Ugyanebben az időszakban vonult be az osztrák és
Magyar forradalmak. Sok románhoz hasonlóan Mocioni is támogatta az egykori liberális reformokat, és hű maradt I. Ferenc Józsefhez, ellenezte a magyar nacionalizmus felemelkedését. Ez a pro-magyar forradalmár, Eftimie Murgu ellen fordult, aki számos más banát lakos hűségét is megszerezte. A magyar állam úgy reagált, hogy elkobozta Mocioni vagyonát, és száműzetésre kényszerítette. 1849 szeptemberében Bécsben volt, ahol Románia képviselőjeként tevékenykedett Ioan Dobran és Vincențiu Babeș mellett. Petru Mocioni a banátiai románok "megbízható embere"ként is tevékenykedett ott, és politikai javaslatokat terjesztett elő a Franz Stadion számára.