Skorzenis 1945 metų sausį ir vasarį vadovavo reguliarioms kariuomenei kaip generolo majoro pareigas einantis, dalyvavo gynyboje Vokietijos Rytų Prūsijos ir Pomeranos provincijose bei Švedto tilto gynyboje. Kovo 17 d. jis gavo įsakymą sabotuoti paskutinį likusį nepaliestą tiltą per Reiną Remagen
Tačiau tą pačią dieną tiltas sugriuvo, o karinio jūrų laivyno naikinimo būrys nesėkmingai užpuolė netoliese esantį sąjungininkų pontoninį tiltą tarp Kripo ir Linco. Hitleris apdovanojo jį vienu iš aukščiausių Vokietijos karinių apdovanojimų, ąžuolo lapai į riterio kryžių.