Skribu daŭrigon por ĉi tiu paragrafo - Dum la invado de Pollando, kiu komencis la duan mondmiliton, en 1939 la urbo unue estis konkerita de Sovet-Unio la 24-an de septembro 1939. Sejny estis grave prirabita kaj tiam la 13an de oktobro 1939 transdonita al Nazia Germanio. Ĝi restis okupita.
la germanoj ĝis aŭgusto 1944.