Mary ja Bothwell palasivat 6. toukokuuta Edinburghille ja 15. toukokuuta joko Holyroodin palatsissa tai Holyroodin luostarissa he menivät naimisiin protestanttisten riittien mukaan. Bothwell ja hänen ensimmäinen vaimonsa, Jean Gordon, joka oli Lord Huntlyn sisar, olivat eronneet kaksitoista päivää aikaisemmin. Alun perin Mary uskoi, että monet aateliset tukivat hänen avioliittoaan, mutta niin nopeasti suhteet äskettäin valitun Bothwellin (Orkney'n herttua) ja hänen ikäisensä välillä heikkenivät, ja avioliitto osoittautui syvästi epäsuosituksi.
masentunut