V auguste 1940 bola York pridelená k flotile Stredozemného mora. Koncom septembra sa pripojila k 3. krížnikovej eskadre v Alexandrii, po tom, čo sprevádzala konvoj okolo mysu Dobrej nádeje. O dva dni neskôr sa zúčastnila operácie MB.5, kde stredomorská flotila eskortovala ľahké krížniky a ako prevážali vojakov na Maltu. Počas bitky pri mysu Passero, York potopil znevýhodnenú a opustenú torpédoborec 13. októbra po zápase torpédoborec s ľahkým krížnikom predchádzajúci večer. O mesiac neskôr "York" a Stredozemná flotila vykonali operáciu MB8, komplexnú sériu manévrov, vrátane
Operácia Judgment, kde loď eskortovala lietadlovú loď, keď jej lietadlá napadli taliansku flotilu v Tarente večer 11./12. novembra. O niekoľko dní neskôr loď "York" previezla britské vojská z egyptskej Alexandrie do gréckeho Pireja. Dňa 26. novembra "York" a zvyšok 3. krížnikovej eskadry pokryli malý konvoj na Maltu.