Scott sloužil v americké armádě během války s Mexikem. V květnu 1846 bojoval pod generálem Zachary Taylorem v bitvách u Palo Alto.
a Resaca de la Palma a získal brevet (poctné povýšení) na majora. Dne 29. června 1846 byl povýšen do plné hodnosti majora.