2011-2012 m. sezono pradžioje Lee buvo 18-oje vietoje ir pralaimėjo Australijos "Goldfields Open" kvalifikaciją.
ir Šanchajaus čempionate. Tačiau jis puikiai pasirodė PTC varžybose, pasiekęs 3 ir 4 varžybų ketvirtfinalį, o 6 varžybose jis buvo geresnis, nes pralaimėjo Neil Robertson. Tai reiškia, kad Lee spalio mėnesį grįžo į 16 geriausių, nes jis buvo 13-asis ir todėl automatiškai pateko į ateinančius reitingo renginius. 2011 m. JK čempionate pralaimėjo pirmame etape, o Vokietijos čempionate pasiekė pirmąjį pusfinalį nuo 2006 m. Šiaurės Airijos trofėjaus, tačiau negalėjo pralaimėti Ronio O'Sullivano, kuris laimėjo 6<unk>4. Po to jis pateko į Velso atvirojo čempionato ketvirtfinalo rungtynes, kur jis buvo sustabdytas mobiliojo telefono skambučio ant jo nugaros svyravimo sprendimo rėmu prieš Ding Junhui ir pralaimėjo rungtynes. Tačiau jis pasinaudojo savo nusivylimu dėl incidento, kai nugalėjo Dominic Dale, Neil Robertson, Graeme Dott ir Robert Milkins ir pasiekė Pasaulio atvirojo čempionato finalą, pirmą kartą nuo 2006 m. Velso atvirojo čempionato. Jis sužaidė su Marku Alenu, bet buvo dominuojamas visą laiką, nes jis pralaimėjo rungtynes 1<unk>10.