În secolul I î.Hr., tribul Sequani (cel mai "galez dintre galii" potrivit istoricului Henri Martin), care era centrat în jurul orașului Besançon, s-a stabilit în Sundgau. Din anul 70 î.Hr., ei au purtat un război permanent cu vecinii lor, Aedui, chemând mercenarii germani, conduși de Ariovistus. Când conflictul s-a terminat, germanii s-au stabilit în regiune, iar Sequani, pentru a-i îndepărta, au apelat la romani. Iulius Cezar l-a învins pe Ariovistus în 58 î.Hr. lângă Cernay, și a început o lungă dominație a romanilor. Acest lucru s-a încheiat brusc în 405, când alamanii au traversat Rinul și au ocupat Sundgau. Ei, la rândul lor, au fost urmați de franci după victoria lor în bătălia de la Tolbiac
În 496. Sundgau a fost încorporat în regatul Austrasiei și creștinismul a fost introdus sub merovingieni.