رجعت الى نورفولك في 1 يناير 1847 لتصلحها، ثم وصلت إلى فيراكروز في 21 مارس 1847، حاملة بيري لتولي قيادة الأسطول الأمريكي. على الفور هي ورجالها انزلوا
العمليات البرمائية ضد فيراكروز، تزويد المدافع وطواقمها ليتم نقلها على الشاطئ للبطارية التي حاربت المدينة للاستسلام في أربعة أيام. خلال بقية الحرب، ساهمت "ميسيسيبي" بالأسلحة والرجال والقوارب في سلسلة من الغارات الساحلية على الساحل الشرقي للمكسيك، حيث شاركت في الاستيلاء على تاباسكو في يونيو 1847.