Yakutit alunperin asuivat Olkhonin ja Baikal-järven alueella. Alkuen 1300-luvulla he muuttivat keskellä Lena, Aldan ja Vilyuy jokien altaisiin nousevien mongolien painostuksesta. Pohjois-Yakutit olivat suurelta osin metsästäjiä, kalastajia ja poron paimenia, kun taas etelä-Yakutit kasvattivat karjaa ja hevosia. 1620-luvulla Tsardom of Muscovy alkoi siirtyä heidän alueelleen ja liittää tai asettuu siihen alas, asetti verot ja onnistui tukahduttamaan useita tsaristisia kapinoita vuosien 1634 ja 1642 välillä.
Transsiiberian rautatie