San José ten un papel destacado na historia filipina polo seu papel durante a Segunda Guerra Mundial. As forzas navais estadounidenses lideradas polo xeneral Douglas MacArthur realizaron o chamado "Segundo Desembarco" nas praias de San José (o "Primeiro" foi o famoso Desembarco de Leyte) o 15 de decembro de 1944, para recuperar as illas filipinas dos xaponeses (a Batalla de Mindoro
) A seguridade de San José e toda a illa de Mindoro resultou decisiva no obxectivo de recuperar Manila e Luzón, e a derrota final das forzas imperiais xaponesas por parte das tropas filipinas e estadounidenses.