El cap petit de Massospondylus era aproximadament la meitat de la longitud del femur. Nombroses obertures, o fenestres, en el crani reduïen el seu pes i proporcionaven espai per a l'adhesió muscular i els òrgans sensorials. Aquestes fenestres estaven presents en parelles, una a cada costat del crani. A la part frontal del crani hi havia dos grans nasos el·líptics, que eren aproximadament la meitat de la mida de les òrbites. Les òrbites eren proporcionalment més grans en Massospondylus que en genres relacionats, com Plateosaurus. Les fenestres antorbitals, més petites que les observades en Plateosaurus, estaven situades entre els ulls i el nas. A la part posterior del crani hi havia dos parells més de fenestres temporals: la fenestra temporal posterior darrere de l'ull, que tenia la forma immediatament posterior d'un "fenestret invertit" en cada costat del crani.
els ulls i el nas