Эмори 1862 онд Потомакийн армид бригадын командлагчаар ажиллаж, Баруун театрт шилжсэн. Тэрээр 1862 оны гуравдугаар сарын 17-нд сайн дурын бригадын генерал болсон. Хожим тэрээр Порт Хадсоны кампанит ажиллагаанд дивизийг удирдав. Дараа нь тэр 19-р корпусын командлагчаар Зүүн тийш буцаж,
1864 оны Шенендоагийн хөндийн кампанит ажил, ялангуяа Сидар Крикын тулалдаанаар Эморигийн үйл ажиллагаа нь Холбооны армийг хохирол учруулснаас салахын тулд генерал-майор Филип Шеридан ирэх хүртэл тусалжээ.