Împreună cu Sergio Cervato, Magnini a format parteneriatul defensiv al lui Fulvio Bernardini în spatele lui Fiorentina. După ce a câştigat campionatul cu clubul în 1956
, a jucat încă două sezoane la Florența înainte de a merge la Genova, și și-a încheiat cariera la Prato în Serie B.