Completar a seguinte frase: Cando estalou a Guerra Civil, Kirkland foi inicialmente nomeado capitán no exército confederado e despois elixido coronel do 11o Voluntarios de Carolina do Norte, máis tarde designado o 21o de Carolina do Norte, en xuño de 1861. Comandou o seu rexemento en First Manassas como parte da brigada do xeneral de brigada Milledge Bonham, pero non participou significativamente. En outubro, o 21o de Carolina do Norte foi adscrito á brigada de Isaac Trimble e na primavera seguinte, participou na campaña de Stonewall Jackson no val de Shenandoah. Kirkland foi baleado nos dous muslos durante o
Primeira Batalla de Winchester, que o deixou fóra de acción durante varios meses. Durante a súa recuperación, Kirkland serviu como xefe de gabinete de Patrick Cleburne durante a campaña de Murfreesboro en decembro de 1862.