Fadrique oli hyvin lähellä katolisia kuninkaita. Hänen isänsä oli taistellut Kastilian perimyssotaa vastaan.
hän oli tulevan kuningatar Isabella I:n puolella hänen veljentyttärensä Juana la Beltraneja vastaan, ja hänen äitinsä oli Juana Enríquez y Fernandez de Cordoban nuorempi sisarpuoli, mikä teki hänestä Ferdinand II Aragonin serkun.