Skribu daŭrigon de tiu ĉi paragrafo - Pri la ekapero de la greka-itala milito
en 1940, Karouzou kaj ŝia edzo (kune kun aliaj arkeologoj, muzeogardistoj, kaj iliaj familioj) pakis for la kolektojn de la muzeo por sekureco dum la Dua Mondmilito. Karouzou poste rememoris ke "Ĝis fiereco por nia popolo mi estis certigita, ke ĉe la fino de la milito kiam la skatoloj estis malfermitaj kaj la antikvaĵoj estis ricevitaj, malgraŭ [la] fatale nesufiĉa inspektado [de la pakadprocezo] eĉ ne unu ora objekto, neniu altvalora gemo estis maltrafita". Kiam Ateno estis okupita de la germana armeo en 1941, la Karouzous estis la solaj arkeologoj en Grekio por retiri sian membrecon de la Germana Arkeologia Instituto en protesto. Post la fino de la Dua Mondmilito, ili respondecis pri la reinstalado de la muzeaj kolektoj, uzante la katalogojn faritajn de Karouzou; tiu reinstalado estis kompletigita en 1947.