El seu primer matrimoni amb Brigitte Stütze va produir tres fills, dos fills i una filla, i va acabar en divorci el 1966. Ell i la seva segona esposa, Irmgard Elsa Kaul, van tenir una filla, Carolin Masur, que es va convertir en cantant d'òpera. Irmgard Masur va morir el 1972 en un accident de cotxe en el qual Masur va resultar greument ferit. El 1975, es va casar amb la seva tercera esposa, soprano i violinista, Tomoko Sakurai: van tenir un fill, Ken-David, un cantant i director d'orquestra clàssica.
tres