Op het Franse kampioenschap van 2010, in Saint-Raphäel, wint ze zowel het individuele medley-evenement van 200 m als het individuele medley-evenement van 400 m, en eindigt als tweede na Coralie Balmy in het 200 m vrije wedstrijd. Op het Europees kampioenschap
In Boedapest kwam Muffat aan als favoriet om goud te winnen op de 200 m individuele medley, en verklaarde tegenover de pers dat de gouden medaille haar doel is in dat evenement. Nadat ze het veld in de derde discipline van de medley, de borststrijd, had geleid, werd ze echter ingehaald door de Hongaarse Katinka Hosszú, waardoor Muffat het momentum verloor en vierde eindigde in het evenement. Op dezelfde dag eindigde het Franse 4 × 200 m freestyle relayteam ook als tweede in de finale toen Muffat, die de Franse relay verankerde, werd ingehaald door een andere Hongaarse zwemmer, Evelyn Verrasztó. Twee dagen later eindigde ze ook als vierde in de 200 m vrije stijl, die werd gewonnen door de Italiaanse zwemmer Federica Pellegrini.