Od 23. apríla 1863 až do konca vojny, "Choctaw" operoval v rieke Mississippi a jej prítokoch. Medzi 29. aprílom a 1. májom 1863 sa postavila nad riekou Yazoo na predstieraný útok na Haynes' Bluff, Mississippi, určený na zabránenie posilneniu Konfederátov.
Veľký záliv. Počas tejto akcie bola zasiahnutá 53-krát.