2018 m. gegužės 24 d. Rodri grįžo į "Atlético" po to, kai klubas pasiekė susitarimą su "Villarreal" dėl jo perdavimo. Jis pasirašė penkerių metų sutartį su Madrido klubu už 20 milijonų eurų ir 5 milijonus kintamųjų. Jis debiutavo rugpjūčio 15 d.
2018 m. UEFA Superkarto varžybose Taline, žaidžiant pirmąsias 71 minutę pertraukos metu pergalės prieš miesto varžovus "Real Madrid".