Rašykite šio skyriaus tęsinį - Lietuva prarado nepriklausomybę ir palaipsniui tapo sovietine socialistine respublika. Tuo pačiu metu Lietuvos armija buvo palaipsniui transformuojama į Raudonosios armijos dalinius. Darbas karinėje akademijoje buvo nutrauktas, kai vyrai buvo pašaukti atgal į savo dalinius, tačiau Raštikis nebuvo leista atsistatydinti. Jis buvo paskirtas į 29-ąjį šaulių korpusą ir paskirtas Lietuvos kariuomenės likvidavimo komisijos pirmininko pavaduotoju. Jis buvo atleistas iš aktyvios tarnybos tik gruodžio 20 dieną. 1941 m. vasario 13 d., baiminantis NKVD arešto kaip "tautos priešo", Raštikis paliko žmoną ir tris dukteris Kaune ir išvyko į Vokietiją. Tai buvo paskutinis kartas, kai jis matė savo dukteris, kurios buvo deportuotos į Sibirą.
Birželio mėnesį. Jis perėjo sieną kovo 19-osios naktį ir buvo gerai priimtas vokiečių. Įvairių lietuvių pagalba jis apsigyveno Berlyne. Ten kartu su Kazys Škirpa įkūrė Lietuvos aktyvistų frontą (LAF). Visų pirma jis redaguoja LAF statutą ir rengia planus dėl Lietuvos išlaisvinimo.