1942 m. Balandžio mėn., kai buvo suformuotas 24-asis tanko korpusas, Burdeinei prisijungė prie jo kaip generolo Badanovo štabo vadovas. Korpusas buvo išsiųstas kovoti su artėjančiomis vokiečių pajėgomis pietuose ir beveik buvo sunaikintas kovose netoli Don upės liepos mėnesį. Spalio pabaigoje, po kelių mėnesių rezerve, vienetas susigrąžino savo nuostolius. Jis buvo paskirtas į Pietvakarių frontą ir dalyvavo Stalingrado mūšyje. Gruodį Korpusas sunaikino Tatsinskos oro uostą ir buvo pervadintas į 2-ąjį Tatsinskos sargybinių tankų korpusą. Po Stalingrado mūšio korpusas kovo mėnesį buvo įtrauktas į Voronežo frontą. 1943 m. birželio 26 d. pulkininkas Burdeinei perėmė Korpuso vadovybę, o pareigas užėmė iki karo pabaigos. Jis dalyvavo Kursko mūšyje.
Rugpjūčio 31 d. buvo paaukštintas į generolo majoro rangą. 1944 m. liepos 3 d. operacijos "Bagration" metu jo padaliniai pirmieji įžengė į Minsko ir išlaisvino miestą. 1944 m. lapkričio 2 d. jis buvo paaukštintas į generolo leitenanto laipsnį. Vėliau korpusas dalyvavo Baltijos, Rytų Prūsijos, Vistulės-Odo ir Berlyno operacijose. Už vadovavimą Minsko puolimui 1945 m. balandžio 19 d. jam buvo suteiktas Sovietų Sąjungos herojaus (medalė Nr. 5026) titulas.