1916 m. Kovo 15 d. Peršingas vadovavo ekspedicijai į Meksiką, kad užimtų Pancho Vilą. Ši ekspedicija buvo prastai įrengta ir trukdė tiekimo trūkumas dėl Kvartemestro korpuso susilaikymo. Nors jau daugelį metų buvo kalbama apie karą pasienyje, nebuvo imtasi jokių veiksmų, kad būtų užtikrintas ekspedicijos atsargų gabenimas. Nepaisant šios ir kitų kliūčių, tokių kaip pagalbos nebuvimas iš buvusios Meksikos vyriausybės ir jų atsisakymas leisti Amerikos kariams vežti karius ir atsargas per jų geležinkelius, Pershingas organizavo ir vadovavo
Meksikos baudžiamoji ekspedicija, 10 000 vyrų ginkluota jėga, įsiveržusi į chaotišką Meksiką. Jie nugalėjo Vilos revoliucininkus, bet nesugebėjo jį sučiupti.