Dokonči nasledujúcu vetu: Bojoval s jednotkou pri pevnosti Henry, pevnosti Donelson, Korintu, Shiloh a Hatcher's Run. Potom ochorel na týfus a 1. augusta 1862 bol prepustený. Vrátil sa po zotavení s Chicago Mercantile nezávislé batérie ľahké delostrelectvo, kde bojoval na Arkansas Post,
Port Gibson, Champion Hill, most nad Veľkou Čiernou riekou, Vicksburg a Mansfield. Pri Mansfielde bola brigáda zajatá a Arnold sa stal zajatcom. Bol uväznený v tábore Ford v Texase 14 mesiacov.