1944 m. gruodį, kai sujungtos filipiniečių ir amerikiečių pajėgos toliau žengė į priekį, norėdamos išlaisvinti Filipinus iš japonų pajėgų, Antrojo Filipinų Respublikos vyriausybė, kurioje buvo ir Aquino, buvo perkelta į Baguio. Vėliau ji buvo nugabenti į Japoniją, kur, kartu su kitais pareigūnais, jos nariai buvo suimti ir įkalinti Sugamo kalėjime, kai japonai pasidavė.
- Taip. 1946 m. rugpjūčio 25 d. A. Aquino buvo išvežtas lėktuvu atgal į Filipinus, kur buvo teisiamas dėl išdavystės kaltinimų. Po kelių savaičių jis buvo paleistas už užstatą.