Tato služba pokračovala až do začátku roku 1809, kdy se vrátila do Británie. Británie byla v té době silně zapojena do Baltského moře a chránila obchodní zájmy. Expedice pod vedením sira Jamese Gambiera v červenci 1807 zajala většinu dánského námořnictva v druhé bitvě u Kodaně, v reakci na obavy, že by mohla padnout do rukou Napoleona, za cenu zahájení války s Dánskem.
- Ne, ne. Kapitán Hamilton opustil loď a byl nahrazen kapitánem Edwardem Sneydem Clayem. "Temeraire" se nyní stala vlajkovou lodí kontradmirála sira Manleyho Dixona, s rozkazem odjet do Baltu, aby posílil flotilu, která tam byla umístěna pod velením sira Jamese Saumareze. "Temeraire" dorazila v květnu 1809 a byla poslána k blokádě Karlskrony na švédském pobřeží.