Po návratu do služby byl Warmoth znovu spojen se svým plukem. Velel v bitvě u Lookout Mountain.
poblíž Chattanoogy, zúčastnil se Shermanovy kampaně v Atlantě, a posílil generála Nathaniela Bankse v útočišti Red Cedar. Později byl pověřen jako soudce oddělení Provostního soudu v zálivu.