خلال حملة تشاتانوغا، حاول الكونفدراليون محاصرة جيش كومبرلاند ليتسلموا، لكن وصل تعزيزات من جيش تينيسي تحت قيادة غرانت، ويليام تيكومسه شيرمان، وجوزيف هوكر. تم طرد الكونفدراليين من المدينة في معارك جبل لوكاوت
ومبشر ريدج في نوفمبر 1863. على الرغم من المشاعر الاتحادية في شرق تينيسي، احتل الكونفدراليون المنطقة لمعظم الحرب. بعد بضعة أيام من سقوط شاتانوجا، قام الكونفدراليون بقيادة جيمس لونغستريت بحملة فاشلة لاستيلاء على نوكسفيل من خلال مهاجمة فورت ساندرز لجنرال الاتحاد أمبروز بيرنسايد. السيطرة على شاتانوجا سمحت لشيرمان بإطلاق حملة أتلانتا من المدينة في مايو 1864. آخر معارك كبيرة في الولاية كانت عندما غزت فوجات جيش تينيسي بقيادة جون بيل هود وسط تينيسي في خريف عام 1864 في محاولة لجذب شيرمان. تم فحصهم من قبل جون سكوفيلد في فرانكلين في نوفمبر وتشتتهم جورج توماس في ناشفيل في ديسمبر. في 27 أبريل 1865، حدثت أسوأ كارثة بحرية في التاريخ الأمريكي عندما انفجرت قارب البخار "سلطانة"، التي كانت تنقل سجناء الاتحاد المحررين، في نهر المسيسيبي شمال ممفيس، مما أسفر عن مقتل 1168 شخص.