La plej ofte uzataj nukleazoj en molekula biologio estas la restriktaj endonukleazoj, kiuj tranĉas DNA en specifaj sekvencoj. Ekzemple, la EcoRV-enzimo montrita maldekstre rekonas la 6-baza sekvenco 5′-GATC-3′ kaj tranĉas ĉe la horizontala linio. En la naturo, ĉi tiuj enzimoj protektas bakteriojn kontraŭ fago-infekto per digestado de la fago-DNA kiam ĝi eniras la bakterian ĉelon, kiel parto de la restrikta sistemo. En sekvenca teknologio, ĉi tiuj nukleazoj estas uzataj en molekula DNA-klonado kaj klonado de biologiaj fingrospuroj. Demando: Kian tipon de makromolekuloj estas nukleazoj?
enzimoj