El 1 de febrer de 2011, Jonathas va canviar d'equip i de país de nou, unint-se al Brescia Calcio en un contracte d'un any i mig per un honorari no revelat, que es va rumorar per ser de 300.000 €. Va aparèixer en sis partits durant la seva campanya de debut.
, quan els "Biancoazzurri" van ser relegats de la Serie A. Va marcar 16 gols a la Serie B 2011-12, el màxim goleador de l'equip.