Baldaŭ post la batalo, li edziĝis kun la filino de eminenta atenano, kaj liaj agadoj poste estis nesolveble ligitaj kun tiu urbo ĝis lia morto. Post kiam Ateno estis kaptita de Ibrahim Pasha en junio 1826, Makriyannis helpis organizi la defendon de la Akropolo, kaj iĝis la provizora komandanto de la garnizono post la morto de la komandanto, Yannis Gouras. Li sukcesis repeli furiozan atakon kontraŭ la Odeono de Herodo Atiko la 7an de oktobro, kaj dum la defendo de la Akropolo, li suferis pezajn vundojn trifoje, al la kapo kaj al la kolo. Tiuj vundoj ĝenis lin dum la resto de lia vivo, sed ili ne malkuraĝigis lin partopreni en la lasta fazo de la milito: en la printempo de 1827 li partoprenis en la bataloj de Pireo kaj la batalo de Falerono
Ĉu vi ne scias?