Escriu una continuació per a aquest paràgraf - La investigació i els escrits de Beinin es centren en els treballadors, camperols i minories de l'Orient Mitjà modern. Tot i que inicialment estava interessat en l'ascens d'una classe obrera àrab a la Palestina obligatòria, sota l'assessorament del seu supervisor de tesi, va canviar el tema de la seva tesi doctoral a una història del moviment obrer egipci des de 1936. Aquesta tesi de doctorat es va combinar amb una que cobria un període anterior de la història del treball egipci per part del seu amic i col·lega Zachary Lockman i va resultar en la publicació de "Trabajadores del Nil: nacionalisme, comunisme, islam i la classe obrera egipcia, 1882<unk>1954" (1989). Entre els seus treballs posteriors hi ha un estudi de les comunitats jueves de l'Egipte modern que va conduir al seu major estudi històric, "La dispersió dels jueus egipcis: cultura, política i la formació d'una diàspora moderna" (1998), que examina la diversitat de les identitats jueves egipcies a Egipte i a la diàspora. Ha participat en el treball de camp per recopilar informes orals entre moltes comunitats jueves egipcies disperses per tot el món després de la Guerra de Suez.
de 1956, entre ells els caraïtes de San Francisco.