Įstojęs į Sąjungos armiją 1861 m. Gegužės mėn. Jis gavo pareigūnų įpareigojimą 9-ajame Niujorko savanorių pėstininkų pulke, populiariai žinome kaip "Hawkins' Zouaves", o vėliau IX armijos korpusas, kuriame jis tarnavo vadovaujant generoliui Benjamin Butler Big Bethel mūšyje ir
Hatteras įlankos ekspedicija. 1862 m. jis lydėjo Potomako armiją generolo Ambrose'o Burnside'o Roanoke ekspedicijoje ir dalyvavo Hatteras įlankos, Roanoke salos, Pietų kalno, Antietamo ir Fredericksburgo mūšiuose. Per kampaniją du kartus sužeistas, Džardinas buvo paaukštintas į majoro laipsnį už "drąsų elgesį" ir trumpai vadovavo 89-ajam Niujorko pėstininkų pulkui.