Napätie existovalo aj medzi rímskokatolíckou cirkvou a po revolúcii
Mexická vláda. Do ústavy krajiny z roku 1917 boli zapísané prísne obmedzenia práv Cirkvi a členov duchovenstva, čo viedlo k vypuknutiu krištérskej vojny v roku 1926. V roku 1992 vláda obnovila diplomatické vzťahy so Svätou stolicou a zrušila takmer všetky obmedzenia pre katolícku cirkev. Tento neskorší krok zahŕňal udelenie legálneho postavenia všetkým náboženským skupinám, priznanie im obmedzených práv na vlastníctvo a zrušenie obmedzení počtu kňazov v krajine. Zákon však naďalej vyžaduje prísne oddelenie cirkvi od štátu. Ústava stále zakazuje členom duchovenstva zastávať verejnú funkciu, obhajovať politické názory, podporovať politických kandidátov alebo odporovať zákonom alebo inštitúciám štátu.