Vuotta myöhemmin, "Operation PBSuccess" -operaatiossa, CIA auttoi paikallista armeijaa kaatamaan demokraattisesti valitun Jacobo Arbenzin vasemmistolaisen hallituksen Guatemalassa ja asettamaan sotilasdiktaattori Carlos Castillo Armasin. United Fruit Company lobbaili Árbenzin kukistamiseksi, koska hänen maa-uudistuksensa vaaransivat heidän maanomistuksensa Guatemalassa, ja maalasi nämä uudistukset kommunistiseksi uhkana. Vallankaappaus käynnisti vuosikymmeniä kestäneen sisällissodan.
Se vaati arviolta 200 000 ihmisen hengen (42 275 yksittäistä tapausta on dokumentoitu), enimmäkseen 626 verilöylyä, jotka tehtiin USA:n tukemien Guatemalan armeijan tekeminä. Riippumaton historiallisen selvityskomissio totesi, että yhdysvaltalaiset yritykset ja hallituksen virkamiehet "painostivat pitämään yllä maan vanhanaikaista ja epäoikeudenmukaista sosioekonomista rakennetta" ja että Yhdysvaltain sotilasapua oli "olennaisesti vaikuttanut ihmisoikeusloukkauksiin aseellisen vastakkainasettelun aikana".