1944 m. vasario 1 d. "Fusō" išvyko iš Truko su "Nagato", kad išvengtų amerikiečių oro antskrydžio, ir vasario 4 d. atvyko į Palaus. Jie išvyko vasario 16 d., kad išvengtų kito oro antskrydžio. Vasario 21 d. laivai atplaukė į Lingga salą, kur "Fusō" buvo panaudotas kaip treniruočių laivas. Po savaitės kapitonas Masami Banas pakeitė Tsuruoką. Nuo balandžio 13 d. iki 27 d. laivas buvo atnaujintas Singapūre ir sugrąžintas į Lingga. Gegužės 11 d. laivas buvo perkeltas į Tawi-Tawi, kur buvo apsaugotas konvojus, kuris negalėjo pasiekti Kioto.
Biako salą sustiprinsime mėnesio pabaigoje. Liepos pradžioje "Fusō" buvo perkelta į Tarakan salą prie Borneo, kur pakilo degalų, o vėliau grįžo į Japoniją ir pabėgo nuo povandeninio laivo. Rugpjūčio pradžioje Kure laivas buvo papildomai aprūpintas radarais ir lengvais AA ginklais. "Fusō" ir jos seserinis laivas buvo perkelti į 2-ojo flotilės 2-ąją karo laivų diviziją rugsėjo 10 d., o "Fusō" rugsėjo 23 d. tapo divizijos vėliava, vadovaujama viceadmirolio Shōji Nishimura. Rugsėjo 23 d. jie išvyko iš Kure į Lingga, kitą dieną išvengė povandeninio laivo išpuolių, ir atvyko spalio 4 d., kur Nishimura perdavė savo vėliavą "Yamashiro". Vėliau laivai buvo perkelti į Brunejų, kur buvo gabenama degalų, rengiantis operacijai "Shō-Gō", bandymui sunaikinti Amerikos laivyną, vykdančią invaziją į Leyte.