Ukonči nasledujúcu vetu: V regióne začal vypuknúť etnický konflikt. 5. júna 1919 bolo 600 arménskych obyvateľov dedín obklopujúcich Šušu zavraždených azerbajdžanskými a kurdskými nelegálnymi vojakmi. Sultanov vyhlásil, že títo nelegálni nie sú pod jeho kontrolou. V auguste 1919 bola Karabašská národná rada nútená uzavrieť dočasnú zmluvu s azerbajdžanskou vládou, ktorá uznáva autoritu azerbajdžanskej vlády, kým nebude vyriešená otázka horskej časti Karabachu na parížskej mierovej konferencii. Napriek podpisu dohody azerbajdžanská vláda neustále porušovala podmienky zmluvy a uplatňovala ešte prísnejšie opatrenia proti arménskemu obyvateľstvu. Generálny guvernér Sultanov zhromaždil vojakov v regióne a 19. februára 1920 vydal Arménom ultimátum, aby akceptovali bezpodmienečné zjednotenie s Azerbajdžanom, potom zmasakrovali obyvateľov niekoľkých arménskych dedín vrátane Khankendi. Menšina zástupcov Karabaghskej národnej rady sa zhromaždila v Šuše, aby prijala Sultanovove požiadavky, zatiaľ čo zvyšok sa stretol v neďalekom Šuškende, aby ultimátum odmietol. Tento spor vyvrcholil arménskym povstaním, ktoré azerbajdžanská armáda potlačila. Koncom marca 1920 arménska polovica policajných síl podľa britského novinára zavraždila azerbajdžanskú polovicu počas tradičných osláv Novruz Bayram. Arménsky prekvapivý útok bol organizovaný a koordinovaný silami Arménskej republiky. Azerbajdžanské pobúrenie z tohto nečakaného útoku nakoniec viedlo k
Masakr a vyhostenie celej arménskej populácie v marci 1920, v ktorom bolo zabitých 500 až 20 000 Arménov zo Šúše a mnohí boli nútení utiecť a arménska polovica mesta bola zničená.