Két kutató, Chris Bennett (1996) és David Peters (2000), azt találták, hogy a pterosaurusok protorosaurusok voltak, vagy szorosan kapcsolódtak hozzájuk. Peters DGS nevű technikát használt, amely magában foglalja a fotó szerkesztő szoftver digitális nyomkövetési jellemzőinek alkalmazását a pterosaurusok fosszíliáinak képére. Bennett csak a pterosaurusokat a protorosaurusok közeli rokonaiként találta, miután eltávolította a hátsó végtagok jellemzőit az elemzéséből, annak érdekében, hogy tesztelje azt az elképzelést, hogy ezek a karakterek a pterosaurusok és a dinoszauruszok konvergens evolúciójának eredményei. Azonban a későbbi elemzés Dave Hone és Michael Benton (2007) nem tudta ezt az eredményt reprodukálni. Hone és Benton Benton azt találta, hogy a pterosaurusok szorosan kapcsolódnak a dinoszaurusokhoz még a hátsó végtagok nélkül is.
a Scleromochlus testvéri csoportja, vagy a Lagosuchus és a Scleromochlus között esnek az ornithodiran családfáján