Cuir crìoch air an abairt a leanas: Nuair a thòisich Cogadh Catharra Ameireagaidh, chaidh Jones gu furasta a-steach do Arm an Aonaidh. Air 7 Iuchar, 1861, chaidh e a-steach don 37mh New York Volunteers, ris an canar gu mòr "Irish Rifles", fo Cho-leanail John H. McCunn. B' e sa chiad àite neach prìobhaideach a bh' annta ach gu luath fhuair e fhèin air a thaghadh gu ìre an dàrna luitenant leis na fir san rèisimeint. Bha e an làthair aig a' Chiad Bhathar aig Bull Run, dìreach dà sheachdain às dèidh dha a chur an sàs, ach cha do chunnaic e gnìomh sam bith leis gun deach an aonad a chumail ann an stòras. Sheall Jones "co-obrachadh gaileant" rè a 'chiad bhliadhnaichean aige leis a' chòmhlan agus dh' èirich e gu luath ann an ìre a 'chiad leifteanant agus adjutant air 4 Samhain, 1861, agus an uairsin mòr air 21 Faoilleach, 1862. Chaidh e fhèin agus na "Irish Rifles" nas fhaide air adhart a-steach do III Corps an t-Seanalair Samuel P. Heintzelman, mar phàirt den 3mh Briogaid den 3mh Roinn fo Bhriogadair an t-Seanalair Philip Kearny, rè iomairt a' Chuimrigh agus ghabh e pàirt ann an Williamsburg,
Seachd Pines agus an iomairt Seachd Làithean. Bha Jones cuideachd an làthair nuair a bha an 37mh New York Volunteers, an uairsin ceangailte ris an 3mh Breatainn den 1mh Earrann den III Corps, aig an Dàrna Bhathar aig Bull Run. Anns a' Chèitean agus san Ògmhios, thòisich e a' fulang le malaria agus chaidh a chur san ospadal ann an Washington, D.C. air 26 Sultain a' fuireach ann gu deireadh an Dàmhair. Bha e cuideachd airson greis na oifigear aig a' Mhòra-ghinealach Franz Sigel mus do dh'fhàg an t-Seanalair Ambrose Burnside a dhreuchd agus an t-Arm a' Potomac air ath-eagrachadh.