En els nens, els bacteris són la causa d'aproximadament el 15% dels casos, amb els tipus més comuns que són Escherichia coli, Salmonella, Shigella, i les espècies de Campylobacter. Si els aliments es contaminen amb bacteris i es mantenen a temperatura ambient durant un període de diverses hores, els bacteris es multipliquen i augmenten el risc d'infecció en aquells que consumeixen l'aliment. Alguns aliments comunament associats amb la malaltia inclouen carn crua o poc cuina, pollastres, mariscs i ous crus; brots; llet no pasteuritzada i queixos suaus; i fruites i sucs vegetals. A tot el món, especialment a l'Àfrica subsahariana i Àsia, la colera és una causa comuna d'infecció gastroenteral. Aquesta infecció es produeix freqüentment per Escherichia coli, Salmonella, Salmonella, Shigella, i espècies de Campylobacter.
També pot ocórrer en aquells que han utilitzat antibiòtics.