Rampungake ukara ing ngisor iki: Kovač makili Kroasia ing rong Piala Dunia, 2002 lan 2006, lan uga melu ing rong Kejuaraan Eropa,
2004 lan 2008. Ing Piala Donya 2006 dheweke main apik ing pertahanan, nanging sawise njupuk kuning kaping pindho nglawan Jepang dheweke ora kejawab pertandingan grup pungkasan nglawan Australia liwat penangguhan. Tanpa Kovač, Kroasia berjuang ing pertahanan karo penggantine Tomas sing nindakake handball kanggo gol pertama Australia liwat tendangan penalti. Kroasia pungkasanipun nyetak 2 × 2 karo Australia nanging dibuwang saka turnamen kasebut. Kanthi Kroasia, Leverkusen, lan Bayern, Kovač dadi kanca tim karo kakange Niko Kovač. Dhèwèké pensiun saka tim nasional ing musim gugur taun 2009, sawisé dadi kapten tim kasebut sawisé pensiun seduluré ing taun 2008.