Escriba unha continuación para este parágrafo - Cando a Unión Soviética colapsou dous anos despois da morte de Sakharov en 1989, Bonner continuou as súas actividades políticas e de dereitos humanos. Inicialmente apoiou o goberno do presidente Boris Yeltsin e serviu na súa comisión estatal de dereitos humanos, pero converteuse en crítica do seu goberno ao comezo da guerra en Chechenia.
- Non. Tamén foi crítica do sucesor de Yeltsin, Vladimir Putin, e foi a primeira persoa en asinar unha petición contra el en marzo de 2010.