1864 m. liepos 20 d. "Susquehanna" buvo paskirta Šiaurės Atlanto blokados eskadrijai ir dalyvavo 1864 m. Kalėdų išvakarėse nesėkminguose išpuoliuose prieš Fort Fisher, Šiaurės Karolinoje. Tačiau, vasario viduryje 1865, dviguba pabaiga buvo galinga jėga, kuri galiausiai
užėmė tą konfederatų tvirtovę ir uždarė Wilmingtoną, Šiaurės Karoliną, paskutinį konfederatų JAV didelį uostą. Tuo metu laivas vadovavo kontradmirolui Sylvanus William Godon. Vienas iš jos įgulos narių, Landmenas Henry S. Webster, buvo apdovanotas Garbės medaliu už savo veiksmus Antrajame Fort Fišerio mūšyje.