1944 m. Stojčovas tapo Tėvynės fronto Biuro Nacionalinio komiteto nariu. Per Antrąjį pasaulinį karą Stojčevas vadovavo Bulgarijos pirmai armijai po to, kai šalis perėjo į sąjungininkų pusę. Stojčevo vadovaujant, Bulgarijos pirmoji armija padėjo Raudonosios armijos ir Jugoslavijos partizanams ištraukti nacistus iš didžiosios Jugoslavijos ir Vengrijos dalies, iki 1945 m. gegužės pasiekė Austrijos Alpes. 1945 m. gegužės 8 d. Vladimiras Stojčevas pasirašė demarkacijos susitarimą su britų V korpuso vadu Čarlzu Keitliu Austrijos pietuose. 1945 m. birželio 24 d.
Maskvos pergalės paradas.