Aceptando unha invitación para a súa reintegración nas forzas gobernamentais albanesas, Moisiu volveu a Albania e a finais de 1940, mentres servía como comandante do batallón Tomorri, foi enviado á fronte italo-grega.
- Non. Spiro non quixo loitar contra os gregos e xunto con outro maior albanés, Prenk Pervizi, retirou os seus homes da liña de fronte e induciu a moitos albaneses a desertar. Isto fixo que fose deportado a un posto militar en Laç onde foi mantido baixo estricta vixilancia ata que o Tribunal Militar Supremo italiano o condenou á morte por deserción das liñas de fronte. A sentencia foi posteriormente cancelada e o seu único castigo foi a expulsión do servizo militar. Isto foi porque os italianos temían un motín dos soldados albaneses que aínda estaban baixo o mando italiano.