بين 1998 و 2006 كان توماس لوثر في الغالب جزء من المنتخب الألماني الذي يمثل ألمانيا في مختلف البطولات الفريقية الدولية: في الألعاب الأولمبية 1998 في إليستا (المرتبة السادسة) ، 2000 في اسطنبول (المرتبة الثانية) ، 2002
في بليد (المرتبة 14) و 2006 في تورينو (المرتبة 15). كما لعب مع ألمانيا في بطولة العالم للفريق في الشطرنج عام 2001 وبطولة أوروبا للفريق في الشطرنج عام 2003 في بلوفديف.