Escribe unha continuación para este parágrafo - En c. 800, Abd al-Malik tamén foi colocado como tutor sobre o fillo de Harun, al-Qasim. A súa importancia e influencia no exército fixo que Harun desconfiase del e en 803 foi arrestado e metido na prisión. A razón real permanece descoñecida, aínda que a maioría das fontes coinciden en que o seu propio fillo, Abd ar-Rahman, informou ao califa de que supuestamente planeaba derrocalos. Abd al-Malik permaneceu preso ata a morte de Harun seis anos despois, cando o califa al-Amin (r. 809<unk>813) liberou-o. A sucesión de Al-Amin foi contestada
polo seu medio irmán maior al-Ma'mun, e houbo disturbios en Siria. Abd al-Malik aínda exercía unha influencia considerable sobre as tropas de fronteira, e por iso foi nomeado gobernador de Siria e Alta Mesopotamia e encargado de asegurar estas rexións para al-Amin e levantar tropas para enfrontarse a al-Ma'mun. Non obstante, pouco despois de chegar ao seu asento en Raqqa, Abd al-Malik caeu enfermo e morreu. A súa tumba foi demolida uns anos despois polo vitorioso al-Ma'mun, supostamente porque Abd al-Malik xurara nunca aceptar o goberno de al-Ma'mun.