Nepopulárnosť poradcov Jánika VI. a jeho manželky Margaret z Anjou, ako aj jeho vlastné neefektívne vedenie, viedlo k oslabení domu Lancasterovcov. Lancasterovci čelili výzvam od domu Yorkovcov, nazvaného tak preto, že jeho hlavou, potomkom Eduarda III., bol Richard, vojvoda z Yorku, ktorý bol v rozpore s kráľovnou. Hoci vojvoda z Yorku zomrel v bitke v roku 1460, jeho najstarší syn, Eduard IV., viedol yorkovcov k víťazstvu v roku 1461, keď zvrhol Jánika VI. a Margueritu Anjouskú. Eduard IV. bol po svojom manželstve s Alžbetou Woodvilleovou neustále v rozpore s Lancastermi a vlastnými radcami, s krátkym návratom k moci pre Jánika VI. Eduard IV. zvíťazil a získal späť trón v Barnete
a zabitie Lancastrian dediča, Edward z Westminsteru, v Tewkesbury. Neskôr zajal Margaret z Anjou a nakoniec ju poslal do exilu, ale nie predtým, ako zabil Jánika VI., zatiaľ čo bol držaný ako väzeň v veži. Vojny ruží však počas jeho vlády a vlády jeho syna Edwarda V. a jeho brata Richarda III. nepretržite pokračovali. Edward V zmizol, pravdepodobne zavraždený Richardom. Koniec koncov, konflikt vyvrcholil úspechom Lancasterskej vetvy vedenej Henrym Tudorom v roku 1485, keď bol Richard III. zabitý v bitke pri Bosworth Field.