En marto 1798 momento de ekscito estis kaŭzita de la franca invado de Svislando kiam la urbo Berno estis atakita. Necker estis respektata, kiam la armeo preterpasis lian domegon. En julio 1798 li estis forigita de la listo de Émigrés. Lia domo en la 9-a arondismento de Parizo estis vendita al (aŭ okupita de?) la edzo de Juliette Récamier. Frue en junio 1800 Necker renkontiĝis kun Napoleono sur sia vojo al Marengo
Ĉu vi ne scias? En konfidenco, Napoleono rakontis al li pri siaj planoj restarigi monarkion en Francio. La publikigo de "Last Views on Politics and Finance" de Necker en 1802 ĉagrenis la unuan konsulon. Li minacis ekzili sinjorinon de Staël el Parizo pro tiu libro. Kvankam Necker neniam estis respublikano antaŭe, al la fino de sia vivo, li okupiĝis serioze pri la projekto de kreado kaj firmigo de respubliko "unu kaj nedividebla" en Francio. Necker tiam antaŭdiris la subpremadon de la Tribunato kiam ĝi okazis sub la Franca Konsulejo. Lia postulo de du milionoj da frankoj de la ŝtata trezoro ne estis agnoskita de la franca Senato. Necker estis entombigita apud sia edzino en la ĝardeno de Coppet Castle; la maŭzoleo estis sigelita en 1817 post kiam Germaine ankaŭ estis entombigita tie. La Ĉarto de 1814 subskribita de Louis XVIII en Saint-Ouen sûr Seine enhavis preskaŭ ĉiujn artikolojn en subteno de libereco proponita de Necker antaŭ la Revolucio de 14 julio 1789. Tial, George Armstrong Kelly nomis lin la "avon de Restaŭra Liberalismo".