Escriba unha continuación para este parágrafo - Pettus serviu no teatro occidental da Guerra Civil Americana. Durante a Campaña do Río Stones, foi capturado polos soldados da Unión o 29 de decembro de 1862, e trocado pouco tempo despois por soldados da Unión. Pettus foi capturado de novo o 1 de maio de 1863, mentres que parte da guarnición rendida que defendía Port Gibson
en Mississippi. Conseguiu escapar e volver ás súas propias liñas. Pettus foi ascendido a coronel o 28 de maio e recibiu o mando do 20o Alabama.