Mentres o I-3 estaba en Yokosuka, a campaña das Illas Aleutianas comezou o 3 e 4 de xuño de 1942 cun ataque aéreo xaponés.
en Dutch Harbor, Alaska, seguida rapidamente pola ocupación xaponesa nas Illas Aleutianas de Attu o 5 de xuño e Kiska o 7 de xuño de 1942. O 10 de xuño de 1842, o "I-1", o "I-2" e o "I-3" foron reasignados á Forza do Norte para o servizo nas Aleutianas, e o 11 de xuño de 1942 o "I-3" partiu para as augas aleutianas en compañía do "I-1", "I-2", "I-6" e "I-7" para comezar a súa cuarta patrulla de guerra. O 20 de xuño de 1942, os "I-1", "I-2" e "I-3" uníronse á liña de patrulla "K" no Océano Pacífico Norte entre e. Permaneceu na liña de patrulla ata o 3 de xullo de 1942. O 20 de xullo de 1942, foi reasignado á Forza Avanzada e ordenoulle volver a Xapón. Chegou a Yokosuka o 1 de agosto de 1942 e foi reparado alí.