Door de ongebreidelde inflatie en het verlies van de schattenvloot uit de Nieuwe Wereld kon Filips zijn soldaten niet consequent betalen, wat leidde tot de zogenaamde Spaanse Fury bij Antwerpen.
In 1576 liepen soldaten in de straten, verbrandden meer dan 1000 huizen en doodden 6000 burgers. Filips stuurde Alexander Farnese, hertog van Parma, als gouverneur-generaal van de Spaanse Nederlanden van 1578 tot 1592. Farnese versloeg de rebellen in 1578 in de Slag bij Gembloux, en hij veroverde vele rebellensteden in het zuiden: Maastricht (1579), Tournai (1581), Oudenaarde (1582), Duinkerken (1583), Brugge (1584), Gent (1584) en Antwerpen (1585).