O filme foi rodado en Haiku, na illa de Maui, con sete escenas adicionais, as preocupacións de Spielberg sobre a infraestrutura e a accesibilidade fixeron que elixise un lugar onde xa traballara. A rodaxe de tres semanas involucrou varios exteriores diurnos para os bosques de Isla Nublar. O 11 de setembro, o furacán Iniki pasou directamente sobre Kaua'i custando un día de rodaxe. Varias das escenas da tempestade da película son imaxes reais filmadas durante o furacán. A rodaxe programada da persecución de Gallimus foi trasladada a Kualoa Ranch na illa de Oahu. Unha das primeiras escenas que se debían crear foi a animación dixital dunha escena de violación. A escena de apertura foi en Haiku, na illa de Maui, con sete escenas adicionais, as preocupacións de Spielberg sobre a infraestrutura e a accesibilidade fixeron que elixise un lugar onde xa traballara.
Kauai