اكتب استمرار لهذه الفقرة - سميت على اسم عمتها من ناحية والدها الإمبراطورة الرومانية المقدسة إليونورا، والتي كانت أيضا عرابتها. زواج والدا إليونورا كان بهدف تعزيز مطالبات فرع نيفيرس من منزل غونزاجا لدوقيات مانتوا ومونتفيرات عندما يختفي الخط الرئيسي. كان على دوق نيفيرز، وهو خادم لمملكة فرنسا، مواجهة معارضة من فيرانت الثاني غونزاغا، دوق غواستالا، الذي اعتمد على دعم الإمبراطورية الرومانية المقدسة، مملكة إسبانيا ودوقية سافوي، وبالتالي بدأ حرب الخلافة المانتوانية
في سنة 1631، غادرت إيلونورا مع والداها وشارل الأخ الأكبر من مانتوا، ولكنها عادت بعد سنة من توقيع معاهدة شيراسكو (19 يونيو 1631) ، والتي اعترفت بحقوق دوق تشارل من نيفيرز على دوقية مانتوا (كأقرب قريب ذكر من السلالة الرئيسية المنقرضة لبيت غونزاغا) ومونتفيرات (بسبب زواج وريثه من ماريا غونزاغا، آخر نسيج من السلالة الرئيسية غونزاغا ووريثة لهذه الدوقية، والتي كان يمكن إثبات تراثها من قبل الإناث منذ أن اكتسبها غونزاغا من خلال الزواج من مارغريتا باليولوجا في عام 1540) ؛ ومع ذلك، بعد شهر واحد (30 أغسطس 1631) ، توفي والد إيلونورا بسبب السل، وبدأت سلسلة من الصراعات السياسية بين الدوق تشارل وزوجته، والتي انتهت بنفيذ مارجريت من من مقاطعة سافوي (ماريا).