Kirjoita jatko tähän kappaleeseen - Joan oli sekaantunut Margaretin aviorikokseen
Vuonna 1314 Margareta syytettiin aviorikoksesta kahden ritarin kanssa, kun heidän sisarpuolensa Isabella todisti. Johannan epäiltiin tietäneen salaa aviorikoksesta. Hänet pantiin kotiarestiin Dourdaniin rangaistuksena, ja se viittasi siihen, että Johanna oli syyllistynyt aviorikokseen. Philipin tuella hän jatkoi syyttömyytensä puolustamista, ja vuoteen 1315 mennessä Pariisin parlamentti oli puhdistanut hänen nimensä osittain Philipin vaikutuksen kautta ja hän sai palata hoville. On epäselvää, miksi Filippus seisoi hänen rinnallaan sillä tavalla. Yksi teoria on ollut, että hän oli huolissaan siitä, että jos hän hylkäisi Joanin, hän saattaisi myös menettää Burgundin; toinen teoria ehdottaa, että hänen hieman "formulaariset" rakkauskirjeensä vaimolleen tulisi ottaa nimellisarvoina ja että hän oli itse asiassa hyvin syvästi rakastunut.