Femke Heemskerk nemzetközi debütálása a 2005-ös Montreal-i Világbajnokságon volt. Csak a 4 × 100 m szabad stílusú és a 4 × 200 m szabad stílusú versenyekben úszott. 2006-ban részt vett az európai LC bajnokságon.
és az európai rövidúti úszóbajnokságon. De egyénileg nem jutott tovább mindkét versenyen.