Kompletigu la sekvan frazon: La 15an de februaro 2006, Benedikto la 16-a nomumis lin Apostola Nuncio en Egiptujo kaj Delegito al la Ligo de Arabaj Ŝtatoj, lia unua diplomatia afiŝo. Li estis unu el la malmultaj nuncioj kiuj ne ĉeestis la Pontifical Ecclesiastical Academy (Pontifika Eklezia Akademio). Laŭ la BBC, "La decido de la germandevena papo kaŭzis tumulton. Vatikan-observantoj provas eltrovi ĉu la movo estas degradado, aŭ rekono de la specialaj talentoj de la ĉefepiskopo". Fitzgerald diris: "Mia fono en la araba kaj islamaj studoj estas verŝajne konsiderata utila en ĉi tiu momento por la disvolviĝo de rilatoj kun Egiptujo kaj la resto de la islama mondo". Unu Vatikano korespondisto nomis la reasignon de Fitzgerald "la plej malbona decido de la papo ĝis nun" kaj lia foresto estis notita de la gazetaro kiam Benedikto ofendis islamanojn per sia
Regensburg-prelego en septembro 2006. La translokigo de Fitzgerald pruvis esti parto de la restrukturado de Benedikto de kuriaj sekcioj por reorienti interreligiajn diskutojn kun ne-kristanoj per unuigado de la rolo de prezidanto de la PCID kun tiu de la Ponka Konsilio por Kulturo, restrukturado kiun Benedikto iniciatis en marto 2006 kaj inversigis en junio 2007.