Después de algunos partidos amistosos y clasificatorios, la primera aparición de Schortsanitis en una importante competición FIBA con el equipo nacional de baloncesto masculino griego fue en el Campeonato Mundial FIBA 2006, que se celebró en Japón. Ayudó a Grecia a ganar la medalla de plata en el torneo, después de que derrotaron al Equipo EE.UU., por un marcador de 101 <unk> 95, en las semifinales. Schortsanitis anotó 14 puntos, en 17 minutos jugados durante el juego. También jugó con Grecia en los Juegos Olímpicos de 2008.
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