V následující sezóně Fernandinho hrál v vítězství 7×1 Superpoháru nad Tavriya Simferopol 4. července. Dne 18. července zaznamenal vyrovnávací gól v remíze 1: 1 s Metalurh Zaporizhya. Dne 7. srpna vstřelil úvodní gól v vítězství 5:0 nad Sevastopol. Hrál také v 1. a 2. mistrovství UEFA.
Porážka před Barcelonou 28. srpna. Zlomil si nohu v 1:0 porážce proti Obolonu v Kyjevě 10. září, což ho mělo vyloučit na celou sezónu. Nakonec se vrátil 1. dubna 2011 po téměř sedmi měsících mimo akci v vítězství 3:1 nad Illichivets Mariupol. Na 94. minutě vstřelil vítězný gól v vítězství nad Tavriya o 2:1, jeho první gól od návratu z zranění. Dne 25. května odehrál celých 90 minut ve finále Ukrajinského poháru, ve kterém Shakhtar porazil Dynamo Kyjev. Na konci sezóny Shakhtar vyhrál mistrovství, přičemž Fernandinho přispěl třemi góly ze svých 15 ligových vystoupení. Podařilo se jim vyhrát tři ceny (Premier League, Cup a Super Cup).