Dokončite nasledujúcu vetu: Synagoga sa čoskoro stala centrom malej, ale žiarivej židovskej komunity, ktorej jeden z vodcov, Abraham Reuben, sa v roku 1936 stal radcom mestskej samosprávy v Karači. Po rozdelení Britskej Indie podľa náboženských zásad medzi hinduistami a moslimami v auguste 1947 spadlo mesto Karáči do hraníc nového štátu s moslimskou väčšinou v Pakistane, po ktorom sa predná nálepka synagógy zmenila a označila ju ako "Pakistán Bene Izraelská komunita". O necelý rok neskôr bola synagóga napadnutá a zapálená moslimskými výtržníkmi po vyhlásení nezávislosti štátu Izrael v roku 1948. Počas tejto doby bolo napadnutých niekoľko Židov po celom Pakistane, čo nakoniec viedlo k tomu, že časti komunity utiekli do susednej Indie. Avšak frekvencia útokov na Židov v Pakistane sa zvýšila po každej z arabsko-izraelských vojen v roku
1948, 1956, 1967 a 1973. Začiatkom sedemdesiatych rokov minulého storočia odišla pakistanská židovská komunita do Izraela alebo Indie v dôsledku židovského exodu z moslimských štátov, čo viedlo k tomu, že synagóga bola do značnej miery neaktívna. Dňa 17. júla 1988 bola synagóga zbúraná a nakoniec nahradená nákupným námestím (Madiha Square) v štvrti Ranchore Line v južnom Karačí.