1777年のサラトーガの戦いの勝利について 公式のデスパッチを 送った時 ウィルキンスンは 大陸議会に
待っていたが,彼は個人的な問題に取り組んだ. 1777年11月6日,大将に任命され,新設された戦争委員会に任命された. より上級の大佐に昇進したことで大陸軍将校の間で騒ぎが起こりました.特にウィルキンソンの噂話が,彼がコンウェイ・カバールの参加者であったことを示唆していたため,ジョージ・ワシントンをホラシオ・ゲイツに取って代わる陰謀で,大陸軍の最高司令官となった. ゲイツはすぐにウィルキンソンに飽き飽きし,1778年3月に辞任を余儀なくされた. 1779年7月29日,議会は彼を陸軍の衣装総長に任命したが,彼は"仕事に対する適性がない"ために1781年3月27日に辞任した.