Useimmat bakteerit pääsevät keuhkoihin pikku aspiraatioiden kautta organismien, jotka asuvat kurkussa tai nenässä. Puolet normaaleista ihmisistä on näitä pieniä aspiraatioita nukkuessaan. Vaikka kurkku sisältää aina bakteereja, mahdollisesti tarttuvia asuvat siellä vain tiettyinä aikoina ja tietyissä olosuhteissa. Vähemmistö bakteereja, kuten Mycobacterium tuberculosis ja Legionella pneumophila saavuttaa keuhkoihin saastuneiden ilmassa olevien tippojen kautta. Bakteerit voivat levitä myös veren kautta. Kun keuhkoissa, bakteerit voivat tunkeutua solut ja solut, joissa makrofageja ja neutrofiilejä (puolustusvalkosoluja) yrittää inaktivoida bakteerit. Neutrofiilejä vapauttaa myös sytokoineja, aiheuttaen yleisen aktivoinnin immuunijärjestelmää. Tämä johtaa kuumetta, ja yleinen väsymys.
veren kautta