Voltooi de volgende zin: Assistent-manager Jimmy Murphy nam het over als manager terwijl Busby herstelde van zijn verwondingen en de geïmproviseerde kant van de club bereikte de FA Cup-finale, die ze verloren tegen Bolton Wanderers. Als erkenning voor de tragedie van het team nodigde de UEFA de club uit om mee te doen aan de Europese Cup van 1958/59 samen met de uiteindelijke kampioenen van de League, Wolverhampton Wanderers. Ondanks de goedkeuring van de Football Association, besloot de Football League dat de club niet in de competitie mocht deelnemen, omdat hij zich niet had gekwalificeerd. Busby herbouwde het team door de jaren 1960 door het ondertekenen van spelers zoals Denis Law en Pat Crerand, die gecombineerd met de volgende generatie jeugdspelers - waaronder George Best - de FA Cup in 1963 wonnen. Het volgende seizoen eindigden ze tweede in de competitie, en wonnen vervolgens de titel in 1965 en 1967. In 1968 werd Manchester United de eerste Engelse (en tweede Britse) club die de Europese Cup won, waarbij ze Benfica versloegen met 4 tegen 1 in de finale met een team dat drie Europese voetballers van het jaar bevatte: Bobby Charlton, Denis Law en George Best. Zij vertegenwoordigden vervolgens Europa in de
1968 Intercontinental Cup tegen Estudiantes van Argentinië, maar verloor de gelijkspel na het verliezen van de eerste etappe in Buenos Aires, voordat ze drie weken later in Old Trafford met 1 tegen 1 drew. Busby nam ontslag als manager in 1969 voordat hij werd vervangen door de reserve-teamcoach, de voormalige Manchester United-speler Wilf McGuinness.