Po německé invazi do Řecka ho nacističtí Němci v roce 1941 převezli do koncentračního tábora v Dachau, odkud byl v květnu 1945 propuštěn. Po návratu do Řecka převzal vedení KKE od Georgiose Siantose, který byl od ledna 1942 výkonným generálním tajemníkem KKE. Zatracená Dekemvriana.
událost právě skončila komunistickou porážkou. Zachariadis nyní prohlásil svůj politický záměr, aby KKE bojovala za demokracii a lidovou moc prostřednictvím voleb.