Kai "I-6" buvo Jokosukoje, Aleutų salų kampanija prasidėjo 1942 m. birželio 3-4 d. Japonijos oro antskrydžiu
1942 m. birželio 5 d. Aleutų salose Attu ir 1942 m. birželio 7 d. Kiska. 1942 m. birželio 10 d. "I-1", "I-2", "I-3", "I-4", "I-5", "I-6" ir "I-7" buvo perkelti į Šiaurės pajėgas, kad būtų paskirtos tarnauti Aleutų salose, o 1942 m. birželio 17 d. arba 20 d. "I-6" išvyko į Aleutų vandenis, kad pradėtų savo ketvirtą karo patruliją. Ji prisijungė prie "K" patruliuojančios linijos Unimako proga. 1942 m. liepos 7 d. jis gavo įsakymą persikelti į Kiskos sritį. Kai 1942 m. liepos 20 d. likusioms povandeninių laivų eskadrilėms buvo įsakyta grįžti į Japoniją, jai buvo įsakyta likti ir veikti iš Kiskos.