Martin Vagner (Csehszlovákia, Jaroměř, 1984. március 16. -) cseh jégkorong védő, jelenleg a HC Hradec Králové csapatában játszik. Az első körben, 26. helyen draftolták a Dallas Stars a 2002-es NHL Entry Draft-ben. De 2004-ben újra belépett a draftba.
és a kilencedik körben, 268. helyen a Carolina Hurricanes választotta ki. Még nem játszott a Nemzeti Hoki Ligában, karrierjét a Cseh Extraligában töltötte.