Lundqvist pelasi yhdeksässä ottelussa IF Mölndal Hockeylla Ruotsin toisessa Allsvenskan-sarjassa ennen liittymistä Frölundan juniorijoukkueeseen J20 SuperElitissä joulukuussa. Hän pelasi huonosti Allsvenskanissa ja sai vaikean alun J20 SuperElitissä. Hän antoi kuusi maalia Kanadan vastaisessa näytösoitossa. Kansallisen juniorijoukkueen valmentajat Bo "Kulon" Lennartsson ja Mikael Tisell olivat huolissaan ja päättivät keskustella Lundqvistin kanssa, jossa he kyseenalaisivat hänen motivaationsa. Lundqvistin käännekohta tuli vuodenvaihteessa 2001 juniorien jääkiekon maailmanmestaruuskilpailussa.
Moskovaan, jossa hän johti Ruotsin juniorijoukkuetta neljänneksi. Hän vietti loput kaudesta J20 SuperElitissä, jossa hän pelasi 18 peliä ja johti liigan maalivahdin pelaamia minuutteja. Hän johti Frölundaa toiseen peräkkäiseen Anton Cup -voittoon, joka tuli 5-2 voitolla Leksands IF: n vastaan finaalissa Stockholmin Globe Arenalla.