Faatasi ai ma le vavaeeseina o setete i Saute e toʻasefulu tasi ma le amataina o le Taua Faalemalo, na auai ai Miller i le ʻautau a le Iuni. I le aso 27 o Aokuso 1861, na tofia ai e le Kovana o Oliver P. Morton Miller e avea ma Kolone o le 29th Indiana Infantry. Ina ua maeʻa aʻoaʻoga, na tofia le regiment i le Kirk's Brigade i le Alexander M. McCook's division i le Buell's Army of the Ohio ma savavali atu i Tennessee. Na auai Miller i le taua i le aso lona lua o le Taua i Sailo
, faapea foʻi ma le osofaʻiga mulimuli ane a Korinito. Na taʻitaʻia e Miller lana vaegaʻau e ui atu i le itu i mātū o Alabama ma Tennessee ma tuliloaina Braxton Bragg e ui atu i Kentucky. Na taʻitaʻia e Miller se vaega o fitafita i lalo o le taʻitaʻiga a James Negley i le taimi o le Taua i Stones River i le faaiuga o Tesema 1862. I le aso lona lua o le taua, na taʻitaʻia ai e Miller le osofaʻiga a le Feterale i le isi itu o le vaitafe o Stones River lea na teena ai le osofaʻiga a le Confederate a John C. Breckinridge. I le taimi o lenei osofaʻiga, na manuʻa ai Miller i le ua.