到着すると,ストックトン号は第7艦隊に合流し,海軍でロス・ネグロス島を侵攻しました. 2月29日に着陸の道を切り開いた最初の爆撃に参加し,この地域で3日間滞在し,陸上の部隊にパトロールし,火力支援を行った. 3月9日から13日まで,シーアドラー・ハーバーで同様の,しかしより小さな着陸を支援した. アメリカ軍がニューギニアの北海岸を横断する中,ストックトンは4月22日のハンボルト湾と5月17日のワクデでの上陸中に対空および対潜水艦のスクリーニング船として機能し,ビアックの上陸に銃撃支援を提供した.
5月27日に ビアク沖では5月28日に岸砲砲砲砲弾に当たったことで軽微な損傷を受け,6月12日には,爆撃により動けなくなって,ハンボルト湾に牽引された.