اكتب استمرار لهذه الفقرة بعد انقلاب 1989
تحت حكم الرئيس عمر البشير، بقي جنوب السودان تحت السودان لمدة 16 سنة. في 9 يناير 2005، تم التوقيع على اتفاق سلام شامل في نيروبي كينيا في ملعب نيايو والذي أعطى الضوء الأخضر لتقرير المصير. كما قال الراحل الدكتور جون غارنج دي مابيور، "سيسعى جنوب السودان في النهاية للبقاء دولة من خلال عملية تقرير المصير في إطار الاستفتاء لتحديد إما البقاء تحت السودان الموحد أو السودان الجديد الذي سيتم رؤيته في الانفصال الودود".