Ken Hollandin sopimuksen jatkamisen jälkeen - Minnesota Wildin omistaja Craig Leipold ja Tampa Bay Lightningin uusi omistaja Jeffrey Vinik halusivat palkata Yzermanin. Kun Yzerman hylkäsi Minnesotan työn ennen kauden 2009/10 päättymistä, hän hyväksyi Lightningin työn ja nimitettiin joukkueen uudeksi varapresidenttiksi ja pääjohtajaksi 25. toukokuuta 2010. Hän allekirjoitti puolustaja Pavel Kubinan toiselle kaudelleen joukkueessa, allekirjoitti vapaana agenttina maalivahdin Dan Ellisin kahden vuoden sopimukseen, allekirjoitti puolustaja Brett Clarkin ja toi vasemman siiven pelaaja Simon Gagnen vaihtokaupassa, joka näki Matt Walkerin ja neljännen kierroksen valinnan vuonna 2011.
Lähtekää Tampa Baystä. Keskivaiheessa hän vaihtoi myös maalivahdin Dwayne Rolosonin, kun Lightning siirtyi itäisen konferenssin finaaliin vain vuoden kuluttua siitä, kun joukkue ei ollut edes päässyt vuoden 2010 playoffeihin. Yzerman puolestaan oli ehdolla NHL:n Vuoden pääjohtaja -palkinnon saajaksi, mutta hävisi Vancouverin Mike Gillisille.