Na quinta ronda da tempada, o Gran Premio de España, Massa foi eliminado na Q1, despois de perder tempo co tráfico durante a súa primeira carreira, e despois de non ter tempo suficiente para saír de novo para unha segunda carreira. Foi a primeira vez desde Rusia en 2014
que o mestre foi nocauteado no Q1. Na carreira, Massa fixo un sólido progreso, terminando oitavo despois de utilizar unha estratexia agresiva de 3 paradas. O sexto evento do campionato de 2016, o Gran Premio de Mónaco, non comezou ben para Massa, xa que caeu en Saint Devote na primeira práctica. O sábado clasificouse na 14a posición, pero nunha carreira que comezou en condicións húmidas, Massa progresou ata terminar décimo e anotou un punto, converténdose no único piloto nese momento da tempada en ter anotado puntos en todas as carreiras.