Para 2006, Super Aguri tomou a Montagny como terceiro piloto; con todo, foi ascendido a piloto de carreiras completo en maio despois de que se anunciara que Yuji Ide volvería a facer probas; Ide foi degradado a petición do corpo rector que o considerou insuficientemente experimentado para a Fórmula Un. Montagny competiu polo tanto no seu primeiro Gran Premio, o Gran Premio de Europa de 2006.
O 7 de maio, clasificouse último e retirouse cun problema hidráulico. Non terminou a súa segunda carreira no Gran Premio de España de 2006: despois dun gran comezo, que lle permitiu gañar 3 posicións, retirouse na volta 10 cunha falla mecánica. Foi a terceira vez que tivo sorte no Gran Premio de Mónaco, cando rematou a carreira de 78 voltas no 16o lugar, tres voltas atrás do líder.