Vuonna 1810 hän purjehti Etelä-Afrikkaan ja tuli Hyväntoivon niemimaan ylipäälliköksi. Hän johti operaatioita, jotka johtivat Javan valloitukseen.
Kun 8. elokuuta 1811 hollantilainen Batavia antautui brittiläisille Stopfordin ja kenraaliluutnantti Sir Samuel Auchmutyn johdolla. Britannian laivastossa oli noin sata laivaa, joista kahdeksan oli Itä-Intian yhtiön risteilijöitä. Hänet nimitettiin Portsmouthin päälliköksi vuonna 1827.