2016 m. Sezono pradžioje Ueda gerai pradėjo sezoną, kai padėjo Kashima Antlers išlaikyti du švarus lapus pirmosiose dviejų sezono rungtynių metu. Ueda taip pat sugebėjo susigrąžinti savo pirmosios komandos vietą, žaidžiant centrinio užpuolio pozicijoje. 2016 m. Balandžio 16 d. Po rungtynės, per kurią "Shonan Bellmare" laimėjo 3:0, jis po rungtynės interviu verkė ir šią pergalę paskyrė savo šeimai ir žmonėms, kurie buvo padėtyje po Kumamoto žemės drebėjimų. Vėliau Ueda padėjo komandai užimti pirmąją vietą pirmojo lygos etapo metu. Tačiau netrukus jis buvo įtrauktas į rezervų lentos eilę likusiam 2016 metų sezonui. Nepaisant to, Ueda ir toliau dalyvavo "Kashima Antlers" pirmojoje komandoje ir padėjo komandai pasiekti viršūnę lentelėje. Nors jis vieną kartą pasirodė čempionato etape, klubas laimėjo lygą, žaidęs abi rungtynes, kad nugalėtų Urawa Red Diamonds 2<unk>2 iš viso per išvykimo tikslą. Ueda dalyvavo FIFA klubo pasaulio čempionate trijose iš keturių rungtynių
, kai jis padėjo "Kashima Antlers" pasiekti finalą, tik pralaimėjo 4-2 prieš "Real Madrid". Nepaisant pralaimėjimo finale, Ueda ir Gen Shoji centrinės gynybos partnerystė buvo pagyrta žiniasklaidos tiek Japonijoje, tiek už jos ribų. Vėliau Ueda dalyvavo kitose dviejose rungtynėse, nugalėdamas "Sanfrecce Hiroshima" ir "Yokohama F. Marinos", kad patektų į Imperatoriaus taurės finalą. Vėliau jis dalyvavo finalo rungtynėse, kai Kawasaki Frontale laimėjo 2:1. 2016 m. Sezono pabaigoje Ueda žaidė trisdešimt vieną rungtynes visose varžybose.