Se antibiotikoj devas esti uzataj, makrolido (kiel ekzemple azitromicino) estas preferata al fluoroquinolone pro pli altaj tarifoj de rezisto al ĉi-lasta. Pseudomembranoza kolito, kutime kaŭzita de antibiotika uzo, estas administrata per ĉesigo de la kaŭzanta agento kaj traktado de ĝi kun aŭ metronidazole aŭ vancomycin. Bakterioj kaj protozooj, kiuj estas akceptemaj al traktado, inkluzivas Shigella Salmonella typhi, kaj Giardia speciojn. En tiuj specioj kun Giardia tinamaeba aŭ Entamolitica tinhea, histidazole estas rekomendita kaj traktado estas pli bona ol metronidazole. La Monda Organizaĵo pri Sano (WHO) rekomendas la uzon de antibiotikoj de la junaj infanoj, kiuj povus havi sangon kaj febron.
Pseudomembranoza kolito