Írj folytatást erre a bekezdésre - A jakobita felkelések sorozata Skóciában is zajlott le, ahol Dundee viscount felhozta a magasvidéki erőket és győzelmet aratott 1689. július 27-én a Killiecrankie-i csatában
, de meghalt a harcban, és egy hónappal később a skót kameroni erők legyőzték a lázadást a Dunkeld-i csatában. Vilmos kegyelmet ajánlott a felkelésben résztvevő skót klánoknak, feltéve, hogy egy határidőig hűséget írtak alá, és skót kormányzata a késleltetést a 1692 -es Glencoe-i mészárlással büntette meg, amely hírhedtvé vált a jakobita propagandában, mivel Vilmos ellenírta a parancsokat. Vilmos a közvélemény előtt meghajolt, és elbocsátotta a mészárlásért felelőseket, bár még mindig az ő javára maradtak; a történész John Dalberg-Acton szavaival élve "az egyik ezredes lett, a másik lovag, a harmadik nemes, a negyedik pedig gróf".