A kék bálna családja a Glanopteridae-nek úgy tartják, hogy már a közép-oligocén korban (már 28 millió évvel ezelőtt) elvált a Mysticeti altörzs többi családjától. A kék bálna származása a miocén korban, 7,5 és 10,5 millió évvel ezelőtt elvált a többi rorqual-tól. A fajok közötti génáramlás azonban úgy tűnik, hogy ezen időszakon túl is folytatódott. A kék bálna a legnagyobb genetikai sokféleségű bármiféle baleen bálna közül, és magasabb, mint az átlagos sokféleségű emlősök között. A legmodernebb ismert genetikailag ismert kék bálna egy részleges fosszíliája Dél-Olaszországban, 1,25 és 1,49 millió évvel ezelőtt. A Glanopteridae családja a Glanoptera és a Glanoptera között elvált a többi családtól, a Glanoptera és a Glanoptera között, a fekete bálna és a fekete bálna között. A korábbi kutatások szerint a kék bálna és a kék bálna között
A görgős bálnák, a finnbálna, a Bryde-bálna, a sei-bálna és a minke-bálna