Įprasti eksperimentiniai metodai apima rentgeno spindulių kristalografiją ir NMR spektroskopiją, iš kurių abu galima gauti struktūrinę informaciją atominėje skiriamumoje. Tačiau NMR eksperimentai gali pateikti informaciją, iš kurios galima apskaičiuoti atstumus tarp atomų porų ir galutinį galimą baltymo konformaciją, sprendžiant atstumo geometrijos problemą. Dvigubo polarizacijos interferografija yra kiekybinis metodas, skirtas analizuoti bendrą baltymo konformaciją ir viruso konformaciją, ir kaip tai gali būti paveikta, t. y. vaistų projektavimo metu. Kadangi baltymų yra per maži, kad juos būtų galima matyti šviesos mikroskopu, reikia naudoti kitus metodus, kad būtų galima nustatyti jų struktūrą.
elektroninė kristalografija