Az első, Julie Marie (1989-ben született), a lánya Jan Tarrant színészi edzőjével. Az ikrek, Anton James és Olivia Rose (2001. január 25-én született) is van, a színésznő Beverly D'Angelo-val, akivel 1996-tól 2003-ig volt kapcsolata. Pacino kapcsolatban volt Diane Keaton-nal - a három Keresztapa filmben szereplő társszereplője -, amely a Keresztapa II. rész forgatása után véget ért. Három nővel volt kapcsolata: Tuesday Weld, Jill Clayburgh, Marthe Keller, Kathleen Quinlan és Lyndall Hobbs. Pacino 2008 és 2018 között tíz éves kapcsolatban volt az argentin színésznővel, Lucila Pollakkal.
Soha nem házasodott meg.