Medijos imperiją 547 m. pr. m. e. užkariavo Kyras, vadovaujantis Achaemenidų dinastijai, ir taip buvo įkurta Persijos imperija, kuri 539 m. pr. m. e. suėmė visą Neobėlonų ar "Kaldynų" imperiją. Karalius Kyras pakeitė Asirijos sostinę iš Ninevos į Arbelą. Asirijai tapo Persijos imperijos, kuriai vadovavo karalius Kserksas, priešininkais, o Maratono mūšyje jie atliko svarbų vaidmenį
Karaliaus Darijaus I valdymo metu 490 m. pr. Kr. Kyras II sugrąžino Asirijos šventus atvaizdus į Ninevą ir Asiriją, pastatė jiems nuolatines šventoves, surinko visus jų buvusius gyventojus ir grąžino juos į jų gyvenvietes. Išgirdęs apie Bardijos (Kiro II sūnaus) nužudymą ir šį ryšį, Darijus Didysis paskelbė, kad keli satrapijos, įskaitant Asirijos satrapiją, sukilo. 482 m. pr. Kr. Babilonas ir Asirija buvo sujungtos į tą patį administracinį padalinį.