Ranskan kukistuttua vuonna 1940 Korsika kuului Vichyn hallituksen eteläiseen "vapaa-alueeseen". Fascistinen johtaja Benito Mussolini vaati Korsikan irredentistien tukemaa Italian hallintaa. Vuonna 1942 Italia valloitti Korsikan valtavalla joukolla. Saksan joukot ottivat vallan vuonna 1943 liittoutuneiden aselevon jälkeen Italian kanssa. Saksalaiset kohtasivat Ranskan vastarinnan vastustusta ja vetäytyivät ja evakuoivat saaren lokakuuhun 1943 mennessä. Sen jälkeen Korsikasta tuli liittoutuneiden lentotukikohta, joka tuki Välimeren teatteria vuonna 1944 ja Etelä-Ranskan hyökkäystä.
Elokuussa 1944. Sodan jälkeen Korsikalla on kehittynyt kukoistava matkailuala, ja se on tunnettu itsenäisyysliikkeistään, jotka ovat toisinaan olleet väkivaltaisia.