Eduard Deisenhofer (27. kesäkuuta 1909 - 31. tammikuuta 1945) oli saksalainen komentaja natsimaassa. Hän oli SS:n varhainen jäsen ja palveli Leibstandarte SS Adolf Hitlerin kanssa ja Dachau'n keskitysleirillä 1930-luvulla. Toisen maailmansodan aikana Deisenhofer palveli useissa taisteluliikkeissä sekä itäisellä että läntisellä rintamalla.
Hän ansaitsi Rautaseurakunnan ritarikreisin. Hänellä oli tohtorintutkinto poliittisesta taloustieteestä.