Fontàs debutoval v prvním týmu 31. srpna 2009, když nahradil dalšího absolventa "La Masia", Gerarda Piquého, v posledních šesti minutách domácího vítězství 3<unk>0 v La Ligě proti Sportingu de Gijón. Na začátku sezony 2009/10 byl povolán manažerem Pepem Guardiolou do španělského Superpoháru a Superpoháru UEFA.
v zápasech proti Athletic Bilbao a FC Shakhtar Donetsk, ale nakonec se ani v jednom případě nedostal na lavici. Většinu svých prvních seniorských sezon strávil registrován u rezerv.