1860-ųjų pabaigoje politinės aplinkybės pasikeitė. 1865 m., po nesėkmingo sukilimo
prieš Rusiją lenkų, buvo panaikintas autonominis Lenkijos Kongresas. Po nesutarimų su Rusijos valdžia unijiečių vyskupas Michailas Kuzemskis išleido atsistatydinimo laišką ir paliko Čelmą. Jo atsistatydinimą Vatikanas nepriėmė, o Rusijos valdžios institucijos paskyrė Galicijos kunigą rusofilą Markellą Popelį Eparchijos administratoriumi, nepaisant to, kad Popelis gyveno atvirame konkubinaže.