Täytä seuraava lause: Jefferson oli haluton sekaantumaan minkäänlaiseen kansainväliseen konfliktiin, mutta hän uskoi, että voima olisi paras keino estää Barbary-valtioita vaatimasta lisää kunnianosoitusta. Hän määräsi Yhdysvaltain laivaston Välimerelle puolustamaan itseään Barbary Piratesia vastaan.
Ensimmäinen barbaarisota. Hallinnon ensimmäiset ponnistelut olivat suurelta osin tehottomia, ja vuonna 1803 Tripoli valloitti fregatin. Helmikuussa 1804 luutnantti Stephen Decatur johti onnistuneen hyökkäyksen Tripolin satamaan, joka poltti "Philadelphian" ja teki Decaturista kansallisen sankarin. Jefferson ja nuori amerikkalainen laivasto pakottivat Tunisin ja Algerin rikomaan liitonsa Tripolin kanssa, mikä lopulta poisti sen sodasta. Jefferson määräsi myös viisi erillistä Tripoliin kohdistunutta meripommitusta, mikä palautti rauhan Välimerellä jonkin aikaa, vaikka Jefferson jatkoi maksamaan jäljelle jääneille Barbary-valtioille presidenttiytensä loppuun asti.