A következő mondatot fejezd be: Bár Vilmos támogatói uralkodtak a kormányban, Jakabnak jelentős követői voltak, különösen a Fennsíki területeken. Az ügyét, amelyet jakabitizmusnak neveztek, a latin (Jacobus) Jakabból, számos felkeléshez vezetett. A kezdeti jakobita katonai kísérletet John Graham vezette, aki most Dundee vikomtája. Az erői, majdnem mind Highlanders, legyőzte William erői a
Killiecrankie csata 1689-ben, de súlyos veszteségeket szenvedtek, és Dundee meghalt a harcokban. Vezetése nélkül a jakobita sereg hamarosan legyőződött a Dunkeld-i csatában. Jakab teljes veresége Írországban Vilmos által az Aughrim-i csatában (1691) véget vetett a jakobita katonai erőfeszítések első szakaszának. A jakobita vereséget követően 1692. február 13-án, egy Glencoe-i mészárlás néven ismert incidensben a Glencoe-i MacDonald klán 38 tagját megölték az Argyll gróf gyalogos ezredének tagjai, akik elfogadták a vendégszeretetüket, azzal az indokkal, hogy nem voltak gyorsak az új uralkodók iránti hűségükben.