Napíšte pokračovanie pre tento odsek - Liénart bol aktívnym účastníkom Druhého vatikánskeho koncilu (1962-1965), bol vedúcim liberálnym hlasom v rade a sedel v jej predsedníctve. Keď Rímska kúria, zložená prevažne z konzervatívnych prelatov, vydala zoznam kandidátov na členov koncilových komisií, Liénart namietol, že žiadna z kvalifikácií kandidátov nebola zahrnutá. Liénart, ktorému pomáhali kardináli Bernardus Johannes Alfrink a Giovanni Colombo, predniesol 8. decembra 1965 jedno z záverečných posolstiev koncilu. Bol tiež jedným z kardinálov voličov v pápežskom konklave v roku 1963
, ktorý vybral pápeža Pavla VI.