Durante su segunda temporada en Michigan, Hughes fue seleccionado para competir en el
Campeonato Mundial Junior de Hockey sobre hielo 2019, junto a su hermano Jack. Se convirtieron en el tercer par de hermanos en competir por el Equipo EE.UU. en un torneo mundial de Juniores, siendo el más reciente Joey y Michael Anderson en 2017. El 24 de diciembre de 2018, Hughes, junto con su compañero de equipo de Michigan Josh Norris, fueron nombrados capitanes alternos del Equipo EE. UU. Los dos jugadores fueron dos de los cinco competidores que regresaron del equipo del Campeonato Mundial Junior de 2018. Hughes ayudó a llevar al Equipo EE.UU. a la ronda de la medalla de oro del torneo donde perdieron 3-2 contra Finlandia.