2016 m. Sausio 13 d. Spalletti buvo paskirtas "Roma" treneriu, kai buvęs treneris Rudi Garcia buvo atleistas dėl prastos komandos veiklos. Vasario 21 d. Francesco Totti viešai kritikavo Spalletti dėl jo paties žaidimo laiko trūkumo po to, kai grįžo iš traumos. Dėl to Totti buvo išmestas Spalletti, kai Roma laimėjo Palermo 5:0, ir šis sprendimas sukėlė triukšmą tarp gerbėjų ir žiniasklaidos. Po pradinių nesutarimų, Spalletti pradėjo naudoti Totti kaip tiesioginį pakaitalą, kuris pasirodė esąs veiksmingas sprendimas, nes Totti iš naujo atrado savo formą ir prisidėjo keturiais golais ir asistu, po to, kai išėjo iš banko penkių iš eilės Serie A
Žaidimai. Dėl to Spalletti sugebėjo nuvesti "Roma" iš vidurio lentelės vietos į antrą vietą Serie A, užsitikrinęs Čempionų lygos play-off vietą.