Jens Bangsbo on UEFA:n ammattilaisvalmentaja (2014) ja UEFA:n, AFC:n ja FIFA:n valmentaja. Vuosina 1999-2001 hän oli Carlo Ancelottin avustaja Juventusissa. Vuosina 2001-2004 hän oli apulaisvalmentaja menestyksekkäässä Juventus FC: n ensimmäisessä joukkueessa, joka voitti kaksi Italian mestaruutta, kaksi Supercupia ja pelasi Mestarien liigan finaalissa vuonna 2003. Hän valmensi aikanaan pelaajia kuten Zinedine Zidane, Gigi Buffon, Alessandro Del Piero ja Pavel Nedved (kultaisen pallon voittaja vuonna 2003). Hän toimi AEK Ateenan päävalmentajan Lorenzo Serra Ferrerin teknisenä ja taktisena neuvonantajana. Hän on ollut apulaisvalmentaja päävalmentaja Morten Olsenille Tanskan maajoukkueessa vuoteen 2016 saakka sekä EURO 2004:n, MM-kisojen 2010 ja EURO 2012 aikana. 23. tammikuuta 2020 hänet nimitettiin EURO 2020 -turnauksen kuntovalmentajaksi.
- Mitä?