Hij herstelde van zijn ziekte... en werd benoemd tot verbindingsofficier bij het hoofdkwartier van de 6e divisie... in september 1943... en werd gepromoveerd tot tijdelijke majoor die maand. Hij volgde later de Staff School in Cabarlah, Queensland, en na het voltooien van de cursus werd hij in oktober 1944 gepost bij de 1st Australian Combined Operations Section. Hij was verbonden aan het hoofdkwartier van de 7e divisie en hielp bij het plannen van de amfibische landingen bij Morotai.
en Balikpapan. Ferguson werd genoemd in de berichten voor zijn plannen.