2018 m. gegužės 24 d. Rodri grįžo į "Atlético" po to, kai klubas pasiekė susitarimą su "Villarreal" dėl jo perdavimo. Jis pasirašė penkerių metų sutartį su Madrido klubu už 20 milijonų eurų ir 5 milijonus kintamųjų. Debutą jis padarė rugpjūčio 15 dieną 2018 m. UEFA Super taurėje.
Tallinoje, žaidžiant pirmąsias 71 minutę pergalės per papildomą laiką prieš miesto varžovus "Real Madrid".