Írj folytatást erre a bekezdésre - A császár személyesen vett részt a svédek elleni hadjáratban, amely a Jankau-i csata vereségével ért véget
1645. március 6-án. A svéd hadsereg Lennart Torstensson parancsnoksága alatt Bécsbe lépett. A város moráljának emelése érdekében a császár nagy felvonulással járta körbe a várost, és a Szűz Mária képmását vitte magával. Ahogy a svéd hadsereg közeledett, Ferdinánd elhagyta a várost. Leopold Vilmos főhercegnek sikerült elűznie az ellenfeleket. Ferdinándnak időnként sikerül I. György Rákóczi transzilvániai herceget, Franciaország és Svédország szövetségesét a maga oldalára állítani. Az 1645-es "Linz-i békében" a császárnak garantálnia kellett a magyar birtokok számára a császári képviselet jogát és a protestánsok vallásszabadságát, ami megakadályozta az ellenreformációt és a jövőben az abszolutista uralmat Magyarországon.