Čo pomáha navrhovať terapeutické protilátky? Vzhľadom na predchádzajúcu otázku napíšte kontext, ktorý obsahuje odpoveď. Môže to byť 1 - 20 vetí. Kontext:
Veľké lieky (> 500 Da) môžu vyvolať neutralizujúcu imunitnú odpoveď, najmä ak sa lieky podávajú opakovane alebo vo väčších dávkach. To obmedzuje účinnosť liekov založených na väčších peptidoch a bielkovinách (ktoré sú zvyčajne väčšie ako 6000 Da). V niektorých prípadoch samotný liek nie je imunogénny, ale môže sa podávať súčasne s imunogénnou zlúčeninou, ako je to niekedy v prípade Taxolu. Výpočtové metódy boli vyvinuté na predpovedanie imunogenity peptidov a bielkovín, ktoré sú obzvlášť užitočné pri navrhovaní terapeutických protilátok, posudzovaní pravdepodobnej virulencii mutácií v časticiach vírusovej vrstvy a validácii navrhovaných liečebných liekov na báze peptidov. Prvé techniky sa spoliehali hlavne na pozorovanie, že hydrofílne aminokyseliny sú v epitopových oblastiach nadmerne zastúpené ako hydrofóbne aminokyseliny; novší vývoj sa však spolieha na techniky strojového učenia s použitím databáz existujúcich známych epitóp, zvyčajne na dobre študovaných vírusových bielkovinách, ako výcvikový súbor. Bola vytvorená verejne prístupná databáza na katalogizáciu epitóp patogénov, o ktorých je známe, že ich môžu rozpoznať B-bunky. Vznikajúca oblasť štúdií imunogenity založených na bioinformatike sa označuje ako imunoinformatika. Imunoproteomika je štúdium veľkých súborov proteínov (proteomika) zapojených do imunitnej odpovede.