O 5 de xullo de 2008, Comotto asinou co club Fiorentina da Serie A por 4,8 millóns de euros (pero tamén custou a "La Viola" un adicional de 198,000 euros como outra taxa). Fixo o seu debut como viola o 21 de setembro de 2008 na Fiorentina-Bolonia, que rematou 1<unk>0. Tamén debutou na Liga dos Campións na primeira xornada das eliminatorias contra o Sporting Clube de Portugal o 18 de agosto de 2009 no Estadio José Alvalade. Foi o lateral dereito titular nas tempadas 2008/09 e 2009/10, pero perdeu o seu lugar ante Lorenzo De Silvestri na Serie A 2010/11.
tempada. Esa tempada só comezou 16 veces e só foi reelecto polo adestrador en outubro despois de criticar ao seu equipo é unha razón para os malos resultados.