Ing Juli 1861 sawijining resimen sing dikenal minangka Resimen Insinyur Kulon direkrut utamane ing Negara-negara Illinois lan Missouri, diatur dening Kolonel J. W. Bissell, lan Henry Flad dadi kapten Perusahaan B. Ing wulan Agustus taun sing padha, dheweke ditugasake dening Jenderal Frémont, banjur dadi komando ing St. Louis, kanggo layanan ing pambangunan benteng ing Cape Girardeau, Missouri, ing kana dheweke tetep pirang-pirang wulan. Banjur ing taun kasebut, nalika Frémont diganti dening Jenderal Halleck, Kapten Flad diprentah gabung karo Jenderal Paus ing Missouri sisih kidul-wétan, lan dadi perwira staf liwat kampanye New Madrid lan Point Pleasant lan njupuk Pulo Nomer Sepuluh, sawise dheweke gabung karo resimen ing New Madrid. Panjenenganipun kaliyan regimen ing Fort Pillow lan Pittsburgh Landing
lan ing operasi sadurunge Korinta. Sajrone musim panas taun 1862 dheweke melu ndandani Mobile lan Ohio Railroad, ing bangunan benteng ing Korinta, lan ndandani Mississippi Central Railroad. Dheweke uga melu maju Grant ing Grenada. Ing wulan Februari, 1863, dheweke diprentah menyang Young's Point, ing ngendi dheweke kerja ing karya teknik, amarga dheweke mengko ing Baxter Bayou, Lake Providence, lan Bayou Macon.