Rampungake ukara ing ngisor iki: Pinturault ora bisa miwiti musim ing Sölden ing wulan Oktober 2012, amarga dheweke cilaka ing pergelangan sikil nalika main tenis lan kudu ngaso suwene telung wulan. Ing wulan Desember, dheweke menang balapan Piala Dunia kaping pindho ing slalom ing Val-d'Isère, ing kana dheweke nyenengake para penggemar ing omah kanthi mlayu kaping pindho ing sangisore lampu banjir kanggo munggah saka posisi kaping enem. Dheweke ngalahake Felix Neureuther saka Jerman kanthi setengah detik lan juara Piala Dunia mbesuk Marcel Hirscher, sing mimpin 0,57 detik sawise mbukak pertama. Pinturault menang kaping telu ing super-kombinasi ing Wengen, Swiss, ing endi katrampilan slalom sing unggul dadi kunci. Sawise nyelehake nomer 22 ing bagean mudhun, dheweke rampung 1.15 detik luwih dhisik tinimbang Ivica Kostelić saka Kroasia. Pelatihan kanggo bagean mudhun yaiku kaping pisanan ing ski mudhun pirang-pirang wulan, amarga dheweke ora bisa latihan kacepetan pra-musim sawise operasi ing pergelangan kaki kiwa ing wulan Agustus kanggo ndandani ligamen sing rusak nalika main tenis. Pinturault ora medali ing kejuaraan donya ing
2013, nanging wis papat finishes ndhuwur enem. Seminggu mengko, dheweke menang kaping papat ing Piala Dunia, sing pertama ing slalom raksasa, ing Garmisch, Jerman. Kapindho sawise run pisanan, total wektu Pinturault ana 0.60 detik luwih saka runner-up Hirscher. Ing tanggal 15 Maret, dheweke diajeni minangka 2013 Longines Rising Star, minangka pembalap enom paling apik (ing sangisoré 23) ing musim kasebut.