Rigardu la malsupran trairejon kaj poste respondu la demandon poste en la sama lingvo kiel la trairejo:  La taksonomio de protistoj daŭre ŝanĝiĝas. Pli novaj klasifikoj provas prezenti monofiletikajn grupojn bazitajn sur morfologiaj (aparte ultrastrukturaj), biokemiaj (kemotaxonomio) kaj DNA-sekvenco (molekula esplorado) informoj. Tamen, kelkfoje ekzistas malkonsentoj inter molekulaj kaj morfologiaj enketoj; tiuj povas esti klasifikitaj kiel du tipoj: (i) unu morfologio, multoblaj genlinioj (ekz. morfologia konverĝo, kriptaj specioj) kaj (ii) unu genlinio, multoblaj morfologioj (ekz. fenotipa plasteco, multoblaj vivciklaj stadioj). Ĉar la protistoj kiel tutaĵo estas parafiletaj, novaj sistemoj ofte disigas aŭ forlasas la regnon, anstataŭe traktante la protistajn grupojn kiel apartajn liniojn de eŭkariotoj. La lastatempa skemo de Adl et al. (2005) ne rekonas formalajn rangojn (filumo, klaso, ktp.) kaj anstataŭe traktas grupojn kiel kladojn de filogenete rilataj organismoj. Tio estas intencita por igi la klasifikon pli stabila en la longa perspektivo kaj pli facila ĝisdatigi. Kelkaj el la ĉefaj grupoj de protistoj, kiuj povas esti traktitaj kiel filumoj, estas listigitaj en la takso-kesto, supra dekstra. Multaj supozeble estas monofiletaj, kvankam ankoraŭ ekzistas necerteco. Ekzemple, la Excavata verŝajne ne estas monofiletikaj kaj la kromalveolatoj verŝajne estas monofiletikaj nur se la haptofitoj kaj kriptomonadoj estas ekskluditaj.  Demando: Kio estas unu karakterizaĵo de la Excavata?
ne monofiletika