Después de la Segunda Guerra Mundial, la capacidad de Génova para terminar en las filas superiores de la Serie A disminuyó de manera significativa; durante el resto de la década de 1940, el club terminó en la tabla media. El
La temporada 1948/49 vio tres resultados muy significativos, Génova venció al Inter 4-1, el famoso "Grande Torino" 3-0 y Padova 7-1. La década de 1950 comenzó de mala manera para el club, habían comprado al argentino Mario Boyé del Boca Juniors, pero solo se quedó una temporada y el club fue relegado después de terminar en la parte inferior de la tabla, pero después de dos temporadas lograron su regreso después de ganar la Serie B, por delante de Legnano. Ragnar Nikolay Larsen fue un jugador notable para el club durante este período y mantuvieron finales de tabla media durante el resto de la década.