En 1966 Whetton participou nos Xogos Europeos de interior, gañando a súa primeira medalla de ouro, gañando a carreira por case tres segundos sobre o segundo clasificado Oleg Rayko. Whetton logrou manter o título europeo de interior durante os dous anos seguintes, en Praga
e Madrid. Whetton representou de novo a Gran Bretaña na altitude influenciada polos Xogos Olímpicos de Verán de 1968 na Cidade de México, e de novo clasificouse para a final. Na final, Whetton terminou quinto, aínda que a catro segundos dos lugares da medalla. A súa última gran medalla foi no Campionato Europeo de Atletismo de 1969, cando gañou os 1500 metros en Atenas. Nun final apertado, Whetton derrotou ao irlandés Francis Murphy para levar o ouro.