وُلِدَت مارجريت في قلعة فارلي هانجرفورد في سومرسيت، وهي البنت الوحيدة الناجية لجورج بلانتاجينيت، دوق كلارنس الأول، وزوجته إيزابيل نيفيل، والتي كانت البنت الكبرى لريتشارد نيفيل، إيرل وارويك السادس عشر، وزوجته آن دي بوشامب، كونتيسة وارويك السادس عشر. مات جدها من جهة أمها وهو يقاتل ضد عمها إدوارد الرابع في معركة بارنيت
. والدها ، دوق كلارنس ، اتحدد بعد ذلك إيرل سالزبوري و وارويك. أعلن إدوارد الرابع أن إدوارد شقيق مارجريت الأصغر يجب أن يعرف باسم إيرل وارويك كلقب مهذب ، لكن لم يتم إنشاء أي شرافت له. مارجريت كانت ليها مطالبة بكونها إيرلدو وارويك، لكن الإيرلدو تم مصادرته على إنجاز أخيها إدوارد.