Írj folytatást erre a bekezdésre - Prost csatlakozott a Ferrarihoz 1990-ben, és ő volt az első versenyző, aki az Enzo Ferrari 1988-as halála után csatlakozott a csapathoz. Ő helyettesítette Gerhard Berger-t a Ferrarinál, és a brit Nigel Mansell-el partnerkedett (Berger vette Prost helyét a McLarennél). Mint a világbajnok, Prost átvette a csapat vezető versenyzőjének a posztját, és azt mondták, hogy ebben a helyzetben játszott. Mansell emlékezik egy olyan incidensre, amikor az 1990-es brit nagydíjon az autó, amit vezetett, nem kezelte ugyanúgy, mint az előző versenyen, ahol pole pozíciót foglalott el, és később megtudta a csapat mechanikusaitól, hogy Prost látta, hogy Mansellnek felsőbbrendű autója van, és cserélte őket Mansell tudása nélkül. Prost öt versenyt nyert a Ferrarinak abban az évben, Brazíliában.
, Mexikó, Franciaország, Nagy-Britannia és Spanyolország. Ezek közül kiemelkedő volt a Mexikói Nagydíj, ahol megnyerte, miután a 13. helyen indult. Mind a mexikói, mind a spanyol versenyen Mansell vezette a Ferrari 1×2 befejezéséhez. A bajnokság ismét a szezon utolsó előtti fordulójára került Japánban, Prost kilenc ponttal maradt a McLaren-i ellenfele, Ayrton Senna mögött. Mint 1989-ben, egy vitatott ütközés a kettő között rendezte a versenyt. Az első kanyarban Senna, ahogy egy évvel később bevallotta, szándékosan Prost autójába vezette a versenyautóját, mindkettőjüket kivonta a versenyből, és a címet saját javára pecsételte. "Az, amit tett, undorító volt" - mondta Prost. "Egy értéktelen ember". Prost hét ponttal zárta a szezont Senna mögött, és a Ferrari csapata második lett a McLaren után.