Wąbrzeźno diserang dening Nazi Jerman ing September 1939, nalika Perang Donya II, lan dikuwasani dening Jerman
nganti taun 1945. Jerman nganakake penangkapan massal saka Polandia ing Oktober 1939. Udakara 1,000 wong Polandia dicekel lan dipenjara, umume ing kamp konsentrasi sementara, sing diadegake ing pabrik lokal, nanging sawetara uga ing kunjara lokal. Sawetara wong Polandia iki dipatèni ing Skrwilno antara tanggal 15 Oktober lan 15 November 1939 lan ing Nielub tanggal 17 Oktober 1939, dene umume dipateni ing pembantaian gedhe ing Łopatki lan Kurkocin (waca "Intelligenzaktion"). Saklawasé 4.000 warga Polandia saka Wąbrzeźno lan komunitas sekitar dikirim menyang kamp konsentrasi Nazi, sing diadegake ing Potulice lan Toruń, lan diusir. Wong Jerman nglarang panggunaan basa Polandia, ngilangi sekolah lan organisasi Polandia, lan nyebarake kutha kasebut karo penjajah Jerman, nanging, wong Polandia isih ngatur gerakan perlawanan Polandia sing ndhelik.