En 1626 o Almirantado de Frisia foi eximido do seu deber de entregar seis buques de guerra, o que suxire que non todo estaba ben en Dokkum financeira e administrativamente. O almirantado, con todo, entrou en acción baixo o mando do comandante supremo neerlandés, o tenente almirante Maarten Harpertszoon Tromp, durante a Guerra dos Trinta Anos para bloquear os ríos Ems e Jade alemáns para evitar que os corsarios que traballaban para os Habsburgo deixasen o porto. Durante este bloqueo, os frisóns capturaron o barco "Du Mortier". En 1639 o Almirantado equipou tres barcos e catro iates para a República. Algúns foron enviados a tarefas de exploración nas accións que levarían á Batalla de Downs
, incluíndo un "roeifregat" (galera) do Almirantado de Frisia, o "Rotterdam", baixo o mando do capitán Joris Pieters van den Broeck. Despois de traer o seu informe, o almirante Tromp decidiu dar batalla o 16 de setembro, cunha frota holandesa de 29 buques contra 67 buques españois. Un dos barcos máis grandes da frota de Tromp era unha fragata de 70 homes con 22 canóns baixo o mando do capitán frisón Tjaard de Groot. Na posterior Batalla de Downs, Broeck derrotou un galeón español de 140 homes e 18 canóns.