Isbister pelasi ensimmäisen NHL-pelinsä 1. lokakuuta 1997 Phoenix Coyotesin (aiemmin Winnipeg Jets) puolella Chicago Blackhawksia vastaan. Hänen ensimmäinen NHL-pisteensä oli avustaja, kun Phoenix voitti Colorado Avalanchen 3-2 11. lokakuuta. Hän teki ensimmäisen NHL-maalinsa kymmenen päivää myöhemmin lokakuun 21. päivänä, 4-3 tappiossa Mighty Ducks of Anaheimille. Isbister sai 17 pistettä 66 ottelussa. Coyotesin toisen kauden jälkeen Isbister vaihdettiin New York Islandersille 20. maaliskuuta 1999 kolmannen kierroksen draft-valinnalla (Brian Collins) vuonna 1999.
Robert Reichel, kolmannen kierroksen draft-valinta (Jason Jaspers) vuonna 1999 ja neljännen kierroksen draft-valinta (aiemmin hankittu Ottawalta; Phoenix valitsi Preston Mizzin) vuonna 1999.