N2:n muuntaminen ammoniakiksi tapahtuu FeMoco-nimisessä metalliryhmässä, joka on raudan ja molybdeenin kofaktorin lyhenne. Mekanismi etenee protonointi- ja vähennysvaiheiden kautta, joissa FeMoco-aktiivinen sivusto hydrogenoi N2:n substraattia. Vapaassa elävässä diatrophassa nitrogenaasin tuottama ammoniakki assimiloituu glutamiini- glutamiinisynteetaasin / glutamiinisynteetaasin kautta glutamaattiin. Mikrobiologiset geenit, joita tarvitaan nitraatin kiinnittämisessä, jaetaan monissa ympäristöissä, joissa nitraatin kiinnittäminen on monimutkaista.
Anaerobiset olosuhteet