اكتب استمرار لهذه الفقرة - جونيبيرو سيررا قضى ثمانية سنوات على مشروع بناء البعثات حتى عام 1770. عندما عدد من الأحداث التاريخية، بما في ذلك طرد اليسوعيين، أجبرت التخلي عن البعثات. سيررا انتقل الى كاليفورنيا. لما رحل سيرا، بقت البعثات في ايدي رجال الدين العاديين. خلال كل من حرب الاستقلال والمكسيكية والثورة المكسيكية
البعثات تعرضت للنهب والتدمير. بدأ العمل الأول في ترميم خارج كنائس البعثة في الثمانينيات. بين عامي 1991 و 1997، تم عمل أعمال داخلية على المذبحات والجوقات والأورغن واللوحات. تم تمويل المزيد من العمل من قبل الدولة بين عامي 1997 و 2002. عمل في التسعينيات شملت أيضاً العمل في الميادين والآثار المحيطة. الجهد لتسجيل البعثات كموقع للتراث العالمي بدأ في عام 2000 ونجح في النهاية في عام 2003، عندما تم إضافته خلال الاجتماع السابع والعشرين للجنة التراث العالمي.