Cabrera pradėjo 2013 m. kaip "Padres" trumpalaikis žaidėjas ir pradėjo 69 iš eilės žaidimus, kol birželio viduryje dėl kaulų žaizdos pateko į 15 dienų neįgaliųjų sąrašą. Gegužės 14 d. Cabrera surinko 60 000-ąjį "Padres" istorijoje. Jis buvo išrinktas į All-Star komandą
kaip rezervas, turintis.291 įmušimo vidurkį,.373 bazės procentą, ir 34 pavogtas bazes pertraukoje.