رجعت إلى نورفولك لإصلاحات في 1 يناير 1847، ثم وصلت إلى فيراكروز في 21 مارس 1847، حاملة بيري لتولي قيادة الأسطول الأمريكي. على الفور هي ورجالها انخرطوا في عمليات برمائية ضد فيراكروز
يزودون بنادق وطاقمهم ليتم نقلهم للشاطئ للضربة التي قاتلت المدينة ليتسلموا في أربعة أيام. خلال بقية الحرب، ساهمت "ميسيسيبي" بالأسلحة والرجال والقوارب في سلسلة من الغارات الساحلية على الساحل الشرقي للمكسيك، حيث شاركت في الاستيلاء على تاباسكو في يونيو 1847.