Goodwin palveli Kansainvälisen laivasto-osaston kanssa Bonin-saarten hyökkäyksissä, Palaun laivasto-operaatioissa ja osallistui Leyte-lahden taisteluun.
Leyte-saarnaajien tukemiseen vuoden 1944 lopulla. Myöhemmin hänet nimitettiin Filippiinien merenrajan ilmaupseeriksi amiraali James L. Kauffmanin alaisuudessa ja hän pysyi komennossa vihollisuuksien loppuun asti. Toisen maailmansodan loppupuolella Goodwinille myönnettiin Legion of Merit with Combat "V". Hänellä oli myös oikeus käyttää kahta merivoimien presidentin yksikköpalkintoa ja merivoimien yksikköpalkintoa.