Ennen operaatio Reinhardin alkamista, joka merkitsi holokaustin tappavimpaa vaihetta Puolassa, monet juutalaiset kuljetettiin maanteitse tappopaikkoihin, kuten Chełmnon tuhoamisleiriin, jotka olivat varustettuina kaasuautoilla. Vuonna 1942 asennettuja kaasukammioita rakennettiin Treblinkaan, Belzecissa, Sobiborissa, Majdanekissa ja Auschwitzissa. PKP:n natsien vallattua junaliikennettä miehitetyn Puolan sisällä ja sen ulkopuolella
Dehomag seurasi niitä IBM:n toimittamien korttien lukukoneiden ja "Reichsbahnin" perinteisten rahtikirjojen avulla. Holokaustin junaa ohjasivat aina SS-miehet, jotka olivat lähetetty järjestelmän eri puolille.