Ako sa komunistické povstanie blížilo ku koncu, vyhlásenie Malajzie zjednotilo federáciu Malajzie so Sarawakom a Sabahom, aby vytvorili nezávislý štát Malajzia. Podmienky, ktoré priniesol ďalší komunistický povstanie
proti novému nezávislému malajzijskému štátu viedlo k tomu, že MCP potlačila disidentstvo vo svojich vlastných radoch, čo spôsobilo rozdelenie mnohých frakcií, ktoré začali bojovať medzi sebou. To vyvrcholilo konečným rozpustením Malajzijskej komunistickej strany v roku 1989, keď radikálna ľavica v krajine začala hľadať alternatívy k marxizmu-leninizmu.