Dokonči nasledujúcu vetu: Počas druhej svetovej vojny Blamey velel Druhým austrálskym cisárskym silám a I. zboru na Blízkom východe. V druhej úlohe velel austrálskym a vojenským jednotkám Spoločenstva v katastrofálnej bitke o Grécko. V predchádzajúcej úlohe sa pokúšal chrániť austrálske záujmy proti britským veliteľom, ktorí sa snažili rozptýliť svoje sily na všetky druhy misií. Bol vymenovaný za zástupcu vrchného veliteľa veliteľstva na Blízkom východe a v roku 1941 bol povýšený na generála. V roku 1942 sa vrátil do Austrálie ako vrchný veliteľ austrálskych vojenských síl a veliteľ spojeneckých pozemných síl v oblasti juhozápadného Tichomoria pod velením generála Douglasa MacArthura. Na príkaz MacArthura a premiéra Johna Curtina, prevzal osobné velenie Novej Guiney počas vojny.
Kokoda Track kampaň, a uvoľnil generálneho poručíka Sydney Rowell a generálneho majora Arthura Allena za kontroverzných okolností. Blamey tiež naplánoval a uskutočnil významnú a víťaznú kampaň Salamaua<unk>Lae. Napriek tomu sa počas záverečných vojnových kampaní stretol s hlasnou kritikou výkonu armády. Podpísal japonský kapitulačný dokument v mene Austrálie pri slávnostnej kapitulácii Japonska v Tokijskom zálive 2. septembra 1945 a neskôr osobne prijal japonskú kapituláciu v Morotai 9. septembra. V júni 1950 bol povýšený na polného maršála.