2011-2012 m. sezone Czisny buvo paskirta 2011 m. "Skate America" ir 2011 m. "Trophée Eric Bompard" Grand Prix renginiams. Ji laimėjo aukso medalį "Skate America" ir bronzą "Trophee Bompard". Bompardo nemokamoje programoje ji užėmė pirmąją vietą su 121,90 taškais, nustatydama naują asmeninį geriausią tarptautinį nemokamojo krepšinio rezultatą. Czisny kvalifikuota į Grand Prix finalą. Gruodžio 8 d. per treniruotę ji susižeidė veršelio, paaiškindama, kad "tai buvo būdas, kuriuo aš pasirinkau šuolius". Komandos gydytojai nustatė, kad Czisny nepakenks sužalojimui, ir ji pradėjo varžytis ir baigė penktąją. Ji laimėjo sidabro medalį 2012 m. JAV čempionate.
- Taip. Po 2012 m. "Challenge Cup", kur ji užėmė bronzą, ji nusprendė neįtraukti dvigubos ašis-trigubo piršto kombinacijos į savo programą Pasaulio čempionate. Dvi kartus žlugusi trumpojoje ir penkis kartus laisvojoje programoje, 2012 m. Pasaulio čempionate ji užėmė 22 vietą.