Dokonči nasledujúcu vetu: V neskorších rokoch sa vzťahy medzi Sauberom a Ferrari oslabili. Na konci sezóny 2004 sa postavili na stranu tímov, ktoré nie sú Ferrari, kvôli plánovaným zmenám pravidiel a tiež sa pripojili k GPWC. Potom sa rozhodli prejsť na pneumatiky Michelin, zatiaľ čo Ferrari pokračovalo v používaní pneumatík Bridgestone. Medzitým spoločnosť Red Bull opustila Sauber v roku 2005 a založila svoj vlastný tím, Red Bull Racing. Vlastníctvo BMW sa začalo 1. januára 2006 tým, že spoločnosť BMW kúpila podiel Credit Suisse v tíme. Posledná veľká cena Saubera pred prevzatím BMW bola
2005 Grand Prix Číny, kde Massa zaujal vítané šieste miesto, čím zakončil históriu tímu. Sauber ukončil svoj nezávislý beh vo F1 so šiestimi tretími miestami a dvoma začiatkami v prvej rade, čo boli ich najlepšie výsledky. Medzi pozoruhodnými jazdcami Sauberu boli Jean Alesi, Felipe Massa, Johnny Herbert a Jacques Villeneuve, majster sveta v roku 1997. Dvaja bývalí jazdci Sauberu v roku 2006 jazdili za nový tím BMW Sauber: Nick Heidfeld, ktorý bol jazdcom Sauberu od roku 2001 do roku 2003, a Villeneuve, ktorý jazdil za tím v roku 2005.