Pagkahuman sa gubat, si Ančerl nagdirig sa Radio Prague hangtod sa 1950, sa dihang siya nahimong artistic director sa Czech Philharmonic, usa ka posisyon nga malamposong iyang gihuptan sulod sa napulo ug walo ka tuig. Human sa 1968 nga pagsulong sa Czechoslovakia
, Si Ančerl mibalhin ngadto sa Toronto, Canada, diin siya nagtrabaho ingong musikong direktor sa Toronto Symphony Orchestra hangtod sa iyang kamatayon niadtong 1973.