FIA nuo 1966 m. įsigaliojo naujos 3 litrų variklių taisyklės. Lotusas buvo mažiau konkurencingas. Pradėjęs nuo 2 litrų Coventry-Climax variklio Lotus 33 Clarkas taškų nesulaukė iki Didžiosios Britanijos Grand Prix
ir trečiąją vietą sekančiame Olandijos GP. Nuo Italijos Grand Prix Lotus naudojo labai sudėtingą BRM H16 variklį "Lotus 43" automobilyje, su kuriuo Clark laimėjo JAV Grand Prix. Jis taip pat užėmė antrą vietą Indianapolis 500, šį kartą už Grahamo Hilo.