A división participou en accións contra o exército dos Estados Unidos durante a batalla de Morotai.
de setembro de 1944 ata o final da guerra. Dous batallóns do 211o Regimento de Infantería foron enviados a Morotai, que estaba a pouca distancia de Halmahera, para desenvolver un campo de aviación en maio de 1944, pero estes foron retirados en xullo de 1944 cando o campo de aviación foi abandonado debido a problemas de drenaxe. Isto deixou a illa só lixeiramente defendida cando unha gran forza aliada desembarcou alí o 15 de setembro de 1944, e os aliados foron capaces de asegurar rapidamente os seus obxectivos no suroeste da illa. Elementos da 32a División, incluído o 3o Batallón do 210o Regimiento de Infantería e todo o 211o Regimiento de Infantería, foron transportados a Morotai a través dun bloqueo da Armada dos Estados Unidos entre setembro e novembro de 1944 nun intento de atacar a base aliada que estaba sendo desenvolvida na illa. A división non foi capaz de lanzar este ataque, con todo, xa que os abastecementos suficientes non puideron ser traídos a través do bloqueo estadounidense. Como resultado, as tropas xaponesas en Morotai retiráronse ao centro da illa onde moitos morreron de enfermidade e fame.