Una de les esferes d'interès de Dyukov és la història de la repressió soviètica, principalment als estats bàltics i Ucraïna, i més recentment, ha escrit un polèmic article en el qual minimitza les massacres de Kurapaty a Bielorússia. Mentre que Dyukov utilitza arxius oberts com els de l'Arxiu Estatal de la Federació Russa (GARF) i l'Arxiu Estatal Rus d'Història Contemporània (RGANI), també cita els arxius del FSB, als quals l'accés dels investigadors és limitat. Són aquests arxius del FSB els que Dyukov utilitza, per exemple, per afirmar en el seu recent llibre, "El mite del genocidi", que el record d'Estònia de les repressions soviètiques, incloses les deportacions, és exagerat. Pel que fa a les deportacions de juny de 1941
, que va tenir lloc abans de la invasió alemanya del 22 de juny de 1941, Dyukov sosté que els estonians deportats eren majoritàriament col·laboradors alemanys o estaven vinculats a ells.