Täytä seuraava lause: Pian päämajan perustamisen jälkeen operatiivisen turvallisuuden vuoksi nimestä poistettiin "ekspeditionary". Tunisian kampanjan valvonnan jälkeen
Eisenhower poistui päämajasta ja palasi Englantiin vuoden 1943 lopulla komentaakseen joukkoja, jotka kokoontuivat Overlord-operaatioon, joka oli liittolaisten Pohjois-Ranskan maihinnousujen koodinimä. Hänen tilalleen tuli kenttämarsalkka Sir Henry M. Wilson. Wilsonista tuli Keski-Välimeren operaatioiden ylipäällikkö, ja amerikkalaiset joukot tulivat sitten kenraaliluutnantti Jacob L. Deversin johtoon, joka oli ollut kenraalikomentaja ETO: ssa toukokuusta 1943 lähtien. Sellaisena Wilson käytti strategista valvontaa Italian kampanjassa. Hän kannatti voimakkaasti Saksan hyökkäystä Tonavan tasangon kautta (operaation Dragoon, Etelä-Ranskan liittoutuneiden hyökkäyksen koodinimen sijasta), mutta tätä ei tapahtunut, koska liittoutuneiden armeijat Italiassa (AAI) heikkenivät jatkuvasti tukemaan muita sotateattereita. Wilson oli komennossa alle vuoden, kunnes hänet lähetettiin Washingtoniin joulukuussa 1944 Britannian yhteisen päällikön tehtävän johtajana. Wilsonin jälkeen tuli kenttämarsalkka Sir Harold Alexander, joka oli korkein komentaja ja AFHQ: n komentaja sodan loppuun asti.