En xaneiro de 1942, Houghton converteuse no segundo comandante do 40o Comando, e participou na derrota dos Aliados
Ataque a Dieppe o 19 de agosto de 1942. Como a maioría da súa unidade, foi capturado polos alemáns no fiasco. Como prisioneiro de guerra, Houghton foi encadeado durante 411 días, e permaneceu en cativerio durante o resto da guerra. Posteriormente foi condecorado coa Cruz Militar pola súa valentía en Dieppe e pola súa resistencia como prisioneiro de guerra.