Escriba una continuación para este párrafo - En 1991, Barghouti fue delegado en la Conferencia de Madrid
, que se celebró con el objetivo de poner fin al conflicto israelí-palestino y a la Primera Intifada. En 1996, se postuló sin éxito como candidato a un escaño legislativo en las primeras elecciones de la Autoridad Palestina. En 2002 Barghouti dejó el Partido Popular Palestino. En junio de 2002, Barghouti, Haidar Abdel-Shafi, Ibrahim Dakkak y Edward Said establecieron la Iniciativa Nacional Palestina ("al-Mubadara al-Wataniyya al-Filistiniyya"), un intento de construir una alternativa reformista e inclusiva tanto a la Organización para la Liberación de Palestina como a los grupos militantes islámicos como Hamas. Barghouti se desempeña actualmente como secretario general de la Iniciativa.