Уилсон Латин Америктай илүү дотно харилцаа тогтоохыг эрмэлзэж, олон улсын маргааныг шийдвэрлэх Панамерикийн байгууллага байгуулахыг найдаж байв. Түүнчлэн тэрбээр Колумб улстай байгуулсан гэрээнд АНУ-ын оролцоотой холбоотойгоор тус улсад нөхөн төлбөр төлөх тухай хэлэлцээрийг байгуулсан боловч Сенат энэ гэрээнд ялагджээ. Гэвч Уилсон Латин Америкийн үйл хэрэгт байнга оролцож, 1913 онд "Би Өмнөд Америкийн бүгд найрамдах улсуудад сайн хүмүүсийг сонгохыг заах болно" гэж хэлсэн. Доминиканы Бүгд Найрамдах Улс нь Рузвельтын ерөнхийлөгчийн үеэс хойш АНУ-ын хамгаалалтад байсан боловч тогтворгүй байдалд өртсөн. 1916 онд Вилсон арлыг эзлэн авахын тулд цэрэг илгээсэн бөгөөд АНУ-ын цэрэг 1924 он хүртэл тэнд үлдсэн байв. 1915 онд АНУ-ын
Гаитид болсон бослого нь Гаити улсын засгийн газрыг огцруулсан бөгөөд 1919 он хүртэл үргэлжилсэн эзлэн түрэмгийлэл эхлэв. Вилсон мөн Куба, Панама, Гондураст цэргийн интервенцийг зөвшөөрсөн. 1914 оны Брайан-Чаморрогийн гэрээгээр Никарагуаг өөр нэг де-факто хамгаалалтад авсан бөгөөд АНУ-ын цэргүүд Вилсоны ерөнхийлөгчийн үед тэнд байрлаж байв.