Promovido a contraalmirante en xuño, Sprague comandou a División 22 de portaavións, que cubriu o asalto a Guam de xullo-agosto e Morotai
En setembro. Encomendando o Grupo de Tarefa 77.4 e a Unidade de Tarefa 77.4.1 ("Taffy 1") durante a Batalla do Golfo de Leyte do 24 ao 25 de outubro, Sprague comandou brevemente portavións de adestramento do Pacífico baixo a División de Transportistas 11, antes de liderar a División de Transportistas 3 de Okinawa de abril a xuño de 1945. El comandou a Task Force 38.1 durante as últimas operacións aéreas contra o Xapón ao final da guerra.