Dokončete následující větu: Náboženské rozdíly byly zdůrazněny rostoucí ekonomickou nesouladností. Katolické, převážně venkovské kantony středního Švýcarska byly obklopeny protestantskými kantony s stále více komerčními ekonomikami. Politicky dominantními kantony byly Zürich a Bern (obě protestantské), ale katolické kantony měly vliv od druhé Kappelské války v roce 1531. V roce 1655 byl pokus (vedený Zürichem) o restrukturalizaci federace zablokován katolickou opozicí, což vedlo k první bitvě u Villmergenu v roce 1656; katolická strana vyhrála a upevnila "status quo". Problémy zůstaly nevyřešeny a znovu vypukly v roce 1712 s
Druhá bitva u Villmergenu. Tentokrát vyhrály protestantské kantony, které ovládly konfederaci. Skutečná reforma však byla nemožná; individuální zájmy třinácti členů byly příliš různorodé a absolutistické kantonální vlády se bránily všem pokusům o správu na úrovni konfederace. Zahraniční politika zůstala roztříštěná.