Het politieke systeem van de Republiek Soedan is herstructureerd na een militaire staatsgreep op 30 juni 1989.
, toen Omar al-Bashir, toen een brigadier in het Soedanese leger, een groep officieren leidde en de regering van premier Sadiq al-Mahdi verdreef. Onder leiding van al-Bashir schorste de nieuwe militaire regering politieke partijen en introduceerde een islamitische wet op nationaal niveau. Vervolgens werd hij voorzitter van de Revolutionaire Commando Raad voor Nationale Redding (een nieuw opgericht orgaan met wetgevende en uitvoerende bevoegdheden voor wat werd omschreven als een overgangsperiode), en nam de functies van staatshoofd, premier, hoofd van de strijdkrachten en minister van defensie op zich. Verder, na het institutionaliseren van de sharia-wetgeving in het noordelijke deel van het land samen met Hassan al-Turabi, heeft al-Bashir zuiveringen en executies in de bovenste gelederen van het leger uitgevaardigd, het verbieden van verenigingen, politieke partijen en onafhankelijke kranten en de gevangenisstraf van vooraanstaande politieke figuren en journalisten. In 1993 veranderde Soedan in een islamitische totalitaire eenpartijstaat toen al-Bashir de Revolutionaire Commando Raad afschafte en het Nationale Islamitische Front (NIF) creëerde met een nieuw parlement en een nieuwe regering die uitsluitend door leden van de NIF werden verkregen, en zichzelf tot president van Soedan uitriep. Als gevolg hiervan zou de Tweede Soedanese Burgeroorlog met het Soedanese Volksbevrijdingsleger (SPLA) de volgende jaren alleen maar escaleren.