Od března 1918 do října 1918 sloužil Smidovich jako předseda Moskevského sovětu. Od roku 1919 byl předsedou moskevské provinční ekonomické rady. V roce 1920 se zúčastnil sovětské delegace na mírových jednáních s Polskem. V roce 1921 se zúčastnil likvidace Tambovské
a Kronštadtské povstání. Dne 30. prosince 1922 otevřel I. Všeunijní kongres sovětů, byl zvolen do jeho předsednictva. Od roku 1922 byl členem protidinářské komise pod Ústředním výborem Všeunijní komunistické strany (bolševiků) a vedoucím sekretariátu pro náboženské záležitosti, od roku 1929 předsedou Stálé komise pro kulty pod předsednictvím Všeruského ústředního výkonného výboru.