Nicméně, nekontrolovatelná korupce v řadách vlády a byrokracie, ekonomická nerovnost mezi oběma křídly země způsobená hlavně nedostatkem reprezentativní vlády a lhostejností vlády k úsilí zuřivých etno-nacionalistických politiků, jako je Mujeeb-ur-Rehman z východního Pákistánu, vyústila v občanskou válku v Pákistánu
a následné oddělení Východního Pákistánu jako nového státu Bangladéšské lidové republiky.