Comey s-a născut pe 14 decembrie 1960, în Yonkers, New York, de părinții Joan Marie Comey (născută Herald) și J. Brien Comey. Bunicul său, William J. Comey, a fost ofițer și mai târziu comisar al Departamentului de Poliție din Yonkers. Familia sa s-a mutat în Allendale, New Jersey, la începutul anilor 1970. Tatăl său a lucrat în domeniul imobiliar al corporațiilor, iar mama sa a fost consultantă în domeniul calculatoarelor și gospodină. Comey este de origine irlandeză.
Doctor în drept (JD)