Írj folytatást erre a bekezdésre - Jelcin visszavonulása után alacsony profilban maradt, szinte nem tett nyilvános nyilatkozatokat vagy megjelenéseket. 2000 decemberében kritizálta utódját, amiért támogatta a szovjet korszak nemzeti himnuszának újra bevezetését. 2001 januárjában hat hétig kórházban volt tüdőgyulladással, amelyet egy vírusfertőzés okozott. 2004. szeptember 13-án, a besláni iskolai túszválságot követően
és szinte egyidejűleg történt terrorista támadások Moszkvában, Putyin kezdeményezést indított a regionális kormányzók választásának helyettesítésére egy olyan rendszerrel, amely szerint közvetlenül az elnök nevezi ki őket, és a regionális törvényhozók jóváhagyják őket. Jelcin, Mihail Gorbacsovval együtt nyilvánosan kritizálta Putyin tervét, mint egy lépést a demokráciától Oroszországban, és egy visszatérés a szovjet korszak központi irányítású politikai apparátusához.