Hänestä tuli USA:n miesten maajoukkueen valmentajan apulainen Bob Bradley. Nowak toimi myös U-23-kansallisjoukkueen päävalmentajana, joka edusti Pekingin 2008 olympialaisiin. Yhdessä Bradleyn kanssa he valmensivat yli 70 pelaajaa ja johtivat USA:n mestaruuskilpailua vuoden 2007 CONCACAF Gold Cup -turnauksessa.
ja Mandelan kuppi. 28. toukokuuta 2009 Nowak erosi virastaan USA:n miesten maajoukkueessa.