Lengkepan kalimah di handap ieu: Deukeut ahir Juni, 1861, Hotchkiss ditandatanganan dina salaku hiji timster Konfederasi nyandak suplai ka Churchville Kavaleri di Rich Gunung, Virginia Kulon. Hotchkiss nawiskeun jasa-jasana salaku tukang nyieun peta ka Brigjen Richard B. Garnett, anu brigade Konfederasi na beroperasi di Virginia kulon. Hotchkiss ngalayanan di Rich Mountain sarta nyieun peta pikeun kampanye anu direncanakeun Jenderal Robert E. Lee di pagunungan. Anjeunna nyandak cuti médis anu pondok saatos katarajang demam tifoid, tapi balik deui ka tugas dina Maret 1862 salaku kapala insinyur topografi Kabupatén Lembah, ngalaporkeun ka Mayor Jenderal Stonewall Jackson. Saatos éléh awal dina Patempuran Kernstown salila
1862 Kampanye Lembah, tanggal 26 Maret 1862, Jackson ngondang Hotchkiss ka markasna di Narrow Passage deukeut Woodstock sarta maréntahkeun manéhna pikeun "nyieunkeun kuring peta Lembah, ti Harper's Ferry ka Lexington, némbongkeun sakabéh titik serangan jeung pertahanan [sic] di tempat-tempat éta". Rekomendasi langsung Hotchkiss nyaéta yén garis Jackson di Stony Creek di Woodstock henteu tiasa dibela, sareng yén Jackson kedah mundur ka Rude's Hill, hiji promontory leutik anu tiasa dibela di beulah kidul Mt. Jackson. (Basa Inggris) Di Rude's Hill, Jackson ngaréorganisasi deui komandanana pikeun sésa-sésa kampanye anu suksés taun 1862 di Lembah Shenandoah.