Sisällissodan aikana hän johti useita merijoukkoja - ja osallistui Gulf Coastin operaatioihin. Hän komensi "Owascoa" ja "Sangamonia", ohitti linnoitukset New Orleansin valloittamiseksi ja taisteli liittoutuneiden patterioiden kanssa Vicksburgin piirityksessä. Hän osallistui myös Galvestonin linnoitusten valloitukseen.
Fort Fisherin valloittaminen Pohjois-Carolinassa.