Írj folytatást erre a bekezdésre - A dinasztikus unió után Portugáliával, Albert lett az első alkirály a királyság és a tengerentúli birodalom 1583-ban. Ugyanebben az időben kinevezték pápai küldöttnek és nagyinquisitornak Portugáliában. Portugália helyetteseként részt vett a 1588-as Nagy Armada szervezésében, és visszaverte az angol ellentámadást.
Lisszabonban 1589-ben. 1593-ban II. Fülöp visszahívta Madridba, ahol vezető szerepet fog betölteni a spanyol monarchia kormányában. Két évvel később a lázadó Hugh O'Neill, Tyrone grófja és Hugh Roe O'Donnell felajánlotta Albertnek az ír koronát abban a reményben, hogy spanyol támogatást kap az ügyükhöz.