Täytä seuraava lause: "Bellerophonille" maksettuaan Warren nimitettiin 44-tykkiselle HMS "President" -alukselle syyskuussa 1810. Hänen tehtävänsä oli kuljettaa Lucien Bonaparte, Napoleonin veli, ja hänen perheensä Maltalta Englantiin, minkä jälkeen hän lähetti vahvistamaan Englannin laivueita Itä-Intiassa. Hän lähti Hyväntoivon satamaan 31. joulukuuta 1810 fregattien ja laivaston kanssa. Käynnin jälkeen Cape, Warren painostettu Itä-Intiaan, ja tuli mukana
Javan valloittaminen elokuun ja syyskuun välisenä aikana 1811. 4. syyskuuta hänet lähetettiin Cireboniin neuvottelemaan kaupungin antautumisesta briteille. Garnisoni suostui antautumaan, ja useat tärkeät ranskalaiset ja hollantilaiset upseerit joutuivat brittiläisten käsiin. Sen jälkeen, kun kenraali Jan Willem Janssens oli luovuttanut saaren brittiläisille 18. syyskuuta, Warren seurasi komentajaa, amiraali Robert Stopfordia takaisin Britanniaan. Hänet nimitettiin 74-kannalliseen ja komensi sitä Välimerellä kesäkuusta 1813 vuoteen 1814.