Escriba unha continuación para este parágrafo - Júnior Baiano gañou 25 partidos coa selección nacional brasileira en 1997 e 1998, e foi membro da selección brasileira que participou na Copa do Mundo de 1998, a Copa de Ouro da CONCACAF de 1998
, e que gañou a Copa das Confederacións da FIFA de 1997. Durante a Copa do Mundo de 1998, Baiano xogou un papel clave na selección brasileira que chegou á final da Copa do Mundo de 1998 en París, aínda que no partido contra Noruega, que o Brasil perdeu por 2 a 1, perdeu unha "prova de forza" con Tore André Flo inmediatamente antes de que o atacante acertase o balón fóra do alcance de Claudio Taffarel para igualar, e tamén falou ao mesmo xogador uns minutos máis tarde, o que resultou na concesión dun penalti, do que os noruegueses marcaron o gol decisivo.