Wiggins keskittyi keväällä 2016 olympialaisiin valmistautumaan. Hän rajoitti kilpailujaan vain muutamaan kilpailuun. Wiggins rikkoi olympialaiskursseissa maailmanennätyksiä olympialaiskursseissa, vaikka Wigginsin ja Cavendishin välillä oli ilmeisiä erimielisyyksiä. Cavendish nimitettiin joukkueen viidenneksi ratsastajaksi, jotta hän pääsisi otteluun. Seuraava
Seurantajoukkue saavutti nopeimman ajan turnaukseen, ennen kuin pääsi finaaliin maailmanennätyksellä voitolla Uutta-Seelantia vastaan. Viimeisessä ottelussa Iso-Britannia voitti Australian, mikä toi Wigginsille hänen kahdeksannen olympiamitalinsa ja viidennen kultansa. Myöhemmin Wiggins ilmoitti suunnitelmastaan jäädä eläkkeelle Gentin kuuden päivän jälkeen marraskuussa. Hän aikoo laajentaa toimintaansa tukemalla ja johtamalla Team Wigginsia, mukaan lukien tavoitteena luoda naisten joukkue. Wiggins sijoittui kakkoseksi Cavendishin kanssa ennen kuin pariskunta voitti hänen viimeisen kilpailun, Six Days of Ghentin. Kilpailun jälkeen Wiggins vahvisti, että tämä oli hänen viimeinen kisaan Cavendishin kanssa, mutta että hän voi perua päätöksensä vetäytyä oikeissa olosuhteissa. Kuitenkin 28. joulukuuta 2016 hän ilmoitti vetäytyvänsä ammattilaispyöräilystä sanoen: "Vuosi 2016 on tämän luvun tien loppu, eteenpäin ja ylöspäin, 'jalka maassa, pää pilvissä' Kilburnin lapset eivät voita olympiakultaa ja Tour de Francesta! Nyt he tietävät".