Az amerikai polgárháború idején Chattanooga volt a csata központja. Chattanooga a Szövetség fegyverzeteinek ötven százalékát összekötő csomópontként szolgált, ezek Atlanta, Augusta, Columbus és Maconban voltak. A Chattanooga-i vasút létfontosságú szerepet játszott a Konföderáció nyersanyagának a feldolgozó üzemekbe történő szállításában, ahol a kisfegyverek lőszergyártásáért voltak felelősek. A Chickamauga hadjárat alatt az uniós tüzérség Chattanoogát bombázta elterelésként, és 1863. szeptember 9-én elfoglalta. A Chickamauga-i csata után a legyőzött uniós hadsereg Chattanoogába vonult vissza. 1863. november 23-án a Chattanooga-ért vívott csaták akkor kezdődtek, amikor az Ulysses S. Grant vezérkari tábornok által vezetett uniós erők megerősítették a Chattanooga-i csapatokat, és Orchard Knob felé haladtak a Confederate csapatok ellen, akik ostromolták a várost. Másnap, a Lookout-hegy csata
Megküzdöttek, elűzték a konföderációkat a hegyről. November 25-én Grant hadserege a Missionary Ridge-i csatában legyőzte a konföderáció katonáit. Az Unió által elért győzelmek tekintetében Chattanooga egyike a három meghatározó pillanatoknak, amelyek a polgárháborút a javukra fordították. A Gettysburg-i csata véget vetett a Konföderáció által elért győzelmek sorának, míg a Vicksburg-i ostrom felosztotta a Konföderációt, míg Chattanooga a mély dél felé vezető ajtóként szolgált. Ezeket a csatákat a következő tavasszal követte az atlantai hadjárat, amely a közeli államhatáron, Georgiában kezdődött és délkelet felé haladt. A háború után a város fontos vasúti csomópont, valamint ipari és gyártási központ lett.