6. heinäkuuta 2013 Fernández valittiin edustamaan Marlinsia National League All-Star -joukkueessa. Hän heitti täydellisen kuudennen erän vuoden 2013 All-Star -pelissä.
Hän poisti Dustin Pedroian, sai Miguel Cabreran ulos ja Chris Davisin. Fernández on yksi kolmesta syöttäjästä All-Star -pelin historiassa, jotka ovat lyöneet kaksi lyöjää ennen 21-vuotissyntymäpäiväänsä All-Star -debyyttinsä, muut kaksi ovat Dwight Gooden ja Bob Feller.