N'August 15, 1945, ndị Japan chịliri aka elu
nye ndị agha Allied. Ụbọchị abụọ ka e mesịrị, a mara ọkwa nnwere onwe nke Indonesia. E kwuru na Maluku bụ otu n'ime ógbè ndị dị na Republic of Indonesia. Agbanyeghị, nhazi na ọnọdụ nke Maluku n'oge ahụ ka a manyere ime na Jakarta, n'ihi na ozugbo ndị Japan nyefere onwe ha, ndị Netherlands Indies Civil Administration (NICA) batara Maluku ozugbo iji weghara njikwa. Ndị Dutch na-achịkwa Maluku ruo 1949, mgbe nkwekọrịta nke Dutch-Indonesian Round Table Conference, ndị Dutch kwenyere na ọbụbụeze nke Indonesia. N'oge na-adịghị anya, ndị Netherlands hapụrụ Maluku. N'ihi enweghị ntụkwasị obi miri emi nke ndị isi ndị Indonesia, nke bụ ndị Alakụba Javanese, na 1951 a kwupụtara Republic nke South Moluccas (Indonesian, Republik Maluku Selatan) na Ambon, nke ndị Dutch kwadoro. Ndị RMS nwere nkwado siri ike n'etiti ndị bụbu ndị agha colonial Moluccan. N'ihi ya, ndị agha Indonesia wakporo Maluku iji kpochapụ ndị nnupụisi ahụ. Ndị agha ndị Indonesia meriri isi ụlọ nke ndị nnupụisi RMS na Ambon na Nọvemba 1950, ebe ọgụ ndị agha nta na-aga n'ihu na agwaetiti Seram ruo 1962. Otú ọ dị, mmeri ahụ na Ambon mere ka gọọmentị RMS kwupụtara onwe ya gbapụ n'àgwàetiti ndị ahụ, na nhazi nke gọọmentị na-agba ọsọ ndụ na Netherlands. N'afọ sochirinụ, ihe dị ka ndị agha 12,000 bụ́ ndị Moluccas na ndị ezinụlọ ha gara Netherlands, bụ́ ebe ha guzobere "Republic of the South Moluccas" bụ́ ọchịchị a chụpụrụ achụpụ.