Vuonna 1679 toisinajattelijat murhasivat arkkipiispa Sharpin ja Moray auttoi tukahduttamaan lyhytaikaisen kapinan.
- Mitä? Tämä johti hänen nimitykseensä 17. heinäkuuta 1680 ylimääräiseksi istuntopäälliköksi; kun Lauderdale irtisanottiin pian sen jälkeen, hän nimitti Morayn valtiosihteeriksi hänen tilalleen. James hyväksyi tämän, mutta vaati, että Moray jakaisi aseman ensin Middletonin ja sitten Melfortin kanssa.