بعد فترة راحة قصيرة، تم نشر 2/1 في غينيا الجديدة، ووصلوا هناك في سبتمبر 1942 تمامًا مع بدء حملة مسار كوكودا
بدأ يتراجع لصالح الحلفاء. انضمت الكتيبة بعد ذلك إلى مطاردة الحلفاء لليابانيين المتراجعين شمالًا نحو رؤوسهم البحرية حول بوناجونا ، وخلال الهجوم المضاد ، شاركت الكتيبة 2/1 في المعارك الرئيسية في جريان إيورا ثم في غوراري ، تليها ساناناندا بين أكتوبر ونهاية نوفمبر 1942. تعرضت الكتيبة لخسائر فادحة خلال الحملة ، حيث قُتل أكثر من 60 في المئة أو جرحوا أو تم إجلاؤهم مريضين. بعد حملة كوكودا، عاد 2/1 إلى أستراليا لإعادة البناء. في هذا الوقت تلقى دفعة كبيرة من التعزيزات من الكتيبة 49 ، وهي كتيبة ميليشيا التي قاتلت حول ساناناندا قبل أن يتم حلها.