Auditorio suunnittelivat Bay Area -alueen tunnetut arkkitehdit John Galen Howard, Frederick Herman Meyer ja John W. Reid Jr. ja se rakennettiin vuonna 1915 osana Panama-Tyynenmeren kansainvälistä näyttelyä. Auditoriumissa pidettiin vuonna 1920 demokraattisen puolueen kansalliskokous
, San Franciscon oopperaa vuosina 1923-1932 ja uudelleen kaudella 1996, kansalliset AAU-nyrkkeilytutkimukset vuonna 1948, ja se oli National Basketball Associationin San Francisco Warriorsin kotipaikka vuosina 1964-1967. Vuonna 1958 valmistui maanalainen laajennus nimeltään Brooks Hall, joka sijaitsee Civic Center Plazan alla, välittömästi Civic Auditoriumin pohjoispuolella. Kuuluisa Mother of All Demos esiteltiin täällä syksyn 1968 yhteisen tietokonekonferenssin aikana, ja World Cyber Games 2004 pidettiin täällä.