Täytä seuraava lause: Vuonna 1900 Ōkubo ylennettiin kenraaliluutnanttiksi ja sotilaskoulutuksen yleisen tarkastajan päälliköksi. Toukokuussa 1902 hänestä tuli IJA: n 6. jalkaväkidivisioonan komentaja. Venäjän-Japanin sodan aikana IJA:n 6. jalkaväkidivisioona liittyi Japanin 2. armeijaan, mutta sen jälkeen kun IJA:n 6. jalkaväkidivisioona oli lopullisesti eronnut, se muuttui japanilaisiksi.
Shahon taistelu siirrettiin Japanin neljänteen armeijaan ennen Mukdenin taistelua. Sodan jälkeen hän sai nousevan auringon ensimmäisen luokan ja kultaisen leijan toisen luokan ritarikunnan. Heinäkuussa 1906 hänet siirrettiin IJA: n 3. divisioonan komentajaksi ja syyskuussa 1907 hänet ylennettiin "kazoku" -paritukseen "danshaku" (paroni) nimellä.