Co estallido da Segunda Guerra Mundial o 1 de setembro de 1939, a área foi escenario da Batalla de Bzura e algúns combates ocorreron nas proximidades de Głowno. A cidade foi invadida pola Wehrmacht alemá durante a segunda semana de setembro. A administración alemá nazi foi establecida e Głowno converteuse en parte da unidade administrativa alemá coñecida como Goberno Xeral. Durante a ocupación
Numerosos actos de resistencia polaca, Armia Krajowa etc., ocorreron en Głowno, incluíndo a execución clandestina dun sacerdote católico que traballaba como informante para a policía nazi. As represalias nazis cobraron a vida de moitos cidadáns, incluídos os asasinados en execucións masivas no cemiterio da cidade e dentro da sede da policía alemá da cidade e tamén na infame prisión Pawiak de Varsovia ocupada polos nazis. Moitos cidadáns foron forzados a traballar como escravos para os alemáns e algúns foron enviados a varias fábricas e granxas en toda Alemaña.