Suffolk ontving ook geen grote subsidies van Edward IV, hoewel de la Pole hem bleef ondersteunen in wapens wanneer dat nodig was, en toen Edward zijn troon verloor in 1470, werd Suffolk niet vertrouwd door het nieuwe Lancastrian regime. Suffolk vocht voor Edward in de veldslagen van Barnet.
en Tewkesbury, maar kwam niet bij Eduards innerlijke kring tijdens zijn tweede bewind. Hij lijkt te hebben ingestemd met de troonsbestijging van Richard III in 1483, maar was, in tegenstelling tot zijn zoon, niet aanwezig bij de nederlaag van Richard III in de Slag bij Bosworth twee jaar later. Hendrik VII schijnt het verraad van de zoon van Suffolk tegen de hertog niet te hebben aangehouden, en schijnt hem zelfs te hebben beschermd tegen de aanslag van de voormalige. John de la Pole stierf in 1492 en werd begraven in Wingfield Church, Suffolk.