Durante 1998, Honda consideró regresar a la Fórmula Uno con su propio equipo. El proyecto fue abortado después de la muerte de su director técnico, Harvey Postlethwaite. En cambio, Honda regresó como proveedor oficial de motores para British American Racing (BAR), y brevemente para el Gran Premio de Jordania. Juntos, BAR y Honda lograron 15 podios y el segundo lugar en el campeonato de constructores de 2004. Honda compró una participación en el equipo BAR en 2004 antes de comprar el equipo por completo a fines de 2005, convirtiéndose en constructor por primera vez desde la década de 1960. Honda ganó el Gran Premio de Hungría 2006
con el conductor Jenson Button. Honda anunció en diciembre de 2008 que abandonaría la Fórmula Uno con efecto inmediato debido a la crisis económica mundial de 2008.