La ciutat va prosperar actuant com a enllaç entre la Gal·lia interior, famolenca de béns i vi romans (que Massalia estava exportant constantment cap al 500 aC), i la necessitat insaciable de Roma de nous productes i esclaus. Durant les Guerres Púniques, Annibal va creuar els Alps
al nord de la ciutat. El 123 aC, Massalia es va enfrontar a una invasió dels Allobroges i Arverni sota Bituitus; va entrar en una aliança amb Roma, rebent protecció de les legions romanes sota Q. Fabius Maximus i Gn. Domici Ahenobarbo va derrotar els gallesos a Vindalium el 121 aC a canvi de cedir una franja de terra a través del seu territori que es va utilitzar per construir la "Via Domitia", una carretera a Espanya. La ciutat va mantenir així la seva independència una mica més de temps, tot i que els romans van organitzar la seva província de Gàllia Transalpina al seu voltant i van construir una colònia a Narbo Martius (Narbona) el 118 aC que posteriorment va competir econòmicament amb Massalia.