Air 3 Samhain 2019, dh'fhàg Niko Kovač Bayern Munich le aonta a chèile às deidh call 5<unk>1 gu Eintracht Frankfurt, chaidh an neach-cuideachaidh aige, Hansi Flick, adhartachadh mar choidse eadar-amail. Anns a 'chiad gheama aige aig a' cheannas, bhuannaich Bayern Olympiakos 2 <unk> 0 ann an ìre buidhnean Lìog Cheamaichean UEFA air 6 Samhain 2019, Anns an Giblean 2020, chuir Bayern Munich Flick mar choidse maireannach le cùmhnant gu 2023. Thug Flick stiùireadh gu soirbheachail do Bayern gus an Bundesliga, DFB-Pokal agus UEFA Champions League a bhuannachadh, agus mar sin a 'crìochnachadh an treble mòr-thìr airson an dàrna turas ann an eachdraidh a' chlub, an t-seusan a leanas, thug e air Bayern Super Cup UEFA 2020 a bhuannachadh
an aghaidh Sevilla. Thug e cuideachd air Bayern a 'chiad cheud cheud a bhuannachadh a-riamh às deidh dhaibh Cupa Cruinne Club a bhuannachadh sa Ghearran 2021 le bhith a' bualadh air sgioba Mexico Tigres.