Írj egy folytatást erre a bekezdésre - A görög-olasz háború kitöréséről
1940-ben Karouzou és férje (más régészek, múzeumi őrök és családjukkal együtt) elpakolták a múzeum gyűjteményeit a biztonság érdekében a második világháború idején. Karouzou később így emlékezett vissza: "Az emberek büszkeségével biztosítottam arról, hogy a háború végén, amikor a dobozokat kinyitották, és a régiségeket megkapták, annak ellenére, hogy [a csomagolási folyamat] végzetes felügyelete nem volt elégséges, egyetlen arany tárgy, egyetlen értékes ékkő sem hiányzott". Amikor 1941-ben a német hadsereg megszállta Athént, a Karouzous család volt az egyetlen görög régész, aki tiltakozásul visszavonta tagságát a Német Régészeti Intézetben. A II. világháború vége után ők voltak a felelősek a múzeumi gyűjtemények újratelepítéséért, a Karouzou által készített katalógusok felhasználásával; ez az újratelepítés 1947-ben fejeződött be.