Konfederacija baigėsi po trejų metų, kai buvo nugalėta Čilės Konfederacijos kare.
- Taip. 1839 m. rugpjūčio mėn. Agustinas Gamarra paskelbė, kad Konfederacija yra išardyta; dėl to Pietų Peru ir Šiaurės Peru vėl tapo viena Peru Respublika.