A Comisión Internacional de Estonia para a Investigación de Crímenes contra a Humanidade foi establecida polo presidente Lennart Meri, que foi un sobrevivente da deportación de 1941
, en outubro de 1998 para investigar crimes contra a humanidade cometidos en Estonia ou contra cidadáns estonios durante a ocupación soviética e nazi. A comisión celebrou a súa primeira sesión en Tallin en xaneiro de 1999. O diplomático finlandés Max Jakobson foi nomeado presidente da comisión. Por motivos de neutralidade, non hai cidadáns estonios entre os seus membros.