Isulat ang pagpadayon niining parapoha - Si Kovalyov maoy usa ka dayag nga kritiko sa awtoritaryanong mga kiling sa mga administrasyon ni Boris Yeltsin ug Vladimir Putin. Niadtong 1996, mibiya siya isip pangulo sa komisyon sa tawhanong katungod ni Yeltsin, human sa pag-publish sa usa ka bukas nga sulat ngadto kang Yeltsin, diin si Kovalyov miakusar sa presidente nga mibiya sa demokratikong mga prinsipyo. Niadtong 2002, iyang giorganisar ang usa ka komisyon sa publiko sa pagsusi sa mga pagbomba sa apartment sa Moscow niadtong 1999
(ang Komisyon ni Kovalyov), nga sa pagkatinuod naparalisado human ang usa sa mga membro niini, si Sergei Yushenkov, gipatay, ang laing membro, si Yuri Shchekochikhin, gituohang gihugawan ug thallium, ug ang legal nga magtatambag ug tig-imbestiga niini, si Mikhail Trepashkin, gidakop.