A következő szezont a 2012-es Supercoppa Italiana megnyerésével kezdte.
Napóleon. A szezonban debütált az európai bajnokságban, és az első UEFA Bajnokok Ligájának gólját az 8-as döntőben a Celtic elleni 3-0-os idegen győzelemben szerezte meg. Egy másik gólt szerzett a versenyen, amikor a Juventus eljutott a negyeddöntőbe, csak hogy a Bayern München végső bajnoka kikerüljön. Matri a harmadik szezonját a klubban azzal fejezte be, hogy megnyerte a második egymást követő Serie A címét. Második Supercoppa Italiana-ját a következő szezon elején, 2013. augusztus 18-án nyerte meg a Juventus, amikor a Juventus 4-0-ra legyőzte a Laziót, mielőtt még abban a hónapban elhagyta a klubot.