يمكن للاينزيمات المكونة من جزيئات غير بروتينية تسمى كوفاكتور، ويمكن للاينزيمات المكونة من جزيئات غير بروتينية تكون غير عضوية (مثلًا، الأيونات المعدنية والكتل الحديدية والكبريت) أو المركبات العضوية (مثلًا، الفلافين والهيم). يمكن للاينزيمات المكونة من جزيئات غير بروتينية أن تكون غير عضوية (مثلًا، الأيونات المعدنية يمكن أن تساعد في تثبيت الأنواع النووية النووية داخل الموقع النشط). يمكن للاينزيمات العضوية أن تكون إما أنزيمات، والتي يتم إطلاقها من الموقع النشط للاينزيمات خلال التفاعل، أو المجموعات الاصطناعية، والتي تكون مرتبطة بقوة للاينزيمات. يمكن للاينزيمات المكونة من جزيئات غير بروتينية تسمى كوفاكتور، والتي تحتوي على كربونات الكرب
مركبات عضوية