Po návrate do Austrálie bol batalónovi udelený 24-dňový odchod, predtým ako sa v marci znovu zoskupil v Ravenshoe v Queenslande, aby začal prípravy na ďalšiu fázu vojny. Batalón zažil vysoký obrat personálu a v čase, keď sa v polovici roku 1945 opäť dostal do boja, zostalo iba 141 osôb, ktoré boli vyslané na Blízky východ v roku 1940. Nový veliteľ, podplukovník Noel Simpson, prišiel v máji 1944 spolu s veľkým množstvom ďalších posily, ktoré nahradili mnoho mužov, ktorí ešte trpeli maláriou z predchádzajúcej kampane. Nasledovalo dlhé tréningové obdobie, pretože existovala určitá neistota o úlohe austrálskej armády v budúcich operáciách v Tichom oceáne po tom, ako americká armáda prevzala hlavnú zodpovednosť za bojové operácie v divadle. Napriek tomu sa v posledných mesiacoch vojny 2/43 zúčastnila na snahe získať späť Labuan.
a Severné Borneo ako súčasť operácie Oboe Six.