Escriu una continuació per a aquest paràgraf - Des de novembre de 1999 a novembre de 2001, va ser director de amenaces transnacionals en el personal del Consell de Seguretat Nacional (NSC), on va ser responsable de la coordinació i implementació de la política antiterrorista dels Estats Units. Durant aquest període, va gestionar la resposta del govern dels EUA a l'alerta terrorista del mil·lenni, l'atac de l'USS "Cole"
, i els atacs de l'11 de setembre. Durant el seu temps al NSC, Cressey va demanar que es prenguessin mesures contra Al-Qaeda i Bin Laden, que van ser ignorades fins a l'11 de setembre.