Remek opiskeli Gagarinin ilmavoimien akatemiassa 1972-1976. Palattuaan Tšekkoslovakiaan vuonna 1976 Remek ylennettiin kapteeniksi ja nimitettiin hävittäjärykmenttinsä varapuheenjohtajaksi, minkä jälkeen Remek palasi Venäjälle koulutamaan Neuvostoliiton johtamaa avaruusohjelmaa. Palattuaan avaruudesta maaliskuussa 1978 Remek työskenteli Tšekkoslovakian kansanarmeijan (ČSLA) henkilökunnassa lentotutkimuslaitoksen apulaisjohtajana Prahassa. Vuonna 1986 Remekista tuli Čáslavissa sijaitsevan lentotason varapuheenjohtaja. Vuonna 1988 hän valmistui Neuvostoliiton ilmavoimien Voroshilov-staff-akatemiasta ja nimitettiin korkeimpaan komentoonsa Moraviassa sijaitsevan 2. ilmapuolustusdivisioonan apulaisjohtajaksi. Samettivallankumouksen jälkeen
Vuonna 1989 Remek siirtyi Prahan ilmailu- ja avaruustutkimusmuseon johtajaksi. Kun Remek oli lopettanut ilmavoimien palveluksen vuonna 1995, hän edusti Tšekin CZ Strakonice -yritystä ja yhteisyritystä CZ<unk>Turbo-GAZ Moskovassa.