Tamen la fina celo de Petrobey estis la libereco de la grekoj de la otomana regado, kaj li uzis sian lokan potencon kaj aŭtonomion por konstrui subtenon por grandskala greka ribelo. En 1821 tiu ribelo formale komenciĝis en kio iĝus la Greka Milito por Sendependeco. Li estis konata kiel interkonsentisto kaj libervole cedis gvidadon de la ribelo al Theodoros Kolokotronis kiam ĝi fariĝis saĝe necesa. Li kontribuis decidajn kontingentojn de soldatoj por liberigi Kalamaton kaj Tripolison.
kaj partoprenis en la ekspedicio por helpi la Souliotes. En tiu ekspedicio la pli juna frato de Petrobey Kyriakoulis Mavromichalis heroe mortis batalante kontraŭ la turkoj. Sub la gvidado de Petrobey kaj lia frato Konstantinos Mavromichalis, grekaj trupoj sukcese venkis la faman otomanan komandanton Ibrahim Paŝa dum la egipta Invado de Mani. Tiu armea venko certigis grekan kontrolon de la strategie grava urbo Nafplio kiu, post la revolucio, iĝus la unua ĉefurbo de la moderna greka ŝtato.