Scrii o continuare pentru acest paragraf - La scurt timp după izbucnirea celui de-al doilea război mondial, familia Morgenstern a fost expropriată și deportată ca evrei în Polonia ocupată
, unde au fost închiși în ghetoul Łódź. Samuel Morgenstern a murit acolo în august 1943. A fost îngropat în cimitirul din ghetou. Soția sa, Emma, care, ca și cumnatul ei Wilhelm Abeles (care a trăit și el în ghetou și a supraviețuit la Auschwitz), a fost martor la moartea soțului ei, a fost cel mai probabil deportată în lagărul de concentrare Auschwitz-Birkenau în aceeași lună. Din moment ce era o practică standard în Auschwitz de a trimite majoritatea nou-veniților, în special femeile în vârstă care nu puteau lucra, direct în camerele de gazare, moartea lor poate fi considerată sigură. În consecinţă, un tribunal din Viena a decis în decembrie 1946 că nu ar fi putut supravieţui până la sfârşitul războiului şi i-a declarat morţi, în acord cu o moţiune depusă de fratele lor Max Pragan.