2006 m. rugsėjo mėn. popiežius Benediktas XVI kalbėjo apie krikščioniškojo tikėjimo "protingumą" Vokietijos Regensburgo universitete. Regensburgo paskaitose
jis kalbėjo apie racionalumą tikėjime, ir cituoja XIV amžiaus Bizantijos imperatoriaus Manuelo II Paleologo komentarus, kuris, kaip sakė popiežius, pasakė "Parodykite man ką tik Mohamedas atnešė, kas buvo nauja, ir ten rasite tik blogus ir nežmoniškus dalykus, tokius kaip jo įsakymas skleisti kardu tikėjimą, kurį jis skelbė". Šis citatas sulaukė griežtos kritikos iš musulmonų visame pasaulyje, įskaitant Pakistano parlamentą, kuris pasmerkė popiežių komentarus ir paprašė jo atsiprašyti. Po šios kalbos rugsėjo 17 d. Choudary vadovavo protestui prie Vestminsterio katedros, kur jis žurnalistams sakė: "Kas įžeidžia Mahometo žinią, bus nubaustas mirties bausme". Metropoliteninė policija ištyrė jo komentarus, bet padarė išvadą, kad per demonstraciją nebuvo padarytos "jokių esminių nusikaltimų". Šešėlinis vidaus reikalų sekretorius Davidas Davisas, kuris ragino imtis veiksmų prieš Choudary, sakė: "Tai gana gėdinga. Tai siunčia žinutę musulmonų ekstremistams, kad mes, kaip šalis, neturime moralinės drąsos priešintis jiems". Tačiau yra teiginių, kad JK teisėsaugos pareigūnai daug kartų turėjo pakankamai įrodymų, kad galėtų jį areštuoti. Jie buvo uždrausti tai daryti, nes jis buvo svarbus Britanijos saugumo tarnybų atliekamiems tyrimams.