Aceste grupuri s-au răspândit din mlaştinile Sudd, unde dovezile arheologice arată că o cultură bazată pe creșterea transhumantă a vitelor a fost prezentă încă din anul 3000 î.Hr., iar cultura nilotă din acea zonă poate fi astfel continuă până în acea dată. Dovezile arheologice, precum și dovezile fizice privind mijloacele de trai ale Nilotilor, inclusiv casele lor în formă de dom și tukul, arată că ei ar fi putut aduce o contribuție enormă la guvernarea și bogăția Regatului Nubia înainte și în timpul dinastiei a 25-a. Expansiunea nilotă din mlaştinile Sudd în restul Sudanului de Sud pare să fi început în secolul al XIV-lea.
regatele creștine nubiene Makuria și Alodia