1863 júliusától 1864 januárjáig, miközben felépült a sebekből, David Tod, Ohio kormányzó személyzetében szolgált, és vezette az Ohio-i milícia egységeit, válaszul Morgan Raid-ra. Később a Kentuckyban és Tennesseeben a XXIII. hadtest 4. hadosztálya 3. zászlóaljának parancsnoka volt, és részt vett Sherman Atlanta-i hadjáratában a Rocky Face Ridge és Resaca csatáiban.
- Igen. Runkle-t 1864. július 21-én tiszteletteljesen felsorakoztatták, és 1864. augusztus 29-én ezredeshelyettesnek nevezték ki a veterán tartalékos testületben, ahol a háború végéig a 21. ezred parancsnoka volt.