Rampungna ukara iki: Bédané agama saya tambah gedhé merga masalah ékonomi. Kanton Katolik, umume pedesaan Swiss tengah diubengi karo kanton Protestan kanthi ekonomi komersial sing saya akeh. Kanton sing dominan ing babagan politik yaiku Zürich lan Bern (kalorone Protestan), nanging kanton Katulik duweni pengaruh wiwit Perang Kapel kaping pindho ing taun 1531. Upaya 1655 (dipimpin dening Zürich) kanggo nyusun ulang federasi diblokir dening oposisi Katulik, sing nyebabake pertempuran Villmergen pisanan ing taun 1656; partai Katulik menang, nggawe "status quo". Masalah kasebut tetep ora bisa dirampungake, meletus maneh ing taun 1712 kanthi
Perang Villmergen sing kapindho. Wektu iki kanton Protestan menang, dominasi konfederasi. Nanging, reformasi sejati ora bisa ditindakake; kapentingan individu saka telulas anggota beda banget, lan pamrentah kantonal absolutist nolak kabeh upaya administrasi ing saindenging konfederasi. Kebijakan luar negeri tetep terfragmentasi.