Baigkite šį sakinį: Pilietinio karo pradžioje Haysas vėl įstojo į tarnybą kaip 63-ojo Pensilvanijos savanorių pėstininkų pulko pulkininkas, taip pat turėdamas kapitono laipsnį 16-oje JAV pėstininkų pulko reguliarioje armijoje iki 1861 m. Gegužės 14 d. Jo vyrai žinojo, kad jis yra "drąsus kaip liūtas". Peninsula kampanijos metu su savo pulku jis buvo priskirtas prie Heintzelmano III korpuso Kearny divizijos pirmos brigados. Jis kovojo Jorktauno mūšiuose, Vilyamsberge, Seven Pines,
Savage'o stotyje ir Malvern Hill. Pasibaigus Septynių dienų mūšiams, jis buvo paskirtas reguliariosios armijos leitenantu pulkininku už didybę veiksmuose, nes Haysas su savo pulku nukreipė baionetą į priešo linijas, kad padėtų savo brigadai atsitraukti. Po mėnesio Haysas trumpai išėjo į atostogų dėl ligos, nes buvo iš dalies aklas ir jo kairiosios rankos buvo paralyžiuota dėl žaizdų, patirtų mūšyje.