La familia se mudó a la ciudad de Nueva York en 1940. Al año siguiente, Eisuke fue transferido de la ciudad de Nueva York a Hanoi, y la familia regresó a Japón. Ono se matriculó en Keimei Gakuen, una escuela primaria cristiana exclusiva dirigida por la familia Mitsui. Permaneció en Tokio durante toda la Segunda Guerra Mundial y el gran bombardeo de fuego del 9 de marzo de 1945.
, durante el cual se refugió con otros miembros de la familia en un búnker especial en el distrito Azabu de Tokio, lejos de los fuertes bombardeos. Ono más tarde fue a la estación de montaña de Karuizawa con miembros de su familia.