Az 1915. augusztus 1-jén Mackinoltyt áthelyezték az Ausztrál Birodalmi Erőkhöz, hogy egy tizenhárom másik mechanikusból álló csapatot vezessen, mint erősítést az ausztrál Flying Corps kontingensének, amely a mezopotámiai hadjáratban szolgált. Kilenc nappal később elindult Melbourne-ből az RMS "Persia" fedélzetén, és szeptember 1-jén érkezett Basrába. Mackinolty csapata azonnal csatlakozott a No. 30 Squadron Royal Flying Corpshoz (eredetileg a mezopotámiai Half Flight AFC), amely Kut városába költözött, miután a brit birodalmi csapatok elfoglalták az Es Sinn-i csata során. Az egység részt vett a Ctesiphon csata novemberben, és szervezett ellátás csepp a brit és indiai helyőrség Kut alatt a ostrom
amely 1915 decemberétől a következő év áprilisáig tartott.