Alueella asuu noin 2,5 miljoonaa hyönteislajia, kymmeniä tuhansia kasveja ja noin 2000 lintua ja nisäkkää. Tähän mennessä alueella on tieteellisesti luokiteltu ainakin 40 000 kasvilajia, 2200 kalaa, 1294 lintua, 427 nisäkkää, 428 sammakkoeläintä ja 378 matelijaa. Joka viides kaikista lintulajeista löytyy Amazonin sademetsästä, ja joka viides kalalajeista elää Amazonin jokien ja purojen alueella. Tutkijat ovat kuvailleet 96 660 - 128 843 selkärangattomia lajia pelkästään Brasiliassa. Kasvilajien biologinen monimuotoisuus on maailman korkein, ja vuonna 2001 tehdyssä tutkimuksessa havaittiin, että Ecuadorin sademetsässä on yli 1100 puulajia.
96,660 ja 128,843