O'Malley estis nomumita koadjutora episkopo de la Diocese of Saint Thomas (Diocezo de Sankta Tomaso) la 30-an de majo 1984, fare de Johano Paŭlo la 2-a. Li ricevis sian episkopan konsekron la sekvan 2-an de aŭgusto de Episkopo Edward John Harper, kun Ĉefepiskopo James Hickey kaj Episkopo Eugene Marino funkcianta kiel ko-konsekratoroj.
Ĉefepiskopo