A finais de 1594, certos membros da Liga aínda traballaban contra Henrique en todo o país, pero todos dependían do apoio de España. En xaneiro de 1595, o rei declarou a guerra a España para mostrar aos católicos que España estaba a usar a relixión como cobertura para un ataque ao estado francés<unk> e para mostrar aos protestantes que a súa conversión non o converteu nunha marioneta de España. Tamén esperaba recuperar grandes partes do norte de Francia das forzas católicas franco-española. O conflito consistiu principalmente en accións militares dirixidas aos membros da Liga, como a Batalla de Fontaine-Française, aínda que os españois lanzaron unha ofensiva concertada en 1595, tomando Le Catelet, Doullens e Cambrai (este último despois dun feroz bombardeo), e na primavera de 1596 capturando Calais en abril. Tras a captura española de Amiens en marzo de 1597, a coroa francesa asediou
ata a súa rendición en setembro. Con esa vitoria, as preocupacións de Henrique volvéronse á situación en Bretaña, onde promulgou o Edicto de Nantes e enviou a Bellièvre e Brulart de Sillery para negociar unha paz con España. A guerra chegou a un final oficial despois do Edicto de Nantes, coa Paz de Vervins en maio de 1598.