Nuo 1863 m. spalio iki 1865 m. birželio Brannanas buvo Kumberlando departamento artilerijos vadas, kur jis prižiūrėjo gynybą Čatanugoje. Jis dalyvavo misionierių kalvos mūšyje ir Atlantos kampanijoje, kur dalyvavo Resacos mūšyje, Dalaso mūšyje ir Kenneso kalno mūšyje. Jis taip pat dalyvavo Atlanta apgultyje ir kapitulacijoje.
- Taip. Jis buvo paskirtas brevetiniu generolu ir reguliariosios armijos, ir savanorių pajėgose už drąsią ir nuopelną Atlanta kampanijoje bei sukilimo metu.