1943 m. vasarį, iškart po to, kai jis dalyvavo sąjungininkų invazijoje į Šiaurės Afriką
, vadovaujant generoliui-mažoriui Terry Allenui, jis parengė ataskaitą, kurioje buvo siūloma pataisyti puolimų divizijų užduočių organizavimą, o jo rekomendacijos buvo priimtos rengiantis operacijai "Husky", sąjungininkų invazijai į Siciliją. Jis buvo paaukštintas į brigados generolio laipsnį ir greitai buvo išsiųstas į Jungtinę Karalystę, kur jis tarnavo kaip Amerikos patarėjas Europos operacijų teatro Kombinuotųjų operacijų skyriuje. Tuo tikslu Cota padėjo prižiūrėti amfibijų iškrovimo operacijų mokymą.