V roku 164 pred Kr. Rhodos podpísal zmluvu s Rímom a ostrovy sa vo väčšej alebo menšej miere spojili s Rímskou republikou, pričom si väčšinou zachovali svoju autonómiu. Rodos sa rýchlo stal hlavným vzdelávacím centrom rímskych šľachtických rodín a keďže ostrovy (a najmä Rodos) boli dôležitými spojencami Ríma, užívali si početné privilégiá a všeobecne priateľské vzťahy. Tieto boli nakoniec stratené v roku 42 pred Kr. v nepokojoch
Po zavraždení Júlia Caesara v roku 44 pred Kristom, po ktorom Cassius napadol a vyplienil ostrovy. Potom sa stali súčasťou Rímskej ríše. Titus urobil z Rodosu hlavné mesto "Provincia Insularum" a nakoniec sa ostrovy pripojili k Kréte ako súčasť 18. provincie Rímskej ríše.