Täytä seuraava lause: 28. elokuuta 1941, yli kaksi kuukautta Saksan Neuvostoliittoon hyökkäyksen jälkeen, Pukhov sai määräyksen korvata 38. armeijan 304. kivääridivisioonan komentajan. Tämä oli hänen ensimmäinen kenttäkomentonsa kiväärirykmentin jälkeen noin 15 vuotta aiemmin. Syyskuun alussa se siirrettiin Kozelshchyna-alueelle, jossa se kärsi syyskuun 17 päivään saakka raskaita tappioita raskaissa puolustustaisteluissa, vetäytyessään itään Sanzheryn, Reshetylivkan ja Poltavan alueelle. 304. soti sitten Donbassin puolustusoperaatiossa lokakuussa, ja vetäytyi sitten reserviin Snezhny Kut -alueelle. Pukhov piti tätä asemaa 20. tammikuuta 1942 saakka, jolloin hänelle annettiin 13. armeijan komennon, jonka hän piti puoliväliin 1946 asti. Vuoden 1942 puoliväliin asti armeija, osa Bryansk-rintamaa, piti puolustusasemia Skorodnoyen ja Kolpnyn linjassa. Armeija taisteli
Voronezhin taistelu vuoden 1942 puolivälissä ja Voronezhin-Kastornenskin hyökkäysoperaatio vuoden 1943 alussa. 14. helmikuuta Pukhov ylennettiin kenraaliluutnanttiksi. Kurskin taistelun aikana heinäkuussa armeija, joka piti asemia Kurskin ulkonäön pohjoispuolella, torjui kuusi päivää saksalaisten hyökkäyksiä ankarassa taistelussa, estäen saksalaisten läpimurron ja rajoittaen saksalaisten etenemistä 10 × 12 kilometriin. Kun Neuvostoliiton joukot siirtyivät hyökkäykseen Saksan armeijan ratkaisevan kukistamisen jälkeen, 13. armeija taisteli operaatiossa Kutuzov.