A világgazdaság és a kereskedelmi útvonalak az Új Világ felé, a Földközi-tengerről való elmozdulásával Genova politikai és gazdasági hatalma fokozatosan hanyatlásba kezdett. Katonai ereje összeomlott a 1793-as Genova elleni támadás és a Genova-i csata során.
1795-ben, ahol Genova harcolt a francia flottával és az angolokkal. 1797-ben, Napóleon nyomása alatt, a Genovai Köztársaság francia protektorátussá vált, a Liguri Köztársaság néven, amelyet 1805-ben Franciaország annektált. Ezt a tényt Tolsztoj "Háború és béke" című regényének első mondatában említi: