Bet šitos Apšvietos reformos pasirodė kontraproduktyvios, arba galbūt per vėlyvos, kol kolonijų reikalavimai buvo nuslopinti. Visą šios Viceroyalty istoriją pažymėjo augantys vidaus neramumai ir politinis nestabilumas. 1780-1782 m. - Túpac Amaru II sukilimas
įkvėpė smurtinį Aymara vadovaujamą sukilimą viršutinėse Peru aukštumose, parodydamas didelį pasipiktinimą prieš kolonijines valdžios institucijas tiek mestizo, tiek vietinių gyventojų. Po dvidešimt penkerių metų čia gimę ispanų kilmės kriolai sėkmingai apsigynė nuo dviejų britų bandymų užkariauti Buenos Airą ir Montevideją. Tai sustiprino jų savarankiškumo ir galios jausmą tuo metu, kai ispanų kariai negalėjo padėti.