Užbaigi šį sakinį: 1468 m. vasarą mirė princas ir jo vietą kaip pretendento į sostą užėmė jo sesuo Izabelė. Carrillo buvo jos pagrindinis patarėjas ir kartu su Pedro de Peralta (Pedro de Peralta y Ezpeleta) jis vaidino svarbų vaidmenį organizuojant jos santuoką su Aragono karaliumi Ferdinandu II 1469 m. spalio mėn. Tačiau kai po Henrikas IV mirties 1474 metų gruodį į valdžią atėjo katalikų karaliai, jie iškart susidūrė su Karilu. Carrillo nepriėmė jų autoritarinio elgesio su juo, taip pat jo priešo kardinolo Pedro González de Mendozos kilimo į karalystės kanclerį. Tai paskatino jį susidurti su Mendoza šeima, mūšyje jis pralaimėjo
Vėliau vyko Kastilijos paveldėjimo karas (1475-1479). Visiškai pakeisdamas savo politiką, Karilo prisijungė prie Portugalijos karaliaus vadovaujamos stovyklos, kuri palaikė jo dukterėčios, princesės Joanos la Beltranejos, pretenzijas į Kastilijos sostą prieš Izabelos I pretenzijas.