كتب استمرار لهذه الفقرة - ظهر بوناجا لأول مرة مع بنما في نصف نهائيات كأس الأمم 2009 من كأس الأمم المتحدة في 30 يناير 2009، وبدل في اللحظة الأخيرة ضد هندوراس، واعتبارا من 1 مايو 2015، حصل على ما مجموعه 23 مباراة، وسجل هدف واحد. مثّل بلاده في مباراتين للتأهل لكأس العالم لكرة القدم لعام 2011
وكأس الكونكاكاف الذهبي لعام 2013. في 10 يناير 2013 سجل هدف ضد غواتيمالا في مباراة ودية في الدقيقة 67 من المباراة.