Kompletoha ang mosunod nga pulong: Sukad sa ika-15ng siglo, ang dapit sa lungsod lakip ang ubang mga bahin sa Labuan nailalom sa Imperyo sa Brunei. Ang kasaysayan niini nagsugod sa panahon nga ang isla gipasagdan ni Sultan Omar Ali Saifuddin II ngadto sa mga Briton. Si Rodney Mundy, usa ka Britanikong opisyal sa barko, sa ulahi miduaw sa isla ilalom sa ngalan ni Rayna Victoria. Ang isla unya gisakop sa Japan gikan sa 3 Enero 1942 hangtud sa Hunyo 1945 ug gimandoan ingon nga bahin sa Northern Borneo militar nga yunit sa Hapon 37th Army. Sulod sa
Ang Labuan gibuhian sa 9th Division sa Australian Imperial Force kaniadtong 10 Hunyo 1945 ug gibutang sa ilalum sa British Military Administration hangtod sa 15 Hulyo 1946, kung kanus-a kini gihiusa sa North Borneo Crown Colony. Niining panahona, ang gobyerno sa Crown Colony nagtukod pag-usab sa dakong bahin sa imprastraktura nga nalaglag sa panahon sa gubat. Ang isla sa ulahi nahimong bahin sa estado sa Sabah ug Malaysia sa 1963 sa wala pa ang gobyerno sa estado sa Sabah mihatag sa isla ngadto sa pederal nga gobyerno sa 1984. Kini gideklarar nga usa ka internasyonal nga offshore nga pinansiyal nga sentro ug free trade zone sa 1990 aron sa pagtabang sa kalamboan sa Victoria.