Ilopango buvo vienas didžiausių ir judriausių oro uostų Centrinėje Amerikoje. Pilietinio karo metu
, dėl jo padėties, jis buvo bombarduojamas partizanų. 1980 m. sausio mėn. buvo užbaigta tarptautinė skrydžių paslauga, kai buvo pastatytas didesnis, modernesnis "Comalapa International". Šiuo metu planuojama modernizuoti ir išplėsti oro uostą, kad jame būtų galima priimti šiuolaikinius orlaivius. 2001 m. oro uosto administravimas perėjo iš kariuomenės į Comisión Ejecutiva Portuaria Autónoma (CEPA), kuri yra atsakinga už modernizavimo projekto planavimą. CEPA El Salvador CEPA; Salvadoro nepriklausoma institucija, teikianti logistikos paslaugas El Salvadoro oro uostų, uostų ir geležinkelių administracijos pagalba.