Escriure una continuació per a aquest paràgraf - Sostenut en molts cercles per les seves polítiques anticomunistes de llarga data, Orfila, no obstant això, es va oposar activament a la marea de violacions dels drets humans a Amèrica Llatina. Treballant amb el president Carter i la secretària d'Estat adjunta per als Drets Humans dels Estats Units, Patricia Derian, va dirigir la llavors inactiva Comissió Interamericana de Drets Humans en investigacions dins de règims repressius com el del seu propi país, la junta militar argentina; després d'investigar acusacions d'assassinats polítics i segrestos generalitzats
el setembre de 1979, l'informe de 1980 de la comissió va eliminar qualsevol dubte sobre l'estat de les llibertats en el país en aquell moment, i va ajudar a conduir a una millora en el clima de les llibertats civils.