كتب استمرار لهذه الفقرة - كمبعوث للحكومة العسكرية، قاد حملة باراغواي المشؤومة. قواته هزمهم بيرناردو دي فيلاسكو في معارك كامبيشويلو وباراغاري
. رغم انه هزم ، إلا أن الحملة بدأت سلسلة الأحداث التي أدت إلى استقلال باراغواي في مايو 1811. تراجع إلى محيط روزاريو ، لتعزيزها ضد هجوم ملكي محتمل من الفرقة الشرقية لنهر أوروغواي. في الوقت اللي كان فيه هناك، صنع علم الأرجنتين. لم يوافق الثلاثي الأول على العلم ، ولكن بسبب الاتصالات البطيئة ، لم يسمع بيلغرانو عن ذلك إلا بعد أسابيع عديدة ، أثناء تعزيز جيش الشمال في جوجوي. هناك ، مع العلم أنه كان في وضع غير مواتٍ استراتيجي ضد الجيوش الملكية القادمة من بيرو العليا ، أمر بيلغرانو بمغادرة جوجوي ، والتي أخلت جميع سكان مقاطعة جوجوي إلى سان ميغيل دي توكومان. أدى هجومه المضاد في معركة توكومان إلى انتصار استراتيجي رئيسي، وسرعان ما تبعه انتصار كامل على جيش بيو تريستان الملكي في معركة سالتا. ومع ذلك ، أدت مداهماته العميقة في بيرو العليا إلى هزائم في فيلكابوجيو وأيوهوما ، مما أدى إلى قيادة الثلاثية الثانية لإصدار أمر باستبداله كقائد لجيش الشمال بواسطة خوسيه دي سان مارتين الذي وصل حديثًا. بحلول ذلك الوقت، وافق مجلس السنة الثالث عشر على استخدام علم بيلجرانو كعلم حرب وطني.