Během Chattanooga kampaně, Konfederáti se pokusili obléhat armádu Cumberland do kapitulace, ale posily z armády Tennessee pod velením Granta, William Tecumseh Sherman, a Joseph Hooker dorazil. Konfederáti byli z města vypuzeni v bitvách u Lookout Mountain.
a Missionary Ridge v listopadu 1863. Navzdory unionistickému náladu ve východním Tennessee, konfederace držela oblast po většinu války. Několik dnů po pádu Chattanoogy, Konfederace vedená Jamesem Longstreetem neúspěšně podnikla kampaň, aby převzala kontrolu nad Knoxville tím, že zaútočila na pevnost Fort Sanders generála Ambrose Burnside. Dobytí Chattanoogi umožnilo Shermanovi zahájit v květnu 1864 z města kampaň v Atlantidě. Poslední velké bitvy ve státě proběhly, když armáda Tennessee pod velením Johna Bell Hooda vpadla do středního Tennessee na podzim roku 1864 ve snaze přilákat Shermana zpět. Byly prověřeny Johnem Schofieldem ve Franklinu v listopadu a zcela rozptýleny Georgem Thomasem v Nashville v prosinci. Dne 27. dubna 1865 došlo k nejhorší námořní katastrofě v americké historii, když parník "Sultana", který přepravoval osvobozené vězně Unie, explodoval v řece Mississippi severně od Memphisu a zabil 1168 lidí.