واصلوا الحرب البحرية، مع الحفاظ المملكة المتحدة على حصار فرنسا عن طريق البحر. انضمت روسيا ، بروسيا ، الدنمارك ، والسويد غير المقاتلات لحماية الشحن المحايد من الهجمات البريطانية ، لكنها لم تنجح. قام الأميرال البريطاني هوراشيو نيلسون بمهاجمة الأسطول الدنماركي في الميناء في معركة كوبنهاغن، ودمّر الكثير من أسطول أحد حلفاء فرنسا الأكثر ثباتاً خلال الفترة. منعته هدنة من الاستمرار في بحر البلطيق لمهاجمة الأسطول الروسي في ريفال (تالين). في الوقت نفسه ، قبالة جبل طارق ، طوافة فرنسية أقل عدداً تحت قيادة لينوا ردت هجوم بريطاني الأول تحت قيادة سوماريز في معركة الجزيرة الأولى
، بتقبض على سفينة خط المعركة. في معركة الجزيرة الثانية ، بعد أربعة أيام ، استولى البريطانيون على سفينة فرنسية وأغرقوا سفينتين إسبانيتين ، مما أسفر عن مقتل حوالي 2000 من البحارة الإسبان في الغالب مقابل خسارة 12 بريطاني.