Escribir unha continuación para este parágrafo - Gudin foi dado o mando da 3a División da Grande Armée e loitou nas guerras da Terceira Coalición e a Cuarta Coalición entre 1805 e 1807. A súa 3a División do III Cuerpo foi a primeira formación importante en acción na batalla de Auerstädt e soportou o principal peso dos combates. Sufriu un 40 por cento de baixas, unha das cales foi Gudin, que foi ferido gravemente. Participou na rendición da cidade de Custrin e xogou un papel importante nas batallas de Pultusk e Eylau. Conde do Primeiro Imperio Francés en 1808, foi nomeado gobernador do castelo de Fontainebleau ao ano seguinte. Participou en varias batallas da Quinta Coalición: Thann, Landshut
Eckmühl, a toma de Ratisbona. Foi ferido na gran batalla de Wagram. En 1812 recibiu o mando dunha división da segunda Grande Armée. Foi ferido por unha bala de canón durante a batalla de Valutino, loitando contra as tropas rusas preto de Smolensk en Rusia. A súa perna foi amputada pero desenvolveu gangrena e morreu tres días despois da batalla. Con todo, o seu corazón foi sacado para ser enterrado nunha capela no cemiterio de Père Lachaise, París.