De grens in het zuidwesten werd langzaam uitgebreid, in 1701 versloegen de Qing de Tibetanen in de Slag bij Dartsedo. Het Dzungar Khanate veroverde de Oeigoeren in de Dzungar verovering van Altishahr en greep de controle over Tibet. Han Chinese Groene Standaard Leger soldaten en Manchu vlaggenhoeders werden geleid door de Han Chinese generaal Yue Zhongqi in de Chinese expeditie naar Tibet (1720)
die de Dzungars uit Tibet verdreven en het onder Qing-heerschappij plaatste. Op meerdere plaatsen, zoals Lhasa, Batang, Dartsendo, Lhari, Chamdo en Litang, werden Green Standard-troepen gedurende de hele Dzungar-oorlog in het garnizoen geplaatst. Groene Standaard Leger troepen en Manchu Bannermen waren beide deel van de Qing kracht die vochten in Tibet in de oorlog tegen de Dzungars. Er werd gezegd dat de Sichuan-commandant Yue Zhongqi (een afstammeling van Yue Fei) Lhasa als eerste binnenkwam toen de 2.000 Green Standard-soldaten en 1.000 Manchu-soldaten van de "Sichuan-route" Lhasa innamen. Volgens Mark C. Elliott gebruikten de Qing na 1728 Green Standard Army-troepen om het garnizoen in Lhasa te bemannen in plaats van Bannermen. Volgens Evelyn S. Rawski vormden zowel het Green Standard Army als de Bannermen het Qing-garnizoen in Tibet. Volgens Sabine Dabringhaus stonden er meer dan 1.300 Chinese soldaten van de Groene Standaard door de Qing in Tibet ter ondersteuning van het 3.000 man sterke Tibetaanse leger.