Az amerikai polgárháború idején az 18th Wisconsin önkéntes gyalogságának ezredes-helyettese lett James S. Alban ezredes parancsnoksága alatt. A 18th Wisconsin 1862. februárjában szerveződött, márciusban Tennessee-be ment, és Shiloh-ban harcba szállt
egy nappal az érkezésük után. Beall a csatában megsebesült, és a lábát a térd alatt amputálták. Alban ezredest megölték, valamint a ezred harmadik parancsnokát, Josiah W. Crane őrnagyot is. Beall felépülése után a New York-i Elmira-ban lévő hadifogolytábor parancsnoka lett, ahol a foglyok "öreg szöges láb" becenevvel ismerték, és azzal vádolták, hogy ismétlődő kegyetlenséggel és bántalmazással járt.