Amb aquesta experiència i una impressionant carrera de forma per a l'Ulster a la Lliga Celta, va fer el panel de 22 homes per a Irlanda
El 2006 va ser el primer jugador de les Six Nations contra Itàlia, i va marcar un intent en aquest partit. Després de la pobra primera meitat d'Irlanda contra França en el següent partit del campionat, Bowe va ser expulsat de l'equip, provocant acusacions de que havia estat fet cap expiatori pel cap d'Irlanda, Eddie O'Sullivan.