La seva cursa d'obertura de la temporada 2009 va ser a la Mitja Marató de Ras Al Khaimah i va millorar el seu millor temps a 1:07:50 per ocupar el tercer lloc. Al maig va guanyar a la Mitja Marató Sotokoto Safari a Kenya, derrotant a Helena Kiprop en el procés. Al Campionat de Kenya de pista i camp va ser tercera en els 10.000 m, darrere de Linet Masai i Lineth Chepkurui. Les seves actuacions li van valer la selecció per al Campionat Mundial de Mitja Marató de la IAAF 2009
i tot i que Mary Keitany va aconseguir una clara victòria, Ongori va vèncer Aberu Kebede en un final de sprint per la medalla de plata. Això va ajudar Kenya al títol de l'equip femení en l'esdeveniment.