Ĉar proteinoj estas tro malgrandaj por esti viditaj sub lummikroskopo, aliaj metodoj devas esti uzataj por determini ilian strukturon. Oftaj eksperimentaj metodoj inkluzivas rentgenan kristalografion kaj NMR-spektroskopion, kiuj ambaŭ povas produkti strukturajn informojn ĉe atoma rezolucio. Tamen, NMR-eksperimentoj povas doni informojn el kiuj subaro de distancoj inter paroj de atomoj povas esti taksita, kaj la finaj eblaj konformacioj por proteino estas determinitaj per distanco-geometria problemo.
elektrona kristalografio