Nors Viljamo šalininkai dominavo vyriausybėje, Džeimsas turėjo daug pasekėjų, ypač aukštumose. Jo siekis, kuris tapo žinomas kaip jakobizmas, iš lotynų kalbos "Jacobus" - Jokūbas, paskatino keletą sukilimų. Pradinį jakobitų karinį bandymą vadovavo Johnas Grahamas, vikontas Dundee. Jo pajėgos, iš kurių beveik visi buvo kalnų gyventojai, nugalėjo Viljamo pajėgas Killiecrankie mūšyje
1689 m., bet jie patyrė didelių nuostolių ir Dundee buvo nužudytas mūšyje. Be jo vadovavimo Jakobitų armija netrukus buvo nugalėta Dunkeldos mūšyje. Po jakobitų pralaimėjimo 1692 m. vasario 13 d., įvykus incidentui, kuris vėliau buvo žinomas kaip Glenko žudynė, 38 Glenko klano MacDonaldų nariai buvo nužudyti Argilio grafų pėsčiųjų pulko narių, nes jie nebuvo skubiai prisiekę ištikimybę naujiems monarchams.