A 2010-es Német Nagydíjon a Ferrari csapatrendelés miatt került nyomozásra, mivel Massa korán átvette a vezetést, Fernando Alonsót megelőzve a második helyen, Sebastian Vettelt pedig a harmadikban. A verseny során ezeket a pozíciókat addig tartották fenn, amíg Massa utasításokat kapott a Ferrari mérnöke, Rob Smedley-től, mondván: "Fernando gyorsabb nálad. Meg tudja erősíteni, hogy megértette az üzenetet?" Nem sokkal később, a 49. körben Massa lehetővé tette, hogy Alonso vezessen, és következésképpen megnyerje a versenyt. Smedley aztán a passz után hozzátette: "Rendben, haver, jó fiú, maradj vele, sajnálom". Az incidens erősen arra utal, hogy a csapat parancsot adott Massa-nak, hogy engedje Alonso-t megelőzni, és a versenyfőnökök beleegyeztek. A csapatfőnök, Stefano Domenicali tagadása ellenére a Ferrari 100 ezer dolláros bírságot kapott a sportszabályok megsértéséért, és az ügyet a FIA Világmotorsport Tanácsa elé terjesztették. Massa negyedik lett Magyarországon és Belgiumban, és harmadik Olaszországban. Szingapúrban a sebességváltó problémája miatt az utolsó helyen végzett, de nyolcadik lett. Massa összeütközött Vitantonio Liuzzivel a Japán Nagydíj első körében.
De Koreában harmadik lettem. Csalódást keltő 15. lett Brazíliában, és tizedik Abu Dhabiban. Massa hatodik lett a versenyzői bajnokságban.