2013. január 21-én bejelentették, hogy Bautista ismét a kanadai "". Bautista június 29-én a Boston Red Sox ellen játszott meccsen érte el karrierje 200. home runját. Július 6-án a negyedik egymást követő All-Star játékára választották.
, és a harmadik, mint a kezdő jobboldali az Amerikai Liga. A válogatás idején.264-es ütés volt, 20 HR és 52 RBI. Az All-Star Game-ben egy áldozati repülésen rögzítette a mérkőzést megnyert RBI-t a negyedik menetben, amikor az Amerikai Liga 3-0-ra nyert.