Op 2 augustus 1944 (in wat in de Republiek Macedonië de Tweede Ilinden
In het klooster van St. Prohor Pčinjski op de Antifascistische vergadering van de Nationale Bevrijding van Macedonië (ASNOM) met Panko Brashnarov (de voormalige IMRO-revolutionair uit de Ilinden-periode en de IMRO United) als eerste spreker, werd de moderne Macedonische staat officieel uitgeroepen, als een federale staat binnen Tito's Joegoslavië, die erkenning kreeg van de geallieerden. Na de oorlogsverklaring van Bulgarije aan Duitsland arriveerde Michailow in september 1944 in het door de Duitsers bezette Skopje, waar de Duitsers hoopten dat hij met hun steun een pro-Duitse Onafhankelijke Staat Macedonië kon vormen. Omdat hij zag dat de oorlog verloren ging voor Duitsland en om verder bloedvergieten te vermijden, weigerde hij. Mihailov belandde uiteindelijk in Rome, waar hij talrijke artikelen, boeken en pamfletten over de Macedonische kwestie publiceerde.