مع اندلاع الحرب العالمية الثانية، القيادة العليا للجيش الألماني (OKH) اتخذت تنظيمها في وقت الحرب. هوزينجر رافق الموظفين الميدانيين وساعد في تخطيط العمليات لغزو بولندا والدنمارك
، النرويج، وفرنسا وبلدان الهبوط. تمت ترقيته إلى رتبة كولونيل في 1 أغسطس 1940، وأصبح رئيس "Operationsabteilung" في أكتوبر 1940، مما جعله رقم ثلاثة في التخطيط الهرمي للجيش، بعد رئيس هيئة الأركان العامة، الجنرال فرانز هالدر، ونائب رئيس هيئة الأركان العامة / رئيس الوزراء، الجنرال فريدريش باولوس.