Escriba una continuación para este párrafo - Pablo Morillo finalmente capturado
Santafé el 6 de mayo de 1816. Al igual que los otros líderes del movimiento independentista, Caldas escapó de la ciudad, originalmente con el objetivo de llegar a Buenaventura para escapar al extranjero. En el camino, sin embargo, el futuro virrey Sámano triunfa sobre las tropas republicanas en la Batalla de la Cuchilla de El Tambo, y reconquista Popayán, y Caldas se ve obligado a esconderse en la Granja Paisbamba en Sotará, donde pronto es arrestado por los realistas españoles en 1816. Luego fue enviado de vuelta a Santafé, y ejecutado por un pelotón de fusilamiento el 29 de octubre de 1816, en la Plaza de San Francisco por orden de Morillo, conde de Cartagena. Cuando Caldas estaba a punto de ser ejecutado y la gente presente en el lugar apeló por la vida del científico, Morillo respondió: "España no necesita sabios". Antes de morir, Caldas escribió en la pared una gran letra griega θ, que se ha interpretado como exclamando "¡Oh larga y oscura partida!" (En español: "¡Oh larga y negra partida!". En la Atenas clásica, Theta fue utilizado como una abreviatura para el griego θάνατος (thanatos, <unk>death<unk>).