Schrijf een vervolg voor deze paragraaf - Toen de Grote Noordelijke Oorlog uitbrak nadat de prins was gekroond als Karel XII, richtte Schlippenbach een regiment van draken op in Livonië, waarvan hij de kolonel werd. Toen Karel het winterkamp bij Dorpat (het huidige Tartu) brak en begin 1701 richting Riga vertrok, werd Schlippenbach achtergelaten om de Livonische grens te verdedigen. Hij won de slag bij Rauge op 5 september 1701 en werd vervolgens gepromoveerd tot generaal-majoor, maar werd vervolgens verslagen door een grote Russische troepenmacht onder Boris Sheremetev bij Erastfer.
Op 30 december van datzelfde jaar en in Sagnitz en Hummelshof op 19 juli 1702. In 1703 moest hij een groot deel van zijn troepen overbrengen om de troepen van Lewenhaupt in Koerland te versterken. Dit maakte hem machteloos om te voorkomen dat Narva en Dorpat in 1704 in Russische handen vielen, hetzelfde jaar werd hij benoemd tot gouverneur-generaal in Reval (het huidige Tallinn).