En octubre de 1985 fue elegido para el Politburó del YSP y como Secretario del Comité Central, pero la crisis había estallado el 13 de enero de 1986, en una violenta lucha en Adén entre los partidarios de Ali Nasir y los partidarios de Ismail. (Ver Guerra civil en el sur de Yemen
Los combates duraron más de un mes y resultaron en miles de bajas, el derrocamiento de Ali Nasir y la misteriosa desaparición de Ismail. Se dice que murió cuando las fuerzas navales leales a Ali Nasir bombardearon su casa en Adén.