A 2016-os nyári olimpiai játékokon Fernandezt választották ki, hogy Spanyolországot képviselje mind az egyéni, mind a csapatos versenyeken. Először is összesen 1986 pontot gyűjtött, hogy a spanyol hármas nyolcadik helyet kapjon a rangsorban, 657 egyéni pontszámával együtt, mint a harmincötödik vetítő a kiürítési szakaszba. A férfi csapatban Fernández és honfitársai, Rodríguez és Alvariño a tornát megnyitó fordulóban a hollandok előtt bukkantak ki, és 1<unk>5 vereséget szenvedtek. Néhány nappal később, a férfiak egyéni válogatásán
Fernández bosszút állt csapatának korai kilépése után, a kínai Taipei Kao Hao-wen (6<unk>0) és az olasz No. 3 David Pasqualucci (6<unk>2) megnyitásával a nyitó körökben, mielőtt 3<unk>7 ponttal verte meg Ausztrália esetleges negyeddöntős Taylor Worth a következő mérkőzésében.