A mészárlások véget értek, amikor a vietnámi hadsereg
1978-ban megtámadták és megdöntötték a Vörös Khmer rezsimet. 1979 januárjáig 1,5-2 millió ember halt meg a Vörös Khmer politikája miatt, köztük 200.000-300.000 kínai kambodzsai, 90.000 muzulmán és 20.000 vietnámi kambodzsai. 20 000 ember ment át a 21-es biztonsági börtönben, az egyik 196 börtönből, amit a Vörös Khmerek működtetett, és csak hét felnőtt élte túl. A foglyokat a Killing Fields-re vitték, ahol kivégezték őket (gyakran pálcával, hogy megspórolják a golyókat), és tömegsírokba temették. A gyermekek elrablása és tanítása széles körben elterjedt volt, és sokakat rábeszéltek, vagy arra kényszerítettek, hogy kegyetlenségeket kövessenek el. 2009-ben a Kambodzsa Dokumentációs Központ 23.745 tömegsírot térképezett fel, amelyek körülbelül 1,3 millió feltételezett kivégzés áldozatát tartalmazták. Úgy vélik, hogy a népirtás halálesete 60%-át a közvetlen kivégzés okozta, míg más áldozatok éhezés, kimerültség vagy betegség miatt haltak meg.