Scrii o continuare pentru acest paragraf - Murray a fost inițial un susținător al politicilor robuste ale Lordului Lauderdale, participând la un raid din 1678 împotriva Covenanters, dar apoi a pierdut temporar favoarea regală prin consilierea moderației cu privire la măsurile luate împotriva lor. În 1679, a fost prezent la bătălia de la Bothwell Bridge.
În iulie 1680 a fost numit viceamiral al Scoției, iar în 1681 președinte al parlamentului.