Skribu daŭrigon por ĉi tiu paragrafo - Ĉirkaŭ la komenco de la 16-a jarcento, post la konstruado de la Ribeira Palaco apud la rivero Tejo, la Palaco de Alcáçova komencis perdi sian gravecon. Tertremo okazinta en 1531 plue difektis la malnovan kastelon, kontribuante plu al ĝia kadukiĝo kaj neglekto. En 1569, reĝo Sebastiano ordonis la rekonstruon de la reĝaj loĝejoj en la kastelo, intencante uzi ĝin kiel sian oficialan loĝejon. Kiel parto de la rekonstruo, en 1577 Filippo Terzi detruis unu el la turoj proksime de la ĉefa fasado de la Preĝejo de Loreto. Tamen, multaj el la verkoj neniam estis kompletigitaj post la ŝajna morto de la juna reĝo dum la Batalo de Alcácer Quibir
Ĉu vi ne scias? La sekva portugala dinastia krizo malfermis la vojon al sesdek jaroj da hispana regado kaj la kastelo estis transformita en armean kazernon kaj malliberejon. La 30an de decembro 1642, Teodósio de Frias la Juna estis nomumita majstra konstruisto por daŭrigi la verkojn komencitajn de lia patro, Luís de Frias, kaj lia avo, Teodósio de Frias. Tio estis parto de pli granda plano de la hispanaj trupoj por rekomenci la fortikaĵon.