"Peiffer" byla oddělená od 7. amfibijního oddílu 20. února a přihlášena k službě u Filipínské mořské hranice, kde zůstala po dobu posledních měsíců druhé světové války. Během této doby přerušila meziostrovní doprovod konvojů a protiponorkové hlídky pouze jednou, na konci července, aby doprovodila na Guam. Po návratu na Leyte 10. srpna zůstala na Dálném východě po japonské kapitulaci.
a během několika následujících měsíců hlídkoval v filipínských vodách, doprovázel konvoje na Okinawu, a před plavbou do Spojených států, přepravoval personál do Šanghaje. Dne 24. listopadu opustil čínské pobřeží a po krátkém návratu na Filipíny se plavil na východ.