Rampungake ukara ing ngisor iki: Ing pungkasan wulan Juni, 1861, Hotchkiss mlebu dadi tim konfederasi kanggo nggawa pasokan menyang Churchville Cavalry ing Rich Mountain, Virginia Barat. Hotchkiss nawakake layanane minangka tukang peta kanggo Brigjen Richard B. Garnett, sing brigade Konfederasi operasi ing Virginia kulon. Hotchkiss dadi ing Rich Mountain lan nggawe peta kanggo kampanye sing direncanakake Jenderal Robert E. Lee ing pegunungan kasebut. Piyambakipun gadhah cuti sakit ingkang cekak sasampunipun kathah demam tifus, nanging wangsul dhateng tugas ing Maret 1862 minangka kepala insinyur topografi Distrik Lembah, nglaporaken dhateng Mayor Jenderal Stonewall Jackson. Sawisé kekalahan awal ing Pertempuran Kernstown nalika
Kampanye Lembah 1862, tanggal 26 Maret 1862, Jackson nimbali Hotchkiss menyang markas ing Narrow Passage cedhak Woodstock lan mrentah supaya "nggawe aku peta Lembah, saka Harper's Ferry nganti Lexington, nuduhake kabeh titik serangan lan pertahanan [sic] ing papan kasebut. " Rekomendasi langsung Hotchkiss yaiku garis Jackson ing Stony Creek ing Woodstock ora bisa dibela, lan Jackson kudu mundur menyang Rude's Hill, sawijining pucuk cilik sing bisa dibela ing sisih kidul Mt. Jackson. - Aku ora ngerti. Ing Rude's Hill, Jackson ngatur maneh komando kanggo sisa kampanye sukses ing taun 1862 ing Lembah Shenandoah.