1856-ban Kekulé Privatdozent lett a Heidelbergi Egyetemen. 1858-ban a Ghenti Egyetemen lett professzor, majd 1867-ben Bonnba hívták, ahol pályafutása hátralévő részében is aktív maradt. Az olyan elődök, mint Williamson, Edward Frankland, William Odling, Auguste Laurent, Charles-Adolphe Wurtz és mások ötleteire alapozva, Kekulé volt a kémiai szerkezet elméletének fő megfogalmazója (1857<unk>58). Ez az elmélet az atomi valencia eszméjéből indul ki, különösen a szén tetravalenciájából (amit Kekulé 1857 végén bejelentett), és a szénatomok egymáshoz kötődő képességéből (amelyet 1858-ban közzétett egy cikkben), a szerves atomok kötődésének meghatározására.
kémiai szerkezete