Rampungake ukara ing ngisor iki: Sawisé Nazi Jerman lan Soviet nyerang Polandia, sing miwiti Perang Donya II, Kolno dicekel pasukan Jerman tanggal 8 September 1939. Tanggal 12-13 September 1939, "Einsatzgruppe V" Jerman mlebu kutha kasebut kanggo nindakake macem-macem kejahatan tumrap masarakat. Tanggal 29 September, Soviet mlebu wilayah kasebut sesuai karo Pakta Ribbentrop-Molotov. Soviet nindakake deportasi massal saka pedunung menyang Uni Soviet. Wis ing taun 1939, gerakan perlawanan Polandia diatur ing Kolno dening Stanisław Milewski. Kutha iki tetep ana ing sangisoré
Pendhudhukan Soviet nganti Operasi Barbarossa (22 Juni 1941) nalika lagi dikalahake dening Wehrmacht.