Wilshire trad in het leger van de Unie als majoor in het One Hundred and Twenty-sixth Regiment, Illinois Volunteer Infantry, en diende vanaf 16 juli 1862. Na het beleg van Vicksburg, werd zijn regiment naar Arkansas gestuurd.
Onder leiding van generaal-majoor Frederick Steele. Hij nam ontslag op 16 juli 1864 om gezondheidsredenen.