1567 m. balandžio 21-23 d. Marija paskutinį kartą aplankė savo sūnų Stirlingas. Grįžusi į Edinburgą, balandžio 24 d. Marija buvo pagrobta, noriai ar nenoriai, Lordo Botvelo ir jo vyrų ir nuvežta į Dunbaro pilį, kur jis galėjo ją išprievartauti. Gegužės 6 d. Marija ir Botvelis grįžo į Edinburgą ir gegužės 15 d. Holyrood rūmuose ar Holyrood Abbey jie susituokė protestantiškais ritualais. Bobvelis ir jo pirmoji žmona, Džinė Gordona, kuri buvo lordų Hantlių sesuo, išsiskyrė prieš dvylika dienų. Iš pradžių Marija tikėjo, kad daugelis kilmingų palaikė jos santuoką, tačiau taip greitai susilpnėjo santykiai tarp naujai išrinkto Bobvellio (Orknijos kunigaikščio) ir jo bendraamžių, ir santuoka pasirodė nepopuliari.
sūnus