Investigațiile au examinat de ce clădirile s-au prăbușit și ce măsuri de protecție împotriva incendiilor erau în vigoare și au evaluat modul în care sistemele de protecție împotriva incendiilor ar putea fi îmbunătățite în construcțiile viitoare. Investigația privind prăbușirea 1 WTC și 2 WTC a fost încheiată în octombrie 2005 și cea a 7 WTC a fost finalizată în august 2008. NIST a constatat că izolarea de foc a infrastructurii de oțel a Turnurilor a fost distrusă de impactul inițial al avioanelor și că, dacă acest lucru nu s-ar fi întâmplat, turnurile ar fi rămas probabil în picioare. Un studiu al prăbușirii turnului nordic publicat de cercetătorii de la Purdue din 2007 a stabilit că impactul avionului a îndepărtat izolarea termică a structurii de oțel din exteriorul clădirii, o susținere exterioară a clădirilor de susținere a focului și a evaluat modul în care sistemele de
scări