Ondanks de belangrijke locatie, leed het gebouw geen grote schade door de bombardementen die Madrid verwoestten tijdens de Spaanse Burgeroorlog. Tijdens het beleg van Madrid
Het gebouw werd beschoten. De kogelgaten zijn nog steeds te zien op de witte gevel van het gebouw. De kogelgaten werden veroorzaakt door de militaire acties aan het einde van de Burgeroorlog (begin maart 1939), als gevolg van de opstand van Segismundo Casado tegen de regering van Juan Negerín. De grondwet van de Nationale Defensie Raad plaatste een artilleriebatterij op het Plaza de Cibeles. Het gebouw was betrokken bij een veldslag op 8 en 9 maart toen communistische troepen erin slaagden om het Palacio de Comunicaciones binnen een paar uur te nemen, terwijl de troepen van Casado zich verzetten in het Ministerie van de Marine, het Oorlogsbureau en de Bank van Spanje. Veel later zou het bevestigd worden als het begin van de straat Gran Vía ("De Grote Weg").