O hospital foi creado como o Royal Hospital for Seamen en Greenwich por instrucións da raíña María II, que fora inspirada pola visión de mariñeiros feridos que volvían da batalla de La Hogue.
en 1692. Ela ordenou que a ala do Rei Carlos do palacio, orixinalmente deseñada polo arquitecto John Webb para o rei Carlos II en 1664, fose remodelada como un hospital naval para proporcionar unha contraparte para o Hospital de Chelsea para soldados. Sir Christopher Wren e o seu axudante Nicholas Hawksmoor deron os seus servizos gratuítos como arquitectos do novo Hospital Real. Sir John Vanbrugh sucedeu a Wren como arquitecto, completando o complexo segundo os plans orixinais de Wren.