Pye a sosit la Marquette în toamna anului 1987 şi a servit ca rezervă pentru Mike Jeffrey în sezonul său de începător. El a preluat rolul de titular la începutul sezonului său de al doilea an și a oferit un impuls imediat în gol. NMU a trecut de la locul 6 la locul 2 în WCHA și Pye a condus Wilcats la primul lor campionat WCHA, capturând onorurile MVP. Northern Michigan nu a fost capabil să-l facă din prima rundă a turneului NCAA dar Buffalo Sabres a văzut suficient pentru a selecta Pye în runda a 6-a a
Draftul NHL.