A les 01:25 JST del 16 d'abril (16:25 UTC, 15 d'abril), es va produir un terratrèmol de magnitud 7,0 sota el districte de Higashi de la ciutat de Kumamoto a la regió de Kyushu al sud-oest del Japó, com a resultat de falles de deslizament a poca profunditat. Es van produir danys addicionals significatius en aquelles àrees de la prefectura de Kumamoto que es recuperaven del terratrèmol del 14 d'abril, amb forts tremolors i danys registrats també tan a l'est com la ciutat de Beppu a la prefectura d'Ōita. També es va sentir tan lluny com Busan, Corea del Sud, amb una intensitat de MMI III. A les 01:27 JST es va emetre un avis de tsunami per a les àrees al llarg del mar d'Ariatsatsima i el mar de Yushiro, amb l'alçada de l'ona prevista de 0.2 a 1 m a 3.3 ft, però es va aixecar menys d'una hora més tard a les 02:14 JST. Més de 180.000 persones van morir i
7,0