Po útoku Britů na Kodaně v roce 1807 a vypuknutí
Ve válce mezi Británií a Dánsko-norským královstvím se Jørgensen chopil malé dánské lodi "Admiral Juul" a v akci 2. března 1808 se zapojil do bitvy s HMS "Sappho"; Britové zajali "Admiral Juul" a zacházeli s Jørgensenem jako s křižníkem. V roce 1809, když byl v Anglii na podmínce, navrhl obchodníkovi, že plavba na Island by mohla být zisková, protože ostrov v té době trpěl nedostatkem potravin kvůli dánskému monopolu na islandský obchod. Jørgensen doprovázel plavbu Clarence jako tlumočník. Na této plavbě se nepodařilo obchodovat s jakýmkoli zbožím, protože loď byla britská a Dánsko zakázalo obchod s Británií. Krátce poté dorazil "Rover" do Reykjavíku. Admiralita ho poslala, aby připravil cestu druhé britské obchodní plavbě.