Santiago Atitlán buvo didelė valstybės remiamo smurto vieta per šalies
Pilietinis karas. Kai kurie iš labiausiai pastebimų incidentų, įvykusių karo metu, yra Romos katalikų kunigo Stanley Rother nužudymas dešiniųjų mirties būrių 1981 m. Liepos 28 d. ir 14 žmonių žudymas (ir dar 21 sužeistas), kai Gvatemalos armija 1990 m. gruodžio 2 d. Atvėrė ugnį į beginklių civilių minią.