Kai Vokietija įsiveržė į Sovietų Sąjungą, Kuznecovas, savo paties prašymu, buvo išsiųstas prisijungti prie sovietų partizanų vienetų nacių okupuotoje Ukrainoje. 1942 m., tais pačiais metais, kai jis tapo Komunistų partijos nariu, kovojo kaip Dmitrijus Medvedevo vadovaujamos partizanų grupės "Victors" narys centrinėje ir vakarinėje Ukrainoje. Kuznetsovas vadovavo kelioms sudėtingoms operacijoms, susijusioms su aukšto rango nacių pareigūnų nužudymu ir pagrobimu Rivne ir Lvove regionuose, tokioms kaip sėkmingos operacijos prieš vokiečių paskirtą Ukrainos vyriausiąjį teisėjo, Galicijos vicegubernatorių, Ukrainos Reichskommissaro patarėją, tris vokiečių generolius ir kitus. Kuznetsovas taip pat buvo pirmasis žvalgybos agentas, kuris atskleidė vokiečių planus pradėti masinę tankų ataką.
Kursko regione, ir informaciją apie vokiečių V-2 raketų, taip pat apie operaciją "Ilgas šuolis", Hitlerio planą nužudyti SSRS, JAV ir Didžiosios Britanijos vadovus per Teherano konferenciją. Kuznetsovas veikė Rivne (Reichskommissariato Ukrainos sostinėje), naudodamasis netikra vokiečių tapatybe "Oberleutnant Paul Siebert". Būtent Kuznecovas gavo informaciją apie Hitlerio "Vilkolakų" būstinę netoli Vinicijos miesto.