El Sudan del Sud va obtenir la seva independència del Sudan el 2011, però la Guerra Civil sud-sudanesa va fer que fos difícil per a la nació obtenir el suport de cinc federacions esportives com es requereix per al seu Comitè Olímpic Nacional per obtenir el reconeixement del Comitè Olímpic Internacional. Guor Marial, un refugiat sud-sudanès que viu als Estats Units, va competir en la marató masculina als Jocs Olímpics d'estiu de 2012
, però ho va fer com a atleta independent olímpic després de negar-se a competir per Sudan. El Sudan del Sud es va convertir en el 206è membre del COI l'agost de 2015, amb les afiliacions d'atletisme, bàsquet, futbol, balon, judo, tennis de taula i taekwondo. La nació va triar Marial com a portabandera tant per a les cerimònies d'obertura com de tancament.