في عام 1916، بعد دخول رومانيا في الحرب العالمية الأولى، عاد راينر إلى بوخارست وانضم إلى مارتا، حيث تم استدعاؤه للخدمة الطبية كعقيد. خلال الهجوم المضاد لعام 1916، أقام الراينرز أقسام جراحية في المستشفيات التي أصبحت ممتلئة بالجرحى من معركة تورتوكايا
و هجوم الزيبلين على بوخارست. في وقت لاحق، خلال احتلال بوخارست من قبل القوى المركزية، أنشأ فرانسيسك رينر مستشفيات مؤقتة في المدارس. واصل التدريس تحت الإدارة الألمانية، حتى لا يفوت طلابه سنة واحدة، لكنه كان ملزمًا أيضًا بتدريس دورات منفصلة للطلاب الألمان. تمكن من منع سلطات الاحتلال من الاستيلاء على ممتلكات الكلية. اعتبروا المشتبه فيهم سياسياً، وتم اختيار عائلة راينر للاحتجاز في بلغاريا، لكن تم إنقاذهم من خلال تدخل مينوفيتشي نيابة عنه. مارتا راينر، التي ادارت مستشفيات الحرب، نظمت فرق من الجراحين للمساعدة في التعامل مع الأزمة الإنسانية، وعملت بدون توقف خلال الشتاء البارد للغاية من 1917-1918.