Vulkaanuitbarstingen veranderen het wereldwijde klimaat door as en gassen in de atmosfeer te injecteren, waardoor de hoeveelheid zonlicht die de aarde bereikt, afneemt, wat vaak leidt tot koud weer en mislukte oogsten. De uitbarsting van Huaynaputina verminderde de hoeveelheid zonne-energie die de aarde bereikte met ongeveer De zomer van 1601 was een van de koudste op het noordelijk halfrond in de afgelopen zes eeuwen, en de impact kan vergelijkbaar zijn met die van de 1815 Tambora, 1453 Kuwae, 1257 Samalas
en 536 Ilopango uitbarstingen. Andere vulkanen kunnen naast Huaynaputina zijn uitgebarsten en ook hebben bijgedragen aan de weersomstandigheden; verschillende grote vulkanische uitbarstingen vonden plaats in de decennia voorafgaand aan en na de uitbarsting van Huaynaputina.