Fischer 1904-ben született Höchst-on-Mainen, ma Frankfurt egyik városrészén. Szülei Dr. Eugen Fischer, a Wiesbaden-i Kalle & Co cég igazgatója és a Stuttgart-i Technikai Gimnázium Privatdozentje és Anna Herdegen voltak. Elsőfokú iskolába járt Stuttgartban, majd később a Wiesbaden-i "Humanistisches Gymnasiumban", 1899-ben jelentkezett be. Kémia és orvostudományt tanult, először a Lausanne-i Egyetemen, majd Marburgban. 1904-ben diplomázott, és 1908-ban orvosi végzettséget szerzett. Kérdés: Eugene fischers fia mely két egyetemen járt?
Lausanne Egyeteme, majd Marburg