Kirjoita tämän kappaleen jatko - Saksan ja Neuvostoliiton yhteisen Puolan hyökkäyksen jälkeen, joka aloitti toisen maailmansodan syyskuussa 1939, Augustów oli miehitetyt
Neuvostoliitolla vuoteen 1941 asti. Monet asukkaat karkotettiin Kazakstanissa, josta jotkut pystyivät palaamaan 6 vuoden kuluttua. 22. kesäkuuta 1941, juuri ennen kuin saksalaiset valloittivat kaupungin, Neuvostoliitto murhasi noin 30-34 puolalaista vankia Augustówissa osana NKVD-vankien verilöylyjä. Natsi-Saksan joukot miehittivät Augustovin vuoteen 1944 saakka ja käyttivät pakkotyöleiriä kaupungissa. Toisen maailmansodan aikana noin 70% kaupungista tuhoutui, ja suurin osa asukkaista kuoli tai pakeni. Heidän joukossaan oli useita tuhansia juutalaisia, jotka vangittiin kanavan ja joen väliseen gettoon. Saksalaiset teloittivat lähes kaikki ennen lähtöään. Vuonna 1945 Neuvostoliitto järjesti lähellä sijaitsevan Augustówin - erikoisoperaation entisiä Armia Krajowan kommunisminvastaisia taistelijoita vastaan.