Hän sai kuitenkin hopeaa 10 000 metrin juoksussa vuoden 2009 maailmanmestaruuskilpailussa Kenenisa Bekelen jälkeen. Zersenay oli johtanut kilpailua suuressa osassa ja asettanut nopean vauhdin, mutta Bekele voitti hänet kultaan. Tämän jälkeen hän voitti kolmannen Maailman puolimaratoninsa.
Hän voitti maailmanmestaruuden 59:35:llä ja myös hopeamitalin Eritrean joukkueessa. Puolimaratonkilpailussa voittanut kultamitalin teki hänestä toisen juoksijan, joka on voittanut maailmanmestaruusmitalin ylimaalla, raiteilla ja maantiellä samana vuonna, saavutus, jonka aikaisemmin saavutti vain Paul Tergat.