Skribu daŭrigon por ĉi tiu paragrafo - Bourdais testis signife por la Toro Rosso-teamo dum la vintro, kvankam li estis necerta pri veturado en la novan jaron. La 6an de februaro 2009 tamen li estis konfirmita kiel Toro Rosso-ŝoforo por dua jaro, kunlabore kun svisa novulo Sébastien Buemi. Malgraŭ du poentoj finitaj en la jaro ĉe la Aŭstralia Granda Premio
Kaj en Monako, Bourdais luktis por egali sian malpli spertan samteamon. En Hispanio Bourdais trafis la aŭton de Buemi kiam la kampo provis eviti turnitan Jarno Trulli en la unua rondiro, finante la vetkuron por ambaŭ ŝoforoj. Ĉe la Brita Granda Premio Bourdais koliziis kun McLaren-ŝoforo Heikki Kovalainen, denove finante la vetkuron por ambaŭ. Ĉe la Germana Granda Premio li suferis mekanikan difekton post kvalifiko lasta de pli ol sekundo.