Rampungna ukara iki: Kleopatra lan kakangné Ptolemeus XIII dadi raja bareng-bareng, nanging akibaté dadi perang sipil. Cleopatra mlayu sedhela menyang Suriah Romawi ing taun 48 SM nanging bali mengko taun kasebut karo tentara kanggo ngadhepi Ptolemy XIII. Minangka negara klien Romawi, negarawan Romawi Pompey Agung ngrancang Mesir Ptolemaik minangka papan perlindungan sawise kalah ing 48 SM Pertempuran Pharsalus ing Yunani nglawan saingan Julius Caesar ing Perang Saudara Caesar. Nanging, Ptolemy XIII matèni Pompey ing Pelousion lan ngirim sirahé sing dipotong menyang Kaisar, nalika sing terakhir ngrebut Alexandria kanggo nguber Pompey. Kanthi wewenang minangka konsul Republik Romawi, Caesar nyoba kanggo rekonsiliasi Ptolemy XIII karo Cleopatra. Nanging, Potheinos, penaséhat utama Ptolemy XIII, nganggep syarat-syarat Kaisar luwih disenengi Cleopatra. Dadi pasukané, sing dipimpin pisanan déning Achillas lan banjur Ganymedes ing sangisoré Arsinoe IV (saduluré Cleopatra),
ngepung Caesar lan Cleopatra ing istana. Pasukan tambahan ngangkat pengepungan ing wiwitan taun 47 SM lan Ptolemy XIII tilar donya ora suwe sawise iku ing Pertempuran Nil. Arsinoe IV pungkasane dibuwang menyang Efesus lan Caesar, saiki dadi diktator sing dipilih, ngumumake Cleopatra lan adhine Ptolemy XIV minangka penguasa Mesir. Nanging, Caesar njaga hubungan pribadi karo Cleopatra sing ngasilake putra, Caesarion (mengko Ptolemy XV), sadurunge dheweke ninggalake Alexandria menyang Roma.