1945 m. rugpjūčio 30 d. 8 val. 20 min. "I-400" kartu su "I-14" ir "Proteus" išplaukė į Tokijo įlanką, kur tą pačią dieną 14 val. 58 min. nusileido. 1945 m. rugpjūčio 31 d. 5 val. JAV vėliava buvo pakelta, o 14 val. 45 min. "I-400", "I-14" ir "Proteus" pradėjo judėti į naują ankaravimo vietą vandenilspręstyje povandeninių laivų bazėje Jokosukoje, kur "Proteus" buvo pritvirtintas iki 16 val. 50 min. Dvylika JAV karinio jūrų laivyno povandeninių laivų, išrinktų atstovauti JAV karinio jūrų laivyno povandeninių laivų pajėgoms
Japonijos kapitulacijos ceremonija Tokijo įlankoje taip pat vyko ten, o "I-401" taip pat atvyko rugpjūčio 31 dieną. 1945 m. rugsėjo 2 d. per kapitulacijos ceremoniją JAV Ramiojo vandenyno flotilės (COMSUBPAC) povandeninių laivų vadas, viceadmirolas Charlesas A. Lockwoodas, įsakė iškelti savo asmeninę vėliavą "I-400" ir "I-401".