Escribir unha continuación para este parágrafo - A Frota Combinada estivo baixo o mando directo do Cuartel Xeral Imperial en 1937. Co inicio da Guerra do Pacífico co ataque a Pearl Harbor levado a cabo polo "Kido Butai" da Frota Combinada (1a Frota Aérea), a Frota Combinada converteuse case en sinónimo da Armada Imperial Xaponesa, baixo o mando do almirante Isoroku Yamamoto ata abril de 1943, cando morreu despois de que o seu avión fora derribado polas forzas aéreas estadounidenses sobre a illa de Bougainville. Comprendeu os acorazados, os portaavións, os avións e os compoñentes que formaban a principal forza de combate da IJN. Foi mobilizado por primeira vez na batalla de Midway. Despois das devastadoras perdas de portaavións en Midway e nas Illas Salomón
A frota reorganizouse en varias "Flotas de Área" para o control operativo local de varias zonas xeográficas. A Frota Combinada evolucionou entón nunha organización máis administrativa.