Na aankomst in Casablanca liet Jean Bart het grootste deel van haar luchtafweerkanonnen verwijderen om de verdediging van de haven te versterken: de 90 mm en 37 mm kanonnen werden verplaatst naar de kade die de haven beschermden en twee van de zes 13,2 mm kanonnen werden op vrachtwagens geplaatst. Na hun nederlaag in de Slag om Frankrijk, ondertekenden de Fransen de wapenstilstand van 22 juni 1940.
, het beëindigen van hun deelname aan het conflict. Tijdens de vredesonderhandelingen stelden de Fransen voor om de Jean Bart en verschillende andere schepen te neutraliseren in Oran, Frans Algerije, maar uiteindelijk stemden ze ermee in om de Jean Bart en de Richelieu naar Toulon te brengen om te worden gedemobiliseerd. De Duitsers besloten later de overtocht niet toe te staan, omdat ze vreesden dat de Britten zouden proberen het schip te bemachtigen tijdens de doortocht door de Straat van Gibraltar; de Britten hadden ondertussen de verkeerde indruk dat de Duitsers de Franse vloot voor eigen gebruik wilden bemachtigen. Dit leidde tot Operatie Catapult, een reeks aanvallen op Franse oorlogsschepen om schepen te neutraliseren die niet naar de Vrije Fransen zouden overlopen.