1864年12月15日に北大西洋封鎖艦隊に再配属され,北カロライナ州ボーフォートに到着し,北カロライナ州フィッシャー砦への攻撃に参加した. 12月24日と25日の最初の戦闘で,キャノニクス号は南軍の砲を2発撃破したと主張したジョージ・ベルナップ中尉が144発の砲を撃った. 船は4回撃たれたが,犠牲者も大きな被害も受けなかった. 1865年1月13日〜15日,第2次攻撃中に
カノニクスは279発の砲弾を 発射し,そのほとんどが最初の日に発射され,再び2発の砲弾を 発射したと主張した. 船は少なくとも38回撃たれたが,わずかな損傷しか受けず,乗組員3人が負傷した. 船の旗は2回撃ち去られ,毎回ダニエル・D・スティーブンス・クォーターマスターによって置き換えられた. スティーヴンは後に彼の行動のために名誉勲章を授与されました.