Od júla 1863 do januára 1864, keď sa zotavil zo zranení, slúžil v štábe guvernéra Ohia Davida Tod a viedol jednotky Ohijskej milície v reakcii na Morganov útok. Neskôr velel 3. brigáde 4. divízie XXIII. zboru v Kentucky a Tennessee a zúčastnil sa na Shermanovej kampani v Atlante v bitkách pri Rocky Face Ridge a Resaca.
- Áno. 21. júla 1864 bol Runkle čestne odvolaný a 29. augusta 1864 bol vymenovaný za podplukovníka v Veteran Reserve Corps, kde až do konca vojny velel 21. pluku.