Anwar alkoi ottaa etäisyyttä Mahathirilta, avoimesti edistämällä hänen ylivoimaisia uskonnollisia uskontonsa ja näyttäen viittaavan siihen, että Mahathir suosi vapauksien vapauttamista Mahathirin pääministeriyden tunnusmerkkiin. Mahathir kuitenkin jatkoi Anwarin tukemista hänen seuraajanaan, kunnes heidän suhteensa romahti dramaattisesti Aasian rahoituskriisin aikana. Heidän asenteensa erosivat vähitellen, kun Mahathir luopui tiukasta raha- ja finanssipolitiikasta, jota IMF kehotti. UMNO:n yleiskokouksessa vuonna 1998 johtava Anwarin kannattaja Ahmad Zahid Hamidi arvosteli hallitusta siitä, ettei Mahathir ollut tehnyt tarpeeksi torjuttaakseen korruptiota ja korruptiota.
Juokse lavalle ja vakuuta hänet itkien jäämään.