Skribu daŭrigon por ĉi tiu paragrafo - Bonucci komencis la sezonon gajnante la 2012 -datita Supercoppa Italiana
kun Juventus. Li debutis en la Ĉampionligo kontraŭ Chelsea en la grupa fazo kaj gajnis sian unuan golon en la konkurado kontraŭ Shaktar Donetsk en oktobro 2012 en remizo 1<unk>1. En decembro 2012 Bonucci estis kritikita por plonĝado en ligo matĉo kontraŭ Palermo sur kiu estis priskribita de kelkaj ĵurnalistoj kiel "la plej malbona plonĝo iam". Li estis rezervita de la arbitraciisto dum la ludo kaj poste ricevis unu-matĉan malpermeson kaj monpunon de 2000 eŭroj de la aŭtoritatoj. Juventus finis la sezonon gajnante la 2012-13 Serie A titolon.