El 6 y el 17 de julio de 1794 Dubois dirigió a sus tropas en enfrentamientos contra las fuerzas de la Coalición. Luchó en la Batalla de Aldenhoven el 2 de octubre, donde lideró a la reserva de caballería de 4,000 hombres. Se metió en una discusión con el departamento de suministros que causó una ruptura con Jourdan. Dejó el ejército a principios de 1795. La Revuelta de 1 Prairial Año III estalló el 20 de mayo de 1795 cuando una multitud de personas armadas irrumpieron en la Convención Nacional y asesinaron a un diputado. En París en ese momento, a Dubois se le dio el mando de la caballería de la capital el 21. Al día siguiente, los soldados bajo el mando de Jean-Charles Pichegru aplastaron la revuelta. Dubois regresó al "Ejército del Norte" donde comandó el departamento de Jemappes. Irritado por este papel inactivo, pidió un traslado al "Ejército de Italia" para reemplazar a la asesinada Amédée Emmanuel François Laharpe; la solicitud fue concedida. El 4 de septiembre de 1796, Dubois fue alcanzado por tres balas de mosquete mientras lideraba a sus jinetes en la Batalla de Rovereto.
- ¿ Qué? El general fatalmente herido le dijo a Napoleón Bonaparte: "Muero por la República. ¿Tengo tiempo para saber si la victoria es completa?" DUBOIS está en la columna 25 del Arco del Triunfo.