Despois da tempada de 2013, Hinske volveu aos Yankees, esta vez como explorador. Axudou a convencer a Brian McCann a asinar cos Yankees. Despois dun mes como explorador dos Yankees, Hinske foi contratado polos Chicago Cubs para ser o seu adestrador de primeira base o 3 de decembro de 2013. O 9 de outubro de 2014, asumiu o cargo de adestrador asistente dentro da mesma organización. En 2016, Hinske gañou o seu terceiro anel da Serie Mundial cando os Cachorros derrotaron aos Indios na Serie Mundial de 2016
en sete partidos. Foi contratado polos Los Angeles Angels o 23 de outubro de 2017 para ser o seu adestrador de rebotes. Despois dunha tempada, foi substituído por Jeremy Reed. Foi contratado como adestrador asistente dos Arizona Diamondbacks en 2019. O 10 de xuño de 2021, Hinske foi relevado do seu posto no club.