A abadía sufriu as invasións turcas do século XVI, particularmente en conexión co asedio de Viena
en 1526. Aínda que a previsión por parte dos abades salvou moitos dos obxectos de valor da abadía enviándolos para a súa custodia noutro lugar antes das incursións, a comunidade non puido escapar dos impostos punitivos do período de guerra e caeu na pobreza: un abad case foi arrestado por non pagar impostos. Durante a Reforma, outro abade fuxiu coa caixa.