Rampungna ukara iki: Ora let suwé sakwisé perang, dhèwèké nikah karo anaké wong Athena sing misuwur, lan sakwisé kuwi, dhèwèké terus ngupaya kanggo nginjil ing kutha Athena nganti séda. Sawisé Athena direbut déning Ibrahim Pasha ing sasi Juni 1826, Makriyannis mbiyantu ngatur pertahanan Akropolis, lan dadi komandan sementara garnisun sawisé pati komandan, Yannis Gouras. Panjenenganipun kasil nolak serangan sengit marang Odeon Herodes Atticus tanggal 7 Oktober, lan nalika mbela Akropolis, dheweke ngalami tatu abot kaping telu, ing sirah lan gulu. Cedera kasebut ngganggu dheweke sajrone sisa uripe, nanging ora bisa nyegah dheweke melu ing fase pungkasan perang: ing musim semi 1827 dheweke melu pertempuran Piraeus lan pertempuran
Phaleron.