El 26 de gener de 2016, Falwell va anunciar el seu suport a Donald Trump per a la nominació republicana a les eleccions presidencials de 2016, fent que alguns exalumnes de la Universitat Liberty i altres evangèlics expressessin la seva preocupació que Falwell havia "vendut la seva ànima". Més tard es va revelar, en una conversa gravada en secret amb el comediant Tom Arnold, que l'advocat personal de Trump i el "fixador" Michael Cohen, havia ajudat a Falwell a recuperar fotos comprometedores abans d'assegurar el seu suport. El 21 de juliol de 2016, a la convenció RNC a Cleveland, Ohio
, Falwell Jr. va anomenar Trump "mil-milliardari de collar blau d'Amèrica" i "un dels més grans visionaris del nostre temps" en la seva aprovació del candidat que va sentir més probable que defensés el "dret a portar armes", "deté l'Iran... de convertir-se en una potència nuclear" i "nominar jutges conservadors a favor de la vida al Tribunal Suprem".