2012 m. balandžio 19 d., padėdamas "Olympiacos" atnaujinti savo lygos viršenybę, Valverde paskelbė apie savo sprendimą išvykti dėl šeimos priežasčių. Gruodžio 3 d. jis grįžo į Ispanijos futbolą, tapdamas "Valencia" klube iki sezono pabaigos, pakeisdamas atleistą Mauricio Pellegrino; jo pirmoji rungtynė įvyko po penkių dienų, 1-0 pergalė "Osasuna", o antroji rungtynė prieš tą patį varžovą Ispanijos taurės varžybose.
, atnešė dar vieną triumfą Reyno de Navarra (2<unk>0).