V následující sezóně se klub nemohl kvalifikovat do Ligy mistrů po porážce Arsenalu, ale postoupil až do šestnáctinové kola UEFA Europa League 2011/12, kde byl vyřazen holandským týmem AZ. V sezóně 2011/12 skončili v Serie A.
na třetím místě, což je nejlepší výsledek v historii klubu, který se vyrovnal sezóně Alberto Zaccheroniho 1996/97, a opět získal místo v kvalifikačním kole pro Ligu mistrů UEFA 2012/13. Ve své třetí sezóně v Udinese Guidolin opět nedosáhl řádné Ligy mistrů, protože prohrál v penále s Bragou, ale tentokrát také skončil na konci své skupiny v UEFA Europa League 2012/13. V tabulce Serie A klub skončil pátý a potřetí se dostal do kvalifikačního kola Ligy Evropy.