A principios de 1940, a escola permaneceu en gran parte non afectada polo estallido da guerra en Europa, e aínda que moitos mozos de Jersey deixaran a illa para unirse ao esforzo de guerra, varios pais ingleses enviaron aos seus fillos a asistir á escola, crendo que as Illas do Canal eran o lugar máis seguro das Illas Británicas. Con todo, os desenvolvementos na guerra ao longo de maio dese ano e o colapso da resistencia francesa
Iso significaba que a illa estaba en perigo. As Illas da Canle foron desmilitarizadas na crenza de que iso sería o mellor para protexer as vidas dos habitantes da illa, o que significaba que moitos temían a inminente ocupación das illas polas forzas alemás. Mentres moitas outras escolas en Jersey deixaron as decisións de evacuación nas mans dos pais, o Victoria College decidiu evacuar a algúns nenos e os seus mestres ao Reino Unido, onde permaneceron durante o resto da Segunda Guerra Mundial, asistiendo a escolas públicas inglesas, incluíndo a Shrewsbury School e a Bedford School. Con todo, ao redor de 130 nenos e varios mestres permaneceron en Jersey, e a escola continuou a funcionar durante a ocupación.