1805年3月に船長に任命されました 1805年7月,彼は22砲の艦隊を地中海での任務に再委任し,1806年10月,36砲の艦隊の指揮を執った. エリオットは次の6年間を指揮し,1807年2月15日に東インド諸島と中国に航海した. 1808年10月8日,彼はベンガル湾で18砲のフランス軍コルベット"イェナ"を追いかけて捕獲し,1809年7月15日,サンダ海峡で"モデステ"のボートと8砲の"トゥイジネーラー"を撃破した. エリオットはジャワを捕まえる作戦に参加した
1811年8月と9月の間に 彼は1813年に38砲の指揮を執り,6月にボルネオの海賊の抑圧に関与した. これらの戦いの時の彼の行動は,彼の上級者達の注意を引いた. パレムバン皇帝を復活させるためにマクレガー大佐に援助したように. ナポレオンの戦争が終結して,彼は指揮職を失い,その後,1827年5月1日から1832年1月24日まで,ポートスマスでガードシップを務めた. この期間のエリオットは,将来の王ウィリアム4世のクレランス公の称賛を得ました.