Do května pokračovala v osvobození Filipín, v přistání v zátoce Mangarin.
, Mindoro, Panay a Mindanao. Eaton vyplul z Subic Bay 7. června 1945 a pokryl přistání v Brunejském zálivu na Borneu 10. června, podporoval operace odstraňování min a poskytoval palebnou podporu invazním Australanům a týmům pro podvodní demolici. Následně přišla neocenitelná pomoc při útoku na velký ropný sklad Balikpapan 1. a 2. července. Vrátila se do San Pedro Bay 5. července a do své základny pro operace až do konce nepřátelství.