Skribu daŭrigon por ĉi tiu paragrafo - La vojo estis uzata de la apostolo Paŭlo dum lia dua misivojaĝo kiam li vojaĝis de Filipio al Tesaloniko (Agoj 16-17). Ĝi ankaŭ ludis esencan rolon en pluraj ŝlosilaj momentoj en la romia historio: la armeoj de Julio Cezaro kaj Pompejo marŝis laŭ la Via Egnatia dum la civita milito de Cezaro, kaj dum la civita milito de la Liberigantoj
Marko Antonio kaj Oktaviano persekutis Kasion kaj Bruton laŭ la Via Egnatia al ilia fatala renkontiĝo ĉe la Batalo de Filipo. Pluvivaj mejloŝtonoj registras, ke la imperiestro Trajano entreprenis ampleksan riparadon de la vojo antaŭ sia kampanjo de 113 kontraŭ la parthoj. Tamen, en la 5-a jarcento p.K. la vojo estis plejparte forlasita kiel rezulto de perforta malstabileco en la regiono. Historiisto de la kvina jarcento rimarkis, ke la okcidentaj partoj de la Via Egnatia estis en tia malbona stato, ke vojaĝantoj apenaŭ povis trairi ĝin.