Buuxi weedha soo socota: 16 Janaayo 2013, waxaa lagu dhawaaqay in Guardiola uu la wareegi doono macalinka kooxda Bundesliga ee Bayern Munich ka dib xilli ciyaareedkii 2012-13, isagoo badalaya Jupp Heynckes xilli ciyaareedka soo socda. Waxa uu khudbadiisii ugu horeysay ee jaraa'id u jeediyay tababaraha Bayern, 24-kii Juun 2013, af Jarmalka, wuxuuna yeeshay kulankiisii ugu horreeyay ee tababar laba maalmood ka dib. Kulankiisii ugu horreeyay ee rasmiga ahaa wuxuu ahaa Koobkii Jarmalka ee Super Cup ee ka dhanka ahaa Borussia Dortmund, iyadoo Bayern ay ku lumisay 4-2. Koobkiisii ugu horeeyay ee uu Bayern la qaaday wuxuu ahaa
2013 UEFA Super Cup, isaga oo ka adkaaday José Mourinho, oo dhawaan ku soo noqday tababaraha Chelsea. Bayern ayaa ku garaacday Chelsea toban ciyaartoy oo ay kooxda ka tirsanayd kadib markii Manuel Neuer uu badbaadiyay Romelu Lukaku.