Varios años después de la revuelta y la Declaración de Independencia Colombiana el 20 de julio de 1810 en Santa Fé de Bogotá vino la reconquista española de Nueva Granada
En 1815-1816, bajo el general Pablo Morillo. En 1816, el sacerdote de Firavitoba, Carlos Suárez, fue encarcelado por predicar la libertad. La campaña de liberación de 1819 culminó con las batallas del Pantano de Vargas, en Paipa, muy cerca de Firavitoba, y de Puente de Boyacá (El Puente de Boyacá), en la que fue asesinado el luchador por la libertad de Firavitoba Cayetano Avella. Estas dos batallas llevaron a la plena independencia de Nueva Granada y la creación de la Gran Colombia en agosto de 1819. La Gran Colombia se disolvió en 1830, y la región se convirtió en parte de la República de Nueva Granada, formada en noviembre de 1831.