Escribe unha continuación para este parágrafo - Antes da tempada 2016, Shibasaki cambiou o número de camiseta de vinte a dez. No inicio da tempada de 2016, Shibasaki continuou recuperando o seu primeiro lugar no equipo, xogando na posición central de centrocampista. Non foi ata o 10 de abril de 2016 cando marcou o seu primeiro gol da tempada e logo estableceu un gol para Caio, que marcou dúas veces nun partido, nunha vitoria de 4-1 contra o Sanfrecce Hiroshima. Un mes máis tarde, o 29 de maio de 2016, Shibasaki marcou o primeiro gol do club no partido e logo marcou o terceiro gol do club no partido, nunha vitoria por 4 a 0 contra Ventforet Kofu. Máis tarde marcou dous goles en setembro, contra Kataller Toyama e Albirex Niigata. Con todo, Shibsaka sufriu unha lesión no pé que o mantivo fóra durante un mes. Despois da clasificación do club para terminar en terceiro lugar ao final da segunda etapa da J.League, non fixo o seu retorno ata a final contra Urawa Red Diamonds e xogou en ambas as pernas, xa que Kashima Antlers empatou 2<unk>2 no total a través dun gol fóra, o que resultou no club converténdose en campións. Na Copa do Mundo de Clubes de 2016
, Shibasaki comezou os tres partidos e axudou a Kashima Antlers a avanzar nas fases de eliminación directa á final. Conseguiu a fama despois de marcar dúas veces para Kashima Antlers na final da Copa Mundial de Clubes de 2016 contra o Real Madrid. O Real Madrid gañou o partido por 4 a 2, aínda que no tempo extra, despois dun hat-trick de Cristiano Ronaldo. A pesar de perder na final, a actuación de Shibasaki foi elogiada polos medios, tanto dentro como fóra de Xapón. Ademais, foi galardoado co Adidas Bronze Ball no torneo. Despois diso, Shibasaki axudou ao club a recuperarse da derrota, marcando dous goles para derrotar ao Yokohama F. Marinos e axudar ao Kashima Antlers a chegar á final da Copa do Emperador. Axudou ao club a derrotar ao Kawasaki Frontale 2<unk>1 para gañar a final da Copa do Emperador. Ao final da tempada de 2016, fixo corenta e seis aparicións e marcou seis veces en todas as competicións.