Escriba una continuación para este párrafo - Los periodistas declararon que él puede "haber jugado un papel principal en la orquestación" de la victoria electoral de Ahmadinejad, y que puede ser "una figura clave en la orquestación de la represión contra los manifestantes antigubernamentales" en junio de 2009, y directamente a cargo de los paramilitares Basij, a pesar de un apagón de su nombre en la prensa del régimen. En una carta abierta, Mehdi Karroubi, ex presidente del Majlis (parlamento) y candidato reformista en las elecciones presidenciales de 2009
, acusó explícitamente a Mojtaba Khamenei de participar en una conspiración para manipular las elecciones, refiriéndose a la interferencia ilegal de "una red".