A nukleinsavokat a szokásos oligonukleotid-szintézis módszerekkel, általában oligonukleotid-szintezátorban automatizálva szintetizálják, és egyedi szekvenciák szálai kereskedelmi forgalomban kaphatóak. A szálak szükség esetén gél-elektroforézis denaturálásával tisztíthatók, és az ultraibolya abszorpciós spektroszkópiával meghatározott pontos koncentrációkat több nukleinsav-kvantitási módszerrel is meg lehet határozni. A teljesen kialakult célszerkezeteket a natív gél-elektroforézis segítségével ellenőrizhetjük, amely a nukleinsav-komplexumok méretét és alakját adja meg. Az elektropézis mobilitási vizsgálata azt vizsgálja, hogy a kívánt szálak tartalmaz-e egy szerkezetet.
hogy a szerkezet tartalmazza-e az összes kívánt szálakat