- Během španělské občanské války v plné obraně Madridu
, kostel je zavřený a nemocnice pokračuje v fungování. Oblast je zdevastována intenzivním dělostřeleckým bombardováním a kostel je zcela v troskách. Po válce byla budova zrekonstruována. Zákonem ze dne 7. března 1940 je Královské patronát začleněno do národního dědictví spolu se zbytkem bývalých královských patronátů. Konečný úpadek nemocnice je označen usnesením správní rady národního dědictví ze dne 9. června 1942, kterým odstranil nemocniční služby el Buen Suceso, které se stávají pokryty generálním ředitelstvím zdravotnictví letectva, které používá stejnou budovu prostřednictvím nájmu. To ve skutečnosti znamenalo likvidaci historického patronátu, a to zbavením jeho podstatného účelu, i když právně prodloužil svou existenci až do dnešních dnů. Náboženský kult pokračuje dodnes, a to díky dohodě podepsané Národním dědictvím a diecézí Madrid-Alcalá, kterou je postoupena budova pro provoz nové farnosti blahoslaveného Corpus Christi v Iglesia del Buen Suceso.