Seuranta saapui Beaufortiin 15. joulukuuta 1864. Se osallistui hyökkäyksiin Fort Fisheriä vastaan. Ensimmäisessä taistelussa 24.-25. joulukuuta "Canonicus" ankkuroitui etäisyydeltä ja ampui 144 laukausta, komentaja George Belknap väitti, että hän oli purkanut kaksi konfederaation tykkiä. Alus osui neljä kertaa, mutta ei kärsinyt uhreja eikä merkittäviä vahinkoja. 13.-15. tammikuuta 1865 toisen hyökkäyksen aikana
"Canonicus" ampui 279 luotia linnoitukseen, enimmäkseen ensimmäisenä päivänä, jälleen väittäen laskeutuneensa kahdesta aseesta. Häntä vastaan ammuttiin ainakin 38 kertaa, mutta hän sai vain lieviä vaurioita ja kolme miehistön jäsentä haavoittui. Laivan lippu ammuttiin pois kahdesti ja korvattiin joka kerta Daniel D. Stevensilla. Stevens sai myöhemmin kunniamitalin teoistaan.