A outra creación de Atkinson, o desafortunado Mr. Bean, apareceu por primeira vez o día de Ano Novo en 1990 nun especial de media hora para Thames Television. O personaxe de Mr. Bean foi comparado a un moderno Buster Keaton, pero o propio Atkinson afirmou que o personaxe de Jacques Tati, Monsieur Hulot, foi a principal inspiración. Varias secuelas de Mr. Bean apareceron na televisión ata 1995, e o personaxe apareceu máis tarde nun filme. Bean (1997) foi dirixido por Mel Smith, colega de Atkinson no Not the Nine O'Clock News.
Mr. Bean's Holiday, foi lanzado en 2007