Dne 29. července 2015 debutoval Sabonis za mužský národní tým Litvy v zápase proti Austrálii, kde získal 4 body a 7 odskoků. Sabonis byl nejmladším hráčem, který kdy hrál za národní tým, porazil Jonase Valančiunase o několik dní. Sabonis během přípravné fáze získal v průměru 6 bodů a 5,9 odskoků a byl druhým nejlepším odskokem týmu po Valančiūnasovi. Sabonis hrál za Litvu na EuroBasket 2015, kde získal stříbrnou medaili ve svém debutovém roce. Byl také členem litevského olympijského národního týmu na Letních olympijských hrách 2016.
, kde měl průměr 5,5 bodů a 4,5 skoků.