El 5è Batalló va ser reformat el 1939 com un duplicat de la 2a línia del 4è Batalló quan l'Exèrcit Territorial va ser duplicat en mida. Inicialment, el 5th Buffs va ser assignat a la 37a Brigada d'Infanteria, part de la 12a Divisió d'Infanteria (Oriental), que era un duplicat de la 2a Línea de la 44a Divisió (Consellers de l'Home). No obstant això, el 26 d'octubre de 1939, va ser transferit a la 36a Brigada d'Infanteria de la Divisió a canvi de la 2/6a East Surreys. El 5th Buffs, juntament amb el 6th i el 7th Royal West Kents, van romandre a la 36a Brigada durant la resta de la guerra. Igual que el 2n i el 4n Batallons, va servir amb el BEF a França el 1940 i va lluitar a la Batalla de França i va ser evacuat a Dunkerque. La 12a Divisió va patir greus baixes degudes principalment a la majoria dels homes que tenien poca formació i la divisió no tenia artilleria o unitats de suport. Després de tornar a Anglaterra, la divisió es va dissoldre el juliol de 1940, a causa de les baixes que havia patit. El 1942, la 36a Brigada va ser assignada a la recentment creada 78a Divisió i va participar en l'Operació Torch, els desembarcaments aliats al nord d'Àfrica, seguit de la campanya a Tunísia, on la 78a Divisió, com a part del Primer Exèrcit britànic, es va distingir durant la crucial captura de Longstop Hill. La divisió va lluitar en la Campanya de Sicília
, com a part del 8è Exèrcit Britànic. El 5th Buffs i la resta de la 78a Divisió van participar en els combats a Itàlia i van servir allà fins a l'Ofensiva de 1945.