Completa la següent frase: El juny de 1861, O'Neal va ser nomenat capità i va comandar tres companyies de soldats. En arribar a Richmond va ser nomenat major del 9è Regiment d'Infanteria d'Alabama i va ser ascendit a tinent coronel a la tardor. El març de 1862, va ser nomenat coronel de la 26a infanteria d'Alabama, i va comandar aquest regiment durant la Campanya de la Península. A la Batalla de Seven Pines, el seu cavall va morir sota ell, i va ser greument ferit per un fragment d'un gran. Va rebre grans elogios per la seva actuació a la Batalla de Chancellorsville. El 1863, va comandar una brigada en la divisió del major general Robert E. Rodes, i la va dirigir a la Batalla de Gettysburg, Batalla de Manassas Gap i a la Batalla de Manassas Gap.
Batalla de Mine Run. A principis de 1864, el seu regiment va ser enviat de nou a Alabama per reclutar les seves files esgotades, però va ser ordenat ràpidament a Dalton, Geòrgia, on O'Neal va prendre el comandament de la brigada del general de brigada James Cantey a l'Exèrcit de Tennessee. O'Neal va comandar aquesta brigada durant la resta de la campanya d'Atlanta. Després que el tinent general John Bell Hood va rebre el comandament de l'Exèrcit de Tennessee, O'Neal va ser alliberat i va servir en servei separat durant la resta de la guerra. Va ser nomenat general de brigada el 6 de juny de 1863, però aquest nomenament va ser retingut pel general Robert E. Lee i la promoció va ser cancel·lada pel president confederat Jefferson Davis.