Írj folytatást erre a bekezdésre - A szigetet a japánok elfoglalták 1942 elején. A Morotai déli síkságát az amerikai erők elfoglalták 1944 szeptemberében a Morotai-i csata során.
, és a szövetségesek Fülöp-szigeteki inváziójának állomáspontjaként használták 1945 elején, és Borneóban az év májusában és júniusában. A japán katonát, Teruo Nakamurat 1974-ben fedezték fel a Morotai dzsungelben, mint a második világháború japán katonáinak egyikét, akik kitartottak a japán hadsereg megadása után.