Os antibióticos non adoitan ser usados para a gastroenterite, aínda que ás veces son recomendados se os síntomas son particularmente graves ou se se sospeita que hai unha causa bacteriana susceptible. Se se empregan antibióticos, un macrolido (como a azitromicina) é preferible a unha fluoroquinolona debido a maiores taxas de resistencia a este último. A colite pseudomembranosa, xeralmente causada polo uso de antibióticos, é controlada interrompendo o axente causal e tratándoo con metronidazol ou vancomicina. As bacterias e protozoos que son susceptibles ao tratamento inclúen a Salmonella Shigella typhi, e as especies de Giardia.
Colite pseudomembranosa