A 21. században a haditengerészeti minisztérium előtt álló változó fenyegetés egyre nagyobb elismerése, ami a terrorista
A 2001 szeptember 11-i jemeni bombázás és a 2001 szeptember 11-i támadások miatt az NCIS átváltoztatta az Anti-Terrorist Alert Center-et a Multiple Threat Alert Center-re (MTAC) 2002-ben.