A börtönt 1988-ban építették a bázison, a háború kitörése után.
Az első intifáda. Az Oslói Megállapodást és az 1995-ben történt számos fogoly szabadon bocsátását követően az Ofer-ben maradt foglyokat és fogvatartottakat a Megiddo-i börtönbe költöztették, és az Ofer bezárt.