Jak se zvěst o nájezdu šířila, stovky demonstrantů se shromáždily před Stonewall. Poté, co se policie pokusila dostat ženu do policejního auta, dav se postavil proti policistům, kteří se vrátili do klubu, aby se vyhnuli stále více vzdorujícímu davu. Poté, co se někteří z davu pokusili klub zapálit, vytáhli parkovací měřič z chodníku a pokusili se jej použít k rozbití dveří a házeli předměty, jako jsou láhve, popelnice a mince na důstojníky, byla povolána další posily, které trvaly více než hodinu, aby obnovily pořádek a rozptýlily dav, který se shromáždil kolem Stonewall Inn. Tu noc byli zraněni čtyři policisté a bylo provedeno 13 zatčení, kromě několika krabic alkoholu, které byly zabaveny, protože hostinec neměl licenci na alkohol. Nepokoje pokračovaly několik nocí a dav se zvětšoval na tisíce. Ve své knize z roku 2004 "Stonewall: The Riots That Sparked the Gay Revolution", David Carter popsal Stonewallské nepokoje jako "pro gay hnutí to, co pád Bastily
je uvolnění francouzské revoluce".