2011-2012 m. sezone "Napoli" baigė penktą vietą Serie A
, bet Stadio Olimpico stadione nugalėjo nepralaimėjusius čempionus "Juventus", ketvirta kartą per klubo istoriją laimėdamas Italijos taurę, praėjus 25 metams po paskutinio taurės laimėjimo. 2011-2012 m. UEFA Čempionų lygos grupėje komanda užėmė antrą vietą ir pateko į aštuntojo etapo varžybas, kur buvo eliminuota galutinės nugalėtojų "Chelsea". 2012-2013 m. "Napoli" užėmė antrą vietą Serie A, tai buvo geriausias klubo pasirodymas nuo 1989-1990 m. "Scudetto" laimėjimo. Edinson Cavani baigė savo karjerą kaip geriausias varžovas divizijoje su 29 taškais, dėl to jis buvo parduotas "Paris Saint-Germain" už klubo rekordinę 64 mln. eurų sumą.