Despois da elección do goberno de Abe en 2012, Koizumi foi nomeado como viceministro de Reconstrución, centrándose na rexión nordeste do Xapón que foi devastada polo tsunami de marzo de 2011.
e o posterior desastre nuclear. Opuxo-se publicamente aos chamamentos do seu pai para que o Xapón abandonase a enerxía nuclear inmediatamente. En 2019, o primeiro ministro Shinzo Abe nomeou a Koizumi ao gabinete como ministro do Medio Ambiente, un papel que mantivo cando Yoshihide Suga sucedeu a Abe como primeiro ministro en setembro de 2020.