الجزيرة اتسميت على اسم الاميرال الجالسي في خدمة البرتغال (Xoán da Nova or de Novoa in Galician; João da Nova in Portuguese) والذي وصل الجزيرة في سنة 1501. الجزيرة ما كانتش مأهولة قط لما أصبحت ملكا لفرنسا في سنة 1897. في سنة 1921، قررت فرنسا نقل إدارة جوان دي نوفا من باريس إلى تاناناريف في مستعمرة مدغشقر والإعتمادات. قبل استقلال مدغشقر، نقلت فرنسا الإدارة إلى سان بيير في جزيرة ريونيون. أصبحت مدغشقر مستقلة في سنة 1960 و تطالب بالسيادة على الجزيرة منذ سنة 1972. تم استغلال ودائع الغوانو (الفوسفات) من بداية القرن العشرين حتى سنة 1970. تم التخلي عن الجزيرة خلال الحرب العالمية الثانية و زارها الغواصات الألمانية. المرافق، بما في ذلك خطوط السكك الحديدية، وآثار المنازل، والسفينة في استقلالها.
سنة 1960