Kai Margarita, jos sūnus ir nuotaka (Anna) buvo pasirengę sekti Varikvikui atgal į Angliją, stalai vėl pasuko į jorkistų pusę, o grafas buvo nugalėtas ir nužudytas grįžtančio karaliaus Edvardo IV Barneto mūšyje
1471 m. balandžio 14 d. 1471 m. gegužės 4 d. Margarita buvo priversta vadovauti savo kariuomenei Tewkesbury mūšyje, kuriame Lancasterų pajėgos buvo nugalėtos, o jos septyniolikmetis sūnus Edvardas iš Vestminsterio buvo nužudytas. Edvardo mirties aplinkybės niekada nebuvo aiškios; nežinoma, ar jis buvo nužudytas per faktinius mūšius, ar po mūšio jį nužudė Klarenso kunigaikštis. Per pastaruosius dešimt metų Margarita tapo agresyvi ir negailestinga, bet po pralaimėjimo Tewkesbury ir vienintelio sūnaus mirties ji buvo visiškai prislėgta. Po to, kai mūšio pabaigoje ją pagrobė Viljamas Stanlis, karaliaus Edvardo įsakymu Margarita buvo įkalinta. Pirmiausia ji buvo nuvežta į Wallingfordo pilį, o po to buvo perkelta į saugesnį Londono bokštą. Henrikas VI taip pat buvo įkalintas Towaryje po Tewkesbury, ir jis ten mirė gegužės 21-osios naktį; jo mirties priežastis nežinoma, nors buvo įtariama, kad jis nužudė karalių. 1472 m. ji buvo perduota savo buvusiam palaimintojui Alice Chaucer, Suffolko kunigaikštienės, kur ji išliko iki 1475 m., kai ją išpirko Liudvikas XI.