1864. július 20-án újra megbízták, a Susquehannát az észak-atlanti blokádos osztaghoz rendelték, és részt vett a Fort Fisher, Észak-Karolina elleni sikertelen támadásokban 1864. karácsony estéjén. Azonban 1865 február közepén a kettős vég volt a hatalmas erőben, amely végül elfoglalta a konföderációs erődöt.
és bezárták Wilmingtont, Észak-Karolinát, az Amerikai Konföderációs Államok utolsó nagy kikötőjét. Abban az időben Sylvanus William Godon ellenadmirális parancsnoksága alatt állt. Az egyik legénység tagja, Henry S. Webster, a második Fort Fisher-i csata során végzett műveleteiért a Becsületérmet kapta.