Scrii o continuare pentru acest paragraf - În 2005/06, Jones a jucat în toate, cu excepția uneia dintre Internaționalele de toamnă ale Țării Galilor (a ratat meciul împotriva Țării Galilor) și în toate Campionatele celor Șase Națiuni din 2006
după care a fost ales de noul antrenor Gareth Jenkins să capiteze echipa în timpul turneului de două teste din Argentina. În octombrie 2006, Jenkins l-a numit pe Stephen Jones căpitan al Țării Galilor până la Cupa Mondială de Rugby din 2007, dar când Stephen Jones a fost odihnit pentru Autumn International împotriva Pacific Islanders, Duncan Jones a revenit pentru prima dată ca căpitan al Țării Galilor acasă. A jucat, în calitate de titular sau înlocuitor, în toate cele patru meciuri internaționale de toamnă și în toate cele cinci meciuri din Campionatul celor Șase Națiuni din 2007, dar a fost odihnit pentru turneul de la mijlocul anului în Australia.