Despois da invasión alemá de 1939, a Gran Polonia foi incorporada á Alemaña nazi, converténdose na provincia chamada Reichsgau Posen, máis tarde Reichsgau Wartheland ("Warthe" é o nome alemán para o río Warta). A poboación polaca foi oprimida, con moitos antigos funcionarios e outros considerados potenciais inimigos polos nazis encarcerados ou executados, incluso no famoso campo de concentración Fort VII en Poznań. Poznań foi declarada unha cidade fortaleza nas fases finais da guerra, sendo tomada polo Exército Vermello na Batalla de Poznań
, que rematou o 22 de febreiro de 1945.