Kai 803 m. Barmakidai buvo nuveršti ir suimti kalifo Haruno al-Rashido, Musa taip pat buvo įkalintas su savo tėvu ir broliais iki al-Amino įkūrimo, kuris juos išleido ir vėl parodė jiems tam tikrą palankumą. Ketvirtosios fitnos metu
, Musa stojo al-Amin pusėje, kovodamas lojalistų armijos gretose prieš al-Ma'mun, bet vėliau jis įstojo į pastarosios tarnybą. Al-Ma'munas paskyrė jį Sindh gubernatoriumi. 835 m. Musa mirė, o jo įpėdinis buvo jo sūnus Imranas.