Chandrasekhar syntyi 19. lokakuuta 1910 Lahoressa, Punjabissa, Brittiläisessä Intiassa (nykyinen Pakistan) tamilinkään hindulaisessa perheessä Sitalakshmi (Divan Bahadur) Balakrishnan (1891<unk>1931) ja Chandrasekhara Subrahmanya Ayyar (1885<unk>1960) -suhteessa, jotka olivat sijoittautuneet Lahoreen Pohjois-Länsi-Rautateiden apulaisvalvontajohtajana Chandrasekharin syntymän aikaan. Hänellä oli kaksi vanhempaa siskoa, Rajalakshmi ja Balaparvathi, kolme nuorempaa veljeä, Vishwanathan, Balakrishnan ja Ramanathan ja neljä nuorempaa siskoa, Sarada, Vidya, Savitri ja Sundari.
isänpuoleinen setä