أكمل الجملة التالية: في عام 1861، ساعد هوكينز في رفع فرقة مشاة نيويورك التاسعة، وهي فوج على غرار الزواف، والمعروف باسم "هوكينز زواف" للخدمة في الحرب الأهلية. تم تعيين هوكينز كولونيل في الفوج في 4 مايو 1861 وخدم مع تمييز في كارولينا الشمالية في وقت مبكر من الحرب. كان جزء من بعثة بنجامين إف بتلر
احتلال حصن هاتيراس سنة 1861. متوقعًا أن يحصل على ترقية إلى اللواء لخدماته في فورت هاتيراس ، تم إعفائه بدلاً من القيادة لعدم الطاعة. في 8 أكتوبر 1861 ، كتب هوكينز مستاء "إن جنرالات اللواء مصنوعين من أشياء غريبة في الوقت الحاضر ، بحيث لا يجب أن أعتبرها شرفًا كبيرًا أن أكون واحدًا". حصل هوكينز في الواقع على ترقية برافت إلى جنرال في عام 1866 ليحصل على رتبة من 13 مارس 1865. على الرغم من عداوته ، إلا أن إرسال هوكينز المبكر لفت انتباه الرئيس آبراهام لينكولن. تمت دعوة هوكينز إلى البيت الأبيض للتشاور مع الرئيس والقائد العام جورج بي ماكليلان. هناك كان له دور فعال في إقناع القيادة العليا للاتحاد بإمكانية عملية مشتركة ضد Pamlico Sound في كارولينا الشمالية.