A hidegháború idején a 13 AF a Fülöp-szigeteken maradt, a nemzet légvédelemét biztosítva, és a Csendes-óceáni Légierő Számos Légierők (PACAF) egyikévé vált. A koreai háború idején az egységek állomásozóhelyet biztosítottak a háborús zónába rendelt emberek és felszerelések számára. Ahogy a vietnámi háború fokozódott az 1960-as évek végén és az 1970-es évek elején, a 13th AF parancsnokságot és irányítást biztosított a Thaiföldön állomásozó USAF egységek számára, egységei harci küldetéseket végeztek egész Indokínában 1973 augusztusáig. 13 AF egységet, akiket utoljára harcba vettek a
SS Mayaguez incidens 1975 májusában.