Femke Heemskerk fixo o seu debut internacional nos Campionatos Mundiais de LC 2005 en Montreal como nadadora de relevo. Ela só nadou nas probas de 4×100 m estilo libre e 4×200 m estilo libre. Competiu no Campionato de Europa LC 2006
e os Campionatos Europeos de Natación de Curta distancia. Pero individualmente non avanzou máis alá das quendas en ambos eventos.