A 2008/09-es szezonban Di Francisca négy negyedfinálisban és egy ezüstéremmel a Dallas-i világbajnokságon visszatért a formájába. Újra bekerült a nemzeti csapatba az európai bajnokságra Plovdivban. Az egyéni versenyen Arianna Errigo csapattársa megállította a 16-os asztalban, de a csapatversenyen Olaszország egymás után legyőzte Romániát, Franciaországot és Oroszországot, hogy visszaszerezze a kontinentális címet, négy évvel Zalaegerszeg után. A
Világbajnokságon Valentina Vezzali legyőzése után eljutott a félfinálba, majd elvesztette az orosz Aida Shanayevát, és bronzéremmel érkezett, ez volt az első egyéni kitüntetése a világbajnokságon. A csapatmérkőzésen Olaszország találkozott Oroszországgal a döntőben, és bosszút állt a Torinóban elvesztett mérkőzésért, legyőzve őket 45-33 -kal, beleértve Di Francisca 5-0-os meccsét Shanayeva ellen. Olaszország így visszaszerezte a világbajnoki címet, amely 2004 óta elkerült őket. Di Francisca a szezont az ötödik helyen fejezte be a világ rangsorban.