Tutkimuksissa selvitettiin, miksi rakennukset romahtivat ja mitkä paloturvallisuustoimenpiteet olivat käytössä, ja arvioitiin, miten paloturvallisuusjärjestelmiä voitaisiin parantaa tulevassa rakentamisessa. Tutkimus WTC:n 1 ja 2 romahduksesta päättyi lokakuussa 2005 ja WTC 7:n romahduksesta päättyi elokuussa 2008. NIST totesi, että lentokoneiden alkuperäisen iskun aiheutti tulipalon tornien teräsrakenteiden palontorjun ja että jos tämä ei olisi tapahtunut, tornit olisivat todennäköisesti pysyneet pystyssä. Tutkimuksessa, jonka Purdue-yliopiston tutkijat julkaisivat vuonna 2007, todettiin, että lentokoneen iskun oli riistänyt rakennusten tyypillisen teräsrakenteen eristyksestä, ja mitkä paloturvallisuustoimenpiteet olivat käytössä, ja arvioitiin, miten paloturvallisuusjärjestelmiä voitaisiin parantaa tulevassa rakentamisessa. Tutkimuksessa todettiin, että alkuperäisten rakennusten romahdus ei aiheuttanut riittävää vahinkoa, koska tulipalo ei voinut tuoda tulta tukemaan rakennusten yläpuolella olevia teräsrakenteita
portaikot