Jis kovojo su tuo padaliniu Fort Henry, Fort Donelson, Corinth, Shiloh ir Hatcher's Run. 1862 m. rugpjūčio 1 d. jis serga tifojaus karščiavimu. Jis grįžo į Čikagą, kur kovojo Arkanzaso pašte, Port Gibsone
Čempiono kalnas, Didžioji Juodosios upės tiltas, Viksburgas ir Mansfildas. Mansfielde brigada buvo užgrobta, o Arnoldas tapo kaliniu. Keturiolika mėnesių jis buvo kalinamas Teksaso Fordo stovykloje.