Napíšte pokračovanie tohto odseku - Prkačin bol členom chorvátskeho juniorského národného tímu do 22 rokov. Jeho debut na veľkom turnaji s seniorským chorvátskym národným tímom nastal na EuroBasket v roku 1997. Po tom, čo hrál s Chorvátskom na nasledujúcich veľkých turnajov FIBA: EuroBasket 1999, EuroBasket 2001, EuroBasket 2003, EuroBasket 2005 a EuroBasket 2007, tiež reprezentoval Chorvátsko na Letných olympijských hrách 2008.
a EuroBasket 2009. Prkačin bol dvakrát kapitánom chorvátskeho tímu.