După ce a părăsit Cuba, Dalton s-a implicat în războiul civil din El Salvador
, s-a alăturat Armatei Revoluționare a Poporului (ERP) în 1973. În ERP, s-a aflat într-o dispută internă gravă cu liderul Alejandro Rivas Mira, care devenea un lider influent al grupării armate. Ca urmare, conducerea ERP a decis să-l execute.