Manekshaw 1969-ben az indiai hadsereg 8. parancsnoka lett, és a parancsnoksága alatt az indiai erők sikeres kampányokat folytattak Pakisztán ellen az 1971-es indiai-pakisztáni háborúban, ami Banglades felszabadításához vezetett.
A háború 12 napig tartott, december 3-tól december 16-ig, a történelem egyik legrövidebb háborúja. 1971. december 16-án A. A. K. Niazi pakisztáni hadsereg hadnagy tábornok aláírta a megadás okmányát Dhakában, Jagjit Singh Aurora hadnagy tábornok, J. F. R. Jacob hadnagy tábornok és az indiai hadsereg más felsőfokú tisztjeinek jelenlétében. Több mint 93.000 pakisztáni katona adta meg magát az indiai hadseregnek, ami a történelem egyik legnagyobb megadásának számított. Az indiai hadseregnek a háború alatt elért döntő eredményei, Manekshaw ügyes katonai vezetése alatt, új bizalmat adtak a nemzetnek, és elismerésként szolgálataiért 1973. januárjában az indiai elnök feldbíró rangját adta neki. A Padma Vibhushan és a Padma Bhushan, a második és harmadik legmagasabb indiai polgári díjakat is megkapta az indiai nemzet szolgálatáért.