I le 2011, na fesoasoani ai Flournoy, o le Sui Failautusi o le Puipuiga mo Faiga Faavae, e faatalitonuina Peresitene Obama e faalavelave faamalosi i Libya
, e ui lava i teteega mai sui o le Konekeresi ma faufautua autu o le Maota Paʻepaʻe, e pei o Joe Biden, Sui Peresitene; Tom Donilon, Faufautua mo le Puipuiga a le Atunuʻu; ma Robert Gates, Failautusi o le Puipuiga. Na lagolagoina e Flournoy le faatulagaga a le NATO o se nofoaga e lē mafai ona lele ai vaalele i luga o Libya, ina ia aveesea ai le taʻitaʻi o le tetee o Muammar Gaddafi, o lē ua molia i le faatonuina o le fasiotia o tagata tetee, ma le folafola atu e "sauaina tagata fouvale ma e leai se alofa mutimutivale". Na taʻua e Flournoy, o le faaeeina atu o se nofoaga e le mafai ona lele ai, e manaʻomia ai le faaumatiaina o puipuiga a le ea a Libya i le US ma Peretania, e ala i le osofaʻia o le faiga o le puipuiga o le missile a Libya, ma le osofaʻiga a le US B-2 e osofaʻia ai malae vaalele a Libya.