Completa a seguinte frase: Yegipko volveu á URSS en agosto de 1938, tomando o posto de comandante da Segunda Brigada Submarina da Frota do Mar Negro. Ocupou este cargo ata decembro de 1939, cando se converteu en comandante da brigada de submarinos da Frota do Báltico. Ocupou este posto durante a
Guerra soviético-finlandesa, deixando en maio de 1940 para retomar os seus estudos na Academia Naval. Graduouse en abril de 1941, sendo promovido o 26 de abril a capitán de 1o rango. Desde ese mes ata setembro foi comandante da 1a Brigada Submarina da Frota do Báltico. Yegipko participou en operacións militares despois da invasión alemá da Unión Soviética en xuño de 1941. Durante a evacuación soviética de Tallin en agosto de 1941, o seu submarino, "S-5", chocou contra unha mina, e Yegipko foi lanzado desde a torre de mando á auga. Foi rescatado, con conmoción cerebral, por outra embarcación. De setembro a outubro de 1941 estivo á disposición do Consello Militar da Frota do Báltico, antes do seu nomeamento como agregado naval da embaixada soviética no Reino Unido. Como agregado naval, Yegipko a miúdo actuou como observador en buques de guerra británicos e navegou a bordo de buques británicos en tarefas de convoi no Ártico.