V decembri 1944 sa Tomioka vrátil do generálneho štábu námorníctva ako šéf operačného úradu a túto pozíciu zastával po zvyšok vojny. Bol jedným z oficiálnych zástupcov generálneho štábu cisárskeho japonského námorníctva na japonskom ceremoniáli kapitulácie.
Na.