O 1 de febreiro de 1944, o "Fusō" partiu de Truk co "Nagato" para evitar un ataque aéreo estadounidense, e chegou a Palau o 4 de febreiro. Partiron o 16 de febreiro para escapar a outro ataque aéreo. Os barcos chegaron o 21 de febreiro á illa de Lingga, e o "Fusō" foi empregado alí como barco de adestramento. Unha semana despois, o capitán Masami Ban relevouse de Tsuruoka. O buque foi remodelado en Singapur entre o 13 e o 27 de abril, e volveu a Lingga. Foi trasladado a Tawi-Tawi o 11 de maio e proporcionou cobertura ao convoi que non puido reforzar a illa de Biak.
ao final do mes. O "Fusō" trasladouse á illa de Tarakan ao largo de Borneo para reabastecerse de combustible a principios de xullo antes de volver a Xapón e escapar dun ataque do submarino. A principios de agosto en Kure, foi reequipado con radares adicionais e armas lixeiras AA. O Fusō e a súa nave irmá foron transferidos á División de Navíos de Guerra 2 da 2a Frota o 10 de setembro, e o Fusō converteuse no buque insignia da división baixo o mando do vicealmirante Shōji Nishimura o 23 de setembro. Partiron de Kure o 23 de setembro para Lingga, escapando dun ataque do submarino o día seguinte, e chegaron o 4 de outubro, onde Nishimura transferiu a súa bandeira a "Yamashiro". Os buques foron trasladados a Brunei para reabastecerse de combustible en preparación para a operación "Shō-Gō", o intento de destruír a frota estadounidense que levaba a cabo a invasión de Leyte.