Escribe unha continuación para este parágrafo - A batalla de Alcácer Quibir en 1578 viu a morte do mozo rei Sebastián. O tío avó e sucesor de Sebastián, o cardeal Henry, tiña 66 anos nese momento. A morte de Henrique foi seguida por unha crise de sucesión, con tres netos de Manuel I reclamando o trono: a infanta Catarina, duquesa de Braganza (casada con Xoán, o 6o duque de Braganza), António, prior de Crato e o rei Filipe II de España. António fora aclamado rei de Portugal polo pobo de Santarém o 24 de xullo de 1580, e despois en moitas cidades e vilas de todo o país. Algúns membros do Consello de Gobernadores de Portugal que apoiaran a Filipe fuxiron a España e declarárono sucesor legal de Henrique. Filipe marchou a Portugal e derrotou as tropas leais ao Prior de Crato na Batalla de Alcântara
- Non. As tropas que ocupaban o campo (Tercios) comandadas polo 3o duque de Alba chegaron a Lisboa. O duque de Alba impuxo ás provincias portuguesas unha suxeición de Filipe antes de entrar en Lisboa, onde se apoderou dun inmenso tesouro; mentres tanto, permitiu aos seus soldados saquear as proximidades da capital. Filipe foi recoñecido como rei polas Cortes de Tomar en 1581, comezando o reinado da Casa de Habsburgo sobre Portugal. Cando Filipe partiu en 1583 para Madrid, nomeou ao seu sobriño Alberto de Austria como seu virrei en Lisboa. En Madrid creou un Consello de Portugal para asesoralo en asuntos portugueses.