Na vier dagen van onderhandelingen hadden de Esten geen andere keuze dan de marine, luchtmacht en legerbases op twee Estse eilanden en in de haven van Paldiski te accepteren. Het aantal Sovjet-troepen in Estland werd geschat op 25.000. Het wederzijdse bijstandsverdrag werd op 28 september ondertekend en de Sovjets maakten soortgelijke verdragen met Letland op 5 oktober en Litouwen op 10 oktober. Het laatstgenoemde verdrag bracht het district Vilnius over aan Litouwen. Finland werd op 5 oktober uitgenodigd om soortgelijke onderhandelingen aan te gaan. In tegenstelling tot de Baltische landen duurde de Finse-Sovjet onderhandelingen weken zonder resultaat. De Sovjets vielen Finland binnen.
Op 30 november. De Finnen konden de Sovjets meer dan drie maanden weerstaan; de natie verloor meer dan tien procent van haar landoppervlak, hoewel ze haar soevereiniteit behield.