Laveran va ser guardonat amb el Premi Bréant de l'Acadèmia Francesa de Ciències el 1889 i la Medalla Edward Jenner de la Royal Society of Medicine el 1902 pel seu descobriment del paràsit de la malària. Va rebre el Premi Nobel de Fisiologia o Medicina el 1907. Va donar la meitat del Premi per la fundació del Laboratori de Medicina Tropical a l'Institut Pasteur. El 1908 va fundar la Société de pathologie exotique, que va presidir durant 12 anys. Va ser elegit membre de l'Acadèmia Francesa de Ciències el 1893, i va ser conferit Comandant de l'Orde Nacional de la Legió d'Honor el 1912. Va ser director honorari de l'Institut Pasteur el 1915, en el seu 70è aniversari. Va ser elegit President de l'Acadèmia Francesa de Medicina el 1920.
Premi Nobel de Fisiologia o Medicina