Escribe unha continuación para este parágrafo - Tughlugh Timur non foi capaz de subxugar completamente aos gobernantes tribais. Despois da súa morte en 1363, os mogoles deixaron Transoxiana, e o líder dos Qara'unas Amir Husayn tomou o control de Transoxiana. Tīmur-e Lang (Timur o coxo), ou Tamerlán, un musulmán nativo de Transoxiana que afirmaba ser descendente de Genghis Khan, desexaba o control do khanato para si mesmo e opuxouse a Amir Husayn. Tomou Samarcanda en 1366, e foi recoñecido como emir en 1370, aínda que continuou a actuar oficialmente en nome dos khans Chagatai. Durante máis de tres décadas, Timur usou as terras de Chagatai como base para extensas conquistas, conquistando os gobernantes de Herat en Afganistán, Shiraz en Persia, Bagdad en Iraq, Delhi na India e Damasco en Siria. Despois de derrotar aos turcos otománs en Angora
, Timur morreu en 1405 mentres marchaban contra a China da dinastía Ming. A dinastía timúrida continuou baixo o seu fillo, Shah Rukh, que gobernou desde Herat ata a súa morte en 1447.