أكمل العبارة اللي تليها: كان تشسكا موسكو واحد من الأعضاء المؤسسين للدوري الروسي الجديد بعد تفكك الاتحاد السوفيتي. فالموسم السادس الأول، احتل الفريق الأماكن في وسط الجدول. فالموسم 1998، كان النادي في المركز الثاني وفي الموسم التاسع، في الموسم التاسع، في الموسم التاسع.
فالموسم التالي، انتهى ثالثا. في الموسمين التالين، احتل تشسكا موسكو مرة أخرى الأماكن في وسط الجدول. فالموسم 2002، فاز الفريق اللي تدربه فاليري غازاييف بالمركز التاني مرة اخرى، و فاز بكاس روسيا. في عام 2003، فاز الفريق بأول بطولة له في تاريخ الدوري الروسي الأول. بعد من ذلك، تم طرد المدرب الرئيسي فاليري غاساييف بشكل مفاجئ وتم توقيع المدرب البرتغالي أرتور خورخي على أنه خليفته. تحت قيادة المدرب الجديد، لم يقدر الفريق على البناء على الأداء من الموسم السابق. بعدما انخفض للوضع الخامس في يوليو 2004, طرد آرثر خورخي بعد ثمانية أشهر فقط في قيادة النادي. بعد عودة فاليري غاساييف، تمكن تشسكا من إنقاذ الموسم ويصبح نائب البطل.