Novinári uviedli, že "možno zohral vedúcu úlohu pri organizovaní" volebného víťazstva Ahmadínežáda a že môže byť "kľúčovou postavou pri organizovaní zásahu proti protestujúcim proti vláde" v júni 2009 a priamo zodpovedný za polovojenskú Basij, napriek tomu, že jeho meno bolo v tlačových médiách režimu zamlčané. V otvorenom liste Mehdi Karroubi, bývalý predseda Majlis (parlament) a reformistický kandidát na prezidentské voľby v roku 2009
, výslovne obvinil Mojtabu Chameneího z účasti na sprisahaní s cieľom zmanipulovať voľby, s odvolaním sa na nezákonné zasahovanie "sietí".