Írj folytatást erre a bekezdésre - A Peru-Bolivia Konföderációt a szomszédos országok kezdettől fogva ellenezték, különösen Chilét és Argentínát, mint potenciális katonai és gazdasági fenyegetést, és a száműzetésben élő disszidensek támogatását. A Konföderáció háborúja
Nem sokkal a megalakulása után indult, amikor Chile és Argentína önállóan megtámadta az országot. Argentína 1837-ben vereséget szenvedett, de a chilei és az észak-perui ellenzékiek egyesített ereje, az Egyesült Restaurációs Hadsereg, győzedelmeskedett a Yungay-i csatában 1839 januárjában, amely "de facto" véget vetett a konföderációnak, mivel Peru és Bolívia független államokként lettek helyreállítva, és Santa Cruz száműzetésbe menekült. A Peru-Bolivia Konföderációt 1839. augusztus 25-én hivatalosan feloszlatottá nyilvánította Agustín Gamarra tábornok, miután Peruban elnök lett.