Fassbender é un católico decadente, aínda que aínda vai á igrexa para acender velas. É un partidario do club de fútbol de Liverpool. En 2010, a ex-namorada de Fassbender, Sunawin Andrews, presentou unha orde de restrición contra el no Tribunal Superior do Condado de Los Angeles, alegando que el "me arroxou sobre unha cadeira que me rompeu o nariz" en 2009, e que tamén a arrastraba ao lado do seu coche, ferindo o tobillo e o xeonllo, así como causando que ela estoupase.
A luz entre os océanos