1861 m. Balandžio mėn. Prasidėjus Pilietiniam karui, jis buvo paskirtas Atlanto blokados eskadrono vėliavos pareigūnu. Rugpjūčio mėnesį jis buvo pasiųstas su generolo Benjamino F. Butlerio vadovaujamais kariais užimti du pakrantės fortus netoli Hatteraso kyšulio. Toliau vykusiame mūšyje
, įtvirtinimai buvo užimti be nuostolių, nors ir ne be kai kurių sunkumų dėl oro sąlygų, o laivynas grįžo į Fort Monroe. Tačiau tai netrukus leido kritikuoti Stringhamą už tai, kad jo laivai nebuvo priartėję prie jūros ir toliau atakavo pakrantėje. Faktas, kad jo laivai ištraukė per daug vandens, kad patektų į seklius pakrantės vandenis, ir kad jam buvo tiesiogiai įsakyta nedelsiant grįžti, galiausiai pasirodė, tačiau, matyt, per vėlu, kad būtų galima nuraminti jo dirginimą, nes kitą mėnesį, jo paties prašymu, jis buvo atleistas iš savo komandos. 1862 m. rugpjūčio 1 d. kaip nedidelę kompensaciją jis buvo paaukštintas į kontradmiralio laipsnį.