Después de la caída de Cromwell, Godolphin adquirió una considerable reputación militar. Parece haber sido reclutado en el comando del ejército como ingeniero, aprovechando su conocimiento de la minería de estaño (que era la principal fuente de ingresos de su familia en Cornualles). Su contribución más importante fue en el asedio de Boulogne.
- ¿ Qué? Richard Carew en su "Encuesta de Cornualles" dice de él "Se humilló muy valientemente más allá de los mares, como lo demuestran las cicatrices que trajo a casa, no menos para embellecer su fama que para desfigurar su rostro". Después de la captura de Boulogne, fue nombrado su alguacil en reconocimiento a la parte que jugó en la victoria, y también nombrado caballero. Fue miembro del Consejo de Regencia de 1547 a 1551, Alto Sheriff de Cornualles en 1549 <unk> 50 y 1568 <unk> 9, y su MP una vez más en 1553. También fue Vicealcalde de Stannaries y Custos Rotulorum de Cornualles desde 1562 hasta su muerte en 1570.