V roce 2013 se AFP podařilo zastavit útoky Národní osvobozenecké fronty Moro v krizi ve městě Zamboanga, když zahájily útok na vyhlášení nezávislosti Bangsamoro Republik. V únoru a listopadu 2016 se AFP střetla s skupinou Maute na Butigu. V roce 2017 se AFP také střetla s militanty ISIS v Marawi.
, volá prezidenta Duterte vyhlásit stanné právo podle proklamace č. 216.