Jis gimė 1876 m. Jinnahbhai Poonja ir jo žmona Mithibai, nuomojamame bute antrajame Wazir Mansion aukštyje netoli Karači, dabar Sindh, Pakistano, bet tada Bombay Prezidijos Britanijos Indijos. Jinnah šeima buvo iš Gujarati Ismaili fone, nors Jinnah vėliau sekė dvylikos Shi'a mokymus. Po jo mirties, jo giminaičiai ir kiti liudytojai teigė, kad jis konvertavo vėliau gyvenime į Sunni sektos. Jo religija mirties metu buvo ginčyta teismo bylose. Jinnah buvo iš turtingų prekybininkų fonas, jo tėvas buvo prekybininkas ir gimė krikščionių tekstilės gamintojų šeimoje, įsikūrusiame su Karači princų Fatli Pane, dabar Sindh, Pakistano, bet tada Bombay.
trys