O 1 de setembro de 1939 as forzas alemás invadiron Polonia. O III./KG 3 atacou as posicións polacas que defendían a ponte de Tczew. A pesar do ataque, e outro do StG 1, os polacos repararon os cables e voaron a ponte dúas horas despois. Ambos grupos estiveron implicados na batalla de Grudziądz. Foron implicados en operacións sobre o Narew, Praha. O KG 3, xunto co KG 27 baixo Wimmer, empuxéronse cara ao sur a partir do 6 de setembro para illar Varsovia do leste. Apoiaron o avance de Varsovia e o posterior sitio. Ambos os grupos bombardearon obxectivos na batalla de Modlin
- Non. As perdas do KG 3 son descoñecidas, pero o II./KG 3 perdeu un bombardeiro nunha explosión en voo debido a un fusible defectuoso; co III./KG 4 e o I./KG 152 do 3 ao 6 de setembro de 1939. O KG 3 bombardeou obxectivos ao redor de Płock, Lida e Biała Podlaska. Ambos grupos participaron na Batalla do Bzura e na destrución do Exército de Poznań e do Exército de Pomorze.