21. října 1861 byl Taylor povýšen na brigádního generála, velitel louisianské brigády pod Richardem S. Ewellem v kampani Shenandoah Valley vedené Stonewallem Jacksonem. Během údolní kampaně Jackson použil Taylorovu brigádu jako elitní údernou sílu, která stanovila rychlé pochodování a rychle prováděla útoky na boku. V bitvě u Front Royal 23. května, první bitva u Winchesteru
25. května a nakonec v bitvě u Port Republic 9. června, Taylor vedl 9. pěchotu v včasných útocích proti silným nepřátelským pozicím.