Durante la campaña de Chattanooga, los confederados intentaron asediar al Ejército de Cumberland para que se rindiera, pero llegaron refuerzos del Ejército de Tennessee bajo el mando de Grant, William Tecumseh Sherman y Joseph Hooker. Los confederados fueron expulsados de la ciudad en las batallas de Lookout Mountain.
y Missionary Ridge en noviembre de 1863. A pesar del sentimiento unionista en el este de Tennessee, los confederados mantuvieron el área durante la mayor parte de la guerra. Unos días después de la caída de Chattanooga, los confederados liderados por James Longstreet hicieron una campaña sin éxito para tomar el control de Knoxville atacando el Fuerte Sanders del general de la Unión Ambrose Burnside. La captura de Chattanooga permitió a Sherman lanzar la campaña de Atlanta desde la ciudad en mayo de 1864. Las últimas grandes batallas en el estado ocurrieron cuando los regimientos del Ejército de Tennessee bajo John Bell Hood invadieron el centro de Tennessee en el otoño de 1864 en un esfuerzo por hacer retroceder a Sherman. Fueron revisados por John Schofield en Franklin en noviembre y completamente dispersados por George Thomas en Nashville en diciembre. El 27 de abril de 1865, ocurrió el peor desastre marítimo en la historia de Estados Unidos cuando el barco de vapor "Sultana", que transportaba prisioneros liberados de la Unión, explotó en el río Mississippi al norte de Memphis, matando a 1.168 personas.