Pacinolla on kolme lasta. Vanhin, Julie Marie (s. 1989), on hänen tyttärensä, jonka hän on saanut näyttelijän valmentaja Jan Tarrantin kanssa. Hänellä on myös kaksoset, poika Anton James ja tytär Olivia Rose (s. 25. tammikuuta 2001), näyttelijä Beverly D'Angelon kanssa, jonka kanssa hänellä oli suhde vuodesta 1996 vuoteen 2003. Pacinolla oli suhde Diane Keatonin kanssa. Pacinolla on ollut suhteita Tuesday Weldin, Jill Clayburghin, Marthe Kellerin, Kathleen Quinlanin ja Lyndall Hobbsin kanssa. Pacinolla oli kymmenvuotinen suhde argentiinalaisen näyttelijä Polakin kanssa vuodesta 2008 vuoteen 2018.
Olivia Rose -niminen