Parašykite šio skyriaus tęsinį - Rusų-japonų karo (1904-1905) pradžioje Zarubajevas buvo paskirtas Ketvirtojo Sibiro armijos korpuso, kurį sudarė Antroji ir Trečioji Sibiro rezervo brigados, vadu. Jis sėkmingai atremė japonų generolio Yasukatos Oku išpuolius per Tašičiao mūšį, tačiau generolas Aleksejus Kuropatkinas liepė jam atsitraukti, o ne tęsti jo sėkmę. Taip pat Liaojango mūšyje jis sėkmingai išlaikė savo pozicijas prieš pakartotinius japonų puolimus, tačiau Kuropatkinas vėl atsisakė jo sustiprinti ir liepė atsitraukti. Šaho mūšyje
, jo pajėgos buvo iš esmės laikomos rezerve ir buvo naudojamos sustiprinti liniją, apimančią Kuropatkino atsitraukimą. Mukdeno mūšyje Zarubajevo pajėgos savo pozicijas laikė dešimt dienų nuo vasario 12 iki 22 dienos. Nuo vasario 23 d. Zarubajevas vadovavo Jungtinei Sibiro armijos korpusui ir Pirmam Sibiro armijos korpusui. Tačiau šios jungtinės pajėgos buvo atšauktos vasario 25 d., o po to, kai Kuropatkiną pakeitė generolas Nikolai Linevičius, Zarubajevas buvo laikinai paskirtas Rusijos pirmosios Mandžiūrijos armijos vadu.