Ross describió las propiedades de Clifford, centradas en Cumberland, Westmorland, Durham y Yorkshire, como "valiosas y estratégicamente importantes en el norte problemático". Sin embargo, el noveno barón nunca había sido tan rico como algunas de las familias vecinas, como los Darcy. Su concesión de 1461 impidió que su hijo heredara, pero en 1470 el rey Eduardo fue obligado a abandonar el trono y al exilio, y Enrique VI fue devuelto al trono. El Conde de Warwick, ahora alineado con la Casa de Lancaster contra Eduardo, estaba a cargo del gobierno, y a su hermano, Juan, Marqués Montagu, se le concedió la tutela de Henry Clifford durante su minoría. Summerson postula que esta fue una oportunidad para Clifford de recuperar su herencia. Sin embargo, probablemente no hubo tiempo suficiente para hacer valer su reclamo, ya que ambos Nevilles fueron asesinados en el
Batalla de Barnet el 14 de abril del año siguiente. La victoria de Eduardo IV en Barnet, y en la Batalla de Tewkesbury unas semanas más tarde, destruyó los restos de la resistencia de Lancaster y devolvió a Eduardo al trono. A pesar de las conexiones de Clifford con Lancaster, parece que nunca estuvo en peligro en este momento, ya que el 16 de marzo de 1472 Eduardo le otorgó un perdón real. Esto fue a pesar de un intento por parte del hermano de Clifford, Thomas, de levantar una rebelión pro-Lancastrian en Hartlepool, aunque sin éxito. A Henry Clifford se le permitió heredar las propiedades de su abuelo materno, Henry Bromflete, Lord Vescy, quien había muerto en 1469, pero aún no su patrimonio Clifford. Además, como su madre todavía estaba viva, un tercio de su herencia - su dote - permaneció fuera de su control hasta su muerte en 1493.