O desenvolvemento do xogo foi liderado por Ubisoft Montreal, que asumiu o desenvolvemento da franquía Far Cry despois do lanzamento de Far Cry: Instincts en 2005. O desenvolvemento adicional foi manexado por outros catro estudos internos de Ubisoft, Ubisoft Toronto, Red Storm Entertainment, Ubisoft Shanghai e Ubisoft Kiev. O estudo de Montreal traballou na campaña do xogo, o estudo de Toronto traballou nos segmentos de Shangri-La da campaña, Red Storm traballou no desenvolvemento do multijugador competitivo, o estudo de Shanghai traballou nas misións de caza e o estudo de Kiev desenvolveu a versión de PC do xogo. O desenvolvemento do xogo comezou a finais de 2012, despois do envío de Assassin's Creed III. O director creativo do xogo é Alex Hutchinson, que traballou anteriormente en Maxis's Spore como Assassin's Creed III.
Nepal