A kapitányságra emelték, és részt vett a Port Royal elleni támadásban a flotta Samuel Francis Du Pont admirális vezetésével. A Hilton Head-i erődön tűzoltást biztosított, és anyagilag segített elhallgattatni az ellenséges akkumulátorokat. 1863-ban commodor rangra emelték, és parancsnoka volt David Dixon Porter admirális flottájának 4. hadosztályának a Fort Fisher első és második csataiban.
1864 decemberében és 1865 januárjában. Az utóbbi akcióról szóló beszámolóban külön dicséretet kapott a főparancsnoknak nyújtott támogatásért, valamint a hajójának jó fegyeleméért és pontos tüzeléséért.