Zatiaľ, americká námorná spravodajská služba sa presvedčila, že Japonci plánujú útok na ostrov Midway v centrálnom Pacifiku. Admirál Chester Nimitz, vrchný veliteľ tichomorskej flotily USA, sa rozhodol využiť príležitosť, aby sa s nimi stretol. Strata Midway by bola veľmi vážnou hrozbou, pretože Japonci by potom mohli ľahko prevziať Havaj a ohroziť západné pobrežie Spojených štátov. Strata jeho najagresívnejšieho a bojovo skúseného admirála Halseyho v predvečer tejto krízy bola pre Nimitza vážnou ranou. Nimitz sa stretol s Halseym, ktorý odporučil jeho veliteľovi divizie krížnikov, kontradmirálovi Raymondovi Spruanceovi, aby prevzal velenie nadchádzajúcej Midway
operácia. Nimitz zvažoval tento krok, ale znamenalo by to prejsť nad admirálom Frankom Fletcherom z Task Force 17, ktorý bol starší z dvoch mužov. Po rozhovore s Fletcherom a preskúmaní jeho správ z angažovanosti v Koralovom mori bol Nimitz presvedčený, že Fletcherov výkon bol dobrý, a dostal zodpovednosť za velenie v obrane Midway. Na základe Halseyho odporúčaní Nimitz následne vymenoval kontraadmirála Spruancea za veliteľa Halseyho Task Force 16, ktorá pozostávala z lietadlových lodí Enterprise a Hornet. Aby pomohol Spruanceovi, ktorý nemal žiadne skúsenosti ako veliteľ lietadlových síl, Halsey poslal spolu so svojím podráždeným náčelníkom štábu, kapitánom Milesom Browningom.