V Ženských šachových olympiádach, Aginian reprezentovala Arménsko sedemkrát (1996, 1998, 2000, 2004, 2006, 2008 a 2010) na 33. šachovej olympiáde, 34. šachovej olympiáde
, 36. šachová olympiáda, 37. šachová olympiáda, 38. šachová olympiáda a 39. šachová olympiáda