Después de un período como instructor en el Reino Unido, Plagis regresó a la acción en septiembre de 1943 como comandante del Escuadrón No. 64, volando Spitfire Mk VCs sobre el norte de Francia. Tomó el mando del Escuadrón No. 126 (Golfo Pérsico) en junio de 1944, y dirigió muchos ataques contra posiciones alemanas durante la invasión de Francia y la campaña
que siguió; fue derribado sobre Arnhem durante la Operación "Market Garden", pero sólo ligeramente herido. Después de convertirse a Mustang IIIs, comandó un ala basada en RAF Bentwaters que apoyaba misiones de bombardeo. Terminó la guerra con el rango de líder de escuadrón y permaneció en la RAF después, operando Gloster Meteors a la cabeza del Escuadrón No. 266 (Rhodesia).