El 24 de juliol de 1567, va ser forçada a abdicar en favor del seu fill d'un any. Després d'un intent fallit de recuperar el tron, va fugir cap al sud buscant la protecció del seu cosí de primer grau, una vegada eliminat, la reina Elisabet I d'Anglaterra. Una vegada que Maria havia reclamat el tron d'Elizabeth com el seu propi i era considerada la sobirana legítima d'Anglaterra per molts participants catòlics, incloent-hi els participants en una rebel·lió coneguda com la rebel·lió de Bothwell, però va ser absolt de l'acusació l'abril de 1567, i el mes següent es va casar amb Maria.
Maria