Henderson volveu ao Oriente Medio en 1951 como embaixador en Irán. Alí tratou co recentemente elixido primeiro ministro, Mohammed Mossadegh, sobre cuestións relacionadas coas reservas de petróleo de Irán anteriormente propiedade de intereses británicos que Mossadegh recentemente nacionalizara. Os Estados Unidos opóñense á nacionalización, e axudou a orquestar o golpe de 1953 axudado pola CIA
que eliminou a Mossadegh, un líder democraticamente elixido.