Od roku 1958 se sudánské vojenské vlády zasahují do soudního procesu. Po převzetí moci armádou v roce 1989
Například Národní revoluční velitelská rada (RCC) vydala dekret, který dal prezidentovi pravomoc jmenovat a odvolávat všechny soudce. Al-Bashir odvolal mnoho z nich, zřejmě proto, že nebyli dostatečně odhodláni uplatňovat šaría ve svých rozhodnutích, a nahradil je stoupenci NIF. Soudnictví se fakticky stalo odpovědným prezidentovi nebo bezpečnostním silám.