Kirjoita jatko tähän kappaleeseen - Liettuan Neuvostoliiton miehityksen jälkeen kesäkuussa 1940 Šliūpas kutsuttiin (todennäköisimmin Mečislovas Gedvilasin kautta, joka oli Eettisen kulttuurin yhdistyksen jäsen) Liettuan kansanhallitukseen, mutta kieltäytyi. Entinen pääministeri Antanas Merkys kävi Šliūpan kotona Palangassa, kun hän yritti paeta ulkomaille. Toisin kuin monet liettualaiset aikakauslehdet, "Laisvoji mintis" ei lakkautettu uudella kommunistisella hallinnolla, vaan Šliūpas korvattiin toimittajana. Šliūpasin sijoitukset ja muu omaisuus kansallistettiin, mutta uusi hallitus teki poikkeuksen, joka salli hänen pitää talonsa Palangassa. Kesäkuun karkotuksessa
, Šliūpan lankona karkotettiin Siperiaan ja hän sai varoituksen, että hänen oma perheensä oli karkotusluettelossa.