A háború után Beszarábia teljes mértékben a Szovjetunió része lett. Besszarábia nagy része a Moldaviai Szovjetunióvá vált, fővárosának Csisinau volt; Besszarábia kisebb részei az ukrán Szovjetunió részévé váltak. Röviddel a
A szovjet megszállás alatt a politikai és társadalmi elitet deportálták a szovjet hatóságok. Chişinău egykori polgármesterei, mint Teodor Cojocaru és Pantelimon V. Sinadino szovjet börtönökben haltak meg. A szovjet megszállás után a szovjet hatóságok 1940-ben lerombolták a kapitólium farkasát és a Simion Murafa, Alexei Mateevici és Andrei Hodorogea emlékművét. A szovjetellenes szervezeteket, mint a Demokrata Agrárpárt, a Szabadságpárt, a Vocea Basarabiei-t súlyosan megfenyegették.