Kirjoita jatko tähän kappaleeseen - Morientes jäi yllättäen pois UEFA Euro 2000 -kisoista, mutta pelasi Euro 2004: ssä
Portugalissa, jossa hän teki yhden kahdesta maalista, jotka joukkue onnistui saamaan aikaan ryhmävaiheen lopussa. Hän pelasi myös maajoukkueessa vuoden 2006 MM-kilpailujen varhaiskokeissa. Liverpoolin huonojen joukkueidensa ansiosta Luis Aragonés ei valinnut häntä turnauksen viimeiseen joukkueeseen, vaikka hän oli osa alkuperäistä 31-miehen listaa.