Po Indijos subkontinento padalijimo 1953 m. buvo įkurta Pakistano mokslų akademija. Po Bangladešo išlaisvinimo
1973 m. 12 akademijos bendraklasčių iš Bangladešo (tuomet buvęs Rytų Pakistano) įkūrė Bangladešo mokslų akademiją. Muhammad Qudrat-i-Khuda buvo įkūrėjas ir prezidentas iki 1976 m.