Fabi ajoi Benettonin Formulaa Benetton B186-BMW M12 -mallilla sen jälkeen, kun Toleman oli otettu kokonaan haltuunsa ennen vuoden 1986 kauden alkua ja siitä tuli Benetton, jolla oli voimakkaat (kilpailu) moottorit ja lahjakas nuori itävaltalainen Gerhard Berger. Benetton oli nopea, mutta hauras, koska hänellä oli vaikeat Pirellin renkaat, ja Fabi ajoi usein paremmin kuin hän kilpaili. Hän sai paalin Itävallan ja Italian Grand Prix -kilpailuissa.
Hänen paras tuloksensa oli viides Espanjan Grand Prix'ssä. Hänestä tuli tunnettu, että hän oli kilpailukykyinen nopeammilla radilla ja kamppaili hitaammilla, teknisemmillä radilla. Molemmat pole-asemat olivat kahdella vuoden 1986 kalenterin nopeimmalla radalla, Österreichringillä ja Autodromo Nazionale Monzassa. Hän päätti kauden viidennenkymmenentenä pisteissä.