Selfridge buvo dislokuotas Presidio per
Didžiojo San Francisko žemės drebėjimo, 1906 m. balandžio 18 d. Jo padalinys dalyvavo paieškos ir gelbėjimo, taip pat valymo operacijose. 1907 m. jis buvo paskirtas į aeronautikos diviziją Fort Myere, Virdžinijoje, kur vėliau buvo išmokytas skraidyti orlaivį. Jis taip pat buvo Jungtinių Valstijų vyriausybės atstovas Aerial Experiment Association, kuriai vadovavo Aleksandras Grahamas Bellas, ir tapo jo pirmuoju sekretoriumi.