Po voľbách v roku 1986 Sadiq vytvoril koaličnú vládu, ktorá pozostávala z strany Umma (ktorú viedol), Národnej islamskej fronty (ktorú viedol jeho švagor Hassan Al-Turabi), Demokratickej unionistickej strany (ktorú viedol Mohammed Uthman al-Mirghani al-Khatim) a štyroch malých južných strán. Táto koalícia sa však ukázala ako nestabilná a bránila Sadiqovi plniť svoje sľuby ukončiť druhú sudánsku občiansku vojnu a vyriešiť prebiehajúcu hospodársku krízu. Dňa 30. júna 1989 bola jeho vláda zvrhnutá pri prevrate.
vedený brigádnym Omarom al-Bashirom. Úrad predsedu vlády Sudánu bol potom zrušený.