A szövetséges erők nem próbálták visszafoglalni a Java, Szumátra, Timor vagy Bali szigetét a háború alatt. A szigeteken lévő japán erők megadták magukat.
a II. világháború végén. A japán katonai személyzet és a polgári gyarmati adminisztrátorok többségét a háború után hazaszállították Japánba, kivéve néhány százat, akiket háborús bűncselekmények miatt tartóztattak le, amelyekért később néhányat bíróság elé állítottak. Körülbelül 1000 japán katona dezertált az egységükből és beolvadt a helyi közösségekbe. Ezek közül a katonák közül sokan segítettek az indonéz köztársasági erőknek az indonéz nemzeti forradalom idején.