اكتب استمرار لهذه الفقرة - كان كوفاليوف ناقد صريح للميول الاستبدادية في إدارات بوريس يلتسين وفلاديمير بوتين. في عام 1996 ، استقال من منصب رئيس لجنة حقوق الإنسان الرئاسية ليلتسين ، بعد أن نشر رسالة مفتوحة إلى يلتسين ، حيث اتهم كوفاليوف الرئيس بالتخلي عن المبادئ الديمقراطية. في سنة 2002، نظم لجنة عامة للتحقيق في تفجيرات شقق موسكو سنة 1999
(لجنة كوفاليوف) ، والتي شلّت فعليًا بعد مقتل واحد من أعضائها، سيرجي يوشينكوف، وعضو آخر، يوري ششيكوتشين، زُعم أنه مسموم بالثاليوم، ومحاميها القانوني والمحقق، ميخائيل تريباشكين، اعتقلوا.