De bezetting van Tibet door de Dzungars duurde tot 1720 toen een expeditie van de Qing
de bewoners verdreven. Kelzang Gyatso werd in hetzelfde jaar van Kumbum naar Lhasa gebracht en op 15 oktober 1720 op de troon gezet in de Potala. Yeshe Gyatso is uit Chakpori gehaald. Zijn lot is niet helemaal duidelijk uit de bronnen, maar het lijkt erop dat hij werd gedeporteerd naar China waar hij stierf in 1725. Tijdens het Losar-festival begin 1726 zegende de 7e Dalai Lama de verdiensten van de overleden Yeshe Gyatso, wat aangeeft dat er tegen die tijd geen vijandigheid meer was tussen de rivaliserende Dalai Lamas vanwege het verlies van politieke betekenis van Yeshe Gyatso. De laatste moet niettemin een aantal volgelingen hebben gehad, aangezien zijn vermeende reïncarnatie in Kham werd ontdekt. Het kind stierf echter al snel aan pokken en er werden geen verdere incarnaties gemeld.