V lednu 1966 byl princ Sadruddin jmenován vysokým komisařem OSN pro uprchlíky poté, co sloužil tři roky jako zástupce vysokého komisaře. Ve věku 33 let se stal nejmladším člověkem, který kdy vedl UNHCR. Dalších dvanáct let vedl agenturu OSN pro uprchlíky v jednom z nejtěžších období, koordinoval mezinárodní reakci na krizi v Bangladéši v roce 1971.
že vykořenil lidi, exodus stovek tisíc Hutuů z Burundi do Tanzanie v roce 1972 a vietnamská tragédie lodních lidí v polovině 70. let. V roce 1972 hrál princ Sadruddin klíčovou roli při hledání nových domovů pro desítky tisíc jihovýchodních Asiatů vyhoštěných z Ugandy Idi Aminem.