Escriu una continuació per a aquest paràgraf - Keene també ha participat en l'organització de diversos partits de finals del Campionat del Món. Va organitzar la primera meitat del Campionat del Món d'Escacs de 1986
partit de tornada entre Kasparov i Karpov a Londres. El partit, però, va ser una derrota per a la Federació Britànica d'Escacs (BCF) i, per raons mai aclarides, va dimitir de la seva posició a la BCF poc després. Va organitzar el partit del Campionat del Món PCA de 1993 entre Kasparov i Nigel Short a Londres, per al qual va ser un dels comentaristes oficials juntament amb els grans mestres Jonathan Speelman i Daniel King. Va ser la força instrumental darrere de 'Brain Games', que va organitzar el partit del Campionat del Món el 2000 entre Kasparov i Vladimir Kramnik. No obstant això, després del partit, va conservar el trofeu en lloc dels diners que creia que li era degut pel col·lapse de Brain Games: Kramnik no el va rebre fins al 2008. Brain Games més tard va col·lapsar en circumstàncies controvertides.