Az új menedzser, Julen Lopetegui 2018 augusztusában érkezése miatt Modrić állandóan visszatérhetett az első csapatba pótlékként, mivel a 2018-as világbajnokság után hiányzott a szezon előtti edzés. Ez magában foglalta a helyettesítő megjelenést a csapat 2 <unk> 4 veszteségében az Atlético Madrid ellen az UEFA Szuperkupában.
- Igen. A szezon első kezdete szeptember 1-én történt, amikor 4-1-es hazai győzelmet aratott a Leganés ellen, amelyben asszisztált a csapat harmadik góljához, amelyet Karim Benzema szerezett. Századik megjelenése az UEFA klubversenyeiben szeptember 19-én történt, amikor a Romával 3-0-os hazai győzelmet aratott, és segített a második gólban, amelyet Gareth Bale szerezett. December 22-én Modrić megnyerte harmadik FIFA Klub Világbajnokságát, az első gólt és a harmadik segítőját az Al Ain elleni döntőben. 2019. január 13-án és 19-én Modrić először szerzett gólt két egymást követő bajnoki mérkőzésen a Real Madriddal, a Real Betis elleni 1-2-es külföldi győzelemben és a Sevilla elleni 2-0-os hazai győzelemben. Ugyanebben a hónapban karrierje során harmadszor szerepelt az UEFA Év Csapatában (2018). Február 27-től március 5-ig Modrić átélte "labdája életének legnehezebb hetét", amikor a Real Madrid kétszer veszített a Barcelonától és az Ajaxtól, és kiesett a Copa del Rey-ből, a címversenyből és a Bajnokok Ligájából. Annak ellenére, hogy nem volt túl jó szezonja, ötödik alkalommal került a FIFA FIFPro World XI-be.