Iš "Daedalo" Kelis tapo pirmuoju leitenantu 64 ginklų 1810 m. Kovo mėn. "Polyphemus" buvo viceadmirolio Bartholomew Rowley, kuris mirė savo pareigų metu, vadas. Kelly buvo išsiųsta namo su pranešimais. Jis vadovavo 18-gun sloop per invaziją į Javą
1811 m. rugpjūčio ir rugsėjo mėn. Jis buvo paaukštintas į komandorių 1811 m. lapkričio 28 d. Po to jis praleido pusiau apmokamą laikotarpį be aktyvaus darbo, nepaisant to, kad 1812 m. karo metu ir lord Exmouth ekspedicijos į Alžyrą metu kreipėsi į Admiraliaciją dėl paskyrimo.