30. září 1862 se Kiesewetter během občanské války zapsal jako voják do roty B, 46th Ohio Infantry. V bitvě u Resacy
14. května 1864 utrpěl vážné zranění levé kyčle. Sedm měsíců ležel na lůžku, protože se z rány stala gangréna. S ošetřením chirurga se uzdravil a byl propuštěn z Camp Chase, Columbus, 31. března 1865. Zůstal v táboře jako úředník až do 25. srpna, kdy byl najat jako účetní v firmě Columbus. Zůstal tam až do roku 1878.