1992 m. "Blue Jays" tapo pirmąja Kanadoje įsikūrusia komanda, laimėjusia "Commissioner's Trophy", su pora šešių rungtynių pergalėmis prieš "Oakland" "ALCS" ir "Atlanta Braves" Pasaulio serijoje. 1993 m. jie pakartojo savo sėkmę, kai dar pora šešių rungtynių pergalės prieš Chicago White Sox ALCS
ir Filadelfijos "Phillies" pasaulio čempionate. Po 1993 m. "Blue Jays" 21 sezoną iš eilės nesugebėjo patekti į atostogų varžybas.