陸上では,アレクセエフと元軍事大臣である クロパトキン将軍との間で, 日本人に対する戦略について, 深刻な不一致が続いていた. アレクセエフはクロパトキンが,補強と物資を運ぶトランスシベリア鉄道が完成するまで,防御的な疲労戦争を行うことを主張したにもかかわらず,クロパトキンをより攻撃的な立場をとるよう強制した. 1904年5月5日,アレクセエフは皇帝からの直接の命令に従い,ポートアーサーを離れ,ムクデンへ向かいました.
シャホの戦いで (1904年10月5日〜17日,ニュースタイル),指揮を免除され,1904年10月12日にサンクトペテルブルクに戻ることを命じられた.