ف 24 سبتمبر 1493، غادر كريستوفر كولومبوس لجزيرة سان خوان باوتيستا، و ف 19 نوفمبر 1493، هبط فيها، و سماها سان خوان باوتيستا على شرف القديس يوحنا المعمدان. تم تأسيس أول مستعمرة أوروبية، كاباررا، في 8 أغسطس 1508، من قبل خوان بونس دي ليون، وهو ملازم تحت قيادة كولومبوس، والذي استقبله القائد التاينو كاكي أغوبانيا، والذي أصبح لاحقًا أول حاكم للجزيرة. كان بونس دي ليون مشترك بنشاط في مجزرة هايوي عام 1503 في هيسبانيولا (الجمهورية الدومينيكية داليوم). في 1508، اختار السير بونس دي ليون من قبل التاج الإسباني لاحتلال العبودية وتوجيه الهنود التاينونيين لعمليات التعدين. في العام التالي، هبط في الجزيرة، و سماها سان خوان باوتيستا على شرف سان خوان دي
ميناء مناسب