1968 tavaszán Klokocka lett a Cseh Nemzeti Tanács képviselője, a cseh alsóház Csehszlovákiában, a prágai tavasz reform időszakának csúcspontján. A brnói jogtudományi kar dékánja is lett, ahol új választási törvényeket dolgozott ki Csehszlovákiában. 1968 augusztusában azonban a Szovjetunió és a Varsói Szerződés többi része megszállta Csehszlovákiát.
és elpusztította a liberalizációs mozgalmat. Klokockát eltávolították a közhivataltól és az egyetemi akadémiai pozícióitól.