Cloudflare hankki vuonna 2014 StopTheHackerin, joka tarjoaa haittaohjelmien havaitsemisen, automaattisen haittaohjelmien poistamisen sekä maineen ja mustan listan seurannan. joulukuussa 2016 Cloudflare hankki Eagerin, jonka tarkoituksena oli päivittää Cloudflare'n Apps -alusta siten, että se mahdollistaa kolmansien osapuolten sovellusten asentamisen Cloudflare-käyttöön perustuviin sivustoihin vetämällä ja pudottamalla.
haittaohjelmien havaitseminen, automaattinen haittaohjelmien poistaminen sekä mainetta ja mustia luetteloita koskeva seuranta