Deze strategische operatie kreeg grote vijandigheid in de publieke kringen en grootschalige afkeuring in de media die deze operatie grondig bekritiseerden. Musharraf had een zware confrontatie en raakte betrokken bij ernstige geschillen met zijn hogere officieren, de chef van de staf van de marine, admiraal Fasih Bokhari, de chef van de staf van de luchtmacht, air chief marshal PQ Mehdi en de senior luitenant-generaal Ali Kuli Khan. Admiraal Bokhari eiste uiteindelijk een volwaardige joint-service krijgsraad tegen generaal Musharraf, terwijl aan de andere kant generaal Kuli Khan de oorlog bestempelde als "een ramp die groter is dan de tragedie in Oost-Pakistan"
, voegde eraan toe dat het plan "foutvol was in termen van het concept, tactische planning en uitvoering" dat eindigde in "het opofferen van zoveel soldaten". Problemen met zijn levenslange vriend, de chef van de luchtmacht, de luchtmaarschalk Pervez Mehdi, ontstonden ook toen de luchtmaarschalk zich onthield van deel te nemen aan of een luchtaanval te autoriseren om de elementen van de legeroperaties in de Kargil-regio te ondersteunen.