Lengkepan kalimah di handap ieu: Dina taun 1861, dina awal Perang Sipil, anjeunna diangkat ku komandan New York Garda Nasional, Brigadier Jenderal John F. Rathbone, pikeun ngawula salaku kapala perwira médis di gudang Albany. Dina Juni 1862, sanggeus
Perang di Savage's Station, nalika Angkatan Darat Potomac, babarengan jeung dokterna, mundur, Swinburne tetep ngurus rébuan tawanan anu luka, boh Uni jeung Konfederasi. Ngahormat kana prinsipna, komandan Konfederasi Stonewall Jackson masihan anjeunna pas, sareng catetan pribadi anu ngiringan, ngamungkinkeun kunjungan ka tahanan Uni. Dina taun 1864, Gubernur Horatio Seymour nyalonkeun anjeunna kana jabatan Pejabat Kaséhatan Pelabuhan New York sareng, dina taun 1867, anjeunna ditunjuk deui ku Gubernur Reuben Fenton, ngajabat sajumlah genep taun, dugi ka 1870. Salila pamaréntahanana, sanajan législatur nagara teu daék méré dana, manéhna ngawaskeun pangwangunan fasilitas karantina anu canggih dina kapuloan anu dingaranan Swinburne jeung Hoffman.