Masters keerde vervolgens terug naar Pearl Harbor om zich bij het 10de Defensie Bataljon aan te sluiten in november 1942. Later, als uitvoerend officier van het bataljon, verbonden aan het I Marine Amphibious Corps, diende hij in de Solomon
en de Russelse Eilanden. Hij werd gepromoveerd tot luitenant-kolonel in april 1943. In augustus van dat jaar gaf hij het bevel aan het 2e Bataljon 1ste Mariniers in Australië voordat hij de eenheid van december 1943 tot februari 1944 opnieuw in gevecht bracht in de Slag bij Kaap Gloucester, opnieuw onder het bevel van Rupertus, nu de bevelhebber van de 1ste Marine Divisie.