5. heinäkuuta 2008 Comotto allekirjoitti sopimuksen Fiorentinalle 4,8 miljoonalla eurolla (mutta se maksoi myös La Violalle ylimääräiset 198 000 euroa muuna palkinnona). Vakava loukkaantuminen poisti Comoton vuoden 2008 Mestarien liigan joukkueesta. Hän teki debyyttinsä 21. syyskuuta 2008 Fiorentina-Bolognan ottelussa, joka päättyi 1: 0. Hän debytoi myös Mestarien liigan ensimmäisessä eräottelussa Sporting Clube de Portugalia vastaan 18. elokuuta 2009 Stadion Jose Alvalade. Hän aloitti oikealla puolustajana kaudella 2008/09 ja 2009/10, mutta menetti paikan Lorenzo De Silvestrille kaudella 2010/11 Serie A: ssa.
Kausi on ohi. Hän aloitti vain 16 kertaa ja valmentaja valitsi hänet uudelleen lokakuussa.