Rampungna ukara iki: Rebane dadi perwira ing Tentara Estonia nganti pasukan Soviet ngrebut negara kasebut ing taun 1940. Soviet bubar lan nyerep sebagian besar Angkatan Bersenjata Estonia lan nyekel lan nglakokake kabeh komando tinggi Estonia. Akeh perwira junior, kayata Rebane, dipecat amarga ora duwe "kepercayaan politik" lan bisa diekspor. Kanggo sawetara wektu, Rebane kerja ing konstruksi, banjur mlayu menyang alas nalika Soviet wiwit
deportasi massal ing taun 1941. Panjenenganipun ngedegaken lan mimpin unit Forest Brothers anti-Soviet ing Virumaa (Estonia Lor) ing Mei 1941.