Escribe unha continuación para este parágrafo - Na Primeira Guerra de Villmergen, en 1656, e a Guerra de Toggenburg
(ou Segunda Guerra de Villmergen), en 1712, o Freie Ämter converteuse no escenario para os exércitos reformados e católicos en guerra. Aínda que a paz despois da guerra de 1656 non cambiou o status quo, a cuarta Paz de Aarau en 1712 provocou unha reorganización das relacións de poder. A vitoria deu a Zúrich a oportunidade de forzar aos cantóns católicos a saír do goberno no condado de Baden e na área adxacente do Freie Ämter. Os Freie Ämter foron entón divididos en dous por unha liña trazada desde a forca en Fahrwangen ata o campanario da igrexa de Oberlunkhofen. A parte norte, o chamado Unteren Freie Ämter (baixo Freie Ämter), que incluía os distritos de Boswil (en parte) e Hermetschwil e o Niederamt, foi gobernada por Zurich, Berna e Glarus. A parte sur, o Oberen Freie Ämter (alto Freie Ämter), estaba gobernada polos sete cantóns anteriores, pero Bern foi engadido para facer un oitavo.