إكتب استمرار لهذه الفقرة - شارك جيمس كونر في قصف فورت سومتر كقائد لحرس مونتغمري، وحدة ميليشيا كارولينا الجنوبية. في بداية الحرب الأهلية، رفض تعيين كمحامي مقاطعة للكونفدرالية. بدلاً من ذلك ، أصبح كابتنًا في فيلق هامبتون وحارب في معركة أول بول ران (ماناساس الأولى) ، حيث تولى قيادة الفيلق مؤقتًا بعد إصابة العقيد وايد هامبتون. في 21 يوليو 1861 ، تم تعيين كونر كرائد في فيلق هامبتون. بعد معركة سبعة الصنوبر
خلال حملة شبه الجزيرة، اتولى قيادة فوج المشاة التطوعي 22 شمال كارولينا. خلال معارك سبعة أيام ، كُسرت ساقه من قبل رصاصة بندقية خلال معركة جينز ميل. بعد فترة استرداد لمدة شهرين ، عاد لقيادة فوجه في معركة تشانسلرزفيل ومعركة جيتيسبرغ.