Vláda Đukanovića poslala vojáky bojovat proti odtržení Chorvatska, protože se postavil proti následkům Jugoslávie způsobené slovinskou nezávislostí
a vzpoury v jiných oblastech. Đukanovićova vláda se aktivně podílela na obléhání Dubrovníku od podzimu 1991 do jara 1992, což vedlo k tomu, že město utrpělo těžké strukturální škody. Okolní oblast Konavli také trpěla kvůli loupežným nájezdům. Během tohoto období byl Đukanović jedním z nejhlasitějších jestřábů v černohorské vládě. Některé z jeho pozoruhodných výroků z tohoto období zahrnují prohlášení o "začínání nenávidět šachy kvůli šahovnici" a agresivní prohlášení vydané ve veřejném projevu během útoku na Dubrovnik, že "Už jsme ztenčili hranice AVNOJ Černé Hory a Hercegoviny, tedy východní Bosny a Černé Hory.