V roce 1631 bojoval Poyntz za Jana Jiřího ze Saska v bitvě u Breitenfeldu. Změnil strany a bojoval jako kapitán ve Wallensteinově armádě ve službách císaře Ferdinanda II. v bitvě u Lützenu v roce 1632. Zůstal v císařské armádě a následující rok bojoval na Slezsku a byl přítomen v bitvě u Nordlingenu.
V roce 1634. Po Pražském míru v roce 1636 opustil armádu a Německo. Jeho čas v Německu byl lukrativní a koupil si statek pravděpodobně v okolí Schorndorfu. V tom roce se vrátil do Anglie a napsal svůj "Relation", ale když se mu nepodařilo získat zaměstnání jako voják v Anglii, je pravděpodobné, že se vrátil na kontinent, aby našel další zaměstnání ve třicetileté válce. Možná dosáhl hodnosti seržanta a mohl být povýšen na rytíře na bojišti.