Escriu una continuació per a aquest paràgraf - Weir va guanyar els Junior Eastern Sectionals el 1999 i el 2000. La temporada següent (2000<unk>2001), Weir va competir com a major per primera vegada, arribant en sisè lloc als Nacionals dels Estats Units malgrat "una greu lesió del flexor de l'anca", i guanyant les Seccionals de l'Est com a major. Va ser el tercer substitut a la final del Gran Premi Junior de 2000, arribant en sisè i segon lloc a les seves dues assignatures de Gran Premi Junior, però va guanyar, als 16 anys, la medalla d'or al Campionat Mundial Junior
- No. Va ser el desè nord-americà que va guanyar als Junior Worlds i el primer patinador masculí nord-americà des que Derrick Delmore va guanyar el 1998. Lysacek va guanyar la medalla de plata; va ser la primera vegada des de Rudy Galindo i Todd Eldredge el 1987 que els homes americans van arribar al primer i segon lloc. Tot i caure en el salt més senzill del seu programa curt, un triple flip, Weir va ser classificat primer en entrar al patinatge lliure. Weir va rebre les millors puntuacions artístiques, rebent 5,7 per la presentació en el seu patinatge lliure.