3 skvadronas ilgiausiai tarnavęs komandantas (CO) karo metu buvo skvadronas lyderis Bobby Gibbes, kurio kelionė truko nuo 1942 vasario iki 1943 balandžio. Gibbesą pakeitė eskadrono vadas Brianas Eatonas, kuris vadovavo padaliniui iki 1944 m. vasario. Per šį laikotarpį 3 eskadrilė dalyvavo sąjungininkų invazijoje į Siciliją.
ir Italija. 1944 m. lapkritį ji buvo atnaujinta su P-51 Mustang ir toliau dirbo Italijoje ir Jugoslavijoje iki Europos karo pabaigos 1945 m. gegužę. 3 eskadrono skrydžių valandų skaičius - 25 663 skrydžių valandos ir 217,5 sunaikinti priešų orlaivai - padarė jį aukščiausiu RAAF naikintuvų eskadronu.