Seuraava merkittävä edistys tapahtui 1940-luvulla, kun Linus Pauling vahvisti Ehrlichin ehdottaman lukko-ja-avain-teorian osoittamalla, että vasta-aineiden ja antigeenien väliset vuorovaikutukset riippuvat enemmän niiden muodosta kuin niiden kemiallisesta koostumuksesta. Vuonna 1948 Astrid Fagreaus löysi, että B-solut, plasman solujen muodossa, olivat vastuussa vasta-aineiden tuottamisesta. Lisää työtä keskittyi vasta-aineiden rakenteiden karakterisointiin.
vasta- aineproteiinien rakenteita.