اكتب استمرار لهذه الفقرة - كان كوفاليوف ناقدا صريحا للميول الاستبدادية في ادارات بوريس يلتسين وفلاديمير بوتين. في عام 1996، استقال من منصب رئيس لجنة حقوق الإنسان الرئاسية ليلتسين، بعد أن نشر رسالة مفتوحة إلى يلتسين، اتهم فيها كوفاليوف الرئيس بالتخلي عن المبادئ الديمقراطية. في عام 2002، نظم لجنة عامة للتحقيق في تفجيرات شقق موسكو عام 1999
(لجنة كوفاليوف) ، والتي شلّت فعليًا بعد اغتيال أحد أعضائها، سيرغي يوشينكوف، وعضو آخر، يوري شيتشيكين، زُعم أنه تسمم بالثاليوم، ومحاميه والمحقق، ميخائيل تريباشكين، اعتقلوا.