Bayern oli lueteltu yhtenä luovutettaviksi asetetuista laivoista. 21. marraskuuta 1918 alukset, joita oli määrä interneroida, varapäämies Ludwig von Reuterin johdolla purjehtivat Saksassa sijaitsevasta tukikohdasta viimeisen kerran. Laivasto tapasi brittiläisen kevyen risteilijän Cardiffin ennen kuin se tapasi 370 brittiläisen, amerikkalaisen ja ranskalaisen sotalaivojen laivaston Scapa Flow'hun. Laivasto pysyi vankeudessa neuvottelujen aikana, jotka lopulta johtivat Versaillesin sopimukseen.
Marraskuu 1918