Hän nousi valtaan "vallankaappauksella", joka syrjäytti Isabel Martínez de Perónin. Vuonna 1985, kaksi vuotta edustavan demokraattisen hallituksen palauttamisen jälkeen, hänet syytettiin laajamittaisista ihmisoikeusrikkomuksista
Hänen hallituskautensa aikana tehtiin lukuisia rikoksia ja rikoksia ihmisyyttä vastaan, mukaan lukien sieppaukset ja pakotetut katoamiset, laajalle levinnyt kidutus ja aktivistien ja poliittisten vastustajien sekä heidän perheidensä oikeuden ulkopuoliset murhat salaisissa keskitysleireissä. Arviolta 13 000 - 30 000 poliittista toisinajattelijaa katosi tänä aikana. Videla tuomittiin myös monien lasten varastamisesta, jotka syntyivät heidän äitinsä vangitsemisen aikana laittomissa säilöönottolaitoksissa, ja heidän luovuttamisesta laittomasti adoptoitaviksi hallinnon yhteistyökumppaneille. Videlan puolustuksessaan hän väitti, että naispuoliset kapinalliset antoivat itselleen tulla raskaaksi uskossa, että heitä ei kidutettaisi tai teloitettaisi. Videla otti vuonna 2010 täyden vastuun armeijan toimista hallintonsa aikana. "Otan vastuun korkeimpana sotilasviranomaisena sisällissodan aikana". "Minun alaiseni tottelivat käskyjäni", hän kertoi argentiinalaiselle tuomioistuimelle. Videla suojeli myös monia natsien pakenevia, kuten Juan Perón ennen häntä, kuten Alfredo Stroessner Paragvaissa ja Hugo Banzer Boliviassa. Hänet tunnettiin joskus nimellä "Pampan Hitler". Hän oli kotiarestissa vuoteen 2008, jolloin hänet lähetettiin sotilasvankilaan.