Se kärsi huomattavia vahinkoja vuonna 1893 satamassa sijaitsevassa Cabo Machichaco -höyrysaluksessa tapahtuneen valtavan dynamiitin räjähdyksen seurauksena. Se kärsi vakavia vahinkoja Espanjan sisällissodan jälkeen vuonna 1941 Santanderin tulipalossa ja tarvitsi laajaa jälleenrakennusta ja korjausta vuodesta 1942 vuoteen 1953, jolloin se avattiin uudelleen. Arkkitehdit, jotka vastasivat tästä tehtävästä, olivat José Manuel Bringas ja Juan José Resines del Castillo. Kysymys: Mikä tapaus pakotti tämän rakennuksen väliaikaiseen sulkemiseen?
Santanderin tulipalo vuonna 1941