In zijn eerste race met Alpine, werd Alonso gedwongen om te stoppen nadat plastic puin in zijn remkanaal kwam. Op de 2021 Emilia Romagna Grand Prix
Hij eindigde op P11 na de kwalificatie P15, met teamgenoot Ocon voorop in P10, maar beide werden een positie geüpgraded nadat Kimi Räikkönen werd bestraft, waardoor Alonso zijn eerste punten van het seizoen kreeg. Tijdens de Hongaarse Grand Prix van 2021 leidde Alonso tijdelijk de race voordat hij stopte en naar de vierde plaats viel, voor Lewis Hamilton. Teamgenoot Ocon schrijft Alonso's verdediging tegen Hamilton toe, waardoor hij zijn eerste raceoverwinning behaalde. In augustus 2021 riep Alonso een optie in om zijn contract voor het seizoen te verlengen.