1941 m. kovo viduryje III./KG 3 išvyko per Prancūziją į Münchendorfą, Austriją ir 1941 m. kovo 27-29 d. atliko mokymus. Grupėje buvo 28 "Dorniers", 26 buvo pasirengę mūšiui ir trys "Junkers Ju 88". Iki balandžio 5 d. jis buvo priskirtas Luftflotte 4 vadovaujamam Aleksandrui Löhrui. Grupė palaikė invaziją į Jugoslaviją ir dalyvavo Belgrado bombardavime.
balandžio 6 d. 102 "Do 17" lėktuvai, nešantys 18 SC 50 kg (110 lb) fragmentinių bombų ir 2 AB 36 kasetines bombas, užpuolė sostinę. Po pirmosios dienos dar buvo eksploatuojami 82 Do 17 lėktuvai, tačiau buvo pranešta tik apie vieną praradimą - KG 3 lėktuvą. Kitas šaltinis nurodo du; abu iš 8 "staffel". Kampanija baigėsi balandžio 18 d. greitąja Ašies pajėgų pergale.