Írj folytatást erre a bekezdésre - A Konföderáció idején a törvényszéki végrehajtójuk birtokolt egy kastélyt a Limmat jobb partján, ellenőrzése alatt tartva a hídhoz való hozzáférést. A svájci parlament 1426-tól 1712-ig többször is találkozott Badenben, így Baden egyfajta főváros lett Svájc számára. A Városháza ('), ahol a parlament ülésezik, még mindig látogatható. A XV. század folyamán a város újra népszerűvé vált gyógyfürdőként ('). A városban 1526 május 21-től június 18-ig tartották a transzubstanciacióról szóló híres vitát. Bár Zwingli nem volt hajlandó személyesen részt venni, egész időtartama alatt kiadványokat nyomtatott, és segédjét, Johannes Oecolampadiust küldte, hogy vitatkozzon Johann Eck és Thomas Murner ellen. Végül a többség a reformisták ellen döntött, de egy jelentős blokk is megjelent a javukra. Johann Pistorius 1589-ben vitát tartott a városban. Stein-t 1658-1670 között megerősítették, de az erődöt 1712-ben elhagyták. 1714-ben a Rastatt és Baden egyezmények véget vetettek a Franciaország és a Habsburgok közötti ellenségeskedésnek, a spanyol örökösödési háború utolsó színterén. Egy másik Bádeni Szerződés véget vetett a toggenburgi háborúnak
a protestáns és katolikus svájci kantonok között 1718-ban. Baden 1798 és 1803 között Baden kanton fővárosa volt, amikor Aargau kanton jött létre.