Completar a seguinte frase: No verán seguinte, o capitán Cristiano Doni foi listado entre os sospeitosos por estar involucrado nun escándalo de amaño de partidos (tamén coñecido como "Calcioscommesse"). O Atalanta enfrontouse a unha penalización de seis puntos na
O 19 de agosto, Doni recibiu unha suspensión de tres anos e medio de todas as actividades relacionadas co fútbol, terminando a súa carreira aos 38 anos. O defensor Thomas Manfredini tamén foi acusado de participación no escándalo e inicialmente recibiu unha suspensión de tres anos, aínda que máis tarde sería absolto. Tamén ese verán, o Atalanta asinou co atacante arxentino Germán Denis, que se convertería nun dos goleadores máis prolíficos do club con 56 goles en catro tempadas e media. Ao comezo da tempada, o Atalanta obtivo 10 puntos nos seus primeiros catro partidos, mentres que a compañía traballaba para defenderse a si mesma e aos seus xogadores destas acusacións. O Atalanta conseguiu 52 puntos antes da penalización de seis puntos, establecendo un novo récord do club para a maioría de puntos na Serie A. Isto seguiu a actuacións consistentes ao longo da tempada (26 puntos en cada metade) e a cuarta mellor defensa da liga con 43 goles recibidos, á par do Bologna e Fiorentina. O club asegurou a seguridade da Serie A na cuarta-última xornada de partidos cunha vitoria en casa de 2 a 0 contra a Fiorentina, aínda que perdeu os últimos tres partidos contra o Milán, o Lazio e a Juventus.