En enero de 2016, Best fue nombrado como el nuevo capitán de Irlanda para el
Campeonato de las Seis Naciones 2016. El 26 de noviembre de 2016, Best se convirtió en el quinto centurión de Irlanda, obteniendo su 100to título en un partido de prueba contra Australia en el Aviva Stadium, Dublín. La semana anterior, Best capitaneó a Irlanda para una histórica victoria de 40 por 29 sobre Nueva Zelanda en su aparición número 99, la primera victoria de Irlanda sobre Nueva Zelanda.