Fassbender dia katolika efa nivadika, na dia mbola mandeha any am-piangonana aza izy mba handrehitra labozia. Mpanohana ny klioba baolina kitra Liverpool izy. Tamin'ny 2010, ny sakaizan'i Fassbender taloha, Sunawin Andrews, dia nametraka didy tsy hifanerasera aminy tao amin'ny Fitsarana Ambony ao Los Angeles County, nilaza fa "nanary ahy teo ambonin'ny seza namaky ny oroko" izy tamin'ny taona 2009, ary izy koa dia nanintona azy teo akaikin'ny fiarany, nandratra ny kitrokeliny sy ny lohalika, ary koa nahatonga azy hipoaka.
Ny Fahazavana eo Anelanelan'ny Ranomasimbe