"Paul Jacobi" bracht het grootste deel van 1943 inactief door in het noordpoolgebied voor hij in september terugkeerde naar Duitsland voor een nieuwe refit. Ze werd zwaar beschadigd door geallieerde luchtaanvallen op Kiel en was pas eind 1944 weer operationeel. Ze bracht het grootste deel van de rest van de oorlog door met het begeleiden van schepen terwijl de Duitsers Oost-Pruisen evacueerden.
en het bombarderen van Sovjet-troepen. Het schip werd in mei 1945 door de geallieerden veroverd en bracht de rest van het jaar onder Brits toezicht door, terwijl de geallieerden besloten hoe ze zich van de gevangen Duitse schepen zouden ontdoen.