El 1543 Andreas Vesalius va inaugurar l'era moderna de la medicina occidental amb el seu tractat d'anatomia humana seminal De humani corporis fabrica, que es basava en la dissecció de cadàvers. Vesalius va ser el primer d'una sèrie d'anatomistes que van reemplaçar gradualment l'escolàsticisme amb l'empirisme en fisiologia i medicina, basant-se en l'experiència de primera mà més que en l'autoritat i el raonament abstracte. A través de l'herborisme, la medicina també va ser indirectament la font de l'empirisme renovat en l'estudi de les plantes. Otto Brunfels, Hieronymus Bock i Leonhart Fuchs van escriure extensament sobre les plantes, el començament d'un enfocament basat en la natura a la gamma de la vida vegetal.
plantes silvestres