Maaliskuussa 1941 konterimiraali Giffen nimitettiin risteilijädivisioonan komentajaksi. Hän johti Pohjois-Atlantin puolueettomuuspartiota yhä "sotaan kaltaisemmissa" operaatioissa vuoden 1941 jälkipuoliskolla. Kun sota virallisesti alkoi Yhdysvalloille joulukuussa, hän komensi merivoimia, jotka saattoivat saattueita ja ajoittain toimivat Britannian kotialuksen kanssa. Marraskuussa 1942 hän osallistui Pohjois-Afrikan hyökkäykseen.
, jonka aikana hänen työryhmänsä hyökkäsi aktiivisesti Ranskan sota-aluksia ja lentokoneita vastaan Casablancan, Marokon.