Kompletigu la sekvan frazon: Post la milito, Mackay studis fizikon ĉe la Universitato de Kembriĝo sub Ernest Rutherford antaŭ reveni al Aŭstralio kaj sia malnova laboro kiel preleganto ĉe la Universitato de Sidnejo. De 1933 ĝis 1940 li estis lernejestro de Cranbrook School, Sidnejo. Li restis en la Milico inter la militoj, kaj estis generalmajoro antaŭ la tempo kiam la Dua Mondmilito eksplodis. Li estis selektita por komandi la 6-an dividadon en 1940, kaj gvidis ĝin tra la unuaj bataloj de la aŭstralia armeo de la milito. Iuj duboj pri lia kapablo baldaŭ malaperis kun la engaĝiĝo de la dividado al la Okcidenta Dezerta Kampanjo. Dum la
Batalo de Bardia en januaro 1941, la 6-a dividado kaptis la fortikigitan urbon kune kun 36,000 italaj kaptitoj. En la Batalo de Grekio, li iĝis la sola aŭstralia generalo alfronti la "Waffen-SS" en batalo. Li suferis serion de malsukcesoj en Grekio, sed impresis la soldatojn sub lia komando per lia kuraĝo sub fajro. Li estis revokita al Aŭstralio en 1941 por servi kiel General Officer Commanding Home Forces. La 6an de aprilo 1942, li transprenis ordonrajton pri la Dua Armeo. Dum 1943 li dufoje komandis la Nov-Gvinean Forton en la bataloj en la Nov-Gvinea kampanjo. Lia aktiva servo finiĝis kun lia nomumo kiel Alta Komisaro al Hindio en novembro 1943.