Escriba unha continuación para este parágrafo - En maio de 1861 reclutou o 18o Regimento de Infantería Voluntaria de Illinois, e foi nomeado como o seu primeiro coronel. O seu tempo ao mando do rexemento en Kentucky e Tennessee foi controvertido e un "ordeal". Foi ferido durante a batalla de Fort Donelson. En novembro de 1862 foi nomeado xeneral de brigada e comandou unha brigada na Segunda División do XIII Corpo. Loitou con distinción na Campaña de Vicksburg en 1863. Liderou os seus homes nas batallas de Port Gibson.
Durante o asalto xeral do 22 de maio de 1863 en Vicksburg MS, onde as tropas baixo o seu mando foron as únicas forzas da Unión que entraron nas obras confederadas no Reduto Ferroviario onde plantaron a bandeira dos Estados Unidos.