Ako poradca vlády Manchukuo počas vojny, so sídlom v Dairen, sa Yasue stále menej zúčastňoval na pláne Fugu v akejkoľvek oficiálnej funkcii. Udržiaval však kontakty a určitú angažovanosť s židovskou komunitou v Šanghaji, ktorá vznikla v dôsledku jeho akcií. Keď Sovietsky zväz napadol Manchukuo
V auguste 1945, tesne pred kapituláciou Japonska a koncom vojny, sa Yasue nepokúsil utiecť z pevniny. Usporadil formálne rozlúčenie so svojou rodinou, v ktorom vyjadril svoj názor, že za vojnu a jej výsledok je vinná celá jeho generácia. Necítil, že by bolo čestné utiecť od svojej zodpovednosti, a tak sa nechal zajať sovietskymi silami.