Ymmärrän yhä paremmin, että laivaston uhka muuttuu 2000-luvulla.
Jemenin terrorismin ja syyskuun 11. päivän 2001 hyökkäysten johdosta NCIS muutti terrorismin vastaisen hälytyskeskuksen moniuhka-hälytyskeskukseksi vuonna 2002.