Bayezid magával vitt egy sereget, amely elsősorban balkáni vazallus csapatokból állt, köztük szerbek Lazarevic vezetésével. Hamarosan szembesült Anatóliában a közép-ázsiai uralkodó, Timur Lenk inváziójával. 1400-ban Timur belépett a Közel-Keletre. Timur Lenk elrabolt néhány falut Kelet-Anatóliában, és megkezdte a konfliktusot az Oszmán Birodalommal. 1400 augusztusában Timur és csapata porig égette Sivas városát, és a szárazföldre lépett. A seregeik Ankarán kívül találkoztak, a
Ankara csatája, 1402-ben. Az oszmánokat legyőzték, és Bayezidet foglyul ejtették, később fogságban halt meg. 1402 és 1413 között polgárháború tört ki Bayezid túlélő fiai között. Az ottomán történelemben Interregnum néven ismert ez a küzdelem ideiglenesen megállította az aktív oszmán terjeszkedést a Balkánon.