Els proteasomes són part d'un mecanisme principal pel qual les cèl·lules regulen la concentració de proteïnes particulars i degraden les proteïnes mal plegades. Les proteïnes són etiquetades per a la degradació amb una petita proteïna anomenada ubiquitina. La reacció d'etiquetatge és catalitzada per enzims anomenats ligases d'ubiquitina. Una vegada que una proteïna és etiquetada amb una sola molècula d'ubiquitina, això és un senyal a altres ligases per unir molècules addicionals d'ubiquitina. El resultat és una cadena de poliubiquitina que està lligada pel proteasoma, permetent-li degradar la proteïna etiquetada. El procés de degradació produeix péptids d'uns set a vuit aminoàcids de llarg, que després es poden degradar més endavant en seqüències d'aminoàcids més curts i utilitzar en la síntesi de noves proteïnes.
ligases de ubiquitina