A második koalíciós háború kezdetén, 1799-ben, amikor a Duna és a Helvetia hadseregei alakultak, Jean Baptiste Jourdan parancsnoksága alatt a Duna Hadsereghez rendelték. A 10. ezred Laurent de Gouvion Saint-Cyr III. Divízió, és a bal oldali szárnyat tartotta az Ostrach-i csatában, 1799. március 21-én délnyugati Németországban. Bár megsebesült 1799. augusztus 14-én Svájcban, részt vett a második Zürichi csatában.
melyben a 10. "Chasseurs à Cheval" egy orosz hadosztályt legyőzött, ami döntő pillanat volt a francia győzelemben. Ordener 1801-ben ezredes lett, 1803. augusztus 29-én pedig brigádgenerál.