Írj folytatást erre a bekezdésre - Pinturault 2012 októberében nem tudott eljutni a szezon kezdetére Söldenben, mivel tenisz közben sérült a bokája, és három hónapos szünetet kellett tartania. Decemberben megnyerte a második világbajnoki versenyét egy slalomban Val-d'Isère-ben, ahol a hatodik helyről a fényszórók alatt egy ragyogó második futással izgatta a hazai rajongókat. Egy fél másodperccel meggyőzően legyőzte a német Felix Neureuthert és a jövőbeli világbajnok Marcel Hirschert, aki az első futás után 0,57 másodperccel vezetett. Pinturault harmadik győzelme a svájci Wengenben volt, ahol kiváló slalom készségei voltak a kulcs. A 22. helyen végzett a lejtőn, 1,15 másodperccel megelőzve a horvát Ivica Kostelić-t. Az edzés a lejtőn volt az első alkalom, hogy lejtőn síelt hónapok óta, mivel kihagyta a szezon előtti gyorsasági edzést azután, hogy augusztusban a bal bokáján műtötték meg a tenisz közben megsérült ízületi kötéseket. Pinturault 2013-ban nem nyert érmet a világbajnokságon.
, de volt négy top-hat befejezés. Egy héttel később a negyedik világbajnokságot nyerte, az elsőt óriásszlalomban, Garmischben, Németországban. Az első futás után Pinturault második lett, 0,60 másodperccel megelőzve Hirschert. 2013. március 15-én Longines Rising Star címet kapott, mint a szezon legjobb fiatal versenyzője (23 év alatti).