Lengkepan kalimah ieu: Bait Allah teu lila jadi puseur komunitas Yahudi nu leutik tapi hirup, salah saurang pamingpinna, Abraham Reuben, jadi anggota déwan kota Karachi taun 1936. Pamisahan India Britania sapanjang garis agama antara Hindu jeung Muslim dina bulan Agustus 1947 ningali kota Karachi tumiba dina wates nagara mayoritas Muslim anyar Pakistan, anu saterusna papan afiliasi hareup sinagoga dirobah, nangtukeun éta dina "Komunitas Pakistan Bene Israel". Kurang ti sataun saterusna, éta sinagog diserang jeung dibakar ku pemberontak Muslim sanggeus Déklarasi Kamerdékaan Nagara Israél 1948. Salila ieu, sababaraha urang Yahudi di sakuliah Pakistan diserang, antukna ngajurung bagian masarakat pikeun ngungsi ka India tatangga. Nanging, frékuénsi serangan ka urang Yahudi di Pakistan ningkat saatos unggal Perang Arab-Israel di
1948, 1956, 1967 jeung 1973. Dina awal taun 1970-an, masarakat Yahudi Pakistan kalolobaanana angkat ka Israél atanapi India kusabab éksodus Yahudi ti nagara-nagara Muslim, sacara épéktip ngajantenkeun sinagog janten umumna teu aktif. Tanggal 17 Juli 1988, sinagog diruntuhkeun sarta ahirna diganti ku hiji alun-alun balanja (Plataran Madiha) di lingkungan Ranchore Line di Karachi kidul.