بعد ما تم الإعلان عن قرار نقل الرئاسة للاتحاد، قال الزعيم الليبي معمر القذافي إنه حان الوقت لتحويل الاتحاد "إلى التجميد". وهذا أثار تساؤلات حول موقف ليبيا تجاه الاتحاد. كان القلق هو أن ليبيا ستكون لها تأثير سلبي على الطريقة التي ستترأس بها المنظمة. علاوة على ذلك، التنافسات التقليدية بين المغرب والجزائر، والمسألة غير المحلولة حول سيادة الصحراء الغربية، عرقلت اجتماعات النقابات منذ أوائل التسعينات على الرغم من عدة محاولات لإعادة إطلاق العملية السياسية. الصحراء الغربية، وهي مستعمرة إسبانية سابقة جنوب المغرب والتي "تم إعادة دمجتها" من قبل مملكة المغرب، أعلنت الاستقلال باسم جمهورية الصحراء العربية الديمقراطية. في أحدث مؤتمر على مستوى أعلى، في منتصف عام 2005، رفض المغرب السماح بقضية الصحراء الغربية، بسبب دعم الجزائر ل
المغرب