Samen met de meerderheid van de etnische Duitse Oost-Pruisen, vluchtten veel Masuriërs.
in West-Duitsland toen het Sovjet Rode Leger Oost-Pruisen naderde in 1945 in de laatste Europese campagnes van de Tweede Wereldoorlog. De naoorlogse conferentie van Potsdam plaatste Masurië - en de rest van Zuid-Oost-Pruisen - onder Pools bestuur. Veel Masuren die als Duitsers werden geclassificeerd, werden met militair geweld verdreven. Na 1956 emigreerden velen die in Polen waren gebleven naar West-Duitsland. Ongeveer 5.000 Masuren woonden nog steeds in het gebied, velen van hen als leden van de Duitse minderheid. Speculaties over de redenen voor deze emigratie variëren van de economische situatie en het ondemocratische - communistische - systeem in Polen tot het krimpende vooruitzicht van een terugkeer van Masurië naar Duitsland.