Voltooi de volgende zin: Alfaro had ook een succesvolle internationale carrière. Als onderdeel van de Under-23-selectie vertegenwoordigde hij Mexico op de Olympische Zomerspelen van 1996 in Atlanta, en verscheen in alle vier de wedstrijden. Hij verzamelde ook 20 volledige caps voor Mexico, waaronder vijf kwalificaties voor het WK van 1998, en speelde in het titelwinnaarsteam van Mexico op de FIFA World Cup in 1998.
1998 CONCACAF Gold Cup. Een favoriete selectie aan het begin van het regime van Bora Milutinovic, glijde Alfaro geleidelijk naar beneden in de hiërarchie met de opkomst van Luis Hernandez en Cuauhtémoc Blanco als de favoriete aanvallers onder Milutinovic's opvolger, Manuel Lapuente. Hij haalde zijn eerste cap tegen Bolivia in een 1-0 overwinning op de Cotton Bowl in Dallas op 8 juni 1996, en maakte zijn laatste internationale verschijning op 18 maart 1998, in een 1-0 gelijkspel met Paraguay.