Hawking naceu o 8 de xaneiro de 1942 en Oxford, fillo de Frank (1905-1986) e Isobel Eileen Hawking (née Walker; 1915-2013). A nai de Hawking naceu nunha familia de médicos en Glasgow, Escocia. O seu rico bisavó paterno, de Yorkshire, estendeu a compra de terras de cultivo e despois entrou en bancarrota na gran depresión agrícola durante o comezo do século XX. A súa bisavó paterna salvou a familia da ruína financeira abrindo unha escola na súa casa. A pesar das limitacións financeiras das súas familias, ambos os pais asistiu á Universidade de Oxford, onde Frank leu medicina e Isobel leu Filosofía, Política e Economía.
limitacións financeiras