Padukone gimė 1955 m. birželio 10 d. Padukone kaime, netoli Kundapura, Udupi. Jo pavardė, Padukone, yra kaimo Padukone pavadinimas, iš kurio kilusi jo šeima. Padukone vedė Ujjala, jų tėvai surengė rungtynes pagal Indijos hinduistų sistemą. Jie turi dvi dukteris - Deepika Padukone, Bollywood aktorę ir Anisha Padukone, golfo žaidėją. Padukone, jo žmona ir jaunesnė dukra Anisha gyvena Bangalore, o Deepika gyvena ir dirba Mumbajuje.
Anisha Padukone