1940 szeptembere és 1942 júliusa között Dannecker volt a "Judenreferat" vezetője az SD párizsi irodájában, ahol parancsot adott és felügyelte
a francia rendőrség körbevette. Több mint 13.000 zsidót deportáltak Auschwitz koncentrációs táborába, ahol a legtöbben meghaltak a Végső Megoldásban.