1878 m. Paryžiaus parodoje jis buvo Indijos skyriaus architektas ir Indijos vyriausybės komercinis agentas. 1880 m. Clarke'as surengė Indijos kolekcijas Pietų Kensingtone, o tai lėmė, kad jis tapo specialiuoju komisaru Indijoje, o 1883 m. tapo Indijos muziejaus Pietų Kensingtone saugotoju. Jis įsigijo Hamzanamos folijus, ankstyvų Mugolų iliustracijas apie Hamzos epinius nuotykius, sukurtas šiaurės Indijos ir Irano menininkų. Jis taip pat įsigijo šiuolaikinius amatus, architektūrinį medinį darbą ir brėžinius. 1892 m. Clarke'as buvo paskirtas meno kolekcijų saugotoju, 1893 m. pakeltas į direktoriaus pavaduotoją, o 1896 m. galiausiai tapo direktoriumi. Jis taip pat dirbo Karališkuoju komisaru 1900 m. Paryžiaus parodoje ir
Sent Luisas 1904 metais. 1905 m. jis atsistatydino iš Pietų Kensingtono muziejaus (kuris 1899 m. buvo pervadintas į Viktorijos ir Alberto muziejų).