Kompletigu la sekvan frazon: La sinagogo baldaŭ fariĝis la centro de malgranda sed vigla juda komunumo, kies unu el la gvidantoj, Abraham Reuben, fariĝis konsilisto de la urba korporacio de Karaĉio en 1936. La dividado de brita Hindio laŭ religiaj linioj inter hinduoj kaj islamanoj en aŭgusto 1947 vidis la urbon Karaĉio fali ene de la limoj de la nova islama-plimulta ŝtato de Pakistano, post kiu la antaŭa afilia ŝildo de la sinagogo estis ŝanĝita, nomante ĝin sub la "Pakistan Bene Israel Community". Malpli ol jaron poste, la sinagogo estis atakita kaj bruligita de islamaj tumultuloj post la Deklaracio de Sendependeco de la Ŝtato de Israelo en 1948. Dum tiu tempo, pluraj judoj tra la tuta Pakistano estis atakitaj, kio poste igis partojn de la komunumo fuĝi al la najbara Hindio. Tamen, la ofteco de atakoj kontraŭ judoj en Pakistano pliiĝis post ĉiu el la arabaj-israelaj militoj en 1948,
1956, 1967 kaj 1973. De la fruaj 1970-aj jaroj, la pakistana juda komunumo plejparte foriris al Israelo aŭ Hindio pro la juda elirado el islamaj ŝtatoj, efike igante la sinagogon plejparte neaktiva. La 17an de julio 1988, la sinagogo estis disfaligita kaj poste anstataŭigita per butikplaco (Madiha Square) en la najbareco Ranchore Line de suda Karaĉio.