خلال الحرب العالمية الثانية، عمل كقائد عام في المغرب والقائد العام في شمال أفريقيا الفرنسية. كان نوجيس مرعوب من الأخبار بأن الحكومة الفرنسية كانت بتسعى لوقفة أسلحة
مع ألمانيا. في 17 يونيو 1940 ، ارسل برقية إلى بوردو ، حيث كانت الحكومة موجودة آنذاك: "كل شمال أفريقيا مذعور. القوات بتتوسل على مواصلة الكفاح لو الحكومة ماعندهاش اعتراض. أنا مستعد لأتحمل المسؤولية عن هذا الموقف بكل المخاطر اللي بيترتب عليه، يعني طلب تلميح لمواصلة القتال. ومع ذلك ، لم يوافق على دعوة الجنرال شارل ديغول من لندن في 18 يونيو لمواصلة القتال ، وقال لضابط الاتصال البريطاني إنه يعتقد أن موقف ديغول "غير لائق" وحظر على الصحافة الشمالية الأفريقية نشر نداء ديغول.