19. huhtikuuta 2012 Valverde ilmoitti päättäneensä lähteä perheasioiden vuoksi. 3. joulukuuta hän palasi Espanjan jalkapalloon nimittämällä hänet Valencian joukkueeseen kauden loppuun, korvaten irtisanotun Mauricio Pellegrinon. Hänen ensimmäinen ottelunsa tapahtui viisi päivää myöhemmin, 1-0 voitto Osasunan kanssa, ja toinen ottelu, vastaan sama vastustaja Espanjan kuppa
, toi toisen voiton Reyno de Navarrassa (2<unk>0).