Unha das esferas de interese de Dyukov é a historia da represión soviética, principalmente nos estados bálticos e Ucraína, e máis recentemente, escribiu un artigo controvertido minimizando as masacres de Kurapaty en Bielorrusia. Mentres Dyukov emprega arquivos abertos como os do Arquivo Estatal da Federación Rusa (GARF) e o Arquivo Estatal Ruso de Historia Contemporánea (RGANI), tamén cita os arquivos do FSB, aos que o acceso dos investigadores é limitado. Son estes arquivos do FSB os que Dyukov usa, por exemplo, para afirmar no seu recente libro, "The Genocide Myth", que a lembranza de Estonia das represións soviéticas, incluídas as deportacións, é exagerada. En relación coas deportacións de xuño de 1941
, que tivo lugar antes da invasión alemá do 22 de xuño de 1941, Dyukov afirma que os estonios deportados eran principalmente colaboradores alemáns ou estaban ligados a eles.