Escriu una continuació d'aquest paràgraf - El 1238, el Papa Gregori IX va formar una aliança entre Gènova i Venècia contra l'imperi, i en conseqüència contra Pisa, també. Un any més tard, va excomunicar Frederic II i va convocar un concili antiimperial a Roma el 1241. El 3 de maig de 1241, una flota combinada de vaixells pisans i sicilians, dirigida pel fill de l'emperador Enzo, va atacar un comboi genovès que transportava prelats del nord d'Itàlia i França, al costat de l'illa de Giglio (Batalla de Giglio
), davant de la Toscana; els genovesos van perdre 25 vaixells, mentre que uns mil mariners, dos cardenals i un bisbe van ser presoners. Després d'aquesta gran victòria, el concili de Roma va fracassar, però Pisa va ser excomunicada. Aquesta mesura extrema només va ser eliminada el 1257. De tota manera, la ciutat toscana va intentar aprofitar la situació favorable per conquerir la ciutat de Còrsega d'Aleria i fins i tot assetjar el mateix Gènova el 1243.