O Palacio Ribeira de Lisboa, un palacio real construído a principios do século XVI en estilo manuelino polo rei Manuel I, foi remodelado cara ao final do século XVI por orde de Filipe I (Filipe II de España). Nesta época a fachada do palacio foi modernizada e unha gran torre de estilo renacentista con cúpula foi construída polo río Texo. O palacio e a súa prominente torre dominaron a paisaxe urbana de Lisboa ata 1755, cando o Gran terremoto de Lisboa
destruílo. Co palacio real destruído, quizais o palacio máis importante do Renacemento tardío en Portugal é o Palacio Ducal de Vila Viçosa, construído entre finais do século XVI e comezos do XVII para os duques de Braganza.