PWS sukelia epigenetinis reiškinys, žinomas kaip imprinting, kurį sukelia tėvų kopijų SNRPN ir NDN necdin genų ištrynimas kartu su snoRNA grupėmis: SNORD64, SNORD107, SNORD108 ir dvi SNORD109 kopijos, 29 SNORD116 (HBII-85) kopijos ir 48 SNORD115 (HBII-52) kopijos. Jie yra 15 chromosomoje, esančioje 15q11-13 regione. Šis vadinamasis PWS / AS regionas gali būti prarastas dėl vieno iš kelių genetinių mechanizmų, kurie daugeliu atvejų atsiranda atsitiktinėmis mutacijomis. Kiti, mažiau paplitę mechanizmai apima vienalytę disparomė, sporadines mutacijas, chromosomų translokacijas ir genų ištrynimus. Dėl imprinting, šių genų tėvų kopijos yra beveik tylios, o tėvų kopijos yra beveik tylios, ir tik tėvų kopijos ištraukiamos iš šio chromosomos regiono.
reiškinys, vadinamas "imprinting"