Augusztusban Butler egy expedíciós csapatot irányított, akik az Egyesült Államok Haditengerészetével együtt elfoglalták Hatteras és Clark erődöt.
Észak-Karolinában. Ez a lépés, az első jelentős uniós győzelem az első Bull Run után, dicséretet kapott Washingtonban és Butler elismerést nyert Lincoln elnöktől. Ezt követően Butlert visszaküldték Massachusettsbe, hogy új csapatokat állítson fel. Ez Butlert hatalmi harcba sodorta Andrew kormányzóval, aki ragaszkodott ahhoz, hogy fenntartsa hatalmát az ezredtisztek kinevezésére, megtagadva (többek között) Butler bátyját, Andrew-t és a tábornok számos közeli munkatársát. A veszekedés egy toborzóháborút indított Butler és az állami milícia között. A vita késleltette Butler Virginiába való visszatérését, de novemberben helyette a Louisiana-i műveletekhez tartozó szárazföldi csapatok parancsnokságát kapta.