Dokončite nasledujúcu vetu: Severná Halmahera, najmä Morotai, zohrala úlohu v druhej svetovej vojne. Ostrov Morotai obsadili Japonci začiatkom roku 1942. Južnú rovinu Morotai obsadili americké sily v septembri 1944 počas
Bitka pri Morotai, ktorá sa stala základňou spojeneckej invázie na Filipíny začiatkom roku 1945 a na Borneo v máji a júni toho istého roku. Japonský vojak Teruo Nakamura bol objavený v džungli Morotai v roku 1974, ako jeden z japonských vojakov z druhej svetovej vojny, ktorí vydržali po kapitulácii japonskej armády. Ostrov Morotai už od roku 2009 nie je súčasťou regiónu Severná Halmahera.