Moitas clasificacións máis recentes intentan presentar grupos monofiléticos baseados en información morfolóxica (especialmente ultrastructural), bioquímica (quimiotaxonomía) e secuencia de ADN (investigación molecular). Con todo, ás veces hai discordancias entre investigacións moleculares e morfolóxicas; estas poden ser categorizadas en dous tipos: (i) unha morfoloxía, múltiples linaxes (por exemplo, converxencia morfolóxica, especies crípticas) e (ii) unha liñaxe, múltiples morfoloxías (por exemplo, plasticidade fenotípica, múltiples etapas do ciclo de vida).
non monofilético