Cuando comenzó la Operación Barbarroja el 22 de junio de 1941, el entonces mayor Seryugin comandó el regimiento en el Frente Sudoeste, liderándolo en las Batallas Fronterizas al oeste de Stanislav y en el sector de Vinnytsia al sur de Uman. En septiembre fue asignado al mando de la 124a División de Rifles, pero no tomó el mando debido a que la 124a fue atrapada en el cerco. Seryugin fue nombrado jefe de personal de la 212a División de Rifles, con la que luchó en la ofensiva de Donbass y Barvenkovo-Lozovaya.
como parte del 6o Ejército del Frente Sudoeste. En mayo de 1942, el entonces coronel Seryugin fue nombrado subcomandante de la división, mientras continuaba sirviendo como su jefe de personal. Luchó con él en la Segunda Batalla de Járkov, durante la cual la división fue rodeada. A principios de junio, Seryugin rompió el cerco y cruzó a la orilla oriental del Seversky Donets con los restos del 212.