El comtat Warren és un comtat situat a la part oriental de l'estat de Missouri, als Estats Units. El comtat va ser organitzat el 5 de gener de 1833, i va ser anomenat així pel general Joseph Warren, que va morir a la Batalla de Bunker Hill durant la Guerra d'Independència dels Estats Units. El comtat és part de l'Àrea Estadística Metropolitana de St. Louis, MO-IL. El comtat és travessat per la Ruta 94, anomenada "Missouri Weinstrasse" a causa de les moltes vinyes de Marthasville a l'est de St. Charles.
Comtat de Warren