اكتب استمرار لهذه الفقرة - في 15 أغسطس 1945، اليابانيين استسلموا
لقوات الحلفاء. بعد يومين، تم إعلان استقلال إندونيسيا. مالوكو اصبحت واحدة من مقاطعات جمهورية اندونيسيا. ومع ذلك، كان تشكيل ووضع مالوكو في ذلك الوقت مضطرًا إلى أن يحدث في جاكرتا، لأنه بمجرد استسلام اليابانيين، دخلت الإدارة المدنية الهندية الهولندية (NICA) على الفور مالوكو لتولي السيطرة. هولندي سيطر على مالوكو حتى عام 1949، عندما في اتفاقات مؤتمر المائدة المستديرة الهولندية-الإندونيسية، اعترف الهولنديون بسيادة إندونيسيا. الهولندي غادر مالوكو. بسبب عدم الثقة العميقة في القيادة الإندونيسية، والتي كانت غالبًا من المسلمين الجاويين، في عام 1951 أعلنت جمهورية جزر الملوك الجنوبية المستقلة (بالإندونيسية: RMS، Republik Maluku Selatan) في أمبون، بدعم من الهولنديين. كان لـ RMS دعم قوي بين الجنود الاستعماريين السابقين في جزر الملوك. نتيجة لذلك، غزت القوات الإندونيسية مالوكو لسحق الانفصاليين. الحصن الرئيسي لمجموعة RMS المتمردة على أمبون هزمت من قبل القوات الإندونيسية في نوفمبر 1950، في حين استمرت معركة حرب العصابات على نطاق أصغر في جزيرة سيرام حتى عام 1962. لكن الهزيمة على امبون أدت إلى هروب حكومة RMS المعلنة ذاتيا من الجزر، وتشكيل حكومة في المنفى في هولندا. في السنة التالية، ذهب حوالي 12000 جندي من جزر المولوك مع عائلاتهم إلى هولندا، حيث أسسوا حكومة في المنفى "جمهورية جزر المولوك الجنوبية".