リトアニアの Bačkis 家族はソビエトによって迫害され,彼の弟 Juozas は
1941年6月にシベリアに 追放され その"年後 亡くなった クライマスは1943年9月にゲシュタポに逮捕され,バッチキスの上級外交官はフランスに留まった. 同年, Bačkisはリトアニアのコンコルドート (リトアニア語で2007年に出版) に関する博士論文を擁護した. 戦後,フランスはリトアニア,ラトビア,エストニアの外交機関を正式に認めなかったが,非公式に機能することを許した. Bačkisは,リトアニアの占領についてさまざまな役人を教育し,国家継続を確保するためにリトアニアのSSRの非承認のためにロビー活動を続けました. 彼はまた,リトアニアの諸問題に関する情報公報 (『Questions Lithuaniennes』の33号,『Bulletin Lithuanien』の8号,そして『Peuples opprimés. 1948年,バチキスは鉄のカーテンから逃れた反ソビエト党員ユオザス・ルクシャと接触し,武装闘争に関する情報を広めるのを助けました. 1949年,欧州運動によって,イギリス国会議員ハロルド・マクミランが議長を務め,東欧諸国を代表する中欧・東欧諸国委員会が設立された. 1951年,バッチキスは委員会の副会長に就任した. 彼はまた,欧州連邦主義者の連合のリトアニア代表であり,Nouvelles équipes internationales (新しい国際チーム) と,捕虜ヨーロッパ諸国の会議に参加した. また,リトアニアカトリック科学アカデミーの再設立を促し,そのセッションで研究論文を積極的に発表しました. 1950年,バチカンから聖グレゴリオ大帝勲章を授与された.