في الألعاب الأولمبية الصيفية 2004 في أثينا، حسين وسع برنامجه من خلال التأهل لسباحة اثنين. حصل على ميداليتين ذهبيتين من دورة الألعاب الأفريقية
في أبوجا، نيجيريا، كسر الرقم القياسي المصري وتلبية FINA B-قطع من 55.75 (100 م الظهر) و 2:02.45 (200 م الظهر).