Pisa, tuo metu stovėjusi prie Arno upės ištakų, pasiekė savo šlovės viršūnę tarp XII ir XIII amžių, kai jos laivai valdė Vakarų Viduržemio jūrą. XII amžiuje Pisa ir Genova susipriešino, o tai baigėsi Melorijos mūšiu (1284 m.)
1299 m. Pisa atsisakė visų pretenzijų į Korsiką ir dalį Sardinijos atidavė Genui. Be to, Aragono užkariavimas Sardinijoje, prasidėjęs 1324 m., atėmė iš toskanų miesto galią valdyti Kaljario ir Galuros "judikatus". Pisa išlaikė savo nepriklausomybę ir Toskanos pakrantės kontrolę iki 1409 m., kai ją aneksavo Florencija.