El 31 d'agost de 2015, Ljajić va signar a l'Internazionale en préstec per tota la temporada, amb l'Inter pagant a la Roma 1,75 milions d'euros i incloent una opció per fer el trasllat permanent al final de la temporada.
per 11 milions d'euros. L'1 de desembre de 2015, Ljajić va marcar el seu primer gol a l'Inter en una derrota per 2-1 a Napoli.