Maroto kehitti Dominikaanikirkon arkkitehtina maanjäristyksiä kestävän holvin. Tekniikkaa jäljiteltiin vuoden 1687 maanjäristyksen jälkeen.
Monissa monumentaalisissa rakennuksissa, kuten Liman katedraalissa ja Liman San Agustínin luostarin kirkossa. Hänen teoksiaan ovat muun muassa Liman miesten ja naisten luostareiden, seurakuntien ja metropoliittisen katedraalin teokset. Hänen tärkein työnsä oli College of Saint Thomas ("Colegio de Santo Tomás"). Koulun pääluostari on ainoa pyöreä luostari Etelä-Amerikassa.