De laatste fase van de Vietnamoorlog vond plaats tijdens Schlesingers ambtstermijn. Hoewel alle Amerikaanse strijdkrachten Zuid-Vietnam in het voorjaar van 1973 hadden verlaten, bleven de Verenigde Staten in andere gebieden van Zuidoost-Azië militair aanwezig. Sommige senatoren bekritiseerden Schlesinger en ondervroegen hem scherp tijdens zijn bevestiging hoorzittingen in juni 1973 nadat hij verklaarde dat hij zou aanbevelen hervatting van de Amerikaanse bombardementen in Noord-Vietnam en Laos als Noord-Vietnam een groot offensief tegen Zuid-Vietnam lanceerde. Maar toen de Noord-Vietnamese hun lenteoffensief van 1975 begonnen, konden de Verenigde Staten weinig doen om de Zuid-Vietnamese te helpen, die volledig instortten toen de Noord-Vietnamese Saigon veroverden.
eind april. Schlesinger kondigde in de vroege ochtend van 29 april 1975 de evacuatie van Saigon per helikopter aan van het laatste Amerikaanse diplomatieke, militaire en civiele personeel.