Kirjoita jatko tähän kappaleeseen - Vuonna 2005/06 Jones aloitti kaikki paitsi yhden Walesin syksyn kansainvälisissä otteluissa (hän ei pelannut peliä vastaan) ja kaikissa 2006 Six Nations -mestaruuskisoissa
Uusi valmentaja Gareth Jenkins valitsi hänet joukkueen kapteeniksi vuoden puolivälissä Argentiinassa järjestettävän kahden testin kiertueen aikana. Lokakuussa 2006 Jenkins nimitti Stephen Jonesin Walesin kapteeniksi vuoden 2007 Rugby World Cup -kisoihin, mutta kun Stephen Jones oli levossa Autumn International -ottelussa Pacific Islandersia vastaan, Duncan Jones palasi Walesin kapteeniksi ensimmäistä kertaa. Hän pelasi alussa tai sijaisena kaikissa neljässä syksyn kansainvälisessä ottelussa ja kaikissa viidessä ottelussa vuoden 2007 kuuden kansakunnan mestaruudessa, mutta hän lepäsi vuoden puolivälin Australian kiertueelle.