Van Rooijen maakte haar internationale senior debuut op het Europees LC Kampioenschap 1999 in Istanbul, Turkije met 4e plaatsen in zowel 4 × 100 m vrije stijl als 4 × 100 m medley relay. Een jaar later startte ze opnieuw in het Europees LC kampioenschap.
Deze keer vond het plaats in Helsinki, Finland. Daar begon ze individueel op de 100 m en 200 m vrije stijl en eindigde ze op de 17e en 24e plaats. In de 4 × 200 m vrije stroom was er een 7e plaats. In september 2000 nam ze deel aan de Olympische Spelen van Sydney, waar ze een zilveren medaille won in de 4 × 100 m vrije stroom relay samen met Inge de Bruijn, Wilma van Hofwegen en Thamar Henneken. Er was ook een 11e plaats in de 4 × 200 m vrije stijl.