En maio de 1861, o segundo tenente Heywood foi ascendido a primeiro tenente, e como tal desembarcou cos Marines en
Hatteras Inlet, onde estivo presente na captura de Fort Clark e Fort Hatteras. Foi ascendido a capitán en novembro dese ano, e durante o inverno de 1861-62 participou activamente nunha serie de expedicións de barcos no río James.