Tačiau kai graikai įsivėlė į pilietinius karus, sultonas paprašė pagalbos savo stipriausiam pavaldiniui, Egipto Muhammado Aliui. Dėl vidaus ginčų ir finansinių sunkumų, nes laivynas buvo nuolat pasirengęs, graikai nesugebėjo užkirsti kelio 1824 m. Kasos ir Psaros užėmimui ir sunaikinimui arba Egipto kariuomenės išsilaipinimui prie Modono. Nepaisant pergalės Samose ir Gerontose, revoliucijai gresia žlugimas, kol į Navarino mūšį įsikišo Didžiosios galios.
1827 metais. Ten Egipto ir Osmanų laivynas buvo ryžtingai nugalėtas Jungtinės Britanijos, Prancūzijos ir Rusijos imperijos laivynų, o tai veiksmingai užtikrino Graikijos nepriklausomybę.