Po ukončení USMA, Hunter bol poverený a pridelený na pohraničnú službu so Štvrtým kavalériovým oddelením. Zúčastnil sa rôznych konfliktov počas amerických indiánskych vojen od roku 1877 do roku 1984. Počas španielsko-americkej vojny, Hunter bol zranený pri
San Juan Hill. V roku 1903 bol Hunter umiestnený na Filipínach, aby potlačil povstanie. Znova bol umiestnený na Filipínach od roku 1911 do roku 1914 vo Fort McKinley. Hunter sa vrátil do Spojených štátov v júni 1914 a bol pridelený k službe ako generálny inšpektor v Chicagu, Illinois až do augusta 1917.