Schrijf een vervolg op deze paragraaf - Noord-Halmahera, in het bijzonder Morotai, speelde een rol in de Tweede Wereldoorlog. Het eiland Morotai werd begin 1942 door de Japanners veroverd. De zuidelijke vlakte van Morotai werd ingenomen door Amerikaanse troepen in september 1944 tijdens de Slag om Morotai.
, en gebruikt als een staging punt voor de geallieerde invasie van de Filippijnen in het begin van 1945, en van Borneo in mei en juni van dat jaar. De Japanse soldaat Teruo Nakamura werd in 1974 in de Morotai-jungle ontdekt als een van de Japanse soldaten uit de Tweede Wereldoorlog die zich na de capitulatie van het Japanse leger hebben vastgehouden. Sinds 2009 maakt het eiland Morotai geen deel meer uit van het regentschap van Noord-Halmahera.