Escribe unha continuación para este parágrafo - Murray foi inicialmente un partidario das políticas robustas de Lord Lauderdale, participando nunha incursión de 1678 contra os Covenanters, pero entón perdeu temporalmente o favor real ao aconsellar a moderación sobre as medidas tomadas contra eles. En 1679, porén, estivo presente na batalla de Bothwell Bridge
En xullo de 1680 foi nomeado vicealmirante de Escocia, e en 1681 presidente do parlamento.