Nors San Franciskas liko pirmojo diviziono komanda ir dažnai varžėsi per likusį 1960-ųjų dešimtmetį, jis per dešimtmetį nebegalėjo kito vėliavos; iš tikrųjų komanda laimėjo vieną divizijos čempionatą nuo 1969 iki 1986 m. (1971
), ir vėl pasirodė pasaulio serijoje tik 1989 m. "Giants" baigė keturis sezonus (1965-68) antrąja vieta. Iki 1969 m. komanda pradėjo rodyti senėjimo ir nuosmukio ženklus. Tuo pačiu metu, Feeney buvo svarstomas dėl žinomų pozicijų Major League Baseball hierarchijoje. Po to, kai jo kandidatavo į Beisbolo komisarą, Feeney pakeitė Warren Gilesą Nacionalinės lygos prezidentu 1969 m. gruodžio 5 d.