Op 25 juli 2018 gooide Hernández voor het eerst in zijn carrière in een wedstrijd, in de 16e inning tegen de Philadelphia Phillies en pakte het verlies op na het lopen van twee slagmensen en het opgeven van een drie-run walk-off home run. Hij is de eerste positiespeler sinds Babe Ruth die in het infield, het outfield speelt en 3 runs of meer geeft in dezelfde wedstrijd. Hij is ook de eerste speler ooit die een walk-off home run heeft opgegeven. Voor het seizoen sloeg hij.256/.336/.470, en sloeg een carrièrehoogte van 21 homeruns en 52 RBIs. In de postseason was hij twee voor 12 in de NLDS tegen de Atlanta Braves, één voor 14 in de NLCS tegen de Milwaukee Brewers en twee voor 15 in de World Series van 2018.
tegen de Boston Red Sox, met één homerun.