La 31an de januaro 2013, Kovačić konsentis pri translokigo al Inter Milano. Estis rivelita ke la interkonsento estis valora je 15 milionoj € en totalo, kun 11 milionoj € tuj pagita kaj 4 milionoj € kiam kaj se Inter kvalifikiĝas por la UEFA Ĉampionligo. Sur lia alveno, Kovačić ricevis la numero 10 ĉemizon, antaŭe portitan fare de Wesley Sneijder. Demando: kie Kovačić diris ke li transdonus al?
Inter Milano