Martínez pradėjo 2013-2014 m. kampaniją ant pakaitinių klubo, vadovaujant naujai treneriui Pep Guardiola. 2013 m. rugpjūčio 30 d.
2009 m. UEFA Super taurės varžybose prieš "Chelsea" antrąją pusę jis išėjo į aikštę anksti ir papildomojo laiko paskutinėje minutėje užmušė 2-2 tašką, kad Bavarijos komanda laimėtų trofėjų varžybas Prahoje po penalti. Martínezas sezoną baigė su vienu įvarčiu 34 varžybose.