Las fuerzas japonesas (la "Flota Combinada") en realidad consistían en dos flotas diferentes detalladas en dos operaciones separadas, a saber, la Operación AL
(para las Aleutianas) y la Operación MI (para Midway). La lista a continuación muestra todos los barcos asignados a la Operación MI, sin embargo, solo la Primera Fuerza de Ataque de Portaaviones de Nagumo y la Fuerza de Apoyo de Midway de Kurita participaron realmente en la Batalla de Midway.