Rampungna ukara iki: Tanggal 15 Agustus 1945, Jepang
nyerah marang pasukan Sekutu. Rong dina sabanjure, Proklamasi Kamardikan Indonesia diumumake. Maluku diproklamasèkaké minangka salah siji provinsi ing Républik Indonésia. Nanging, pambentukan lan posisi Maluku ing wektu kasebut kepeksa ditindakake ing Jakarta, amarga nalika Jepang nyerah, Administrasi Sipil Hindia Walanda (NICA) langsung mlebu Maluku kanggo ngontrol. Walanda ngontrol Maluku nganti taun 1949, nalika ing perjanjian Konferensi Meja Bulat Walanda-Indonesia, Walanda ngakoni kedaulatan Indonesia. Wong Walanda ora suwé banjur lunga saka Maluku. Amarga ora percaya banget karo pimpinan Indonesia, sing umume Muslim Jawa, ing taun 1951 Republik Maluku Selatan independen diumumake ing Ambon, didhukung dening Walanda. RMS duwe dhukungan sing kuat ing antarane mantan prajurit kolonial Moluccan. Akibaté, pasukan Indonesia nyerang Maluku kanggo ngremuk separatis. Benteng utama klompok pemberontak RMS ing Ambon dikalahake dening pasukan Indonesia ing wulan November 1950, dene perjuangan gerilya skala cilik terus ing Pulo Seram nganti taun 1962. Nanging kekalahan ing Ambon nyebabake penerbangan pamrentah RMS sing dinyatakake dhewe saka pulau-pulau kasebut, lan pambentukan pamrentah ing pengasingan ing Walanda. Ing taun candhake udakara 12.000 prajurit Moluccan sing diiringi kulawargane lunga menyang Walanda, ing kana dheweke nggawe pamrentah "Republik Moluccas Selatan" ing pengasingan.