La unua universitato en Bratislavo, en la Regno de Hungario (kaj ankaŭ en la teritorio de aktuala Slovakio) estis Universitas Istropolitana, fondita en 1465 de reĝo Matthias Corvinus. Ĝi estis fermita en 1490 post lia morto. Bratislavo estas la sidloko de la plej granda universitato (Universitato Komenio, 27,771 studentoj), la plej granda teknika universitato (Slovaka Universitato de Teknologio, 18,473 studentoj), kaj la plej malnovaj artlernejoj (la Akademio de Prezentartoj kaj la Akademio de Belartoj kaj Dezajno) en Slovakio. Aliaj institucioj de terciara eduko estas la publika Universitato de Ekonomio kaj la unua privata kolegio en Slovakio, Universitato de Seattle. En totalo, proksimume 56,000 studentoj ĉeestas universitaton en Bratislavo. Estas 65 publikaj bazlernejoj, naŭ privataj bazlernejoj kaj dek religiaj bazlernejoj.
Reĝo