Después del ataque británico a Copenhague en 1807 y el estallido de la
En la guerra de cañoneras entre Gran Bretaña y el reino danés-noruego, tomó un pequeño buque danés, el "Almirante Juul", y en la acción del 2 de marzo de 1808 se enfrentó al HMS "Sappho"; los británicos capturaron el "Almirante Juul" y trataron a Jørgensen como un corsario. En 1809, mientras estaba en libertad condicional en Inglaterra, le sugirió a un comerciante que un viaje a Islandia podría ser rentable, ya que la isla sufría escasez de alimentos en ese momento, debido al monopolio danés del comercio islandés. Jørgensen acompañó el viaje del "Clarence" como intérprete. Ese viaje no logró comercializar ninguna mercancía ya que el barco era británico y Dinamarca había prohibido el comercio con Gran Bretaña. Poco después, el "Rover" llegó a Reykjavík. La Junta del Almirantazgo lo había enviado para preparar el camino para un segundo viaje mercante británico.