Abans de l'inici de la temporada 2005/06, el Bayern es va traslladar de l'Olympiastadion a la nova Allianz Arena, que el club comparteix amb 1860 Munic. En el camp, el seu rendiment el 2006/07 va ser erràtic. Perder-se en la lliga i haver perdut a Alemannia Aachen en la copa una vegada més, l'entrenador Magath va ser acomiadat poc després de la pausa d'hivern.
Allianz Arena