San Jose je ve filipínské historii významným městem kvůli své roli během druhé světové války. Americké námořní síly pod vedením generála Douglase MacArthura 15. prosince 1944 zorganizovaly takzvané "druhé přistání" na plážích San Jose (první je slavné přistání na Leyte) k získání filipínských ostrovů z rukou Japonců (bitva u Mindora
) Zabezpečení San Jose a celého ostrova Mindoro se ukázalo jako rozhodující v cíli znovuobsadit Manilu a Luzon a nakonec porazit japonské císařské síly filipínskými a americkými vojáky.