Voltooi de volgende zin: In april 1862 bij de Slag bij Shiloh in West-Tennessee, werd Holtzclaw ernstig gewond in zijn rechterlong tijdens de eerste dag van de gevechten. Men dacht aanvankelijk dat hij dodelijk gewond was geraakt, maar hij herstelde verbazingwekkend en was na slechts negentig dagen weer in zijn functie. Hij werd gepromoveerd tot kolonel en diende een tijdje in Montgomery. In 1863 werd hij opnieuw gewond, deze keer toen hij van zijn paard werd gegooid tijdens de Slag bij Chickamauga in Noord-Georgië. De blessure was echter niet ernstig genoeg om hem van het veld te dwingen. In november 1863 nam hij het bevel over een brigade in de divisie van Stewart in het Tweede Korps van het Leger van Tennessee en leidde het tijdens de Chattanooga-campagne, waaronder de
De Slag bij Lookout Mountain. Voor een tijdje leidde hij tijdelijk de brigade van Henry Clayton.