Aliaj kondiĉoj, kiuj povas kaŭzi similajn simptomojn al migrena kapdoloro, inkluzivas temporalan arteriton, klastrajn kapdolorojn, akutan glaŭkomon, meningiton kaj subarachnoidan hemoragion. Temporala arterito tipe okazas ĉe homoj pli ol 50-jaraj kaj prezentas sentemon super la templo, klastraj kapdoloroj prezentas unuflankan nazŝtopiĝon, larmojn kaj fortan doloron ĉirkaŭ la orbitoj, akutan glaŭkomon estas asociita kun vidaj problemoj, meningito kun febroj, kaj subarachnoida hemorago kun tre rapida komenco. Tensionaj kapdoloroj tipe okazas sur ambaŭ flankoj, ne estas batantaj, kaj estas malpli handikapantaj. Tiuj kun stabilaj kapdoloroj, kiuj plenumas kriteriojn por migrenoj, ne ricevu neŭroimaging por serĉi aliajn intracranianajn malsanojn. Ĉi tio koncernas aliajn rezultojn kiel ekzemple papila disko (semao de la temporala disko) okazas. Homoj kun kapdoloroj ne estas pliigita risko
en homoj pli ol 50-jaraj