Na cestě na olympijské hry v Sydney se Wouda zúčastnila mistrovství Evropy v vodním sportu v roce 2000
v Helsinkách ve Finsku, kde získal bronzovou medaili ve volném stylu 4 × 200 m spolu s Martijnem Zuijdwegem, Markem van der Zijdenem a Pieterem van den Hoogenbandem. Wouda vyhrál bronzovou medaili v 4×200 m volný styl v letní olympiádě 2000 v Sydney, Austrálie vedle Martijn Zuijdweg, Johan Kenkhuis a Pieter van den Hoogenband. Individuálně skončil pátý na 200 m v individuální medley a 13. na 100 m prsou. S týmem 4×100 metrů skončil čtvrtý, jen o medaili vedle Klaas-Erika Zweringa, Jorise Keizera a Pietera van den Hoogenbanda. Po olympijských hrách v Sydney Wouda odešel z plavání. O šest měsíců později napsal Mark Hoogstad, novinář nizozemského deníku NRC Handelsblad, knihu popisující vzkříšení holandského plavání v důsledku Woudovy kariéry.