În iulie 1862, Lincoln l-a ridicat pe Henry Halleck în funcție de președinte. Lincoln l-a numit pe John Pope ca comandant al noii Armate a Virginiei. Pope s-a conformat dorinței lui Lincoln de a avansa asupra Richmond din nord, protejând astfel Washingtonul de contraatacuri. Pope a fost apoi învins la a doua bătălie de la Bull Run în vara anului 1862, forțând Armata Potomacului să se întoarcă pentru a apăra Washingtonul. În ciuda nemulțumirii sale față de eșecul lui McClellan de a se întări, Lincoln l-a readus la comanda tuturor forțelor din jurul Washingtonului.
creşterea inflaţiei