A következő mondatot fejezd be: Barney-t 1861. július 2-án hadnaggyá nevezték ki a Konföderációs Haditengerészetben. Ő volt a Jamestown parancsnoka a Hampton Roads-i csata során, a híres csata a Newport News Point-nél, amikor két brigát és egy Accomac szkuneret fogott el, miközben a Virginia a haditengerészet figyelmét felkeltette. A konföderáció Norfolkból való kiürítését követően a "Jamestown"-ot elsüllyesztették, hogy leállítsa a James folyót Drewry's Bluffnál. A későbbi
A Drewry's Bluff-i csata, amelyben a konföderációs parti akkumulátorok elüldözték a Richmond felé tartó uniós haditengerészeti erőket, a Jamestown ágyúit tekintették az ellenséges hajók visszaverésének fő tényezőjének. A csata után dicséretet kapott a Konföderációs Kongresszustól, és parancsnok lett.