Írj folytatást erre a bekezdésre - Az ír választók 2008. június 12-i elutasítását a Lisszaboni Szerződés ratifikálásának egyes médiák és politikai megfigyelők tiltakozásnak tekintették Cowen és kormánya ellen. Az "Irish Independent" a sikertelen népszavazás következményét a kormány "tíz évtizedek legnagyobb politikai válságának" nevezte. Brendan O'Connor újságíró a végeredményt "egy megalázó kudarcnak nevezte Cowen és azok számára, akik ott helyezték". A Taoiseach maga vitathatatlanul káros csapást mért saját oldalára, amikor 2008. május 12-én egy rádióinterjúban elismerte, hogy nem olvasta el teljes egészében a Lisszaboni Szerződést. A szerződést végül az ír szavazók jóváhagyták, amikor a sikeres huszonnyolcadik módosítás
Az új alkotmányt a második lisszaboni népszavazáson hagyták jóvá, amelyet 2009 októberében tartottak.