Escribir una continuación para este párrafo - Para la temporada 2011/12
En la temporada 2003-04, Perrotta fue utilizado como centrocampista junto a Daniele De Rossi y Miralem Pjanić. El 20 de febrero de 2012, Perrotta firmó una nueva extensión de un año a su contrato con Roma que lo mantendrá en el club hasta 2013. La comisión bruta fija de Perrotta para la temporada actual se elevó a 2,6 millones de euros más bonificaciones por rendimiento. Jugó 20 partidos en la temporada 2011-12, sin marcar un gol.