Atlanta valitsi ensimmäisenä Patrik Stefanin vuoden 1999 NHL:n pelivuorossa. Hän pelasi seitsemän NHL-kautta, mutta häntä on kutsuttu yhdeksi suurimmista draft-puutteista liigan historiassa. Kaksi vuotta
Stefanin jälkeen Atlantalla oli jälleen ensimmäinen valinta ja he valitsivat Ilya Kovaltshukin. Hänestä tuli Thrashersin kaikkien aikojen johtaja kymmenessä tilastossa. Hän on johtaja maalien, tukien, pisteiden, maalipaalojen, ylityskausien, voittomaalien, pelin voittomaalien ja pelattujen pelien osalta.