Het zwakke politieke systeem van de Tweede Spaanse Republiek en de opkomst van het nationalisme leidden tot het uitbreken van de Spaanse Burgeroorlog in juli 1936. Kort na het conflict werd Puerta de Hierro ingenomen door de Juventudes Socialistas Unificadas, die het terrein gebruikten om zichzelf te huisvesten. Later dat jaar werd de club bezet door de Rosal Column, die hun hoofdkwartier in het clubhuis vestigden en verschillende loopgraven en machinegeweer nesten op het hele landgoed, inclusief de golfbanen, uitgegraven. De club, die zich in het midden van het Madridse front bevond, was een van de meest populaire clubs in de stad.
, was voor het grootste deel republikeins grondgebied, terwijl het Casa de Campo het begin van het nationalistische gebied markeerde. Het was alleen in deze periode dat de club geen president had (1936-1939).