Tačiau jis atsigavo ir 2009 m. pasaulio lengvosios atletikos čempionate 10 000 metrų lenktynėse laimėjo sidabrą, baigiant už Kenenisa Bekele. Zersenay daugelį lenktynių vadovavo, nustatydamas greitą tempą, tačiau jis buvo nugalėtas Bekele'io sprinto finišo metu. Po to jis laimėjo savo trečiąjį pusmaratoną.
Čempionato titulą, nustatydamas 59:35 rekordą ir taip pat laimėdamas sidabro medalį su Eritrėja komandinėje varžybose. Aukso medalis pusės maratono atstumu padarė jį antrą bėgiką kada nors laimėti pasaulio čempionato medalius kryžminio, lenktynių ir kelių lenktynių visus tame pačiame metais, iššūkis anksčiau pasiektas tik Paul Tergat.