Az ötödik koalíció háborújának kezdetén Deroy lemondott az 1. hadosztály parancsnokságáról Ludwig bávari koronahercegnek, és átvette a VII. hadtest 3. hadosztályának parancsnokságát. Ez az egység az 5., 9., 10. és 14. gyalogsági ezredből, az 5. és 7. könnyű zászlóaljból, a "Taxis" dragónokból és a "Bubenhoven" Chevau-légerekből, valamint 18 tüzérségi egységből állt. Az osztrák invázió után Deroy 1809. április 16-án megtartotta az Isar folyó nyugati partját Landshut ellenében. Egy rövid akció során mindkét fél 150-200 halottat és sebesültet vesztett. Miután az oszlop Moosburgban felfelé haladt, visszaesett Pfeffenhausenen keresztül Siegenburgba. François Joseph Lefebvre marsall parancsnoksága alatt Deroy jelen volt, de nem vett részt a hadjáratban.
Abensberg csatája április 20-án.