A rexión é o fogar de preto de 2,5 millóns de especies de insectos, decenas de miles de plantas e uns 2.000 aves e mamíferos. Ata a data, polo menos 40.000 especies de plantas, 2.200 peixes, 1.294 aves, 427 mamíferos, 428 anfibios e 378 réptiles foron clasificados cientificamente na rexión. Un quinto de todas as especies de aves atópanse na selva amazónica, e un quinto das especies de peixes viven nos ríos e arroyos amazónicos. Os científicos describiron entre 96.660 e 128.843 especies de invertebrados só en Brasil. A biodiversidade de especies de plantas é a máis alta da Terra, cun estudo de 2001 que descubriu que un cuarto de quilómetro cadrado (62 acres) de selva ecuatoriana alberga máis de 1.100 especies de árbores.
1.294 aves, 427 mamíferos