Kanouté va jugar per a l'equip nacional malià sub-18 al Campionat Africà FIBA Sub-18 de 2018 a Bamako. Va fer una mitjana d'equip de 14,3 punts, 5,4 assistències i 4,4 rebots per partit, i va portar el seu equip a la seva primera medalla d'or en el torneig. Kanouté va registrar 10 punts, sis rebots i cinc assistències contra Senegal a la final i va ser nomenat MVP del torneig. Més tard va participar a la Copa del Món FIBA Sub-19 de 2019
a Heraklion, Grècia. En set partits, Kanouté va fer una mitjana de 15,4 punts, 5,1 assistències i 2,4 robades per partit, ajudant a Mali a capturar una medalla d'argent improbable, la millor actuació d'un equip africà en el torneig. Va ser nomenat All-Star Five amb el seu company d'equip Oumar Ballo.