Fernandez atstovauja Ispanijos vyresnio amžiaus nacionalinei komandai tarptautiniu mastu. Jis laimėjo du FIBA pasaulio taurės titulus, 2006 ir 2019 metais, du olimpinius sidabro medalius 2008 ir 2012 metais.
2016 m. vasaros olimpinėse žaidynėse laimėjo bronzinį medalį. Jis taip pat laimėjo tris EuroBasket vardų 2009, 2011 ir 2015 m., sidabro medalį 2007 m. ir bronzos medalį 2013 m. 2009 m. Fernandezas buvo išrinktas į Europos krepšinio komandą.