Dabar jis turėjo atsikratyti tų respublikonų, kurie nenorėjo perduoti respublikos vienam žmogui, ypač jo kariniams varžovams. Marengo pergalė
(1800 m. birželio 14 d.) laikinai išsilaikė, bet užsitikrino ir, suteikė dar vieną galimybę jo ambicijoms, padidindamas jo populiarumą. 1800 m. gruodžio 24 d. rojalistų sąmokslas Rue Saint-Nicaise leido jam išvalyti demokratinius respublikonus, kurie, nepaisant jų nekaltumo, buvo deportuoti į Prancūzijos Gvianą. Jis panaikino asamblėjas ir padarė senatą visagalis konstituciniais klausimais.