Con unha gran parte das forzas do Imperio francés agora enredadas na sangrienta Guerra Peninsular, o Imperio austríaco creu que a súa mellor oportunidade para vingar a humillante derrota de 1805 finalmente chegou. Os austríacos buscaban derrotar a Francia e recuperar a súa antiga influencia en Italia e Alemaña. A principios de 1809, os preparativos de guerra austríacos eran tan intensos que Napoleón viuse obrigado a deixar España e volver a París para reorganizar o seu exército principal en Alemaña. Na primavera, Nansouty foi chamado ao mando da 1a das tres divisións de cabalería pesada da Reserva de Cabalería, esta vez baixo o mando do marechal Jean-Baptiste Bessières. Cando estalou a Guerra da Quinta Coalición, a división de Nansouty pronto foi separada da Reserva e temporalmente unida ao III Cuerpo do Mariscal Louis Nicolas Davout, a forza á que se lle asignaron as tarefas máis difíciles durante as primeiras operacións militares desta guerra. Como Napoleón ordenou a concentración do exército en Ratisbona, a división de Nansouty foi unha vez máis colocada baixo o mando de Bessières e enviada a servir co exército bávaro. Despois das súas vitorias iniciais en Abensberg e Landshut
Napoleón concentrou a maior parte do seu exército, incluídos os homes de Nansouty, en Eckmühl, onde Davout agardaba.