Les seves 24 hores de Le Mans de 1999 van començar amargament després que l'equip fos atormentat per múltiples fallades de pneumàtics Michelin, la situació es va convertir en una reminiscència de 1998, quan els cotxes núm. 1 i núm. 2 es van retirar. Martin Brundle en el Toyota número 1 va patir una punció a gran velocitat en la recta de Mulsanne, la suspensió posterior del cotxe va ser greument danyada i no va poder tornar als boxes. El Toyota número 2 conduït per Thierry Boutsen va ser el següent a morir quan va patir un accident a gran velocitat sota el pont Dunlop a causa d'una ràpida deflació. El cotxe va ser destruït i Boutsen va patir lesions a la seva esquena. A l'alba, el BMW núm. 15 estava gairebé una volta per davant del Toyota núm. 3 que havia estat circulant tranquil·lament a un ritme constant. Amb aquesta olor de victòria Ukyo Katayama va posar el peu a la Toyota i va marcar la volta més ràpida de la cursa. Va reduir la diferència a menys d'un minut fins que una altra vegada un pneumàtic va rebentar l'equip Toyota de nou. Katayama va ser capaç de tornar als boxes per a pneumàtics nous i va continuar. Va aconseguir acabar segon després d'un valent esforç per ocupar el primer lloc a la classe GT-P. No obstant això, no van aconseguir la victòria general a Le Mans, el que els hauria fet només el segon fabricant japonès a obtenir una victòria general (Mazda va ser el primer el 1991).
)