V januári 1943 sa pluk vrátil do Austrálie na palube lode "Ile de France" ako súčasť finále presunu austrálskych pozemných jednotiek z Blízkeho východu do Tichého oceánu. Po odchode sa 2/12th znovu formoval v Kairi, na Atherton Tablelands v Queenslande v apríli 1943. Nasledovalo obdobie reorganizácie a výcviku, keďže 2.12. bol pripravený na náročné bojovanie v džungli. Koncom júla sa oddelením v Cairns vydali na niekoľko transportov vrátane "Van Heutz", "W Ellery Channing" a "Van Der Lijn", smerujúcich do Novej Guiney, kde sa mali pripojiť k boju proti Japoncom. Po príchode do zálivu Milne v auguste sa následne zúčastnili vylodenia okolo Lae a potom Finschhafenu v septembri a videli akciu počas kampane na polostrove Huon. Podporujúca 20. pešia brigáda počas počiatočného pristátia okolo Scarlet Beach, keď bol zabezpečený Finschhafen, zbrane pluku podporujú útok na Sattelberg z pobrežnej roviny, predtým ako podporujú ďalší postup na sever ako súčasť pohonu smerom k Sio pred návratom do Austrálie začiatkom roku 1944. Po ročnom tréningu v okolí Ravenshoe v Queenslande, pluk podnikol svoju poslednú vojnu v roku 1945, poskytujúc palebnú podporu počas bitky o Severné Borneo. Pridelený na podporu 24. pešej brigády počas vylodenia na Labuane
Dvaja vojaci z 2/12th prišli na breh spolu s útočiacou pešoťou v LVT, niečo, čo Austrálska armáda nikdy predtým neurobila. Neskôr, v júni, bolo 14 kanónov z pluku premiestnených barkou na podporu operácií okolo Westonu a Beaufortu. Bažinatá pôda v tejto oblasti spôsobila problém strelcom, ktorí museli podložiť pôdu kokosovými palmami. Na konci vojny bol pluk rozpustený a jeho posledný záznam vo vojnovom denníku bol vykonaný 1. marca 1946.