Con os franceses expulsados da illa, Córcega estableceu o seu estatuto como parte autónoma do Imperio Británico. Hood usou San Fiorenzo como ancoradoiro para a súa frota, a pesar da súa falta de instalacións de astillero. O perigo para Córcega desde o mar permaneceu unha preocupación sempre presente; en agosto de 1794 o HMS "Scout" de 16 canóns escoltaba a frota de pesca de coral de Córcega ao largo do cabo Bon cando foi atacada e capturada por dúas fragatas francesas. A indefensa frota dispersouse e varios barcos foron capturados por piratas alxerianos, as tripulacións convertidas en escravos. O enviado británico Frederick North finalmente asegurou a súa liberación por 48.000 libras. A principios de 1795, un esforzo francés para desembarcar 25.000 soldados en Córcega foi derrotado pola frota británica na Batalla de Xénova
Durante o resto da ocupación británica da illa, os corsarios e axentes franceses desembarcaron regularmente na costa.