V roce 2005 se Groot umístil na 4. místě v běhu 4×100 m volným stylem a na 9. místě v 50 m motýlem na mistrovství světa ve vodních disciplínách v Montrealu v Kanadě. Na konci roku vyhrála třetí zlatou medaili v řadě na 4 × 50 m volným stylem na mistrovství Evropy v plavání na krátkých tratích 2005. Rok 2006 začal Světovým šampionátem FINA na krátké dráze v Šanghaji. Společně s Inge Dekker, Hinkelien Schreuder a Marleen Veldhuis, Groot stanovil světový rekord a vyhrál zlatou medaili v 4 × 100 m volný styl střídačky v čase 3:33,32. V létě se zúčastnila mistrovství Evropy v vodních disciplínách v roce 2006.
v Budapešti, Maďarsko, kde přidala stříbrnou medaili ve volném stylu 4 × 100 m s Dekkerem, Veldhuisem a Ranomi Kromowidjojo, a bronzovou medaili, čtvrtýkrát v kariéře, v 50 m motýlem k její působivé sbírce medailí. V Helsinkách získala stříbrnou medaili ve volném stylu 4 × 50 m na mistrovství Evropy v plavání na krátké dráze v roce 2006. Její dalším velkým turnajem byly mistrovství světa v vodních disciplínách 2007 v Melbourne v Austrálii, kde byla vyřazena z týmu volného stylu 4 × 100 m spoluhráčkou Femke Heemskerk, zatímco byla pravidelným členem týmu ve finále po mnoho let. Individuálně skončila na 13. a 20. místě na 50 m a 100 m motýlem, což byl pro Groota zklamáním. Páté místo na mistrovství Evropy v plavání na krátkých tratích 2007 bylo jejím nejlepším výsledkem zklamání roku.