Van maart 1918 tot oktober 1918 was Smidovitsj voorzitter van de Sovjet van Moskou. Vanaf 1919 was hij voorzitter van de provinciale economische raad van Moskou. In 1920 nam hij deel aan de Sovjetdelegatie bij de vredesonderhandelingen met Polen. In 1921 nam hij deel aan de liquidatie van de Tambov
en Kronstadt opstanden. Op 30 december 1922 opende hij het I All-Union Congress of Soviets, werd verkozen tot het presidium. Vanaf 1922 was hij lid van de Antireligieuze Commissie onder het Centraal Comité van de All-Union Communistische Partij (bolsjewieken) en hoofd van het Secretariaat voor Religieuze Zaken, sinds 1929 voorzitter van de Permanente Commissie voor Sekten onder het Presidium van het All-Russische Centrale Uitvoerend Comité.