V roce 1962 druhá sada ústavy zcela zrušila funkci předsedy vlády, protože všechny pravomoci byly převedeny na prezidenta Pákistánu. Kritika prezidenta po prezidentských volbách v roce 1965 kvůli centralizaci pravomocí. Po všeobecných volbách, které se konaly v roce 1970, byl úřad zřízen s Nurul Aminem, který se stal premiérem, který byl také viceprezidentem. Rozpadlé jednání mezi Zulfikarem Ali Bhuttem, Mujiburem Rehmanem a Yahyou Khanem, které vyvolalo osvobozenecké hnutí
ve východním Pákistánu. Zásah Indie do Východního Pákistánu a pákistánská porážka vedla k pádu prezidentského systému v roce 1971.