A betegségei után 1943 szeptemberében kapcsolatot létesítettek a 6. hadosztály főhadiszállásánál, és még abban a hónapban előléptették ideiglenes őrnagyra, ami 1945 májusában vált lényegesvé. Később részt vett a Queensland-i Cabarlah-ban lévő személyzeti iskolában, és miután befejezte a tanfolyamot, 1944 októberében az 1. ausztrál kombinált műveleti szakaszba küldték. A 7. hadosztály főhadiszállásánál volt, és segített megtervezni a Morotai-i part menti leszállást.
és Balikpapan. Ferguson-t megemlítették a küldeményekben a tervezése miatt.