لعب مع الأرجنتين في بطولة العالم لكرة القدم لعام 2006، حيث انتهى فريقه في المركز الرابع. كان جينوبيلي حامل العلم لأرجنتين في حفل افتتاح دورة الألعاب الأولمبية الصيفية لعام 2008، والتي أقيمت في بكين، الصين. في بطولة كرة السلة في دورة الالعاب الاولمبية الصيفية في بكين 2008
في عام 2015، هزمت الأرجنتين التي يقودها جينوبيلي ليتوانيا للفوز بلعبة الميدالية البرونزية، على الرغم من أن الحارس القاتل لم يلعب في تلك المباراة، بعد تعرضه لإصابة في نصف النهائيات من البطولة. في أبريل 2010، أعلن جينوبيلي أنه لن يشارك في بطولة العالم لكرة القدم لعام 2010، لأسباب عائلية. ومع ذلك، شارك مع الفريق في دورة الألعاب الأولمبية الصيفية في لندن عام 2012، حيث فاتت الأرجنتين بفارق ضئيل على الفوز بالميدالية البرونزية، في مباراة الميدالية البرونزية ضد روسيا. لعب آخر مباريات دولية في الألعاب الأولمبية الصيفية في ريو 2016، حيث انتهت الأرجنتين في المركز الثامن.