Ang pagsalig sa mga Hapones sa ilang katakos sa pagdaog sa dali nga kadaogan nagpasabot nga wala nila tagda ang mga depasahe sa pag-ayo sa mga barko sa Pearl Harbor, mga tanka sa langis, base sa mga submarino, ug karaang bilding sa hedkuwarter. Kining tanan nga mga tumong wala ilakip sa listahan ni Genda, apan sila napamatud-ang mas importante kay sa bisan unsang barko sa gubat sa Amerikanhong paningkamot sa gubat sa Pasipiko. Ang pagpadayon sa mga tindahan sa pag-ayo ug mga deposito sa gasolina nagtugot sa Pearl Harbor sa pagpadayon sa logistic nga suporta sa mga operasyon sa US Navy, sama sa Doolittle Raid ug sa mga Gubat sa Coral Sea ug Midway
. Ang mga submarino maoy nagpugong sa dagkong mga barko sa Imperial Japanese Navy ug nagpahinabo sa ekonomiya sa Hapon nga hapit na mahurot pinaagi sa pagpaluya sa pag-importar ug langis ug mga hilaw nga materyales: sa kataposan sa 1942, ang gidaghanon sa mga hilaw nga materyales nga gidala gipakunhod sa katunga, "ngadto sa katalagmanong napulo ka milyong tonelada", samtang ang langis "halos bug-os nga nahunong". Sa kataposan, ang basement sa Old Administration Building mao ang pinuy-anan sa cryptanalytic nga yunit nga nakatampo pag-ayo sa Midway ambush ug sa kalamposan sa Submarine Force.