Lokakuuhun mennessä "Luftwaffe" oli vahvistanut "Fliegerkorps II" -joukkoa, ja uusi raskaiden hyökkäysten kierros alkoi, käyttäen uusia matalan tason tai matala sukellus pommitus taktiikka, pääasiassa lentokentille ja RN sukellusveneen tukikohtaan. Niissä käytettiin Ju88-koneita, joita saattoi useita saksalaisia ja italialaisia hävittäjiä, sekä Bf 109-koneita, Macchi C.202 "Folgores" -koneita ja Fiat CR.42 "Falco" -koneita, jotka toimivat hävittäjäpommittajina. Kuitenkin nämä hyökkäykset hävisivät myös voimakkaasti AA-aseille ja RAF-taistelijoille, huolimatta saaren lisääntyvästä ruoan ja tarvikkeiden puutteesta. Viimein marraskuussa "Welshman" ja sen sisarlaiva HMS "Manxman" ilmestyivät, ja niiden perässä seurasi tarvikekonvoi. Kun Axis hävisi Alameinissa ja liittoutuneet laskeutuivat Pohjois-Afrikkaan
Samana päivänä Maltan piiritys päättyi. Vihollisen ainoa ilmatehtävä loppuvuodesta oli satunnaisia korkeita tiedustelulentoja ja yksi hyökkäys Luqaa vastaan joulukuussa. 18. marraskuuta komentava upseeri, everstiluutnantti J.E.C. Blunt, siirrettiin 4. HAA Rgt:iin ja majuri G.J. Bell ylennettiin 12. AA-aseoperaatiohuoneen komentajasta hänen tilalleen.