A criptografía é tamén unha rama da enxeñería, pero unha excepcional, xa que trata con oposición activa, intelixente e malévola (ver enxeñería criptográfica e de seguridade); outros tipos de enxeñería (por exemplo, enxeñería civil ou química) só teñen que tratar con forzas naturais neutras. Tamén hai investigación activa que examina a relación entre os problemas criptográficos e a física cuántica (ver criptografía e criptografía cuántica).
énfasis