2018 m. birželio 26 d. Naingolanas pasirašė sutartį su "Inter Milan" už 38 mln. eurų (daugiau 24 mln. eurų plus Davide Santon ir Nicolò Zaniolo, vertinamas 14 mln. eurų) iki 2022 m. birželio mėn. Jis užmušė savo debiutą lygoje rugsėjo 1 d., padėdamas svečiams nugalėti "Bologna" 3<unk>0.2018 m. spalio 3 d. Naingolanas užmušė vienodo rezultato rezultatą per 2-0 pergalę prieš "PSV Eindhoven" Čempionų lygos grupės etape ir tapo pirmuoju Belgijos žaidėju, kuris pasiekė šį pasiekimą "Inter Milan" varžybose.
2018 m. birželio 26 d.