Si la descendencia fuera realmente ininterrumpida, de padre a hijo, desde la vida de Confucio, los varones de la familia tendrían todos el mismo cromosoma Y que su antepasado masculino directo, con ligeras mutaciones debido al paso del tiempo. El objetivo de la prueba genética era ayudar a los miembros de las ramas colaterales en China que perdieron sus registros genealógicos a su descendencia. Sin embargo, en 2009, muchas de las ramas colaterales involucradas decidieron no aceptar las pruebas de ADN. Bryan Sykes, profesor de genética de la Universidad de Oxford, entiende esta cuestión: "¿El árbol familiar de Confucio tiene un enorme significado científico?" La prueba de ADN fue propuesta durante el siglo XX para probar el origen de los miembros de la familia de Confucio.
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