اكتب استمرار لهذه الفقرة - بعد اندلاع الحرب مع اليابان، عاد آلن الى استراليا في مارس 1942، وفي أغسطس اتولى مسؤولية العمليات ضد التقدم الياباني على طول مسار كوكودا
 وبالرغم من نجاحه ، إلا ان آلن تعرض لما يعتبره الكثيرون انتقادات غير عادلة من قبل قائد الحلفاء في منطقة جنوب غرب المحيط الهادئ ، الجنرال الأمريكي دوغلاس ماك آرثر وقائد القوات البرية الحليفة ، الجنرال الأسترالي السير توماس بلامي ، للتحرك ببطء شديد في مطاردة اليابانيين عبر سلسلة اوين ستانلي. خُلِعَ من قيادته في 29 أكتوبر 1942. وَتَبِعَتْ تَعَيُّنَاتٌ صَغِيرَةٌ، لَكِنْ فِي أكتوبر 1944، أوصى بليمي بِتَعَيُّنِ ألن كَفَارِسًا قائدًا لأمر الإمبراطورية البريطانية، على الرغم من أن ألن لم يُعَيَّن أبدًا.