"Napoli" laimėjo 2012 m. Italijos taurės finalą prieš nepralaimėjusius čempionus "Juventus" gegužės 20 d.; tai buvo vienintelis "Juventus" pralaimėjimas sezone ir pirmasis "Napoli" titulas per daugiau nei 20 metų. Tų pačių metų rugpjūčio 11 d. klubas patyrė kontroversišką pralaimėjimą "Juventus" per papildomą laiką 4-2.
, kuriame buvo išmesti du "Napoli" žaidėjai ir Mazzarri. 2013 m. gegužės 19 d. jis paliko "Azzurri", vedęs juos į antrą vietą ir vietą Čempionų lygoje 2012-13 Serie A sezono pabaigoje; tai buvo geriausias klubo lygos rezultatas per 20 metų.