V októbri 2015 Horst Seehofer, premiér bavorského štátu a vodca CSU, kritizoval politiku Merkelovej, ktorá dovolila stovky tisíc migrantov z Blízkeho východu.
"Sme teraz v stave mysle bez pravidiel, bez systému a bez poriadku kvôli nemeckému rozhodnutiu". Seehofer ostrým jazykom napadol politiku Merkelovej, vyhrážal sa, že bude žalovať vládu na najvyššom súde a naznačil, že CSU by mohla zvrhnúť Merkelovú. Mnohí poslanci Merkelovej CDU tiež vyjadrili nespokojnosť s Merkelovou. Kancelárka Merkelová trvala na tom, že Nemecko má ekonomickú silu zvládnuť príliv migrantov a zopakovala, že neexistuje zákonný maximálny limit počtu migrantov, ktorých môže Nemecko prijať.