1958-ban, Alam csatlakozott a Pakisztáni Atomenergia Bizottsághoz kutatóként, és irányítást kapott, hogy csatlakozzon a Nukleáris Tudományos és Technológiai Intézethez (PINSTECH), a Nilore-i nemzeti laboratóriumhoz 1970-ben. A háború alatt Indiával
1971-ben Alam érdeklődött a számítástechnika és a matematika iránt, rövid ideig számítógépes programot írt, miközben a logikával és a matematikával kapcsolatos problémákon dolgozott. Alam fontos szerepet játszott a számítógépes részleg létrehozásában az Intézetben a Nukleáris Tudomány és Technológia, mielőtt csatlakozott a Fizika Osztályhoz.