De Confederaten werden gedwongen om de "Virginia" te vernietigen toen ze zich begin mei 1862 terugtrokken uit Norfolk en zijn scheepswerf, terwijl de "Monitor" de James River opzeilde om het leger van de Unie te ondersteunen tijdens de Peninsula Campaign onder generaal-in-chief George B. McClellan. Het schip nam deel aan de Slag bij Drewry's Bluff
Later die maand bleef ze in het gebied om de landmacht van generaal McClellan te ondersteunen, totdat ze in december bij de blokkade van de marine van de Unie bij North Carolina mocht aansluiten. Op weg daarheen zonk ze tijdens een storm bij Cape Hatteras op de laatste dag van het jaar. Het wrak van de "Monitor" werd in 1973 ontdekt en is gedeeltelijk gered. Haar geweren, revolvertoren, motor en andere overblijfselen worden tentoongesteld in het Mariners' Museum in Newport News, Virginia, een paar kilometer van de plaats van haar belangrijkste militaire actie.