Com que les proteïnes són massa petites per ser vistes sota un microscopi de llum, cal emprar altres mètodes per determinar la seva estructura. Els mètodes experimentals comuns inclouen la cristal·lografia de raigs X i l'espectroscòpia de RMN, que poden produir informació estructural a resolució atòmica. No obstant això, els experiments de RMN són capaços de proporcionar informació des d'on es pot estimar un subconjunt de distàncies entre parells d'atoms, i les possibles conformes finals d'una proteïna es determinen mitjançant una geometria de distància.
cristal·lografia electrònica