V septembri 1942 sa Blamey rozhodol poslať 6. divíziu do Papuy, aby pomohla zastaviť japonský postup pozdĺž
Kokoda Trail. Navštívil v Port Moresby generála Sydneyho Rowella, veliteľa Novej Guiney a I. zboru, a opýtal sa ho, koho by radšej poveril divíziou. Rowell vybral Vaseyho, takže Vasey sa stal veliteľom 6. divízie a ako DCGS ho nahradil Berryman. Neskôr v tom istom mesiaci generál Douglas MacArthur a premiér John Curtin nariadili Blameyovi, aby osobne prevzal velenie nad silami Novej Guiney. Po hádke Blamey najprv nahradil Rowella Herringom a potom generála majora Artura "Tubbyho" Allena zo 7. divízie. Dňa 27. októbra Vasey letel do Myoly, aby nahradil Allena.