1981 m. vasarą 28 metų Filipovičius prisijungė prie dabartinio Portugalijos čempiono S.L. Benficos, kur per tris sezonus jis įstojo 28 taškus 54 lygos rungtynėse. Zoranas Filipovičius taip pat vedė Benfiką į 1983 m. UEFA taurės finalą.
Prieš R.S.C. Anderlecht, buvo geriausias to sezono varžybų įvaržėjas ir įžengė įsimintinus Portugalijos taškus ketvirtfinale prieš AS Roma ir pusfinale prieš Universitatea Craiova.