La pacnegocadoj kun Aŭstrio iris nenien en la printempo de 1799, kaj la Direktorio decidis lanĉi novan ofensivon en Germanion, sed la alveno de rusa armeo sub Aleksandro Suvorov kaj freŝaj aŭstraj trupoj sub la arkiduko Karlo ŝanĝis la potenc-ekvilibron por tempo. La armeo de la Danubo de Jourdan transiris Rejnon la 6an de marto sed estis venkita de la arkiduko Karlo, unue ĉe la Batalo de Ostrach
kaj poste ĉe la Batalo de Stockach la 25an de marto 1799. La armeo de Jourdan retiriĝis dum Jourdan mem revenis al Parizo por peti pli da soldatoj.