Scrieți o continuare pentru acest paragraf - Bayern a îndeplinit dorința lui Guardiola de a-l semna pe Thiago Alcântara de la FC Barcelona și primul sezon al lui Guardiola a început bine, Bayern prelungind o serie de meciuri neînvinse de la sezonul trecut la 53 de meciuri. Pierderea finală în fața lui Augsburg a avut loc la două zile după ce Bayern a câștigat deja titlul de campionat. Pe parcursul sezonului, Bayern a mai câștigat alte două titluri, Cupa Mondială de Cluburi FIFA și Supercupa UEFA.
, acesta din urmă fiind ultimul trofeu major pe care clubul nu l-a câștigat încă. Bayern a câștigat, de asemenea, cupa pentru a-și completa a zecea dublă națională, dar a pierdut în semifinala Ligii Campionilor în fața lui Real Madrid. De asemenea, BayernLB a fost condamnat la trei ani și jumătate de închisoare. Hoeneß a demisionat a doua zi. Vicepreședintele Karl Hopfner a fost ales președinte la 2 mai. Înainte de sezonul 2014-15, Bayern l-a luat pe Robert Lewandowski după ce contractul său s-a încheiat la Borussia Dortmund și l-a împrumutat pe Xabi Alonso de la Real Madrid. Bayern l-a lăsat şi pe Toni Kroos să plece la Real. Icoanele clubului, Bastian Schweinsteiger și Claudio Pizarro au plecat înainte de sezonul 2015-16. În aceste două sezoane, Bayern și-a apărat titlul de campionat, inclusiv un alt dublu în 2015-16, dar nu a reușit să treacă de semifinale în Liga Campionilor. Deși conducerea clubului a încercat să-l convingă pe Guardiola să rămână, antrenorul a decis să nu-i prelungească contractul de trei ani.