La unidad participó en la Operación Weserübung. Stab./KG 26 fue colocado bajo "X Fliegerkorps". Durante las 6 horas rápidas
Durante la invasión alemana de Dinamarca (1940) la unidad se trasladó al aeropuerto de Aalborg, Dinamarca, el 12 de abril de 1940. Se trasladó durante la Campaña noruega a Stavanger, luego a Trondheim a medida que la Wehrmacht avanzaba hacia el norte.