Pag-base sa iyang mga ideya sa mga sa mga nanguna sama sa Williamson, Edward Frankland, William Odling, Auguste Laurent, Charles-Adolphe Wurtz ug uban pa, Kekulé mao ang nag-unang formulator sa teoriya sa kemikal nga istruktura (1857<unk>58). Kini nga teoriya naggikan sa ideya sa atomikong valence, ilabi na ang tetravalence sa carbon (nga Kekulé gipahibalo sa ulahing bahin sa 1857) ug sa abilidad sa carbon atoms sa link sa usag usa (gipahibalo sa usa ka papel nga gipatik sa 1858), sa determinasyon sa bug-os nga propesor sa sa University of Ghent, unya sa 1867 siya gitawag sa Bonn, diin siya nagpabilin alang sa nahibilin sa iyang karera. Ang pipila sa iyang mga ideya nga gibase sa mga nanguna sama sa Williamson, Edward Frankland, William Odling, Auguste Laurent, Charles-Adolphe Wurtz ug uban pa, Kekulé mao ang nag-una nga naggamit sa mga ideya sa kemikal nga istruktura nga mga pamaagi sa pagtuki sa kemikal nga gitawag nga "ang mga sinte nga mga
kemikal nga istruktura