Írj folytatást erre a bekezdésre - Madani utasításai szerint részt vett és vezetővé vált az indiai függetlenségi mozgalomban. India 1947-es felosztását követően Chowdhury támogatta az újonnan létrehozott Pakisztán fejlődését, a Jamiat Ulema-e-Hind szervezet vezetésével együtt dolgozva. Banglades függetlenségének kihirdetése után
1971-ben megpróbálta megakadályozni a pakisztáni hadsereg által elkövetett erőszakos cselekményeket. Amikor ötven rokonát Ronokaliban sarokba szorította a hadsereg, Chowdhury sikeresen kérte a katonákat, hogy kíméljék meg őket. Egy másik alkalommal képes volt közbelépni, és megmenteni hét hindu életét hasonló körülmények között. Chowdhury később aktív szerepet játszott a bangladesi Khilafat mozgalomban, Hafezzi Huzur vezetése alatt dolgozva, és számos konferenciáján elnökölt.