După opt ani de succes la Peñarol în liga sa nativă uruguayană, Schiaffino a fost cumpărat de clubul italian Serie A A.C. Milan, pentru o taxă record mondială de 52 de milioane de lire, în septembrie 1954. A jucat 171 de meciuri cu A.C. Milan și a marcat 60 de goluri, și a participat la finala Cupei Europene din 1958, pe care Milan a pierdut-o în fața lui Real Madrid 2<unk>3 (aet). El a fost printre jucătorii ofensivi cruciali într-o echipă din Milano care a fost dominată de vedete străine precum Nils Liedholm și Gunnar Nordahl. Schiaffino a câștigat trei campionate naționale cu Milan, victoriile fiind în 1955, 1957 și 1959.
- Da, domnule. Schiaffino a plecat în 1960 pentru a se alătura Romei, unde și-a jucat cariera în două sezoane moderat de succes, în care Roma a terminat pe locul cinci în clasament.