V máji 1861, 2. poručík Heywood bol povýšený na prvého poručíka, a ako taký pristál s mariňákmi na
Hatteras Inlet, kde bol prítomný pri dobytí Fort Clark a Fort Hatteras. V novembri toho istého roku bol povýšený na kapitána a počas zimy 1861-62 sa aktívne zúčastnil niekoľkých lodných expedícií na rieke James.