En 1860, Young informou a bordo da fragata de vapor de roda lateral, que operaba no Golfo de México, Esquadrón Mediterráneo e ao longo da costa leste dos Estados Unidos. Estaba a bordo do "Susqehanna" cando estalou a Guerra Civil Americana en abril de 1861, e participou no bloqueo da Unión dos Estados Confederados de América. Tamén participou a bordo do "Susquehanna" na captura
A Batalla de Hatteras Inlet, Carolina do Norte, o 28 de agosto de 1861 e a Batalla de Port Royal en Port Royal, Carolina do Sur, o 7 de novembro de 1861. De novembro de 1861 a xuño de 1862, foi oficial executivo do sloop-of-war, que participou no bloqueo de Wilmington, Carolina do Norte, e de xuño de 1862 a novembro de 1862 foi oficial executivo da fragata de vapor de roda lateral no servizo de bloqueo de Charleston, Carolina do Sur, sendo ascendido a tenente comandante o 16 de xullo de 1862.