أكمل الجملة التالية: تمت ترقيته لرتبة رائد (الولايات المتحدة) بعد وقت قصير من عودته للخدمة، أصيب ويلسون بجروح خطيرة، أطلق عليه النار ثلاث مرات خلال معركة تشيكاموغا. بعد تعافيه في ويسكونسن (خلال هذه الفترة تزوج من ماري مادسون، 1843-1903) ، عاد ويلسون في نوفمبر 1863 كضابط قائد في الفوج الاسكندنافي خلال معركة روكي فيس ريدج،
ريساكا وبيكيتز ميل (خلالها عانى الفوج من خسائر فادحة بشكل خاص) قبل تسليم القيادة إلى الكولونيل أول جونسون في يوليو 1864. بقي ويلسون مع الفوج، وخدم في 26 اشتباكات عسكرية إضافية، حتى نهاية الحرب في عام 1865.