Nalika bali menyang Polandia ing taun 1784, Kościuszko ditugasake minangka jenderal utama ing Tentara Persemakmuran Polandia-Lithuania ing taun 1789. Sawisé Perang Polandia-Rusia taun 1792
ing Partisi Kaloro Persemakmuran, dhèwèké mimpin pambrontakan nglawan Kakaisaran Rusia ing Maret 1794 nganti dicekel ing Pertempuran Maciejowice ing Oktober 1794. Kekalahan Pemberontakan Kościuszko ing wulan November kasebut nyebabake Partisi Ketiga Polandia ing taun 1795, sing mungkasi Persemakmuran. Ing taun 1796, sawisé Tsaritsa Catherine II tilar donya, Kościuszko diampuni déning penerusé, Tsar Paul I, lan dhèwèké émigrasi menyang Amérikah Sarékat. Kanca cedhak saka Thomas Jefferson, sing bareng karo dheweke nuduhake cita-cita hak asasi manungsa, Kościuszko nulis wasiat ing taun 1798, ngaturake aset AS kanggo pendhidhikan lan kebebasan para budak AS. Kościuszko pungkasane bali menyang Eropa lan urip ing Swiss nganti seda ing taun 1817. Eksekusi wasiate mengko kabukten angel, lan dana kasebut ora nate digunakake kanggo tujuan sing dikarepake Kościuszko.