2009年4月から2011年9月まで,バーンスタインはまず地方事務局長,そしてその後,米国国土安全保障省の政府間事務局長補佐官として勤務しました. この役割で,彼はDHSの市長や知事へのアウトリーチを調整した. DHSでの任期中に,バーンスタインは,重要なイベントや政策イニシアチブに対する多数の対応に広く取り組んだ.
BPディープウォーター・ホライゾン・オイル・リープ ハイチでの地震 そして 脅威が増加した時期に 州や地方政府への諜報情報の拡散