Täytä seuraava lause: 27. heinäkuuta 2012 Scutaro vaihdettiin San Francisco Giantsille Charlie Culbersonin tilalle. 8. elokuuta 2012 St. Louis Cardinalsia vastaan Busch Stadiumilla pelatussa pelissä Scutaro ajoi uransa korkeimman seitsemän juoksua, mukaan lukien Grand Slam. Hän iski.306 säännöllisen kauden aikana, mukaan lukien.362 Giantina, auttaen Giantsia voittamaan National League West -tittelin. Hänet palkittiin NLCS: n MVP: llä, kun hän sopi NLCS: n ennätyksen 14 lyönnillä ja myös lyömällä.500 (14 28: sta) kuuden juoksun ja neljän juoksun lyönnin aikana.
Seitsemän ottelun sarja Cardinalsia vastaan. Lokakuun 28. päivänä 2012 Scutaro ajoi Ryan Theriotin voittojuoksulle, kun Giants pyyhki Detroit Tigersin.