A ala de bombardeiros de mergullo apoiou o Afrika Korps do "Generalfeldmarschall" Erwin Rommel na súa campaña de dous anos no norte de África; a súa outra tarefa principal era atacar o transporte aliado. En 1941, as operacións de Ju 87 no norte de África foron dominadas polo asedio de Tobruk, que durou máis de sete meses. Serviu durante a Batalla de Gazala e a Primeira Batalla de El Alamein, así como a decisiva Segunda Batalla de El Alamein, que levou a Rommel de volta a Túnez. Cando a marea cambiou e o poder aéreo aliado creceu no outono de 1942, o Ju 87 converteuse moi vulnerable e as perdas foron pesadas. A entrada dos americanos no norte de África durante a Operación Torch
O Stuka era obsoleto no que era agora unha guerra de caza-bombardeiro. O Bf 109 e o Fw 190 podían polo menos loitar contra os cazas inimigos en igualdade de condicións despois de deixar caer a súa munición, pero o Stuka non podía. A vulnerabilidade do Ju 87 foi demostrada o 11 de novembro de 1942, cando 15 Ju 87D foron derrubados por Curtiss P-40Fs das Forzas Aéreas do Exército dos Estados Unidos (USAAF) en minutos. (Segundo Ring/Shores había 15 Ju 87 na misión, 2.SAAF Sqn. derrubou 8 con 4 probables e 3 derrubados por 57.Fighter Group. Dous sudafricanos e un estadounidense foron derrubados por un caza alemán de escolta. Tres tripulantes de Stuka foron capturados, 1 foi ferido, ningún morto.