Lengkepan kalimah di handap ieu: Hamšík dimimitian dina
2012 Supercoppa Italiana, diayakeun di Beijing, dina 11 Agustus; kumaha oge, Napoli éléh ku Juventus 4<unk>2 dina waktu tambahan. Saterusna dina bulan éta, dina patandingan liga munggaran Napoli dina musim 2012-13 Serie A, Hamšík nyetak gawang kahiji klub sarta mantuan serangan Christian Maggio dina kekalahan 3-0 ti Palermo. Leungitna pamuter gawang Edinson Cavani pikeun patandingan klub ngalawan Chievo dina 28 Oktober 2012, Hamšík nyambung dina salib Juan Camilo Zúñiga pikeun masihan Napoli kameunangan 1-0. Tanggal 6 Januari 2013, anjeunna nyieun penampilan ka-200 di Serie A dina kameunangan 4-1 ngalawan Roma. Dina poé patandingan panungtungan dina musim Serie A, Hamšík ngumpulkeun pas ti Goran Pandev jeung nudged bal imah di 93rd menit, rescuing 2 ka meunangna 1 leuwih Siena, confirming tempat klub di group tahap Liga Champions bari condemning Siena ka relegation. Pamaén Slovak ieu milu dina unggal patandingan Serie A pikeun Napoli salila usum 2012-2013, nyadiakeun 11 gol jeung 14 assists nalika "Partenopei" réngsé di tempat kadua di tukangeun juara Juventus, usum anu ngabuktikeun jadi usum terakhir manajer Walter Mazzarri di klub, nalika anjeunna jadi palatih Internazionale engké usum panas éta.