Os xornalistas afirmaron que podería "ter un papel destacado na orquestración" da vitoria electoral de Ahmadinejad, e que podería ser "unha figura clave na orquestración da represión contra os manifestantes antigubernamentais" en xuño de 2009, e directamente ao mando do paramilitar Basij, a pesar do apagón do seu nome na prensa do réxime. Nunha carta aberta, Mehdi Karroubi, ex presidente do Majlis (parlamento) e candidato reformista nas eleccións presidenciais de 2009
, acusou explícitamente a Mojtaba Khamenei de participar nunha conspiración para manipular as eleccións, referíndose á interferencia ilegal dunha "rede".