A fost o figură proeminentă în politica și societatea guatemaleză din anii 1970, când a câștigat proeminență ca ofițer de informații militare în Ministerul Finanțelor Publice al țării în timpul administrației Luis Garcia. În mare parte din războiul civil de 36 de ani din Guatemala
, Ortega Menaldo a fost puternic implicat în monitorizarea activităților de gherilă de stânga. În timpul mandatului lui Ortega ca director al serviciilor de informații militare, Administrația Americană pentru Combaterea Drogurilor "și-a coordonat operațiunile cu serviciile de informații militare", oferindu-i lui Ortega "acces la informații valoroase despre eforturile de interdicție și eradicare". S-a căsătorit cu fiica fostului președinte general Carlos Arana, având 3 copii, Francisco Ortega Jr., Enrique Ortega și Gabriela Ortega. Acum e pensionat.