După ce Statele Unite au intrat în cel de-al Doilea Război Mondial, Ballentine a servit ca al doilea ofițer comandant al portavionului de escortă USS "Long Island" din 26 decembrie 1941 până la 18 aprilie 1942. A fost promovat la gradul de căpitan la 30 iunie 1942. Ballentine a servit ca șef de personal al comandantului Grupului Operațional 34.2, contramiralul Ernest D. McWhorter, la bord în timpul invaziei Aliatilor în Africa de Nord Franceză.
În noiembrie 1942.