A rexión é o fogar de preto de 2,5 millóns de especies de insectos, decenas de miles de plantas e uns 2.000 aves e mamíferos. Ata a data, polo menos 40.000 especies de plantas, 2.200 peixes, 1.294 aves, 427 mamíferos, 428 anfibios e 378 réptiles foron clasificados cientificamente na rexión. Un quinto de todas as especies de aves atópanse na selva amazónica, e un quinto das especies de peixes viven en ríos e arroyos amazónicos. Os científicos describiron entre 96.660 e 128.843 especies de invertebrados só en Brasil. A biodiversidade de especies de plantas é a máis alta da Terra, cun estudo de 2001 que supostamente descubriu que un cuarto de quilómetro cadrado (62 acres) de selva ecuatoriana alberga máis de 1.100 especies de árbores.
96,660 e 128,843