El Palacio de la Ribeira de Lisboa, un palacio real construido a principios del siglo XVI en estilo manuelino por el rey Manuel I, fue remodelado hacia finales del siglo XVI por orden de Felipe I (Filipo II de España). En esta época se modernizó la fachada del palacio y se construyó una gran torre de estilo renacentista con una cúpula junto al río Tajo. El palacio y su prominente torre dominaron el paisaje urbano de Lisboa hasta 1755, cuando el Gran terremoto de Lisboa
lo destruyó. Con el palacio real destruido, quizás el palacio más importante del Renacimiento tardío en Portugal es el Palacio Ducal de Vila Viçosa, construido entre finales del siglo XVI y principios del XVII para los duques de Braganza.