1862. március 1-jén Timrod közlegényként vonult be a hadseregbe a 20. dél-karolinai ezred B századába, és különleges szolgálatra küldték, mint a ezred főhadiszállásánál szolgáló hivatalnokot, de a tuberkulózisa megakadályozta, hogy sok szolgálatot végezzen, és hazaküldték. A Shiloh véres csata után
, újra megpróbálta élni a tábor életét a Charlestoni "Mercury" nyugati háborús tudósítójának, de ez is rövid életű volt, mivel nem volt elég erős a durva feladathoz.