"Merrill" buvo paskirta lėktuvnešų kovos grupei, 1991 m. vėl buvo dislokuota į Artimuosius Rytus. Keliaudama į Persijos įlanką "Merrill" 1991 m. birželį dalyvavo Operacijoje "Uždegimas budėjimas". Po Persijos įlankos karo paliaubų atvykęs į regioną, "Merrill" tapo koalicijos minų valymo pajėgų Persijos įlankoje pavyzdiniu laivu ir buvo antrasis karo laivas, kuris po Irako invazijos aplankė išlaisvintą Kuveito miestą.
- Taip. 1992 m. "Merrill" pradėjo kovoti su narkotikais Centrinės Amerikos operacijų srityje. 1992 m. rugsėjo mėn. "Merrill" buvo išsiųstas į Long Bičo karinių laivų statyklą, kur buvo atliktas didelis remontas, kuris truko iki 1993 m. pabaigos. Ši peržiūrą sudarė radaro sistemų valdymo plokščių atnaujinimas, laivui buvo pridėtas visas aukštis, kuriame buvo anksčiau įrengti CIWS valdymo kompiuteriai, ir svarbiausia, kad visam laivui buvo pridėta RAM (radaro absorbcinė medžiaga), pirmoji žlugdytojui. Gavusi pranešimą apie planuojamą Long Bičo uždarymą, USS Merrill 1994 m. persikėlė į San Diego karinio jūrų laivyno bazę ir praleido keletą mėnesių kaip bandymų platformą, kurioje buvo įdiegta RAM medžiaga, kuri buvo sukurta taip, kad laivas radaruose atrodytų mažas kaip vilkikas.