Aniston estis naskita la 11-an de februaro 1969, en la najbareco de Sherman Oaks en Los-Anĝeleso, filino de greka aktoro John Aniston kaj aktorino Nancy Dow. Unu el ŝiaj patrinflankaj praavoj, Louis Grieco, estis el Italio. La alia deveno de ŝia patrino inkluzivas la anglan, irlandan, skotan, kaj malgrandan kvanton de greka. Aniston havas du duonfratojn, John Melick, ŝian pli maljunan patrinflankan fraton, kaj Alex Aniston, ŝian pli junan patrinflankan fraton. La baptopatro de Aniston estis aktoro Telly Savalas, unu el la plej bonaj amikoj de ŝia patro. Kiel infano ŝi translokiĝis al Novjorko. Malgraŭ la televida kariero de sia patro ŝi estis malkuraĝigita spekti televidon, kvankam ŝi trovis manierojn ĉirkaŭ la malpermeso. Kiam ŝi estis sesjara, ŝi komencis lerni en Waldorf-lernejo. Kiam ŝi estis naŭjara malkovrita de ŝiaj gepatroj, ŝi enskribiĝis en la lernejo
Los-Anĝeleso