Napíšte pokračovanie pre tento odsek - Po integrácii flotily Virginie do námorníctva Konfederácie, bol Barron poverený ako veliteľ a vymenovaný za šéfa Úradu príkazov a podrobností 10. júna. Barron zostal na tomto mieste do 20. júla, kedy konfederovaný tajomník námorníctva Stephen R. Mallory súhlasil s Barronovou žiadosťou, aby bol pridelený ako veliteľ pobrežnej obrany Virgínie a Severnej Karolíny, dôležitého prístavu pre konfederovaných korespondentov so sídlom v Pamlico Sound. Po príchode do svojho veliteľstva na pevnosti Hatteras 28. augusta, Barron velil obranu oboch pevností Hatteras
a Clarka proti dôstojníkovi vlajky Únie Silase H. Stringhamovi počas bitky pri Hatteras Inlet 28. - 29. augusta. Barron bol zajatý po kapitulácii dvoch pevností. Stretol sa vo Fort Columbus na ostrove Governors v prístave v New Yorku, potom vo Ft. Warren, prístav v Bostone, Barron bol nakoniec prepustený v výmene väzňov v nasledujúcom roku.