Os dentes de Castorocauda son diferentes en moitos aspectos de todos os outros docodonts, presumiblemente debido a unha diferenza na dieta (aínda que vexa a continuación). A maioría dos docodonts tiña dentes especializados para unha dieta omnívora. Os dentes de Castorocauda suxiren que o animal era un piscivoro, alimentándose de peixes e pequenos invertebrados. Os dous primeiros molares tiñan cousps en liña recta, eliminando a función de molienda que suxire que eran estritamente para agarrar e non para masticar. Esta característica de tres cousps en liña é semellante á condición ancestral en parentes (como se ve en triconodonts), pero é case certamente un carácter derivado en molares de Castorocauda.
Unha diferenza na dieta