La decepció s'intensificaria al maig, però, quan Jones no va aconseguir la qualificació per a les 500 milles d'Indianapolis del 2007. El seu cotxe número 40 havia estat pintat per a semblar el que el seu pare va utilitzar en les 500 milles d'Indianapolis del 1967
quaranta anys abans; aquest cotxe era impulsat per un motor de turbina de gas i utilitzava un sistema de tracció a les quatre rodes. Ambdues tecnologies havien estat prohibides des de llavors a l'Speedway i no es van presentar en l'entrada de 2007 per a Jones.