Lisle praleido ateinančius trejus metus Oksforde įsikūrusioje rojalistų armijoje, iš pradžių būdamas pulkininko leitenantu, vadovaujant Artūrui Astonui. Jis dalyvavo 1642 m. spalio mėn. Edgehilo mūšyje ir įgijo drąsos ir patikimumo reputaciją. 1643 m. kovojo Chalgrove, buvo sužeistas per Pirmąją Niuberio mūšį
Rugsėjį, o netrukus buvo paaukštintas į pulkininką. Jis vadovavo pėstininkų pulkui Cheritone 1644 m. Kovo mėn. Ir kampanijos metu vakaruose vadovavo brigadai arba tercio Cropredy Bridge, Lostwithiel ir Second Newbury.