O "Susquehanna" foi recomendado o 20 de xullo de 1864 e asignado ao Esquadrón de Bloqueo do Atlántico Norte e participou nos abortados ataques contra Fort Fisher, Carolina do Norte, na véspera de Nadal de 1864. Con todo, a mediados de febreiro de 1865, o dobre final estaba na poderosa forza que finalmente tomou esa fortaleza confederada
e pechou Wilmington, Carolina do Norte, o último gran porto dos Estados Confederados de América. Naquel momento, estaba baixo o mando do contraalmirante Sylvanus William Godon. Un dos seus tripulantes, o Landman Henry S. Webster, foi condecorado coa Medalla de Honra polas súas accións na Segunda Batalla de Fort Fisher.