Rampungake ukara ing ngisor iki: Massa miwiti kanthi apik ing Ferrari, kualifikasi nomer loro ing balapan pambuka ing
Bahrain, lan teka saka posisi 21 dadi 5 ing Malaysia, ngalahake kanca tim Michael Schumacher, sing diwiwiti saka 14. Nanging, ing Bahrain, ing latihan dina Setu lan balapan, Massa nerusake kecenderungan muter, kanthi nyuda Fernando Alonso, sing menang balapan kasebut. Ing GP Australia, dheweke nabrak Ferrari ing kualifikasi, banjur tabrakan karo Christian Klien lan Nico Rosberg ing tikungan pertama balapan kasebut. Nanging, Massa nyetak podium karir pisanan ing Nürburgring, ngrampungake nomer telu ing mburi Michael Schumacher lan Fernando Alonso. Dheweke uga nyetel puteran paling cepet ing Barcelona ing taun 2006. Massa duwe papat podium liyane ing taun 2006, lan njupuk posisi pole F1 pisanan lan menang F1 pisanan ing sirkuit Istanbul Park. Posisi masa depan ing Ferrari dijamin nalika Michael Schumacher ngumumake tanggal 10 September 2006, dheweke bakal pensiun saka F1 ing pungkasan musim 2006. Ing tanggal 22 Oktober, Massa menang balapan ing omah ing Interlagos, dadi pembalap Brasil sing pertama menang ing Interlagos wiwit Ayrton Senna ing taun 1993. Massa ngrampungake musim kaping telu kanthi 80 poin, ing mburi juara dunia Fernando Alonso lan rekan tim Ferrari Michael Schumacher.