Pasibaigk šią frazę: 1861 m. Birželio pabaigoje Hotchkissas pasirašė sutartį kaip konfederatų vagonas, kuris veždavo atsargas Churchville kavalerijai Rich Mountain, Vakarų Virdžinijoje. Hotchkissas pasiūlė savo paslaugas kaip žemėlapių kūrėjo brigados generoliui Richardui B. Garnettui, kurio konfederatų brigada veikė Vakarų Virdžinijoje. Hotchkiss tarnavo Rich Mountain ir sukūrė žemėlapius generolas Robertas E. Lee planuojamai kampanijai kalnuose. 1862 m. kovo mėn. jis grįžo į tarnybą kaip Valley rajono vyriausiasis topografinis inžinierius. Po pirmojo pralaimėjimo Kernstown mūšyje,
1862 m. kovo 26 d. Džeksonas pasikvietė Hotčkisą į savo būstinę prie Narrow Passage netoli Vudstoko ir liepė jam "pasidaryti man slėnio žemėlapį nuo Harper's Ferry iki Leksingtono, kuriame būtų parodyti visi puolimų ir gynybos taškai [sic] tose vietose". Hotchkisso rekomendacija buvo, kad Džeksono linija prie Stouni Kriko Vudstoke yra neapsaugota ir kad Džeksonas turėtų pasitraukti į Rude's Hilą, apsaugomą mažą žemyno viršūnę į pietus nuo Mt. Džeksonas. Rude's Hill'e Džeksonas reorganizavo savo komandą likusioms sėkmingoms 1862 m. kampanijoms Šenandoah slėnyje.