Rampungake ukara ing ngisor iki: Sanajan ana 89 gol sing apik banget ing 165 pertandingan kanggo "Bianconeri", Inzaghi enggal-enggal diputer kanggo David Trezeguet lan tanggal 2 Juli 2001 mlebu ing AC Milan kanthi laporan 70 milyar lire, utawa 45 milyar lire awis ditambah Cristian Zenoni. (Sky Sports nglaporake jumlah total sing luwih cilik, £ 17 yuta) kanggo kampanye 2001 <unk>02 dening pelatih Fatih Terim. Juventus ngumumake manawa adol Inzaghi ngasilake bathi modal € 31.100.000 kanggo klub kasebut, nggawe biaya transfer nyata ngluwihi angka kasebut. Nanging, Inzaghi ngalami cedera lutut lan ora bisa main ing babak pertama musim iki. Sasampunipun wangsul, piyambakipun saged damel kemitraan pencetak gol ingkang kiyat kaliyan Andriy Shevchenko, lan piyambakipun enggal-enggal damel piala ingkang nyengsemaken kaliyan "Rossoneri" wonten ing sangandhaping manajer énggal Carlo Ancelotti, ing antawisipun Liga Champions 2002-03 (ing pundi Milan ngalahaken tim sakdurungipun, Juventus, ing final ing penalti), bebarengan kaliyan Coppa Italia 2002-03 (nyetak gol ing 2-2 ing babak kaping kalih), Piala Super UEFA 2003, Piala Super UEFA UEFA 2002-03 (nyetak gol ing babak kaping kalih), Piala Super UEFA 2002-03 (nyetak gol ing babak kaping tiga), Piala Super UEFA 2002-03 (nyetak gol ing babak kaping tiga), Piala Super UEFA 2002-03 (nyetak gol ing babak kaping tiga), Piala Super UEFA 2002-03 (nyetak gol ing babak kaping tiga), Piala Super UEFA 2002-03 (nyetak gol ing babak kaping tiga), Piala Super UEFA 2002-03 (nyetak gol ing babak kaping tiga), Piala Super UEFA 2002-03 (nyetak gol ing babak kaping tiga), Piala Super Italia 2002-03 lan Piala UEFA 2002-03).
2004 Supercoppa Italiana, lan 2003 <unk> 04 "Scudetto". Ing kampanye Liga Champions 2002-03, dheweke mencetak hat-trick Liga Champions kaping telu nglawan Deportivo de La Coruña ing Tahap Grup lan gol sing nemtokake ing babak perempat final nglawan Ajax, kanthi total 12 gol Eropa ing musim kasebut. Ing wulan November 2004, dheweke mlebu kontrak extension karo klub kasebut.