V roku 1755 utrpel kláštor veľké škody počas zemetrasenia, ktoré takmer úplne zničilo Lisabon.
; mníšky boli nútené žiť v stane mimo budovy, kým sa vykonávali obnovovacie práce. Napriek tomu bola Santa Marta jedným z jedenástich (z šesťdesiatich piatich) kláštorov, ktoré zostali obývateľné.