Kompletoha ang mosunod nga pulong: Sa Gubat Sibil sa Amerika, si Geddes nagsilbi sa kasundalohan sa Unyon, nga nagpalista ingong usa ka pribado sa ika-8 nga Iowa Infantry. Siya gipromot ngadto sa kapitan ug dayon sa tinugyanan nga koronel, ug human sa Pebrero 1862 ingon nga koronel sa mga boluntaryo. Siya miapil sa pagpakig-away sa
Shiloh, diin siya nasamdan ug nadakpan. Siya gibilanggo sa usa ka panahon sa Madison, Georgia, ug sa Libby Prison sa Richmond, Virginia. Human sa pagbayloay, siya nakig-away sa Vicksburg ug Jackson. Sa Oktubre 1863, siya gihatagan ug mando sa usa ka brigada ug gipadala sa Brownsville, Texas. Sa ulahi, siya nag-alagad ingon nga ang Provost marshal sa Federal nga giokupar Memphis, Tennessee, nga iyang giluwas gikan sa pagdakop sa Confederate kabalyero sa ilalum sa Nathan Bedford Forrest. Siya nagmando sa usa ka brigada sa Mobile Campaign ug nakig-away uban sa kalainan sa Battle of Spanish Fort. Sa Enero 13, 1866, si Presidente Andrew Johnson nominado Geddes alang sa appointment sa grado sa brevet brigadier heneral sa mga boluntaryo, sa ranggo gikan sa Hunyo 5, 1865, ug ang Senado sa Tinipong Bansa nagpamatuod sa appointment sa Marso 12, 1866.