San Andreas Fault aiheutti maanjäristykset vuosina 1906 ja 1989. Pienet maanjäristykset tapahtuvat säännöllisesti. Suurten maanjäristysten uhka on suuri osa kaupungin infrastruktuurin kehitystä. Kaupunki rakensi apuvedenjakelujärjestelmän ja on toistuvasti päivittänyt rakennussääntöjään, mikä edellyttää vanhempia rakennuksia ja korkeampia insinööristandardeja uudelle rakentamiselle. Kuitenkin on yhä tuhansia pienempiä rakennuksia, jotka ovat haavoittuvaisia maanjäristysvaurioille. USGS on julkaissut Kalifornian maanjäristysennusteen mallit, jotka ennustavat maanjäristyksen esiintymistä Kaliforniassa.
lahdesta kaivettu materiaali sekä Yerba Buena -tunnelin kaivamisesta peräisin oleva materiaali