Pantano estaba listo para debutar na Fórmula Un para Jaguar, pero dous días antes de que fixese o seu debut, asinaron un acordo con Christian Klien, que conseguiu 10 millóns de dólares de Red Bull. O italiano asinou para o equipo de Fórmula Un de Xordania a principios de 2004, e despois de probas mínimas a súa tempada resultou problemática. Terminou último na súa primeira carreira en Melbourne, mentres que o seu compañeiro de equipo máis experimentado Nick Heidfeld, retirouse cun problema de transmisión. Continuou correndo, nunca conseguindo clasificarse ou terminar máis alto que ao redor da parte de atrás do campo, e retirándose en varias ocasións, non conseguindo chamar a atención. Foi substituído por un debutante alemán Timo Glock (por razóns financeiras) no Gran Premio de Canadá.
, que anotou dous puntos terminando sétimo, por diante do seu compañeiro de equipo Nick Heidfeld que estaba oitavo. Pantano volveu ao seu asento no equipo para a seguinte carreira en Indianápolis, pero saíu na primeira curva despois de chocar con outros pilotos. Continuou con resultados máis decepcionantes ata o Gran Premio de Italia en Monza, despois do cal foi substituído por Timo Glock nas tres carreiras restantes da tempada. Pantano máis tarde revelou que fora a súa propia decisión deixar de competir con Jordan debido á carga financeira colocada na súa familia e os seus propios sentimentos de que o equipo estaba favorecendo ao seu compañeiro de equipo Heidfeld sobre el. Pantano estaba ligado ao regreso á Fórmula Un con Campos Meta, pero o equipo confirmou que Bruno Senna e Karun Chandhok se unirían ao equipo.