Prieš ir per Pilietinį karą Pensilvanija buvo padalinta valstybė. Nors Pensilvanijoje vergovė buvo uždrausta, daugelis konservatyvių Pensilvanijos gyventojų tikėjo, kad federalinė vyriausybė neturėtų kištis į vergovės instituciją. Vienas tokių buvo demokratas Džeimsas Buchananas, paskutinis prieš Pilietinį karą buvęs prezidentas. Buchanano partija iš esmės laimėjo prezidento ir gubernatoriaus rinkimus Pensilvanijoje. Tačiau naujai įkurtos Respublikonų partijos pirmasis kongresas
įvyko Filadelfijoje, o 1860 m. rinkimuose Respublikonų partija laimėjo valstijos prezidento rinkimus ir gubernatoriaus postą. Po Krietendeno kompromiso nesėkmės, Pietų atsiskyrimo ir Fort Sumter mūšio prasidėjo Pilietinis karas, Pensilvanija buvo pagrindinė Sąjungos narė. Nepaisant respublikonų pergalės 1860 m. rinkimuose, demokratų partija išliko galinga valstijoje, o keli "medžio galvos" ragino taiką karo metu. 1862 m. rinkimuose demokratų partija vėl perėmė valstijos įstatymų leidėjų kontrolę, tačiau 1863 m. gubernatorių postą išlaikė dabartinis respublikonas Andrew Curtinas. 1864 m. Rinkimuose prezidentas Linkolnas smarkiai nugalėjo Pensilvanijos gimtinį George'ą B. McClellaną dėl valstijos rinkėjų balsų.