Jefferson'as nenorėjo įsitraukti į bet kokį tarptautinį konfliktą, bet jis tikėjo, kad jėga geriausiai atgrasytų barbarų valstybes nuo tolesnio tributo reikalavimo. Jis įsakė JAV kariniam jūrų laivynui įstoti į Viduržemio jūrą, kad apsigintų nuo barbarų piratų, pradėdamas Pirmąjį barbarų karą.
- Taip. Pirminės administracijos pastangos iš esmės buvo neveiksmingos, o 1803 m. Tripolio pajėgos užėmė fregatą. 1804 m. vasarį leitenantas Stephenas Decaturis sėkmingai puolė Tripolio uostą ir sudegino "Philadelphia", pavertį Decaturą nacionaliniu heroju. Džefersonas ir jaunas Amerikos karinis jūrų laivynas privertė Tunisą ir Alžyrą nutraukti sąjungą su Tripoliu, o tai galiausiai išvedė jį iš karo. Jeffersonas taip pat įsakė penkias atskiras jūrų bombardavimus Tripolijui, kurie tam tikrą laiką atkurė ramybę Viduržemio jūroje, nors Jeffersonas ir toliau mokėjo likusias Barbary valstybes iki savo prezidentūros pabaigos.