De belangrijkste gevechten van het regiment waren de Slag om Rowlett's Station, de
Slag bij Shiloh en Slag bij Stones River in 1861 en 1862. De 32e Indiana nam ook deel aan de Tullahoma-campagne, de Chickamauga-campagne en de Chattanooga-campagne in 1863, en aan talrijke veldslagen tijdens de Atlanta-campagne in 1864. Nadat de eerste groep driejarige soldaten op 7 september 1864 bij Indianapolis was opgeroepen, vochten de resterende troepen van het regiment in de Slag bij Jonesborough en de Slag bij Lovejoy's Station. Een gereorganiseerde 32e Indiana, die een bataljon van vier compagnieën omvatte, werd gehecht aan het departement Texas en diende in Texas totdat de resterende mannen op 4 december 1865 uit dienst werden genomen.