Scrie o continuare pentru acest paragraf - Evenimentul a intrat apoi într-o perioadă de mari perturbări. Campionatul nu a fost jucat în mod regulat și multe ediții au fost considerate neoficiale, doar pentru a fi considerate valabile mai târziu de CONMEBOL. De exemplu, Argentina ar fi prima (și până acum singura) echipă care a câștigat trei titluri consecutive câștigând campionatele din 1945, 1946
şi 1947. După aceste trei turnee anuale, competiția a revenit la fiecare doi ani, apoi la trei și mai târziu la patru. Au fost chiar două turnee organizate în 1959, una în Argentina și a doua în Ecuador. În această perioadă, unele echipe naționale au fost indiferente la turneu. Unele nu au participat în fiecare an, altele au trimis echipe mai mici; în ediția din 1959 desfășurată în Ecuador, Brazilia a introdus o echipă din statul Pernambuco. Bolivia a câștigat pentru prima dată când a găzduit turneul în 1963, dar a fost învinsă în primul joc al turneului din 1967 de debutantul Venezuela. Înființarea Copa Libertadores în 1959 a afectat și modul în care turneul a fost văzut de participanții săi.