1864 m. gegužės ir birželio mėn. Gen. Granto sausumos kampanijos metu Gibbonas vėl vadovavo 2 divizijai, dalyvavo mūšiuose Wilderness, Spotsylvania Court House ir Cold Harbor. 1864 m. birželio 7 d. jis buvo paaukštintas į savanorių generolo majoro rangą. Vėliau vykusioje Petersburgo apgulties kampanijoje (nuo 1864 m. birželio iki 1865 m. balandžio mėn.), Gibonas nusivylė, kai jo kariai atsisakė kovoti Reamo stotyje.
1864 m. rugpjūtį. Prieš išeidamas į ligos atostogą, jis trumpai vadovavo XVIII korpusui, tačiau jo tarnyba buvo pernelyg vertinga, todėl jis grįžo vadovauti naujai sukurtam XXIV korpusui Džeimso armijoje. 1865 m. balandžio mėn. jo kariai padėjo pasiekti lemiamą proveržį Trečioje Peterburgo mūšyje, užimdami Fort Greggą, kuris buvo Konfederacijos gynybos dalis. Appomattox kampanijos metu jis padėjo užblokuoti konfederatų pabėgimo kelią Appomattox teismo rūmų mūšyje, dėl to generolas Lee pasidavė. Jis buvo vienas iš trijų konfederatų kapitulacijos komisarų.