En juny de 1849, Haynau va ser cridat a Viena per comandar un exèrcit de reserva; li va ser ordenat entrar al camp contra els hongaresos.
durant la seva revolució i finalment va aconseguir derrotar-la amb l'ajuda d'una força intervencionista russa aclaparadora, demostrant ser un líder eficaç però despietat. La seva estratègia agressiva pot haver estat motivada en part pel seu desig de fer que Àustria, en lloc de Rússia, aparegués com el principal vencedor de la guerra. De fet, el general va qüestionar la saviesa d'invitar els russos a intervenir, ja que considerava que Àustria, amb reforços d'Itàlia, podria haver guanyat la guerra per si sola.