Después de la reincorporación, Warmoth se reunió con su regimiento. Él mandó en la Batalla de la Montaña Lookout
cerca de Chattanooga, participó en la campaña de Atlanta de Sherman, y reforzó al general Nathaniel Banks en el retiro de Red Cedar. Más tarde fue comisionado como juez del Departamento del Tribunal Provost del Golfo.