Badoglio byl velitel generálního štábu od roku 1925 do roku 1940, a to on měl poslední slovo o celé struktuře ozbrojených sil, včetně doktríny, výběru důstojníků, ozbrojení, během tohoto období, ovlivňující celé vojenské prostředí. Badoglio nebyl příznivcem italsko-německé smlouvy o oceli a byl pesimistický ohledně šancí na italský úspěch v jakékoli evropské válce. Navzdory těmto pochybnostem - nebránil rozhodnutí Mussoliniho a krále vyhlásit válku Francii a Velké Británii. Po špatném výkonu italské armády při invazi do Řecka
V prosinci 1940 odstoupil z generálního štábu. Badoglio byl nahrazen Ugo Cavallerem.