Rampungake ukara ing ngisor iki: Nalika Lithuania dikuwasani dening Uni Soviet ing wulan Juni 1940, Aukštuolis bebarengan karo para pejabat liyane nyambut Vladimir Dekanozov, wakil Vyacheslav Molotov, ing Bandara Kaunas. Piyambakipun tetep wonten ing Lithuania sanajan garwanipun mlayu dhateng Argentina lan piyambakipun migunakaken kontak diplomatik kanggé mbiyantu Martynas Yčas minggat dhateng Berlin. Sawise pengambilalihan Soviet, Aukštuolis kelangan pakaryan ing kementerian nanging kanthi rekomendasi saka Justas Paleckis (padha kerja bareng ing legasi Lithuania ing Riga) entuk tugas mulang basa Rusia ing Sekolah Menengah No. 1 ing Panevėžys. Dheweke minangka salah sawijining 17.500 wong Lithuania sing dideportasi menyang Siberia sajrone
Deportasi Juni ing taun 1941. Bebarengan karo sawetara wong Lithuania liyane sing misuwur, kalebu mantan presiden Aleksandras Stulginskis lan menteri Stasys Šilingas, Aukštuolis pungkasane mlebu ing Kraslag ing Krasnoyarsk Krai. Ing taun 1942, dheweke lan 16 wong Lithuania liyane maneh dicekel lan dituduh nindakake kegiatan anti-Soviet. NKVD nyaranake ukuman pati, nanging ukuman pungkasan 25 taun ing pakunjaran diumumake mung ing Februari 1952 <unk> meh telung taun sawise Aukštuolis tilar donya amarga tuberkulosis lan kekurangan gizi ing Dubravlag.