Írj folytatást erre a bekezdésre - Az 1966-os nigériai puccs után
1966 január 18-án letartóztatták, és Victor Banjo ezredessel együtt azzal vádolták, hogy összeesküvést szőttek a katonai államfő, Johnson Aguiyi-Ironsi tábornok nagymenő meggyilkolására. Aghanya-t tárgyalás nélkül tartották fogva a Kirikiri szigorúan őrzött börtönben másokkal együtt, akik állítólag részt vettek az államcsínyben. Később az Enugu-i, majd az Abakaliki-i börtönbe került. Visszatekintve azok, akik aktívan részt vettek a puccs tervezésében és végrehajtásában, mint például Adewale Ademoyega őrnagy, emlékirataikban igazolták Aghanya és Banjo ártatlanságát. Az 1966-os nigériai ellenpörgés után, amelyben Aguyi Ironsi meggyilkolták, Aghanya-t 1967 márciusában elengedték a börtönből a keleti régió akkori kormányzója, Odumegwu Ojukwu ezredes (később tábornok) parancsa alapján, szembeszegülve az új államfő, Yakubu Gowon ezredes (később tábornok) parancsaival. Válaszul Gowon bejelentette Aghanya és a többiek szabadlábra helyezését.