اكتب استمرار لهذه الفقرة - بعد وفاة باتوري في 1586، ساعد زامويسكي سيجسموند الثالث فاسا في الحصول على العرش البولندي، وحارب في الحرب الأهلية القصيرة ضد القوات التي تدعم هابسبورغ مكسيميليان الثالث من النمسا. معسكر دعم سيغيسموند جمع حول زامويسكي، بينما دعم ماكسيميليان عائلة زبوروفسكي. زامويسكي دافع عن كراكوف وهزم قوات ماكسيميليان في معركة بايتشينا
في سنة 1588. في تلك المعركة ، التي يصفها سلافومير ليسنيوسكي بأنها "واحدة من أهم المعركة في التاريخ البولندي ، وأهمها في مهنة زامويسكي العسكرية" ، تم القبض على ماكسيميليان وسجنه في معاهدة بيتوم و بيدزين الناتجة في عام 1589 وكان عليه التخلي عن كل الادعاءات إلى التاج البولندي. في وقت لاحق من تلك السنه اقترح زامويسكي اصلاح الانتخابات الملكيه ، والتي فشلت في اجتياز سيم. زامويسكي عرض على هذا السيم مشروع انه في حال مات الملك الحالي بدون اولاد لا احد الا مرشح من بعض السلاف يجب ان يكون مؤهلا للكرسي البولندي. هذا كان مشروع يقدر حتى يتخيل امكانية نوع من الاتحاد بين بولندا الكاثوليكية، موسكوفي الأرثوذكسية وبوهيميا شبه البروتستانتية. في الحقيقة، كان مقترح مضاد متعرج ومخادع ضد السياسة الموالية لـ هابسبورغ.