Unser pokračoval v zlepšovaní na okruhu CART, skončil štvrtý v bodovom poradí v roku 1986, tretí v roku 1987, druhý v roku 1988 a nakoniec vyhral sériu prvýkrát v roku 1990. V roku 1989 bol Unser na pokraji svojho prvého víťazstva v Indianapolis 500, ale keď bojoval s Emersonom Fittipaldiom o vedenie, oba kolesá sa dotkli a Unser sa otočil, narazil do steny a ukončil svoje šance. Tento závod je zapamätaný za pozoruhodnú ukážku športového ducha, keď Malý Al vystúpil zo svojho zničeného pretekárskeho auta a dal Fittipaldiovi "palce hore", keď riadil Unser pod opatrnosťou. Unser by mal svoj deň v Indy v roku 1992
, však porazil Scott Goodyear o 0.043 sekundy, čo je najbližší koniec v histórii Indianapolis 500.