Kompletigu la sekvan frazon: En marto 1861, Ferguson estis komisiita kapitano en la milico de Suda Karolino, poste estante nomumita leŭtenanto kaj adjudanto al C.S. Army Brigadier-General P. G. T. Beauregard. Li estis unu el la oficiroj, kiuj ricevis la formalan kapitulacon de usona armea majoro Robert Anderson en Fort Sumter, levis la unuan konfederitŝtatan flagon, kaj afiŝis la unuajn gardistojn en Fort Sumter. Post la sieĝo, li estis sendita por prezenti la unuan konfederacian flagon trafita de malamika pafo al la Provizora Kongreso de la Konfederaciaj Ŝtatoj. Li estis leŭtenanto-kolonelo kaj helpanto de generalo Beauregard dum la
Batalo de Ŝilo. Dum la Batalo de Farmington, li estis en la 28-a Misisipo-Kavaleriregimento. Li komandis la unuon dum defendado de Vicksburg, kaj helpis haltigi atakojn faritajn de usona generalmajoro William T. Sherman kaj usona komodoro David Porter.