Kompletoha ang mosunod nga pulong: Sa dihang nagsugod ang Gubat Sibil sa Amerika niadtong 1861, si Fesler midapig sa Unyon. Sa Agosto 30, 1861, siya nagpalista sa Union Army sa Morgantown, Indiana. Si Fesler nahimong Kapitan sa Kompanya G sa ika-27 nga Indiana Infantry Regiment. Si Fesler nagmando sa iyang kompaniya sa
Ang Unang Gubat sa Winchester ug sa Gubat sa Cedar Mountain. Sa 1862, ang Fesler's Regiment giasayn sa 12th Army Corps, diin kini magpabilin sa tibuok 1863. Dayon si Fesler nagmando sa iyang kompaniya panahon sa Battle of Antietam, duol sa Sharpsburg, Maryland, sa Septiyembre 17, 1862. Ang iyang regimiento migugol sa tingtugnaw sa 1862 ngadto sa 1863 nga nagkampo sa Stafford Courthouse, Virginia, ug sa Pebrero 13, 1863, si Fesler gipromot nga Lt. Colonel sa ika-27 nga Indiana. Niadtong Marso 1863, ang 12th Corps, diin ang 27th Indiana usa ka bahin, gihatagan ug bituon ingon nga badge sa iyang corps. Sa Mayo 5, 1863, si Fesler nasamdan sa pag-away sa panahon sa Battle of Chancellorsville, sa Spotsylvania County, Virginia. Siya dayon temporaryo misugo sa 27th Indiana gikan sa Hulyo 2-3, 1863 sa panahon sa Battle sa Gettysburg sa diha nga ang koronel sa regimiento gibutang sa pagmando sa iyang brigada. Si Fesler ug ang iyang regimiento unya miapil sa pagpugong sa New York City Draft Riots sa ulahi nianang bulana.