Wüst aloitti kauden kahdella mestaruudella ja yhdellä toisella sijalla Hollannin kaukokilpailussa 2007. Hän voitti myös vuoden 2007 hollantilaisen Allround-mestaruuden. Vuoden 2007 Euroopan mestaruuskilpailussa Wüst johti mestaruutta kolmen neljästä etäisyydestä, mutta Martina Sáblíková voitti hänet. Seuraavana viikonloppuna hän kilpaili 2007 World Sprint Speed Skating Championshipsissa Hamarissa ja voitti jälleen hopeamitalin. Hänestä tuli maailmanmestari vuoden 2007 maailmanmestaruuskilpailussa.
Heerenveenin kotijoukkueelle. Hän voitti vuoden 2006 ja 2007 MM-kisojen 1500 metrin juoksun voitettuaan kaksi kuudesta kilpailusta sekä 1000 metrin juoksun Calgaryn MM-kisojen finaalissa. Vuoden 2007 maailmankilpailussa hän voitti kultamitalin 1000 metrin juoksussa rikkoen kansallisen ennätyksen ja toisen 1500 metrin juoksussa. Renate Groenewoldin ja Paulien van Deutekomin kanssa hän voitti hopean joukkueen takaa-ajossa Kanadan takana.