カンボジアでは1978年12月に全面戦争が再び始まった.
ベトナム軍が 赤いクメールを倒すために 侵攻した 赤いクメールの部隊は国境地帯に撤退した. 1月,ベトナム軍が寺院に隠れ隠れした赤クメール軍を攻撃したと伝えられていますが,それに対する被害の報告はありませんでした. 大勢のカンボジア人難民が侵攻後,タイに入国した. カンボジアでは1980年代から1990年代にかけてゲリラ戦争が続けられ,プレア・ヴィヘアへのアクセスが妨げられました. 寺院は1992年に一時的に公開され,翌年に赤クメールの戦闘員によって再占領された. 1998年12月,この寺院は,ゲリラ運動の最後の重要な勢力であると言われている数百人のクメール・ルージュの兵士が,プノンペン政府に降伏することに同意した交渉の場でした.