V februári 2004 Rybkin zmizol na 4 dni za záhadných okolností. Deň po svojom návrate obvinil Putinovu administratívu z účasti na
Bombové útoky v Moskve v roku 1999, ktoré viedli k vojne v ruskej separatistickej republike Čečensko. O päť dní neskôr sa Rybkin objavil v Kyjeve. Neskôr vyhlásil, že bol unesený a omamnený ruskými agentmi FSB, ktorí ho lákali na Ukrajinu sľubom, že usporiada stretnutie s bývalým čečenským vodcom Aslanom Maschadovom. Po príchode mu ponúkli občerstvenie v byte, a v tom momente sa mu "zhorelo". Po tom, čo bol v bezvedomí, sa zobudil 10. februára. Keď sa zobudil, ukázali mu videokazety, na ktorých sa zúčastnil "odporných skutkov", ktoré vykonali "strašní úchylníci". Bolo mu povedané, že nahrávka bude zverejnená, ak bude pokračovať vo svojej prezidentskej kampani. Podľa Alexandra Litvinenka agenti FSB očividne liečili Rybkina štandardnou drogou pravdy.