1687 m. Partenonas buvo smarkiai sugadintas per didžiausią katastrofą per visą jo istoriją. Morejos karo (1684-1699) dalis
, venecianiečiai siuntė ekspediciją, kuriai vadovavo Francesco Morosini, užpulti Atėnus ir užimti Akropolį. Osmanų turkai tvirtino Akropolį ir Partenoną naudojo kaip šaudmenų saugyklą, nepaisant to, kad buvo iš anksto įspėti apie šio naudojimo pavojų 1656 m. Sprogimas, kuris smarkiai sugadino Propylejas, ir kaip vietos turkų bendruomenės narių prieglobstį.