A sikeres lázadás reményei elhalványultak, amikor Napóleon legyőzte a Teugen-Hausen-i csatákban Ausztria hercegének, Károlynak az osztrák erőit.
Abensberg, Eckmühl és Ratisbon, amely után az osztrák csapatok visszavonultak Tirolból, és Hofernek vissza kellett vonulnia a hegyekbe. A francia marsall, François Joseph Lefebvre vette át a tiroli hadtér irányítását, és a bávari és a szász erők Karl Philipp von Wrede parancsnoksága alatt május 13-án veres csatában legyőzték az osztrákokat Wörglnél. A bajorok május 19-én elfoglalták újra Innsbrucket. De amikor a francia szövetségesek elmentek, a lázadás újra lángra lobbant.