În 1969, Sattar a fost numit comisarul şef al alegerilor din Pakistan. El a organizat primele alegeri generale din Pakistan în 1970, în care Liga Awami a câștigat o majoritate parlamentară istorică pentru a forma guvernul. Liga a fost refuzată de preluarea puterii de către junta militară condusă de generalul Yahya Khan. În timp ce războiul de eliberare din Bangladesh a izbucnit cu un genocid
împotriva civililor bengalezi, Sattar a fost blocat în Islamabad, Pakistanul de Vest, îndepărtat de la pozițiile oficiale și internat de guvernul pakistanez. În 1973, Sattar s-a întors în Bangladesh independent ca parte a repatrierii oficialilor bengalezi blocați. El s-a bucurat de o prominență în creștere în Dhaka, dar a trăit o viață liniștită cu soția sa și nu a avut copii.