Matsui asmeniškai paaukojo 500 000 dolerių labdaros organizacijai, padedančiai nukentėjusiems nuo 2004 m. Indijos vandenyno žemės drebėjimo. Jis taip pat paaukojo 620 000 JAV dolerių pagalbos pastangoms aukoms po 2011 m. žemės drebėjimo ir cunamio
Japonijos Tohoku regione. 2015 m. kovo 21 d. Matsui ir jo buvęs komandos draugas Derek Jeter surengė beisbolo labdaros renginį, skirtą padėti vaikams, nukentėjusiems nuo 2011 m. žemės drebėjimo ir cunamio, Tokijo kupolyje. Į renginį buvo įtraukta beisbolo klinika ir "home run" derbis tarp Matsui ir Jeter.