Después de las elecciones de 1986, Sadiq formó un gobierno de coalición compuesto por el Partido Umma (que él dirigía); el Frente Nacional Islámico (dirigido por su cuñado, Hassan Al-Turabi); el Partido Unionista Democrático (dirigido por Mohammed Uthman al-Mirghani al-Khatim); y cuatro pequeños partidos del sur. Sin embargo, esta coalición resultó ser inestable, lo que impidió que Sadiq cumpliera con sus promesas de poner fin a la Segunda Guerra Civil sudanesa y solucionar la crisis económica en curso. El 30 de junio de 1989, su gobierno fue derrocado en un golpe de estado.
dirigido por el general de brigada Omar al-Bashir. El cargo de Primer Ministro de Sudán fue entonces abolido.