En mayo de 1861, el segundo teniente Heywood fue ascendido a primer teniente, y como tal desembarcó con los marines en
Hatteras Inlet, donde estuvo presente en la captura de Fort Clark y Fort Hatteras. Fue ascendido a capitán en noviembre de ese año, y durante el invierno de 1861-62 participó activamente en una serie de expediciones en barco en el río James.