Haryanto volt a második versenyző, akit a 2016-os bahreini nagydíj kvalifikációjától kikerültek.
Felipe Nasr előtt. Ez azonban azt jelentette, hogy a 20. hely miatt a Renault Kevin Magnussen-nek a bokszútból kellett indulnia, miután nem állt meg a súlyzás miatt a gyakorlat során. Ő volt az utolsó autó, aki befejezte a versenyt, 17. helyen, egy kört lemaradva. Sikerült legyőznie a másik Renault-pilótát, Jolyon Palmer-t a 21. helyre Kínában, mielőtt belekeveredett egy első körben bekövetkezett balesetben Oroszországban, amelyben Nico Hülkenberg és Esteban Gutiérrez is részt vett. Haryanto megismételte a bahreini teljesítményét Spanyolországban, a következő versenyen Monacóban karrierje legjobb 15. helyét, bár 4 kört lemaradt, és ismét az utolsó minősített befejező. A következő két futamon 19. és 18. helyen maradt, mielőtt a 16. hely Ausztriában felhívta a figyelmet a tehetségek közötti szakadékra maga és csapattársa, Wehrlein között, aki ugyanabban a versenyen szerzett Manor egyetlen pontját. Az utolsó két futamán ismét az utolsó rangsorban végzett, mivel a jövője bizonytalan volt a szponzorok hiánya miatt.