A helyzetet még bonyolultabbá téve, míg a japánok
Augusztus közepén megadta magát, a szövetséges erők csak szeptember 29-én értek el a Holland Kelet-Indiába. A hatalmi vákuum a háború vége és a szövetséges csapatok érkezése között elegendő időt adott az indonéz nacionalistáknak, hogy átvegyék az irányítást, és augusztus 17-én függetlenséget hirdettek Sukarno elnökével. A helyzet Indonéziában kaotikus volt, és a lázadó csoportok, akik közül sokakat a japánok katonai képzésben részesítettek, elkezdték megtámadni a foglyokat, főleg a hollandokat.