Nadat Okinawa veilig was gesteld, concentreerde de Derde Vloot zich op operaties tegen Japan zelf. Van 10 tot en met 29 juli 1945 ondersteunde Merrimack overweldigende aanvallen op Japanse doelen, wat het einde van de oorlog versnelde. Volgende
Na de capitulatie van Japan op 15 augustus 1945 maakte de Merrimack verschillende cruises tussen de westkust van de Verenigde Staten en Oost-Azië om olie te brengen voor schepen die de bezetting van Japan ondersteunden en langs de kusten van China en Korea opereren. Ze werd in oktober 1949 toegewezen aan de Military Sea Transportation Service (MSTS), kort voor het begin van de pre-inactivatie-herhaling. De Merrimack werd op 8 februari 1950 buiten dienst gesteld en trad in bij de Atlantic Reserve Fleet in Orange, Texas.