Completa a seguinte frase: O 23 de agosto de 2015, Bonaventura fixo o seu debut na tempada cando o Milan perdeu por 2-0 ante a Fiorentina. No seguinte partido contra o Empoli, Bonaventura entrou no campo como substituto de Suso no minuto 55 e logrou asistir o gol da vitoria de Luiz Adriano cun tiro de esquina 15 minutos despois. O 19 de setembro, Bonaventura asistiu o primeiro gol de Carlos Bacca e marcou directamente dun tiro libre na vitoria por 3 a 2 sobre o Palermo. Tamén gañou outra axuda e un gol no seguinte partido do Milan, a vitoria por 2 a 3 sobre o Udinese. Unha vez máis, asistiu aos goles de Carlos Bacca e Philippe Mexès contra o Lazio na vitoria de 3 a 1 en casa o 1 de novembro. Continuou a desempeñarse ben baixo o adestrador do equipo Siniša Mihajlović e converteuse nun xogador fundamental para o seu equipo ao longo da tempada. Despois de perder un empate de 0 a 0 contra o seu antigo equipo Atalanta por suspensión, marcou o gol inaugural nunha derrota por 4 a 1 contra o Sampdoria o 28 de novembro. Marcou de novo no seu seguinte partido o 1 de decembro, unha derrota de 3 a 1 en Coppa Italia de Crotone, a través dun brillante tiro libre de 20 yardas. O 20 de decembro asistiu ao gol de Carlos Bacca e marcou un gol tardío cando o Milan derrotou a Frosinone por 4-2. O 17 de xaneiro de 2016, proporcionou outra axuda para Carlos Bacca cando os Rossoneri derrotaron á Fiorentina por 2-0. Finalizou a tempada con 7 goles e 8 asistencias en todas as competicións.
Serie A, e perdeu na final da Coppa Italia contra a Juventus, tras unha derrota de 1 a 0 no tempo extra.