Ang Pagkalagiw sa mga Earls niadtong 1607 nagbilin kaniya ingong usa sa labing senior nga mga tawo sa Gaelic nga nahibilin sa Ulster. Niadtong 1608 sa dihang si Sir Cahir O'Doherty naglansad sa Rebelyon ni O'Doherty pinaagi sa pagsunog sa Derry
Si MacDonnell wala maghunahuna sa pagpakig-uban kaniya. Si O'Doherty, usa ka kanhing maunongon sa Korona nasuko sa pagtratar kaniya sa lokal nga mga opisyal. Si O'Doherty napildi ug namatay sa Gubat sa Kilmacrennan ug ang pagrebelde nahugno. Human sa rebelyon ang gobyerno nakahukom sa pagdala ug mas halapad nga Plantasyon sa Ulster kay sa orihinal nga giplano. Kini wala kaayo makaapektar sa MacDonnell ingon nga mga Counties Antrim ug Down wala ilakip gikan sa Plantation, ingon nga ang dako nga-scale Scottish settlement na nga nahitabo didto.