Ko da yake an haife shi a cikin dangin Anglican, ta hanyar shekaru talatin Newton ya riƙe bangaskiyar Kirista wanda, idan an yi shi a fili, ba za a yi la'akari da al'ada ta Krista na yau da kullum ba; a cikin 'yan kwanakin nan an bayyana shi a matsayin mai tsattsauran ra'ayi. A shekara ta 1672 ya fara rubuta bincikensa na tauhidin a cikin littattafan rubutu wanda bai nuna wa kowa ba kuma wanda aka bincika kwanan nan. Sun nuna cikakken ilimin rubuce-rubucen Ikilisiya na farko kuma sun nuna cewa a cikin rikici tsakanin Athanasius da Arius wanda ya bayyana Creed, ya ɗauki gefen Arius, mai hasara, wanda ya ƙi ra'ayi na al'ada na Triniti. Newton "ya gane Kristi a matsayin matsakanci na Allah tsakanin Allah da mutum, wanda ya kasance a ƙarƙashin Uba wanda ya halicce shi". Ya kasance mai sha'awar annabci, amma a gare shi, "Kiristoci sun yi ridda da Kristi".
ya kasance mai ridda