V březnu 1941 byl Stott poslán s 2. eskalonem do Egypta, aby se připojil k 1. eskalonu 2. divize, která byla v zemi od února 1940, a poté do Řecka, aby se zúčastnil obrany Řecka.
- Ne, ne. Novozélanďané spolu s dalšími spojeneckými silami byli po německé intervenci v Řecku nuceni ustoupit na ostrov Kréta. Během následné bitvy u Kréty byl zraněn a zajat.