Prolinas ir glicinas kartais vadinami "spiralės laužytojais", nes jie sutrikdo α spiralinio stuburo konformacijos reguliarumą; tačiau abu turi neįprastus konformacinius gebėjimus ir paprastai randami pakaitomis. Amino rūgštys, kurios pirmenybę teikia spiralinėms konformacijoms baltymuose, yra metioninas, alaninas, leucinas, glutamatas ir lizinas ("MALEK" amino rūgščių 1 raidės kodais); tuo tarpu dideli aromatiniai likučiai (triptofanas, tirozinas ir fenilalaninas) ir Cβ-šakos amino rūgštys (isoleucinas, valonstrinas ir trejonas) pirmenybę teikia β- ir β-konformacijoms. Tačiau šie pirmenybės nėra pakankamai stiprūs, kad būtų galima patikimai numatyti antrinės struktūros sekos metodą naudojant šį metodą.
antrinė struktūra