Amikor Jean-Charles Pichegru-t átvették az "Észak hadseregének" vezetésére 1794 januárjában, Michaud-ot kissé akaratlanul emelték a hadsereg parancsnokságára. Abban az évben ő vezette a sereget Schifferstadtban és a Vosges-hegységben. A hadsereget 1795. áprilisában egyesítették a "Rhin-et-Moselle hadseregével". 1800-ig ő irányította a belső területeket, amikor a Mincio-nál vezette a csapatokat.
Olaszországban. 1805 és 1813 között Hollandia és Észak-Németország katonáinak parancsnoka volt az Első Francia Birodalom idején. 1814-ben nyugdíjba vonult, és 1835-ben halt meg. MICHAUD egyike azoknak a neveknek, amelyek a 13. oszlopban, a diadalív alatt vannak felvázolva.