Femke Heemskerk debutovala na světovém mistrovství v LC 2005 v Montrealu jako střídačka. Plávala pouze v závodech 4×100 m volný styl a 4×200 m volný styl. Zúčastnila se mistrovství Evropy LC 2006.
a evropských šampionátů v plavání na krátkých tratích. Ale individuálně nepředběhla v obou disciplínách.