بحلول القرن الثامن عشر، انخفاض إنتاج الفضة والتنويع الاقتصادي قلل بشكل كبير من الدخل الملكي. رداً على ذلك، سن التاج إصلاحات بوربون، وهي سلسلة من المراسيم التي زادت الضرائب وقسمت نائب الملكية. قوانين جديدة أثارت تمرد توباك عمارو الثاني
و ثورات تانية، كلهم تم قمعهم. نتيجة لهذه التغييرات وغيرها ، وصل الإسبان وخلفاؤهم الكريول إلى احتكار السيطرة على الأرض ، واستولوا على العديد من أفضل الأراضي التي تخلت عنها التخريب الجماعي للسكان الأصليين. ومع ذلك، لم يقاوم الأسبان التوسع البرتغالي للبرازيل عبر خط الطول. معاهدة تورديسيلاس اتخلت من معناها بين 1580 و 1640 بينما سيطرت اسبانيا على البرتغال. أدت الحاجة لتسهيل الاتصالات والتجارة مع إسبانيا إلى تقسيم نائب الملكية وإنشاء نائب ممالك جديدة من غرناطة الجديدة وريو دي لا بلاتا على حساب الأراضي التي شكلت نائب ملكية بيرو. هذا خفض قوة ليما وبرزها وأهميتها كعاصمة نائب الملك ونقل التجارة الأندية المربحة إلى بوينس آيرس وبوجوتا ، في حين أن سقوط إنتاج التعدين والمنسوجات تسارع في التدهور التدريجي لنائب ملكية بيرو.