Vuonna 1966 perustettiin SCSA Bamakoon; se hallinnoi koko Afrikan pelejä. Toiset olympialaiset järjestettiin vuonna 1969, mutta sotilaallinen vallankaappaus pakotti olympialaisten peruuttamisen. Nigerian Lagos sai olympialaisten isännöinnin vuonna 1971. Nämä olympialaiset pidettiin lopulta vuonna 1973.
Biafran sodan takia, joka oli juuri päättynyt Nigeriassa.