Kesäkuussa 1897 Hughes nimitettiin jalkaväen toiseksi luutnanttiksi ja määrättiin 17. jalkaväkirykmenttiin. Elokuussa hänet määrättiin 4. jalkaväkirykmenttiin ja lähetettiin Fort Sheridaniin Illinoisissa. Espanjan-Amerikan sodan aikana Hughes palveli 4. jalkaväkirykmentissä Kuubassa ja haavoittui 1. heinäkuuta 1898 El Caneyn taistelussa.
- Mitä? Toipumisvapaan jälkeen hän palasi Fort Sheridanin palvelukseen. Hughes sai kunniamerkkin sankarillisuudestaan El Caneyssä. Kun armeija perusti hopeatähden vuonna 1918, Hughes'in palkinto muutettiin uudeksi mitaliksi.