Seuraavien taistelujen aikana Tripoli pääsi lopulta sopimaan rauhan ehdoista Yhdysvaltojen kanssa. Tobias Lear neuvotteli toisen "rauhan ja ystävyyden sopimuksen" Pasha Yusufin kanssa 4. kesäkuuta 1805. Monet amerikkalaiset olivat järkyttyneitä siitä, että uudessa sopimuksessa oli mukana 60 000 dollarin (nykyisen dollarin arvoinen) lunnainen, joka maksettiin USS "Philadelphia" -aluksen ja useiden Yhdysvaltain kauppalaivojen vankien vapauttamiseksi. Vuoteen 1807 mennessä Algerissa oli jälleen otettu Yhdysvaltain laivoja ja merimiehiä panttivangeiksi. Vuoden 1812 sodan ja itse sodan esipuheet häiritsivät Yhdysvaltoja vastaamaan provokaatioihin vasta vuonna 1815 toisen Barbary-sodan myötä, jolloin ensimmäinen sota päättyi.
ja toinen Barbary Wars (1800<unk>1815).