Escribe unha continuación para este parágrafo - Kovalyov foi un crítico franco das tendencias autoritarias nas administracións de Boris Yeltsin e Vladimir Putin. En 1996, dimitiu como xefe da comisión presidencial de dereitos humanos de Yeltsin, despois de publicar unha carta aberta a Yeltsin, onde Kovalyov acusou ao presidente de renunciar aos principios democráticos. En 2002, organizou unha comisión pública para investigar os atentados de 1999 en Moscova.
(a Comisión Kovalyov), que foi efectivamente paralizada despois de que un dos seus membros, Sergei Yushenkov, fora asasinado, outro membro, Yuri Shchekochikhin, presuntamente envenenado con tálio, e o seu avogado e investigador, Mikhail Trepashkin, foron arrestados.