Después de la secesión de Carolina del Norte de la Unión, las defensas del estado fueron descuidadas por el gobierno confederado en Richmond. El Departamento de Guerra, dirigido al principio por el Secretario Leroy P. Walker y más tarde por Judah P. Benjamin, utilizó las tropas mejor entrenadas y mejor equipadas del estado para participar en las campañas en Virginia, a las que se les dio una mayor prioridad. Fueron vistos como la protección de la capital confederada de Richmond. Cuando la isla de Hatteras
cayó a las fuerzas de la Unión en agosto de 1861, sólo seis regimientos de infantería estaban disponibles para defender toda la costa del estado.