Írj folytatást erre a bekezdésre - Morientes meglepetés volt az UEFA Euro 2000-ben, de játszott az Euro 2004-ben
Portugáliában, ahol az egyik két gólt szerzett, amit a csapat el tudott intézni, egy későbbi csoportfázisban. A 2006-os világbajnokság időmérőjén is játszott az országért; azonban a Liverpool klubjában elért gyenge formája miatt Luis Aragonés, a nemzeti csapat edzője nem választotta ki a bajnokság végső csapatába, bár ő is része volt a kezdeti 31 fős listának.