A csapat legjelentősebb szerződést kötött, amikor a korábbi világbajnok, Damon Hill, a jordániai F3000 program végzőse váltotta Fisichellát. A csapat a Peugeot-okat is felváltotta, amelyek Prosthoz mentek, Mugen Honda motorokkal. A szezon feléig Jordan egyetlen pontot sem tudott szerezni megbízhatósági problémák miatt. Ekkor Mike Gascoyne-t vették fel a Tyrrell-től, hogy erősítse a technikai csapatot, és a régóta dolgozó technikai igazgató, Gary Anderson néhány hónappal később lemondott. A dolgok a szezon vége felé jelentősen javultak, és az idei esőszáros Belga Nagydíjon
amelyben csak hat autó végzett, Hill Jordan első győzelmét hozta a Forma-1-ben, ami szintén Hill karrierjének 22. győzelme volt. Ralf Schumacher megédesítette a győzelmet a második helyezkedéssel. Később azonban kiderült, hogy a csapat utasításai voltak - Schumachernek utasítást kaptak, hogy ne haladjon el Hill felett. Michael mérgesen azt mondta Jordannek, hogy Ralf soha többé nem fog versenyezni a csapatban, és 2 millió fontért megvette a bátyja szerződését. Hill hatodik lett a versenyzők rangsorában, Ralf pedig tizedik. Hill utolsó körben, a Heinz-Harald Frentzen utolsó kanyarban a Suzukában lehetővé tette számára, hogy a versenyt a negyedik helyen fejezze be, és a Jordániát is a negyedik helyen szerzett a konstruktőrök bajnokságában 1998-ban (ezt mérsékelte a spekuláció, hogy Frentzen "ajándékozta" a helyet Hillnek, miután a német megerősítette, hogy 1999-ben Jordániába költözik, a Williams-szel folytatott zűrös karrierje után).