Skribu daŭrigon por ĉi tiu paragrafo - En 1900, Ōkubo estis promociita al generalleŭtenanto kaj ĉefo de la Ĝenerala Inspektoro de Armea Trejnado. En majo 1902, li iĝis komandanto de la IJA 6-a Infanteriodivizio. Dum la Rusa-Japana Milito, la IJA 6-a Infanteriodivizio estis ligita al la japana Dua Armeo, sed post la Batalo de Shaho
estis transdonita al la japana Kvara Armeo antaŭ la Batalo de Mukden. Post la milito, li estis premiita kun la Ordeno de la Leviĝanta Suno, unua klaso kaj la Ordeno de la Ora Kite, dua klaso. En julio 1906, li estis transdonita por komandi la IJA 3-a dividado kaj en septembro 1907 estis levita al la "kazoku" nobeleco kun la titolo de "danshaku" (barono).