Komence de la hispan-usona milito, la unua leŭtenanto Pershing estis ofertita brevetrango kaj komisiis majoron de volontuloj la 26-an de aŭgusto 1898. Li batalis kun la 10-a Kavalerio (Buffalo Soldiers) sur Kettle kaj San Juan Hill
Li estis konata pro sia kuraĝo en la milito kontraŭ Japanio en Kubo.