Pagkahuman sa pagsulod sa Italya sa gubat sa Hunyo 10, 1940, si Waller nalangkit sa pagpangita sa mga minahan sa baybayon sa Amihanang Aprika. Usa ka batid nga tigpusil, siya mismo ang nagpalong sa naglutaw nga mga mina nga naggamit ug riple ug mga bala nga makasulod sa armadura. Sa Hunyo 21, gipusil sa "Stuart" ang lungsod sa Bardia nga gipanag-iya sa Italya. Pagkasunod bulan, ang iyang ika-10 nga Destroyer Flotilla miapil sa Battle of Calabria. Ang mga barko ni Waller mihimog mga pagbomba sa Fort Capuzzo niadtong Agosto 17 ug sa usa ka Italyanhong base sa mga seaplane sa Gulpo sa Bomba usa ka semana sa ulahi. Sa Septiyembre, siya awarded sa Distinguished Service Order (DSO) alang sa "kaisug, enterprise, ug sa debosyon sa katungdanan sa bag-ohay nga mga pakig-away"<unk> sa partikular, ang iyang pinpoint sa kaaway minahan. Sa samang bulan, siya gibalhin ngadto sa HMAS "Vampire" samtang ang "Stuart" giayo. Sa dihang ang Allied nga mga kasundalohan misugod sa pagkontra-atake sa Italyanhong mga puwersa sa Disyembre 1940, ang Komander-in-Chief sa Mediterranean Fleet, si Admiral Sir Andrew Cunningham, mihatag kang Waller sa mando sa bag-ong naporma nga Inshore Squadron, nga naglangkob sa mga destroyer, mga minasweeper, ug mga auxiliary. Sa iyang papel ingon sa Cunningham's Senior Officer Afloat, si Waller maoy nagdumala sa naval support alang sa pag-atake sa Bardia
, nga napukan sa mga Alyado niadtong Enero 5, 1941. Wala madugay human niana, iyang gipasagdan ang mando sa Inshore Squadron ug gibalhin balik sa "Stuart".