1808 m. Reynoldsas persikėlė į "Hulk", bet mažiau nei po metų jam buvo suteikta pirmoji komanda. 1811 m. vasarį jis tapo vadu ir perėmė laivą, kuriuo jis dalyvavo atakuojant Javą.
ir buvo paaukštintas į kapitono postą kaip atlygis, perimdamas HMS "Sir Francis Drake". Admiralitetas patvirtino jo paaukštinimą 1812 m., pripažįstant jo tėvo, kuris mirė 1811 m. Kalėdų išvakarėse. 1812 m. rugpjūčio mėn. jis grįžo į Britaniją ir išbuvo jose vienerius metus, kol dėl sveikatos sutrikimų išėjo į pusiau pensiją. Pasibaigus karui 1815 m. Reynoldsui buvo pasiūlyta tęsti tarnybą kaip fregatos kapitonas mažesniame kariniame jūrų laivyne, tačiau buvo priverstas atsisakyti šio posto dėl ilgo sveikatos sutrikimo.