Reuter je nejvíce známý svým postojem během studené války v Berlíně. Během sovětské blokády Berlína
(1948/49) byla západní část města udržována Berlínským vzdušným mostem, který byl založen americkým vojenským guvernérem Luciusem D. Clayem. V reakci na hrozbu, se občané v západních sektorech museli spojit. Ernst Reuter se stal jejich mluvčím a vůdcem, symbolickou postavou "svobodného" Berlína. Památný je Reuterův projev před vyhořelou budovou říšského parlamentu 9. září 1948, před davem 300 000 lidí, kde apeloval na svět, aby neopustil Berlín. Ve volbách, které se konaly v západní části Berlína o dva měsíce později, jeho popularita dala SPD nejvyšší vítězství s 64,5% dosud dosaženou jakoukoli stranou ve svobodných volbách v Německu. Jako starosta vytvořil velkou koaliční vládu se dvěma největšími stranami, aby prokázal jednotu západního Berlína. Reuterova výzva k Západu nebyla neposlouchána. Letecká přeprava zachránila město před hladem a Reuter se stal pouze druhým německým poválečným politikem (po Konradovi Adenaueru), který byl umístěn na obálce časopisu "Time". Měl název "Herr Berlin".