بعد انتخابات 1986، شكّل صادق حكومة ائتلافية تضمّ حزب الأمة (الذي قاده) ، الجبهة الإسلامية الوطنية (التي قادها صهرها، حسن الترابي) ، الحزب الاتحادي الديمقراطي (الذي قاده محمد عثمان الميرغني الخطيم) وأربع أحزاب جنوبية صغيرة. ومع ذلك، أثبت هذا التحالف أنه غير مستقر، مما منع صادق من الوفاء بوعوده بإنهاء الحرب الأهلية السودانية الثانية وإصلاح الأزمة الاقتصادية المستمرة. في 30 يونيو 1989، تم الإطاحة بحكومته في انقلاب.
بقيادة العميد عمر البشير. منصب رئيس وزراء السودان بعد ذلك تم إلغاؤه.