Las recomendaciones de la junta para el bloqueo del Atlántico fueron aceptadas en su mayoría, con modificaciones, por la administración de Lincoln. La captura de Fernandina, propuesta como la acción ofensiva inicial de la Armada de la Unión, fue pospuesta hasta después de la captura de la isla Hatteras
y Port Royal. La sugerencia de bloquear la ensenada de Hatteras fue rechazada por el oficial de bandera Silas Stringham y el general de brigada Benjamin F. Butler, los hombres que lideraron la expedición. (La junta había anticipado que sus recomendaciones no serían seguidas al pie de la letra. En su informe, incluyeron la declaración de que "Estos planes pueden sufrir alguna modificación en manos de la persona a quien se le confiará su ejecución".