În septembrie 1799, la căderea Republicii Romane, a urmat francezii şi s-a refugiat în Franţa, la Marsilia şi Paris. După Marengo
S-a întors în Italia, dar nu la Roma. În schimb, s-a oprit la Milano, unde a devenit chirurg și chirurg major al diviziei italiene a "Veliti della Guardia".