南スーダンは2011年にスーダンから独立したが,南スーダンの内戦により,国際オリンピック委員会から承認を得るために必要な5つのスポーツ連盟の支持を得ることが困難になった. 米国に住む南スーダン人難民のグオル・マリアルは,2012年夏季オリンピックの男子マラソンに出場した
スーダン代表の競技を拒んだ後,独立オリンピック選手として参加した. 南スーダンは2015年8月に206番目のIOC加盟国となり,陸上競技,バスケットボール,サッカー,ハンドボール,柔道,卓球,そしてテクワンドーの加盟国となった. オープニングと閉幕式の両方で旗手としてマリアルを選んだ.