Wasu ƙwayoyin cuta na iya faruwa lokacin da gurɓatattun ƙwayoyin cuta da ke cikin iska suka shiga cikin baki ko hanci. Da zarar a cikin hanyoyin numfashi na sama, ƙwayoyin cuta na iya shiga cikin huhu, inda suke mamaye ƙwayoyin da ke cikin hanyoyin numfashi, alveoli, ko parenchyma na huhu. Wasu ƙwayoyin cuta kamar su kyanda da herpes simplex na iya shiga cikin huhu ta hanyar jini. mamayewar huhu na iya haifar da matakan sel na mutuwa. Lokacin da tsarin rigakafi ya amsa ga kamuwa da cuta, har ma da huhu na iya faruwa.
idanu ko hanci