بين 1998 و 2006 كان توماس لوثر في الغالب جزء من المنتخب الألماني الذي يمثل ألمانيا في مختلف البطولات الفريقية الدولية: في الألعاب الأولمبية 1998 في إيليستا (المرتبة السادسة) ، 2000
في اسطنبول (المرتبة التانية) ، في 2002 في بليد (المرتبة الرابعة عشر) وفي 2006 في تورينو (المرتبة الخامسة عشر). كما لعب مع ألمانيا في بطولة العالم للفريق في الشطرنج عام 2001 وبطولة أوروبا للفريق في الشطرنج عام 2003 في بلوفديف.