A atmosfera de Xúpiter é a maior atmosfera planetaria do Sistema Solar. Está composta principalmente de hidróxeno molecular e helio en proporcións aproximadamente solares; outros compostos químicos están presentes só en pequenas cantidades e inclúen metano, amoníaco, sulfuro de hidróxeno e auga. Aínda que se pensa que a auga reside profundamente na atmosfera, a súa concentración medida directamente é moi baixa. A abundancia de nitróxeno, xofre e gases nobres na atmosfera de Xúpiter excede os valores solares por un factor de aproximadamente tres. A atmosfera de Xúpiter carece dun claro límite inferior e as transicións gradualmente ao interior do planeta líquido. Desde a máis baixa ata a máis alta, as capas atmosféricas son a troposfera, os estratos, os BA e os exos. Cada capa ten gradientes de temperatura característicos. A capa da atmosfera ten unha complexa estrutura de nubes tropicais e espirais, que inclúen metano, amoníaco e amoníaco. O modelo de referencia do Gran Vórtice mostra que as grandes bandas de cor branca e branca son as máis escuras
limpar o límite inferior e gradualmente as transicións ao interior líquido do planeta.