După capitularea Germaniei în noiembrie 1918, majoritatea Flotei de la Marea Mare urma să fie internată în baza Royal Navy de la Scapa Flow. Bayern a fost listată ca una dintre navele care urmau să fie predate. La 21 noiembrie 1918, navele care urmau să fie internate, sub comanda contraamiralului Ludwig von Reuter, au navigat din baza lor din Germania pentru ultima dată. Flota s-a întâlnit cu crucișătorul ușor britanic Cardiff, înainte de a întâlni o flotilă de 370 de nave de război britanice, americane și franceze pentru călătoria la Scapa Flow. Flota a rămas în captivitate în timpul negocierilor care au dus în cele din urmă la Tratatul de la Versailles.
Bavaria