Ferdinand aloitti rauhanneuvottelut marraskuussa, mutta hänen asemansa heikkeni, kun Gallasin armeija hajosi; jäännökset vetäytyivät Böömiin, jossa Torstenson hajotti heidät Jankaussa
maaliskuussa 1645. Toukokuussa von Mercyn alainen Baijerin joukko tuhosi ranskalaisen erillisryhmän Herbsthauseniin, ennen kuin hän kukistui ja kuoli toisessa Nördlingenissä elokuussa. Koska Ferdinand ei kyennyt auttamaan, Johan Georg Saksin allekirjoitti syyskuussa kuuden kuukauden rauhan Ruotsin kanssa, minkä jälkeen maaliskuussa 1646 solmittiin Eulenbergin rauha, jossa hän suostui pysymään puolueettomana sodan loppuun asti.