Schrijf een voortzetting voor deze paragraaf - Gilbert sloot zich later aan bij het vrijwilligersleger dan veel van zijn tijdgenoten, in oktober 1862. Niettemin werd hij op 3 oktober 1862 kolonel van het 27e Iowa Volunteer Infantry Regiment. Gilbert's regiment nam deel aan Frederick Steele's Little Rock Expeditie
maar was niet betrokken bij een gevecht. Hij werd geplaatst bij een garnizoendienst in Arkansas en vervolgens overgeplaatst naar Mississippi, waar zijn regiment werd toegevoegd aan de divisie van Andrew J. Smith in het XVI Corps tijdens de Meridian-expeditie.