Po to, kai Jungtinės Valstijos įžengė į Antrąjį pasaulinį karą, Ballentine tarnavo antruoju komandantu eskorto vežėjo USS "Long Island" nuo 1941 m. gruodžio 26 d. Iki 1942 m. balandžio 18 d. 1942 m. birželio 30 d. jis buvo paaukštintas į kapitoną. Ballentine tarnavo 34.2 užduočių grupės vadas kontradmiralas Ernest D. McWhorter viršininku per
1942 m. lapkričio mėn. sąjungininkų invazija į Prancūzijos Šiaurės Afriką.