Para compensar a perda das propiedades ancestrais de Metternich no val do Mosela cando a República Francesa anexionou a marxe oeste do Rin, o Receso Imperial de 1803 trouxo á familia de Metternich novas propiedades en Ochsenhausen, o título de Príncipe e un asento na Dieta Imperial. Na reorganización diplomática que se produciu, Metternich foi nomeado embaixador no Reino de Prusia, sendo notificado diso en febreiro de 1803 e tomando o seu cargo en novembro dese ano. Chegou a un momento crítico na diplomacia europea, pronto preocupado polas ambicións territoriais de Napoleón Bonaparte, o novo líder de Francia. Este temor foi compartido pola corte rusa baixo Alexandre I, e o tsar mantivo Metternich informado da política rusa. No outono de 1804 Viena decidiu actuar en agosto de 1805 cando o Imperio austríaco (como o Sacro Imperio Romano estaba en proceso de converterse) comezou a súa participación na Guerra da Terceira Coalición. A tarefa case imposible de Metternich era convencer a Prusia a unirse á coalición contra Bonaparte. O seu eventual acordo non foi debido a Metternich, e despois da derrota da coalición na Batalla de Austerlitz
, Prusia ignorou o acordo e asinou un tratado cos franceses.