O 31 de agosto de 2016, o Senado votou para condenar a Rousseff, destituíndoa do cargo e facendo de Temer a Presidenta de Brasil. Serviría o resto do segundo mandato de Rousseff, que rematou o 1 de xaneiro de 2019. O cargo de vicepresidente quedou vacante, e o presidente da Cámara de Deputados actúa como o primeiro substituto constitucional durante o seu mandato. O 7 de setembro de 2016, inaugurou
Os Xogos Paralímpicos de Verán no Maracanã en medio de masivas abucheos dos espectadores.