En 1796, con el rango de capitán, Bessières fue a servir en la campaña italiana de Napoleón Bonaparte. En el
Rovereto su conducta lo llevó a la atención de su jefe, y después de la Batalla de Rivoli fue enviado a Francia para entregar los colores capturados al Directorio. Volviendo rápidamente al frente, acompañó a Napoleón en la invasión de Estiria al mando de los Guías, que formaron el núcleo de las posteriores Guardias Consulares e Imperiales.