Miután Okinawa biztonságban volt, a Harmadik Flotta a Japán elleni műveletekre koncentrált. 1945. július 10. és 29. között a "Merrimack" támogatta a japán célpontokra irányuló, túlnyomó erővel rendelkező támadásokat, amelyek felgyorsították a háború végét. Japán kapitulációját követően
1945. augusztus 15-én a "Merrimack" többször is hajózott az Egyesült Államok nyugati partja és Kelet-Ázsia között, olajat szállítva a Japán megszállását támogató hajók számára, amelyek Kína és Korea partjainál működtek. 1949 októberében a katonai tengeri szállítási szolgálathoz (MSTS) került hozzárendelve, röviddel az inaktiválás előtti felülvizsgálat megkezdése előtt. A Merrimack-ot 1950. február 8-án állították ki a szolgálatból, és az atlanti tartalékflotta részévé vált a texasi Orange-ban.