1863年7月1日,ウォーカーは准将に昇進し,ゲティスバーグの戦いの後に北バージニア陸軍の第3軍団のヘンリー・ヘス少将の師団に配属され,当初ヘスの元旅団を指揮し,その後アーチャーの重傷を負った後,ジェームズ・J・アーチャー准将の旅団も指揮した. ウォーカーは1864年5月10日にスポッツシルバニア裁判所の戦いで左足を失ったまでヘスの指揮下で旅団司令官を務めた. 彼は1863年10月14日のブリストー・ステーションの戦いに参加し,マイン・ランの戦いに参加した.
1864年−1864年の冬に シェナンダワ渓谷で戦った後 スポッツシルバニアの裁判所で負傷した