Aínda que San Francisco permaneceu como un equipo de primeira división, e frecuente candidato, durante o resto da década de 1960, non gañou outro pennant na década; de feito, o equipo gañou un campionato de división de 1969 a 1986 (1971
), e non apareceu na Serie Mundial de novo ata 1989. Os Giants remataron en segundo lugar durante catro tempadas consecutivas (1965-68). En 1969, o equipo mostraba sinais de envellecemento e declive. Ao mesmo tempo, Feeney estaba sendo considerado para posicións prominentes dentro da xerarquía da Major League Baseball. Despois de que a súa candidatura ao cargo de Comisionado de Béisbol fracasou, Feeney sucedeu a Warren Giles como presidente da Liga Nacional o 5 de decembro de 1969.