Tuliskeun saterusna pikeun paragraf ieu - Sanggeus commissioning, kapal ieu ditugaskeun ka Kaopat Carrier Divisi tina 1st Air armada, babarengan jeung, dina paréntah tina Rear Admiral Kakuji Kakuta. Anjeunna ditugaskeun pikeun ngarojong Operasi AL, hiji serangan rencanana pikeun ngarebut sababaraha Kapuloan Aleutian pikeun nyadiakeun warning sateuacanna bisi serangan Amérika ti Aleutians handap Kapuloan Kurile bari awak utama armada Amérika ieu dikawasa ngabela Midway. "Jun'yō" mawa 18 A6M2 Zeros jeung 18 D3As pikeun operasi ieu. Dina subuh tanggal 3 Juni, manéhna ngaluncurkeun 9 Zero jeung belasan D3A pikeun nyerang Dutch Harbor
di Pulo Unalaska. Maranehna kudu balik deui alatan cuaca anu goréng, sanajan hiji pesawat pangintipan PBY Catalina Amérika ditémbak ku Zero. Serangan udara kadua diluncurkeun saterusna dina poé éta pikeun nyerang sakumpulan kapal perang anu kapanggih ku pesawat ti serangan kahiji, tapi gagal manggihan targetna. Serangan udara séjén diluncurkeun dina poé saterusna ku dua pamawa nu diwangun ku 15 Zero, 11 D3A, jeung 6 B5N sarta suksés ngabom Dutch Harbor. Nalika pesawat ti "Jun'yō" keur ngaraketkeun deui sanggeus serangan, maranéhanana diserang ku 8 pesawat tempur Curtiss P-40 nu némbak 2 Zero jeung sapasang D3A bari kaleungitan 2 pesawat sorangan. D3A séjén leungit sarta gagal nyieun deui ka carrier nu. Teu lila sanggeus pesawat diluncurkeun, Amerika nyerang operator, tapi gagal pikeun inflict karuksakan wae. Hiji Martin B-26 Marauder jeung hiji PBY ditémbak ku Zero, sarta hiji Boeing B-17 Flying Fortress ditémbak ku flak salila serangan.