A következő mondatot fejezze be: A német Lengyelország elleni inváziót követően, amely 1939 szeptemberében megindította a II. világháborút, az "SS-Totenkopf-Standarte Brandenburg" belépett a városba, hogy különböző bűncselekményeket kövessen el a lakosság ellen. Már 1939 szeptemberében a németek a közeli Rzuchów erdőben meggyilkolták a Kłodawa-i lengyel túszokat, és az egyik háború előtti polgármestert, Władysław Zalewskit 1939 novemberében meggyilkolták Środa Wielkopolska-ban. A
A náci megszállás idején a várost "Tonningen"-nek nevezték át (1940-1945). Már 1940-ben a lengyel földalatti ellenállási mozgalom alakult a városban, és titkos lengyel iskolákat is szervezett. 1941-ben több mint 1500 Kłodawi zsidót öltek meg a náci németek a Chełmno-i kivégzőtáborban. 1943-ban a németek letartóztattak néhány helyi lengyel ellenállót, akiket halálra vagy börtönre ítéltek. A Kłodawa plébániájának papját, Teofil Choynowski atyát 1943-ban ölték meg a Dachau-i koncentrációs táborban. Kłodawa végül 1945. január 19-én szabadult meg a Vörös Hadsereg által, és visszakerült Lengyelországhoz.