Ukonči nasledujúcu vetu: Napoleon Bonaparte, keď sa v roku 1801 stal prvým konzulom, podpísal s pápežom konkordat, v ktorom sa dohodol na obnovení bývalých cirkevných pozemkov vrátane Panthéonu. Panthéon bol pod jurisdikciou kánonov katedrály Notre Dame de Paris. Oslavy dôležitých udalostí, ako je víťazstvo Napoleona na
Tam sa konala bitka pri Austerlitzu. Avšak krypta kostola si zachovala svoju oficiálnu funkciu ako miesto odpočinku pre ilustrovaných Francúzov. Nový vchod priamo do krypty bol vytvorený cez východnú verandu (1809<unk>1811). Vnútorné zdobenie kopule bol poverený umelec Antoine-Jean Gros. Zkombinoval svetské a náboženské aspekty cirkvi; ukazoval, ako Genevievu vzali do neba anjeli v prítomnosti veľkých vodcov Francúzska, od Klodvíka I. a Karla Veľkého po Napoleona a cisárovnú Jozefínu.