Despois da partición do subcontinente indio, a Academia de Ciencias do Paquistán foi establecida en 1953. Despois da liberación de Bangladesh
En 1973, 12 membros de Bangladesh (o entón Paquistán Oriental) da academia formaron a Academia de Ciencias de Bangladesh. Muhammad Qudrat-i-Khuda foi o presidente fundador ata 1976.