Scrie o continuare pentru acest paragraf - GT-One va concura doar o singură dată, un singur participant care apare în 1999 la Le Mans Fuji 1000km. Deși cursa a fost în mare parte formată din echipe japoneze, lăsând astfel în afara majoritatea producătorilor care au concurat la Le Mans, Toyota a trebuit totuși să concureze împotriva rivalului Nissan, care a intrat, de asemenea, cu R391. În cele din urmă, GT-One a fost din nou subțire, terminând pe locul 2 și doar cu un tur în spatele câștigătorului R391. Cu toate acestea, Toyota a câștigat clasa LMGTP (R391 fiind un LMP), ceea ce le-ar fi acordat intrarea automată la 2000 24 de ore de la Le Mans
au continuat programul GT-One.