O Japón ten nove ecorregións forestais que reflicten o clima e a xeografía das illas, que van desde bosques húmidos subtropicais de folla ancha nas illas Ryukyu e Bonin, a bosques de folla ancha temperados e mixtos nas rexións de clima suave das illas principais, a bosques de coníferas temperadas nas partes frías e de inverno das illas do norte. O Xapón ten máis de 90.000 especies de vida salvaxe, incluíndo o oso pardo, o macaco xaponés, o can raccoon xaponés, o rato de campo xaponés grande e a salamandra xigante xaponesa.
As illas Ryūkyū e Bonin