1813-as hadjárat alatt Eugène a
Lützen csatája. Napóleon ezután visszaküldte Olaszországba, ahol megszervezte a védelmet az osztrákok ellen, és a Mincio-ban tartott az 1814-es abdikációig. Napóleon 1814-es bukása után Eugène Münchenbe vonult vissza, és a sógorának, Maximilian I. József bajor királyának kérésére. Édesanyja halála után hamarosan visszatért Párizsba, ahol XVIII. Lajos és I. Sándor fogadta, és azonnal lemondott a politikai tevékenységéről, és visszatért feleségének családjához Bajorországba. Ennek megfelelően semleges maradt Napóleon visszaállása idején a hatalomra a Száz Napok alatt.