Op 10 februari 2017 werd Gutoc door de regering van Rodrigo Duterte benoemd tot lid van de Bangsamoro Transition Commission die de Bangsamoro Basic Law moest opstellen. Echter, ze nam ontslag op 29 mei van dat jaar, onder vermelding van haar afkeuring van de behandeling van de regering van de Marawi belegering.
, de verklaring van de staat van beleg, en Duterte's grap dat hij de schuld zou nemen voor soldaten die verkrachting plegen tijdens de staat van beleg.