クリントンの政権下で テロは国家安全保障の重要な問題として 浮上しました ソビエト・アフガン戦争の終わりの年に オサマ・ビン・ラディンはアルカイダを組織し スンニ派の過激派組織でした アルカイダの指導者たちは 西洋の価値観を軽蔑し サウジアラビアでの米軍の存在に 特に憤慨しました アルカイダは1990年代に拡大し 中東や他の場所でテロ行為に従事した. 1993年のワールドトレードセンター爆破, 東アフリカにある2つのアメリカ大使館の爆破,
イエメンの港でアメリカの船を爆撃した 報復として クリントンは アフガニスタンとスーダンのアルカイダの施設を爆撃するよう命じた 中央情報局と軍隊はビンラディンの動きを追跡し 捕まえるか殺そうとしたが ビンラディンは アフガニスタン山脈の奥深くで 捕獲を回避した