Biotopo akvariumas yra tam tikros gamtos aplinkos atkūrimas. Kai kurie iš populiariausių biotopų yra Amazonės ir Rio Negro upių gėlavandeninės buveinės, Malavio ežero ir Tanganjikos ežero Afrikos riftų ežero aplinka, Australijos, Raudonosios jūros ir Karibų jūros druskos vandens koralų rifiai. Žuvis, augalai, substratas, uolienos, mediena, koralai ir bet kuri kita ekrano dalis turėtų visiškai atitikti vietos gamtos aplinką. Tokių aplinkų atkūrimas gali būti iššūkis, o dauguma "tikrųjų" biotopų turės tik keletą (jei ne tik vieną) žuvų ir bestuburių rūšių.
druskos vandenų koralų rifai