كتب استمرار لهذه الفقرة - كمبعوث للحكومة العسكرية، قاد حملة باراغواي المشؤومة. قواته هزمهم بيرناردو دي فيلاسكو في معارك كامبيشيلو وباراغاري
.. مع انه هزم، بدأت الحملة سلسلة الأحداث التي أدت إلى استقلال باراغواي في مايو 1811. تراجع إلى محيط روزاريو، لتعزيزها ضد هجوم ملكي محتمل من النطاق الشرقي لنهر أوروغواي. وخلال وجوده هناك، صنع علم الأرجنتين. لم توافق المجموعة الثلاثية الأولى على العلم، لكن بسبب بطء الاتصالات، لم يعلم بيلغرانو عن ذلك إلا بعد أسابيع عديدة، أثناء تعزيز جيش الشمال في جوجو. هناك، مع العلم أنه في وضع غير مواتٍ استراتيجي ضد الجيوش الملكية القادمة من بيرو العليا، أمر بيلغرانو بمغادرة جوجوي، والتي أخلت جميع سكان مقاطعة جوجوي إلى سان ميغيل دي توكومان. هجومه المضاد في معركة توكومان أسفر عن انتصار استراتيجي رئيسي، وسرعان ما تبعه انتصار كامل على جيش بيو تريستان الملكي في معركة سالتا. ومع ذلك، أدت مداخلاته العميقة في بيرو العليا إلى الهزائم في فيلكابوجيو وأيوهوما، مما أدى إلى قيادة الثلاثية الثانية لإصدار أمر باستبداله كقائد لجيش الشمال من قبل خوسيه دي سان مارتين الذي وصل حديثًا. في ذلك الوقت، وافق اجتماع السنة الثالثة عشر على استخدام علم بيلغرانو كعلم حرب وطني.