皇帝の次は息子のフランシス2世 (1792年−1835年) で,フランスとの戦争に巻き込まれた.
(1792年−1797年) と第2次 (1798年−1802年) の連合戦争で,オーストリアはさらに領土を失い,ナポレオン戦争 (1803年−1815年) の前奏となった. 第3次連合戦争 (1803年−1806年) でオーストリアがさらに敗北した後,ハプスブルク帝国の未来はますます不確実に見えた. 1804年5月,ナポレオンがフランス皇帝を宣言し,神聖ローマ帝国の土地の多くを再編成することに忙しく,第二のシャルルマグネとして,皇帝の称号も受けているように見えた. フランソワ2世は8月にオーストリア帝国を宣言し,皇帝の称号を冠した. 1806年,彼は両称号を暫定的に保持し,ドイツ国家の神聖ローマ帝国の皇冠を辞任し,その後その存在が止まった.