La ĉefa kaŭzo de tuberkulozo estas Mycobacterium tuberculosis (MTB), malgranda, aerba, nemovebla bacilino. La alta lipida enhavo de ĉi tiu patogeno respondecas pri multaj el ĝiaj unikaj klinikaj karakterizaĵoj. Ĝi dividas ĉiujn 16 ĝis 20 horojn, kio estas ekstreme malrapida rapideco kompare kun aliaj bakterioj, kiuj kutime dividas en malpli ol unu horo. Mikobakterioj havas eksteran membranan lipidan duoblan. Se oni faras Gram-koloraĵon, MTB-koloraĵoj estas aŭ tre malforte "Gram-pozitivaj" aŭ ne retenas tinkturon pro la alta lipida kaj mikol-acida enhavo de ĝia ĉela muro. MTB povas elteni malfortajn desinfektaĵojn kaj postvivi en seka stato dum semajnoj. En naturo, la bakterio povas kreski nur ene de la ĉeloj de gastiganta organismo, sed MTB-tuberkulozo povas esti malkovrita en la laboratorio. Uzante plej multajn histopologiajn specimenojn, kiuj kutime dividas en malpli
Auramino-rodamino-kolorigado kaj fluoreska mikroskopo