2002-ben úgy döntött, a Telefónica World Series-re koncentrál, amit megnyert. 2003-ban Zontát a Toyota F1 csapatának tesztpilótájává vették fel, és 2004-ben megtartotta a pozíciót. A szezon vége felé a csapat kirúgta Cristiano da Mattát a versenypénztől, és Zonta négy nagydíjban vezetett. A
Belgiumban, negyedik helyen futott, három körre a céltól, amikor a motorja meghibásodott. Suzukában a csapat Jarno Trullit bérelte fel, és Zontának ki kellett ülnie az eseményen, de a csapat megengedte neki, hogy versenyezzen otthoni versenyén, a brazil nagydíjon, amelyet 13. helyen végzett. 2005-ben Toyota tesztpilótájaként folytatta, Olivier Panis veterán francia pilótával együtt. Az USA nagydíján később abban az évben helyettesítette a sérült Ralf Schumachert, és elfoglalta a helyét a kezdőlapon, csak a Toyota, mint a többi hat Michelin-csapat, biztonsági okok miatt visszavonult a versenyből. 2006-ban Zonta a Toyota-val folytatja a csapat harmadik és tesztpilótájaként. 2006. szeptember 6-án megerősítették, hogy a Renault Formula 1 csapatának tesztpilótája lesz a 2007-es szezonra.