En xuño de 1997, Lissouba temía un golpe de estado e enviou aos Cocoyes para arrestar ao líder do Cobra Denis Sassou Nguesso e desarmar a milicia iniciando a segunda guerra civil.
- Non. Os seus antigos inimigos os Ninjas aliáronse con eles contra a cobra, durante a segunda guerra civil o Cocoye xogou un papel importante, capturando a presa de Moukoukoulou e cortando a electricidade a gran parte do sur.