De Japanse strijdkrachten (de "Combined Fleet") bestonden eigenlijk uit twee verschillende vlootjes die gedetailleerd waren voor twee afzonderlijke operaties, namelijk Operatie AL
(voor de Aleutians) en Operatie MI (voor Midway). De onderstaande lijst toont alle schepen die zijn toegewezen aan Operatie MI, maar alleen Nagumo's First Carrier Striking Force en Kurita's Midway Support Force waren daadwerkelijk betrokken bij de Slag om Midway.