Després que el 21è Massachusetts fos transferit al nord de Virgínia el juliol de 1862, el regiment finalment es va convertir en part de l'Exèrcit del Potomac i va participar en diverses de les batalles més grans de la guerra, incloent la Segona Bull Run, Antietam i Fredericksburg. El regiment va patir les seves majors baixes durant la Batalla de Chantilly.
el 1 de setembre de 1862. En la confusió de la batalla, combatut en boscos densos durant una tempesta, Clark es va separar del seu regiment i va vagar pel camp de Virgínia durant quatre dies abans de trobar l'exèrcit de nou. Mentre estava desaparegut, va ser incorrectament catalogat com mort en acció i un diari d'Amherst va imprimir el seu obituari sota el titular, "Another Hero Gone".