La începutul carierei sale, Lochte a fost profesor de oceanografie biologică la Institutul Leibniz pentru Științe Marine de la Universitatea Christian-Albrechts din Kiel, unde a condus o unitate de cercetare axată pe ciclurile chimice din mare. A predat oceanografie biologică la Universitatea din Rostock și Kiel din 1995 până în 2000 și ulterior la Institutul Leibniz pentru Cercetări ale Mării Baltice din Warnemünde până în 2007.
1995 până în 2000