Isulat ang usa ka pagpadayon alang niini nga parapo - Ang katakos gibahin ngadto sa Czech ug German nga mga bahin sa 1882, ug ang Faculty sa Natural Sciences nahimong usa ka bulag nga institusyon tali sa 1920-1939. Niadtong 1939, ang tunghaan gisirad-an sa mga puwersa sa Nazi sa Alemanya, ug misunod ang mabangis nga paglutos sa mga magtutudlo ug mga estudyante. Human sa katapusan sa pag-okupar sa 1945, ang Faculty of Arts milambo pag-usab sa pipila ka mga tuig; kini gipugos sa pagtapos sa 1948 sa mga Komunista coup sa 1948. Ang dungog sa mga magtutudlo dali nga mius-os tungod sa pinugos nga pagbiya sa daghang tinahod nga mga magtutudlo ug sa pagpaila sa Marxist-Leninist pagtuon. Sa mga 1960, ang mga magtutudlo sa hinayhinay nagsugod sa pag-abli ngadto sa mga bantog nga mga magsusulat sa panahon, apan kini nga trend gibalik sa Soviet pag-okupar sa 1968
, nga giprotestahan ni Jan Palach, usa ka estudyante sa tunghaan, pinaagi sa pagsunog sa iyang kaugalingon. Human sa kataposan sa Komunistang rehimen sa Czechoslovakia sa 1989, ug sa pagbiya sa mga representante niini diha sa mga magtutudlo, kini naestablisar pag-usab ingon nga usa sa labing taas nga giisip nga mga institusyon sa unibersidad sa nasod.