V roce 1882 se však v Egyptě odehrála nacionalistická vzpoura pod vedením plukovníka Urabiho. Vnímal se nebezpečí pro Suezský průplav, a proto britské komunikace s jeho indickou říší, stejně jako britští držitelé egyptských dluhopisů. Gladstone nejprve apeloval na Koncert Evropy, aby podnikl kolektivní akci, ačkoli to bylo přijato ne nadšeně. Francie zpočátku poslala válečné lodě, aby se připojily k královskému námořnictvu v Alexandrii, ale odmítla vyslat vojenské síly ze strachu ze oslabení své obrany proti Německu. Dne 10. července Gladstone nařídil, aby byl Urabiovi dán ultimátum, aby zastavil vojenské opevnění Alexandrie do dvanácti hodin. Urabi neodpověděl, a tak 11. července královské námořnictvo bombardovalo město, zatímco Francouzi ustoupili. To vyústilo v nepokoje a Gladstone dostal od parlamentu 2 300 000 liber a zvýšil daň z příjmu z 5 dnů na 6 a půl dne na financování vojenské kampaně.
- Ne, ne. Rozhodnutí jít do války se setkalo s opozicí uvnitř Liberální strany a radikální poslanec John Bright rezignoval z vlády v námitce. Dne 19. srpna britská vojska pod velením sira Graneta Wolseleyho přistála v Port Saidu a 13. září porazila Urabiho síly v bitvě u Tel-el-Kebiru. Když se Gladstone dozvěděl o britském vítězství, byl nadšený a nařídil na jejich počest salutovat děly v Hyde Parku.