عمل دستور اتحاد مالايا بناء على المقترحات الدستورية المعدلة في 1 فبراير 1948 وقرار حزب الشعب الماليزي بإطلاق تمرد مسلح كان علامة بداية النهاية لتحالف بوتيرا-أمججا وأمججا ككل. مع إعلان حالة الطوارئ على مستوى البلاد
، انسحبت المنظمات التأسيسية من الائتلاف ، أو ذهبت تحت الأرض ، أو في حالة MDU ، حلوا نفسها طواعية وتوقفت AMCJA عن الوجود كهيئة.