O acordo de Arras esixía que todas as tropas españolas deixasen estas terras. Mentres tanto, Filipe tiña o ollo posto en unir toda a Península Ibérica baixo o seu dominio, un obxectivo tradicional dos monarcas españois. A oportunidade chegou en 1578, cando o rei portugués Sebastián lanzou unha cruzada contra Marrocos. A expedición terminou en desastre e a desaparición de Sebastián na Batalla dos Tres Reis.
- Non. O seu vello tío Henrique gobernou ata a súa morte en 1580. Aínda que Filipe se preparara desde hai moito tempo para tomar o control de Portugal, aínda así considerou necesario lanzar unha ocupación militar liderada polo duque de Alva. Filipe tomou o título de rei de Portugal, pero o país permaneceu autónomo, mantendo as súas propias leis, moeda e institucións. Con todo, Portugal renunciou a toda independencia na política exterior, e as relacións entre os dous países nunca foron cálidas.