Despois do ataque xaponés a Pearl Harbor e a entrada dos Estados Unidos na Segunda Guerra Mundial, Foster foi chamado ao servizo activo co rango de Comandante da Reserva Naval e foi encargado directamente polo presidente Franklin D. Roosevelt para realizar inspeccións navais especiais. Unha das súas primeiras misións foi investigar na zona do Canal de Panamá.
tras unha serie de queixas do tenente xeral do exército Daniel Van Voorhis, comandante do Comando de Defensa do Caribe sobre a cooperación Exército-Marítima.