Az aminosavak, amelyek inkább a spirális konformációkat alkalmazzák a fehérjékben, közé tartoznak a metionin, az alanin, a leucin, a glutamát és a lizin ("MALEK" az aminosav 1-betűs kódjaiban); ezzel szemben a nagy aromás maradványok (triptofan, tirozin és fenilalanin) és a Cβ-ágazó aminosavak (isoleucin, valon, és threonstrin) inkább a β- és β-ágazásokat alkalmazzák. Azonban ezek a preferenciák nem elég erősek ahhoz, hogy megbízható módon megjósolhassák a második szerkezetből származó konformációk sorrendjét.
másodlagos szerkezet