Bonello teki debyyttinsä Maltan maajoukkueessa elokuussa 1979 ystävyyssopimuksessa Tunisiaa vastaan. Hän pelasi yhteensä 29 ottelua eikä tehnyt maalia. Hän on edustanut maataan seitsemässä FIFA-maailmancupin kelpuutusottelussa. Bonello oli maalivahti epäsuotuisassa joulukuussa 1983 tapahtuneessa Euroopan mestaruuskilpailuissa, jossa Malta hävisi Espanjalle.
Espanja pääsi Euro 1984 -kisoihin Alankomaita edeltäen.