ムスリムは聖ヨハネの教会の半分を市内の金曜日のモスク (アル・ヌリの大モスク) に変え,ホムスはすぐにイスラム教の中心地になりました. カリド・イブン・アル・ワリド,彼の息子アブド・アル・ラフマン,そしてカリフ・オマルの息子ウベイド・アラーの墓は,この街にあります. 紛争中
オマヤードとアリの間では,ホムスの住民はアリと同盟し,後者が敗北したとき,オマヤドのカリフムアウィヤは,ジュンドヒムスの北半分を切り離して,別の地区,ジュンド・キンナスリンを形成しました.明らかに罰として. アリの修道院 ("マシュハド・アリ") は市内にあり,イスラム教の伝統では,彼の指紋が刻まれていると主張している. オマヤードによる弾圧にもかかわらず,ホムスはしばらくの間,シーア派のイスラムの中心地として残った. バヌ・カルブの要塞として,この都市は後者のカイス部族派との紛争に巻き込まれた. 最後のオマヤード・カリフ,マルワン2世は,カイスの支持を得て,バヌ・カルブによる反乱に反応して,その後城壁を壊した.