Rampungake ukara ing ngisor iki: Tanggal 4 Maret 2017, Aubameyang ngliwati 20 gol Bundesliga kanggo musim kaping pindho kanthi rong gol ing kekalahan 6 <unk> 2 saka Bayer Leverkusen. Sekawan dina sabanjure, dheweke nggawe hat-trick ing kemenangan 4 kanggo 0 nglawan Benfica kanggo nyelehake Dortmund menyang perempat final Liga Champions. Ing tanggal 20 Mei, Aubameyang nyetak kaping pindho ing dina pungkasan Borussia ngalahake Werder Bremen kanggo mungkasi musim kasebut minangka pencetak gol paling dhuwur ing Bundesliga kanthi 31 gol. Ing
ing final DFB-Pokal 2016-17 tanggal 27 Mei 2017, dhèwèké nyétak gol kemenangan, minangka penalti, nalika Dortmund ngalahaké Eintracht Frankfurt 2-1.