2013-2014 m. sezono metu jis dalyvavo 2013 m. DFL-Supercup varžybose su "Borussia Dortmund",
UEFA Super taurė prieš "Chelsea" ir dvi rungtynės FIFA klubo pasaulio čempionate; pirmoji prieš "Guangzhou Evergrande" ir antroji prieš "Raja Casablanca". 2013 m. gruodžio 2 d. Alaba pasirašė naują sutartį su "Bayern Munich", kuri baigtųsi 2018 m. Gruodžio 20 d. Alaba trejus metus iš eilės buvo pripažintas metų Austrijos futbolo žaidėju. 2014 m. sausio mėn. Alaba pirmą kartą buvo įvardintas į UEFA 2013 metų komandą.