Isulat ang pagpadayon niining parapoha - si Kiernan nag-insistir sa pag-apil sa mga ranggo sa pakig-away, ug sa maong katakos daw gitudlo nga usa ka Mayor sa ika-6 nga Missouri. Niadtong Mayo 1863 sa Port Gibson
, Missouri, siya nasamdan sa wala nga baga ug gibiyaan diha sa kapatagan nga gihunahuna nga patay na. Sa dihang nadakpan ug napriso, siya miikyas balik ngadto sa mga puwersa sa Unyon ug mibiya sa iyang komisyon. Sa 1 Agosto 1863 siya gi-komisyon sa usa ka Brigadier General sa mga Boluntaryo sa Presidente Abraham Lincoln; nagmando sa usa ka post sa Miliken Bend sa Mississippi. Bisan pa niana ang sakit sa panglawas ingon nga resulta sa iyang mga samad sa gubat nagpugos kaniya sa pagbiya sa 3 Pebrero 1864.