Istorija pasakoja apie Garde pilotą Nagate Tanikaze nuotykius, kuris nuo gimimo gyveno Sidonijos požeminiame sluoksnyje ir buvo auginamas savo senelio. Niekada nesusitikinęs su kuo nors kitu, jis kiekvieną dieną treniruojasi sename "Guardian" pilotų simuliatoriuje, galiausiai jį įsisavinęs. Po senelio mirties jis pasirodo paviršiuje ir yra pasirinktas kaip "Guardian" pilotas, taip pat kai Sidonijai dar kartą gresia "Gauna".
Apsaugos pilotas