El sostre de l'església va ser greument danyat en el bombardeig aeri sobre Varsòvia el 1939
i després va ser destruït per foc el 1944 durant l'aixecament de Varsòvia, però aviat va ser reparat. El 1949 les parets van ser minades per l'excavació per a la ruta WZ i van haver de ser ràpidament reforçades. La restauració de tots els elements es va dur a terme des de la dècada de 1940-1970, supervisada per l'arquitecte.