Egyidejűleg, Portugália elutasítása, hogy elkötelezze magát a kontinens rendszer mellett, és Spanyolország kudarca, hogy megtartsa azt, vezetett a félsziget-háborúhoz és az ötödik koalíció háborújának kitöréséhez. A franciák elfoglalták Spanyolországot és spanyol kliens királyságot alapítottak, ezzel véget vetve a két ország közötti szövetségnek. Hamarosan az Ibériai-félszigeten komoly brit beavatkozás következett, míg az Antwerpen elfoglalására tett brit erőfeszítés kudarcot vallott. Napóleon felügyelte a helyzetet Ibériában, legyőzve a spanyolokat.
, és kiűzi a briteket a félszigetről. Ausztria, amely a harmadik koalíciós háborúban elvesztett területek visszaszerzésére törekedett, megtámadta Franciaország keleti európai ügyfélállamait. Napóleon legyőzte az ötödik koalíciót Wagramnál.