A Hudson folyó a New York-i New Jersey államtól elválasztja a várost. A Kelet-folyó - egy árapály-szoros - a Long Island Sound-tól áramlik, és elválasztja a Bronxot és Manhattanet a Long Island-tól. A Harlem-folyó, egy másik árapály-szoros az East és a Hudson folyók között, elválasztja Manhattan nagy részét a Bronxtól. A Bronx folyó, amely a Bronx és a Westchester megyéből folyik, az egyetlen teljesen édesvízi folyó a városban. A város földterülete lényegesen megváltozott az emberi beavatkozás miatt, a holland gyarmati idők óta jelentős földtermeléssel a vízpartok mentén; a földtermelés a legjelentősebb a Lower Manhattan-ban, olyan fejlesztésekkel, mint a Battery City Park az 1970-es években és az 1980-as években. Néhány természeti földterületet a Harlem folyó felső részén találtak, beleértve a Manhattan-t.
az East és a Hudson folyó között