أكمل الجملة التالية: لما بدأت الحرب الأهلية الأمريكية في عام 1861 تطوع جونز للخدمة في جيش الاتحاد. في 3 أكتوبر تم انتخابه كابتن في فوج المشاة الـ 53 في أوهايو ، وشهد العمل على هذا النحو خلال معركة شيلوه وحصار كورينثوس. في 2 مايو 1862 ، أصبح جونز عقيدًا لفرقة أوهايو 53 وقائدًا لها. قاد فوجه خلال حصار فيكسبرج وفي معركة ميسيونري ريدج ، كلاهما في عام 1863. جونز شهد المزيد من العمل خلال حملة أتلانتا عام 1864 ، حيث قاتل في ريساكا ، دالاس ، كينيسو ماونتن و
اتلانتا. في أغسطس ، تم تعيين جونز في قيادة اللواء عندما أصيب ضابطه الأعلى ، العميد جوزيف إيه جيه لايتبورن ، وتخلى عن القيادة لبقية الحرب. القي الكولونيل جونز الآن اللواء الثاني في فرقة ويليام بي هيزن الثانية من الفيلق الخامس عشر في جونزبورو. بالصدفة، كان اللواء الأول من تلك الفرقة بقيادة "عقيد جونز" آخر، ثيودور جونز من فرقة أوهايو الثلاثين. شارك ويلز جونز في مسيرة 1864 إلى البحر ، وأصيب أثناء العمليات حول فورت ماكاليستر ، جورجيا ، في 13 ديسمبر.