A spanyol gyarmatosítás mellett a Fülöp-szigetek a közelmúltban is szenvedett az amerikai gyarmatosítástól, amely még ma is fennáll. 1898. december 10-én Spanyolország átadta a Fülöp-szigeteket az Egyesült Államoknak a Párizsi Szerződéssel. Ezzel kezdődött az amerikai gyarmatosítás hosszú időszaka, amely hatalmas szerepet játszott a Fülöp-szigeteki régészetben, mivel lehetővé tette az amerikai antropológusoknak, hogy kiterjedt régészeti helyszíneket fedezzenek fel az emberi foglalkozás és evolúció mélyreható bizonyítékával. Később, olyan régészek, mint H. Otley Beyer, képesek voltak a Fülöp-szigeteket a régészeti feljegyzésekbe helyezni olyan események révén, mint az 1904-es
A St. Louis-i Világkiállítás, amely a Fülöp-szigeteken megkezdte a régészet fejlődését.