Palmyra werd gebruikt als een toevluchtsoord door Shirkuh II's kleinzoon, al-Ashraf Musa, die zich verbond met de Mongoolse koning Hulagu Khan en vluchtte na de Mongoolse nederlaag in de 1260 Slag bij Ain Jalut
tegen de Mamelukken. Al-Ashraf Musa vroeg de Mameluken sultan Qutuz om vergiffenis en werd geaccepteerd als een vazal. Al-Ashraf Musa stierf in 1263 zonder erfgenaam, waardoor het district van Homs onder direct Mamluk-beheer kwam.