2012 m. rugpjūčio 31 d. jo "Atlético" komanda laimėjo UEFA Superkarą, nugalėjusi "Chelsea" 4<unk>1 Monako "Louis II" stadione. Vidaus lygoje komanda įspūdingai pradėjo sezoną, pirmojo pusmečio pabaigoje užėmė antrą vietą, likusi tik už "Barcelonos" ir virš miesto varžovų "Real Madrid". Galiausiai Simeone atvedė komandą į trečią vietą lygoje, kuri tuo metu buvo geriausia "Atlético" baigtis per 17 metų. 2013 m. gegužės 17 d. jis laimėjo Karaliaus taurę.
po to, kai "Atlético" nugalėjo varžovus "Real Madrid" 2 į 1 "Santiago Bernabéu" stadione.