1982-ben a harminc éves Khan átvette a pakisztáni krikett csapat kapitányságát Javed Miandadtól. 1984-ben azonban, mint kapitány, Khan 48 teszt mérkőzést játszott Pakisztán ellen, amelyek közül 14 nyert Pakisztán, 8 elvesztett, a fennmaradó 26 pedig egyenlő volt. 1984-ben Khan 1982-ben játszott 139 egynapos mérkőzést, 77 győzelemmel, 57 vereséggel és egy egyenlőségben. A csapat második mérkőzésében Khan vezette őket az első teszt győzelemhez 28 év után az angol földön Lord's-ban. Khan első éve kapitányként volt a csúcsa az örökségének, mint gyors dobó, valamint az all-rounder.
Khan 48 teszt mérkőzést játszott, amelyek közül Pakisztán 14 győzött, 8 vesztett és a fennmaradó 26 egyenlő lett.