Simeone johti Atléticon toiseen Eurooppa-liigan voittoon kolmen vuoden aikana sen perustamisesta lähtien, kun se voitti Athletic Bilbaon 3 - 0 finaalissa 9. toukokuuta 2012 Bukarestin National Arenalla, jossa Radamel Falcao <unk> kaksi kertaa <unk> ja Diego oli maalivahti. Jälleen voittamalla Europa League, he pääsivät UEFA Super Cup 2012
Chelsea, edellisen kauden Mestarien liigan voittaja, joka pelattiin Stade Louis II: ssä, Monaco 31. elokuuta 2012; Atlético voitti 4<unk>1, mukaan lukien Falcaon hat-trick ensimmäisellä puoliajalla. 17. toukokuuta 2013 Atlético voitti Real Madridin 2<unk>1 Copa del Rey -finaalissa jännittävässä ottelussa, jossa molemmat joukkueet päätyivät 10 mieheen. Tämä lopetti 14-vuotisen ja 25-ottelun voitoton sarjan Madridin derbyssä. Vuoden 2012-13 kaudella klubi voitti kolme mestaruutta hieman yli vuodessa.