Primele 747-100 au fost construite cu șase ferestre de punte superioare (trei pe fiecare parte) pentru a găzdui zonele de salon de la etajul superior. Mai târziu, când companiile aeriene au început să utilizeze puntea superioară pentru scaune de pasageri premium în loc de spațiu de salon, Boeing a oferit o punte superioară cu zece ferestre ca opțiune. Unele primele -100 au fost dotate cu noua configurație. -100 a fost echipat cu motoare Pratt & Whitney JT9D-3A. Nu a fost dezvoltată nicio versiune de marfă a acestui model, dar multe 747-100 au fost convertite în marfă. Au fost construite un total de 168 de 747-100; 167 au fost livrate clienților, în timp ce Boeing a păstrat prototipul, Everett City.
șase ferestre de la puntea superioară (trei pe fiecare parte)