As forzas alemás invadiron de novo o país en maio de 1940, e 40.690 belgas, máis da metade deles xudeus, foron asasinados durante a ocupación posterior e o Holocausto. De setembro de 1944 a febreiro de 1945 os aliados liberaron
Bélxica. Despois da Segunda Guerra Mundial, unha folga xeral obrigou ao rei Leopoldo III a abdicar en 1951, xa que moitos belgas sentían que colaborara con Alemaña durante a guerra. O Congo belga obtivo a independencia en 1960 durante a crise do Congo; Ruanda-Urundi seguiu coa súa independencia dous anos despois. Bélxica uniuse á OTAN como membro fundador e formou o grupo de nacións Benelux cos Países Baixos e Luxemburgo.