Egy muszlim csoport, a Rabedis néven ismert, akik lázadtak Cordoba-ban Al-Andalusban (Andalúzia a mai Spanyolországban), áttelepedtek Volubilisban 818-ban. Bár Volubilisban még több évszázadig éltek emberek, a 14. században valószínűleg szinte elhagyatott volt. Leo Africanus leírja a falakat és kapukat, valamint Idris sírját, amelyet csak két vagy három kastély őriz. A testét később Moulay Idriss Zerhounba vitték, ahol egy nagy mauzóleumot építettek neki. A város nevét elfelejtették, és a helyiek "Ksar Faraounnak" vagy "Fáraó kastélyának" nevezték el, utalva arra a legendára, hogy az ókori egyiptomiak építették. Mindazonáltal néhány épülete még mindig állt, bár romokban, egészen a 17. századig, amikor Moulay Ismail kirabolta a helyszínt, hogy építőanyagot biztosítson új császári fővárosának, Meknesnek. Az 1755-ös lisszaboni földrengés
további súlyos pusztítást okozott. John Windus angol régészeti kutató azonban már 1722-ben megrajzolta a helyet. Windus az 1725-ben megjelent "Utazás Mequinezbe" című könyvében így írja le a jelenetet: