Rampungake ukara ing ngisor iki: Müller miwiti musim 2013 <unk> 14 ing sangisoré manajer anyar Pep Guardiola kanthi main ing Piala Super Jerman. Ing tanggal 5 Agustus, Müller nyetak hat-trick nalika Bayern menang 5<unk>0 ing tim kasebut 2013<unk>14 DFB-Pokal pertandhingan babak pertama nglawan Schwarz-Weiß Rehden. Ing pambukaan Bayern 2013-14 Bundesliga, Müller ora entuk penalti kaping pisanan. Detik mengko, nylametake saka penalti flick tangan Álvaro Domínguez sing nyebabake penalti liyane sing diowahi David Alaba. Sawise iki, Müller nyatakake, "Aku isih seneng njupuk penalti, nanging aku mikir David Alaba minangka wong utama kanggo tendhangan titik saiki". Dheweke main ing
Piala Super UEFA.