بعد ان انضم المنطقة الى جمهورية الصين الشعبية، ساهمت عوامل مثل الهجرة الجماهيرية التي ترعاها الدولة من الهان الصينيين من الخمسينيات الى السبعينيات، وسياسات الحكومة التي تعزز الوحدة الثقافية الصينية وتعاقب بعض التعبيرات عن الهوية الويغورية، والاستجابات القاسية للانفصالية في التوتر بين الويغور والشرطة الحكومية والهان الصينيين. هذا اتخذ شكل كل من الهجمات الارهابية والاضطرابات العامة الواسعة مثل شغب بلدة بارين ، تفجيرات حافلة أورومكي 1997 ، الاحتجاجات في غولجيا ، حادثة شاغوان يونيو 2009 والاضطرابات الناتجة عن شغب أورومكي يوليو 2009
2011 هجوم هوتان, ابريل 2014 هجوم اورمكي, مايو 2014 هجوم اورمكي, هجوم كونمينغ 2014 وكذلك هجوم منجم أكسو لسنة 2015. منظمات اويغورية اخرى مثل المؤتمر الاويغورى العالمي تدين الشمولية والتعصب الديني والارهاب كأداة سياسية.