In Sepang introduceerde het team een verbeterde motor. Alonso moest de motoroordeel nemen, waardoor hij op de laatste plaats in de kwalificatie terechtkwam, terwijl Button naar verwachting de nieuwe motor en straf zou nemen in Austin.
Ik weet het. Button heeft het gehaald tot Q3, met een oudere specs motor het hele weekend met 9e. De auto was competitief genoeg om voor de 2e keer een dubbele puntenplaats te behalen met Alonso die de oude motor gebruikte om zijn weg terug te vinden naar nog een 7e plaats, terwijl Button op de 9e plaats bleef. Echter een week later in Suzuka, de thuisrace van Honda, beleefde het team hun moeilijkste race van het seizoen omdat de circuitkenmerken niet geschikt waren voor de auto of de motor, ondanks dat beide coureurs de bijgewerkte motor voor de race gebruikten, waardoor McLaren werd overtroffen door Haas, Renault en zelfs Sauber. Button slaagde er niet eens in om de Q2 te halen, terwijl Alonso zich slechts als 15e kwalificeerde, waarbij Button ervoor koos om de nieuwe motor en straf te nemen die bestemd was voor Austin, om strategische redenen vanwege het gebrek aan concurrentievermogen van de auto voor die race, en als laatste begon. Met geen retraites van de race voor het 2e opeenvolgende jaar, konden zowel Alonso als Button alleen de 16e en 18e plaats halen, hun slechtste finishposities (exclusief retraites) van 2016 tot nu toe.