Nakajima dalyvavo 80 Formulės 1 Grand Prix, debiutavo Brazilijos Grand Prix
1987 m. Balandžio 12 d. Lotus komanda įsigijo "Honda" variklius. Jis debiutavo lenktynėse būdamas 34 metų, todėl yra vienas seniausių šiuolaikinio amžiaus "Formulės 1" debiutuotojų. 1987 m. San Marino Grand Prix lenktynėse jis baigė šeštasis ir taip užsitarnavo tašką. Per savo debiutinį sezoną Nakajimą viršijo jo komandos draugas Ayrtonas Senna, ir daugelis abejojo Nakajimos vieta F1, teigdami, kad jei ne "Honda", jis nebūtų ten dėl nuopelnų.