Después del ataque japonés a Pearl Harbor y la entrada de los Estados Unidos en la Segunda Guerra Mundial, Foster fue llamado al servicio activo con el rango de Comandante en la Reserva Naval y fue encargado directamente por el presidente Franklin D. Roosevelt para realizar inspecciones navales especiales. Una de sus primeras misiones fue investigar en la Zona del Canal de Panamá.
Después de una serie de quejas del teniente general del Ejército Daniel Van Voorhis, comandante del Comando de Defensa del Caribe sobre la cooperación entre el Ejército y la Marina.