Ji buvo įkurta 1868 m. kaip Vokietijos ir Šveicarijos piliečių mokykla, pagrįsta lygiateisiškumo principu, kad tarnautų vokiečių kalbančiajai miesto bendruomenei. 1871 m. šiai mokyklai buvo pastatytas pastatas netoli Galata bokšto. 1894 m. Stambulo žemės drebėjimo metu pastatas buvo smarkiai pažeistas, todėl 1897 m. mokykla persikėlė į kitą pastatą, kuriuo vis dar naudojasi mokykla. Po kelerių metų mokykla taip pat pradėjo priimti turkiškai kalbančius studentus. 1918 m., po Pirmojo pasaulinio karo, mokykla buvo uždaryta ir pastatas buvo naudojamas okupacijos
jėgas. 1923 m. paskelbus Turkijos respubliką, 1924 m. mokykla vėl buvo atidaryta. 1925 m. ji persikėlė į dabartinį pastatą. 1945 m. dėl Turkijos politinės pozicijos prieš Vokietiją per Antrąjį pasaulinį karą jis vėl buvo uždarytas, o pastate buvo įsikūrusi Beyoğlu mergaičių vidurinė mokykla. 1953 m. pastatas buvo atiduotas Deutsche Schule Istanbul ir nuo to laiko mokykla naudoja tą patį pastatą.