Po pádu Filipín začala divize trénovat k útoku na samotné Japonsko.
Kapitulace byla na prvním místě. Divize se přestěhovala do Japonska, kde několik měsíců okupovala ostrov Honšú. 41. pěší divize byla deaktivována v Kure-Hiro v Japonsku dne 31. prosince 1945.