اكتب استمرار لهذه الفقرة -- اندلعت الحرب في سبتمبر 1939 وانضم مولر للجيش. استأنف مسؤولياته في الجمعية، على الرغم من ان الجمعية كانت غير نشطة حتى عام 1945
.. في تلك السنة توفي نيرنهايم بعد يومين من عيد ميلاده الثمانين، وعاد مولر من الحرب إلى هامبورغ، واستأنف مهامه في جمعية تاريخ هامبورغ وكعضو كبير في فريق الإدارة في أرشيف المدينة. في عام 1948، تم تعيينه مدير (رئيس) للشركة. تولى منصبه في 1 يناير 1948، لكن بعد ذلك تم إرساله في إجازة في بداية فبراير 1948، حيث كان يواجه احتمال الإقالة.