Od svého vzniku v 15. století až do svého rozpuštění v roce 1833 se hlavní cíle Casa da Índia měnily v průběhu času, stejně jako její vztahy s portugalskou korunou a císařskou správou. Po roce 1642 ztratila veškeré své obchodní monopoly na zlato, stříbro, slonovinu, koření a další cenné komodity, což změnilo působnost organizace výhradně na obchodní regulátor a celní agenturu. Po zničení sídla a zařízení Paláce Ribeira při velkém Lisabonském zemětřesení v roce 1755
V průběhu války se Casa da Índia ve vztahu k transformační obchodní a koloniální politice Portugalska stále více zastaralá, což vedlo k tomu, že většina jejích funkcí byla pomalu absorbována do ministerstev a agentur portugalské vlády až do jejího konečného rozpuštění v roce 1833.