Skribu daŭrigon por ĉi tiu paragrafo - Ĝis ĉi tiu tempo la urbo Massalia gardis sian sendependecon kaj profitis de sia alianco kun Romo. Tamen, en 49 a.K., kiam la lukto por la gvidado de Romo komenciĝis inter Pompejo la Granda kaj Julio Cezaro, la gvidantoj de Massalia faris la fatalan decidon subteni Pompejon. (Vidu la Civitan Militon de Cezaro). Cezaro tuj sendis armeon al Massalia kaj sieĝis la urbon. Li konstruis longajn tranĉeojn ĉirkaŭ la urbo, kiel li faris kontraŭ la gaŭloj ĉe Alesia
Kaj fortranĉis la sanktajn arbarojn de la Liguroj por konstrui sieĝoturojn. Li ankaŭ konstruigis dekduon da batalŝipoj en Arles kaj lia nova floto, gvidita de lia legato Decimus Junius Brutus Albinus, venkis la Massalian-floton de la insuloj de la Friola arkipelago, kaj blokis la urbon de la maro. Malsanoj ruinigis la loĝantaron. En septembro 49 a.K., la soldatoj de la legato de Cezaro Trebonio rompis la murojn de Massalia kaj kaptis ĝin. La Massalians pagis pezan prezon por subtenado de Pompejo; la grandurbo perdis sian sendependecon, devis kapitulaci siajn batalŝipojn kaj kason, kaj estis devigita rezigni ĉiujn siajn teritoriojn sur la marbordo kaj interno, krom la Stoechades insuloj kaj Nico.