Lengkepan kalimah di handap ieu: Salila taun kadua Latimer tina studi, Perang Sipil pecah jeung Latimer ditinggalkeun VMI ngawula ka Konfederasi Kidul. Manéhna mimitina ngajabat salaku drillmaster kadét pikeun Richmond Hampden Artillery salila usum semi jeung usum panas 1861. Dina usum gugur, anjeunna ditugaskeun salaku letnan kahiji sarta ningali aksi jeung divisi Mayor Jenderal Richard S. Ewell dina Kampanye Lembah Shenandoah taun 1862. Sanggeus distinguishing dirina kalawan batré-Na dina battles kayaning
Mimiti Winchester jeung Cedar Mountain, Latimer dipromosikeun jadi komandan batalion anu saméméhna milik A. R. Courtney. Sanggeus maréntah batalion di Fredericksburg dina bulan Désémber 1862, Latimer dipromosikeun jadi mayor dina bulan Maret 1863. Ewell ngarujuk ka anjeunna salaku "Napoleon Muda", tapi para sasama jamanna nyatet nonoman sareng leutikna, saeutikna ku nelepon "Boy Mayor". Manéhna jadi perwira di Batalyon Mayor Richard Snowden Andrews ti Divisi Mayor Jenderal Edward "Allegheny" Johnson.