Skribu daŭrigon por ĉi tiu paragrafo - Malgraŭ esti laŭdata de la publiko pro lia traktado de la ŝtata burokratio dum la katastrofo de 1906
Pardee daŭre havis streĉitan rilaton kun la Suda Pacifika Fervojo, kiu estis daŭranta ekde la 1890-aj jaroj dum li estis urbestro de Oakland. La rolo de Pardee en la burĝona Progresema movado, kiu malfidis grandajn entreprenajn monopolojn, same kiel liaj klopodoj konservi kaj protekti ŝtatajn arbarojn, restis konstanta dorno por Sudpacifikaj oficuloj. Longa amara batalo pri la Haveno de Oakland, kiun Pardee argumentis nome de Oakland ke la haveno estis municipa prefere ol privata entrepreno, eltiris por granda parto de lia guberniestreco. La kazo estis decidita fare de la Kalifornia Supera Tribunalo en 1906, decidante en la favoro de Oakland. Pardee ankaŭ instigis al kreado de novaj fervojfirmaoj por rompi la monopolojn de la Suda Pacifiko.