Halsey fue nombrado comandante del Área del Pacífico Sur, y dirigió a las fuerzas aliadas en el transcurso de la Batalla de Guadalcanal (1942-1943) y la
luchando por la cadena de Salomón (1942 <unk> 1945). En 1943 fue nombrado comandante de la Tercera Flota, cargo que ocupó durante el resto de la guerra. Participó en la Batalla del Golfo de Leyte, la mayor batalla naval de la Segunda Guerra Mundial y, según algunos criterios, la mayor batalla naval de la historia. Fue ascendido a almirante de la flota en diciembre de 1945 y se retiró del servicio activo en marzo de 1947.