Okafor oli rekrytoitu jo ennen lukio-opintojaan, ja hän oli rekrytointiluokituksen kärjessä useiden vuosien ajan. Hän pelasi lukion koripalloa Chicagossa, Illinoisissa Whitney M. Young Magnet High Schoolissa, jossa hän ansaitsi McDonald'sin, USA Today: n ja Parade-lehden vuoden kansallisen pelaajan palkintoja. Vuoden 2012 FIBA U-17 -maailmancupissa hän voitti turnauksen MVP: n kultamitalin voittaneelle USA: n joukkueelle. Vuonna 2013 Okafor johti Whitney Youngin vuoden 2013 Chicago Public High School League (CPL) kaupungin mestaruuteen. Hän oli All-American juniorina vuonna 2013. Seuraavana kesänä hän oli All-Tournament -joukkueen valinta vuoden 2013 FIBA Under-19 World Cupissa.
USA:n joukkue voitti kultamitalin. Hänen vanhemman kauden jälkeen hän ansaitsi laajan All-American tunnustuksen ja hänet nimettiin vuoden kansalliseksi pelaajaksi muun muassa "Parade", "USA Today" ja McDonald's. Hän allekirjoitti sopimuksen Duke'n kanssa Tyus Jonesin kanssa, ja hänet tunnustettiin laajasti vuoden college-pelaajana.