Después de ganar una medalla de oro y una de plata en el Campeonato Europeo de Natación Juvenil de 1998 en Amberes, hizo su debut internacional en el Campeonato Mundial FINA de Curso Corto de 1999 en Hong Kong. Groot inmediatamente ganó su primera medalla internacional, una de plata, en el relevo de estilo libre de 4×100 m junto con Thamar Henneken, Wilma van Hofwegen e Inge de Bruijn. Individualmente terminó 14o en los 100 m mariposa. Unos meses más tarde compitió en el Campeonato Europeo de Acuáticos de 1999
en Estambul. En los 50 m mariposa ganó su primera medalla individual, a la edad de 17 años, alcanzando el tercer lugar detrás de Anna-Karin Kammerling y Johanna Sjöberg. Chantal también llegó a la final de los 50 m estilo libre terminando séptima. En los 4×100 m estilo libre terminó cuarta con el equipo.