أكمل الجملة التالية: جونسون بدأ موسم 2016 بشكل جيد مع ستة من أفضل 10 في أول عشر مسابقات. بعد انتهاءه مرتين خارج المراكز العشرة الأولى، اقترب من الفوز ببطولة التذكار، حيث أنهى ضربة واحدة خلف الفائز في النهاية ويليام ماكغيرت. سجّل آخر 10 أعلى في فيديكس سانت جود كلاسيك بعد أسبوع. جونسون فاز
بطولة الولايات المتحدة المفتوحة لعام 2016 ليحصل على أول لقب رئيسي في 19 يونيو 2016 في ظهوره الرئيسي التاسع والعشرين. الفوز كان محاطاً بالجدل مع ذلك، حيث تم إعطاء جونسون ضربة جزاء واحدة بعد أن انتهت جولته الأخيرة بسبب حادث في الخضراء الخامسة. بينما كان يستعد ليتعامل مع الكرة من أجل ضربة، تحركت كرته قليلاً. جانسون ابتعد وقال انه لم يتحدث الى الكرة. بعد ما تكلم مع مسؤول قواعد الموقع، قيل له ان يواصل بالرماية والتي نجح فيها. انتهى به الفوز بثلاثة ضربات أمام شين لوري، سكوت بيرسي وجيم فوريك. حادثة الكرة المتحركة أثارت غضباً بين العديد من كبار لاعبي الغولف في العالم مع لاعبين مثل جوردان سبيث، روري ماكيلروي، ريكي فاولر وويب سيمبسون أخذوا إلى وسائل التواصل الاجتماعي لانتقاد USGA لقرارها. ارتفع جونسون بثلاثة مراكز في OWGR ليكون رقم ثلاثة بعد هذا الفوز.