Na rok 2006 Super Aguri prevzal Montagnyho ako tretieho jazdca; bol však v máji povýšený na plného pretekárskeho jazdca po tom, čo bolo oznámené, že Yuji Ide sa má vrátiť do testovania; Ide bol degradovaný na príkaz riadiaceho orgánu, ktorý ho považoval za nedostatočne skúseného pre Formule 1. Montagny tak súťažil vo svojej prvej Grand Prix,
2006 Grand Prix Európy 7. mája, kvalifikácia posledná a odchod do dôchodku s problémom s hydraulikou. Neukončil svoj druhý závod v španielskej Grand Prix 2006: po skvelom štartovaní, ktorý mu umožnil získať 3 pozície, odišiel z 10. kola s mechanickou poruchou. Bolo to tretie šťastie pre neho na Grand Prix v Monaku, keď dokončil 78-kolový závod na 16. mieste, tri koly za lídrom.