Sa 1172 ang Murcia gisakop sa amihanang Aprikanhong mga Almohades, ang kataposang Muslim nga imperyo nga nagmando sa habagatang Espanya, ug sa dihang ang mga puwersa sa Kristohanong Reconquista nakab-ot ang labaw nga kamot, mao kini ang kaulohan sa usa ka gamay nga Muslim nga emirato gikan sa 1223 ngadto sa 1243. Pinaagi sa pakigsaad sa Alcaraz, sa 1243, ang Kristohanong hari nga si Ferdinand III sa Castile naghimo sa Murcia nga usa ka protektorado, nga nakabaton ug kahigayonan sa pag-adto sa Mediteranyo nga dagat samtang ang Murcia gipanalipdan batok sa Granada ug Aragon. Ang Kristohanong populasyon sa lungsod nahimong kadaghanan samtang ang mga lumulupyo miulbo gikan sa halos tanang bahin sa Iberian Peninsula. Ang Kristohanong imigrasyon giawhag uban ang tumong sa pagtukod ug maunongong Kristohanong pundasyon. Kining maong mga lakang mitultol sa popular nga pagrebelde sa mga Muslim
sa 1264, nga gipugngan ni James I sa Aragon sa 1266, nga nagsakop sa Murcia ug nagdala sa mga Aragonese ug Catalan nga mga imigrante uban kaniya.