En abril, Hitler se vio obligado a intervenir en los Balcanes, lo que condujo a la campaña del mismo nombre, también conocida como la invasión alemana de Yugoslavia, que incluyó la invasión de Bosnia y Herzegovina y la invasión de Bosnia y Herzegovina.
La Batalla de Grecia. La campaña posterior y las fuertes pérdidas alemanas en la Batalla de Creta convencieron a Hitler de que las caídas aéreas detrás de las líneas enemigas, utilizando paracaidistas, ya no eran factibles a menos que se lograra la sorpresa. Reconoció que las posibilidades de éxito en una operación aérea de ese tipo eran bajas; las fuerzas aerotransportadas alemanas no emprendieron ninguna operación de este tipo nuevamente. Esto tuvo importantes consecuencias para Malta, ya que indicaba que la isla solo estaba en riesgo de un asedio del Eje. Cuando, en junio, Hitler atacó a la Unión Soviética bajo la Operación Barbarroja, el "Fliegerkorps X" partió hacia el Frente Oriental, y la "Regia Aeronautica" se quedó para continuar su campaña aérea altamente efectiva contra Malta en los próximos meses. Geisler, al mando de los restos del "Fliegerkorps X", solo podía contar con aviones de colocación de minas del "Kampfgeschwader 4" (KG 4) y Ju 87 en operaciones nocturnas. Los problemas de suministro eran malos, la pequeña fuerza alemana que quedaba se vio obligada a abandonar las operaciones el 22 de abril de 1941. A principios de mayo de 1941, la "Luftwaffe" había volado 1.465 bombarderos, 1.144 cazas y 132 misiones de reconocimiento para sólo 44 pérdidas. El III./"Kampfgeschwader 30" (KG 30) y el III./"Lehrgeschwader 1" (KG 1) realizaron ataques nocturnos esporádicos durante abril.