Jodl foi elixido por Hitler para ser o xefe do Estado Maior de Operacións do recén formado Oberkommando der Wehrmacht (OKW) o 23 de agosto de 1939, xusto antes da invasión alemá de Polonia. Jodl actuou como xefe de gabinete durante a invasión de Dinamarca.
e Noruega. Despois da caída de Francia, Jodl era optimista sobre o éxito de Alemaña sobre Gran Bretaña, escribindo o 30 de xuño de 1940 que "A vitoria alemá final sobre Inglaterra é agora só unha cuestión de tempo".