O comezo da tempada 2013-14 foi difícil para Yakimenko: caendo ao posto número 17, xa non se beneficiaba da exención do Top-16 e tivo que pasar pola fase de cualificación en cada competición da Copa do Mundo. Volveu en abril con unha medalla de bronce en Atenas, seguida por dúas de bronce en Chicago e Varsovia. A principios de xuño foi afectado pola morte de David Tyshler, un dos maiores espadachines de Rusia e o seu supervisor persoal na universidade. Poucos días despois, no Campionato de Europa en Estrasburgo, derrotou aos seus compañeiros de equipo Kamil Ibragimov e Veniamin Reshetnikov respectivamente nas semifinais e na final, para reclamar o seu quinto título individual europeo e a súa undécima medalla europea. No evento por equipos, Rusia derrotou a Ucraína, logo a Bielorrusia para enfrontarse a Italia na final. Despois dun partido apertado, Italia finalmente prevaleceu 45 a 44 e Rusia foi relegada a unha medalla de prata. Nos Campionatos do Mundo
En Kazan, Yakimenko superou ao coreano Won Woo-young nos cuartos de final, pero cedeu ao seu compañeiro de equipo Gu Bon-gil nas semifinais. Saíu con unha medalla de bronce, o seu segundo podio individual no Mundial. Declarou estar moi satisfeito con este resultado e dedicou a súa medalla á súa noiva. O evento por equipos non alcanzou as expectativas: a Rusia, a primeira selección, foi derrotada nas semifinais por Alemaña, que finalmente gañou a medalla de ouro. Moi molestos por esta derrota, Rusia non se reagrupou para o combate da medalla de bronce e perdeu 45 a 43 contra Hungría, volvendo a casa sen medalla.