Iš "Daedalo" Kelis 1810 m. kovo mėn. tapo pirmuoju leitenantu 64 kanonuose. "Polyphemus" buvo viceadmirolio Bartholomew Rowley, kuris mirė savo pareigų metu, vadas. Kelly buvo išsiųsta namo su pranešimais. Jis buvo 18-gun sloop kapitonas per
1811 m. rugpjūčio-rugsėjo mėn. įsiveržė į Javą ir 1811 m. lapkričio 28 d. buvo paaukštintas į komandantą. Po to jis praleido pusiau apmokamą laikotarpį be aktyvaus darbo, nepaisant to, kad 1812 m. karo metu ir lord Exmouth ekspedicijos į Alžyrą metu kreipėsi į Admiraliaciją dėl paskyrimo.