Naceu en Manchester e foi adoptada por Constance e John William Winterson o 21 de xaneiro de 1960. Creceu en Accrington, Lancashire, e foi criada na Igrexa Pentecostal Elim. Foi criada para converterse nunha misionera cristiá pentecostal, e comezou a evangelizar e escribir sermóns aos seis anos. Aos 16 anos, Winterson saíu como lesbiana e deixou a casa.
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