MacKenzie aloitti junioriuransa pelaamalla kotiseudultaan Sudbury Wolvesissa Ontario Hockey League'ssa (OHL). Toisen kautensa jälkeen, jolloin hän lisäsi pisteytyksensä 20:stä 87:een, Atlanta Thrashers valitsi hänet viidennessä erässä, 128 kokonaisvaltaisesti, vuoden 1999 National Hockey League (NHL) aloitusluonnoksessa.
- Mitä? Viimeisellä kaudellaan hän teki 40 maalia ja 89 pistettä johtaen Wolvesia pisteissä ja päätyessään kuudenneksi OHL:ssä. Hän voitti myös OHL: n ja Canadian Hockey League (CHL) Face-off-palkinnon.