Después de la partición del subcontinente indio, la Academia de Ciencias de Pakistán se estableció en 1953. Después de la liberación de Bangladesh
, 12 miembros de Bangladesh (el entonces Pakistán Oriental) de la academia formaron la Academia de Ciencias de Bangladesh en 1973. Muhammad Qudrat-i-Khuda desempeñó el papel de presidente fundador hasta 1976.