Oito anos despois de competir nos seus últimos Xogos Olímpicos, Ndjissipou clasificouse para o seu terceiro equipo centroafricano, aos 31 anos, na maratón masculina.
nos Xogos Olímpicos de 2004 en Atenas, recibindo un lugar nos Campionatos Mundiais da IAAF en París. Finalizou a carreira cun tempo de 2:21:23, quedando atrás do corredor italiano e medallista de ouro Stefano Baldini e do brasileiro Vanderlei de Lima (cuxa carreira fora agarrada e empurrada polo protestante irlandés Cornelius Horan) por unha estimación de dez segundos. Construíndo o seu propio marco como tres veces olímpico, Ndjissipou foi nomeado polo Comité Olímpico Nacional para levar a bandeira centroafricana na cerimonia de apertura.