Empedocle a stabilit patru elemente supreme care formează toate structurile din lume: focul, aerul, apa, pământul. Empedocle a numit aceste patru elemente "rădăcini", pe care le-a identificat, de asemenea, cu numele mitologice Zeus, Hera, Nestis și Aidoneus (de exemplu, "Acum auziți rădăcinile pătrate ale tuturor lucrurilor: însuflețind Hera, Hades, strălucind Zeus. Și Nestis, udând izvoarele muritoare cu lacrimi. ") Empedocle nu a folosit niciodată termenul "element" (στοιχεῖον, stoicheion), care pare să fi fost folosit pentru prima dată de Platon. Potrivit diferitelor proporții în care aceste patru elemente indestructibile și neschimbătoare sunt combinate unele cu altele, se produce următoarea diferență a structurii. Este în segregarea și astfel în segregarea celor patru elemente, că Empedocle a numit aceste patru elemente "rădăcini", așa cum au numit-o atomistii, care a fost, de asemenea, identific
Foc, aer, apă, pământ.