Sa ting-init sa 1981, ang 28-anyos nga si Filipović miduyog sa naghari nga mga kampeon sa Portuges nga si S.L. Benfica diin sa mosunod nga tulo ka mga panahon siya nagpunting og 28 ka mga tumong sa 54 ka mga dula sa liga. Si Zoran Filipović naggiya usab sa club nga si Benfica ngadto sa 1983 UEFA Cup Final
batok sa R.S.C. Anderlecht, nga mao ang top scorer sa kompetisyon sa maong panahon ug sa pag-iskor sa mahinumduman nga mga tumong alang sa Portuges sa quarterfinal batok sa AS Roma ug sa semifinal batok sa Universitatea Craiova.