Kirkon sulki Saksan armeija 16. syyskuuta 1939.
Ja lähetyssaarna-aukko otettiin Saksan joukkojen ja poliisin varastoon. Rakennus häpäistiin, sen varusteet varastettiin. Perääntyvien saksalaisten joukkojen vetäytyessä kaupungista sytyttivät rakennuksen tuleen 19. tammikuuta 1945, joka kesti kolme päivää. Neuvostoliiton joukot ampuivat tykistökuoria kirkkoon, vahingoittaen pahasti kupolin ja aiheuttaen toisen tulipalon ullakon asuinalueella.