De overblijfselen van de kerk werden bewaard door de tussenkomst van Trinity House in 1810, aangezien de torens al lang belangrijk waren als een mijlpaal voor de scheepvaart: het behoud werd bereikt door de eerste effectieve inspanning om de klif waarop de kerk toen stond te beschermen tegen verdere erosie. Sommige materialen van de structuur werden opgenomen in een vervangende kerk, ook gewijd aan St. Mary, gebouwd in Hillborough in dezelfde parochie. Een groot deel van de rest werd gebruikt voor de bouw van een nieuwe havenmuur in Margate, bekend als Margate Pier. Andere overgebleven overblijfselen zijn fragmenten van een hoog stenen kruis dat ooit in de kerk stond, en twee stenen zuilen van een drievoudige boog tussen het schip en het koor: de zuilen maakten deel uit van de oorspronkelijke kerk en stonden nog steeds op hun plaats toen de sloop begon. De kruisfragmenten en zuilen worden nu bewaard in de kathedraal van Canterbury en behoren tot de kenmerken die ertoe hebben geleid dat de kerk wordt beschreven als een voorbeeld van de Angelsaksische kerkenarchitectuur
en beeldhouwkunst.