2013-14 m. Sezono metu jis žaidė 2013 m. DFL-Supercup prieš Borussia Dortmund, UEFA Super Cup
prieš "Chelsea" ir dvi rungtynes FIFA klubo pasaulio čempionate; pirmoji - prieš "Guangzhou Evergrande", o antroji - prieš "Raja Casablanca". 2013 m. gruodžio 2 d. Alaba pasirašė naują sutartį su "Bayern Munich", kuri baigtųsi 2018 m. Gruodžio 20 d. Alaba trejus metus iš eilės buvo pripažintas metų Austrijos futbolo žaidėju. 2014 m. sausio mėn. Alaba pirmą kartą buvo įvardintas į UEFA 2013 metų komandą.