Antrasis, didesnis rusų antplūdis įvyko po to, kai Rusijos imperija aneksavo Lietuvą Lenkijos padalijimo metu XVIII a. pabaigoje. Rusijos valdžioje valdžia regione išliko daugiausia lietuvių kilmingumo rankose, tačiau kai kuriuos administracinius postus pamažu perėmė rusai, kurie taip pat apsigyveno Vilniuje ir Kaune. Taip pat po 1863 m. sukilimo
Lenkijoje kai kurie turtai buvo konfiskuoti iš vietos kilmingųjų ir duoti Rusijos pareigūnams. Daug rusų, emigravusių į Lietuvą, buvo kareiviai, jūreiviai ir prekybininkai.