1796 m. jis tarnavo Napoleono Bonaparte Italijos kampanijoje ir buvo paaukštintas į "général de division" už gerą tarnybą lauke. 1798 m. Brune vadovavo prancūzų kariuomenei, okupavusiam Šveicariją ir įkūrusiam Helvetų respubliką. Kitąmet jis vadovavo prancūzų kariuomenei, ginantiems Amsterdamą nuo anglo-rusų invazijos į Olandiją, kuriai vadovavo Jorko kunigaikštis. Anglo-rusų pajėgos buvo nugalėtos Castricumo mūšyje ir po sunkaus atsitraukimo buvo priverstos vėl įplaukti į laivą. Jis toliau gerai tarnavo Vendeje ir Italijos pusiasalyje nuo 1799 iki 1801 m. (laimėjo Pozzolo mūšį
)