في بداية الحرب العالمية الثانية، تم تعيين بروتيه في الفرقة الغواصة الثالثة، ومقرها تولون، جنبا إلى جنب مع أخواتها، و. في بداية فبراير 1940، تم نقل فرقة الغواصات الثالثة لفترة وجيزة إلى الدار البيضاء لتنفيذ مراقبة جزر الكناري، حيث كانت هناك زوجين من سفن الشحن الألمانية. بعد ذلك، تم تعيين فرقة الغواصات في مسرح المعركة في البحر الأبيض المتوسط في 12 أبريل، أولاً في بيزرت ثم، بدون "فريسنيل"، في بيروت، تحت سلطة القائد العام البريطاني في الإسكندرية. "بروتي" شاركت في عدة دوريات في دوديكانيز حتى توقيع الهدنة بين فرنسا وألمانيا
في 22 يونيو 1940. في 25 يونيو، تاريخ دخول الهدنة حيز التنفيذ، تجاهل قائد "بروتي" أمر بالعودة إلى بيروت، وأبحر بدلاً من ذلك إلى الإسكندرية، ليصبح جزءًا من القوة إكس. تم توبيخ القبطان لهذا الحادث.