Vyplňte nasledujúcu vetu: Cena urobil prekvapivý návrat ako posledný účastník zápasu Royal Rumble, vyhral ho a tradičný titul WrestleMania XXIV, tým, že naposledy eliminoval Triple H. Namiesto toho, aby čakal až do WrestleMania, titulový výstrel bol vyplatený proti vtedy WWE šampiónovi Randy Ortonovi v roku 2008 v No Way Out v zápase Cena vyhral diskvalifikáciou a preto nebol ocenený šampionátom. Nasledujúci večer na "Raw" bol Cena umiestnený späť do zápasu WWE Championship v WrestleManii, kde porazil Ortona v ne-titulovom zápase s Triple H ako špeciálnym hosťujúcim rozhodcom, čím sa stal trojitým hrozbou medzi tromi mužmi, počas ktorého bol Orton pripnutý. Na Backlashovi sa Cena nepodarilo získať späť titul v smrteľnom štvorcestnom eliminačnom zápase, v ktorom bol eliminovaný Ortonom. Počas tohto zápasu Cena eliminoval JBL, obnovil ich spor z roku 2005. Cena porazil JBL na
Súdny deň a potom na One Night Stand v prvom krvavom zápase. Cena sa tiež nepodarilo získať späť WWE Championship od Triple H v Night of Champions. Neskôr JBL porazil Cenu v New York City Parking Lot Brawl na Veľkom americkom Bash v júli, aby ukončil spor. V epizóde "Raw" zo 4. augusta sa Cena stal po druhýkrát svetovým šampiónom v tag tímoch. Spolupracoval s Batistom, aby porazil Codyho Rhodesa a Teda DiBiaseho, ale v nasledujúcom týždni sa mu nepodarilo udržať si titul proti bývalým šampiónom. Cena prehral Batiste na SummerSlam. Krátko potom bol Cena označený za jedného zo štyroch uchádzačov o CM Punk's World Heavyweight Championship v zápase Championship Scramble v Unforgiven, ale bol nahradený Rey Mysterio po utrpení herniated disk v krku v jeho zápase na SummerSlam, ktorý vyžadoval operáciu. Cena podstúpil úspešnú operáciu na opravu zranenia.