Napíše pokračování pro tento odstavec - Na krátkou dobu opustil zvyky a vstoupil do koncilního semináře v Buenos Aires v roce 1860. Během paraguayské války sloužil jako vojenský kaplan a za své hrdinské chování byl povýšen na podplukovníka. Canavery byl přítomen v bitvách u Yatay, Bitva u Tuyutí
, bitva u Curupayty a bitva u Lomas Valentinas, se odehrála 27. prosince 1868. Po skončení války byl přidán k jednotkám, které okupovaly město Asunción. Byl prvním kaplanem, který sloužil ve Villa Occidental, byl nahrazen na pozici José Pablo Lynch y Cabrera.