Vyplňte nasledujúcu vetu: Pinturault sa v októbri 2012 nemohol zúčastniť začiatku sezóny v Söldenu, pretože sa pri hraní tenisu zranil na členku a musel sa na tri mesiace zastaviť. V decembri vyhral svoj druhý závod na Majstrovstvách sveta v slalome vo Val-d'Isère, kde nadchnul domácich fanúšikov brilantným druhým behom pod reflektormi, aby sa zvýšil zo šiesteho miesta. Presvedčujúco porazil nemeckého Felixa Neureuthera o pol sekundy a budúceho majstra Svetového pohára Marcela Hirschera, ktorý viedol o 0,57 sekundy po prvom kole. Tretia výhra Pinturaulta bola na superkombinácii vo švajčiarskom Wengene, kde jeho vynikajúce schopnosti v slalome boli kľúčové. Po umiestnení na 22. mieste v spustnej časti skončil o 1,15 sekundy pred Ivicom Kostelićem z Chorvátska. Na tréningovom behu na zjazdovej časti sa prvýkrát po mesiacoch pohyboval na zjazdových lyžiach, pretože vynechal predsezónny rýchlostný tréning po operácii ľavého členku v auguste na opravu väzov poškodených pri hraní tenisu. Pinturault nezískal medaili na majstrovstvách sveta v
2013, ale mal štyri top-šesť dokončenie. O týždeň neskôr získal štvrté víťazstvo na Majstrovstvách sveta, jeho prvé v obrovskom slalome, v Garmisch v Nemecku. Druhý po prvom kole, Pinturaultov celkový čas bol o 0,60 sekundy pred druhým Hirscherom. 15. marca bol ocenený ako 2013 Longines Rising Star, ako najlepší mladý pretekár (pod 23) sezóny.