Torres valittiin Chelsean uuden managerin José Mourinhon aloittamaan Hull Cityn kanssa 2013/14 kauden avajaispäivänä, jossa hän voitti viidennen minuutin rangaistuspotkun. Hän teki kauden ensimmäisen maalinsa vuoden 2013 UEFA Super Cupissa.
Bayernia vastaan. 28. syyskuuta 2013 hän sai kaksi keltaista korttia, kun Chelsea ja Tottenham Hotspur pelasivat tasapeliä White Hart Lanella.