Dit leidde tot het gevaarlijkste moment in de carrière van Ferdinand, in 1529, toen Suleiman gebruik maakte van deze Hongaarse steun voor een massale maar uiteindelijk mislukte aanval op de hoofdstad van Ferdinand: het Beleg van Wenen
, die Ferdinand naar een toevluchtsoord in Bohemen stuurde. Een verdere Ottomaanse invasie werd in 1532 afgeweerd (zie Belegering van Güns). In dat jaar sloot Ferdinand vrede met de Ottomanen, waarbij Hongarije werd verdeeld in een Habsburgsector in het westen en het domein van Jan Zápolya in het oosten, de laatste effectief een vazalstaat van het Ottomaanse Rijk.