1998 m. Pasaulio vandens sporto čempionate Perte, Vakarų Australijoje, Australija Wouda tapo pasaulio čempionu 200 m individualiame varžybose ir laimėjo du sidabro medalius 400 m individualiame varžybose ir 4 × 200 m laisvo stiliaus švaistoje kartu su Van den Hoogenband, Van der Zijden ir Zuijdweg. 1999 m. Balandžio mėn. 1999 m. FINA pasaulio plaukimo čempionate (25 m) Honkonge, Kinija Wouda laimėjo keturis medalius. Jis tapo pasaulio čempionu 4×200 m laisvosios stiliaus lenktynėse kartu su Pieteriu van den Hoogenbandu, Johanu Kenkhuisu ir Martijnu Zuijdvegu. Jis laimėjo sidabro medalius 400 m individualiame varžybose ir 4 × 100 m laisvuoju stiliumi kartu su Mark Veens, Johan Kenkhuis ir Pieter van den Hoogenband, 200 m individualiame varžybose jis laimėjo bronzinį medalį. 1999 m. vasarą Wouda dalyvavo 1999 m. Europos vandens sporto čempionate.
Stambule, Turkijoje. Jis sėkmingai gynė savo titulą 200 m individualiame varžybose ir laimėjo štafeto titulus 4 × 100 m laisvu stiliumi su Kenkhuisu, Veens ir van den Hoogenband, ir 4 × 100 m varžybose su Klaas-Erik Zwering, Stefan Aartsen ir van den Hoogenband. Jis taip pat laimėjo bronzinį medalį 400 metrų individualiniame varžybose.