El 1801, Johann David Schoepff va anomenar el descobriment de Muhlenberg com Testudo muhlenbergii en honor de Muhlenberg. El 1829, Richard Harlan va canviar el nom de la tortuga Emys muhlenbergii. L'espècie va ser posteriorment reanomenada a Calemys muhlenbergii per Louis Agassiz el 1857, i a Clemmys muhlenbergii per Henry Watson Fowler el 1906.
Emys muhlenbergii