Isulat ang pagpadayon niining parapoha - Panahon sa Pagrebelde ni O'Doherty sa 1608 siya mibalik sa aktibong pagserbisyo uban sa Irish Army, human sa Pagsunog sa Derry
. Sa 1624, napili siya nga Mayor sa Derry. Siya usa ka lig-on nga tigsuporta ni George Villiers, 1st Duke sa Buckingham ug nangulo sa usa ka pwersa sa Irish nga mga tropa sa pag-alagad ubos kaniya sa Siege sa La Rochelle. Siya namatay panahon sa gubat sa Pont du Feneau.