Naskiĝinta en Napolo, Ferrara komencis sian karieron kun la junulara sistemo de la hejmurba klubo Napoli en 1980. Li diplomiĝis de la "primavera" junulara taĉmento en 1984, kaj komencis gajni unuajn teamojn en tiu sezono. Li faris 14 totalajn aspektojn kun la klubo en sia unua plena sezono. La sekvan sezonon, Ferrara iĝis parto de la komenca dekunuo, kaj li baldaŭ komencis gajni alvokojn al la nacia teamo de Italio, farante la taĉmenton por la Monda Pokalo de 1990. Li ankaŭ trafis unu el la goloj de Napolo kiam ili gajnis la UEFA-pokalon de 1989. Aldone al la UEFA-pokalo, kun Napolo li gajnis du Serie A-titolojn (en 1986-87).
kaj 1989-90), la 1987 Coppa Italia finalo, kaj la 1990 Supercoppa Italiana, ĉi-lasta super lia estonta teamo, Juventus.