Durante a Guerra Civil Americana, Chattanooga foi un centro de batalla. Chattanooga serviu como un centro que conectaba o cincuenta por cento dos arsenais da Confederación, os que estaban localizados en Atlanta, Augusta, Columbus e Macon. Os ferrocarrís de Chattanooga demostraron ser vitais no transporte de materia prima da Confederación a fábricas de procesamento onde eran responsables de producir municións de armas pequenas. Durante a Campaña de Chickamauga, a artillería da Unión bombardeou Chattanooga como unha distracción e ocupou o 9 de setembro de 1863. Despois da batalla de Chickamauga, o derrotado Exército da Unión retirouse a Chattanooga. O 23 de novembro de 1863, as batallas por Chattanooga comezaron cando as forzas da Unión lideradas polo xeneral Ulysses S. Grant reforzaron as tropas en Chattanooga e avanzaron a Orchard Knob contra as tropas confederadas que sitiaban a cidade. O día seguinte, a batalla de Lookout Mountain
Foi loitado, expulsando aos confederados da montaña. O 25 de novembro, o exército de Grant derrotou aos confederados na batalla de Missionary Ridge. En canto ás vitorias gañadas pola Unión, Chattanooga marca un dos tres momentos decisivos que viraron a Guerra Civil a seu favor. A Batalla de Gettysburg puxo fin á racha de vitorias obtidas pola Confederación, mentres que o Asedio de Vicksburg dividiu a Confederación en dous, mentres que Chattanooga serviu como a porta de entrada ao sur profundo. Estas batallas foron seguidas na primavera seguinte pola Campaña de Atlanta, comezando xusto por riba da liña estatal en Xeorxia e avanzando cara ao sueste. Despois da guerra, a cidade converteuse nun importante centro ferroviario e industrial e de fabricación.