Alvarado nam deel aan de Spaanse kolonisatie van Amerika, die begon in 1510. Hij had de rang van kapitein van de cavalerie en diende in de Spaanse veldtochten tegen het Azteekse Rijk, de Maya in Guatemala
en El Salvador, en het Inca-rijk. Hij stichtte de Peruaanse stad Huánuco in 1539 en stierf aan een ziekte kort na de Slag bij Chupas in 1542.