Cuir crìoch air an abairt a leanas: San Iuchar 1999, chaidh Jacoby a cho-roinn mar stiùiriche airson fiosrachaidh (J2) air a 'Chòmhlain Luchd-obrach. Thòisich a dhreuchd le bhith a' stiùireadh na h-oidhirpean fiosrachaidh gus sgrùdadh a dhèanamh air na h-obraichean anns na Balcannan agus ann an Kosovo. Lean Operations Northern and Southern Watch air a bhith a' cumail a-mach No-Fly Zones agus smachan an aghaidh an Iorac. A bharrachd air an sin, chaidh itealan-saidheans EP-3 Navy na SA a chur an grèim leis na Sìonaich air Eilean Hainan às deidh bualadh le itealan-strì Sìneach rè obrachaidhean thairis air Muir Shìona a Deas agus an ionnsaigh air
Chaidh USS "Cole" a dhèanamh ann an Aden, Yemen. Chuir an tachartas mu dheireadh seo atharrachadh bunaiteach air dòigh-obrach a thaobh anailis sceimhlitheoireachd agus taic do dh'fheachdan obrachaidh a chaidh a chuir an sàs anns a 'Bhòrd Tasg Eadar-nàiseanta Co-cheangailte, a' sabaid an aghaidh na sceimhlitheoireachd (JITF-CT) a bha air a mholadh a bha ag obair fo stiùir an Staff Co-cheangailte J-2 mar phàirt den Defense Intelligence Agency. Bha Jacoby a 'toirt taic do mhaoineachadh nas motha airson JITF-CT air feasgar 10 Sultain, 2001 le àrd luchd-obrach air Comataidh Seòrsach Maireannach na Taigh-seinnse. Bha e anns a' Phentagon nuair a chaidh ionnsaigh a thoirt air air an 11mh den t-Sultain, 2001. Bha e na stiùiriche air JITF-CT, bha e gnìomhach ann an planadh fiosrachaidh airson Cogadh Cruinneil an aghaidh na h-Eadar-nàdarra agus gnìomhan armachd ann an Afganastan, bha e a 'cumail sùil air gnìomhan J-2 rè na h-ìrean tùsail de ghnìomhan sabaid ann an Afganastan agus bha e air leth cudromach ann a bhith a' leasachadh agus a 'toirt taic do bhun-bheachd obrachail ris an canar "2 Plus 7" a thàinig gu bhith na phrìomh phuing airson gnìomhan na SA gus an eagrachadh Al-Qaeda a chuir às agus ionnsaigh a thoirt air na gnìomhan stiùiridh agus planachaidh meadhanach aige. Bha na h-oidhirpean ag amas air obrachaidhean an aghaidh an dà cheannard agus na seachd àrd-phlanaichean obrachaidh. B' e droch bhuaidh mòr a bh' ann air comasan na buidhne. Chrìochnaich Jacoby a leudachadh aon bhliadhna mar Staff Eadar-mheas J-2 san Iuchar 2002.