لكن الفساد المتفشي في صفوف الحكومة والبيروقراطية، وعدم المساواة الاقتصادية بين الجناحين في البلاد، والذي سببه أساسا نقص الحكومة التمثيلية، وعدم مبالاة الحكومة لجهود السياسيين القوميين العرقيين الشرسين مثل مجيب الرحمن من شرق باكستان، أدى إلى حرب أهلية في باكستان.
وبعدها انفصال شرق باكستان كدولة جديدة لجمهورية بنغلاديش الشعبية.