PGFTU:ta on kritisoinut voimakkaasti sisäpiirin edustajat, kuten Muhammad Al-Arouri, joka johti PGFTU:n lainsäädäntöyksikköä ennen erottamistaan vuonna 2005. GFTU:n johtaja vuonna 1982, Mahmud Ziyada, Al-Arourin ystävä ja ammattiliiton jäsen, joka oli vangittuna yhteensä neljä vuotta ensimmäisen intifadan aikaan Israelin harjoittaman ammattiliittojen tukahduttamisen aikana
<unk> erosi protestoidakseen demokraattisten vaalien puuttumisesta; (Ziyada on nykyään Demokratian ja työntekijöiden oikeuksien keskuksessa). Bassim Khoury Palestiinan itsehallinnosta esitti samankaltaisia huolenaiheita PGFTU:n epäonnistumisesta edustaa työntekijöitä vuosikymmeniä myöhemmin vuonna 2007.