Aby se zabránilo obyčejným muslimům, ať už jsou to Turci, Kurdové nebo Arabové, zachraňovat životy Arménů, byl vydán dekret, který prohlašoval trest za poskytnutí útočiště Arménům byl smrt oběšením a zničením vlastního domova; navzdory tomuto dekretu, řada obyčejných Turků, Kurdů a Arabů poskytla útočiště Arménům před zuřivostí Speciální organizace. Jiní obyčejní Turci, Kurdové a Arabové pomáhali armádě, žandarmům a Speciální organizaci při deportacích a vraždách, motivovaných touhou vyrabovat arménský majetek, mít arménské ženy a dívky jako sexuální otroky nebo kvůli podněcování muslimskými duchovními, kteří říkali, že genocida byla aktem "džihádu". Když žandarmové zatýkali Arménce k deportaci, bylo běžné, že se zřídily trhy s otroky, kde za správnou cenu mohl muslimský muž koupit arménské ženy a / nebo dívky, aby je použil jako své sexuální otroky. Kromě genocidy proti Arménům, režim CUP vedl genocidu Asyřanů proti Asyřanské menšině a genocidu Pontských Řeků
proti Pontským Řekům v Pontusu. V Thracii a západní Anatolii speciální organizace s pomocí vládních a vojenských úředníků deportovala všechny řecké muže vojenského věku do pracovních brigád, které začaly v létě 1914 a trvaly až do roku 1916.