Admirolas Halsey, įplaukęs į "Missouri", 1945 m. rugpjūčio 29 d. vadovavo Trečiajam laivynui į Tokijo įlanką. 1945 m. rugsėjo 2 d. Japonijos imperijos kapitulacijos dokumentai
"Missouri" pakrantėje buvo pasirašyta karo pabaiga. Trečiasis laivynas Japonijos vandenyse išliko iki 1945 m. rugsėjo pabaigos, kai jo laivai buvo nukreipti į JAV Vakarų pakrantę. 1945 m. spalio 7 d. Trečiasis laivynas buvo paskirtas rezervo laivynu ir išleistas iš veiklos.