Fischer an haife shi ne a Höchst on Main, yanzu gundumar birnin Frankfurt. Iyayensa sune Dr. Eugen Fischer, Daraktan kamfanin Kalle & Co, Wiesbaden, da Privatdozent a Makarantar Fasaha, Stuttgart, da Anna Herdegen. Ya tafi makarantar firamare a Stuttgart, kuma daga baya zuwa "Humanistisches Gymnasium" a Wiesbaden, wanda ya shiga a 1899. Ya karanta ilmin sunadarai da magani, da farko a Jami'ar Lausanne sannan a Marburg. Ya kammala karatunsa a 1904, kuma a 1908 ya cancanci M.D. Tambaya: Eugene fischers dan ya halarci jami'o'i biyu?
Jami'ar Lausanne sannan kuma a Marburg