Escriba una continuación para este párrafo - Apareció como testigo en el juicio de Slobodan Milošević ante el TPIY en 2003. Esta aparición rompió su silencio de 12 años; después de ese testimonio, dio una entrevista a la revista de noticias "Globus" con sede en Zagreb. En su testimonio, declaró que Milošević obviamente se esforzaba por tallar una Gran Serbia de las ruinas de Yugoslavia. También reveló que tanto Milošević como Tuđman le confirmaron que en marzo de 1991 en Karađorđevo hicieron un acuerdo para dividir Bosnia y Herzegovina. Milošević respondió culpando a Marković por la intervención del Ejército yugoslavo en Eslovenia. Marković se negó a ordenar la intervención en Eslovenia
, declarando que estaba fuera de su mandato como primer ministro de Yugoslavia.