Napětí také existovalo mezi římskokatolickou církví a post-revoluční
Mexická vláda. Do ústavy země z roku 1917 byla zapsána přísná omezení práv církve a členů duchovenstva, což vedlo k vypuknutí krištérské války v roce 1926. V roce 1992 obnovila vláda diplomatické vztahy se Svatým stolcem a zrušila téměř všechna omezení pro katolickou církev. Tento pozdější krok zahrnoval udělení legálního postavení všem náboženským skupinám, přiznání jim omezeného vlastnického práva a zrušení omezení počtu kněží v zemi. Zákon však nadále nařizuje přísné oddělení církve a státu. Ústava stále zakazuje členům duchovenstva zastávat veřejné funkce, obhajovat stranické politické názory, podporovat politické kandidáty nebo být proti zákonům nebo institucím státu.