La aerolínea se estableció en 2002 como sucesora de la insolvente Balkan Bulgarian Airlines y comenzó a operar el 4 de diciembre de ese año. Por orden del Ministro de Transporte y Comunicaciones, fue declarada la aerolínea de bandera nacional en noviembre de 2002. Bulgaria Air comenzó a operar con el nombre "Balkan Air Tour". La aerolínea fue conocida con ese nombre durante un corto período de tiempo. El nombre "Bulgaria Air" y el logotipo inicial fueron determinados por un concurso público. Bulgaria Air fue privatizada en 2006; aunque se rumoreaba que el gobierno quería vender la aerolínea a un importante inversor extranjero, un grupo de compañías de propiedad local, liderado por Hemus Air, surgió como el comprador con la aerolínea italiana One Air siendo el único otro competidor.
Aerolíneas de los Balcanes de Bulgaria