Na de Japanse aanval op Pearl Harbor en de toetreding van de Verenigde Staten tot de Tweede Wereldoorlog, werd Foster teruggeroepen tot actieve dienst met de rang van commandant in de Naval Reserve en kreeg rechtstreeks de opdracht van president Franklin D. Roosevelt om speciale marine-inspecties uit te voeren. Een van zijn eerste missies was onderzoek doen in de Panamakanaalzone.
Na een reeks klachten van luitenant-generaal Daniel Van Voorhis, commandant van het Caribbean Defence Command over de samenwerking tussen leger en marine.