En januaro 1964, ribelo okazis ĉe la armea kazerno en Jinja, la dua urbo de Ugando kaj hejmo de la unua bataliono de la armeo de Ugando. Similaj ribeloj okazis en du aliaj orientaj afrikaj ŝtatoj; ĉiuj tri landoj petis la subtenon de soldatoj de la brita armeo. Antaŭ ol ili alvenis, tamen, Obote sendis sian defendministron Felix Onama por negoci kun la ribelantoj. Onama estis tenita kiel ostaĝo, kaj konsentis pri multaj postuloj, inkluzive de signifaj salajraj altiĝoj por la armeo, kaj la rapida promocio de multaj oficiroj, inkluzive de la estonta prezidanto.
Li suspendis la konstitucion kaj en marto 1966 li deklaris sin prezidanto.