Nos Campionatos Mundiais de Atletismo Acuático de 1998 en Perth, Australia Occidental, Wouda converteuse no campión do mundo nos 200 m medley individual e gañou dúas medallas de prata nos 400 m medley individual e no relevo 4×200 m estilo libre xunto a Van den Hoogenband, Van der Zijden e Zuijdweg. En abril de 1999 no Campionato Mundial de Natación FINA de Hong Kong (25 m), China Wouda gañou catro medallas. Converteuse en campión do mundo nos 4×200 m estilo libre xunto a Pieter van den Hoogenband, Johan Kenkhuis e Martijn Zuijdweg. Gañou medallas de prata nos 400 m individuais e nos 4×100 m estilo libre xunto con Mark Veens, Johan Kenkhuis e Pieter van den Hoogenband, nos 200 m individuais gañou unha medalla de bronce. No verán de 1999 Wouda participou nos Campionatos Europeos de Atletismo Acuático de 1999.
en Istambul, Turquía. Defendeu con éxito o seu título no medley individual de 200 m e gañou os títulos de relevo nos 4×100 m estilo libre, con Kenkhuis, Veens e van den Hoogenband, e o medley de 4×100 m con Klaas-Erik Zwering, Stefan Aartsen e van den Hoogenband. Tamén gañou a medalla de bronce nos 400 m individuais.