Dne 19. prosince 2011 souhlasil s návratem do Palerma, kde nahradil Devisa Mangia jako hlavního trenéra klubu ze Serie A ze Sicílie. Ve svém prvním zápase ve vedení klubu dosáhl remízy 2x2 proti Novarě, která se potýkala s posledními zápasy, po kterém následovala domácí porážka 1x3 v rukou Napoli. Po zklamáním začátku se výsledky v lednu zlepšily také díky zimním podpisům, jako jsou Emiliano Viviano, Franco Vázquez a Massimo Donati (poslední byl kapitánem týmu během svého předchozího období v Bari), což vedlo k řadě čtyř po sobě jdoucích domácích vítězství a remíze 4 × 4 na San Sirovi proti Interu, která přivedla Palermo zpět do boje o místo v Lige Evropy UEFA. Palermo skončilo na šestnáctém místě v sezóně 2011/12
a byl propuštěn šest měsíců poté, co převzal pozici trenéra.