V srpnu se Pawnee připojil k Atlantické blokádní eskadře v Hampton Roads a 26. odplul k pobřeží Severní Karolíny. Tam se zúčastnila útoků na pevnosti Hatteras a Clark.
(28<unk>29th), které kapitulovaly a byly obsazeny americkými vojáky. "Pawnee" zůstala v Hatteras Inlet až do 3. října, kde získala čtyři ceny a získala zpět dvě lodě, které již dříve zajali Konfederaci.