Sa Enero 1966, si Prinsipe Sadruddin gitudlo nga United Nations High Commissioner alang sa mga Refugees human sa pag-alagad sulod sa tulo ka tuig ingong Deputy High Commissioner. Sa edad nga 33 siya nahimong kinamanghoran nga tawo nga nagmando sa UNHCR. Sulod sa misunod nga 12 ka tuig iyang gidumala ang ahensiya sa mga kagiw sa Hiniusang Kanasoran sa usa sa labing lisod nga mga yugto niini, nga nagkoordinar sa internasyonal nga tubag sa krisis sa Bangladesh sa 1971.
nga nagpalagpot sa mga tawo, ang 1972 nga pagbiya sa ginatos ka libo sa mga Hutu gikan sa Burundi ngadto sa Tanzania, ug ang trahedya sa Vietnamese boat people sa tungatunga sa katuigang 1970. Sa 1972, si Prinsipe Sadruddin nakahimo ug hinungdanong papel sa pagpangita ug bag-ong mga balay alang sa tinagpulo ka libo ka taga-South Asia nga gipalagpot gikan sa Uganda ni Idi Amin.