Kompletoha ang mosunod nga mga pulong: Ubos sa mga instruksiyon ni Madani, siya miapil ug nahimong lider sa Indian nga kalihokan alang sa kagawasan. Human sa Partisyon sa India sa 1947, si Chowdhury misuporta sa kalamboan sa bag-ong gilalang nga Pakistan, nga nagtrabaho kauban ang pagpangulo sa organisasyon sa Jamiat Ulema-e-Hind. Human sa Bangladesh
sa pagdeklarar sa kagawasan sa 1971, siya misulay sa pagpugong sa mga insidente sa kapintasan batok sa mga tawo sa Pakistan nga militar. Sa dihang ang 50 sa iyang mga paryente sa Ronokali gipiit sa kasundalohan, si Chowdhury malamposong mihangyo sa mga sundalo sa pagluwas kanila. Sa laing okasyon, siya naka-interbensyon sa pagluwas sa kinabuhi sa pito ka Hindu nga anaa sa susamang mga kahimtang. Sa ulahi si Chowdhury aktibo nga miapil sa kalihokan sa Khilafat sa Bangladesh, nga nagtrabaho ubos sa pagpangulo ni Hafezzi Huzur ug nangulo sa daghang mga komperensya niini.