2018 m. rugpjūčio mėn. atvykus naujam treneriui Julenui Lopetegui, Modričiui buvo suteikta nuolatinė grįžta į pirmąją komandą kaip pakaitalas dėl to, kad po 2018 m. Pasaulio taurės jis neturėjo pasirengimo treniruotėms. Tai buvo pakaitinis pasirodymas jo komandos pralaimėjime 2: 4 po papildomo laiko prieš Atlético Madrid UEFA Super taurėje.
- Taip. Pirmasis sezono startas įvyko rugsėjo 1 d. 4-1 namuose pergalėje prieš "Leganés", kur jis padėjo savo komandos trečiajam tikslui, kurį įveikė Karim Benzema. Jo 100-asis pasirodymas UEFA klubo varžybose įvyko rugsėjo 19 dieną, kai "Roma" nugalėjo 3-0, kai jis padėjo antram tikslui, kurį įmušė Gareth Bale. Gruodžio 22 d. Modrić laimėjo trečiąjį FIFA klubo pasaulio taurę, įmušęs pirmąjį tašką ir padėdamas trečiajam finalo rungtynėse prieš "Al Ain". 2019 m. sausio 13 d. ir 19 d. Modričius pirmą kartą įmušė du rungtynes iš eilės "Real Madrid" varžybose, kai "Real Betis" nugalėjo 1-2, o "Sevilla" nugalėjo 2-0. Tą patį mėnesį jis buvo įtrauktas į UEFA metų komandą (2018) trečią kartą savo karjeroje. Nuo vasario 27 d. iki kovo 5 d. Modričius išgyveno tai, ką jis apibūdino kaip "sunkiausią savo futbolo gyvenimo savaitę", kai "Real Madrid" du kartus pralaimėjo "Barcelona" ir "Ajax" ir iškrito iš "Copa del Rey", vardo varžybų ir Čempionų lygos. Nepaisant to, kad sezonas buvo nesėkmingas, jis penktą kartą iš eilės buvo įtrauktas į FIFA FIFPro World XI.