A kriptográfia is egy mérnöki ága, de szokatlan, mivel aktív, intelligens és rosszindulatú ellenállással foglalkozik (lásd a kriptográfiai mérnöki és biztonsági mérnöki munkát); más mérnöki tevékenységek (pl. polgári vagy vegyi mérnöki) csak semleges természeti erőkkel foglalkoznak. Van olyan kutatás is, amely a kriptográfiai problémák és a kvantumfizika (lásd a kvantum és a kvantum kriptográfia) közötti kapcsolatot vizsgálja.
hangsúly