Murray iš pradžių palaikė Lord Lauderdale'o griežtą politiką, dalyvaudamas 1678-aisiais vykusiame reide prieš "Covenanters", tačiau jis laikinai prarado karališkąjį palankumą, patardamas nuosaikumą dėl priemonių, kurių imtasi prieš juos. Tačiau 1679 m. jis dalyvavo Bothvelo tilto mūšyje.
1680 m. liepos mėn. jis buvo paskirtas Škotijos viceadmiraliu, o 1681 m. - parlamento pirmininku.