Schrijf een vervolg op deze paragraaf - Tijdens de controverse over de islam van paus Benedictus XVI
, ook bekend als de 2006 Regensburg lezing, verklaarde hij de toespraak van de paus was "intelligent en noodzakelijk". Op 12 juni 2009 kondigde Couchepin zijn ontslag uit de Federale Raad aan met ingang van 31 oktober 2009. Dit leidde tot een verkiezing om zijn vrijgekomen zetel te vullen.