كتب استمرار لهذه الفقرة - سرعان ما أصبح المعبد مركز مجتمع يهودي صغير ولكنه حيوي، واحد من زعماءه، إبراهيم روبن، أصبح مستشارًا في شركة مدينة كراتشي في عام 1936. بعد تقسيم الهند البريطانية على أسس دينية بين الهندوس والمسلمين في أغسطس 1947 ، سقطت مدينة كراتشي ضمن حدود دولة باكستان الجديدة ذات الأغلبية المسلمة ، وبعد ذلك تم تغيير لوحة الانتماء الأمامية للمعبد ، مع تسميته تحت "جماعة باكستان بني إسرائيل". بعد أقل من سنة ، تم مهاجمة المعبد اليه و حرقها من قبل المتظاهرين المسلمين بعد إعلان استقلال دولة إسرائيل في عام 1948. خلال الفترة دي ، تعرض العديد من اليهود في جميع أنحاء باكستان للهجوم ، مما دفع في النهاية أجزاء من المجتمع للهروب إلى الهند المجاورة. ومع ذلك ، ازدادت تكرار الهجمات على اليهود في باكستان بعد كل من الحروب العربية الإسرائيلية في عام 1948
، 1956، 1967 و 1973. بحلول أوائل السبعينيات ، غادر المجتمع اليهودي الباكستاني إلى حد كبير إلى إسرائيل أو الهند بسبب الخروج اليهودي من الدول الإسلامية ، مما جعل التجمع ساكناً إلى حد كبير. في 17 يوليو 1988 ، تم هدم الكنيس واستبدل في النهاية بمساحة تسوق (ساحة ماديها) في حي Ranchore Line في جنوب كراتشي.