1943 m. gruodžio 1 d. "Tsugaru" buvo perkeltas į Trečiąjį Pietų ekspedicijų laivyną. 1944 m. kovo 24 d. laivas iš Palau pradėjo kasti Balabaco sąsiauryje Filipinuose, po to buvo dislokuotas Balikpapane Borneo saloje. Viena iš minų iš šios misijos yra įvertinta, kad nuskendo 1944 m. Liepos mėn. Gegužės 31 d. "Tsugaru" buvo priskirtas operacijai "KON".
(Biaco reljefas), pervežant pastiprinimą iš Zamboangos į Mindanao, siekdamas užkirsti kelią amerikiečių iškrovimui. Birželio 21 d., išvykęs iš Sorongo, Naujosios Gvinėjos, į Halmaheros salą, "Tsugaru" buvo torpeduotas Nyderlandų karališkųjų jūrų pajėgų povandeninio laivo "K-XIV", kuris padarė didelę žalą. Po laikino remonto jis bandė pasiekti Manilą, bet birželio 29 d. netoli Biako buvo pastebėtas laivas, kuris paleido šešis torpedus. Dviejų "Tsugaru", kuris nuskendo po mažiau nei 25 minučių, prarado daugumą savo įgulos narių, įskaitant jo komandą, kapitoną Nakatsu.