2002-ben Ryder szerepelt a kritikusok által elítélt "Mr. Deeds" című filmben, ami után a karrierje hanyatlásnak indult, és szünetet tartott a filmekben. 2009-ben visszatért a nagy hírű Star Trek filmbe. 2010-ben két Screen Actors Guild díjra jelölték: a főszereplőként a "" című televíziós filmben és a "Fekete hattyú" szereplői között. Szintén újra találkozott Burtonnal a Frankenweenie-ben (2012). Joyce Byers szerepét játszotta a Netflix sci-fi horror sorozatában, a Stranger Things (2016-tól), amiért Aranygömböt és Screen Actors Guild díjat kapott.
2020-ban a HBO dráma-minisorozatában "The Plot Against America" szerepelt.