Escriu una continuació per a aquest paràgraf - El 9 de setembre de 1939, Wejherowo va ser capturat per la Wehrmacht. Després de la invasió de Polònia, que va marcar l'inici de la Segona Guerra Mundial, Wejherowo va ser annexat per l'Alemanya nazi i va ser administrat com a part del Regierungsbezirk Danzig a la província de Reichsgau Danzig-Prússia Occidental. La majoria de la comunitat jueva de la ciutat va ser assassinada pels nazis durant l'ocupació.
, mentre que molts polonesos locals també van ser víctimes de la política d'extermini nazi.