O club foi fundado o 4 de febreiro de 1899 como Fußballverein Werder por un grupo de 16 estudantes de secundaria vocacional que gañaron un premio de equipos deportivos. Os estudantes tomaron o nome do club dunha palabra alemá para "península do río", que describía o campo fluvial no que xogaron os seus primeiros partidos de fútbol. O club xogou o seu primeiro partido o 10 de setembro de 1899 contra o ASC 1898 Bremen saindo con unha vitoria de 1<unk>0. En 1900, o FV Bremen estaba representado na fundación da Asociación Alemá de Fútbol (BDF) en Leipzig. O club gozou de algúns primeiros éxitos, gañando equipos competitivos e gañando un número de campións locais.
Fußballverein Werder