Escriba unha continuación para este parágrafo - Jokubaitis xogou para Lituania no Campionato de Europa FIBA U16 de 2016 en Polonia. Ten unha media de 10 puntos e axudou ao seu equipo a gañar a medalla de prata. Jokubaitis foi o xogador máis novo na Copa do Mundo FIBA Sub-19 de 2017 en Exipto, cunha media de 10 puntos e 5.3 asistencias por partido para o equipo que ocupou o sexto lugar. No Campionato de Europa FIBA Sub-18 de 2018 en Letonia, promediou 12,9 puntos e 5,6 rebotes por partido cando o seu equipo terminou quinto. Jokubaitis levou a Lituania ao cuarto lugar na Copa do Mundo FIBA Sub-19 de 2019
en Grecia, onde fixo unha media de 11,3 puntos e 5,6 asistencias por partido.