1862 metų birželį Džuetas prisijungė prie Sąjungos armijos, kad kovotų Pilietiniame kare, ir buvo paskirtas antrojo leitenanto 9-ajame Vermonto pėstininkų pulke. Rugpjūčio 3 d. jis buvo sučiuptas ir liko Konfederacijos belaisvis 25 dienas. 1863 m. gegužę Džuetas buvo paaukštintas į leitenantą. Savo tarnybos metu jis dalyvavo mūšiuose prie Harper's Ferry (1862 m. rugsėjo 13 ir 15 d.), Newport Barracks (1864 m. vasario 2 d.), Chaffin's Farm (1864 m. rugsėjo 29 d.) ir Fair Oaks
1864 m. spalio 27 d. 1864 m. Lapkričio mėn. Jis atsistatydino ir grįžo į Vermontą.