Rampungake ukara ing ngisor iki: Johnston seneng banget karo Perang Meksiko-Amerika. Piyambakipun ngladosi staf Lt. Gen. Winfield Scott ing
Pengepungan Veracruz, wis dipilih dening Scott dadi perwira sing nggawa panjaluk nyerah sadurunge menyang gubernur provinsi. Panjenenganipun wonten ing garis depan gerakan pedalaman ing sangisoré Brig. Jenderal David E. Twiggs lan tatu parah déning grapeshot nindakaken pengintaian sadèrèngipun Pertempuran Cerro Gordo. Piyambakipun dipunangkat dados Letnan Kolonel kanggo tumindak ing Cerro Gordo. Sawisé pulih ing rumah sakit lapangan, dhèwèké gabung manèh karo tentara ing Puebla. Sajrone maju menyang Mexico City, dheweke dadi wakil komandan "Regiment Voltigeurs AS", sawijining unit sing kasusun saka infanteri ringan utawa skirmishers. Panjenenganipun mbedakake piyambak ing Contreras lan Churubusco, tatu maneh ing Chapultepec, lan nampa rong promosi paten kanggo rong pertunangan pungkasan, mungkasi perang minangka kolonel paten sukarelawan. (Sawise mungkasi permusuhan, dheweke bali menyang pangkat kapten ing wektu tentrem ing insinyur topografi.) Winfield Scott nyathet kanthi lucu manawa "Johnston minangka prajurit sing hebat, nanging dheweke duwe bakat sing ora apik amarga dheweke ditembak ing meh kabeh pertunangan". Kasusahan paling gedhe Johnston nalika perang yaiku sedane ponakané, Preston Johnston. Nalika Robert E. Lee ngandhani Johnston manawa Preston tiwas dening tembakan artileri Meksiko ing Contreras, kalorone perwira nangis, lan Johnston sedhih sajrone sisa uripe.