1991-ben a többségében megszállt területeken több mint 400.000 horvátot a horvát szerb erők vagy menekült az erőszak. A háború utolsó napjaiban, 1995-ben több mint 100.000 szerb önként elmenekült az országból a horvát erők érkezése előtt a Vihar hadművelet során, hogy elkerüljék, hogy bíróság elé állítsák az igazolhatatlan cselekedeteikért a horvát függetlenségi háború alatt. A háború után a menekültek száma mintegy 250.000-re esett. A horvát kormány gondoskodott a menekültekről a szociális biztonsági rendszer, és 1991 óta a menekültek és menekültek hivatalán keresztül.
Horvát szerb erők