Schrijf een voortzetting voor deze paragraaf - In de brand van Kopenhagen van 1728
De universiteitsbibliotheek werd verwoest en 30.000 boeken gingen in de vlammen verloren. Alleen enkele materialen die tegen de regels door studenten en professoren uit het gebouw waren gehaald, werden bewaard. Na de brand werd de bibliotheek samen met de rest van het Trinitatis-complex gerestaureerd en werden stappen ondernomen om een nieuwe collectie op te bouwen. In 1730 legde Árni Magnússon zijn boek- en manuscriptencollectie na aan de bibliotheek. Het omvatte vooral een uitgebreide collectie van IJslandse en andere Noorse manuscripten, die sindsdien na hem bekend staat als de Arnamagnæaanse manuscriptencollectie. De bibliotheek introduceerde leningen in 1788.