodan aikana kapinalliset tunkeutuivat museoon, ja muutama Muammar Gaddafiin kuuluva esine vahingoittui. Museon henkilökunta säilytti arvokkaimmat esineet turvallisesti toisessa paikassa. Henkilökunta säilytti Gaddafia koskevat muut tavarat.