În 1999, cursa de 24 de ore de la Le Mans a început amar după ce echipa a fost afectată de mai multe defecțiuni de anvelope Michelin, situația devenind oarecum reminiscentă de 1998, când mașinile nr. 1 și nr. 2 au fost retrase. Martin Brundle din Toyota nr. 1 a suferit un punct la viteză mare pe linia dreaptă Mulsanne, suspensia spate a mașinii a fost grav deteriorată și nu a putut să se întoarcă la boxuri. Toyota nr. 2 condusă de Thierry Boutsen a fost următoarea victimă când a suferit un accident la viteză mare sub podul Dunlop din cauza unei deflaţii rapide. Maşina a fost distrusă şi Boutsen a suferit leziuni la partea inferioară a spatelui. La răsăritul zorilor, BMW nr. 15 era aproape cu un tur înaintea lui Toyota nr. 3, care se plimba în linişte cu o viteză constantă. Cu acest miros de victorie Ukyo Katayama a pus piciorul în Toyota şi a stabilit cel mai rapid tur al cursei. El a redus diferenţa la mai puţin de un minut până când din nou un pneu explodat a lovit echipa Toyota din nou. Katayama a reușit totuși să se întoarcă la box pentru anvelope noi și a continuat. A reușit să termine al doilea după un efort curajos plasându-se pe primul loc în clasa GT-P. Cu toate acestea, nu au obținut victoria generală la Le Mans, ceea ce i-ar fi făcut doar al doilea constructor japonez care a obținut o victorie generală (Mazda fiind primul în 1991).
), cu excepția