Az Atkinson másik alkotása, a szerencsétlen Mr. Bean, először 1990-ben, újév napján jelent meg a Thames Television félórás speciális műsorában. Mr. Bean karakterét hasonlították a modern Buster Keatonhoz, de Atkinson maga állította, hogy Jacques Tati Monsieur Hulot karaktere volt a fő inspirációja. Mr. Bean több folytatása 1995-ig jelent meg a televízióban, és a karakter később egy játékfilmben jelent meg. Bean (1997) rendezője Mel Smith, Atkinson kollégája a Nem a kilenc órás hírekben. Egy második film, Mr. Bean's Holiday, 2007-ben jelent meg. 1995-ben és 1996-ban Atkinson Raymond Fowler felügyelőt alakította az Elton Benforth által írt The Thin Blue Line televíziós szitkomban, amely egy fiktív rendőrségen játszódik.
Mr. Bean's Holiday, 2007-ben jelent meg