Li restis lojala al prezidanto Ali Nasser Mohammed dum la Sud-Jemena Civita Milito.
, kaj sekvis lin en ekzilon en la najbara Nord-Jemeno. Dum la civita milito en Jemeno en 1994, Hadi aliĝis al la jemena registaro de prezidanto Ali Abdullah Saleh kaj estis nomumita kiel Ministro pri Defendo. En tiu rolo li gvidis la armean kampanjon kontraŭ la Demokratia Respubliko Jemeno. Post la milito li estis promociita al vicprezidanto la 3an de oktobro 1994, anstataŭigante Ali Salim Al-Beidh, kiu eksiĝis kaj batalis kontraŭ la registaro dum la civita milito.