A través do intercambio de R. A. Dickey, os Mets recibiron moitos novos prospectos, incluíndo Travis D'Arnaud e Noah Syndergaard. Despois de perder os dereitos para os Buffalo Bisons, os Mets reclamaron os Las Vegas 51s como o seu afiliado Triple A para 2013<unk>15. O Citi Field foi o anfitrión do 2013 Major League Baseball All-Star Game
que tivo lugar o 16 de xullo de 2013. Matt Harvey foi o lanzador principal do equipo e foi o titular dos All-Stars da Liga Nacional. Durante a tempada, Harvey recibiu o alcume de "The Dark Knight of Gotham" de Sports Illustrated. Os Mets remataron a tempada 74-88, o mesmo récord da tempada anterior. Con todo, por primeira vez na historia da franquicia, os Mets varreron aos seus rivais da cidade, os Yankees, na Subway Series.