Unser tovább fejlődött a CART pályán, 1986-ban negyedik lett, 1987-ben harmadik, 1988-ban második, és végül 1990-ben megnyerte a sorozatot. 1989-ben Unser közel volt az első Indianapolis 500 győzelméhez, de miközben Emerson Fittipaldival harcolt a vezetésért, a két kerék megérintette egymást, és Unser kiforgott, a falba ütközve, és véget vetett esélyeinek. Ez a verseny a figyelemre méltó sportérzetének bemutatására emlékezik, amikor a Kis Al kiugrott a roncsolt versenyautójából, és Fittipaldi-nak "ugró ujjait" adta, miközben óvatosan vezetett Unser mellett. Unser 1992-ben Indyben járt.
Scott Goodyeart egy másodperc 0.043-as különbséggel legyőzte, ez volt a legközelebbi eredmény az Indianapolis 500 történetében.