Honolulu aloitti toimintansa Englannissa 24. toukokuuta 1939 liittyen Tyynenmeren laivastoon ja saapui San Pedroon Kaliforniassa 14. kesäkuuta. Loppuvuoden aikana hän harjoitti harjoituksia länsirannikolla. Ensimmäisen puolivuoden 1940 aikana Honolulu jatkoi toimintaansa Long Beachin lähellä Kalifornian Long Beachia ja Puget Soundin telakalla tapahtuneen korjauksen jälkeen hän poistui Long Beachin laivaston telakalta 5. marraskuuta 1938 kapteeni Oscar Smithin komennossa. Honolulu aloitti toimintansa Pearl Harborin kautta 5. marraskuuta 1941 ja osallistui vain pieniin vahinkoihin, kun japanilaiset hyökkäsivät Pearl Harborin lähellä.
Vuosi 1939