Žmonų šachmatų olimpiadoje Aginian septynis kartus (1996, 1998, 2000, 2004, 2006, 2008 ir 2010) atstovavo Armėnijai 33-oje Šachmatų olimpiadoje, 34-oje Šachmatų olimpiadoje
, 36-oji Šachmatų olimpiada, 37-oji Šachmatų olimpiada, 38-oji Šachmatų olimpiada ir 39-oji Šachmatų olimpiada.