في حين ازداد معاداة السامية الإسلامية في أعقاب الصراع العربي الإسرائيلي، كانت هناك أعمال شغب ضد اليهود في بلدان الشرق الأوسط قبل تأسيس إسرائيل، بما في ذلك الاضطرابات في الدار البيضاء، شيراز وفاز في 1910s، المذابح في القدس، يافا، صفد والخليل في 1920s، المذابح في الجزائر وتركيا وفلسطين في 1930s، فضلا عن الهجمات على اليهود في العراق وتونس في 1940s. عندما قرر الزعيم العربي الفلسطيني أمين الحسيني عقد تحالف مع ألمانيا هتلر خلال الحرب العالمية الثانية، قتل 180 يهودي وجرح 700 يهودي في أعمال الشغب المستوحاة من النازيين في عام 1941 والمعروفة باسم فرحود. اليهود في الشرق الأوسط تأثروا أيضا بالهولوكوست. معظم شمال افريقيا خضعت لسيطرة النازيين والكثير من اليهود تعرضوا للتمييز واستخدموا كعبيد حتى هزيمة المحور. في عام 1945، جُرح مئات اليهود خلال مظاهرات عنيفة في مصر وتم تخريب ممتلكات اليهود ونهبوها. في نوفمبر 1945، 130 يهودي قتلوا خلال تجميد في طرابلس. في ديسمبر 1947، بعد فترة وجيزة من خطة تقسيم الأمم المتحدة، أدت أعمال الشغب العربية إلى مئات الضحايا اليهود في حلب، من بينهم 75 قتيلا. في عدن، قتل 87 يهودي وجرح 120 عصابة من البحارة المسلمين نهبوا بيوت اليهود ومحلاتهم في المنامة. خلال عام 1948 كانت هناك أعمال شغب أخرى ضد اليهود في طرابلس والقاهرة وعجدة وجرادة. كأول حرب عربية اسرائيلية
انتهى في عام 1949، هجوم قنبلة يدوية ضد كنيس مينارشا في دمشق أودى بحياة عشرات والجرحى ثلاثين. حرب الستة أيام عام 1967 أدت إلى مزيد من الاضطهاد ضد اليهود في العالم العربي، مما أدى إلى زيادة في الهجرة اليهودية التي بدأت بعد تأسيس إسرائيل. خلال السنوات التالية، انخفض عدد السكان اليهود في الدول العربية من 856,000 في عام 1948 إلى 25,870 في عام 2009 نتيجة للهجرة، معظمهم إلى إسرائيل.