Verdú ha sido nominada para los Premios Goya en once ocasiones, convirtiéndose en la actriz más nominada en la historia de estos premios. Su primera nominación, a Mejor Actriz, fue por la película de 1991 "Lovers" de Vicente Aranda, perdiendo finalmente ante Sílvia Munt por su papel en "Alas de Mariposa". Su segunda nominación, esta vez por Mejor Actriz de Reparto, fue por "La Celestina", una película de 1996 de Gerardo Vera, pero perdió ante Mari Carrillo por "Más Alla del Jardín". En "La Buena Estrella", de Ricardo Franco en 1997, logró su tercera nominación, nuevamente por Mejor Actriz, perdiendo finalmente ante Cecilia Roth en "Martín (hache) ". En 2006, recibió su cuarta nominación, a la Mejor Actriz, con "Pan's Labyrinth" de Guillermo del Toro, perdiendo una vez más ante Penélope Cruz. Finalmente, en su quinta nominación, ganó el Premio a la Mejor Actriz en los 22o Premios Goya en 2008, por "Siete mesas de billar francés" de Gracia Querejeta. La sexta nominación llegó más tarde en 2008, por Mejor Actriz en "Los girasoles ciegos" de José Luis Cuerda. Al año siguiente, 2009, sería nominada nuevamente a Mejor Actriz en la película "Tetro" de Francis Ford Coppola. En 2011, sería nominada como actriz de reparto por "Chrysalis" ("De tu ventana a la mía"), de Paula Ortiz. En 2013, en la 27a entrega de los Premios Goya
En 2009, recibió su segundo Premio a la Mejor Actriz, por "Blancanieves", de Pablo Berger. En 2014, fue nominada como actriz de reparto, por "15 años y un día", de Gracia Querejeta, perdiendo ante Terele Pávez por "Witching &amp; Bitching" ("Las brujas de Zugarramurdi"). Recibió su undécima nominación en 2017, por Mejor Actriz en "Abracadabra", otra película de Pablo Berger.