Na de overgave van het bastion van de Confederatie op 4 juli 1863, werd de 106th overgeplaatst naar Helena, Arkansas, onder het bevel van generaal-majoor Frederick Steele. Hier nam het deel aan de opmars naar Little Rock en de Slag bij Bayou Fourche.
op 10 september 1863, die Little Rock en het grootste deel van Arkansas voor de Unie veiligstelde. Voor de rest van de oorlog werd de 106e toegewezen aan bewakingsposten in heel Arkansas, om de vrede te bewaren en te bewaken tegen mogelijke Zuidelijke tegenstoten in die regio. Het verslag van de adjudant-generaal van Illinois vat de dienst van de 106e Illinois kort samen: "Behalve het beleg van Vicksburg, was het regiment niet betrokken bij een van de meest bekende veldslagen, maar niettemin heeft het zijn deel goed gedaan bij het onderdrukken van een opstand, en het heeft veel ontberingen en ontberingen ondergaan door door moerassen en bayous te marcheren, spoorwegen, overheidsbezit te bewaken, te vechten en voedsel te zoeken, zoals blijkt uit de lange lijst van slachtoffers".