Escriba una continuación para este párrafo - El 16 de septiembre de 2008, Puyol hizo su aparición número 400 para el Barcelona en un partido de la fase de grupos de la Liga de Campeones contra el Sporting CP. En la temporada de la liga, a pesar de los problemas de lesiones, apareció en 28 partidos y los ayudó a ganar otro título de liga. Su único gol fue contra el Real Madrid en "El Clásico" en el Santiago Bernabéu el 2 de mayo de 2009, que terminó con una rotunda victoria de 6-2, y celebró su gol besando su brazalete de la bandera catalana frente a los fanáticos indignados de Madrid. Fue esencial para que el equipo también ganara la Copa del Rey de 2009, la Liga de Campeones de 2009 y la Supercopa de la UEFA de 2009.
y la Copa Mundial de Clubes de la FIFA 2009 para completar un sextuple sin precedentes, apareciendo en casi 100 partidos oficiales.