Rampungna ukara iki: Sakwisé Meksiko mardika taun 1821, pasukan Spanyol sing akèh terus nguwasani San Juan de Ulúa nganti taun 1825. Iki minangka situs pungkasan ing tilas koloni Spanyol Anyar sing dianakake dening Spanyol lan diserahake menyang Jenderal Meksiko Miguel Barragán ing wulan November 1825. Alasan kanggo prentah pengusiran sing diterbitake dening Presiden Vicente Guerrero yaiku upaya gagal kanggo ngrebut maneh Meksiko. Wiwit iku, San Juan de Ulúa dadi simbol militer lan politik perlawanan Meksiko tumrap invasi lan pendhudhukan asing, amarga sawetara kedadeyan ing abad kaping sangalas. Ing taun 1836, Prancis ngebom benteng kasebut ing Pertempuran Veracruz sajrone Perang Pastry, konflik sing disebabake dening warga Prancis ing Meksiko sing njaluk ganti rugi kanggo toko pastry sing diduga rusak; sajrone Perang Meksiko-Amerika, Amerika Serikat
ngubengi benteng kasebut sajrone perang, konflik sing disebabake amarga ana perselisihan babagan Republik Texas sing isih anyar, lan ing taun 1863 Prancis ngrebut kutha kasebut nalika nginstal Maximilian I dadi kaisar Meksiko. Sajrone abad kaping 19, benteng kasebut dadi pakunjaran, utamane kanggo tahanan politik sing dianggep oposisi marang pamrentah. Akeh politisi Meksiko sing misuwur nglampahi wektu ing kene nalika ora kuwasa.