Diverses dinasties xineses han exercit històricament diversos graus de control i influència sobre parts de l'actual Xinjiang. La regió va quedar sota el domini de la Xina com a resultat de l'expansió cap a l'oest
de la dinastia Qing liderada pels manxús, que també va conquerir el Tibet i Mongòlia. Aquesta conquesta, que va marcar l'inici de Xinjiang sota el govern de Qing, va acabar al voltant de 1758. Tot i que va ser declarat nominalment com a part del territori central de la Xina, generalment va ser vist com una terra distant per la seva pròpia cort imperial; el 1758, va ser designat una colònia penal i un lloc d'exili, i com a resultat, va ser governat com un protectorat militar, no integrat com una província.