وبالرغم من أن المياه كايتعتقد بلي كاينة في أعماق الغلاف الجوي، فإن تركيزها المقياس مباشرة منخفض جداً. النيتروجين والكبريت والغاز النبيل في الغلاف الجوي لليوبيتر كيتجاوز القيم الشمسية بمعامل تقريباً ثلاثة. الغلاف الجوي لليوبيتر ماعندهش حدود أدناه واضحة ويتحول تدريجيا إلى داخل الكوكب السائل. من الأدنى إلى الأعلى، طبقات الغلاف الجوي هي التروبوس، الستراتوس، البي إموس، والإكسوس. كل طبقة فيها التدرجات الدرجات الحرارية المميزة.
حد أدنى واضح والانتقال تدريجيا إلى الداخل السائل للكوكب.