في يوليو 1813، وبدافع من انتصاره على الفيدراليين، بدأ الجنرال ناريينو حملة عسكرية مكثفة ضد القوات الإسبانية والرويالية المتبقية في الجنوب، ويعتزم الوصول إلى باستو وفي النهاية كيتو. تمكنت قوات نارينيو، المعروفة باسم جيش الجنوب، والتي بلغت عددها 1500 إلى 2000 رجل، من الاستيلاء على بوبايان في يناير 1814، لكنها هُزمت تمامًا في باستو في مايو 1814، وتم اعتقال نارينيو ثم أرسلت إلى السجن الملكي في قادس عبر كيتو. استغل الفيدراليون هذا ليهاجموا بوغوتا، مما سمح للجنرال سيمون بوليفار من المقاطعات المتحدة بفرض شروط في ديسمبر 1814. ومع ذلك، بحلول منتصف عام 1815، وصل بابلو موريلو مع قوة إسبانية كبيرة وأعاد المنطقة إلى الخضوع
لفرناندو الذي اعيد اعادته. انتهت حملة موريلو باحتلال سانتافيه في 6 مايو 1816.