Nelson a rămas cu Flota Mediterană timp de câțiva ani; a luptat în "Agamemnon" la Bătălia de la Genova
În 1795, a jucat un rol esențial în înfrângerea flotei spaniole în bătălia de la Cape St Vincent în 1797, iar în 1798 a condus flota britanică care a distrus flota mediteraneană franceză în bătălia de la Nil. În 1800, în timpul asediului Maltei, l-a întâlnit din nou pe Perrée în bătălia convoiului maltez, în care Perrée a fost ucis în acțiune, iar nava sa a fost capturată de Nelson. Nelson însuşi a fost ucis în luptă cinci ani mai târziu, în bătălia de la Trafalgar, în care a fost distrusă o flotă comună franceză şi spaniolă. El este amintit ca unul dintre cei mai mari și mai de succes comandanți navali britanici.