Completa la següent frase: El 28 d'agost de 1941, més de dos mesos després de l'Operació Barbarossa, la invasió alemanya de la Unió Soviètica va començar, Pukhov va rebre l'ordre de reemplaçar el comandant de la 304a Divisió de Rifles del 38è Exèrcit; aquest va ser el seu primer comandament de camp des del regiment de rifles uns 15 anys abans. A principis de setembre va ser traslladat a la zona de Kozelshchyna, on fins al 17 de setembre va patir greus pèrdues en intensos combats defensius, retrobant-se a l'est a la zona de Sanzhery, Reshetylivka i Poltava. El 304 va lluitar en l'Operació Defensiva de Donbass durant l'octubre, després es va retirar a la reserva a la zona de Snezhny Kut. Pukhov va ocupar aquest càrrec fins al 20 de gener de 1942, quan li va ser donat el comandament del 13è Exèrcit, que va ocupar fins a mitjans de 1946. Fins a mitjans de 1942 l'exèrcit, part del Front de Bryansk, va mantenir posicions defensives a la línia de Skorodnoye i Kolpny. L'exèrcit va lluitar en la
Batalla de Voronezh a mitjans de 1942 i l'operació ofensiva de Voronezh-Kastornensk a principis de 1943. El 14 de febrer, després d'aquest, Pukhov va ser ascendit a tinent general. Durant la Batalla de Kursk al juliol, l'exèrcit, que mantenia posicions a la cara nord de la protuberància de Kursk, va repel·lir sis dies d'atacs alemanys en ferotges combats, impedint una breca alemanya i limitant l'avanç alemany a 10 × 12 quilòmetres. Quan les tropes soviètiques van passar a l'atac després de derrotar decisivament l'exèrcit alemany, el 13è Exèrcit va lluitar en l'Operació Kutuzov.