Les negociacions de pau amb Àustria no van anar a cap lloc a la primavera de 1799, i el Directori va decidir llançar una nova ofensiva a Alemanya, però l'arribada d'un exèrcit rus sota Alexander Suvorov i forces austríaques fresques sota l'arciduque Carles van canviar l'equilibri de poder durant un temps. L'Exèrcit del Danubi de Jourdan va creuar el Rin el 6 de març, però va ser derrotat per l'Arxiduc Carles, primer a la Batalla d'Ostrach
i després a la Batalla de Stockach el 25 de març de 1799. L'exèrcit de Jourdan es va retirar mentre que el mateix Jourdan va tornar a París per demanar més soldats.