Escribe unha continuación para este parágrafo - En 1608, cando a rebelión de O'Doherty estalou no Ulster, o asentamento de Derry foi capturado e queimado
por rebeldes liderados por Sir Cathaoir Ruadh Ó Dochartaigh (Sir Cahir Rua O'Doherty). A pesar de que o bispo Montgomery e Ó Dochartaigh estiveran en boas relacións antes do levantamento (ambos discutiron con Sir George Paulet, o gobernador de Derry, a quen a miúdo culpan de provocar a rebelión), os rebeldes queimaron a casa do bispo e a súa biblioteca de dous mil libros debido ao seu suposto contido herético. A esposa e a irmá do bispo foron tomadas como reféns polos rebeldes, pero foron finalmente liberadas polas forzas da Coroa.