Hernández umpiroval ve Světové sérii v letech 2002 a 2005, stejně jako v All-Star Game v letech 1999, 2009 a 2017. Rozhodoval v sedmi Ligových šampionátových sériích (2000, 2001, 2003, 2004).
, 2007, 2010, 2016) a v jedenácti Ligových divizijních sériích (1997, 1998, 2002, 2005, 2009, 2011, 2012, 2015, 2017, 2018, 2020). Hernández také pracoval v sedmém zápase ALCS 2008 jako náhradník za Derryla Cousinsa. Ve druhé polovině basebalové sezóny 2011 byl Hernández přesunut z rozhodčího týmu Joea Westa do týmu Gerryho Davise.