Morales werd eerst naar Cámus' eenheid gestuurd, het 3e Regiment van de Lijn, dat aan het front stond van de Chileense campagnes gedurende het grootste deel van de oorlog. Hoewel ze officieel geen soldaat was en niet aan gevechten moest deelnemen, weerhield dit haar er niet van naast de mannen van haar regiment te vechten. Ze stond bekend om haar grote vaardigheid met een geweer. Ze vocht bij de amfibische landing en de daaropvolgende felle aanval op een Peruaanse positie in de Slag bij Pisagua op 2 november 1879 en in de Slag bij San Francisco.
Op 19 november. Ze werd door de mannen van haar eenheid bewonderd voor haar onbaatzuchtige verzorging van de gewonden na gevechten. Ze bracht zichzelf ook meerdere keren in gevaar om gevangen Peruaanse soldaten te redden van misbruik door haar landgenoten.