Po tom, co Frémontovy síly zastavily svůj postup do údolí po McDowellovi, se Jackson obrátil na poražení Banksů. Dne 21. května Jackson pochodoval svým velením na východ od New Market a pokračoval na sever. Jejich rychlost nuceného pochodu byla typická pro kampaň a jeho pěchota získala přezdívku "Jacksonova pěchá kavalérie". Poslal svou jízdu přímo na sever, aby Banks myslel, že bude útočit na Strasburg, ale jeho plánem bylo porazit malou základnu u Front Royal a rychle zaútočit na Banksovu komunikační linii u Harpers Ferry. Dne 23. května v bitvě u Front Royal Jacksonova armáda překvapila a překonávala pikety 1000 mužů unijní posádky, zajala téměř 700 z posádky a utrpěla méně než čtyřicet obětí. Jacksonovo vítězství přinutilo Banksy ze Strasburgu k rychlému ústupu směrem k Winchesteru. Ačkoli se Jackson pokoušel pronásledovat, jeho vojáci byli vyčerpaní a drancovali zásobovací vlaky Unie, což je nesmírně zpomalilo. 25. května, v první bitvě u Winchesteru
Banksova armáda byla napadena konvergujícími se konfederačními sloupy a byla hluboce poražena, přičemž ztratila více než 1 300 obětí a velkou část zásob (včetně 9 000 ručních zbraní, půl milionu nábojů a několika tun zásob); stáhli se na sever přes řeku Potomac. Jackson se pokoušel pronásledovat, ale nebyl úspěšný, protože Ashbyho kavalérie a jeho pěchota byli vyčerpaní; po několika dnech odpočinku následoval Banksovy síly až do Harpers Ferry, kde se potýkal s posádkou Unie.