2003-ban Schumacher ismét versenyzett Williams-szel Montoya mellett. Januárban nem tudott részt venni a téli teszteken, a szezon előtt, a visszatérő hátfájás miatt, bár később februárban visszatért. A szezon első felében jól teljesített: Schumacher pontokat szerzett az első hét versenyen, és a szezon első dobogóját a kanadai második helynek köszönhetően biztosította. Schumacher az eredményeket az európai és a francia nagydíj egymást követő győzelmeivel támasztotta alá. Sikerült kilencedik helyezést érnie
Nagy-Britannia. A Német Nagydíjon Schumacher az első körben vonult vissza, miután összeütközött Rubens Barrichellóval és Kimi Räikkönennel, amiért a következő versenyen 10 helyű büntetést kapott. A Williams sikeresen fellebbezett a döntés ellen, és Schumachernek sikerült másodiknak minősülnie a Magyar Nagydíjon, ahol negyedik lett.