De nieuwe manager van de Marlins, Jim Leyland, zette Conine in 1997 terug op het eerste honk, omdat de club Moisés Alou had gekocht. De Marlins eindigden op de tweede plaats achter de Atlanta Braves in de National League East met negen wedstrijden, maar hun 92 tegen 70 record was genoeg om de wild card play-off plaats van de National League te verzekeren. Na het wegvagen van de San Francisco Giants in de 1997 National League Division Series, versloegen de Marlins hun divisie rivaal Braves in de 1997 National League Championship Series.
Vier wedstrijden tegen twee. Conine's zevende inning single zorgde voor de game-winnende RBI in game vijf van de serie.