Škola byla založena v roce 1993 na příkaz Geshe Lharampa Nagri Choszed (1920-1998), původem z Tibetu, který přišel do Phuktal v roce 1959 po čínské invazi do Tibetu.
- Ne, ne. Nagri Choszed přinesl s sebou vysokou úroveň buddhistického filozofického vzdělání a výcviku, k němuž izolovaní mniši z Phuktalu neměli po několik století prakticky žádný přístup. Obnovil starodávnou tradici učení a vzdělání v Phuktalu a poučil mnichy o filozofii, tradičních rituálních systémech a morální disciplíně. Také vyslal mnoho mnichů za účelem dalšího učení v jiných institucích, kteří se vrátili do Phuktal a začali učit.