Írj folytatást erre a bekezdésre - A Kirkyard részt vett a Covenanters történelmében. A Covenanting mozgalom a Nemzeti Szövetség aláírásával kezdődött Greyfriars Kirkben 1638. február 28-án. A Covenanters vereségét követően a Bothwell Brig.
1679-ben 1200 szövetségest börtönöztek be egy mezőbe a temető déli részén. Amikor a 18. században ennek a mezőnek egy részét a temetőbe foglalták, a terület "Covenanters' Prison" néven vált ismertté.