També el 1896, Armand Peugeot es va separar de Les Fils de Peugeot Frères per formar la seva pròpia empresa, Société Anonyme des Automobiles Peugeot, construint una nova fàbrica a Audincourt per centrar-se totalment en cotxes. El 1899, les vendes van arribar als 300; les vendes totals de cotxes per a tota França aquell any eren 1.200. El mateix any, Lemaître va guanyar el Rallye de Niça-Castellane-Niça en un especial 5.850 cc (357 cu in) de 20 hp (14.9 kW) de carrer. Al Salon de París de 1901, Peugeot va debutar amb un diminut eix de 652 cc (40 cu in) de 5 hp (3.7 kW) de un cilindre, anomenat "Bébé" ("baby"), i va perdre el seu estil conservador, convertint-se en un líder d'imatge.
El 1896