Voltooi de volgende zin: Op 4 maart 2017 passeerde Aubameyang 20 Bundesliga-doelen voor het tweede achtereenvolgende seizoen met twee doelpunten in een 6 tegen 2 nederlaag van Bayer Leverkusen. Vier dagen later scoorde hij een hat-trick in een 4 tegen 0 overwinning op Benfica om Dortmund in de kwartfinale van de Champions League te brengen. Op 20 mei scoorde Aubameyang twee keer in Borussia's laatste dag nederlaag van Werder Bremen om het seizoen af te sluiten als topscorer van de Bundesliga met 31 doelpunten. In de
In de finale van de 2016-17 DFB-Pokal op 27 mei 2017 scoorde hij het winnende doelpunt, een strafschop, toen Dortmund Eintracht Frankfurt versloeg met 2-1.