Guibor fue transferido al ejército confederado de John C. Pemberton, asegurando partes de Mississippi. Guibor fue herido en un duelo de artillería con un escuadrón fluvial federal en la Batalla del Gran Golfo.
- ¿ Qué? Guibor fue capturado con el ejército de Pemberton en la caída de Vicksburg, Mississippi.