Seuraavana päivänä hän nousi laivaan Liverpoolissa liittyäksesi saattueeseen Algeriin. Erwin Rommelin tappion ja Pohjois-Afrikan vapautuksen jälkeen Amer, nyt langaton operaattori MTB 243:ssa, lähetettiin Maltalle. Heinäkuussa 1943 liittoutuneet hyökkäsivät Sisiliaan. Amer osallistui hyökkäykseen.
ja Kreikka. Hän haavoittui vakavasti taistelussa, mutta toipui kenttäsairaalassa lähellä Cataniaa. Kun sota Euroopassa päättyi, hänen veneensä siirrettiin Yhdistyneiden Kansakuntien avustus- ja kuntoutusvirastoon (UNRRA). Muutamaa viikkoa myöhemmin sota lopulta päättyi ennen kuin hän saattoi lähettää Kaukoidässä taistelemaan japanilaisia vastaan.