1944 m. spalio mėn. laivas dalyvavo operacijoje "Šo-1".
Leyte. "Nagato", priskirtas viceadmirolio Takeo Kuritos 1-iosios diversijos pajėgos (dar žinomos kaip Centrinė pajėgos), buvo užpultas kelių amerikiečių nardymo bombonešių ir naikintuvų bangų per Sibujan jūros mūšį spalio 24 d. Kelionėje į Leyte įlanką. Jį du kartus užpuolė bombos ir žuvo 52 įgulos nariai, tačiau jis nebuvo rimtai pažeistas.