La batalla va invertir la situació estratègica entre les forces de les dues nacions a la Mediterrània i va consolidar la Royal Navy en la posició dominant que va mantenir durant la resta de la guerra. També va encoratjar altres països europeus a girar-se contra França, i va ser un factor en l'esclat de la Guerra de la Segona Coalició. L'exèrcit de Bonaparte va quedar atrapat a Egipte, i el domini de la Royal Navy a la costa de Síria va contribuir significativament a la derrota francesa en el setge d'Acre el 1799 que va precedir el retorn de Bonaparte a Europa.
Marina Reial