V nedávné historii Filipíny kromě španělské kolonizace také trpěly americkou kolonizací, která trvá dodnes. Dne 10. prosince 1898 se Španělsko vzdalo Filipín Spojeným státům prostřednictvím Pařížské smlouvy. To začalo dlouhé období americké kolonizace, která hrála obrovskou roli ve filipínské archeologii, protože umožnila americkým antropologům prozkoumat rozsáhlá archeologická místa s hlubokými důkazy o lidské okupaci a evoluci. Později byli archeologové jako H. Otley Beyer schopni zapsat Filipíny do archeologických záznamů prostřednictvím událostí, jako je Světová výstava v St.
, který zahájil rozvoj archeologie na Filipínách.