Ottaviani bol jedným z kardinálov-voličov, ktorí sa zúčastnili pápežského konklavu v roku 1963
, ktorý vybral Giovanniho Battista Montiniho za pápeža Pavla VI. Počas konklave bol tiež "protodiakonom" (starší kardinál-diakón) a ako taký oznámil Montiniho zvolenie a korunoval ho 30. júna triregnumom.