Mikrobiologinen arviointi on myös suositeltavaa vakavassa keuhkokuumeessa, alkoholismissa, asplenia, immunosuppressiossa, HIV-infektiossa ja alkoholin väärinkäyttössä. Vaikka positiivinen verenviljely ja pleura-nesteviljely lopullisesti vahvistaa diagnoosin mikro-organismin tyypistä, positiivinen sputumviljely on tulkittava huolellisesti hengitysteiden koloniisaation mahdollisuutta varten. Muiden tiettyjen organismien testaaminen voidaan suositella kansanterveyssyistä puhkeamien aikana. Niissä potilaissa, jotka eivät reagoi hoitoon, sputumviljelyä tulisi harkita, ja sekä Mycobacterium tuberculosis -viljelyä suositellaan henkilöillä, joilla on krooninen tuottava yskä. Mikrobiologinen arviointi voidaan myös määrittää joko vaikeassa keuhkokuumeessa, alkoholismissa, asplenia, immunosuppressiossa, HIV-infektiossa ja alkoholin väärinkäyttössä.
Legionella- ja Streptococcus-antigeenit