13-oji divizija iš pradžių buvo surinkta Takados mieste, dabar Jōetsu, Niigata, iš vyrų Niigatos prefektūroje, vadovaujant generoliui leitenantui Haraguchi Kensai. Ji buvo suteikta nepriklausoma užduotis okupuoti Sachaliną.
prieš sudarant Portsmuto sutartį, išplaukė į Sachaliną 1905 m. liepos 7 d., praėjus vos trims mėnesiams po to, kai buvo suformuota, ir užsitikrino salą iki 1905 m. rugpjūčio 1 d. Dėl sėkmingos operacijos Japonijai buvo suteikta Pietų Karafuto, viena iš nedaugelio teritorijų, kurias Japonija laimėjo per karą.