Hänen ensimmäinen julkaisemansa kirja oli vuonna 1925 julkaistu runokokoelma "The Espalier", jota ylistivät A. E. Housman ja Arthur Quiller-Couch. David Garnett rohkaisi häntä kirjoittamaan fiktiota. Warnerin romaaneihin kuului "Lolly Willowes" (1926), "Mr Fortune's Maggot" (1927), "Summer Will Show" (1936) ja "The Corner That Held Them" (1948). Toistuvat teemat ovat ilmeisiä useissa hänen teoksissaan. Näitä ovat kristinuskon hylkääminen ("Mr Fortune's Maggot" ja "Lolly Willowes", jossa päähenkilöstä tulee noita); naisten asema patriarkaalisissa yhteiskunnissa ("Lolly Willowes", "Summer Will Show", "The Corner that Held Them"); epämääräinen seksuaalisuus tai biseksuaalisuus ("Lolly Willowes", "Mr Fortune's Maggot", "Summer Will Show"); ja maiseman lyyriset kuvaukset. Mr. Fortune's Maggot -kirjaa, joka kertoo lähetyssaarnaajasta Tyynenmeren saarilla, on kuvailtu "satiriseksi, imperialismin vastaiseksi romaaniksi". "Summer Will Show" -sarjassa sankari Sophia Willoughby matkustaa Pariisiin
1848 vallankumouksen jälkeen hän rakastuu naiseen. "The Corner That Held Them" (1948) keskittyy keskiaikaisen luostarin nunnia.