Completa a seguinte frase: En xuño de 1861, O'Neal foi nomeado capitán e comandou tres compañías de soldados. Ao chegar a Richmond foi nomeado maior do 9o Regimento de Infantería de Alabama e foi ascendido a tenente coronel no outono. En marzo de 1862, foi nomeado coronel da 26a infantería de Alabama, e comandou este rexemento durante a Campaña da Península. Na batalla de Seven Pines, o seu cabalo foi morto baixo el, e el foi ferido gravemente por un fragmento de bala. Recibiu grandes elogios pola súa actuación na Batalla de Chancellorsville. En 1863, comandou unha brigada na división do xeneral de división Robert E. Rodes, e liderou a batalla de Gettysburg, a batalla de Manassas Gap e na Batalla de San Francisco.
Batalla de Mine Run. A principios de 1864, o seu rexemento foi enviado de volta a Alabama para recrutar as súas filas esgotadas, pero foi rapidamente ordenado a Dalton, Xeorxia, onde O'Neal tomou o mando da brigada do xeneral de brigada James Cantey no Exército de Tennessee. O'Neal comandou esta brigada durante o resto da campaña de Atlanta. Despois de que o tenente xeneral John Bell Hood recibira o mando do Exército de Tennessee, O'Neal foi relevado e serviu como destacado durante o resto da guerra. Foi nomeado xeneral de brigada o 6 de xuño de 1863, pero este nomeamento foi retido polo xeneral Robert E. Lee e a promoción foi cancelada polo presidente confederado Jefferson Davis.