Az AU megpróbált közvetíteni a 2011-es líbiai polgárháború korai szakaszában, öt elnökből álló "ad hoc" bizottságot (Denis Sassou Nguesso kongói elnök, Amadou Toumani Touré mali elnök, Mohamed Ould Abdel Aziz mauritániai elnök, Jacob Zuma dél-afrikai elnök és Yoweri Museveni ugandiai elnök) alakítva, hogy békét közvetítsenek. Azonban a NATO vezette katonai beavatkozás kezdete
2011 márciusában megakadályozta, hogy a bizottság Líbiába utazzon, hogy találkozzon a líbiai vezetővel, Muammar Kadhafival. Az AU mint testület határozottan ellentmondott az ENSZ Biztonsági Tanácsának azon döntésének, hogy repülési tilalom zónát hozzon létre Líbia felett, bár néhány tagország, mint például Botswana, Gabon, Zambia és mások kifejezték a határozat támogatását.