Jis dalyvavo kaip liudytojas 2003 m. ICTY Slobodano Miloševičiaus teismo procese. Po šio liudijimo jis davė interviu Zagrebo laikraščiui "Globus". Savo parodymuose jis pareiškė, kad Miloševičius akivaizdžiai stengėsi iš Jugoslavijos griuvėsių sukurti Didžiąją Serbiją. Jis taip pat atskleidė, kad Miloševičius ir Tuđmanas jam patvirtino, kad 1991 m. Kovo mėn. Karađorđevoje jie sudarė susitarimą dėl Bosnijos ir Hercegovinos padalijimo. Miloševičius atsakė kaltindamas Markovičius už Jugoslavijos armijos intervenciją Slovėnijoje. Marković atsisakė nurodyti intervenciją Slovėnijoje
, nurodydamas, kad tai buvo už jo įgaliojimų kaip Jugoslavijos premjero ribų.