في القرن السادس عشر، خلال فترة الغزو الإسباني لغواتيمالا، كان شاطئ البحيرة مسرح معركة هزم فيها الإسبان وحلفاؤهم من الكاكشيكل التزوتوجيل. بعد الغزو الاسباني لغواتيمالا
في عام 1520، أسس الفرنسيسكان كنيسة ودير في باناياخيل بعد فترة وجيزة، واستخدموا المدينة كمركز لتحويل السكان الأصليين في المنطقة إلى الإيمان الكاثوليكي الروماني. الواجهة الأصلية للكنيسة ما زالت قائمة، وتعتبر واحدة من جواهر النمط الاستعماري في غواتيمالا.