Escriu una continuació per a aquest paràgraf - El febrer de 1939, Pétillon va demanar ser enviat al Congo Belga i va rebre un lloc com a "chef de cabinet" del governador general, Pierre Ryckmans. Encara estava al Congo el maig de 1940 quan Bèlgica va ser envaïda per Alemanya. Tot i ser el "chef de cabinet" de De Vleeschauwer amb el govern belga a l'exili a Londres, Pétillon va passar la major part de la Segona Guerra Mundial al Congo. Després de la liberació de Bèlgica
al setembre de 1944, Pétillon va jugar un paper important en el restabliment de les relacions entre l'administració colonial a l'Àfrica i el Ministeri de les Colònies.