A német inváziót követően Nagy-Lengyelországot a náci Németországba foglalták be, így a tartományt később Reichsgau Warthelandnak nevezték el (a Warta folyó német neve). A lengyel és a zsidó lakosságot a nácik ember alattiaként osztályozták, és szervezett népirtásnak vetették alá, tömeggyilkosságokat és etnikai tisztogatást, sok korábbi tisztviselőt és másokat, akiket a nácik potenciális ellenségnek tekintettek, bebörtönöztek vagy kivégeztek, beleértve a hírhedt Fort VII koncentrációs táborban Poznańban. A háború záró szakaszában Poznańot erődvárnak nyilvánították, amelyet a Vörös Hadsereg elfoglalott a Poznań-i csata során.
, amely 1945. február 22-én ért véget.