Kirjoita jatko tähän kappaleeseen - Vuonna 2016 Shoji aloitti kauden auttaen Kashima Antlersiä pitämään kaksi puhdasta levyä kauden kahdessa ensimmäisessä liigan ottelussa. Kauden alusta alkaen Shoji jatkoi ensimmäisen joukkueen paikkansa palauttamista pelaamalla keskustaustaustajan asemassa. Vasta 6. huhtikuuta 2016 hän teki kauden ensimmäisen maalinsa voitolla 3-1 Nagoya Grampusia vastaan J.League Cupissa. J.League -turnauksen ensimmäisessä vaiheessa Shojin panos ensimmäiseen joukkueeseen auttoi joukkuetta pääsemään kärkeen. Hänet erotettiin yhdestä ottelusta, mutta hän palasi takaisin lähtöjoukkueeseen, kun Kashima Antlers hävisi Gamba Osakaan vastaan 2 päivänä heinäkuuta 2016. Shoji jatkoi joukkueen auttamista seuraaviin yksitoista otteluun. Vasta 16. syyskuuta 2016 hän teki kauden toisen maalinsa voitolla 3:0 Júbilo Iwataa vastaan. Hän allekirjoitti sopimuksen klubin kanssa. J.League-kisojen toisen vaiheen lopussa Shoji auttoi joukkuetta voittamaan liigan, kun hän pelasi molemmissa otteluissa Urawa Red Diamondsia 2 <unk> 2 aggregatissa vieraita vastaan. Shoji pelasi kaikki neljä MM-kisoja.
, kun hän auttoi Kashima Antlersiä pääsemään finaaliin, mutta hävisi 4-2 Real Madridia vastaan. Vaikka he hävisivät finaalissa, sekä Shojin että Naomichi Uedan keskustapuolustajien yhteistyö sai median ylistyksen sekä Japanissa että sen ulkopuolella. Shoji auttoi myös joukkuetta pääsemään keisarin cupin finaaliin päihittämällä Kawasaki Frontaleen 2<unk>1. Vuoden 2016 kauden lopussa hän teki 45 ottelua ja teki kaksi maalia kaikissa kilpailuissa. Shoji nimitettiin J.League Best XI:ksi vuoden 2016 kaudella.