2012 m. Sausio 14 d. Hjustone Flanagan laimėjo JAV maratoną, užfiksavęs rekordą - 2:25:38. Vėliau ji atstovavo JAV komandai olimpiniame moterų maratone Londone, kur ji užėmė 10-ąją vietą su laiku 2:25:51. Ji kovo mėnesį nugalėjo aukštos klasės varžovą Lisabonos pusmaratone, užfiksavusi 1:08:52 laiką. Ji buvo 25-oji
2012 m. Pasaulio pusmaratono čempionatas.