Martínez a început campania 2013-14 pe banca suplinitorilor, sub noul manager Pep Guardiola. La 30 august 2013, în același an,
În Supercupă UEFA din 2008, a intrat pe teren la începutul celei de-a doua reprize împotriva lui Chelsea și a marcat egalizatorul 2-2 în ultimul minut al prelungirii timpului, în timp ce bavarezii au câștigat trofeul în Praga după o serie de penalități. Martínez a încheiat sezonul cu un gol în 34 de apariții.