የሚከተለውን ዓረፍተ ነገር አሟላ፦ በወቅቱ የነበረውን የጦርነት አለመጋፈጥ ስምምነት በመጣስ የጀርመን ጦር ሶቪየት ኅብረትን ወረረ። በሐምሌ 1941 ካርል ሊንኬ እና ልጁ ሃይንዝ ሁለቱም በቀይ ጦር ውስጥ በፈቃደኝነት ተቀላቀሉ ፣ እዚያም ከሊንኬ ሚናዎች አንዱ በፓርቲዛን ክፍል ውስጥ ኮሚሽነር ሆኖ ነበር ፣ ለሁለት ዓመታት በፓርቲዛን ቡድን ውስጥ (የኮሚኒስት) "የፓርቲ ጸሐፊ" ሚናውን አጣምሯል ። በዚህ አቅም በጀርመን መስመሮች በስተጀርባ በጎሜል ክልል ውስጥ በፓራሹት ኦፕሬሽኖች ውስጥ ተሳት participatedል ። በ 1944 የድንገተኛ ቡድን መሪ እንደመሆኑ መጠን በታጠቁ የስሎቫኪያ የሽምቅ ተዋጊዎች እንቅስቃሴዎች እና ከዚያ በኋላ በነሐሴ እና በጥቅምት 1944 መካከል በተከሰተው የሶሎቫክ ብሔራዊ አመፅ ላይ ተሳት participatedል ። የ
ጦርነቱ በ1945 የበጋ መጀመሪያ ላይ ሲያበቃ ካርል ሊንኬ በጦርነቱ በደረሰበት ቁስል እና በስሎቫክ ተዋጊዎች ጋር ሲዋጋ በተገደለው ልጁ ሃይንዝ ሞት ምክንያት ወደ ሞስኮ ተመለሰ።