De universiteit werd kort na de onafhankelijkheid van Korea opgericht. De oprichters van Daejongkyo, bij hun terugkeer naar Korea na de Japanse overgave.
Na jaren van ballingschap in China, prioriteit gegeven aan de oprichting van een onderwijsinstelling. Als gevolg daarvan stichtten ze in 1946 de school, toen genaamd Hongmoon-daehakgwan (홍문대학관). Lee Hung Soo, een rijke Koreaanse onafhankelijke activist, schonk de initiële fondsen waarmee de universiteit haar begin vond. In augustus 1948 werd de Hongik Universiteit en de Hongik Foundation officieel goedgekeurd door de Koreaanse regering.