1943. december 1-jén a "Tsugaru" a harmadik déli expedíciós flottához került. 1944. március 24-én Palautól a Fülöp-szigeteken lévő Balabac-szoros bányászatára indult, majd Balikpapan-ban állomásozott Borneóban. Az egyik aknája az egyik aknája volt, ami elsüllyesztette a hajót 1944 júliusában. Május 31-én a "Tsugaru" a "KON" művelethez került.
(a Biak-i segély), erősítéseket szállít Zamboanga-ból Mindanao-ra, hogy ellensúlyozza az amerikai partra szállásokat. Június 21-én, miután Sorongból, Új-Guineából a Halmahera-szigetre indult, a "Tsugaru"-t a holland királyi haditengerészet "K-XIV" tengeralattjárója torpedózta, ami súlyos károkat okozott. Az ideiglenes javítás után megpróbált elérni Manilát, de június 29-én a Biak közelében észlelték, amely hat torpedót lőtt ki. A kettő a "Tsugaru"-t találta el, amely kevesebb, mint 25 perccel később elsüllyedt, a legénység nagy részének veszteségével, beleértve a parancsnokot, Nakatsu kapitányt is.