Kai 1937 m. Japonija įsiveržė į Kiniją, Lee, kuris buvo žinomas dėl savo ryšių su Kinijos Kuomintango partija, vadovavo Selangoro Kinijos pagalbos fondui, palaikydamas Kiniją. Vėliau 1941 m. jis buvo paskirtas Kvala Lumpuro pasyviosios gynybos pajėgų vadu. Dėl jo antijaponiškų karinių pastangų, kai karas pasiekė Malaiziją, Lee buvo priverstas pabėgti su šeima į Mumbajų per Čongčingą.
Tais pačiais metais japonai už jį paskelbė premiją.