V červnu 1997 se Lissouba obával státního převratu a poslal Cocoyes, aby zatkli vůdce Cobra Denis Sassou Nguesso a odzbrojili milici, která začala druhou občanskou válku.
- Ne, ne. Jejich bývalí nepřátelé, ninjové, se s nimi spojili proti kobře. Během druhé občanské války hráli Cocoye velkou roli, dobyli přehradu Moukoukoulou a odřízli elektřinu z většiny jižní části.