1580 m. dinastijos krizės metu Gvardos vyskupas D. Žoao pasisako už Portugalijos nepriklausomybę ir priešinosi Filipinų valdymui. Tada vyskupas priešinosi Alkantaros mūšio rezultatui.
ir toliau palaikė António, Krato prioro pusę, priešingai nei visi kiti portugalų vyskupai. 1582 m. kovo 18 d. popiežius pasmerkė Gvardos vyskupo D. Žavo "peržengimus", o jis mirė 1592 m., valdant Ispanijos (Portugalijos) karaliui Filipui II.