Het seizoen 2012/2013 was een doorbraakjaar voor Lisowski, omdat hij zich kwalificeerde voor vijf rankingtoernooien, waaronder het wereldkampioenschap, en zijn tweede finale als professional bereikte. Het eerste toernooi dat hij bereikte was de Australian Goldfields Open door Dave Harold te verslaan en hij verloor 2<unk>5 van Mark Davis in de eerste ronde in Bendigo. Hij kon zich niet kwalificeren voor de volgende twee evenementen, maar versloeg Chen Zhe en Joe Perry om voor het eerst in het Britse kampioenschap te spelen. In zijn wedstrijd tegen Chen, maakte Lisowski de eerste 147 in competitief spel van zijn carrière. In de eerste ronde van het evenement in York verloor Lisowski 2 tegen 6 van Stuart Bingham. Lisowski versloeg Ian Burns en Jamie Burnett om zich te kwalificeren voor de China Open.
en zag Zhou Yuelong naar de laatste 32 gaan. Hij speelde tegen goede vriend Judd Trump en maakte een 131 break in 5<unk>3 overwinning, voordat hij terugkwam van 2<unk>4 naar beneden om 5<unk>4 te winnen tegen Mark Davis en zijn eerste ranking evenement kwartfinale te bereiken. Echter, deze keer was het Lisowski die een 4<unk>2 voorsprong liet glippen toen hij 4<unk>5 verloor van Shaun Murphy, waarbij Murphy verklaarde dat snooker de toekomst had gezien met Lisowski's optredens tijdens de week.