Musel se vrátit do Norfolku ve Virginii, aby opravil a byl tam ještě, když amfibiové přistaly ve Veracruzi.
se uskutečnila. Jeho návrat do USA dal jeho nadřízeným šanci, aby mu konečně dali rozkazy, aby následoval komodora Connera ve velení domácí eskadry. Perry se vrátil k flotile a jeho loď podpořila obléhání Veracruzu z moře. Po pádu Veracruzu se Winfield Scott přestěhoval do vnitrozemí a Perry se přestěhoval proti zbývajícím mexickým přístavním městem. Perry shromáždil Mosquito Flotilu a zajal Tuxpan v dubnu 1847. V červenci 1847 osobně zaútočil na Tabasco, vedl 1.173-člennou vyloděnou sílu na břehu a napadl město San Juan Bautista ze země, porazil mexické síly a získal město.