V auguste sa "Pawnee" pripojila k Atlantickej blokádnej eskadre v Hampton Roads a 26. sa plavila na pobrežie Severnej Karolíny. Tam sa zúčastnila na
útoky na pevnosti Hatteras a Clark (28/29), ktoré kapitulovali a boli obsadené americkými vojskami. "Pawnee" zostal v Hatteras Inlet až do 3. októbra, zachytil štyri ceny a získal späť dve lode, ktoré predtým zajali Konfederáci.