Kylmän sodan aikana yritys oli tunnettu suurnopeuslentokoneista L-29 Delfin ja L-39 Albatros. Se kehitti myös L-39:n, L-59 Super Albatrosin ja L-159 Alcan johdannaisia. Aero Vodochodin uskotaan hoitanneen suurimman ilma-alusten teollisuusohjelman, joka on toteutettu kaikissa COMECON-maissa paitsi Neuvostoliitossa. Kommunistisen hallituksen kaatumisen jälkeen
Aero Vodochody koki vuoden 1989 aikana Tšekkoslovakiassa vaikean liiketoimintajakson, sillä se oli menettänyt suuren osan lentokouluttajiensa markkinoista. Myynti laski huomattavasti 1990-luvulla Itä-Euroopassa sekä Naton maissa rauhandividentin seurauksena.