في ربيع سنة 1862، قوات بانكس واجهت قوات الكونفدرالية للجنرال توماس جاكسون في سلسلة معارك معروفة باسم حملة وادي جاكسون. في مايو 1862، خلف أندروز الكولونيل جورج هنري غوردون كقائد لماساتشوستس الثانية وقاد الفوج خلال معركة وينشستر الأولى
. في 13 يونيو 1862، تمت ترقية أندروز إلى رتبة كولونيل.