Lengkepan kalimah di handap ieu: Tanggal 15 Pébruari 2006, Paus Benediktus XVI nunjuk anjeunna salaku Nuncio Apostolik ka Mesir sareng Délégasi ka Liga Nagara Arab, jabatan diplomatik kahijina. Anjeunna salah sahiji ti saeutik nuncio anu henteu ngahadiran Akademi Keagamaan Kepausan. Numutkeun BBC, "Kaputusan ku pontiff dilahirkeun di Jerman geus ngabalukarkeun aduk. Watcher Vatikan nyoba pikeun ngajawab naha move mangrupa demotion, atawa pangakuan tina bakat husus tina uskup agung. " Fitzgerald ngomong: "Pangalaman kuring dina Arab jeung studi Islam meureun dianggap mangpaat dina momen ieu pikeun ngembangkeun hubungan jeung Mesir jeung sésana dunya Islam". Hiji koresponden Vatikan nyebutkeun ditugaskeun deui Fitzgerald salaku "kaputusan Paus nu panggoréngna nepi ka ayeuna" jeung henteuna dicatet ku pers nalika Paus Benediktus ngahina umat Islam ku
Regensburg ceramah dina bulan Séptember 2006. Pindah Fitzgerald kabuktian jadi bagian tina restrukturisasi Benediktus departemén curial ka reorient diskusi interreligious jeung non-Kristen ku ngahijikeun peran presiden PCID jeung nu ti Déwan Pontifical pikeun Kabudayaan, hiji restrukturisasi nu Benediktus dimimitian dina Maret 2006 jeung reversed dina Juni 2007.