ولد ألن في 21 يناير 1953 ، في سياتل ، واشنطن ، لأبيه كينيث سام ألن و إدنا فاي (مواليد جاردنر) ألن. درس ألن في مدرسة ليكسايد ، وهي مدرسة خاصة في سياتل ، حيث اتصاحب بيل غيتس الأصغر منه بسنتين ، والذي شارك معه حماس للكمبيوترات. استخدموا محطة تلي تايب ليكسايد لتطوير مهاراتهم في البرمجة على العديد من أنظمة الكمبيوتر المشتركة في الوقت. استخدموا أيضًا مختبر قسم علوم الكمبيوتر بجامعة واشنطن ، للقيام بأبحاث شخصية وبرمجة الكمبيوترات ؛ في مناسبة واحدة على الأقل في عام 1971 ، تم حظرهم من المختبر بسبب إساءة استخدام امتيازاتهم هناك. وفقًا لألن ، في سنوات مراهقتهم ، كان هو وبيل غيتس يذهبون إلى القمامة للتخفيض عن برنامج الكمبيوتر.
هارفارد