1943 m. rugpjūčio mėn. Hooveris buvo paskirtas sausumos oro pajėgų vadu, Centrinėje Ramiojo vandenyno dalyje, ir tą pareigas ėjo iki to paties metų gruodžio, kai jo komanda buvo iš naujo paskirta pirmiausia į oro pajėgų vadu, Centrinėje Ramiojo vandenyno dalyje, o vėliau - į Centrinės Ramiojo vandenyno priekinių pajėgų vadu. Šiomis pareigomis jis tarnavo laivyno admirolo Chestero Nimitzo vadovaujant Taravos, Kvajleino ir
"Eniwetok" Gilberto ir Marshalo salose ir Saipan, "Guam" Marianos ir Palau salose. Hooveris organizavo savo komandos sritį, kad būtų galima efektyviai remti būsimas laivyno operacijas, ir vadovavo savo galingai sausumos smūgių grupei giliai į priešišką teritoriją, bombarduodamas ir šaudydamas priešo galybę drąsiomis puolamosiomis operacijomis, kurios materiškai sumažino amfibijų atakos pajėgų tikslus, besiplečiančius jo paieškos ir žvalgybos lėktuvų. Jis gavo antrą karinio jūrų laivyno išskirtinės tarnybos medalį už savo tarnybą šiose kampanijose.