Dokončite nasledujúcu vetu: V čase, keď Margaret, jej syn a snacha (Anna) boli pripravení nasledovať Warwick späť do Anglicka, stoly sa opäť obrátili v prospech Yorkovcov a gróf bol porazený a zabitý vracajúcim sa kráľom Eduardom IV.
Bitka pri Barnete 14. apríla 1471. Margaret bola nútená viesť vlastnú armádu v bitke pri Tewkesbury 4. mája 1471, v ktorej boli Lancasterské sily porazené a jej sedemnásťročný syn Eduard z Westminsteru bol zabitý. Okolnosti Edwardovej smrti neboli nikdy objasnené; nie je známe, či bol zabitý v skutočnom boji alebo popravený po bitke vojvodom z Clarence. V priebehu predchádzajúcich desiatich rokov si Margaret získala povesť agresívnej a nemilosrdnej, ale po porážke v Tewkesbury a smrti svojho jediného syna bola úplne zlomená. Po tom, ako ju William Stanley zajal na konci bitky, bola Margaret uväznená na príkaz kráľa Edwarda. Najprv ju poslali do hradu Wallingford a potom presunuli do bezpečnejšieho Toweru v Londýne. Ján VI. bol tiež uväznený v Toweru v dôsledku Tewkesbury a zomrel tam v noci z 21. mája; príčina jeho smrti je neznáma, hoci bola podozrivá z regicídu. V roku 1472 bola uložená do starostlivosti svojej bývalej dvornej dámy Alice Chaucerovej, vojvodkyne z Suffolku, kde zostala až do vykúpenia Ludvíkom XI. v roku 1475.