2014 júniusában a FIFA Etikai Bizottsága 90 napig kitiltotta Beckenbauer-t minden labdarúgóval kapcsolatos tevékenységtől, mert állítólag nem volt hajlandó együttműködni a 2018-as és 2022-es világbajnokságok elosztásával kapcsolatos korrupciós vizsgálatban.
Oroszország és Katar. Tiltakozott a tiltakozás ellen, mivel azt kérte, hogy a kérdések németül és írásban legyenek. A tilalmat feloldották, miután Beckenbauer beleegyezett, hogy részt vesz a FIFA vizsgálatában. 2016 februárjában Beckenbauer 7000 svájci frank bírságot kapott, és a FIFA etikai bizottsága figyelmeztette, amiért nem működött együtt a vizsgálatban 2014-ben.