Radicalizados por los acontecimientos recientes, los reformistas polacos (ya sea en el exilio o aún residentes en el área reducida restante a la Mancomunidad) pronto estaban trabajando en los preparativos para una insurrección nacional. Tadeusz Kościuszko, un popular general y veterano de la Revolución Americana, fue elegido como su líder. Regresó del extranjero y emitió la proclamación de Kościuszko en Cracovia el 24 de marzo de 1794. Llamó a un levantamiento nacional
bajo su mando supremo. Kościuszko emancipó a muchos campesinos para inscribirlos como "kosynierzy" en su ejército, pero la insurrección duramente combatida, a pesar del amplio apoyo nacional, resultó incapaz de generar la asistencia extranjera necesaria para su éxito. Al final, fue reprimido por las fuerzas combinadas de Rusia y Prusia, con Varsovia capturada en noviembre de 1794 a raíz de la Batalla de Praga.