في عام 1940 ، قبل فريدمان منصبًا في جامعة ويسكونسن في ماديسون ، لكنه غادر بسبب الخلافات مع أعضاء هيئة التدريس فيما يتعلق بمشاركة الولايات المتحدة في الحرب العالمية الثانية. اعتقد فريدمان أن الولايات المتحدة يجب أن تدخل الحرب. في عام 1943 ، انضم فريدمان إلى قسم أبحاث الحرب في جامعة كولومبيا (برئاسة و. ألين واليس وهارولد هوتيلنج) ، حيث أمضى بقية الحرب العالمية الثانية في العمل كإحصائي رياضي ، مع التركيز على مشاكل تصميم الأسلحة والتكتيكات العسكرية والتجارب المعدنية. في عام 1945 ، قدم فريدمان دخلات من الممارسة المهنية المستقلة (المؤلفة بالتعاون مع كوزنيتز والتي اكتملت خلال عام 1940) إلى كولومبيا كأطروحة الدكتوراه. منحت له الجامعة درجة الدكتوراه في عام 1946. قضى فريدمان العام الأكاديمي 1945-1946 في جامعة مينيسوتا (حيث كان صديقه جورج ستيغلر
سنة 1945