Baixo o mando de Antonio Conte, Chiellini volveu á súa posición orixinal como lateral esquerdo debido ao bo desempeño de Barzagli e Bonucci. Despois de loitar para volver adaptarse á súa posición anterior, creceu no seu papel e logrou manter a Paolo De Ceglie, o único outro natural que quedaba na escuadra, no banco durante a primeira metade da tempada 2011-12. Na segunda metade da tempada 2011/12, Conte cambiou a unha defensa de tres homes, onde Chiellini asociou a Bonucci e Barzagli nun sistema defensivo moi exitoso para a Juve, que rematou a tempada como campións da Serie A, co mellor récord defensivo, así como sendo invicto na liga. Debido ás súas actuacións xuntos, a defensa de tres homes gañou o alcume de "BBC", unha referencia ás iniciais dos xogadores, e pronto o trío se estableceu como unha das mellores defensas do fútbol mundial durante as tempadas seguintes. A Juventus perdeu a final da Coppa Italia 2012 contra o Napoli, pero máis tarde derrotaríaos na Supercoppa Italiana 2012.
, aínda que Chiellini perdería o partido.