Francescato fixo o seu debut internacional o 7 de outubro de 1990 contra Romanía. A súa última aparición cos Azzurri foi o 8 de novembro de 1997 contra Sudáfrica. Quizais o seu momento máis famoso cunha camiseta italiana foi marcar un dos intentos do torneo na Copa do Mundo de 1991
no partido contra os Estados Unidos, no que pasou e fingiu pasar varios defensores americanos antes de aterrar entre os postes.