Toukokuussa 2008 BBC ilmoitti, että Moffat seuraa Daviesia johtavana kirjailijana ja tuottajana "Doctor Who" -sarjan viidennessä sarjassa, joka lähetetään vuonna 2010, vaikka Davies oli aloittanut keskusteluja Moffatin kanssa tästä jo heinäkuussa 2007. Hän oli aikonut tehdä loppuun "Tintin" -trilogian ennen "Doctor Who" -sarjan jatkamista, mutta viivästymiset aiheuttivat välillinen 2007-2008 Writers Guild of America -lakko.
Hän tarkoitti, että hän voi toimittaa vain osan ensimmäisen elokuvan käsikirjoituksesta. Moffat kertoi The Guardianille vuonna 2012, että Spielberg oli "rakas" päätöksestään luopua kolmen elokuvan "Tintin" sopimuksesta ja palata "Doctor Whoen". Trilogian ensimmäisen elokuvan "Tintinin seikkailut" käsikirjoitus valmistui Edgar Wrightin ja Joe Cornishin toimesta, ja elokuvassa käytettiin osaa Moffatin käsikirjoituksesta.