V roku 1856 sa Kekulé stal Privatdozentom na univerzite v Heidelbergu. V roku 1858 bol najatý za plnohodnotného profesora na univerzite v Ghente, potom v roku 1867 bol povolaný do Bonnu, kde zostal po zvyšok svojej kariéry. Založil svoje myšlienky na predchodcoch ako Williamson, Edward Frankland, William Odling, Auguste Laurent, Charles-Adolphe Wurtz a iní, Kekulé bol hlavným tvorcom teórie chemickej štruktúry (1857<unk>58). Táto teória vychádza z myšlienky atómovej valencie, najmä tetravalencie uhlíka (ktorú Kekulé oznámil koncom roku 1857) a schopnosti atómov uhlíka vzájomne sa prepojiť (oznámená v článku uverejnenom v roku 1858), na určenie väzby všetkých atómov v ťažkej organickej molekule. Archibald Couperland bol najprv aktívny, potom v roku 1867 bol povolaný do Bonn, kde zostal po zvyšok svojej kariéry.
chemická štruktúra