Írj folytatást erre a bekezdésre - 2017. május 17-én Wernert a német válogatottban nevezték fel a 2017-es FIFA Konföderációs Kupára, amelyet Oroszországban tartottak. A csapat helyettesítője volt Sandro Wagnernek az ausztrál csapat elleni megnyitó meccsen, mielőtt az első két nemzetközi gólját azután szerzetté tette, hogy június 25-én Kamerun ellen játszott német csapatának utolsó mérkőzésében kezdőnek választották. Négy nappal később Werner szerezte Németország harmadik gólját a Mexikó elleni 4-1-es félfinális győzelemben. 2017. július 2-án Werner segített Lars Stindl győztes gólját a 2017-es FIFA Konföderációs Kupának döntőjében.
Chile ellen. Három gólja és két segítője miatt Werner elnyerte a bajnokság Aranycipőjét.