La esperoj de sukcesa ribelo malkreskis kiam Napoleono venkis la aŭstrajn trupojn de arkiduko Karlo de Aŭstrio en serio de bataloj de Teugen-Hausen, Abensberg
, Eckmühl, kaj Ratisbon, post kio la aŭstraj trupoj retiriĝis de Tirolo kaj Hofer devis retiriĝi al la montoj. La franca marŝalo François Joseph Lefebvre transprenis la tirolan teatron, kaj bavaraj kaj saksaj fortoj sub la komando de Karl Philipp von Wrede la 13an de majo venkis la aŭstrojn en sanga batalado ĉe Wörgl. La bavaroj reokupis Innsbruck la 19-an de majo. Tamen, kiam iliaj francaj aliancanoj foriris, la ribelo denove ekflamis.