La 11an de marto 2011, la flughaveno estis difektita de la Tōhoku sismo de 2011
kaj poste pro la cunamo estis tute inundita. Aldone al subakvi la antaŭbordon, taksiojn kaj startlenon, la inunda akvo atingis partojn de la dua nivelo de la pasaĝera terminalo, igante elektrajn ekipaĵojn, transformilojn kaj sekurecajn ekipaĵojn nefunkciigeblaj. La operacioj en Sendai same kiel en la flughaveno Odate-Noshiro kaj la flughaveno Sado, kiuj estis kontrolataj de la kontrolturo de la flughaveno Sendai, estis suspenditaj. Proksimume 1300 homoj estis blokitaj ene de la terminalo ĝis la 13a de marto, kiam ili estis evakuitaj. Antaŭ la 17-a de marto armeaj inĝenieroj parte malfermis la flughavenon por la flugoj de la cunamaj reagoj.