Mientras que el antisemitismo islámico ha aumentado a raíz del conflicto árabe-israelí, hubo disturbios contra los judíos en los países de Oriente Medio antes de la fundación de Israel, incluidos los disturbios en Casablanca, Shiraz y Fez en la década de 1910, las masacres en Jerusalén, Jaffa, Safed y Hebrón en la década de 1920, los pogromos en Argelia, Turquía y Palestina en la década de 1930, así como los ataques contra los judíos de Irak y Túnez en la década de 1940. Cuando el líder árabe palestino Amin al-Husseini decidió hacer una alianza con la Alemania de Hitler durante la Segunda Guerra Mundial, 180 judíos fueron asesinados y 700 judíos resultaron heridos en los disturbios de 1941 inspirados por los nazis, conocidos como Farhud. Los judíos de Oriente Medio también fueron afectados por el Holocausto. La mayor parte del norte de África quedó bajo el control nazi y muchos judíos fueron discriminados y utilizados como esclavos hasta la derrota del Eje. En 1945, cientos de judíos resultaron heridos durante manifestaciones violentas en Egipto y la propiedad judía fue vandalizada y saqueada. En noviembre de 1945, 130 judíos fueron asesinados durante un pogromo en Trípoli. En diciembre de 1947, poco después del Plan de Partición de la ONU, los disturbios árabes resultaron en cientos de víctimas judías en Alepo, incluidas 75 muertes. En Adén
87 judíos fueron asesinados y 120 heridos. Una turba de marineros musulmanes saquearon casas y tiendas judías en Manama. Durante 1948 hubo más disturbios contra los judíos en Trípoli, El Cairo, Oujda y Jerada. Cuando la primera guerra árabe-israelí llegó a su fin en 1949, un ataque con granadas contra la sinagoga Menarsha de Damasco se cobró una docena de vidas y treinta heridos. La Guerra de los Seis Días de 1967 condujo a una mayor persecución contra los judíos en el mundo árabe, lo que provocó un aumento en el éxodo judío que comenzó después de la creación de Israel. En los años siguientes, la población judía en los países árabes disminuyó de 856.000 en 1948 a 25.870 en 2009 como resultado de la emigración, principalmente a Israel.