V máji 1861 bol 2. poručík Heywood povýšený na prvého poručíka a ako taký pristál s mariňákmi na Hatteras Inlet.
, kde bol prítomný pri dobytí Fort Clark a Fort Hatteras. V novembri toho istého roku bol povýšený na kapitána a počas zimy 1861-62 sa aktívne zúčastnil niekoľkých lodných expedícií na rieke James.