Para o 2016 foi contratado polo mesmo equipo como piloto de tempo completo na mesma clase. Na sexta carreira da tempada, en Mugello, Di Giannantonio logrou os seus primeiros puntos de campionato e o seu primeiro podio cun segundo lugar, comezando unha racha de dez primeiros lugares, incluíndo dous podios máis, outro segundo lugar en Assen
e un terceiro lugar en Brno.