يمكن لبعض المضادات الحيوية أن تؤدي إلى آثار جانبية واسعة تتراوح من خفيفة إلى شديدة اعتمادا على نوع المضاد الحيوي المستخدم، والميكروبات المستهدفة، والمرضى الفردي. يمكن لبعض الآثار الجانبية أن تعكس الخصائص الصيدلانية أو السمية للمضاد الحيوي أو قد تنطوي على فرط الحساسية أو التفاعلات الحساسية. يمكن لبعض الآثار الجانبية من الحمى والغثيان إلى ردود الفعل الحساسة الكبرى، بما في ذلك التهاب الجلد الضوئي والعكسية الحساسية. غالباً ما تكون ملامح السلامة للأدوية الجديدة غير مثبتة بالشكل نفسه بالنسبة لأولئك الذين لديهم تاريخ طويل من الاستخدام. الآثار الجانبية الشائعة هي الإسهال، الناتجة عن الاضطراب في تكوين النوع من النباتات المعوية في الأمعاء، مما يؤدي على سبيل المثال إلى الإفراط في نمو المضاد الحيوي، مما يؤدي إلى
التهاب الجلد الضوئي والعدوى الحساسة