1826年末,ボナパルトは家族と共にヨーロッパに戻った.彼はドイツを訪問し,そこでフィリップ・ヤコブ・クレツシュマーと出会い,イギリスを訪れ,イギリス博物館でジョン・エドワード・グレイと出会い,オードゥーボンとの知り合いを更新した.1828年に家族はローマに定住した.イタリアでは,彼はいくつかの科学会議の創設者であり,アメリカとヨーロッパの鳥類学および自然史の他の分野について広く講演し,執筆した.1832年から1841年の間に,ボナパルトはイタリアの動物に関する彼の著作"イタリアの動物学" (Iconografia della Fauna Italica) を出版した.彼はまた,フィラデルフィアとローマの鳥類の緯度を比較するSpecchio Comparativo delle Ornithologie di Roma e Filadelfia di Pisaurus (1827年) を出版した.彼は,ボナパルトの名前の後に彼の妻であるボナパルトをZenaidaと名付けた.ボナパルトは,ナポレオン・ナポレオンとボナポレオンに敬意を表し,その鳥類のレプリカに名前を付けた
オードゥーボン