In augustus 1940 werd de York toegewezen aan de Middellandse-Zeevloot, waarna ze eind september bij het 3e Cruiser Squadron in Alexandrië kwam, nadat ze een konvooi rond de Kaap de Goede Hoop had begeleid. Twee dagen later nam ze deel aan Operatie MB.5, waarbij de Middellandse Zeevloot de lichte kruisers begeleidde en troepen naar Malta brachten. Tijdens de Slag bij Kaap Passero
De York zonk op 13 oktober na een botsing met de lichte kruiser de avond ervoor. Een maand later voerden York en de Middellandse Zeevloot operatie MB8 uit, een complexe reeks manoeuvres, waaronder operatie Judgment, waarbij het schip het vliegdekschip begeleidde toen haar vliegtuigen de Italiaanse vloot aanvielen in Taranto op de avond van 11/12 november. Enkele dagen later bracht de York Britse troepen van Alexandrië (Egypte) naar Piraeus (Griekenland). Op 26 november dekte York en de rest van het 3rd Cruiser Squadron een klein konvooi naar Malta.