V apríli 1975 južná armáda Vietnamskej republiky stratila kontrolu nad Saigonom vo Vietnamskej vojne a
mesto padlo do rúk vietnamskej ľudovej armády. Nová komunistická vláda skonfiškovala univerzitu Van Hanh a jej budovy sa premenili na spálne. Doan bol zadržaný v nasledujúcom roku v masovom zhromaždení intelektuálov s väzbami na Spojené štáty, na základe toho, že hoci v tejto chvíli nemusí byť agentom CIA, mohol by sa ním kedykoľvek stať. Dňa 29. augusta 1976 bol poslaný do reedukačného tábora, kde bol uväznený bez súdu na dvanásť rokov v cele zdieľanej s 40 ďalšími ľuďmi.