بين 1998 و 2006 كان توماس لوثر في الغالب جزء من المنتخب الألماني بتمثل ألمانيا في مختلف البطولات الدولية للفريق: في الأولمبياد 1998
في إليستا (المرتبة السادسة) ، 2000 في اسطنبول (المرتبة التانية) ، 2002 في بليد (المرتبة الرابعة عشر) و 2006 في تورينو (المرتبة الخامسة عشر). كما لعب مع ألمانيا في بطولة العالم للفريق في الشطرنج عام 2001 وبطولة أوروبا للفريق في الشطرنج عام 2003 في بلوفديف.