En outubro de 1939, pouco despois da invasión de Polonia e o comezo da Segunda Guerra Mundial, "Însemnări Ieșene" publicou o seu artigo deplorando o retorno do home á súa natureza "bestial" e expresando temores de que a vida moderna fixera aos soldados indiferentes aos transcendentais. Popa presenciou os desenvolvementos posteriores desde o lado. A Fronte Nacional do Renacemento caeu do poder despois de aceptar perdas territoriais a favor de Hungría e a Unión Soviética. Formaba parte do Gran Caucus da Universidade, que emitiu unha protesta reservada contra a cesión do norte de Transilvania. Con un número especial e artigos en "Însemnări Ieșene", Popa tamén lamentou a perda de Besarabia e Bukovina do Norte
- Non. Acosado pola Garda de Ferro, que o incluíu na lista negra de asasinos, Popa conseguiu sobrevivir ao seu réxime de "Estado Nacional Legionario", proclamado en setembro de 1940. Con todo, "Însemnări Ieșene" foi prohibido, e algúns dos seus membros do persoal trasladouse á revista de inspiración fascista "Cetatea Moldovei". A comisión de purga da facultade de medicina de Iași, encabezada por homes da Garda de Ferro, propuxo a transferencia de Popa "a outra institución científica", citando as "ideas de esquerda" de Popa como fundamento.