En el Campeonato de Francia de 2010, en Saint-Raphäel, ganó tanto el evento de medley individual de 200 m como el evento de medley individual de 400 m, terminando segundo detrás de Coralie Balmy en el evento de estilo libre de 200 m. En el Campeonato de Europa
En Budapest, Muffat llegó como la favorita para llevarse el oro en los 200 m medley individual, declarando a la prensa que la medalla de oro es su objetivo en ese evento. Sin embargo, después de liderar el campo en la tercera disciplina del medley, el pecho, fue superada por la húngara Katinka Hosszú, haciendo que Muffat perdiera el impulso y terminara cuarta en el evento. El mismo día, el equipo francés de relevo de 4 × 200 m estilo libre también terminó segundo en la final cuando Muffat, que estaba anclando el relevo francés, fue superado por otra nadadora húngara, Evelyn Verrasztó. Dos días más tarde, también terminaría 4o en el evento de estilo libre de 200 m, que fue ganado por la nadadora italiana Federica Pellegrini.