اكتب استمرار لهذه الفقرة - في عام 2001، بعد اندلاع الحرب الشيشانية الثانية، انضم خانغوشفيلي للمقاومة المسلحة لجمهورية إيشكريا الشيشانية في قتالها ضد روسيا. كان خانغوشفيلي قائد ميداني وكان له علاقات وثيقة بالرئيس الشيشاني السابق اسلان ماسخادوف. قتل ماسخادوف في مارس 2005 في مداهمة من قبل جهاز الاستخبارات الفدرالي الروسي، وكالة الاستخبارات الداخلية الروسية. وفقًا لأخ خانغوشفيلي، زوراب، شارك زيلمخان في هجوم يونيو 2004
على قوات الأمن والجيش والشرطة في جمهوريات إنغوشيا و داغستان الروسية ، واللي قتل فيها 88 من مسؤولي الشرطة والمدنيين ؛ زيلمخان جرحت في الساق خلال العملية. الرئيس الروسي فلاديمير بوتين ادعى انه واحد من مرتكبي تفجير مترو موسكو. ومع ذلك ، نفى زيلمخان نفسه أنه كان مسؤولًا عن جرائم الحرب ، وقال لوسائل الإعلام الجورجية ، "الروس يلومونني على أشياء كثيرة ، بما في ذلك الهجمات الإرهابية. ده كذب. ما في احد يقدر يقدم اي دليل على ان واحد من المدنيين جرح او مات في اي من اعمالي!".