Piso byl odpuštěn v obecné amnestii a zdálo se, že se vyrovnal s Caesarovým vítězstvím. Ale když vražda diktátora v roce 44 vyvolala válku Druhého triumvirátu
se spojil s vrahy Caesara, "Liberatores", připojil se k armádám Gaius Cassius Longinus (Cassius) a Marcus Junius Brutus mladší (Brutus). Byli poraženi v těžce bojované bitvě u Filipov v roce 42, která zahrnovala 200 000 vojáků. Piso velel jednotkám během tažení, ale jeho přesná role není známa. Byl opět odpuštěn a vrátil se do Říma, kde se odmítl podílet na politické aréně, která byla pod kontrolou Caesarova dědice, Caesar Octavianus (budoucí Augustus).