Kai komunistų sukilimas baigėsi, Malaizijos proklamacija suvienijo Malaizijos federaciją su Sarawaku ir Sabah, kad suformuotų nepriklausomą Malaizijos šalį. Dar vienas komunistų sukilimas atnešė sąlygas
prieš naujai nepriklausomą Malaizijos valstybę, MCP nuslopino savo pačių gretose esančius disidentus, sukeldama daugelio frakcijų susiskaldymą, kurios pradėjo kovoti tarpusavyje. Tai baigėsi galutiniu Malaizijos komunistų partijos išardymu 1989 m., kai krašto radikalios kairiosios sparnai pradėjo ieškoti alternatyvų marksizmui-leninizmui.