O 18 de xaneiro de 2016 anunciouse que Safari volvería ao Malmö FF cando o seu contrato co FC Basilea expirase ao final da tempada 2015/16. Safari asinou un contrato con Malmö que se estende durante a tempada 2020 e lle permite unirse ao equipo a medio camiño da tempada 2016
- Non. Marcou un gol na Allsvenskan o 11 de abril de 2017 contra GIF Sundsvall e foi nomeado vicecapitán despois de Markus Rosenberg. Gañou o seu décimo título de liga despois de gañar o Allsvenskan de 2017, facendo de Zlatan Ibrahimović o único sueco con máis títulos de liga. Safari converteuse nun titular regular para o MFF cando se clasificaron para a UEFA Europa League 2018-19 o 30 de agosto de 2018. O 28 de setembro de 2020, Safari anunciou que se retiraría do fútbol profesional despois da tempada 2020. O 8 de novembro de 2020, Safari e Malmö gañaron o Allsvenskan 2020. Safari xogou o seu último partido profesional o 6 de decembro de 2020 nunha vitoria por 4 a 0 sobre Östersund, levantando o Lennart Johansson Trophy despois e recibindo un tributo de xogadores como Walter Samuel e Roger Federer.