Írj folytatást erre a bekezdésre - 1966 januárjában lett Nigéria legfiatalabb katonai vezérkari főnöke 31 évesen, mert egy katonai puccs d'état
egy csoport fiatal tiszt, Chukwuma Kaduna Nzeogwu őrnagy vezetésével, elvezették a nigériai civil kormány megdöntését. A puccs során többnyire északi és nyugati vezetők haltak meg, köztük Sir Abubakar Tafawa Balewa, Nigéria miniszterelnöke; Sir Ahmadu Bello, a Sokoto Sardauna és az északi régió miniszterelnöke; és Samuel Akintola, a nyugati régió miniszterelnöke, Arthur Unegbe hadnagy ezredes és még sokan mások. Gowon ezredes-hadnagy két nappal a puccs előtt tért vissza a brit Latimer-i Közös Főiskola tanfolyamáról - egy késői érkezés, ami valószínűleg mentesítette őt a összeesküvésesek célpontlistájából. A huszadik századi világháborúban 1919 óta elért sikerek és Johnson Aguiyi-Ironsi tábornok (aki az államfő volt az 1966 januárjában történt puccs után Gowon vezérkari főnöke) kudarca, hogy teljesítse az északi követeléseket a puccs szervezőinek büntetőeljárása érdekében, tovább gyújtotta az északi dühöt. A puccs tervezőinek jelentős támogatása volt mind a keleti régióban, mind a többnyire baloldali "Lagos-Ibadan" sajtóban.