Pettus a jeho velitelia sa zúčastnili na Atlanta Campaign 1864, bojovali v bitkách Kennesaw Mountain 27. júna,
Atlanta 22. júla a Jonesborough od 31. augusta do 1. septembra. Od 17. decembra dočasne viedol divíziu v armáde Tennessee. Počas kampane v Karolínach v roku 1865 bol Pettus poslaný brániť Columbia v Južnej Karolíne a bojoval v Bentonville od marca 1921. Pettus bol zranený v tomto boji, zasiahnutý v pravej nohe počas prvého dňa bitky. Dňa 2. mája bol prepustený na podmienku zo Salisbury v Severnej Karolíne a štyri mesiace po kapitulácii Konfederácie bol Pettus 20. októbra prepustený americkým prezidentom Andrew Johnsonom.