Escriba unha continuación para este parágrafo - Mentres estaba ao mando do Exército suxeríu reunir grupos de dereitos humanos, a Igrexa Católica e o Exército para formar un "panel de reconciliación" co fin de descubrir o paradero dos "desaparecidos". Con todo, foi fortemente criticado por defender a represión e as accións ilegais militares
do goberno militar, por supuestamente protexer aos oficiais implicados, e por atrasar o proceso de reconciliación iniciado polo seu predecesor, Martín Balza. Brinzoni tivo máis controversia cando se revelou que o seu avogado durante este período, Juan Enrique Torres Bande, era membro do partido neo-nazi Novo Triunfo.