Escriu una continuació per a aquest paràgraf - El 2005/06, Jones va començar en tots els Internationals d'Automne de Gal·les excepte en un (va perdre el partit contra) i en tot el seu Campionat de les Sis Nacions del 2006
partits, després de la qual va ser escollit pel nou entrenador Gareth Jenkins per capità de l'equip durant una gira de dues proves de mig any a l'Argentina. A l'octubre de 2006, Jenkins va nomenar a Stephen Jones com a capità de Gal·les fins a la Copa del Món de Rugbi de 2007, però quan Stephen Jones va descansar per a l'Autumn International contra els Pacific Islanders, Duncan Jones va tornar a ser capità de Gal·les a casa per primera vegada. Va jugar, com a titular o substitut, en els quatre torneigs internacionals d'automne i en els cinc partits del Campionat de les Sis Nacions de 2007, però va descansar per a la gira de mig any a Austràlia.