In juni 1944 werd besloten om de 61ste vleugel van Darwin naar Nieuw-Guinea te verplaatsen, waar het de geallieerde opmars naar de Filippijnen zou ondersteunen. Dit werd tegengewerkt door de Air Officer Commanding North-Western Area, Air Vice Marshal Adrian Cole, die wilde dat de vleugel zou deelnemen aan een geplande operatie om het eiland Selaru in Nederlands-Indië (NEI) te veroveren; deze operatie werd echter op 7 juni effectief geannuleerd. No. 61 Wing verliet Darwin in augustus en arriveerde op Morotai in de NEI op 18 september, drie dagen nadat de troepen van het leger van de Verenigde Staten voor het eerst op het eiland waren geland in de Slag om Morotai.
Ik weet het. No. 14 Airfield Construction Squadron landde op Morotai op 18 september en begon de volgende dag met het bouwen van vliegvelden. Kort voordat deze operatie begon, werd de No. 12 Survey and Design Unit op 12 september opgenomen in het hoofdkwartier van No. 61 Wing.