La majoria dels bacteris entren als pulmons a través de petites aspiracions d'organismes que viuen a la gola o el nas. La meitat de les persones normals tenen aquestes petites aspiracions durant el son. Mentre que la gola sempre conté bacteris, els potencialment infecciosos només hi viuen en determinats moments i sota determinades condicions. Una minoria de tipus de bacteris com Mycobacterium tuberculosis i Legionella pneumophila arriben als pulmons a través de gotes contaminades en l'aire. Els bacteris també es poden propagar a través de la sang. Un cop als pulmons, els bacteris poden envair els espais entre les cèl·lules i entre els alveols, on els macròfags i els neutròfils (cells blancs de la sang defensors) intenten inactivar els bacteris. Els neutròfils també alliberen citocines, causant una activació general del sistema immunitari. Això porta a la febre, la fatiga i la fatiga.
per la sang