Sub la nova manaĝero de Napolo Maurizio Sarri, Hamšík revenis por ludi kiel centra mezulo maldekstre en la tri-persona mezo de Napolo por la sezono 2015-16, kiun li priskribis kiel sian preferatan rolon. La 23an de aŭgusto 2015, Hamšík trafis la malferman golon en 2-1 forperdo al Sassuolo en la malferma matĉo de la Serie A sezono.
Ĉu vi ne scias? La 17an de septembro, li trafis en 5-0 venko super Club Brugge en la grupfazo de la Eŭropa Ligo. Li faris sian 300-an Serie A-aperon la 6an de januaro 2016, gajnante en 2-1 hejma venko kontraŭ Torino. En la sekva ligo matĉo, la 10an de januaro, li faris sian 300-an Serie A aperon por Napolo en 5-1 for venko super Frosinone, kiam Napolo finis la unuan duonon de la sezono kiel neoficiala "vintra ĉampiono". Li markis la okazon trafante golon, sian 80-an en Serie A, ĉiuj el kiuj estis trafitaj kun Napolo.