El H+3 va ser descobert per primera vegada per J. J. Thomson el 1911. Mentre estudiava les espècies resultants de les descàrregues de plasma, va descobrir una cosa molt estrany. Utilitzant una forma primerenca d'espectrometria de masses, va descobrir una gran abundància d'un ion molecular amb una relació massa-carga de 3. Va declarar que les úniques dues possibilitats eren C4+ o H+3. Com que C4+ seria molt improbable i el senyal es va fer més fort en gas d'hidrogen pur, va assignar correctament l'espècie com a H+3.
J. J. Thomson