2016. január 26-án Falwell bejelentette, hogy támogatja Donald Trump republikánus jelölését a 2016-os elnökválasztáson, ami miatt néhány Liberty Egyetem öregdiákja és más evangélikusok aggodalmukat fejezték ki, hogy Falwell "eladta a lelkét". Később kiderült, hogy egy titokban rögzített beszélgetés során Tom Arnold humoristával, Trump személyes ügyvédje és "szerelője" Michael Cohen segített Falwellnek visszaszerezni a kompromittáló fotókat, mielőtt biztosította volna a támogatását. 2016. július 21-én az RNC kongresszusán Clevelandben, Ohio államban
Falwell Jr. Trumpot "Amerika kékgalléros milliárdosának" és "korunk egyik legnagyobb látnokainak" nevezte, amikor a "fegyverkezési jogot" védő jelölt támogatását fejezte ki, "megakadályozza Iránot... abban, hogy nukleáris hatalommá váljon", és "konszervatív életvédő bírákat nevezzen ki a Legfelsőbb Bíróságra".