Massa ngamimitian alus di Ferrari, kualifikasi kadua di balapan bubuka di Bahrain
, jeung datang ti posisi 21 ka 5 di Malaysia, ngéléhkeun timnya Michael Schumacher, anu dimimitian ti 14. Di Bahrain, kumaha oge, boh dina latihan Sabtu jeung lomba, Massa neruskeun kacenderungan-Na pikeun spin, narrowly leungit Fernando Alonso, nu pamustunganana meunangna lomba. Dina GP Australia anjeunna nabrak Ferrari na dina kualifikasi, teras tabrakan sareng Christian Klien sareng Nico Rosberg di tikungan mimiti balapan. Sanajan kitu, Massa meunang podium kahijina di Nürburgring, réngsé katilu di tukangeun Michael Schumacher jeung Fernando Alonso. Manéhna ogé netepkeun lap panggancangna di Barcelona dina taun 2006. Massa meunang opat podium deui dina taun 2006, sarta meunangkeun posisi pole F1 kahijina sarta meunang F1 kahijina di sirkuit Istanbul Park. Posisi kahareupna di Ferrari dijamin nalika Michael Schumacher ngumumkeun dina 10 Séptémber 2006, anjeunna bakal pensiunan ti F1 di ahir usum 2006. Tanggal 22 Oktober, Massa meunang balapan di Interlagos, jadi kahiji kalina saurang supir Brasil meunang di Interlagos saprak Ayrton Senna dina 1993. Massa réngsé usum katilu jeung 80 poin, di tukangeun juara dunya Fernando Alonso jeung tim Ferrari Michael Schumacher.