Dokončite nasledujúcu vetu: Hoci Portugalsko bolo počas druhej svetovej vojny neutrálne, v decembri 1941 bol portugalský Timor okupovaný malou britskou, austrálskou a holandskou armádou, aby sa zabránilo japonskej invázii. Avšak v februári 1942 Japonci napadli v bitke o Timor. Pod japonskou okupáciou boli hranice Holandska a Portugalska prehliadané a ostrov Timor sa stal jedinou administratívnou zónou cisárskej japonskej armády (IJA). 400 austrálskych a holandských komandosov uväznených na ostrove japonskou inváziou viedlo partizánsku kampaň, ktorá zaviazala japonské jednotky a spôsobila viac ako 1000 obetí. Timorčania a Portugalci pomohli gerilam, ale po evakuacii spojencov bola japonská odmena zo strany ich vojakov a Timorských milícií, ktoré boli vybudované v Západnom Timore, prísna. Do konca vojny zomrelo odhadom 40 až 60 000 Timorčanov, ekonomika bola v troskách a hladomor bol rozšírený (pozri
Bitka o Timor).