Dne 9. ledna 1942 "Jintsū" opustil Davao pro invazi na Celebes, doprovázel transporty, které drží Sasebo č. 1 Combined Special Naval Landing Force (SNLF). Dne 17. ledna sestřelil průzkumný plachetník Kawanishi E7K2 "Alf" vypuštěný z "Jintsū" nizozemský lehký bombardér Lockheed Hudson poblíž Menada, ale byl sestřelen sám, než se mohl vrátit. Počátkem února byla "Jintsū" přidělena k invazní jednotce pro Ambon, následovaná holandským a portugalským Timorem.
a východní Jávě. Dne 20. února, zatímco mimo Alor Island, neúspěšně zaútočila na americkou ponorku.