Rašyti tęsinį šiam punktui - Po to įvykio Gvatemalos žmogaus teisių ombudsmenas Ramiro de León Carpio pagal konstituciją tapo prezidentu. Jis paskyrė Perezą savo prezidento štabo viršininku, pareigas jis užėmė iki 1995 m. Laikomas Gvatemalos kariuomenės frakcijos lyderiu, kuris pritarė derybų sprendimui dėl 30 metų trukusio Gvatemalos pilietinio karo.
, Pérez atstovavo kariuomenei derybose su partizanų pajėgomis. Jie pasiekė 1996 m. taikos susitarimus.