A Braves-nél maradva, Neagle-nek volt a legjobb szezonja, 20 x 5 volt, 2,97 ERA-val. Neagle a Braves csapatának kezdőjátszója volt az első rendszeres mérkőzésen a Turner Fielden, 1997. április 4-én. Egy újabb All-Star választást szerzett, és harmadik lett a Cy Young Award szavazáson. A negyedik meccsen...
1997-ben a National League Championship Series-ben Neagle teljes mérkőzésre zárta ki a meccset.