Během druhé světové války byl Solun těžce bombardován fašistickou Itálií (s 232 mrtvými, 871 zraněnými a více než 800 budov poškozenými nebo zničenými jen v listopadu 1940), a když Italové selhali v invazi do Řecka,
, 8. dubna 1941 padla do rukou nacistického Německa a byla okupována Německem. Nacisté brzy přinutili židovské obyvatele do ghetta poblíž železnice a 15. března 1943 zahájili deportaci židů města do koncentračních táborů v Osvětimi a Bergenu-Belsenu. Většina byla okamžitě poslána do plynových komor. Z 45 000 Židů deportovaných do Osvětimi přežilo jen 4%.