Os chilenos marcharon cara a Iquique e, o 19 de novembro de 1879, derrotaron as tropas aliadas sen os homes de Daza reunidos en Agua Santa na
Batalla de San Francisco e Dolores. Disolveron as forzas bolivianas alí e as forzas do sur retiráronse a Oruro, e os peruanos retrocederon a Tiliviche. O exército chileno capturou Iquique (80 km ao sur de Pisagua) sen resistencia. Algunhas das forzas peruanas que foran derrotadas en San Francisco retiráronse a Tarapacá, unha pequena cidade co mesmo nome da provincia, onde se combinaron con tropas peruanas que se retiraron a Tarapacá directamente de Iquique.