Ferrisov vzostup mu priniesol v období mieru medzi koncom americkej vojny za nezávislosť a vypuknutím francúzskych revolučných vojen velenie niekoľkých malých lodí, ale až do začiatku vojen s Francúzskom nedosiahol hodnosť plného kapitána. Strávil väčšinu vojny velením jednej lode, na rôznych eklektických službách. Nasledovali viac aktívnych a konvenčných velení a bol zapojený do zachytenia Gorée v roku 1801. Po návrate z tohto triumfu bol vymenovaný za veliteľa 74-paľby a vyslaný s flotilou pod vedením kontradmirála sira Jamesa Saumareza na hliadky vo francúzskych a španielskych prístavoch. Pri vykonávaní tejto úlohy Saumarez objavil a zaútočil na letku pod velením Charlesa-Alexandra Leona Duranda Linois. Táto akcia,
Prvá bitka pri Algeciras bola tvrdá a Britom bránili plytké vody, ľahký vánok a prítomnosť nepriateľských pobrežných batérií. "Hannibal" uviazol na brehu a bol ťažko poškodený, pričom utrpel niekoľko zranení. Pokusy o jej odplávanie z lodi zlyhali a zvyšok flotily jej nebol schopný pomôcť. V beznádejnej situácii bol Ferris nútený vzdať sa svojej lode.