En setembro de 1943, PEAN, a ala ateniense de EDES e a Brigada Sagrada formaron a Unión de Liberación Popular (LAE), unha alianza de organizacións de resistencia venezelistas. O arresto do seu liderado foi un golpe crítico para o PEAN, que nunca fora moi grande, e limitou severamente as súas capacidades. Con todo, continuou, nun papel puramente político, continuando a publicar "Doxa", e gradualmente mudando a unha postura máis conservadora, particularmente a través da súa rivalidade con EAM. A súa ala armada reactivou só a partir de marzo de 1944, cando realizou unha serie de ataques de sabotaxe contra os alemáns. Durante os acontecementos de decembro de 1944
O PEAN apoiaba aos grupos de dereita, aos británicos e ao goberno de George Papandreou contra as forzas do EAM-ELAS.