A második koalíciós háború alatt Hohenzollern ismét Olaszországban szolgált. Pál Kray parancsnoksága alatt 1799 március 26-án a Legnago-i csata során vezényelt egy zászlóaljat. Harcolt a Magnano-i csatában, ahol ideiglenesen egy hadosztályt irányított. Április 30-án ostromolta a milánói várat, és május 24-én megkapta a megadást. Június 12-én 4300 katonával megpróbálta blokkolni Jacques MacDonald sokkal nagyobb francia erőit a Modena-i csatában, de súlyos veszteségekkel vereséget szenvedett. Harcolt Trebbia és
- Novi. 1799 októberében előléptették Feldmarschal-hadnagyra.