De ezek a felvilágosodásbeli reformok kontraproduktívnak bizonyultak, vagy talán túl későn, hogy elnyomják a gyarmatok követeléseit. A helyettes uralkodás egész történelmét egyre növekvő belső zavargások és politikai instabilitás jellemezte. 1780 és 1782 között II. Túpac Amaru lázadása
Az Aymara vezette erőszakos lázadást indította a felső perui hegyekben, és megmutatta a nagy haragot a gyarmati hatóságok ellen mind a mestizo, mind az őslakos lakosság részéről. Huszonöt évvel később a criollók, a spanyol származású őslakosok sikeresen megvédtek magukat két egymást követő brit kísérlet ellen, hogy meghódítsák Buenos Aires-t és Montevideót. Ez erősítette önállóságuk és hatalmuk érzését abban az időben, amikor a spanyol csapatok képtelenek voltak segíteni.