El club va ser fundat el 4 de febrer de 1899 com a Fußballverein Werder per un grup de 16 estudiants d'escola secundària vocacional que havien guanyat un premi d'equip esportiu. Els estudiants van prendre el nom del club d'una paraula alemanya per a "península fluvial", que descrivia el camp riberenc en el qual van jugar els seus primers partits de futbol. El predecessor de Bremen, conegut com a SV Werder, va jugar el seu primer partit el 10 de setembre de 1899 contra l'ASC 1898 Bremen venint amb una victòria de 1<unk>0. El 1900, el FV Bremen va ser representat en la fundació de la Federació Alemanya de Futbol (BDF) a Leipzig. El club va gaudir d'alguns èxits inicials, guanyant partits competitius i guanyant un nombre de campions locals.
El Fußballverein Werder