عادت إلى نورفولك لإصلاحات في 1 يناير 1847 ، ثم وصلت إلى فيراكروز في 21 مارس 1847 ، حاملة بيري لتولي قيادة الأسطول الأمريكي. على الفور هي ورجالها غاصوا في
عمليات برمائية ضد فيراكروز، بتزويد الأسلحة وطواقمها ليتم نقلها على الشاطئ للبطارية اللي حاربت المدينة لتستسلم في أربعة أيام. خلال ما تبقى من الحرب ، ساهمت "ميسيسيبي" بالأسلحة والرجال والقوارب في سلسلة من الغارات الساحلية على الساحل الشرقي للمكسيك ، حيث شاركت في الاستيلاء على تاباسكو في يونيو 1847.