Molts patògens van evolucionar diversos mètodes que els permeten infectar amb èxit un hoste, mentre eviten la detecció o destrucció pel sistema immunitari. Altres bacteris sovint superen les barreres físiques mitjançant la secreció d'enzims que digereixen la barrera, per exemple, mitjançant l'ús d'un sistema de secreció de tipus II. Alternativament, utilitzant un sistema de secreció de tipus III, poden inserir un tub buit a la cèl·lula hoste, proporcionant una via directa per a que les proteïnes es desplacin del patògen a l'hoste. Aquestes proteïnes s'utilitzen sovint per tancar les defenses de l'hoste. Una estratègia d'evasió utilitzada per diversos patògens per evitar el sistema immunitari innat és amagar-se dins de les cèl·lules de l'hoste (anomenats patògens intracel·lulars).
cèl·lules immunitàries, anticossos i complement