Etelä-Sudan itsenäistyi Sudanista vuonna 2011, mutta Etelä-Sudanin sisällissota teki maalle vaikeaksi saada viisi urheiluliittoa tukeen, jotta sen kansallinen olympiakomitea saisi tunnustuksen Kansainväliseltä olympiakomitealta. Guor Marial, Etelä-Sudanin pakolainen, joka asuu Yhdysvalloissa, kilpaili miesten maratonissa kesäolympialaisissa 2012
, mutta teki sen itsenäisenä olympiaurheilijana, kun hän kieltäytyi osallistumasta Sudanille. Etelä-Sudanista tuli IOC:n 206. jäsen elokuussa 2015, ja sen jäsenmaiksi tuli urheilu, koripallo, jalkapallo, käsipallo, judo, pöytätennis ja taekwondo. Kansakunta valitsi Marialin lippu- ja avaus- ja sulkemisseremonioihin.