Kun Elisabet I tuli kuningattareksi, hän määräsi tutkimaan linnojaan. Vuonna 1562 hänen raportissaan kerrottiin, että vain kymmenen linnaa hänen valtakuntansa pohjoispuolella oli säilyttämisen arvoisia; Melbournen linnan yläpuolella ei ollut yksi näistä. Vuoden 1576 lisätutkimuksessa kerrottiin, että vaikka kivityö oli hyvässä kunnossa lukuun ottamatta yhtä savupiippua ja ikkunaa, puuta oli tuhoutunut, lyijykatto oli täynnä reikiä, yksi keittiö oli romahduksen partaalla ja toinen tarvitsi sen lattian korvaamista. Samana vuonna George Talbot, 6. Earl of Shrewsbury, kirjoitti kuningattarelle vakuuttaakseen hänelle, että linna oli hyvässä kunnossa, arvoltaan £1,000, ja sitä voitaisiin korjata 100 punnalla. Koska hän oli vastuussa vankilassa pidetystä Mariasta, Skotlannin kuningattaresta, ja hänen 140 vankilasta, hän lopulta vakuutti hänelle, että vain kymmenen linnaa Melbournen linnassa oli syytä siirtää. Vuonna 1583, kun kuningattaren asuinpaikka oli Melbournessa
muu rakennus.