Kai Izraelio pajėgos, remiamos britų ir prancūzų naikintuvų, išvarė
Egipto kariuomenei Sinajaus pusiasalyje ir Sueco kanale, kuriuos 1956 m. nacionalizavo Nasseris, Egipto ginkluotųjų pajėgų vadas Abdel Hakim Ameras panikavo ir pasiūlė pasiduoti. Nasseris atsisakė ir paskyrė Boghdadį vadovauti egiptiečių pasipriešinimo organizavimui prie kanalo. Po Sueco karo jis buvo paskirtas generaliniu kanalo rekonstrukcijos administratoriumi. Jis taip pat buvo paskirtas komunikacijų ministru ir kartu su Zakaria Mohieddine ir Amer, buvo įtrauktas į komitetą, kuris atranko naujai įsteigtos 350 narių Nacionalinės Asamblėjos kandidatus. Boghdadi buvo išrinktas Pirmojo nacionalinio susirinkimo pirmininku.