De regering van Jozef is ook opmerkelijk voor de aardbeving van Lissabon
, vuurstorm en tsunami van 1 november 1755, waarbij tussen de 30.000 en 40.000 mensen omkwamen. De aardbeving veroorzaakte dat Joseph een ernstig geval van claustrofobie ontwikkelde, en hij voelde zich nooit meer op zijn gemak in een ommuurd gebouw. Daarom verhuisde hij het koninklijke hof naar een uitgebreid complex van tenten in de heuvels van Ajuda.