2005 was niet fantastisch voor Groot met een 4e plaats in de 4×100 m vrije stijl en 9e in de 50 m vlinder tijdens het Wereldkampioenschap Watersport 2005 in Montreal, Quebec, Canada. Aan het einde van het jaar won ze voor de derde keer op rij de gouden medaille in de 4 × 50 m vrije stijl op het Europees Kampioenschap Zwemmen op korte afstand 2005. 2006 begon met de FINA Short Course Wereldkampioenschappen in Shanghai. Samen met Inge Dekker, Hinkelien Schreuder en Marleen Veldhuis, zette Groot een wereldrecord op en won een gouden medaille in het 4×100 m vrijstap-estafette in een tijd van 3:33,32. In de zomer nam ze deel aan het Europees Kampioenschap Watersport 2006.
in Boedapest, Hongarije, waar ze een zilveren medaille toevoegde aan haar indrukwekkende medailleverzameling, in de 4 × 100 m vrije stijl met Dekker, Veldhuis en Ranomi Kromowidjojo, en een bronzen medaille, voor de vierde keer in haar carrière, in de 50 m vlinder. In Helsinki won ze een zilveren medaille in de 4 × 50 m vrije stijl op het Europees Kampioenschap Zwemmen op korte afstand 2006. Haar volgende grote toernooi was het Wereldkampioenschap Watersport 2007 in Melbourne, Australië, waar ze uit het 4×100 m vrije stijl-team door teamgenoot Femke Heemskerk werd gezwongen, terwijl ze al zo vele jaren een regulier teamlid was in de finales. Individueel eindigde ze 13e en 20e op de 50 m en 100 m vlinder, waardoor het een teleurstellend toernooi voor Groot werd. Een vijfde plaats op de Europese Short Course Zwemkampioenschappen 2007 was haar beste resultaat van een teleurstellend jaar.