Bat Ayin buvo įkurta septynių šeimų, vadovaujamų rabino Yitzchak Ginsburg 1989 m., ant žemės, kurią iš pradžių pirko žydai prieš
1948 m. Jordanijos valdžioje iki 1967 m. buvo laikoma "priešo nuosavybe". Galiausiai apie 40 šeimų gavo didelių žemės sklypų. Įsigyvenimo gyventojai nebuvo kilę iš pagrindinio įsikūrimo. Daugelis iš pradžių čia įsikūrusių žmonių buvo užaugę "kalnuose". Jis įgijo reputaciją, kad yra ypač ekstremistinis ir labai nejautrus vietos palestiniečiams, iš kurių nė vienam nebuvo leista praeiti arčiau gyvenviečių. 2000 m. pradžioje vykusiuose visuotiniuose rinkimuose pusė Bat Ayin rinkėjų išreiškė pirmenybę Herut kandidatui Baruch Marzel. 1993 m. Motti Karpel ir Chaim Nativ įkūrė "Chai Vekayam" (Gyvas ir sveikas) judėjimą Bat Ayin, kurio dokumente "Identity Card" aiškiai nurodyta, kad Izraelio valstybės įstatymai nėra privalomi Vakarų Krante gyvenantiems gyventojams. Pasak vieno gyventojo, interviu, Izraelis yra tik žydams, kurie yra "išrinkta tauta", ir palestiniečiai privalo jiems tarnauti, pagal Torah žodžius: "Žmonės dirbs jums, tautos jums nusilenkia". Kalbama, kad gyvenvietė turi ekspansionizmo interesus, įkūrusi nelegalią prieplauką, vadinamą Vakarų-Vakarų Bat Ayin.