Lundqvist xogou nove partidos para o IF Mölndal Hockey na segunda división sueca Allsvenskan antes de unirse ao equipo xuvenil de Frölunda na J20 SuperElit en decembro. Despois do seu mal xogo en Allsvenskan e un duro comezo na J20 SuperElit, permitiu seis goles nun partido de exhibición contra Canadá. Os adestradores do equipo nacional Bo "Kulon" Lennartsson e Mikael Tisell estaban preocupados e decidiron ter unha conversa con Lundqvist, onde cuestionaron a súa motivación. O punto de inflexión de Lundqvist chegou ao cambio de ano no Campionato Mundial de Hockey sobre xeo xuvenil de 2001
en Moscova, onde liderou o equipo nacional xuvenil sueco a un cuarto lugar no torneo. Pasou o resto da tempada na J20 SuperElit onde xogou 18 partidos, liderando a liga en minutos xogados por un porteiro. Nos playoffs, liderou a Frölunda á súa segunda vitoria consecutiva na Anton Cup, que chegou nunha vitoria por 5 a 2 sobre o Leksands IF na final no Estocolmo Globe Arena.