In de vijfde ronde van het seizoen, de Spaanse Grand Prix, werd Massa uitgeschakeld in Q1, nadat hij tijd had verloren met het verkeer tijdens zijn eerste run, en daarna niet genoeg tijd had om weer uit te gaan voor een tweede run. Het was de eerste keer sinds Rusland in 2014
Dat Massa werd uitgeschakeld in Q1. In de race maakte Massa solide vooruitgang, om op de achtste plaats te eindigen na het gebruik van een agressieve 3-stop strategie. De zesde wedstrijd van het kampioenschap van 2016, de Grand Prix van Monaco, begon niet goed voor Massa, omdat hij in de eerste training bij Saint Devote neerstortte. Op zaterdag kwalificeerde hij zich in P14, maar in een race die in natte omstandigheden begon, eindigde Massa als tiende en scoorde een punt, waardoor hij de enige coureur werd die op dat moment in het seizoen punten scoorde in elke race.