Du Bois 1885-1888 m. lankė Fiskų universitetą, istoriniu požiūriu juodų tautų koledžą Našvilyje, Tenesio valstijoje. Jo kelionė į Pietų Ameriką ir jo rezidencija buvo pirmoji Du Bois patirtis su pietų rasizmu, kuris tuo metu apėmė Džimo Krovo įstatymus, fanatizmą, juodųjų balsavimo slopinimą ir linčus; pastarasis pasiekė aukščiausią lygį per ateinančius dešimtmetį. Gavęs bakalauro laipsnį iš Fiskų, jis 1888-1890 m. lankė Harvardo koledžą (kuris nepriėmė kursų kreditų iš Fiskų), kur jis buvo stipriai paveiktas jo profesoriaus Williamo Džeimso, žinomų Amerikos filosofijoje. Du Bois tris metus lankė Harvardo universitetą su pinigais iš Našvilyje, Tenesio valstijoje.
Gustavas von Šmolleris, Adolfas Vagneris ir Heinrichas von Treitske