Skribu daŭrigon por ĉi tiu paragrafo - La Japana Imperio invadis Maluku frue en 1942 kiel parto de sia Kampanjo pri Nederlandaj Orientaj Indioj de la Dua Mondmilito, forpeli la nederlandanojn de la regiono. Halmahera iĝis la loko de japana mararmea bazo ĉe Kao Bay. Du jarojn poste, usonaj trupoj kaj iliaj aliancanoj lanĉis la Batalon de Morotai.
en 1944; bombardante la insulon en aŭgusto kaj invadante ĝin en septembro. Japanaj armeoj en Morotai rezistis ĝis 1945, sed ne sukcesis forpeli la Aliancitajn invadantojn. En la lasta parto de 1944, 61,000 personaro alteriĝis sur Morotai. Du trionoj el ili estis inĝenieroj, kiuj rapide starigis instalaĵojn inkluzive de havenoj kaj du startlenoj kaj ankaŭ ampleksajn fuelajn stokojn. La formala kapitulaco de la Dua Japana Armeo okazis ĉe Morotai la 9an de septembro 1945. La lasta japana persisto de la milito, soldato Teruo Nakamura (Amis: Attun Palalin), estis malkovrita de la indonezia aerarmeo sur Morotai, kaj kapitulacis al serĉpatrolo la 18-an de decembro 1974.