En agosto de 1940 o York foi asignado á Frota do Mediterráneo, uníndose ao 3o Escuadrón de Cruceiros en Alexandría a finais de setembro, despois de escoltar un convoi ao redor do Cabo da Boa Esperanza. Dous días despois participou na Operación MB.5, onde a Frota do Mediterráneo escoltou aos cruceiros lixeiros e como transportaron tropas a Malta. Durante a Batalla de Cabo Passero, o York afundeu o destróier abandonado o 13 de outubro despois do enfrontamento do destróier co cruceiro lixeiro a noite anterior. Un mes despois, o "York" e a Frota do Mediterráneo executaron a operación MB8, unha complexa serie de manobras, incluíndo
Operación Xulgamento, onde o buque escoltaba ao portaavións mentres os seus avións atacaban a frota italiana en Taranto na noite do 11/12 de novembro. Poucos días despois, o "York" levou as tropas británicas de Alexandría, Exipto, a Pireo, Grecia. O 26 de novembro, o York e o resto do 3o Escuadrón de Cruceiros cubriron un pequeno convoi a Malta.