Scrie o continuare pentru acest paragraf - Zersenay nu a reușit să ajungă pe podium pentru a doua oară la Campionatele Mondiale de Cross Country din 2006
, dar locul al patrulea a condus echipa eritreană spre medalia de argint în competiția de echipă. Luna următoare, Zersenay i-a învins pe Fabiano Joseph și Boniface Kiprop pentru a câștiga Great Manchester Run. A alergat până la linie cu un timp de 27:36; un record eritrean și al doilea cel mai rapid în acel an. În luna august a aceluiași an, el a îmbunătățit semnificativ recordul de 10.000 de metri la Memorial Van Damme; timpul său de 26:37.25 a scăzut cu aproape treizeci de secunde față de marca sa anterioară, făcându-l a opta persoană cea mai rapidă din istorie, dar el a terminat în continuare în spatele lui Micah Kogo, care a alergat cel de-al zecelea cel mai rapid din istorie. Un nou record de 59:16 al lui Zersenay la Rotterdam Half Marathon a egalat recordul de curs al lui Samuel Wanjiru și a fost un bun semn pentru viitoarea cursă de campionat.