A Lotus-Honda 100T nem volt sikeres, és Ducarouge 1989 közepén visszatért Franciaországba. A Lotus felvette Frank Dernie-t, hogy helyettesítse. Az 1989-es új normál légszívó motor előírásokkal a Lotus elvesztette a Honda turbómotorokat, és Judd V8-as motorokra váltott. Az év közepén Warr távozott, és Rupert Manwaring váltotta fel csapatmenedzserként, míg a hosszú ideje Lotus vezető vezetője, Tony Rudd lett az elnök. 1989-ben azonban a csapat legjobb eredménye Piquet 4. helye volt
Nagy-Britannia, Kanada, Japán és a 4. hely és a leggyorsabb kör Nakajima Ausztráliában. A szezon végén Piquet a Benettonhoz ment, Nakajima pedig a Tyrrellhez.