1998年8月20日,この工場は,アメリカ軍が,アメリカ大使館に対するトラック爆弾攻撃の報復として, 打ち上げられた巡航ミサイル攻撃で破壊されました.
8月7日,タンザニアのダール・エス・サラームとケニアのナイロビで ビル・クリントン大統領の政権は,アル・シファ工場が致命的な神経毒物質VXの処理に関与しており, イスラム教アルカイダグループとつながっていたという理由で, 攻撃を正当化しました. オサマ・ビン・ラディンは, 大使館の爆破とボジンカ作戦の背後にあると考えられていました. 8月20日の米軍の攻撃は,ビン・ラディンが1996年5月にスーダンから追放された後,移住したアフガニスタンにあるアルカイダのキャンプにも打撃を与えた.