Írj folytatást erre a bekezdésre - 1940-ben, a Molotov-Ribbentrop-paktum következtében Románia kénytelen volt lemondani
területének egy részét a Szovjetuniónak, beleértve Chișinăut is, ahol a moldovai Szovjetunió megalakult. Az új hatóságok bezárták Kotsovszkij intézetét. Az intézetet újra megnyitották, amikor a II. világháború kitörése után a Chișinăut a tengelyerők elfoglalták. Kotsovskij a II. világháború alatt is folytatta tudományos munkáját. Ebben az időben munkáit főként német és osztrák tudományos folyóiratokban publikálta.