A 13. hadosztály kezdetben Takada városában, a mai Jōetsu-ban, Niigata-ban, a Niigata prefektúrából állt fel Haraguchi Kensai hadnagy parancsnoksága alatt. A Szahalin elfoglalásának független megbízását kapta.
a Portsmouth-i Szerződés megkötése előtt, 1905. július 7-én, csak három hónappal a létrejöttük után a Szahalin-szigeten szálltak le, és 1905. augusztus 1-jéig biztosították a szigetet. Sikeres művelete eredményeként Japánnak a Portsmouth-i Szerződés során a déli Karafuto-t adták, amely Japán néhány területi nyereségének egyike volt a háború alatt.