Kompletoha ang mosunod nga mga pulong: Nagatomo nagsugod sa iyang ikaduha nga Inter Milan panahon pinaagi sa pagdula 62 minutos sa pag-abli
Serie A duwa batok sa Palermo, natapos sa usa ka 4 sa 3 away kapildihan. Sa 27 Septyembre 2011, Nagatomo gihatag sa usa ka pagtabang alang sa Giampaolo Pazzini pinaagi sa nutmegging Aleksei Berezutski sa wala pa sa pagmaneho sa bola tabok sa tumong sa panahon sa 3 <unk> 2 sa gawas nga pagdaog batok sa CSKA Moscow sa ikaduha nga grupo sa hugna sa dula sa Champions League. Siya mipunting sa iyang unang tumong sa panahon sa 10 Disyembre 2011 sa panahon sa 2 <unk> 0 sa balay nga kadaugan batok sa Fiorentina sa matchday 15 sa Serie A. Siya sa pag-usab sa scoresheet tulo ka adlaw sa ulahi ingon nga siya nag-ulo sa balay sa usa ka Ricky Álvarez krus sa 1 <unk> 0 kadaugan batok sa Genoa. Sa katapusan nga duwa sa 2011 batok sa Lecce sa balay, Nagatomo nga gihimo sa usa ka "tawo sa duwa" performance pinaagi sa paghatag sa duha ka makatabang sa usa ka sa ulahi 4<unk>1 kadaugan.