Po vypuknutí občianskej vojny v roku 1862 rezignoval na svoje poslanie, aby sa zapísal do 24. regimentu dobrovoľníckej pechoty v Iowe. Prihlásil sa ako vojak, ale bol zvolený za kapitána svojej roty. Zostal v armáde po celú vojnu, pričom dostal menšie zranenia v bitkách pri Champion Hill (Mississippi) a Winchester
(Virginia). V septembri 1864 bol povýšený na majora a v januári 1865 na podplukovníka a v auguste 1865 bol odvolaný.