Kahdeksan vuotta sen jälkeen, kun Ndjissipou oli kilpaillut viimeksi olympialaisissa, hän pääsi kolmanneksi keski-afrikkalaiseen joukkueeseen 31-vuotiaana miesten maratonin kilpailuun.
2004:n Ateenan kesäolympialaisissa, kun hän sai paikan IAAF:n maailmanmestaruuskilpailuihin Pariisissa. Hän pääsi kilpailuun neljännenkymmenenneneljännen sijan aikaan 2:21:23, jäljessä italialaisen juoksijan ja kultamitalistin Stefano Baldinin ja brasilialaisen Vanderlei de Liman (jonka kilpailu oli tarttunut ja työntänyt irlantilainen mielenosoittaja Cornelius Horan) jälkeen arviolta kymmenellä sekunnilla. Ndjissipou oli kolmikertainen olympiavoittaja, ja kansallinen olympiakomitea nimitti hänet (WEB kantamaan Keski-Afrikan lippua avajaisissa.