Voltooi de volgende zin: Hij verliet de gewoontes voor een korte periode en ging in 1860 het Conciliarische Seminarie van Buenos Aires in. Hij diende als militair kapelaan tijdens de Paraguayaanse Oorlog, en voor zijn heldhaftige gedrag werd hij gepromoveerd tot luitenant-kolonel. Canavery was aanwezig bij de veldslagen van Yatay,
De Slag bij Tuyutí, de Slag bij Curupayty en de Slag bij Lomas Valentinas vonden plaats op 27 december 1868. Na de oorlog werd hij toegevoegd aan de troepen die de stad Asunción bezetten. Hij was de eerste kapelaan die in Villa Occidental diende, en werd vervangen door José Pablo Lynch y Cabrera.