Az NTFS v3.0 több új funkciót is tartalmaz az elődöknél: ritka fájl támogatást, lemezhasználat kvótákat, reparse pontokat, elosztott link nyomon követést és fájlszintű titkosítást, amelyet titkosító fájlrendszernek (Encrypting File System, EFS) neveznek.
NTFS v3.0