1940 m., per Antrąjį pasaulinį karą, Rumunija sutiko ultimatumi
ir atidavė Moldovą Sovietų Sąjungai, kuri ją suorganizavo į Moldovos SSR. 1941 m. viduryje Rumunija prisijungė prie Hitlerio Ašies, įsiveržusi į Sovietų Sąjungą, susigrąžindama Besarabiją ir šiaurinę Bukoviną, taip pat okupavusi teritoriją į rytus nuo Dnjestro, kurią pavadino "Transnistrija". Antrojo pasaulinio karo pabaigoje Sovietų Sąjunga atgavo visas prarastas teritorijas ir atkūrė sovietų valdžią. Sovietų Sąjunga tvirtai propagavo moldavių etninę tapatybę, priešingai nei kitos nuomonės, kurios visus rumunų kalbą kalbančius žmones laikė vienos etninės grupės dalimi, pasinaudodama nepilna Besarabijos integracija į tarpukario Rumuniją.