Cardinalii au continuat să câştige după plecarea icoanelor francizei, La Russa şi Pujols. Fostul backstop al Cardinals, Mike Matheny, a devenit noul manager al Cardinals pentru sezonul 2012. Carlos Beltrán, un alt agent liber semnat pentru a-l înlocui pe Pujols înainte de sezonul 2012, a obținut un premiu de jucător al săptămânii în luna mai după ce a lovit șase home run-uri într-o săptămână; în cele din urmă a lovit 32 pentru sezon. În playoff, Cardinalii au profitat de noua lor personalitate de revenire împotriva Washington Nationals în NLDS: în ultimul joc, Pete Kozma a condus două runuri în a noua repriză pentru a câștiga seria după ce a fost în urmă cu 6-0. Cu toate acestea, după ce au urcat cu 3 la 1, au căzut în fața lui San Francisco Giants în NLCS.
- Da, domnule. După sezon, publicațiile de top, cum ar fi ESPN și "Baseball Prospectus", au continuat să afișeze sistemul de fermă Cardinals ca fiind unul dintre cele mai bune sisteme din baseball.