13 a. pabaigoje Palestina ir Sirija tapo pagrindiniu frontu prieš sparčiai besiplečiančią mongolų imperiją, kurios armija pirmą kartą pasiekė Palestiną 1260 m., pradedant mongolų puolimų į Palestiną, vadovaujamų nestorietiško krikščionybės generolio Kitbuqa. Mongolų lyderis Hulagu Khanas nusiuntė laišką Prancūzijos karaliui Liudvikui IX, kad Jeruzalė buvo perduota krikščionims pagal Prancūzijos ir Mongolių sąjungą; tačiau netrukus po to jis turėjo grįžti į Mongoliją po Mongke mirties, palikdamas Kitbuqa ir sumažintą armiją. Kitbuqa tada kovojo su mamelukais, vadovaujamais Baibaru, lemiamoje Ain Jalut mūšyje.
Jezreelio slėnyje. Mamelukų lemiama pergalė Palestinoje laikoma viena reikšmingiausių mūšių pasaulio istorijoje, sukūrusi viršūnę mongolų užkariavimams. Tačiau 1300 m. mongoliams pavyko surengti keletą trumpų įsiveržimų į Gazaną ir Mulajus, pasiekiant net Gazą. Jeruzalę mongolai užėmė keturis mėnesius (žr. Devintąjį kryžiaus žygį).