Ny fandinihana mikrobiolojika dia voatondro ihany koa amin'ny pnemonia mafy, ny alikaola, ny asplenia, ny immunosuppression, ny areti-mifindra VIH, ary ny fanararaotam-panafody. Na dia mamaritra mazava tsara ny karazan'ny mikraoba voakasik'izany aza ny kolontsain'ny ra sy ny kolontsain'ny tsiranoka pleural, ny kolontsain'ny sputum tsara dia tsy maintsy adika amim-pitandremana ny mety hisian'ny fanjanahana ny lalan-pisefoana. Ny fitiliana ireo zavamananaina manokana dia azo atolotra mandritra ny fipoahana, noho ny antony ara-pahasalamam-bahoaka. Amin'ireo olona nampidirina hopitaly noho ny aretina mafy, ny kolontsain'ny sputum dia tokony hodinihina, ary ny kolontsaina ho an'ny Mycobacterium tuberculosis dia tokony hatao amin'ny olona manana kohaka maharitra. Ny fanombanana mikrobiolojika dia voatondro ihany koa amin'ny pnemonia mafy, ny alikaola, ny asplenia, ny immunosup
antigen amin'ny Legionella sy ny Streptococcus