En 2006 Déby gañou un terceiro mandato nas eleccións que a oposición boicoteou. A violencia étnica no leste de Chad aumentou; o Alto Comisionado das Nacións Unidas para os Refugiados advertiu de que un xenocidio como o de Darfur aínda pode ocorrer no Chad. En 2006 e en 2008
As forzas rebeldes intentaron tomar a capital pola forza, pero fracasaron en ambas as ocasións. Un acordo para a restauración da harmonía entre Chad e Sudán, asinado o 15 de xaneiro de 2010, marcou o fin dunha guerra de cinco anos. A corrección das relacións levou aos rebeldes chadianos de Sudán a volver a casa, a apertura da fronteira entre os dous países despois de sete anos de peche e o despliegue dunha forza conxunta para asegurar a fronteira. En maio de 2013, as forzas de seguridade en Chad frustraron un golpe de estado contra o presidente Idriss Déby que se preparara durante varios meses.