Weir y Lysacek habían dominado los Nacionales de EE.UU. durante los cinco años anteriores, pero en
2009, Jeremy Abbott, que había ganado en la final del Gran Premio en diciembre, rompió ese dominio y ganó la medalla de oro. Weir no estaba preparado para los Nacionales porque estaba "comprometido" por su enfermedad. En el programa corto, Abbott terminó en primer lugar con 86.40 puntos, Lysacek fue segundo con 83.59 puntos, y Weir llegó en séptimo lugar con 70.76 puntos. La puntuación general de Abbott fue una mejor puntuación personal de 237.72 puntos, cuatro puntos más que las mejores puntuaciones personales de Weir y Lysacek. Fue el resultado más bajo de Weir en el programa corto como patinador senior en una Nacional en su carrera.