Vuonna 1808 Reynolds muutti, mutta alle vuoden kuluttua sai ensimmäisen komennonsa, Hulkin. Helmikuussa 1811 hänestä tuli komentaja ja hän otti haltuunsa laivan, jolla hän osallistui Javan hyökkäykseen.
Hänet ylennettiin kapteeniksi, kun hän otti HMS Sir Francis Draken. Amiraliteetti vahvisti hänen ylennyksensä vuonna 1812, tunnustuksena hänen isänsä palveluista, joka oli kuollut 1811 jouluaattona. Hän palasi Britanniaan elokuussa 1812 ja pysyi laivassa vuoden ennen kuin hän siirtyi osittain eläkkeelle huonon terveyden vuoksi. Sodan päättymisen jälkeen vuonna 1815 Reynoldsille tarjottiin jatkotoimintaa fregattikapteenina pienennetyllä laivastolla, mutta hänen oli pakko kieltäytyä virasta pitkäaikaisen huonon terveyden vuoksi.