وبالرغم من ذلك، كايكون في بعض الأحيان التناقضات بين التحقيقات الجزيئية والمورفولوجية؛ ويمكن تصنيفها على شكل نوعين: (i) مورفولوجية واحدة، سلالات متعددة (مثل التقاء المورفولوجي، الأنواع السريرية) و (ii) سلالة واحدة، مورفولوجيات متعددة (مثل البلاستيكية الظاهرية، مراحل متعددة في دورة الحياة). وبالرغم من أن المجموعات المورفولوجية لا تزال غير مستقرة، فمن المحتمل لا يزال يُمْكِن أن يتم التعامل مع بعض المجموعات المورفولوجية والكروموفيلات على سبيل المثال الرسمي، وربما ما يزال هناك ما يُقَصِّر على تصنيفها على أنها سلالة واحدة.
غير أحادي النوع