Afghanistan maakte zijn paralympische debuut op de Olympische Zomerspelen van 1996.
in Atlanta, Verenigde Staten. Met uitzondering van de Paralympische Zomerspelen van 2000, hebben ze sindsdien een delegatie naar elke Paralympische Zomerspelen gestuurd, waardoor Rio de vijfde keer is dat het land deelneemt aan de Paralympische Zomerspelen. Ze hebben nog nooit deelgenomen aan de Paralympische Winterspelen en hebben nog nooit een Paralympische medaille gewonnen. De Paralympische Zomerspelen van 2016 werden gehouden van 7 tot 18 september 2016 met in totaal 4.328 atleten die 159 Nationale Paralympische Comités vertegenwoordigden. Atleet Mohammad Durani was de enige deelnemer voor Afghanistan in Rio. Hij werd gekozen als vlaggensdrager voor de openingsceremonie.