O 26 de xaneiro de 2016, Falwell anunciou o seu aval a Donald Trump para a candidatura republicana nas eleccións presidenciais de 2016, causando que algúns ex-alumnos da Universidade Liberty e outros evangélicos expresasen a súa preocupación de que Falwell "vendera a súa alma". Foi revelado máis tarde, nunha conversa gravada en segredo co comediante Tom Arnold que o avogado persoal de Trump e "fixador" Michael Cohen, axudou a Falwell a recuperar fotos comprometedoras antes de asegurar o seu respaldo. O 21 de xullo de 2016, na convención RNC en Cleveland, Ohio
Falwell Jr. chamou a Trump de "o billonario de colar azul de Estados Unidos" e "un dos maiores visionarios do noso tempo" no seu respaldo ao candidato que sentía máis propenso a defender o "dereito a portar armas", "deter o Irán... de converterse nunha potencia nuclear" e "nomear xuíces conservadores a favor da vida para o Tribunal Supremo".