2016年11月2日,カリフォルニア州ロサンゼルスで映画の撮影が開始された.トバイアス・A・シュライスラーは映画の撮影担当者で,ナオミ・ショハンがプロダクションデザイナー,パコ・デルガドが衣装デザイナー,リッチ・マクブライドが映像効果監督を務めた.制作中に,デュヴァーネはマクブライドに映像効果のシーケンスにできるだけ柔軟性を求め,撮影中に変更や新しいアイデアを組み込むことを要求した.監督は"あるスティーブン・キングのウェブサイト"と"カラフルなポストクレジットのシーン"を入れることを決定した. 映画『A Wrinkle in Time』の撮影は2016年11月29日からカリフォルニア州ホールド郡のユーレカを含む複数の場所で開始された. 映画の撮影はセコイア公園,セコイア動物園の隣に位置するユーレカのセコイア公園で行われた. 2週間後にロサンゼルスに移り,制作は2週間続いた. 2017年2月,デュヴァーネはニュージランドで撮影した映画『Wrinkle in Time』のキャストとクルーを紹介し,撮影はオーストラリアのオ
ニュージーランド