Dokonči nasledujúcu vetu: Ako delegát Junty viedol nešťastnú paraguayskú kampaň. Jeho jednotky porazil Bernardo de Velasco v bitkách pri Campichuelo a
Paraguajčania. Hoci bol porazený, kampaň začala reťaz udalostí, ktoré viedli k nezávislosti Paraguaja v máji 1811. Vrátil sa do okolia Rosaria, aby ho opevnil proti možnému útoku rojalistov z východného pásma rieky Uruguaj. Tam vytvoril vlajku Argentíny. Prvý triumvirát vlajku neschválil, ale kvôli pomalým komunikáciám sa o tom Belgrano dozvedel až o niekoľko týždňov neskôr, keď posilňoval Armádu Severu v Jujuy. Tam, vediac, že je v strategickej nevýhode proti royalistickým armádam prichádzajúcim z Horného Peru, Belgrano nariadil Jujujský exodus, ktorý evakuoval celú populáciu provincie Jujuy do San Miguel de Tucumán. Jeho protiofenzíva v bitke pri Tucumáne viedla k kľúčovému strategickému víťazstvu, ktoré čoskoro nasledovalo úplné víťazstvo nad rojalistickou armádou Pío Tristána v bitke pri Salte. Avšak jeho hlbšie vpády do Horného Peru viedli k porážkam pri Vilcapugio a Ayohuma, čo viedlo k tomu, že Druhý triumvirát nariadil jeho nahradenie ako veliteľa armády Severu novopríletým Joséom de San Martínom. V tom čase už Asamblea del Año XIII schválila používanie Belgránskej vlajky ako národnej vojnovej vlajky.