A historia segue as aventuras do piloto da Garda Nagate Tanikaze, que viviu na capa subterránea de Sidonia desde o seu nacemento e foi criado polo seu avó. Nunca coñeceu a ninguén, entrena a si mesmo nun antigo simulador de piloto da Garda todos os días, e finalmente o domina. Despois da morte do seu avó, emerxe á superficie e é seleccionado como piloto da Garda, así como Sidonia é unha vez máis ameazada polo Gauna. Pregunta: Como é seleccionado despois da morte do seu avó?
Piloto Guardián