في موسم 2016-17، تمكنت فرانكفورت من إنهاء منتصف الجدول في المرتبة الحادية عشرة، بالإضافة إلى الوصول إلى نهائي كأس الدوري الألماني لعام 2017، وهو أول نهائي للنادي منذ عام 2006، حيث خسرت فرانكفورت 1<unk>2 ضد بوروسيا دورتموند. في الموسم 2017/18، تنافست فرانكفورت على مكان في المنافسة الأوروبية للموسم التالي. كوفاتش عادةً يستخدم تشكيل 3<unk>4<unk>2<unk>1 مع التركيز على الاستقرار الدفاعي ولعب الجناح. اخذ فرانكفورت لنهائي كأس ألمانيا 2018.
ثاني في النادي، حيث هزم صاحب عمله في المستقبل، بايرن ميونخ. مع هذا الفوز، قاد كوفاتش فرانكفورت الى كأسها الاول منذ 1988. انتهى بسجل 38 فوز و 20 تعادل و 33 خسارة في 91 مباراة. ادي هوتير اصبح خليفته.