Os métodos de tratamento de Fanon comezaron a evolucionar, particularmente comezando a terapia social para conectarse cos antecedentes culturais dos seus pacientes. Tamén adestrou enfermeiros e internos. Tras o estallido da revolución alxeriana
En novembro de 1954, Fanon uniuse ao Front de Libération Nationale, despois de ter feito contacto co Dr. Pierre Chaulet en Blida en 1955. Traballando nun hospital francés en Alxeria, Fanon converteuse no responsable de tratar a angustia psicolóxica dos soldados e oficiais franceses que levaban a cabo torturas para suprimir a resistencia anticolonial. Ademais, Fanon tamén foi responsable do tratamento de vítimas de tortura alxerianas.