A principis de juny, el "Yamato" i el "Musashi" van ser requisats novament com a transports de tropes, aquesta vegada per reforçar les defenses navals i de guarnició de l'illa de Biak com a part de l'Operació Kon
- No. La missió va ser cancel·lada quan la notícia va arribar a la seu d'Ozawa dels atacs dels portaavions nord-americans a les Illes Marianes. En canvi, la Marina Imperial Japonesa es va reorganitzar, concentrant la majoria de la seva força de combat restant amb l'esperança d'aconseguir un èxit decisiu contra els nord-americans. En aquesta època, però, tota la marina japonesa era inferior en nombre i experiència a la Flota del Pacífic dels Estats Units. Del 19 al 23 de juny de 1944, el Yamato va escoltar les forces de la Flota Móbil d'Ozawa durant la Batalla del Mar de les Filipines, anomenada pels pilots nord-americans "The Great Marianas Turkey Shoot". Els japonesos van perdre tres portaavions i 426 avions; l'única contribució significativa de "Yamato" va ser obrir foc per error contra avions japonesos que tornaven.