Scrii o continuare pentru acest paragraf - Cercetările și scrierile lui Beinin se concentrează asupra muncitorilor, țăranilor și minorităților din Orientul Mijlociu modern. Deși inițial interesat de creșterea unei clase muncitoare arabe în Palestina Mandatorie, sub sfatul supervizorului său de teza, el a schimbat subiectul tezei sale de doctorat la o istorie a mișcării muncitorești egiptene din 1936. Această teză de doctorat a fost combinată cu una care acoperă o perioadă anterioară a istoriei muncii egiptene de către prietenul și colegul său Zachary Lockman și a dus la publicarea cărții "Lucrătorii de pe Nil: naționalism, comunism, islam și clasa muncitoare egipteană, 1882-1954" (1989). Printre lucrările sale ulterioare se numără un studiu al comunităților evreiești din Egiptul modern, care a condus la studiul său istoric major, "Dispersia evreilor egipteni: cultură, politică și formarea unei diaspore moderne" (1998), care examinează diversitatea identităților evreiești egiptene în Egipt și în diaspora. El s-a angajat în munca de teren pentru a colecta rapoarte orale între multe comunități evreiești egiptene împrăștiate în întreaga lume după Războiul de la Suez.
din 1956, printre care Karaites din San Francisco.