1846 m. birželio mėn. Meksikos-Amerikos karo pradžioje Van Burenas buvo pakartotinai paskirtas į armiją kaip mokėtojas majoro laipsniu. Van Burenas tarnavo generolų Zachary Taylor ir Winfield Scott padėjėju ir dalyvavo Contreras mūšyje, Monterrey mūšyje, Veracruzo apgultyje.
, Cerro Gordo mūšis ir Churubusco mūšis.