Po Džungaro užkariavimo, Khangchenė liko Ngari ir pradėjo nutraukti ryšių linijas tarp Džungaro, dislokuotų Tibete, ir jų namų bazės Džungarijoje. 1719 m. jis sėkmingai užpuolė Džungaro kareivių būrį, kuris ketino atgabenti keletą Lhabzango chano buvusių pareigūnų į Džungariją. Kartu su kilminguoju Pholhané jis organizavo karinį pasipriešinimą Džungariams. Po beveik trejų metų nepopuliari Džungaro valdžia baigėsi 1720 m. ekspedicija
Jis buvo paleistas Qing Kangxi imperatoriaus. Regentas marionetas Tagtsepa buvo nubaustas, 7-asis Dalai Lama buvo atvežtas į Lhasą, o okupantai suformavo laikinąją vyriausybę. Dėl didžiulės jo tarnybos prieš džungarus, 1721 m. Kangxi įsakymu Khangchenné buvo paskirtas Tibeto kabineto arba Kashag vadovu. Taip jis išlaikė savo galios pagrindą Ngari. Senasis "desi" (regento) postas buvo panaikintas, nes vienoje rankoje buvo per daug valdžios. Vietoj to, Khangchenné gavo "Dai-ching Batur" ir kabineto pirmininko vardus. Jam buvo suteiktas Yardrokling turto jo asmeniniam palaikymui.