Enskribiĝante en la Unio-Armeo en majo 1861, li ricevis komisionon kiel oficiro kun la 9-a New York Volunteer Infantry Regiment, populare konata kiel "Hawkins' Zouaves", kaj poste la IX-a Armeo-Korpuso kie li servis sub generalo Benjamin Butler ĉe la Batalo de Big Bethel kaj Hatteras Inlet ekspedicio
Ĉu vi ne scias? En 1862, li akompanis la Armeon de la Potomac en la ekspedicio Roanoke de generalo Ambrose Burnside kaj partoprenis en la Bataloj de Hatteras Inlet, Roanoke Island, Suda Monto, Antietam kaj Fredericksburg. Dufoje vundita dum la kampanjo, Jardine estis promociita al la rango de majoro por "gallanta konduto" kaj mallonge komandis la 89-an New York Infanterioreĝimenton.