Penguins vaihdettiin ensimmäisenä vuoden 2003 valinnaksi.
, jonka avulla he valitsivat maalivahdin Marc-André Fleuryn. Fleury oli kolmas maalivahti, joka valittiin ensimmäisenä Michel Plassén ja Rick DiPietron jälkeen. Pittsburghin ensimmäisen kierroksen valinta, toinen kokonaisuudessaan, vuonna 2004, Evgeni Malkin, oli pingviinien toinen Calder Trophy -voittaja. Penguins voitti toisen ensimmäisen kokonaisvalinnan vuonna 2005 ja valitsi Sidney Crosbyn lempinimellä "Sidney Crosby Sweepstakes".