1799 m. rugsėjį, po Romos Respublikos žlugimo, jis sekė prancūzus ir pasislėpė Prancūzijoje, Marselio ir Paryžiaus. Po Marengo
, jis grįžo į Italiją, bet ne į Romą. Vietoj to jis sustojo Milane, kur tapo "Veliti della Guardia" Italijos divizijos chirurgu ir vyriausiuoju chirurgu.