A második világháború kitörésével, 1939. szeptember 1-jén, a terület a Bzura-i csata helyszíne volt, és néhány harcot Głowno környékén. A várost szeptember második hetében elfoglalta a német Wehrmacht. A náci német adminisztráció létrejött, és Głowno része lett a német közigazgatási egységnek, amelyet Általános Kormányként ismertek. A
Számos lengyel ellenállás, Armia Krajowa stb. történt Głownóban, beleértve egy római katolikus pap titkos kivégzését, aki a náci rendőrség informátoraként dolgozott. A náci megtorlás sok polgár életét követelte, köztük azokat, akiket tömeges kivégzések során meggyilkoltak a város temetőjén és a város német rendőrségi központjában, valamint a náci megszállás alatt álló Varsó hírhedt Pawiak börtönében. Sok polgárt kényszerítettek rabszolga munkára a németek számára, és néhányat Németország különböző gyáraiba és farmaiba szállítottak.