A következő mondatot töltse ki: Courtois kölcsönadása az Atlético-nak a 2012/13-as szezonra volt kiterjesztve. Az első mérkőzése a Chelsea ellen volt.
2012 UEFA Szuperkupa döntője Monacóban, amely az Atlético Madrid 4-1 győzelmével ért véget. A szezon végén Courtois új Atlético Madrid rekordot állított fel, 820 percet töltött anélkül, hogy gólt fogadott volna az Estadio Vicente Calderonban, amit a Real Sociedad ellen 1-0-os vereségben ért el. Az Atlético eljutott a 2013-as Copa del Rey döntőjéhez, és Courtois-t a mérkőzés legjobbjául választották a Real elleni 2:1-es győzelemben, amely az első alkalom volt, hogy az Atlético 14 év alatt legyőzte a városi riválisokat.