A Tsugaru-szoros keleti és nyugati nyakát egyaránt körülbelül 20 km-es szélességűek. Az 1946-ban végzett kezdeti felmérések azt mutatták, hogy a keleti nyak 200 méter mély volt vulkáni geológiával. A nyugati nyakának maximális mélysége 140 méter (459 láb) volt, és geológiája többnyire a neogén időszak üledékszirtjeiből állt. A nyugati nyakot az alagút geológiájának kedvező feltételeivel választották ki. Az alagút tenger alatti része vulkáni sziklákból, piroclasztikus sziklákból és a nyugati időszak üledékszirtjeiből áll.
legfiatalabb szikla