Klien 2006 m. pradėjo stipriai, pirmąsias 2 sezono lenktynes kvalifikuodamasis tarp dešimties geriausių. Bahreine
jis baigė 8-uoju, uždirbdamas tašką. Tačiau Malaizijoje jis susidūrė su Kimi Räikkönen pirmojo rato metu ir turėjo patekti į aikštelę dėl pakabos pažeidimo, o galiausiai išėjo dėl hidraulinio gedimo.