1991 m. "Conte" pasirašė sutartį su "Juventus" treneriu Giovanni Trapattoni (Conte Trapattoni vadina savo "antruoju tėvu"), debiutavęs 1991 m. lapkričio 17 d. prieš miesto varžovus "Torino". Dėl pastovių pasirodymų, darbo, vadovavimo ir atkaklaus žaidimo stiliaus jis tapo svarbiu klubo gerbėjų figūra. Vėliau 1996 m. Marcello Lippi buvo paskirtas komandos kapitonu, po to, kai klubo kapitonas Gianluca Vialli pasitraukė, ir prieš tai, kai Alessandro Del Piero buvo paaukštintas į šį vaidmenį. 1998-1999 m. Sezono metu, kai Del Piero patyrė sunkią kelių traumą, Conte grįžo į komandos kapitoną, ir jis išlaikė šią poziciją iki 2001-2002 m. Sezono. Per savo "Juventus" karjerą Conte laimėjo penkis Serie A titulus, 1994-1995 m. Italijos taurę, 1992-1993 m. UEFA taurę ir 1995-1996 m. UEFA Čempionų lygą, taip pat keturis Supercoppa Italiana titulus, 1996 m. UEFA Super taurę, 1996 m. Tarptautinį taurę.
1999 m. UEFA Intertoto taurę, laimėdamas visus galimus aukščiausio lygio klubo titulus, išskyrus UEFA taurės nugalėtojų taurę.