A következő mondatot fejezd be: Az 1990-es évek folyamán, a Öböl-háborút követően, a terrorista támadások nagy hatással voltak a CENTCOM erőire. Az olyan támadásokkal szembesülve, mint az 1996-os Khobar-tornyok bombázása, amely 19 amerikai pilótát ölt meg, a parancsnokság elindította a Sivatagi fókusz műveletet, amelynek célja az amerikai létesítmények védelmezhetőbb helyekre (például a Prince Sultan légibázisba) való áthelyezése, az Egyesült Államok előretolt "lábnyomának" csökkentése azáltal, hogy megszünteti a nem létfontosságú lakásokat, és visszaküldje a függőket az Egyesült Államokba. 1998-ban a terroristák
megtámadták az amerikai nagykövetségeket Kenyában és Tanzániában, 250 embert öltek meg, köztük 12 amerikaiat. Az 2000 októberében a USS "Cole" ellen elkövetett támadás, amely 17 amerikai tengerész halálát okozta, kapcsolatban állt Osama bin Laden Al-Kaida szervezetével.