Konflikty začaly menší rytířskou revoltou (1522), následovanou větší německou rolnickou válkou (1524<unk>1525) v Svaté římské říši. Válka se zintenzivnila poté, co katolická církev v roce 1545 zahájila protireformaci proti růstu protestantismu. Tyto konflikty vyvrcholily třicetiletou válkou, která zdevastovala Německo a zabila třetinu jeho obyvatelstva, což je dvojnásobek úmrtnosti než v první světové válce. Vestfálský mír obecně vyřešil konflikty uznáním tří samostatných křesťanských tradic ve Svaté římské říši: římský katolicismus, luteranství a kalvinismus. Ačkoli mnoho evropských vůdců bylo od roku 1648 krveprolitím znechuceno, pokračovaly menší náboženské války až do roku 1710, včetně válek tří království (1639 <unk> 1651) na Britských ostrovech, války Savoyard <unk> Waldensian (1655 <unk> 1690) a válka Toggenburg
(1712) v západních Alpách.