بعد فترة وجيزة، بدأت الكودية في جذب انتباه مختلف الجهات الفاعلة السياسية بسبب أفكارها المتمردة التي شهدت في النهاية مشاركة بعض فصائلها في تمرد مسلح ضد الفرنسيين واليابانين والشيوعيين حتى الخمسينيات. نتيجة لذلك، تم نزع السلاح عن الدين، وسجن زعماءه، وقمع أتباعه في ظل الأنظمة السياسية المختلفة، والتي ساهمت في انخفاض نفوذها داخل المجتمع. بعد سقوط سايغون، القوات الشيوعية حصلت على السيطرة الكاملة.
في عام 1975، ازداد الاضطهاد الديني تجاه الكودية، وتم حظر الدين رسميا. وبينما كان الكرسي الرئيسي في تسي نين وغيره من المواقع عسكريًا بشدة وممنوعًا ممارساتهم الدينية الخارجية، يبدو تقريباً أن الدين سيختفي بدون جيل متتابع من القادة لقيادته. كثير من أتباعها ذهبوا تحت الأرض للبقاء على قيد الحياة، في حين سعى آخرون للاجئين في الخارج من الاضطهاد الديني، وبالتالي خلقوا مجتمعات الشتات في بلدان حول العالم. بعد فترة الإصلاح الاقتصادي في التسعينيات، تمكنت الكودية من إحياء وجودها العام من خلال إعادة فتح معابدها حيث استعاد الوجود الديني شرعية الدولة. ومع ذلك، الممارسة المثيرة للجدل لا تزال محظورة حتى اليوم.