Completa a seguinte frase: Despois de que a frota de Virginia se integrara coa Armada Confederada, Barron foi nomeado comandante e xefe da Oficina de Ordens e Detalles o 10 de xuño. Barron permanecería nese posto ata o 20 de xullo, cando o Secretario Confederado da Mariña, Stephen R. Mallory, aceptou a solicitude de Barron de ser asignado como comandante das defensas costeiras de Virxinia e Carolina do Norte, un importante porto para os corsarios confederados baseados en Pamlico Sound. Chegando ao seu cuartel xeral en Fort Hatteras o 28 de agosto, Barron comandou a defensa dos fortes Hatteras e Clark contra o oficial de bandeira da Unión Silas H. Stringham durante a Guerra Civil Americana.
Batalla de Hatteras Inlet o 28-29 de agosto. Barron foi capturado despois da rendición das dúas fortalezas. Celebrado en Fort Columbus na illa Governors no porto de Nova York, despois en Ft. Warren, porto de Boston, Barron foi finalmente liberado nun intercambio de prisioneiros o ano seguinte.