O 30 de xuño de 1989, o coronel Omar al-Bashir dirixiu un golpe militar sen derramamento de sangue.
- Non. O novo goberno militar suspendeu os partidos políticos e introduciu un código legal islámico a nivel nacional. Máis tarde, al-Bashir realizou purgas e execucións nas filas superiores do exército, a prohibición de asociacións, partidos políticos e xornais independentes, e o encarceramento de figuras políticas e xornalistas destacadas. O 16 de outubro de 1993, al-Bashir nomeouse a si mesmo "Presidente" e disolveu o Consello de Comando Revolucionario. Os poderes executivos e lexislativos do consello foron tomados por al-Bashir.