Bourdais kwalificeerde als vierde voor de Italiaanse Grand Prix van 2008.
Ik weet het. Zijn auto koos echter niet voor de eerste versnelling op de startgrid en moest vanaf de pitbaan starten, een ronde achter (aangezien de race achter de veiligheidswagen begon, was er geen opwarmingsronde). Hoewel hij uiteindelijk een ronde achter de winnaar van de race, teamgenoot Vettel, eindigde, zette hij de op een na snelste ronde van de race; alleen Ferrari's Kimi Räikkönen ging sneller. Tijdens de Japanse Grand Prix van 2008 was hij 6e op de weg, maar kreeg een 25-seconden straf omdat hij een vermijdbaar ongeval veroorzaakte met Felipe Massa die hem naar de 10e plaats liet zakken. Weinig waren het eens met de beslissing <unk> ITV Sport's Martin Brundle had tijdens de live tv-verslaggeving van de race verklaard dat hij vond dat Massa een straf zou kunnen krijgen, terwijl zijn collega James Allen verklaarde dat 99% van de experts met wie hij sprak vonden dat Bourdais geen straf verdiende; de FIA stond op dat moment onder zo'n publieke controle na een reeks controversiële beslissingen dat ze de ongekende stap namen om publiekelijk "alleen stewards" beeldmateriaal van het incident vrij te geven, om de beslissing te rechtvaardigen.