Vienas pirmųjų jo užduočių po perrinkimo buvo apsilankymas Airijoje, kad įtikintų Airijos piliečius patvirtinti Lisabonos sutartį per antrąjį šalies referendumą.
kuris turi būti surengtas kitą mėnesį. 2009 m. rugsėjo 19 d. ryte išlipus iš lėktuvo Šanono oro uoste, J. Barroso buvo pasveikinti Airijos gynybos ministro Willie O'Dea ir užjūrio plėtros valstybės ministro Peter Power, o vėliau trumpai susitiko su Oireachtas jungtiniu komitetu ir sutiko bei pasveikino žmones Limeriko miesto savivaldybėje, Limeriko universitete (UL) ir Savoy viešbutyje. "The Irish Times" interviu, kurį tarptautiniu mastu citavo "Reuters", jis sakė, kad buvo paklaustas, ar Airija pasitrauks iš Europos Sąjungos. Jis taip pat paskelbė apie 14,8 mln. eurų dotaciją buvusiems "Dell" Limeriko gamyklos darbuotojams, kurią buvusi Europos Parlamento narė ir Lisabonos priešininkė Patricia McKenna apibūdino kaip "patogiai tinkamą".