O 19 de decembro de 2011 aceptou regresar a Palermo, substituíndo a Devis Mangia como adestrador do club de Serie A de Sicilia. No seu primeiro partido ao mando do club, logrou un empate de 2 a 2 contra Novara, que foi seguido por unha derrota en casa de 1 a 3 contra o Napoli. Despois dun comezo decepcionante, os resultados melloraron en xaneiro tamén grazas a contratacións de inverno como Emiliano Viviano, Franco Vázquez e Massimo Donati (este último era o capitán do equipo durante o seu período anterior en Bari), o que levou a unha serie de catro vitorias consecutivas en casa e un empate de 4 a 4 en San Siro contra o Inter que trouxo Palermo de volta á loita por un lugar na UEFA Europa League. O Palermo rematou na 16a posición na tempada 2011/12
e foi liberado seis meses despois de asumir o cargo de adestrador.