Lyhytaikaiset komplikaatiot ovat kaksikymmentä kertaa vähemmän todennäköisiä vasektomiasta kuin tubal ligation jälkeen. Vasektomian jälkeen voi olla turvotusta ja kipuä kivesoissa, jotka yleensä häviävät yhdessä tai kahdessa viikossa. Tubal ligation yhteydessä komplikaatioita esiintyy 1 - 2 prosentilla menettelyistä, joissa on vakavia komplikaatioita, jotka yleensä johtuvat anestesiasta. Kumpikaan menetelmästä ei suojaa seksuaalisesti tarttuvista infektioista. Tämä päätös voi aiheuttaa katumusta joillakin miehillä ja naisilla. Yli 30-vuotiaista naisista, jotka ovat saaneet tubal ligation, noin 5% katsoo päätöksensä, verrattuna 20%: iin naisista, jotka ovat saaneet tubal ligation.
anestesiaa