I le 1989, na auai ai Janša i le faavaeina o se tasi o vaega teteʻe muamua i Slovenia, o le Slovenian Democratic Union (SDZ) ma avea ai ma ona sui peresitene muamua, ma mulimuli ane avea ma peresitene o le Fono a le Pati. Ina ua mavae le uluai palota saoloto ia Me 1990 na avea ai o ia ma Minisita o le Puipuiga i le kapeneta a Lojze Peterle, o se tulaga na ia umia i le taimi o le taua a Slovenia mo le tutoatasi
ia Iuni ma Iulai 1991. Faatasi ai ma le Minisita o le Lotoifale Igor Bavčar, o Janša o le faʻatulagaina autu o le fuafuaga a Slovenia faasaga i le Yugoslav People's Army.