1944 m. gegužę Asakura buvo paaukštintas į kontradmiralą, o "Musashi" gegužės 10 d. išvyko iš Kure į Okinavą, o gegužės 12 d. - į Tawi-Tawi. Kartu su savo seserimi ji buvo priskirta prie 1-ojo mobiliojo flotilės, kuriai vadovavo viceadmirolas Jisaburo Ozawa. Birželio 10 d. kariniai laivai išplaukė iš Tawi-Tawi į Batjaną, vadovaujant viceadmiroliui Matome Ugaki, ruošiantis Kon operacijai, planuojamam priešpuoliui prieš Amerikos laivyną.
invazija į Biak. Po dviejų dienų, kai Ugaki sužinojo, kad amerikiečiai atakavo Saipaną, jo pajėgos buvo nukreiptos į Marianos salas. Birželio 16 d. jie susitiko su Ozavos pagrindinėmis pajėgomis ir buvo priskirti viceadmirolio Takeo Kuritos 2 flotei. Pilipinų jūros mūšyje "Musashi" nebuvo užpultas. Po pražūtingo Japonijos pralaimėjimo mūšyje (taip pat žinomas kaip "Didžioji Marianos Turkijos šaudymas"), Antrasis laivynas grįžo į Japoniją. Liepos 8 d. "Musashi" ir jos sesuo pakėlė į laivą 3 522 karius ir įrangą iš 49-osios pėstininkų divizijos 106-ojo pėstininkų pulko ir išplaukė į Lingga salą, kur jie atvyko liepos 17 d.