Konplete fraz sa a: Apre sezon 2012 la, Scutaro ak Giants yo te dakò ak yon kontra 3 zan, $ 20 milyon dola ki te vin ofisyèl sou Desanm 7, 2012. Nan 2013, Scutaro te kòmanse dezyèm baz la, ak Tony Abreu ak Nick Noonan kòm backup prensipal li yo. Nan 81 jwèt nan premye mwatye a, Scutaro frape.316/.367/.400 ak 2 HR, 22 RBI ak 37 R, e li te rele nan
2013 MLB All-Star jwèt. Scutaro te jwe dènye jwèt li nan 2013 sou 15 septanm, epi li te ofisyèlman fèmen sou 24 septanm. Li te sibi yon operasyon sou 27 septanm ki te inséré yon broch nan pinky gòch li korije dwèt malèt li, yon aksidan li te soufri sou 11 jen kont Pirates yo lè li te frape pa Tony Watson. Nan 127 jwèt nan 2013, li frape.297/.357/.369 ak 2 HR, 31 RBI ak 57 R.