Hän kiinnitti erityistä huomiota läheisten lajien maantieteelliseen jakautumiseen etelä-Amerikassa ja sitten Malaijin saaristossa. Kun hän oli saaristossa, hän tunnisti Wallacen linjan, joka kulkee Spice-saarten läpi ja jakaa saariston eläimistön aasialaisen vyöhykkeen ja Uuden-Guinean / Australian vyöhykkeen välillä. Hänen avainkysymyksensä siitä, miksi saarten eläimistöjen kanssa, joilla on tällainen ilmasto, olisi niin erilainen, voitaisiin vastata vain ottamalla huomioon niiden alkuperä. Vuonna 1876 hän kirjoitti The Geographical Distribution of Animals, joka oli vakiotyö yli puolen vuosisadan ajan ja jatko-osa, Life Island, vuonna 1880. Hän keskittyi erityisesti kuuden saaren maantieteelliseen jakautumiseen ensin Etelä-Amerikassa ja sitten Malaijin saaristossa.
Ernst Haeckel