المرحلة الثانية من حملة بورنيو بدأت في 10 يونيو عندما أجرت الفرقة التاسعة هجمات متزامنة على الشمال الغربي في جزيرة لابوان وساحل بروناي. في حين تم تأمين بروناي بسرعة ، الحامية اليابانية في لابوان صمدت لأكثر من أسبوع
. بعد تأمين منطقة خليج بروناي ، هبط اللواء الـ 24 في شمال بورنيو ، و تقدم اللواء الـ 20 على طول الساحل الغربي لبورنيو جنوبًا من بروناي. تقدمت كل من اللواءين بسرعة ضد المقاومة اليابانية الضعيفة ، وتم تحرير معظم شمال غرب بورنيو بحلول نهاية الحرب. خلال الحملة ، ساعدت الفرقة التاسعة من قبل المقاتلين الأصليين الذين كانوا يشنون حرب عصابات ضد القوات اليابانية بدعم من القوات الخاصة الأسترالية.