Kompletigu la sekvan frazon: Kovalyov estis sincera kritikisto de aŭtoritatemaj tendencoj en la administracioj de Boris Yeltsin kaj Vladimir Putin. En 1996, li eksiĝis kiel estro de la prezidanta komisiono pri homaj rajtoj de Jeltsino, publikiginte malferman leteron al Jeltsino, kie Kovalyov akuzis la prezidanton rezigni pri demokrataj principoj. En 2002, li organizis publikan komisionon por esplori la
1999 Moskvaj apartamento-bombadoj (la Kovalev-Komisiono), kiu estis efike paralizita post kiam unu el ĝiaj membroj, Sergej Juŝenkov, estis murdita, alia membro, Juri Ŝĉekoĉikin, supoze venenita per taliumo, kaj ĝia advokato kaj enketisto, Miĥail Trepaŝkin, arestita.