Kaupunki kukoisti toimimalla yhdyslinkkinä sisämaassa sijaitsevan Gallian ja Rooman tavaroiden ja viinin (jota Massalia vienti vakaasti vuoteen 500 eKr.) välillä sekä Rooman tyydyttämättömän tarpeen uusiin tuotteisiin ja orjiin. Punilaissotien aikana Hannibal ylitti Alpit
Pohjoisessa kaupungissa. Vuonna 123 eaa. Massalia kohtasi Bituituksen johdolla Allobroges- ja Arverni-invaasioita; se solmi liiton Rooman kanssa ja sai Q. Fabius Maximus ja Gn. Domitius Ahenobarbus kukisti gallialaiset Vindaliumin taistelussa vuonna 121 eaa. Vastineeksi siitä, että he antoivat alueensa kautta raidan, jota käytettiin "Via Domitia" -tien rakentamiseen Espanjaan. Kaupunki säilytti näin itsenäisyytensä hieman pidempään, vaikka roomalaiset järjestivät Transalpinen Gallian maakuntansa sen ympärille ja rakensivat siirtokunnan Narbo Martiusissa (Narbonne) vuonna 118 eaa., joka kilpaili myöhemmin taloudellisesti Massalian kanssa.