A Stanford Egyetem nagy része a San Francisco-félszigeten, a Santa Clara-völgy (Szilícium-völgy) északnyugati részén található, San Franciscótól kb. 37 mérföldre (60 km) délkeletre és San Jose-tól kb. 20 mérföldre (30 km) északnyugatra. 2008-ban ennek a földnek a 60%-a fejlesztetlen maradt. A Stanford fő campusának egy népszámlálási kijelölt helye van a be nem épített Santa Clara megyében, bár néhány egyetemi terület (mint például a Stanford bevásárlóközpont és a Stanford Kutatási Park) a Palo Alto város határain belül van. A campus magában foglalja a be nem épített San Mateo (beleértve az SLAC National Accelerator Laboratory-t és a Jasper Biological Reserve-t), valamint a Menlo Hills Parkot a város határain belül.
20 mérföld.