Atmosfera lui Jupiter este cea mai mare atmosferă planetară din Sistemul Solar. Ea este în mare parte alcătuită din hidrogen molecular și heliu în proporții aproximativ solare; alți compuși chimici sunt prezenți doar în cantități mici și includ metan, amoniac, sulfur de hidrogen și apă. Deși se crede că apa se află în adâncul atmosferei, concentrația sa măsurată direct este foarte scăzută. Abundența azotului, sulfului și gazelor nobile din atmosfera lui Jupiter depășește valorile solare cu un factor de aproximativ trei. Atmosfera lui Jupiter nu are o limită inferioară clară și trec treptat în interiorul planetei.
Limita inferioară clară şi trecerea treptată în interiorul lichid al planetei.