የሚከተለውን ዓረፍተ ነገር አጠናቅቅ፦ የአሥራ አንድ የደቡብ ግዛቶች መለያየት እና የእርስ በእርስ ጦርነት መከሰት ሚለር የዩኒየን ጦር ሠራዊት አባል ሆነ። ነሐሴ 27 ቀን 1861 ገዥው ኦሊቨር ፒ ሞርቶን ሚለርን የ 29 ኛው ኢንዲያና እግረኛ ኮሎኔል አድርገው ሾሟቸው ። ከስልጠና በኋላ ሬጅመንቱ በኦሃዮ ውስጥ በቡል ጦር ውስጥ በአሌክሳንደር ኤም ማኩክ ክፍል ውስጥ ወደ ኪርክ ብሪጌድ ተመደበ እና ወደ ቴነሲ ተጓዘ ። ሚለር በሁለተኛው ቀን ላይ እርምጃውን ተመልክቷል
በሺሎ ጦርነት እንዲሁም በቆሮንቶስ ወረራ ወቅት ሚለር በሰሜን አላባማ እና በቴነሲ በኩል ጦሩን በመምራት ብራክስተን ብራግን በኬንታኪ በኩል አሳደደ ። ሚለር በታህሳስ ወር 1862 መጨረሻ ላይ በድንጋይ ወንዝ ጦርነት ወቅት በጄምስ ኔግሊ ስር አንድ ብርጌድ አዛ ። በጦርነቱ በሁለተኛው ቀን ሚለር የፌዴራል ተቃዋሚዎችን በመምራት የጆን ሲ ብሬኪንሪጅን የኮንፌዴሬሽን ጥቃት በመቃወም የድንጋይ ወንዝ ተሻገረ ። በዚህ ጥቃት ሚለር በአንገቱ ላይ ጉዳት ደረሰበት።