Isulat ang usa ka pagpadayon alang niini nga parapo - Pinturault wala makahimo sa paghimo sa panahon sa pagsugod sa Sölden sa Oktubre 2012, ingon nga siya nasamdan sa iyang bukobuko samtang nagdula tennis ug kinahanglan nga mohunong alang sa usa ka tulo ka bulan nga panahon. Sa Disyembre, siya midaog sa iyang ikaduhang lumba sa World Cup diha sa slalom sa Val-d'Isère, diin siya nakapahingangha sa mga tagahanga sa balay pinaagi sa usa ka maanindot nga ikaduhang pagdagan ilalom sa mga suga sa tubig aron mobangon gikan sa ikaunom nga dapit. Siya makombinsir nga nakabuntog sa Aleman nga si Felix Neureuther ug sa umaabot nga kampiyon sa World Cup nga si Marcel Hirscher, nga nanguna sa 0.57 segundo human sa unang run. Ang ikatulong kadaogan ni Pinturault maoy sa super-combined sa Wengen, Switzerland, diin ang iyang labaw nga mga kahanas sa slalom maoy hinungdan. Human sa pagbutang sa ika-22 sa downhill nga bahin, siya nahuman 1.15 segundo sa unahan ni Ivica Kostelić sa Croatia. Ang pagbansay sa pagdalagan alang sa downhill nga bahin mao ang iyang unang higayon sa downhill skis sulod sa mga bulan, tungod kay siya nawala sa pre-season speed training human sa operasyon sa iyang wala nga bukobuko sa Agosto aron ayohon ang mga ligamento nga nadaot samtang nagdula og tennis. Pinturault wala medalya sa kalibutan championships sa 2013
, apan may upat ka top-six nga mga finishes. Usa ka semana sa ulahi siya miangkon ug ikaupat nga kadaogan sa World Cup, ang iyang unang kadaogan sa higanteng slalom, sa Garmisch, Alemanya. Ikaduha human sa unang run, ang kinatibuk-ang panahon ni Pinturault 0.60 segundo sa unahan sa runner-up nga si Hirscher. Sa Marso 15, siya gipasidunggan ingon sa 2013 Longines Rising Star, ingon sa top batan-ong racer (sa ilalum sa 23) sa panahon.