En febrero de 2004, Rybkin desapareció durante 4 días en circunstancias misteriosas. Un día después de su regreso acusó a la administración de Putin de complicidad en
los atentados con bombas de 1999 en Moscú que llevaron a una guerra en la república separatista rusa de Chechenia. Cinco días después, Rybkin apareció en Kiev. Más tarde declaró que había sido secuestrado y drogado por agentes del FSB ruso que lo atrajeron a Ucrania prometiendo organizar una reunión con el ex líder checheno Aslan Maskhadov. A su llegada le ofrecieron refrescos en el apartamento, momento en el que se sintió "muy somnoliento". Después de estar inconsciente, se despertó el 10 de febrero. Al despertar, le mostraron una cinta de video en la que estaba realizando "actos repugnantes" llevados a cabo por "horribles pervertidos". Le dijeron que la cinta sería hecha pública si continuaba con su campaña presidencial. Según Alexander Litvinenko, los agentes del FSB aparentemente trataron a Rybkin con su droga estándar de la verdad.