La konvertiĝo de N2 en amoniakon okazas en metala areto nomata FeMoco, mallongigo por la fer-molibdeno-kofaktoro. La mekanismo okazas per serio de protonaj kaj reduktitaj ŝtupoj, kie la FeMoco-aktiva loko hidrogenas la N2-substraton. En liberaj vivantaj diazofasoj, la nitrogenazo-generitita amoniako estas asimilata en glutamaton tra la glutamina sintezilo / glutamatasa.
anaerobiaj kondiĉoj