Isulat ang pagpadayon niining parapoha - Si Junípero Serra migugol ug walo ka tuig sa proyekto sa pagtukod sa mga misyon hangtod sa 1770. Sa dihang ang ubay-ubayng makasaysayanhong mga hitabo, lakip na ang pagpalagpot sa mga Heswita, nagpugos sa pagbiya sa mga misyon. Si Serra mibalhin sa California. Sa dihang mibiya si Serra, ang mga misyon gibilin sa mga kamot sa regular nga klero. Panahon sa Gubat sa Independensya sa Mexico ug sa Rebolusyon sa Mexico
, ang mga misyon nag-antos sa paglugos ug paglaglag. Ang unang buhat sa pag-ayo sa gawas sa mga simbahan sa misyon gisugdan sa mga tuig 1980. Taliwala sa 1991 ug 1997, gihimo ang mga obra sa sulod sa mga halaran, mga koral, mga organo ug mga dibuho. Ang dugang nga trabaho gisuportahan sa estado tali sa 1997 ug 2002. Ang trabaho nga gihimo sa katuigang 1990 naglakip usab sa mga plasa ug mga monumento sa palibot. Ang paningkamot sa pagsulat sa mga misyon ingon nga World Heritage Site nagsugod sa 2000 ug sa katapusan malampuson sa 2003, sa diha nga kini gidugang sa panahon sa ika-27 nga miting sa World Heritage Committee.