Hannigan syntyi Washingtonissa, D.C:ssä, kiinteistövälittäjä Emilie (Posner) Haasin ja Teamstersin kuorma-autonkuljettaja Alan Hanniganin ainoana lapsena. Hänen isänsä on irlantilaista alkuperää ja hänen äitinsä on juutalainen. Kysymys: Mikä on Hanniganin isän kansalaisuus?
Irlanti