V roce 1943 japonská okupační vláda vytvořila ochránce Armády otčiny jako pomocnou sílu složenou z Indonésanů, která měla pomoci Japoncům, kdyby Spojenci napadli Indonésii. Stejně jako mnoho jeho vojenských současníků, se k nim připojil i Panggabean. V Panggabeanově případě se však zdálo, že se mu podařilo projít pouze vojenskou školou a základním výcvikem, než se Japonci vzdali.
a nacionalističtí vůdci Sukarno a Mohammad Hatta vyhlásili nezávislost Indonésie.