La ciutat de Nagasaki havia estat un dels ports marítims més grans del sud del Japó, i va ser de gran importància en temps de guerra a causa de la seva àmplia activitat industrial, incloent la producció d'artilleria, vaixells, equips militars i altres materials de guerra. Les quatre companyies més grans de la ciutat eren Mitsubishi Shipyards, Electrical Shipyards, Arms Plant, i Steel and Arms Works, que ocupaven al voltant del 90% de la força de treball de la ciutat, i representaven el 90% de la indústria de la ciutat. Tot i ser una important ciutat industrial, Nagasaki havia estat estalviada dels bombardeigs perquè la seva geografia li feia atracar de nit amb el radar AN/APQ-13. A diferència de les altres ciutats, Nagasaki no havia estat posada fora dels límits dels bombarders per la directiva important de l'Estat Major Conjunt del 3 de juliol, i va ser llançada una bomba de cinc dimensions petites. Durant la recerca de la ciutat, el regiment d'acer de Nagasaki va colpejar un petit nombre d'avions anti-explosius i
munició, vaixells, equipament militar i altres materials de guerra