1783 m. žemės drebėjimas sunaikino didžiąją miesto dalį, o atstatyti ir atgaivinti Messinos kultūrinį gyvenimą užtruko dešimtmečius. 1847 m. tai buvo vienas pirmųjų Italijos miestų, kur kilo Risorgimento riaušės. 1848 m. jis atvirai maištavo prieš valdžią turintį burbonų valdžią, bet vėl buvo smarkiai nuslopintas. Tik 1860 m., po Milaco mūšio, Garibaldino kariuomenė užėmė miestą. Vienas pagrindinių Italijos suvienijimo veikėjų, Giuseppe Mazzini, 1866 m. visuotiniuose rinkimuose buvo išrinktas deputatu iš Messinos. 1894 m. lapkričio 16 d. miestą pakenkė dar vienas silpnesnis žemės drebėjimas. Miestas buvo beveik visiškai sunaikintas žemės drebėjimu
1908 m. gruodžio 28 d. ryte įvyko cunamis, nusinešęs apie 100 000 žmonių gyvybių ir sunaikinęs didžiąją dalį senovės architektūros. Kitąmet miestas buvo iš esmės atstatytas.