Op 22 maart 2017 werd generaal-majoor Senanayake benoemd tot stafchef van het leger en op 4 juli 2017 werd hij op bevel van president Maithripala Sirisena gepromoveerd tot luitenant-generaal en legercommandant. Tijdens zijn ambtstermijn werd het leger bij verschillende gelegenheden gemobiliseerd en ingezet ter ondersteuning van de civiele autoriteiten toen een noodtoestand werd uitgeroepen als gevolg van de anti-moslimrellen van 2018 en de Paasbommen van 2019.
de veiligheidssituatie onder controle krijgen. Op 21 augustus 2019 ging hij met pensioen uit het leger, nadat hij was gepromoveerd tot de rang van generaal. Hij werd opgevolgd als legercommandant door generaal-majoor Shavendra Silva, de stafchef van het leger.