Nacionaliniu lygmeniu El Salvadore yra dvi pagrindinės politinės partijos, kurios šaknys yra pilietiniame kare. Pagrindinė dešiniojo sparno partija yra La Alianza Republicana Nacionalista (Nacionalistinė respublikonų aljansas <unk>ARENA), įkurta 1981 m. rugsėjo 30 d., išlaikė tvirtus ryšius su kariuomene pilietinio karo metu ir valdė vėlesnius karo metus ir didžiąją pokario laikotarpį. Farabundo Martí Nacionalinio išsivadavimo frontas (FMLN), socialistinė partija, yra tiesioginis komunistinių partizanų karių, kurie kovojo prieš Salvadoro vyriausybę, palikuonis, ir buvo teisiškai įkurta kaip politinė partija 1992 m. Rugsėjo 1 d. Po pilietinio karo
Šios dvi partijos išliko pagrindinėmis šalies politinėmis partijomis, vis dar susiskaldžiusiomis kairiųjų ir dešiniųjų dvinariniu.