1946-ban arab nacionalista volt, és fegyvereket kezdett beszerzni, hogy az egykori brit mandátumban Palesztinába csempésszék, hogy az Arab Felsőbizottság és a Szent Háború hadseregének milíciái használhassák. Az 1948-as arab-izraeli háború alatt Arafat elhagyta az egyetemet, és más arabokkal együtt Palesztinába akart belépni, hogy csatlakozzon az izraeli csapatokhoz, akik az izraeli csapatok és az Izrael állam létrehozása ellen harcoltak. Azonban ahelyett, hogy csatlakozott a palesztin csapatokhoz, Arafat a Muzulmán Testvériség mellett harcolt, bár nem csatlakozott a szervezethez.
1949-ben