Brockenbrough otti komennon - kun Field haavoittui toisessa taistelussa.
Chantillyä. Marylandin kampanjan aikana Brockenbrough osallistui Harpers Ferryn valloitukseen ja marssi sitten muiden kevyiden divisioonien kanssa pelastamaan kenraali Robert E. Leen armeijaa Sharpsburgissa; hänen prikaatinsa oli sijoitettu A.P. Hillin linjan kaukana oikealla ja ei nähnyt mitään suoraa toimintaa siellä. Fredericksburgissa hänen prikaatinsa sai käskyn tukkia reikä liittolaisjoukkojen linjassa, jota liittojoukot käyttivät hyväkseen majuri kenraali George G. Meaden johdolla. Brockenbrough menetti prikaatinsa hallinnan ja kaksi hänen rykmenttinsä erosivat hänen kanssaan eivätkä koskaan päässeet taisteluun. Lee ei ilmeisesti ollut vaikuttunut Brockenbrough'n johtajuudesta. Vaikka kuukausia oli kulunut, yksikköä kutsuttiin edelleen Fieldin prikaatiksi ja Brockenbroughia pidettiin edelleen sen väliaikaisena komentajana. Lee ei suositellut Johnia ylennyksiä varten.