De Japanse overtuiging dat ze een snelle overwinning konden behalen, betekende dat ze Pearl Harbors marine-reparatieplaatsen, olietankplaatsen, onderzeebotenbasis en het oude hoofdkwartiergebouw verwaarloosden. Al deze doelen werden weggelaten van Genda's lijst, maar ze bleken belangrijker te zijn dan elk slagschip voor de Amerikaanse oorlogsinspanningen in de Stille Oceaan. Door het voortbestaan van de reparatiewerkplaatsen en brandstofdepots kon Pearl Harbor logistieke ondersteuning bieden aan de operaties van de Amerikaanse marine, zoals de Doolittle-inval en de veldslagen bij de Koraalzee en Midway.
Ik weet het. Het waren onderzeeërs die de zware schepen van de Japanse Keizerlijke Marine immobiliseren en de Japanse economie praktisch tot stilstand brengen door de invoer van olie en grondstoffen te verlammen: tegen het einde van 1942 was de hoeveelheid ingevoerde grondstoffen gehalveerd, "tot een rampzalige tien miljoen ton", terwijl olie "bijna volledig was gestopt". Ten slotte was de kelder van het oude administratiegebouw de thuisbasis van de cryptologische eenheid die aanzienlijk bijdroeg aan de hinderlaag op Midway en het succes van de onderzeeërmacht.