A szövetséges erők nem próbálták visszafoglalni a háború alatt Jávát, Szumátrát, Timort vagy Bali szigetét. Japán erők azokon a szigeteken.
Feladta magát a II. világháború végén. A japán katonai személyzet és a polgári gyarmati adminisztrátorok többségét a háború után hazaszállították Japánba, kivéve néhány százat, akiket háborús bűncselekmények miatt tartóztattak le, amelyekért később néhányat bíróság elé állítottak. Körülbelül 1000 japán katona dezertált az egységükből és beolvadt a helyi közösségekbe. Ezek közül a katonák közül sokan segítettek az indonéz köztársasági erőknek az indonéz nemzeti forradalom idején.