Războiul de la Karonga a fost minor în ceea ce privește combatanții și victimele în comparație cu primul sau al doilea război Matabele din Rhodesia de Sud, dar a avut o semnificație majoră pentru istoria Malawiului, în special pentru nordul țării, deoarece a forțat o schimbare în politica guvernului britanic. Acest lucru a fost inițial pentru a se asigura că nici o altă putere nu a controlat zona de vest și de sud de Lacul Malawi, dar fără ca Marea Britanie să își asume suveranitatea asupra acestei zone. S-a schimbat într-una în care Marea Britanie a considerat necesar să proclame un protectorat. Ca şi revolta Abushiri, care a avut loc cam în acelaşi timp.
În Africa de Est Germană, războiul a reprezentat sfârșitul influenței politice a comercianților swahili care au recunoscut autoritatea sultanului Zanzibarului în Africa de Est și Centrală și sfârșitul încercărilor companiilor Chartered de a-și asuma sau de a păstra controlul în locul guvernelor lor de origine.