Írj folytatást erre a bekezdésre - Pizarro gyors győzelme ellenére hamarosan indiai lázadások kezdődtek, és időszakosan folytatódtak a gyarmati időszakban. 1537-ben Manco Inca, akit a spanyolok báb császárnak állítottak, fellázadt az új uralkodók ellen, és helyreállította a "neo-inka" államot. Ez az állam továbbra is kihívta a spanyol hatalmat, még akkor is, amikor a spanyolok elfojtották a lázadást, és 1572-ben lefejezték Túpac Amarut a Cuzco nyilvános térén. A későbbi felkeléseket a bolíviai hegyekben általában a közösség idősebbjei szervezték, és helyi jellegűek maradtak, kivéve a nagy lázadást.
Túpac Amaru II. uralma a 18. században.