En 1876 escribiu The Geographical Distribution of Animals, que foi o traballo estándar durante máis de medio século e unha secuela, Life Island, en 1880, que se centrou na hipótese da transmutación, prestou especial atención á distribución xeográfica de especies estreitamente aliadas durante o seu traballo de campo primeiro en América do Sur e despois no arquipélago malaio. Mentres que no arquipélago identificou a liña Wallace, que atravesa as illas Spice dividindo a fauna do arquipélago entre unha zona asiática e unha zona de Nova Guinea / Australia. A súa pregunta clave, como por que a fauna das illas con climas tan similares debería ser tan diferente, só podería ser respondida considerando a súa orixe.
Ernst Haeckel