Els anys 1980 van ser un període de turbulències fora del camp per al Bayern, amb molts canvis en el personal i problemes financers. En el camp, Paul Breitner i Karl-Heinz Rummenigge, anomenats FC Breitnigge, van portar l'equip a guanyar els títols de Bundesliga el 1980 i 1981. A part d'una victòria en la DFB-Pokal el 1982, van seguir dues temporades relativament infructuoses, després de la qual Breitner es va retirar i l'ex entrenador Udo Lattek va tornar. El Bayern va guanyar la DFB-Pokal el 1984 i va guanyar cinc campionats de Bundesliga en sis temporades, incloent un doble el 1986.
cinc