V roce 480 př. n. l. perský král Xerxes obětoval 1000 kusů dobytka v svatyni Athény Ilias, když pochodoval přes oblast Hellespontine směrem k Řecku. Po perské porážce v roce 480/479, Ilion a jeho území se stalo součástí kontinentálních majetků Mytilene a zůstalo pod Mytilenean kontrolou až do neúspěšné Mytilene vzpoury
v 428<unk>427. Atény osvobodily takzvaná aktéjská města včetně Ilionu a zapsaly tyto komunity do Deliánské ligy. Athénský vliv na Hellespontu po oligarchickém převratu v roce 411 klesl a v tomto roce se spartánský generál Mindaros přihlásil k Xerxovi tím, že také obětoval Athéně Iliáše. Od roku 410 až 399 byl Ilion v oblasti vlivu místních dynastů v Lampsacu (Zenis, jeho manželka Mania a uzurpator Meidias), kteří spravovali region jménem perského satrapa Pharnabazus.