في الفورمولا واحد، بعد بدايته الواعدة في السنة السابقة، كان عام 1966 عاماً سيئاً لستيوارت؛ كانت سيارات H16 BRM ذات سعة 3 لتر غير موثوقة، على الرغم من أن ستيوارت فاز بجائزة موناكو الكبرى في سيارة ذات محرك سعة 2 لتر. أهم حدث في تلك السنة كان حادثته في جائزة بلجيكا الكبرى
في سبا-فرانكورشانس، والذي أثار حملته لتحسين السلامة في الفورمولا واحد وجعله يفوت جائزة فرنسا الكبرى في ريمز.