Ngrampungake ukara ing ngisor iki: Fàbregas mungkasi kekeringan gol sing dawa kanggo klub nalika dheweke mencetak gol liga pertama ing musim kasebut kanthi penyokong nglawan Sevilla ing kemenangan 3 × 2 adoh. Dheweke banjur nyetak telung gol ing Oktober, teka ing liga, Liga Champions lan
Copa del Rey. Dhèwèké nyétak gol manèh ing tanggal 25 November nalika menang 4 kanggo 0 nglawan Levante. Ing tanggal 13 Januari 2013, Fàbregas nyetak gol ing kemenangan 3-1 nglawan Málaga. Fàbregas damel hat-trick kapisanan ing kariripun nglawan Mallorca ing kamenangan 5 kanggo 0 tanggal 6 April 2013. Dheweke mungkasi musim kapindho ing Barcelona kanthi menang gelar liga pertama ing karir, kanthi rekor 100 poin. Nanging, Barcelona dibuwang ing semifinal Copa del Rey, kanggo saingan Real Madrid, lan Liga Champions, kanggo pemenang Bayern Munich. Fàbregas mungkasi musim kasebut kanthi 14 gol lan 12 bantuan ing 48 penampilan ing kabeh kompetisi.