Dagestano karas prasidėjo 1999 m. rugpjūčio 7 d., per kurį Islamo tarptautinė brigada (IIPB) pradėjo nesėkmingai įsiveržimą į kaimyninę Rusijos Dagestano respubliką Dagestano šurės, siekiančios nepriklausomybės nuo Rusijos, naudai. Rugsėjį, serija bombų apartamentuose
kad buvo nužudyti apie 300 žmonių keliuose Rusijos miestuose, įskaitant Maskvą, buvo kaltinami Čečėnijos separatistai. Kai kurie žurnalistai nesutinka su oficialiu paaiškinimu, užuot kaltinę Rusijos slaptąsias tarnybas, kad jie susprogdino pastatus, kad pradėtų naują karinę kampaniją prieš Čečėniją. Atsakydamas į bombardavimus, ilga aviacijos kampanija, skirta atsakiniams smūgiams prieš Ichkerijos režimą ir sausumos puolimas, prasidėjęs 1999 m. spalio mėn., pažymėjo Antrojo Čečėnijos karo pradžią. Rusų ginkluotosios pajėgos, kur kas geriau organizuotos ir suplanuotos nei per pirmąjį Čečėnijos karą, užėmė daugumą regionų. 2000 m. vasario 5 d. Rusijos pajėgos naudojo žiaurią jėgą ir per valymo operaciją Aldyje, Čečėnijoje, nužudė 60 Čečėnijos civilių. Po Groznio perėmimo 2000 m. vasarį Iškerijos režimas žlugo.