În Războiul celei de-a Doua Coaliții, în calitate de comandant al Diviziei I a Armatei Dunării, Ferino a condus divizia peste Rin la Hüningen, a trecut prin Ducatul Baden și a mărșăluit spre Schaffhausen. El cunoştea acest teritoriu din campania din 1796. Divizia sa a asigurat flancul drept pentru forța principală a lui Jourdan pentru bătălia de la Ostrach
pe 21 martie 1799. Deși trupele sale au rămas în afara zonei principale de luptă, în timpul retragerii, o parte din coloana sa a fost tăiată de armata arhiducelui Carol și capturată.