Sotilaallisten kampanjoiden vaikeudet aiheuttivat Cornwallisille suurta fyysistä vahinkoa, ja hän yritti palata Englantiin. John Shore, hänen tilalleen, saapui vasta maaliskuussa 1793, ja Cornwallis jäi elokuuhun asti auttamaan siirtymävaiheessa. Hän valvoi myös Ranskan etuvartioaseman valloittamista Pondicherryssä.
Euroopassa. 14. elokuuta 1793 hän purjehti hiljaisesti Kalkutasta Madrassiin ilman seremoniaa, ja 10. lokakuuta hän purjehti lopulta Englantiin "Swallow" -aluksella.