Skorzeny käytti tammi- ja helmikuun 1945 säännöllisten joukkojen komentajana toimivana kenraalimajorina, osallistuen Itä-Preussin ja Pommeranian saksalaisten maakuntien puolustukseen ja Schwedtin sillanpään puolustukseen. 17. maaliskuuta hän sai käskyn sabotoida
Silta romahti samana päivänä, ja laivaston purkamisryhmä hyökkäsi epäonnistuneesti läheiseen liittoutuneiden pontooniltaan Krippin ja Linzin välillä. Hitler myönsi hänelle Saksan korkeimman sotilaskunnan kunnianosoituksen.