Ondanks de officiële overgave, was er een belangrijke lokale verzetbeweging tegen de Japanse bezetting. Elementen van het Filippijnse leger bleven actief en waren in staat om alle provincies van de Filippijnen te bevrijden, behalve twaalf van de toenmalige vijftig provincies, terwijl andere groepen zoals de Hukbalahap ook betrokken waren. Tijdens zijn ballingschap bleef president Manuel L. Quezon de Filipijnen vertegenwoordigen tot zijn dood aan tuberculose in 1944. De Amerikaanse troepen onder generaal MacArthur keerden in oktober 1944 terug.
Op Leyte.