Jo komandos klestėjimas tęsėsi ir 2009 m. antroje pusėje, kai "Barcelona" tapo pirmuoju klubu, pasiekusiu šešias kartus, per metus laimėjęs šešis aukščiausio lygio trofėjus. Po pergalių Supercopa de España ir UEFA Super Cup
Rugpjūčio mėnesį "Barcelona" laimėjo FIFA klubo pasaulio taurę prieš "Estudiantes de La Plata" gruodžio 19 dieną, o Messi laimėjo 2<unk>1 tikslą savo krūtimi. 22 metų amžiaus, Messi laimėjo "Auksinį kamuolį" ir FIFA pasaulio metų žaidėjo apdovanojimą, abiem atvejais didžiausiu balsavimo skirtumu kiekvieno trofėjaus istorijoje.