Az 1984 május 30-án II. János Pál pápa kinevezte O'Malley-t a Szent Tamás egyházmegye segéd püspökévé. A következő augusztus 2-án Edward John Harper püspök fogadta el püspöki felszentelését, James Hickey érsek és Eugene Marino püspök pedig társ felszentelőként szolgált. Kérdés: Mi James Hickey rangja az egyházban?
Főpásztor.