Completa la següent frase: Quan es va fundar el New York State Agricultural College (més tard fusionat amb la Cornell University) a Ovid, Nova York, Kimball va esdevenir professor de Química i Geologia Econòmica. Amb l'esclat de la Guerra Civil Americana el 1861, el president de l'universitat, el major M. R. Patrick va ser nomenat general de brigada de Voluntaris; Kimball va esdevenir cap d'Estat Major del general de brigada Patrick, amb el rang de capità. Va veure el servei de camp sota el major general Irvin McDowell, i va estar present a la Segona Batalla de Bull Run (28-30 d'agost de 1862);
Batalla de Chantilly (1 de setembre de 1862); Batalla de South Mountain (14 de setembre de 1862); Batalla d'Antietam (17 de setembre de 1862); Batalla de Fredericksburg (11-15 de desembre de 1862); Batalla de Chancellorsville (30 d'abril a 6 de maig de 1863); i Batalla de Gettysburg (1 de juliol de 1863). El general de brigada Patrick va ser nomenat llavors mariscal provost de l'Exèrcit del Potomac, i el capità Kimball el va acompanyar allà, servint a l'Estat Major sota els generals George B. McClellan, Ambrose Burnside, Joseph Hooker i George Meade successivament.