Op 3 februari 2020 werden Fountas door de fans van Rapid Wien uitgeroepen tot beste speler van 2019 dankzij zijn uitstekende prestaties bij de Oostenrijkse club. Op 16 februari kwam zijn twaalfde doelpunt van het seizoen na een fout van tegenstander Thanos Petsos in een 2<unk>0 thuiswinnaar tegen WSG Swarovski Tirol. Op 1 maart, Fountas omgezet een pas van Christoph Knasmüllner om de tweede doelpunt in een 3×1 thuiswinnaar wedstrijd tegen SV Mattersburg. Hij scoorde opnieuw op 7 maart, profiterend van een ernstige fout van Nemanja Rnić en eindigde nadat hij de bal had gewonnen voor zijn 14e doelpunt van het seizoen, in een 2<unk>2 buitenspel tegen Wolfsberger AC. Op 7 juni, nadat de COVID-19-pandemie de competitie had opgeschort, scoorde hij opnieuw in een 4 tegen 0 overwinning op SK Sturm Graz. Drie dagen later scoorde hij het vitale doelpunt in een 1-0 uitwedstrijd overwinning tegen LASK Linz. Een week later scoorde hij opnieuw en behaalde nog een overwinning van 1<unk>0 tegen TSV Hartberg. Op 24 juni scoorde hij een late goal na de assist van Ercan Kara, in een rampzalige 2<unk>7 thuisverlies tegen de kampioenen Red Bull Salzburg. Op 1 juli scoorde hij in zijn vijfde wedstrijd op rij een belangrijke 3<unk>1 thuiswinst tegen LASK. Fountas handhaafde zijn vruchtbare vorm bij Rapid Wenen tot het einde van de Oostenrijkse voetbalbundesliga 2019-20
De Europese Commissie heeft in haar mededeling over de toekomst van de Europese Unie en de Europese Unie in de toekomst van de Europese Unie een aantal voorstellen voor maatregelen voorgesteld om de Europese Unie in staat te stellen haar doelstellingen te bereiken. Bovendien eindigde Fountas het seizoen als de derde hoogste doelmaker van de Bundesliga in Oostenrijk, achter alleen Patson Daka (24 doelpunten, RB Salzburg) en Shon Weissman (30 doelpunten, Wolfsberger).