1990年代後半から2000年代初頭まで 海上安全保障の概念と課題が進化した. 特に港湾施設に対するテロ攻撃に対する懸念は,海事分野における新たな安全保障上の関心事を引き起こした. 海上安全保障のパラダイムに影響を及ぼす顕著なイベントは,USS コール爆破事件である.
2001年の9月11日のテロです それ以来,いくつかの国家や国際機関が海上安全保障戦略を概説しています. 2002年のISPSコードのような海上物理セキュリティに関する多くのベストプラクティスや基準は,攻撃の結果として規制当局や海事業界によって公表されています. テロの脅威に照らして,海上安全保障のコンセプトの範囲は,国間の軍事的対決に限った焦点から,他の問題を含むように拡大し始めました. (重要なセキュリティ研究も参照)