Voltooi de volgende zin: Toen het nieuws van de Burgeroorlog Minnesota bereikte, sloot Bloomer en zijn neven zich aan bij de Stillwater Guards, een lokale militie. De Guards werden op 29 april 1861 bij Fort Snelling bijeengebracht in het First Minnesota Volunteer Infantry Regiment, waardoor de kern van Company B werd gevormd. Bloomer kreeg aanvankelijk de rang van korporaal en nam deel aan alle belangrijke gevechten van het regiment tot de Slag bij Antietam. Hij werd licht gewond in het hoofd bij de Slag bij Bull Run. Tijdens de
Bij de slag bij Savage's Station op 29 juni 1862, die deel uitmaakte van de Peninsula Campaign, werd Bloomer gepromoveerd tot sergeant. In het midden van het gevecht werd de vaandeldrager gedood. Bloomer nam de vlaggen op en werd vijf uur van het regiment gescheiden. Hij gaf de vlaggen terug aan het regiment en werd gepromoveerd voor zijn moed.