Post sia resaniĝo, d'Hautpoul ricevis komandon de la peza kavalerio de la Armeo de Sambre-et-Meuse sub generalo Paul Grenier. Post Neuwied, li estis transdonita al la Armeo de Anglio sub komando de Lazare Hoche. Kiam la franca Direktorio forlasis la ideon de invado de Anglio, li denove estis deplojita sur la germana fronto, ĉi-foje kiel parto de la Danuba Armeo. Post la franca malvenko en la Batalo de Ostrach
, lia kavaleriorezervo protektis la francan retiriĝon de Pfullendorf. Kelkajn tagojn poste, post malsukceso gvidi ĝustatempan pagendaĵon ĉe la Batalo de Stockach, li estis suspendita laŭ ordoj de la armeokomandanto, Jean-Baptiste Jourdan, kiu kulpigis d'Hautpoul pri la malvenko. Malkondamnita de militkortumo en Strasburgo, d'Hautpoul rekomencis siajn devojn fine de julio 1799, maltrafinte la kritikajn agojn ĉe la Unua Batalo de Zuriko.