1919-1923 m. Wegeneris dirbo pionieriškai, rekonstruodamas praeities laikų klimatą (dabar žinomas kaip "paleoklimatologija"), glaudžiai bendradarbiaudamas su Milutin Milankovičiumi, 1924 m. išleido Die Klimate der geologischen Vorzeit (<unk>Geologinės praeities klimatas) kartu su savo uošviu Vladimiru Köppenu. 1922 m. Trečiame, visiškai persvarstytoje "Kontinentų ir vandenynų kilmės" leidinyje pasirodė diskusija apie jo teoriją apie dryftą, pirmiausia vokiečių kalba ir vėliau tarptautiniu mastu.
jo žmona ir jų dvi dukterys