Met de commandowijziging van Spruance naar Halsey op 26 augustus 1944 veranderden alle eenheden weer van aanwijzing. Mitscher, die een vlieger was van vroege opleiding en een meesterlijk bevel had over de airgroups, verzocht dat hij het commando van de Fast Carrier Task Force zou behouden totdat zijn vervanger, admiraal John McCain, de juiste tijd zou hebben om meer vertrouwd te raken met het omgaan met een carrier task force. King en Nimitz waren het ermee eens. Admiraal Halsey, net als Spruance voor hem, zeilde met de Fast Carrier Task Force. De troepen groeiden tot negen CV en acht CVL in voorbereiding op de landingen.
Op Leyte. Task Force 38 bestond uit vier taakgroepen: Task Group 38.1 werd geleid door admiraal McCain, met zijn vorige commandant, admiraal Joseph "Jocko" Clark, die als adviseur bleef, Task Group 38.2 was onder het commando van admiraal Gerald Bogan, Task Group 38.3 werd geleid door admiraal Frederick Sherman en Task Group 38.4 was onder het commando van admiraal Ralph Davison.