La segona, més gran, influència de russos va seguir a l'annexió de Lituània per l'Imperi Rus durant les particions de Polònia a finals del segle XVIII. Sota el govern rus, el poder a la regió va romandre principalment en mans de la noblesa lituana, però alguns llocs administratius van ser gradualment assumits pels russos, que també es van establir a ciutats com Vilnius i Kaunas. També després de la revolta de 1863
a Polònia, algunes propietats havien estat confiscades a la noblesa local i donades a funcionaris russos. Molts dels russos que van emigrar a Lituània eren soldats, mariners i comerciants.