10世紀末,現在の北マケドニア共和国は,ブルガリア帝国の政治・文化の中心地となった.これは,ブルガリア帝国の東部の領土が,ブルガリア帝国のロシア・ビザンチン戦争 (970年-971年) で,ビザンチン帝国のヨハネ1世ツィミスキスによって征服された後であった. ブルガリアの首都プレスラブとブルガリアの皇帝ボリス2世が捕らえられ,ブルガリアの聖ソフィア神殿のレガリアが降ろされ,ブルガリアは正式にビザンチウムに併合された. オフリドに新しい首都が設立され,ブルガリアの教皇庁の所在地となった. ツァル・サミュエルとその後継者の指揮下の新しい王朝であるコミトポリ朝は,さらに数十年間,ビザンチン人に対する抵抗を続けた.
1018年に マケドニアを含むブルガリアの西部はブルガリアの州 (ブルガリアのテーマ) としてビザンチン帝国に併合され,ブルガリア教皇は大司教区に縮小された.