Cuando la insurgencia comunista llegó a su fin, la proclamación de Malasia unió la federación de Malasia con Sarawak y Sabah para formar el país independiente de Malasia. Las condiciones traídas por una nueva insurgencia comunista
contra el nuevo estado independiente de Malasia llevó al MCP a reprimir la disidencia dentro de sus propias filas, causando la división de numerosas facciones, que comenzaron a luchar entre sí. Esto culminó en la disolución final del Partido Comunista de Malasia en 1989, cuando la izquierda radical del país comenzó a buscar alternativas al marxismo-leninismo.