Napište pokračování tohoto odstavce - Molloyho další lodí byla 64-kanónová, kterou si objednal v roce 1781. Byl s sirem Georgem Brydgesem Rodneym během holandské kampaně v západní Indii na počátku roku 1781 a byl přítomen při dobývání ostrova Sint Eustatius 3. února a v bitvě u Fort Royal.
29. a 30. dubna. Vrátil se do Severní Ameriky s flotilou sira Samuela Hooda a byl přítomen v bitvě u Chesapeake 5. září 1781. Molloy byl pochválen za své úsilí během bitvy, byl popsán jako 'připravovaný nejvíce galantně', a za to, že pomohl. Molloy se vrátil do Západní Indie s Hoodem a dorazil tam 5. prosince 1781. Zúčastnil se bitvy u Saint Kitts 25. a 26. ledna 1782. Poté, co sloužil v mnoha námořních akcích americké války za nezávislost, Molloy odplul na Jamajku v květnu téhož roku a poté se vrátil do Británie s konvojem, kde v srpnu zaplatil "Intrepid".