Pagkompleto sa mosunod nga mga pulong: Pagpalista sa Union Army sa Mayo 1861, siya nakadawat sa usa ka komisyon ingon nga usa ka opisyal sa 9th New York Volunteer Infantry Regiment, popular nga nailhan nga "Hawkins' Zouaves", ug sa ulahi ang IX Army Corps diin siya nagserbisyo ubos sa Heneral Benjamin Butler sa Battle of Big Bethel ug
Hatteras Inlet nga ekspedisyon. Sa 1862, siya miuban sa Army sa Potomac sa General Ambrose Burnside ni Roanoke ekspedisyon ug miapil sa mga gubat sa Hatteras Inlet, Roanoke Island, South Mountain, Antietam ug Fredericksburg. Duha ka beses nga nasamdan sa panahon sa kampanya, si Jardine gipataas ngadto sa ranggo sa mayor alang sa "gallant conduct" ug sa makadiyot nagmando sa 89th New York Infantry Regiment.