Lengkepan kalimah di handap ieu: Nagatomo dimimitian usum kadua Inter Milan ku maén 62 menit dina bubuka
Pertandingan Serie A ngalawan Palermo, réngsé ku kekalahan 4-3 di luar imah. Tanggal 27 Séptémber 2011, Nagatomo nyadiakeun hiji bantuan pikeun Giampaolo Pazzini ku nutmegging Aleksei Berezutski saméméh nyetir bal di sakuliah gawang salila 3×2 jauh meunang ngalawan CSKA Moscow dina patandingan tahap grup kadua Liga Champions. Manéhna nyetak gawang kahijina dina 10 Désémber 2011 nalika meunang 2-0 ngalawan Fiorentina dina poé patandingan 15 Serie A. Manéhna aya deui dina scoresheet tilu poé saterusna nalika manéhna ngajalankeun balik hiji cross Ricky Álvarez dina meunangna 1-0 ngalawan Genoa. Dina patandingan pamungkas 2011 ngalawan Lecce di imah, Nagatomo ngahasilkeun "man of the match" kinerja ku nyadiakeun dua assists dina win 4-1 ahirna.