Als onderdeel van de 1e vloot nam de "Fuji" deel aan de gevechten bij Port Arthur op 9 en 10 maart 1904, waarbij de "Fuji" lichte schade opliep en de "Yashima" onbeschadigd was. Op 15 mei sloeg de "Yashima" twee maritieme mijnen aan en zonk. "Fuji" nam deel aan de Slag om de Gele Zee
in augustus en werd vervolgens licht beschadigd tijdens de Slag bij Tsushima in mei 1905. Ze werd gecrediteerd met het schot dat de explosie veroorzaakte die het slagschip "Borodino" vernietigde. In oktober 1908 verwelkomde de Fuji de Amerikaanse ambassadeur in Japan en enkele hoge officieren van de Great White Fleet, en werd later herclassificeerd als kustverdedigingsschip in 1910. Het schip werd ontwapend en in 1922 omgebouwd tot een accommodatieschip. De "Fuji" werd in 1945 door Amerikaanse vliegtuigen tot zinken gebracht en in 1948 gesloopt.