Přestože San Francisco zůstal prvotřídním týmem a častým soutěžícím během zbytku 60. let, nevyhrál další vlajku v desetiletí; ve skutečnosti tým vyhrál jeden divizi mistrovství od roku 1969 do roku 1986 (1971
), a znovu se objevil ve Světové sérii až v roce 1989. Giants skončili na druhém místě po čtyři po sobě jdoucí sezóny (1965-68). V roce 1969 tým vykazoval známky stárnutí a úpadku. Současně byl Feeney zvažován pro významné pozice v hierarchii Major League Baseball. Poté, co jeho kandidatura na komisaře baseballu selhala, Feeney následoval Warrena Gilese jako prezident Národní ligy 5. prosince 1969.