Skribu daŭrigon por ĉi tiu paragrafo - Sekvante la nacian germanan kaj sovetian invadon de Pollando, kiu komencis la duan mondmiliton, Kolno estis transprenita de la germanaj trupoj la 8an de septembro 1939. La 12-13an de septembro 1939, la germana "Einsatzgruppe V" eniris la urbon por fari diversajn krimojn kontraŭ la loĝantaro. La 29an de septembro sovetianoj eniris la areon konforme al la Pakto Ribbentrop-Molotov. La sovetianoj aranĝis amasajn deportadojn de la loĝantoj al Sovet-Unio. Jam en 1939, la pola rezista movado estis organizita en Kolno fare de Stanisław Milewski. La urbo restis sub sovetia okupo.
Ĝis Operacio Barbaroso (22 junio 1941) kiam ĝi denove estis transkurita de la Wehrmacht.