A polgárháború kitörése után 1862-ben lemondott a törvényhozói helyről, hogy beiratkozzon a 24. Iowa Önkéntes Gyalogság Ezredbe. Katona lett, de a század kapitányává választották. A háború során a hadseregben maradt, kisebb sebeket kapott a Champion Hill (Mississippi) és
Winchester (Virginia). 1864. szeptemberében őrnagy lett, 1865 januárjában pedig ezredeshelyettes, és 1865 augusztusában vonult ki.