Komence de 1953, ili estis translokigitaj al la Palestina Arkeologia Muzeo (ofte nomata la Muzeo Rockefeller) en Orienta Jerusalemo kaj dum ilia transportado suferis pli da malboniĝo kaj damaĝo. La muzeo estis subfinancita kaj havis limigitajn rimedojn por ekzameni la volvlibrojn, kaj, kiel rezulto, kondiĉoj de la "volvlibro" kaj stokadareo estis lasitaj relative nekontrolitaj de modernaj normoj. La muzeo lasis la plej multajn el la fragmentoj kaj volvlibroj inter la fenestraj vitroj, kaptante la humidon kun ili, kaŭzante akcelon de la procezo de difekto. Dum parto de la konflikto dum la milito de 1956
la kolekto de la Palestina Arkeologia Muzeo estis konservita en la trezorejo de la Otomana Banko en Amano, Jordanio. Humidaj kondiĉoj de provizora stokado de la volvetoj en la trezorejo de la Otomana Banko de 1956 ĝis la printempo de 1957 kaŭzis pli rapidan rapidecon de malboniĝo de la volvetoj. La kondiĉoj kaŭzis, ke sur la volvlibroj kaj fragmentoj formiĝis ŝimo, kaj iuj fragmentoj estis parte detruitaj aŭ iĝis nelegeblaj de la gluo kaj papero de la manilkovriloj, en kiuj ili estis konservitaj dum en la trezorejo. Antaŭ 1958 oni rimarkis, ke ĝis 5% de iuj el la volvlibroj tute difektiĝis. Multaj el la tekstoj fariĝis nelegeblaj kaj multaj el la pergamenoj fariĝis konsiderinde malhelaj.