Antaŭ la komenco de la Milito de la Dua Koalicio en 1799 li estis oficiro en la Cisalpina Respubliko funkcianta kiel Aide de Camp (ADC) al Jean Victor Marie Moreau, tiam Barthélemy Catherine Joubert dum la kampanjo en Norda Italio. Post la morto de Joubert en la katastrofa batalo de Novi
Balabio fuĝis kun siaj trupoj kaj aliĝis al la fortoj sub André Masséna, distingante sin kiel ADC dum la sieĝo de Ĝenovo 1800, por kiu li estis promociita al kolonelo.