Djibouti participou nos Xogos Olímpicos de Verán de 2000, que se celebraron en Sydney, Australia, do 15 de setembro ao 1 de outubro. A participación do país en Sydney marcou a súa quinta aparición nos Xogos Olímpicos de Verán desde o seu debut nos Xogos Olímpicos de Verán de 1984 en Los Ángeles, Estados Unidos. A delegación incluía dous atletas de atletismo; Omar Daher Gadid na maratón masculina
e Roda Ali Wais nos 800 metros femininos. Gadid non puido rematar a maratón, mentres que Wais non pasou a primeira rolda do seu evento.