Yksi Lee'n ensimmäisistä suurista kansainvälisistä kilpailuista oli
2009 Talviuniversiade Harbinissa, Kiinassa. Lee voitti kolme kultamitallia lyhytkentällä 1000, 1500 ja 3000 metrin kilpailuissa, ja vain maanmiehen Sung Si-Bak voitti sen Torinon talviuniversiassa vuonna 2007, voittaen kaikki 500, 1000, 1500, 3000 ja 5000 metrin väylät. Huolimatta menestyksistään Lee järkytti monia tarkkailijoita, kun hän ei onnistunut ansaitsemaan paikkaa Etelä-Korean short track -joukkueessa huhtikuussa 2009. Myöhemmin samana vuonna syyskuussa Lee vaihtoi lyhytradasta pitkälle radalle.