Escribe unha continuación para este parágrafo - No incendio de Copenhague de 1728
A biblioteca da Universidade foi devastada e 30.000 volumes foron perdidos nas chamas. Só se gardaron algúns materiais que, en contra das normas, foron retirados dos locais por estudantes e profesores. Despois do incendio, a biblioteca foi restaurada xunto co resto do complexo Trinitatis e tomáronse medidas para construír unha nova colección. En 1730, Árni Magnússon legou o seu libro e colección de manuscritos á biblioteca. Incluía, o máis significativo, unha extensa colección de manuscritos islandeses e outros nórdicos que desde entón se coñeceu como a Colección de manuscritos de Arnamagnæan despois del. A biblioteca introduciu préstamos en 1788.