وُلِد شون باتريك أومالي باسم باتريك أومالي في 29 يونيو 1944 في لايكوود بولاية أوهايو، وهو ابن ثيودور و ماري لويز أومالي. كان الوالدين من أصل أيرلندي. ترعرع أومالي وشقيقته وشقيقه الأكبر في ساوث هيلز في بيتسبورغ، وريدينغ بولاية بنسلفانيا. في سن 12 دخل كلية سانت فيديليس الصغرى في هيرمان، وهي مدرسة داخلية للطلاب الذين كانوا يفكرون في الانضمام إلى فرنسيسكان. في حين أنه هناك، بالإضافة إلى دراسة المواد العادية في المدرسة الثانوية، درس أيضًا الإسبانية والبرتغالية واليونانية والألمانية والعبرية، في حين كان نشطًا أيضًا في المسرح.
٢٩ يونيو ١٩٤٤