Írj egy folytatást erre a bekezdésre - A függetlenségi háború
Az egyetem oktatói személyzetét súlyosan érintette, akik közül néhányan emigrációba mentek, míg másokat bebörtönöztek. Az 1848-ban megfogalmazott hosszú távú fejlesztési terveket hosszú időre ki kellett vonni a napirendről. Mindazonáltal ebben a reakciós időszakban bizonyos modernizációra került sor; 1850-től a középiskolai végzettség kötelezővé vált az egyetemre való felvételhez. Bár még mindig kilenc osztályon képezték ki a szakembereket, a sebészeti mesterképzés, amelyet korábban folyamatosan teljesítettek, elhervadt, és végül megszűnt. 1872-ben a sebészi céheket is feloszlatták.