Embarcado a bordo do Missouri, o almirante Halsey dirixiu a Terceira Frota á baía de Tokio o 29 de agosto de 1945. O 2 de setembro de 1945, os documentos de rendición do Imperio xaponés
As cartas de fin de guerra foron asinadas na cuberta do Missouri. A Terceira Frota permaneceu en augas xaponesas ata finais de setembro de 1945, cando os seus barcos foron dirixidos á costa oeste dos Estados Unidos. O 7 de outubro de 1945, a Terceira Frota foi designada como unha frota de reserva e foi retirada do estado activo.