Escribide unha continuación para este parágrafo - Ellis ofreceu voluntariamente para o servizo e foi recrutado no 15o Regimento, 2a Brigada, 4a División do Exército de Tennessee, en Freeport, Illinois. O 15o Regimento participou en acción en Fort Donelson preto de Clarksville, Tennessee, antes da batalla de Shiloh
- Non. O 6 de abril de 1862, mentres estaba no Hornet's Nest, tendo sido ascendido ao rango de coronel interino, Ellis foi golpeado varias veces polo fogo inimigo, pero continuou a dirixir as súas tropas ata que unha bala fatal o alcanzou. Despois da batalla, o seu corpo foi recuperado do campo de batalla e os seus restos foron enviados a Rockford para o enterro. Tras un funeral elaborado, Ellis foi enterrado na parcela familiar que comprara só uns anos antes despois da morte dunha das súas fillas.