Bergoglio 2013. március 13-án választották pápának, a 2013-as pápai konklávé második napján.
Ferenc pápai nevét vette fel. Ferencöt a konklávé ötödik szavazásán választották meg. A "Habemus papam" bejelentést Jean-Louis Tauran bíboros protodiákónus tette. Christoph Schönborn bíboros később azt mondta, hogy Bergoglio két természetfeletti jel alapján választották meg, az egyik a konklávéban, és ezért bizalmas, és Schönborn latin-amerikai barátai, akik Schönborn fülébe suttogták Bergoglio nevét; Schönborn megjegyezte: "ha ezek az emberek azt mondják, Bergoglio, ez a Szentlélek jele".