Vain Fujiwara no Kamatarin vanhimman pojan Fuhiton jälkeläiset saivat käyttää nimeä Fujiwara. Kaikki muut Nakatomi-klanin jäsenet pitivät alkuperäisen sukunimensä, kunnes Nakatomi no Imimaro ylennettiin "chūnagoniksi" Fuhiton tuella. Vuonna 764 Kiyomaro, Imimaron poika, liittyi keisari Kogenin puolelle Fujiwara no Nakamaron kapinan aikana.
Vuonna 769 hänelle myönnettiin Ōnakatomi-nimi, ja näin perustettiin Ōnakatomi-klaani. Heian-kaudella kaikille kolmelle Nakatomi-klaanin lailliselle talolle myönnettiin nimi Ōnakatomi. Nakatomi no Ichishi oli Nakatomi-klaanin viimeinen "jingihaku" (palvontaosaston päällikkö), ja hänen poikansa Itohito otti myöhemmin Ōnakatomi-nimen ja oli siten Nakatomi-klaanin viimeinen jäsen.