Täytä seuraava lause: Calgary ei päässyt playoffeihin kummassakin kaudella, ja vaikka Bouwmeesterin hyökkäys lisääntyi lukitusten lyhentämässä 2012 -13 kaudella, hänellä oli 6 maalia ja 15 pistettä 33 pelissä Calgarylle ja johti jälleen joukkuetta jääajassa. Hän saavutti myös 750 urapeliä ilman, että hän esiintyi playoffeissa. Kun Flames astui jälleenrakennusvaiheeseen, Bouwmeester suostui luopumaan kaupankäynnin kieltämisestä ja hyväksyi kaupankäynnin 1. huhtikuuta 2013. Hänet vaihdettiin St. Louis Bluesille Mark Cundari, Reto Berra ja ensimmäisen kierroksen Draft-valinta vastaan.
Vuosi 2013. Hän kuvaili Calgaryn lähtöä "kukavaksi", ja sanoi kaupungin olevan loistava paikka pelata, mutta toivoi saavuttavansa lopulta playoffit Bluesilla. Hän saavutti tämän tavoitteen, kun Blues sai playoff-paikan kolmannessa viimeisessä kauden pelissä ja Bouwmeesterin uraan 762. Näin hän vältti rikkomasta Olli Jokinenin NHL-ennätystä 799 urapeliä ennen kuin hän teki playoff-debyyttinsä (Jokinen ylitti Ron Hainsey kaksi vuotta myöhemmin).