Escribir unha continuación para este parágrafo - Coa abolición do goberno da Zona do Canal
En 1979, a Escola Secundaria Balboa, como o resto do sistema de Escolas da Zona do Canal, caeu baixo o Departamento de Escolas de Dependentes de Defensa. Durante as dúas décadas seguintes, a poboación de dependentes da zona do canal estadounidense diminuíu a medida que a poboación da propia zona do canal cambiou. Ademais de miles de dependentes estadounidenses da Compañía do Canal de Panamá (posteriormente Comisión do Canal de Panamá), o Goberno da Zona do Canal e as forzas armadas estadounidenses, a Escola Secundaria Balboa tamén foi a Alma Mater de moitos dos negocios e da elite política de Panamá.