Scrieți o continuare pentru acest paragraf - Jokubaitis a jucat pentru Lituania la Campionatul European FIBA U16 2016 din Polonia. A avut o medie de 10 puncte şi şi-a ajutat echipa să câştige o medalie de argint. Jokubaitis a fost cel mai tânăr jucător la Cupa Mondială FIBA sub-19 din 2017
în Egipt, cu o medie de 10 puncte şi 5,3 asistenţe pe meci pentru echipa de pe locul şase. La Campionatul European FIBA U18 din 2018 din Letonia, el a avut o medie de 12,9 puncte și 5,6 rebounduri pe meci, echipa sa terminând pe locul cinci. Jokubaitis a condus Lituania pe locul al patrulea la Cupa Mondială FIBA sub 19 ani din 2019 din Grecia, unde a avut o medie de 11,3 puncte și 5,6 asistențe pe meci.