Els estudis suggereixen que la contaminació lumínica al voltant dels llacs impedeix al zooplàncton, com la Dafnia, de menjar algues superficials, causant flors d'algues que poden matar les plantes dels llacs i la baixa qualitat de l'aigua. La contaminació lumínica també pot afectar els ecosistemes d'altres maneres. Per exemple, els biòcopters i els entomòlegs han documentat que la llum nocturna pot interferir amb la capacitat de les papallones i altres insectes nocturns de navegar. Pot alterar les interaccions competitives, canviar les relacions depredador-presa i causar danys fisiològics. El ritme de vida està orquestrat pels patrons diürns naturals de llum i foscor, de manera que la interrupció d'aquests patrons afecta la dinàmica ecològica.
Contaminació lumínica