Dokončete následující větu: Po smrti Batoryho v roce 1586 pomohl Zamoyski Sigismundovi III. Vase získat polský trůn, bojoval v krátké občanské válce proti silám podporujícím habsburského arcivévody Maxmiliána III. Rakouského. Základní tábor Sigismunda se shromáždil kolem Zamojského, zatímco Maximiliána podporovala rodina Zborowskichů. Zamoyski bránil Kraków a porazil Maximilianovy síly v
Bitva u Byčiny v roce 1588. V této bitvě, kterou Sławomir Leśniewski popisuje jako "jednu z nejdůležitějších v polské historii a nejdůležitější v Zamojského vojenské kariéře", byl Maximilian zajat a v výsledné Bytomské a Będzinské smlouvě z roku 1589 musel vzdát se všech nároků na polskou korunu. Později téhož roku Zamoyski navrhl reformu královských voleb, která Sejm nepřijala. Zamoyski předložil tomuto Sejmu návrh, že v případě, že by současný král zemřel bez dědictví, nikdo kromě kandidáta některého slovanského původu by měl mít nárok na polský trůn. Byl to projekt, který dokonce dokázal představit možnost nějaké unie mezi katolickým Polskem, pravoslavným Moskovskem a polo-protestantským Čechami. Ve skutečnosti to byl obvodový a nemotorný proti návrhu proti pro-Habsburské politice.