En aŭgusto 1945, la japana registaro ignoris kapitulacajn postulojn kiel precizigite en la Potsdama Deklaracio. Kun la subteno de la plej multaj el liaj asistantoj, Truman aprobis la horaron de la planoj de la militistaro faligi atombombojn sur la japanajn urbojn Hiroŝimo kaj Nagasako. Hiroŝimo estis bombita la 6-an de aŭgusto, kaj Nagasako tri tagojn poste, postlasante ĉirkaŭ 135.000 mortintojn; pliaj 130.000 mortus pro radiada malsano kaj aliaj malsanoj rilataj al la bomboj en la sekvaj kvin jaroj. Japanio konsentis kapitulaci.
la 10-an de aŭgusto, kun la sola kondiĉo ke la imperiestro Hirohito ne estus devigita abdiki; post iu interna debato, la Truman-registaro akceptis tiujn kondiĉojn de kapitulaco.