O 9 de agosto de 2016, Farnerud regresou ao seu país natal, asinando un contrato a longo prazo co BK Häcken e reincorporándose ao seu amigo de infancia Rasmus Lindgren no seu novo club. Xogou 11 partidos e marcou tres goles na súa campaña de debut.
, e fixo oito asistencias durante o seu período antes de sufrir unha lesión grave no xeonllo nun partido contra o IK Sirius o 22 de xullo de 2017; debido ás súas enfermidades físicas recorrentes, elixiu saír de mutuo acordo en novembro.