Ing taun 2011, Mukerji nikah karo Aditya Chopra ing upacara pribadi ing Italia. Ing tanggal 9 Desember 2015, dheweke nglairake anak wadon sing jenenge Adira. Pitakon: Apa jeneng putrine? Pitakon: Mukerji wis kerja sama lan njaga persahabatan sing cedhak karo aktor Shah Rukh Khan lan Aamir Khan, lan pembuat film Karan Johar. Sifat hubungan Mukerji karo pembuat film Aditya Chopra dadi topik laporan tabloid sing semangat ing India, sanajan dheweke ora gelem ngomong babagan iki.
Adira