しかし,ペトロベイの究極の目標は,オスマン支配からのギリシャ人の自由であり,彼は地元の権力と自治を利用して,大規模なギリシャの反乱のための支持を構築しました. 1821年,この反乱はギリシャ独立戦争として正式に始まった. 彼は取引者として知られ,政治的に必要になったとき,反乱のリーダーシップをテオドロス・コロコトロニスに自発的に譲渡した. カラマタとトリポリスを解放するために重要な部隊を寄与した.
そして,スーリオート族を助けるための遠征に参加しました. この遠征で,ペトロベイの弟キリアクルス・マヴロミカリスは,トルコ人との戦いで英雄的に死んだ. ペトロベイと彼の兄弟のコンスタンティノス・マブロミカリスの指揮下で,ギリシャ軍はエジプトのマニ侵攻中に有名なオスマン軍の司令官イブラヒム・パシャを倒した. この軍事的勝利により,ギリシャは戦略的に重要なナフプリオの支配権を確保し,革命後,近代ギリシャ国家の最初の首都となった.