Az édesapja, akit szintén Isaac Newtonnak hívtak, három hónappal korábban halt meg. Korábban született, Newton még kisgyerek volt; édesanyja, Hannah Ayscough azt mondta, hogy egy negyed pohárba is beleférhetett volna. Amikor Newton három éves volt, édesanyja újraházasodott, és az új férjével, Barnabas Smith tiszteletes tiszteletesével költözött, és a fiát anyja anyai nagymamája, Margery Ayscough gondozásába hagyta. Apja nem kedvelte az édesapját, és ellenségeskedést tanúsított édesanyja iránt, mert feleségül vette őt.
1665-ben