În acea vară, a preluat comanda canonierei cu roţi laterale şi a condus-o într-o serie de lupte cu forţele Confederaţiei. În 1864, s-a întors la blocada Atlanticului ca ofițer executiv al "Powhatan". În timp ce a fost repartizat pe acea navă, Bache a participat atât la asalturile nereușite cât și la cele reușite
pe Fort Fisher, realizat în decembrie 1864 și ianuarie 1865. În ultimul atac, a fost rănit, dar nu grav.