Blaskowitz dirixiu o 8o Exército durante a invasión de Polonia e foi o comandante en xefe da Polonia ocupada de 1939 a 1940; escribiu varios memorandos para o Alto Mando alemán protestando contra as atrocidades das SS e entregou sentenzas de morte a membros das SS por crimes contra a poboación civil. Foi destituído, pero logo reelexido. Comandou o Grupo de Exércitos G durante a invasión aliada do sur de Francia.
e a Operación Nordwind, a última gran ofensiva alemá da Segunda Guerra Mundial na Fronte Occidental.