Escribe unha continuación para este parágrafo - Halmahera do Norte, particularmente Morotai, xogou un papel na Segunda Guerra Mundial. A illa Morotai foi capturada polos xaponeses a principios de 1942. A chaira sur de Morotai foi tomada polas forzas estadounidenses en setembro de 1944 durante a batalla de Morotai.
, e usado como punto de escala para a invasión aliada das Filipinas a comezos de 1945, e de Borneo en maio e xuño dese ano. O soldado xaponés Teruo Nakamura foi descuberto na selva de Morotai en 1974, como un dos soldados xaponeses da Segunda Guerra Mundial que resistiron despois da rendición do exército xaponés. A illa Morotai, desde 2009, xa non forma parte da rexencia de Halmahera Norte.