De situatie verslechterde echter al snel radicaal. Vanaf 1648 werd het zuiden en oosten overspoeld door de Kozakken-opstand van Khmelnytsky, die al snel werd gevolgd door een Zweedse invasie.
, die woedde door de Poolse kernlanden. Door de oorlogen met de Kozakken en Rusland werd Oekraïne verdeeld, met het oostelijke deel verloren door het Gemenebest, en werd het een afhankelijkheid van de tsaar. Johannes III Sobieski, die langdurige oorlogen voerde met het Ottomaanse Rijk, deed de militaire macht van het Gemenebest opnieuw herleven en hielp in 1683 om Wenen te bevrijden van een Turkse aanval.