Clapp va continuar els seus extensos estudis de postgrau a la Louis Agassiz Anderson School of Natural History a Penikese Island, Buzzard's Bay, MA el 1874. Va adoptar el dictà "Estudi la natura, no els llibres!" d'Agassiz i el va aplicar a la seva pròpia docència. Va introduir el seu coneixement a través d'un curs d'embriologia a Mount Holyoke, substituït per mostres d'alumnes de l'estranger. Juntament amb altres entomòlegs de Nova Anglaterra, Clapp va recollir insectes de les muntanyes blanques de New Hampshire a l'estiu de 1875 i dels estats de l'Atlàntic Mitjà el 1877.
Nova Hampshire