Acest proces începe de obicei cu liza celulelor, în care membrana celulei este perturbată și conținutul său intern este eliberat într-o soluție cunoscută sub numele de lizat brut. Amestecul rezultat poate fi purificat folosind ultracentrifugarea, care fracționează diferitele componente celulare în fracțiuni care conțin proteine solubile; lipide și proteine de membrană; organele celulare și acizi nucleici. Precipitarea printr-o metodă cunoscută sub numele de saltare poate concentra proteinele din acest lizat. Diferite tipuri de cromatografie sunt apoi utilizate pentru a izola proteina sau proteinele de interes pe baza unor afinități precum greutatea moleculară, greutatea netă și legătura.
trebuie purificat departe de alte componente celulare