También estableció el 13,000 acres (53 km2) Santanoni Preserve en el lago Newcomb en las montañas Adirondack al norte del estado de Nueva York, que hoy es un parque estatal y Monumento Histórico Nacional. Después de que el presidente William McKinley fue asesinado
En 1901 en la Exposición Panamericana en Buffalo, el entonces vicepresidente Theodore Roosevelt viajó a Buffalo para visitar a McKinley en el hospital. Como parecía que McKinley se recuperaría, Roosevelt fue a Santanoni como invitado de Pruyn; los dos eran viejos amigos. Cuando la condición de McKinley empeoró, Roosevelt partió directamente de Santanoni a Búfalo donde fue inaugurado como el 26o Presidente de los Estados Unidos.