En la siguiente temporada, el club no pudo clasificarse para la Liga de Campeones después de perder ante el Arsenal, pero progresó hasta la ronda de 16 en la UEFA Europa League 2011-12, siendo eliminado por el equipo holandés AZ. Terminaron la Serie A 2011/12
En tercer lugar, el mejor resultado en la historia del club, igualando la temporada 1996-97 de Alberto Zaccheroni, logrando nuevamente un lugar en la ronda de clasificación para la UEFA Champions League 2012-13. En su tercera temporada en Udinese, Guidolin nuevamente no pudo llegar a la Liga de Campeones, perdiendo en penales ante Braga, pero esta vez también terminó en la parte inferior de su grupo en la UEFA Europa League 2012-13. En la tabla de la Serie A, el club terminó quinto, llegando a la ronda de clasificación de la Europa League por tercera vez.