Parašykite šio skyriaus tęsinį - 1939 m. rugsėjo 13 d. Vokietijos invazijos į Lenkiją metu, kuri pradėjo Antrąjį pasaulinį karą, Leżajską užėmė Wehrmacht. Po to vokiečių "Einsatzgruppe I" įžengė į miestą, kad įvykdytų įvairius žiaurumus gyventojams. 1939 m. lapkričio 3 d. Vokietijos saugumo policija, vykdydama "Intelligenzaktion", surengė masinius vietinių lenkų suėmimus. Tuomet lenkai buvo arba įkalinami vietiniame kalėjime, arba žudomi vietinėse kapinėse. Tarp žudytų lenkų buvo mokytojai, mokyklos direktoriai, kunigai ir kariniai pareigūnai. Lenkai iš Ležajsko taip pat buvo tarp didžiosios Katino žudynių, kurias 1940 m. balandžio-gegužės mėn. įvykdė rusai, aukų. Vokiečių okupacijos metu
, vietinė armija buvo labai aktyvi šioje srityje. Nuo 1940 m. gegužės Lenkijos pasipriešinimo judėjimas Ležajske platino požeminį lenkų laikraštį "Odwet". 1943 m. gegužės 28 d. vokiečiai nušovė 43 miesto gyventojus. Leżajską 1944 m. liepos 27 d. užėmė Krašto armija.