Tijdens de Chattanooga-campagne probeerden de Confederaten het Army of the Cumberland tot overgave te dwingen, maar versterkingen van het Army of the Tennessee onder het bevel van Grant, William Tecumseh Sherman en Joseph Hooker arriveerden. De Confederaten werden uit de stad verdreven in de veldslagen bij Lookout Mountain.
en Missionary Ridge in november 1863. Ondanks de unionistische sentimenten in Oost-Tennessee, hielden de Confederaten het gebied voor het grootste deel van de oorlog in handen. Een paar dagen na de val van Chattanooga, voerde de Confederatie onder leiding van James Longstreet een mislukte campagne om de controle over Knoxville over te nemen door het Fort Sanders van generaal Ambrose Burnside aan te vallen. De verovering van Chattanooga stelde Sherman in staat om de Atlanta-campagne vanuit de stad te lanceren in mei 1864. De laatste grote veldslagen in de staat vonden plaats toen het leger van Tennessee regimenten onder John Bell Hood Midden Tennessee binnenviel in het najaar van 1864 in een poging om Sherman terug te trekken. Ze werden gecontroleerd door John Schofield in Franklin in november en volledig verspreid door George Thomas in Nashville in december. Op 27 april 1865 vond de ergste maritieme ramp in de Amerikaanse geschiedenis plaats toen de stoomboot "Sultana", die bevrijde gevangenen van de Unie vervoerde, ontplofte in de rivier de Mississippi ten noorden van Memphis, waarbij 1.168 mensen omkwamen.