En 1799, foi nomeado para o estado maior de Jean-Baptiste Jourdan do Exército do Danubio, guarnicionado inicialmente en Estrasburgo. Despois de cruzar o Rin a principios de marzo, o exército enfrontouse ás tropas austríacas do arquiduque Carlos nas batallas de Ostrach
e Stockach. Despois da derrota en Ostrach, o exército foi reorganizado co Exército de Helvetia, baixo o mando de André Masséna. Hastrel recibiu un nomeamento de persoal en Milán.