Įpilkite šią frazę: 1956 m. rugpjūčio mėn. Eskadronas persikėlė į RAF Akrotiri Kipre, kai Didžioji Britanija ir Prancūzija ruošėsi kariniam atsakymui į Egipto
Sueco kanalo nacionalizavimas. Spalio 31 d. britai ir prancūzai pradėjo operaciją "Mušketyras", seriją sunkių oro atakų prieš Egipto taikinius, po kurių lapkričio 6 d. nusileido. 39-osios eskadrilės vaidmuo buvo apsaugoti gyvybiškai svarbius Kiprą veikiančius oro uostus nuo bet kokio galimo Egipto keršto. Jungtinių Tautų spaudimas privertė Egiptą nutraukti ugnį ir iki gruodžio pabaigos išvesti anglo-prancų pajėgas, tačiau po to, kai britų pajėgos išsiskyrė, eskadrilė liko Kipre, skraidydama patrulius, kad atgrasytų orlaivius, kurie buvo įtariami, kad nukreipė atsargas į EOKA pajėgas, kovojančias prieš britų valdymą Kipre. 1957 m. kovo mėn. pagrindinė eskadrono dalis grįžo į Maltą, tačiau Kipre buvo išlaikytas atskirtis. Dėl įtampos Libane (kuri galiausiai baigėsi 1958 m. liepos- spalio Libano krize) 1958 m. gegužę visa eskadrilė persikėlė į Kiprą, bet netrukus grįžo į Maltą ir 1958 m. birželio 30 d. buvo išardyta.