Cea mai comună formă de încrucișare cromozomală este recombinația omologă, în care cele două cromozomi implicate au secvențe foarte similare. Recombinația non-homologă poate fi dăunătoare pentru celule, deoarece poate produce translocații cromozomiale și anomalii genetice. Reacția de recombinație este catalizată de enzime cunoscute sub numele de recombinații, cum ar fi RAD51. Primul pas în recombinație este o distrugere dublă cauzată fie de o nuclează, fie de o deteriorare a ADN-ului la capătul de vest. O serie de etape de recombinație poate fi, de asemenea, implicată în repararea ADN-ului, în special în răspunsul celulei la ruperile de două fire.
structură de joncțiune tetraedrică