A háború után Gichon katonai hírszerző tisztként maradt az izraeli hadseregben, és 1950-ben ezredeshelyettes rangjára lépett. Számos vezető pozícióban szolgált, és részt vett az 1956-os
Sinai hadjárat. 1963-ban vonult vissza a hadseregből. Katonai szolgálata alatt 1956-ban diplomát szerzett.