Flores kutsui 10. helmikuuta 1899 kokoukseen Filippiinien tasavallan Cebu-virkamiehiä keskustelemaan sodasta amerikkalaisia voimia vastaan. Clímaco sai tehtäväkseen valmistella sotaa. Kun amerikkalaiset joukot laskeutuivat 21. helmikuuta 1899 Cebuun ja vaativat antautumista, Clímaco antoi tukensa amerikkalaisvastaiselle kapinaan
Arcadio Maxilomin johdolla, - ja matkusti Samariin keräämään aseita. Flores ja Julio Llorente, jonka amerikkalaiset myöhemmin nimittivät ensimmäiseksi kuvernööriksi, suostuivat luovuttamaan maakunnan.