A causa del seu interès en la hipòtesi de la transmutació, va prestar especial atenció a la distribució geogràfica d'espècies estretament aliades durant el seu treball de camp primer a Amèrica del Sud i després a l'arxipèlag de Malàisia. Mentre que a l'arxipèlag va identificar la línia de Wallace, que travessa les illes Spice dividint la fauna de l'arxipèlag entre una zona asiàtica i una zona de Nova Guinea / Austràlia. La seva pregunta clau, per què la fauna de les illes amb climes tan similars hauria de ser tan diferents, només es podria respondre considerant el seu origen.
Ernst Haeckel