Deși răscoala din Albayzín părea să fie înăbușită și Granada a fost transformată în mod nominal într-un oraș creștin, rebeliunea s-a răspândit în mediul rural. Liderii răscoalei Albayzín au fugit în munții Alpujarra. Locuitorii munților, aproape exclusiv musulmani, au acceptat doar cu reticență dominația creștină. Ei s-au ridicat rapid în revolte împotriva a ceea ce considerau a fi o încălcare a termenilor Tratatului de la Granada și pentru că se temeau că vor suferi aceleași conversii forțate ca și locuitorii din Albayzín. Până în februarie 1500, 80.000 de soldați creștini au fost mobilizați pentru a înăbuși rebeliunea. Din lipsa regelui Ferdinand, în martie următor, rebelii au continuat personal operațiunile. Rebelii creștini au luptat bine tactic și au folosit adesea terenul muntos pentru a conduce războiul de gherilă.
Rebelii au fost adesea bine conduși tactic și au folosit terenul muntos pentru a conduce războiul de gherilă