Escribindo cinco goles no seu partido de estrea na Süper Lig suxeriu que Jardel se adaptaría ben ao seu novo club, pero cara ao final da tempada, as lesións e os crecentes problemas persoais insinuaron que pronto deixaría Turquía. En calquera caso, formou parte do equipo do Galatasaray que gañou a Supercopa da UEFA de 2000.
Jardel marcou seis goles na competición e axudou en vitorias contra equipos como Rangers, Deportivo de La Coruña, Mónaco, Paris Saint-Germain, Milán e Real Madrid. Finalizou a tempada con 34 goles.