اكتب استمرار لهذه الفقرة - بسبب نشاطه اعتقلته الشرطة الايرانية عدة مرات. فِي 22 اغسطس 2009، اُعتقلَ مُجدداً في سياق الاضطرابات بعد الانتخابات الرئاسية في 2009
 فِي ابْتِدَاءِ آذار 2010 أُطْلِقَ بِكَفَالَةٍ بَعْدَ انْقِضَاءِ حَوَالَيْ ثَلاثَة أَشْهُرٍ فِي الحبس الانفرادي. اتُهم بـ"محاربة" لـ"مُتَعَامَلَة مَع مجموعات أجنبية غير محددة والعمل على تقويض النظام الإسلامي" و"إهانة مؤسس الجمهورية الإسلامية آية الله الخميني والآية الله خامنئي". ماليكي دخل المستشفى عدة مرات بسبب نوبة قلبية ومشاكل جسدية اخرى من ضمنها سرطان البروستاتا خلال الاعتقال. ويقال ايضا انه حُرِمَ من الحصول على العلاج الكافي ، ولاحقا (سبتمبر 2011) ، كتب تقريرا مختصرا الى المقرر الخاص للأمم المتحدة في ايران عن التعذيبات التي عانى منها خلال فترة سجنه ، والتي تم استجوابه لاحقا وتلقى إشعار يمنعه من السفر الى الخارج.