1587 m. vasario 7 d. vakare Fotheringheyje Marijai buvo pasakyta, kad kitą rytą ji bus nužudyta. Ji praleido paskutines savo gyvenimo valandas maldoje, paskirstydama savo daiktus savo namų nariams ir rašydama testamentą bei laišką Prancūzijos karaliui. Didžiojoje salėje pastatytas ešafodas buvo apvilktas juodu audiniu. Jis buvo pasiektas dviem ar trimis žingsniais ir aprūpintas bloko, pagalve, kad ji galėtų kluptis ant, ir trimis kėdėmis, kad ji ir Shrewsbury ir Kent grafai, kurie buvo ten, kad pamatytų egzekuciją.
"Tavo rankose, Viešpatie, patikėsiu savo dvasią"