Helmikuussa 1864 Warrenin asukkaat lahjoittivat hänelle miekan, vyön, vyön ja muita varusteita. Petersburgin taistelussa 15. kesäkuuta 1864 hän haavoittui vakavasti ja hänet vietiin Chesapeaken sairaalaan Hamptoniin, Virginiassa. Lokakuussa 1864 hänet ylennettiin everstikseksi ja määrättiin Yhdysvaltain värillisen jalkaväen 37. rykmentin johtoon. Hän otti komennon 10. marraskuuta 1864. Hän liittyi kenraalimajuri Benjamin F. Butlerin retkelle Fort Fisheriä vastaan, osallistuen myös toiseen retkelle.
Alfred H. Terryn johdolla ja taisteli linnakkeen valloituksessa. Hän taisteli kaikissa myöhemmin tapahtuneissa taisteluissa Pohjois-Carolinassa kunnes kenraali Joseph Johnstonin armeija antautui kenraali William T. Shermanille Raleighissä, Pohjois-Carolinassa huhtikuun lopulla 1865.