Mivel az ellenőrző tanács csak a négy tag egyetértésével tudott eljárni, ez a lépés lényegében bezárta az intézményt, miközben a hidegháború a szovjet berlini blokád idején érte el a csúcspontját.
1948-49-ben. A Szövetséges Ellenőrző Tanács nem szűnt meg hivatalosan, de megszűnt minden tevékenység, kivéve a Négyhatalmi Hatóságok működését, nevezetesen a Spandau Börtön vezetését, ahol a nürnbergi perekben elítélteket 1987-ig tartották, és a berlini légibiztonsági központot.