Prima universitate din Bratislava, în Regatul Ungariei (și, de asemenea, pe teritoriul actualei Slovacii) a fost Universitas Istropolitana, fondată în 1465 de regele Matei Corvinus. A fost închisă în 1490 după moartea sa. Bratislava este sediul celei mai mari universități (Universitatea Comenius, 27.771 de studenți), cea mai mare universitate tehnică (Universitatea Slovacă de Tehnologie, 18.473 de studenți) și cele mai vechi școli de artă (Academia de Arte Speciale și Academia de Arte Frumoase și Design) din Slovacia. Alte instituții de învățământ terțiar sunt Universitatea publică de Economie și primul colegiu privat din Slovacia, Universitatea Orașului Seattle. În total, aproximativ 56.000 de studenți frecventează universitatea din Bratislava.
Regele