Rampungake ukara ing ngisor iki: Konfederasi Peru-Bolivia ditentang dening negara-negara tetanggan wiwit diwiwiti, utamane Chili lan Argentina, minangka ancaman militer lan ekonomi potensial, lan dhukungan kanggo para pembangkang ing pengasingan. Ing
Perang Konfederasi dipicu ora suwe sawise dibentuk nalika Chili lan Argentina kanthi mandhiri nyerang negara kasebut. Argentina dikalahake ing taun 1837, nanging pasukan gabungan saka Chili lan Peru Utara sing dikenal minangka Tentara Restorasi Bersatu menang ing Pertempuran Yungay ing Januari 1839, sing "de facto" mungkasi konfederasi amarga Peru lan Bolivia dibalekake minangka negara independen, lan Santa Cruz mlayu menyang pengasingan. Konfederasi Peru-Bolivia resmi diumumake dibubarake tanggal 25 Agustus 1839, dening Jenderal Agustín Gamarra sawise diangkat dadi Presiden Peru.