Ekri yon kontinyasyon pou paragraf sa a - Nan mwa jen 1861, O'Neal te komisyone kòm yon kòmandan ak kòmande twa konpayi sòlda. Lè li rive Richmond li te nonmen majò nan 9yèm Règman Alabama Infanteri e li te pwomosyon nan Lt Kolonèl nan otòn la. Nan mwa mas 1862, li te nonmen kolonèl nan 26th Alabama infanterye, ak kòmande sa a rejiman pandan kanpay la Peninsula. Nan batay Seven Pines la, chwal li te mouri anba li, e li te blese gravman pa yon fragman kokiy. Li te resevwa gwo lwanj pou pèfòmans li nan batay Chancellorsville. Nan 1863, li te kòmande yon brigad nan Majò Jeneral Robert E. Rodes 'divizyon, epi li te dirije li nan batay la nan Gettysburg, batay la nan Manassas Gap ak nan batay la nan Mine Run
Li pa gen pwoblèm. Nan kòmansman 1864, yo te voye rejiman li a tounen nan Alabama pou rekrite ran deplete li yo, men li te byen vit bay lòd pou Dalton, Georgia, kote O'Neal te pran lòd brigad Brig. Jeneral James Cantey nan Lame Tennessee. O'Neal te kòmande brigad sa a pandan rès kanpay Atlanta a. Apre Lt. Jeneral John Bell Hood te bay kòmandman nan Lame a nan Tennessee, O'Neal te soulaje epi li te sèvi sou devwa detache pou rès lagè a. Li te nonmen brigadye jeneral sou 6 jen 1863, men randevou sa a te kenbe pa Jeneral Robert E. Lee ak pwomosyon an te anile pa Konfederasyon Prezidan Jefferson Davis.