1781年10月のヨークタウンでの降伏で,ジョンソンは家に帰り,平和まで失業した. その後,ノバ・スコットランドとニューファンドランドで第17歩隊を指揮した. フランスとの戦争が始まると
アイルランドにおけるイギリス人駐留所の採用担当の総督に任命され,1798年までその職務に就いた. その年の反乱の間,彼はニュー・ロスを占領するために三千人の男を派遣し,1798年6月5日に反乱軍が攻撃したときに反乱者を倒した. 暴動の最難戦だった コーンウォーリス卿はジョンソンに無関心な意見を持ち",頭が悪いバカ"と書いた.