アイワゾフスキーは1900年4月19日 (新式5月2日) にフェオドシアで死去した.彼の願望に従って,彼は聖サーギスアーメニア教会の庭に埋葬された. 1901年にイタリアの彫刻家L. Biogiolliによって白い大理石の棺が作られた.モヴセス・ホーレナツィのアーメニア史の古典アルメニア語の引用が彼の墓石に彫刻されている: "死者として生まれ,不滅の遺産を残した"または"死者として生まれ,ロシア人の記憶の不滅を残した"と訳される. 碑文には"プロフェッサー・イヴァン・ヨシエール・コンスタンティナウイチは1817年から1900年に亡くなったか?"と書かれています. コンスタンティン・アイワゾフスキー教授は1817年から1919年に"何をした?"と問われた.
1900 年