Írj folytatást erre a bekezdésre - Sok templomot károsítottak vagy lerombolták a horvát háború alatt (1991 <unk> 1995). A zagrebi, a karlováci, a szlavóniai és a dalmátiai egyházmegyék püspökei és papjai, valamint a hívek többsége menekült lett. Az utóbbi három szinte teljesen elhagyatott volt a szerbek kivándorlása után Horvátországból 1995-ben (Vihar hadművelet). Dalmácia eparchiájának székhelye is ideiglenesen Kninba költözött, miután megalapították az önkiáltott Szerb Krajina Köztársaságot. A szlavón eparchiának székhelye Pakracból Daruvarba költözött. A Vihar hadművelet után
, két kolostor különösen sérült, a Krupa kolostor 1317-ben épült, és a Krka kolostor 1345-ben épült.