Maar deze verlichtingsreformen bleken contraproductief, of misschien te laat, om de eisen van de koloniën te onderdrukken. De hele geschiedenis van dit onderkoninkrijk werd gekenmerkt door groeiende binnenlandse onrust en politieke instabiliteit. Tussen 1780 en 1782, de Opstand van Túpac Amaru II
De revolutie van de Aymara's in de hooglanden van Peru toonde de grote wrok tegen de koloniale autoriteiten van zowel de mestizen als de inheemse bevolking. Vijfentwintig jaar later verdedigden de Criollos, inheemse mensen van Spaanse afkomst, zich met succes tegen twee opeenvolgende Britse pogingen Buenos Aires en Montevideo te veroveren. Dit versterkte hun gevoel van autonomie en macht in een tijd dat de Spaanse troepen niet in staat waren om te helpen.