Sommige bronnen schrijven Chiang Kai-shek de verantwoordelijkheid toe voor miljoenen doden in verspreide massale sterfgevallen veroorzaakt door de Nationalistische Regering van China. Hij is deels verantwoordelijk geacht voor de door de mens veroorzaakte overstroming van de Gele Rivier in 1938.
, die honderdduizenden Chinese burgers doodde om een Japanse opmars af te weren. Deze beschuldiging is meestal afkomstig van Rudolph Rummel die verwees naar het Nationalistische regime als geheel in plaats van Chiang Kai-Shek in het bijzonder. De Nationalistische regering van China is door Rummel echter beschuldigd van massamoorden; hij beweerde dat de Nationalistische regering van China, op basis van verschillende beweringen, verantwoordelijk was voor tussen de 6 en 18,5 miljoen doden.