Rugadh Seán Patrick O'Malley mar Patrick O'Malley air 29 an t-Ògmhios, 1944, ann an Lakewood, Ohio, mac Theodore agus Mary Louise (née Reidy) O'Malley. Bha an dà phàrant de shliochd Èireannach. Dh'fhàs O'Malley, a phiuthar, agus a bhràthair nas sine suas ann an South Hills of Pittsburgh, agus Reading, Pennsylvania. Aig aois 12, chaidh e a-steach do St. Fidelis Minor Seminary ann an Herman, sgoil-iarainn airson oileanaich a bha a' beachdachadh air a dhol a-steach don òrdugh Franciscan.
29 Ògmhios, 1944