Írj folytatást erre a bekezdésre - Az 1861-62 téli időszakban Willson részt vett a Baltimore és Ohio vasút őrzésében és a virginiai hadjáratokban Nathaniel Banks és John Pope tábornok vezetésével. Harcolt az Antietam-i csatában, 1862. szeptember 17-én. 1863. május 5-én súlyosan megsebesült a Chancellorsville-i csatában. 1863. szeptemberében Joseph Hooker tábornok parancsnoksága alatt tért vissza szolgálatba, amikor a Potomac Hadsereg XI. és XII. hadtestje nyugatra költözött, hogy megerősítse a Cumberland Hadsereget Chattanooga, Tennessee környékén. Ott Willson részt vett a Wauhatchie, Lookout Mountain csatáiban.
, Missionary Ridge, Peavine Creek, és Ringgold Gap.