Aunque las fuerzas armadas holandesas nunca tomaron el S.13 en servicio, Fokker operó el prototipo S.13 en librea militar. Por lo tanto, el S.13 ha volado como D-101. Durante la inundación de febrero de 1953
, el D-101 fue utilizado para el fotoreconocimiento desde la estación aérea naval de Valkenburg.