En 1462, o máis ambicioso dos señores das Illas, John MacDonald, fixo unha alianza con Eduardo IV de Inglaterra para conquistar Escocia. Guerra civil en Inglaterra
impediu que isto entrase en vigor e fose descuberto ata 1475, cando a corte inglesa revelou voluntariamente a súa existencia. Seguíronse as demandas de perda do señorado, pero calmaronse cando Xoán renunciou á maioría dos seus territorios continentais. Con todo, o sobriño de John lanzou unha grave incursión en Ross, pero finalmente fallou. Aos dous anos da incursión, en 1493, Xacobe IV de Escocia declarou a perda do señorío das illas, transformando o reino nunha parte intrínseca de Escocia en vez de unha dependencia.