Scrie o continuare pentru acest paragraf - În octombrie 1939 - la scurt timp după Invazia Poloniei și începutul celui de-al Doilea Război Mondial - "Însemnări Ieșene" a publicat articolul său în care deplângea întoarcerea omului la natura sa "bestială" și își exprima temerile că viața modernă i-a făcut pe soldați indiferenți față de transcendenți. Popa a fost martor la evoluţiile ulterioare din lateral. Frontul Renașterii Naționale a căzut de la putere după ce a fost de acord cu pierderile teritoriale în favoarea Ungariei și a Uniunii Sovietice. El a făcut parte din Marele Caucus al Universității, care a emis un protest rezervat împotriva cedării Transilvaniei de Nord. Cu un număr special și articole în "Însemnări Ieșene", Popa a deplâns și pierderea Basarabiei și Bucovinei de Nord
- Da, domnule. Hărțuit de Garda de Fier, care l-a inclus pe lista neagră pentru asasinat, Popa a reușit să supraviețuiască regimului său de "stat național legionar", proclamat în septembrie 1940. Cu toate acestea, "Însemnări Ieșene" a fost interzisă, iar unii dintre membrii personalului său s-au mutat la revista "Cetatea Moldovei" de inspirație fascistă. Comisia de epurare a Facultății de Medicină din Iași, condusă de bărbați ai Gărzii de Fier, a propus transferul lui Popa "la o altă instituție științifică", citând "ideile de stânga" ale lui Popa ca motiv.