V roku 1943 slúžil Serong ako generálny štábny dôstojník 2 s kombinovanými 6. a 7. divíziami na Atherton Tableland v ďalekom severnom Queenslande, kde odpočívali a precvičili sa pred ďalším vedením operácií. Začiatkom roku 1944 vyučoval na personálnom kurze v Cabarlah. V auguste sa presťahoval do Aitape, aby sa pripravil na rozmiestnenie 6. divízie. Neskôr bol pridelený k americkým silám pre vylodenie na ostrove Morotai.
v Holandskej Východnej Indii v polovici septembra 1944. V posledných týždňoch vojny bol Serong spomenutý v depešiach za svoje činy v boji proti Japoncom v Wewaki, keď slúžil s pešoškou v 35. praporu. Počas incidentu 21. júla 1945 velel sile troch plutonov a miestnej polície na hliadke na zničenie japonskej skládky munície. Hoci strávil viac času na výcvikových funkciách ako v boji, počas vojny mal Serong dôležité kontakty, s ktorými neskôr pracoval v budúcich pozíciách, vrátane plukovníka Reg Pollarda, ktorý sa neskôr stal náčelníkom generálneho štábu (CGS) a plukovníka Charlesa Spryho, neskôr riaditeľa vojenskej spravodajskej služby a generálneho riaditeľa austrálskej bezpečnostnej spravodajskej organizácie (ASIO).