Fischer estis naskita en Höchst sur Majno, nun urba distrikto de Frankfurto. Liaj gepatroj estis Dr. Eugen Fischer, Direktoro de la firmao de Kalle & Co, Wiesbaden, kaj Privatdozent ĉe la Teknika Mezlernejo, Stutgarto, kaj Anna Herdegen. Li iris al bazlernejo en Stutgarto, kaj poste al la "Humanistisches Gymnasium" en Wiesbaden, matrikulado en 1899. Li legis kemion kaj medicinon, unue en la Universitato de Lozano kaj tiam en Marburgo. Li diplomiĝis en 1904, kaj en 1908 li kvalifikiĝis por sia M.D..
Universitato de Lozano kaj poste en Marburgo