في 29 يوليو 2015، ظهر سابونيس لأول مرة مع المنتخب الوطني الليتواني للرجال في مباراة ضد أستراليا، حيث سجل 4 نقاط وحصل على 7 ريباونديات. كان سابونيس أصغر لاعب يلعب في المنتخب الوطني على الإطلاق ، فاقد جوناس فالانشيوناس بضعة أيام. سابونيس بمتوسط 6 نقاط و 5.9 ريباوندي خلال مرحلة الألعاب التحضيرية ، وكان ثاني أفضل ريباوندي في الفريق بعد فالانشيوناس. لعب سابونيس مع ليتوانيا في يوروباسكيت 2015 ، وفاز بميدالية فضية في عامه الأول. كان عضواً في المنتخب الوطني الليتواني الأولمبي خلال دورة الألعاب الأولمبية الصيفية لعام 2016.
، حيث بلغ متوسطه 5.5 نقطة و 4.5 ريباوند.