Bonaga először Panamában játszott az UNCAF Nemzetek Kupája 2009-es félfináléjában, 2009. január 30-án utolsó percben pótolva Honduras ellen, és 2015. május 1-jéig összesen 23 meccset játszott, 1 gólt szerzett. 2 FIFA Világbajnokságon képviselte országát és játszott a 2011-es FIFA Világbajnokságon.
és a 2013-as CONCACAF Aranykupát. 2013. január 10-én gólt szerzett Guatemala ellen egy barátságos mérkőzésen a 67. percben.