Thomas Boteler syntyi Bewsey Old Hallissa vuonna 1461. Vuonna 1463 hänen isänsä Sir John FitzJohn le Boteler murhattiin, ja Thomasin vanhempi veli William peri tilan. Vilhelm kuoli 22-vuotiaana taistelemassa Lancastrien riveissä Tewkesburyn taistelussa
Vuonna 1471 Thomas peri perintönsä.