A II. világháború után visszatért a csehszlovák száműzött kormány. A normális kapcsolatok 1948-ig folytatódtak, amikor a kommunisták elfoglalták a hatalmat, és a kapcsolatok gyorsan megfagyottak. A
1968 augusztusában a Csehszlovákia szovjet inváziója tovább bonyolította az amerikai-csehszlovák kapcsolatokat. Az Egyesült Államok az Egyesült Nemzetek Biztonsági Tanácsához vitatta az ügyet, mint az Egyesült Nemzetek Alapokmányának megsértését, de a szovjetek ellen nem tettek semmit.