Femke Heemskerk maakte haar internationale debuut op het Wereldkampioenschap LC 2005 in Montreal als relay-zwemmer. Ze zwom alleen in de heats van de 4×100 m vrije stijl en de 4×200 m vrije stijl evenementen. Ze nam deel aan het Europees LC Kampioenschap 2006
en het Europees kampioenschap zwemmen op korte afstand. Maar individueel kwam ze in beide wedstrijden niet verder dan de heats.