En la antaŭbaloto de la respublikanoj en 2016, Estrosi ankaŭ subtenis Sarkozy kiel la kandidato de la partio por la franca prezidant-elekto en 2017. Dek monatojn antaŭ la elektoj, li kaj aliaj lokaj konservativuloj agreseme kritikis la ministron pri internaj aferoj Bernard Cazeneuve pro la forto de la nacia polictrupo en la nokto de la kamiona atako en Nico en 2016.
Ĉu vi ne scias? Meze de la Fillon-afero, en marto 2017, Estrosi aliĝis al Xavier Bertrand, Valérie Pécresse kaj aliaj por postuli Alain Juppé anstataŭigi François Fillon kiel la kandidato de la partio. Ankaŭ, li renkontiĝis kun Emmanuel Macron dum lia kampanjo.