A finals de setembre de 1997, mesos després de l'obertura sudanesa (feita per al-Bashir a la carta a Hamilton), el Departament d'Estat dels Estats Units, sota la directiva de la secretària d'Estat Madeleine Albright, va anunciar per primera vegada que retornaria diplomàtics nord-americans a Khartoum per perseguir dades de contraterrorisme en possessió del Mukhabarat. En pocs dies, els Estats Units van revertir aquesta decisió i van imposar sancions econòmiques, comercials i financeres més dures i més completes contra el Sudan, que van entrar en vigor a l'octubre de 1997. A l'agost de 1998, després dels bombardejos de les ambaixades d'Àfrica Oriental
, els EUA van llançar atacs de míssils de creuer contra Khartoum. L'últim ambaixador dels Estats Units al Sudan, l'ambaixador Tim Carney, va deixar el seu càrrec el febrer de 1996 i no es va designar cap nou ambaixador fins al desembre de 2019, quan l'administració del president dels Estats Units, Donald Trump, va arribar a un acord amb el nou govern sudanès per intercanviar ambaixadors.