John Mwathiwa oli 29 vuotias olympialaisten aikaan ja oli kolmannella peräkkäisellä ja viimeisellä olympialaisissa. 4. elokuuta hän osallistui maratoniin
Kilpailu järjestettiin ilman kierroksia. Hän ehti pisteeseen 2 tunnissa, 24 minuutissa ja 45 sekunnissa, mikä asetti hänet 65. sijalle 111 kilpailijan joukossa. Kultaisen voitti eteläafrikkalainen Josia Thugwane 2 tunnissa, 12 minuutissa ja 36 sekunnissa, hopean eteläkorealainen juoksija Lee Bong-ju ja pronssin kenialainen Erick Wainaina.