اكتب استمرار لهذه الفقرة - في عام 2001، بعد اندلاع الحرب الشيشانية الثانية، انضم خانغوشفيلي إلى المقاومة المسلحة لجمهورية إيشكريا الشيشانية في قتالها ضد روسيا. كان خانغوشفيلي قائد ميداني وكان له علاقات وثيقة مع الرئيس الشيشاني السابق اسلان ماسخادوف. قتل ماسخادوف في مارس 2005 في مداهمة من قبل ايف اس بي، وكالة الاستخبارات الروسية. طبقاً لأخ خانقوشفيلي، زوراب، زيلمخان شارك في هجوم يونيو 2004
على قوات الأمن والجيش والشرطة في جمهوريات إنجوشيا و داغستان الروسية، والتي قتل فيها 88 من ضباط الشرطة والمدنيين؛ زيلمخان جرح في الساق خلال العملية. الرئيس الروسي فلاديمير بوتين ادعى انه واحد من مرتكبي تفجير مترو موسكو. ومع ذلك، نفى زيلمخان نفسه أنه مسؤول عن جرائم الحرب، وقال لوسائل الإعلام الجورجية، "الروس يلومونني على أشياء كثيرة، بما في ذلك الهجمات الإرهابية. هذه كذبة. لا احد يستطيع ان يقدم اي دليل على ان احد المدنيين اصيب او قتل في اي من اعمالي!"