Írj folytatást erre a bekezdésre - 1806-ban a hollandiai francia megszálló hatóságok az Utrecht Egyetemet "école secondaire" (magasiskola) -ra csökkentették, de a Holland Királyság 1813-as megalapítása után visszanyerte korábbi státusát. Leiden, Leuven, Groningen, Utrecht és Ghent voltak az új állam öt egyeteme. Az egyetemek közül kettő (Leuven és Ghent) az új belga állam részévé vált, miután az adott tartományok elkülönültek.
az Egyesült Hollandi Királyságtól 1830-ban. Ennek eredményeként az Utrecht Egyetem továbbra is az egyetlen három holland egyetem egyike maradt. A francia megszállás alatt Louis Napóleon király palotát épített Utrecht központjában, amely végül az egyetemi könyvtár városközpontjává vált.