După ce Adolf Hitler a venit la putere, instituind al treilea Reich, Deutsche Bank și-a concediat cei trei membri ai consiliului de administrație evreiesc în 1933. În anii următori, Deutsche Bank a luat parte la arianizarea afacerilor deținute de evrei; potrivit propriilor istorici, banca a fost implicată în 363 de astfel de confiscări până în noiembrie 1938. În timpul războiului, Deutsche Bank a încorporat alte bănci care au căzut în mâinile germanilor în timpul ocupației Europei de Est. Deutsche Bank a furnizat facilități bancare pentru Gestapo și a împrumutat fondurile utilizate pentru construirea lagărului Auschwitz și a facilităților IG Farben din apropiere. În timpul celui de-al Doilea Război Mondial, Deutsche Bank a devenit responsabilă pentru gestionarea Băncii Uniunii Boemei din Praga, cu sucursale în Protectorat și în Slovacia, Banca Credinverein din Iugoslavia (care a fost acum împărțită în două corporații financiare, una în Serbia și una în Amsterdam), Banca Națională
Al Treilea Reich