Skribu daŭrigon por ĉi tiu paragrafo - Sekvante la germanan invadon de Pollando, kiu komencis la duan mondmiliton en septembro 1939, la "SS-Totenkopf-Standarte Brandenburg" eniris la urbon por fari diversajn krimojn kontraŭ la loĝantaro. Jam fine de septembro 1939, la germanoj murdis polajn ostaĝojn de Kłodawa en la proksima Rzuchów arbaro, kaj unu el la antaŭmilitaj urbestroj, Władysław Zalewski, estis murdita en novembro 1939 en Środa Wielkopolska. Dum la okupo de Nazia Germanio
, la urbo estis renomita "Tonningen" (1940<unk>1945). Jam en 1940, la pola subtera rezista movado estis formita en la urbo, kaj ankaŭ sekreta pola instruado estis organizita. En 1941, pli ol 1,500 judoj de Kłodawa estis mortigitaj de la nazioj en la ekstermejo de Chełmno. En 1943, la germanoj arestis kelkajn el la lokaj polaj rezistaj membroj, kiuj tiam estis kondamnitaj al morto aŭ malliberejo. La paroĥa pastro de Kłodawa, Pastro Teofil Choynowski, estis mortigita en la koncentrejo Dachau en 1943. Kłodawa estis poste liberigita la 19-an de januaro 1945 fare de la Ruĝa Armeo, kaj restarigita al Pollando.