Skribu daŭrigon por ĉi tiu paragrafo - Yegipko revenis al Sovetunio en aŭgusto 1938, okupante la postenon de komandanto de la Dua Submarŝipa Brigado de la Nigra Mara Floto. Li tenis tiun pozicion ĝis decembro 1939, kiam li iĝis komandanto de la submarŝipa brigado de la Balta Floto. Li tenis tiun postenon dum la Sovet-finna milito, forirante en majo 1940 por rekomenci siajn studojn en la Maramea Akademio. Li diplomiĝis en aprilo 1941, estante promociita la 26an de aprilo al kapitano unua rango. De tiu monato ĝis septembro li estis komandanto de la unua Submarine Brigade de la Balta Floto. Yegipko partoprenis en militaj operacioj post la germana invado de Sovet-Unio en junio 1941. Dum la sovetia evakuado de Talino
En aŭgusto 1941, lia submarŝipo, S-5, trafis minon, kaj Yegipko falis el la turo de la ŝipestro en la akvon. Li estis savita, kun grava cerbo-konfuzo, de alia ŝipo. De septembro ĝis oktobro 1941 li estis je la dispono de la Milita Konsilio de la Balta Floto, antaŭ sia nomumo kiel maramea ataŝeo ĉe la sovetia ambasado en Britio. Kiel maramea ataŝe Yegipko ofte funkciis kiel observanto sur britaj militŝipoj, kaj velis sur britaj ŝipoj en arktaj konvojdevoj.