በታኅሣሥ 1944 ፊሊፒንስን ከጃፓን ኃይሎች ነፃ ለማውጣት የተባበሩት የፊሊፒንስና የአሜሪካ ኃይሎች መሻሻላቸውን ሲቀጥሉ አኪኖን ጨምሮ የሁለተኛው የፊሊፒንስ ሪፐብሊክ መንግሥት ወደ ባጊዮ ተዛወረ። ከጊዜ በኋላ ወደ ጃፓን ተጓዘ፤ እዚያም ከሌሎች ባለሥልጣናት ጋር በመሆን አባላቱ ተይዘው በጃፓኖች እጅ ሲሰጡ በሱጋሞ እስር ቤት ታሰሩ።
ምን ማለትህ ነው? ነሐሴ 25 ቀን 1946 አኪኖ በሕዝብ ፍርድ ቤት በአገር ክህደት ክስ ለፍርድ ወደ ፊሊፒንስ ተመለሰ፤ ከጥቂት ሳምንታት በኋላ በዋስ ተለቀቀ።