El 26 de juny de 2018, Nainggolan va signar amb l'Inter de Milà per 38 milions d'euros (24 milions d'euros més Davide Santon i Nicolò Zaniolo, valorats en 14 milions d'euros) fins al juny de 2022. Va marcar en el seu debut a la Lliga l'1 de setembre, ajudant als visitants a derrotar a Bolonya 3<unk>0. El 3 d'octubre de 2018, Nainggolan va marcar l'egalitzador en una victòria de retorn 2<unk>1 contra el PSV Eindhoven a la fase de grups de la Lliga de Campions per convertir-se en el primer belga en aconseguir l'obra en la competició per a l'Inter.
26 de juny de 2018