San Juan megerősítése folytatódott; 1634-ben Spanyolország IV. Fülöp megerősítette San Cristóbal erődöt, valamint a várost körülvevő hat erődítményt. 1702-ben az angol politikus megtámadta a San Juan észak-nyugati partján található Arecibo városát, a spanyol politikus nélkül. 1797-ben a franciák és az Egyesült Királyság háborúba kezdtek. A britek megpróbálták meghódítani San Juan szigetét, körülvették San Felipe del Morro erődöt és La Fortaleza-t. A lakosok elmenekültek a városból, de a spanyolok Juan de Haro kormányzó vezetésével képesek voltak elűzni a holland csapatokat a San Felipe del Morro erődből. San Juan megerősítése folytatódott; 1634-ben Spanyolország IV. Fülöp megerősítette San Cristóbal erődöt, valamint hat erődöt, amelyek egy sor homokköves falakkal kapcsolódtak össze a várost.
7 000 fő