1. března 1862 se Timrod zapsal do armády jako voják v rotě B, 20. pluku Jižní Karolíny, a byl přidělen na zvláštní službu jako úředník v ústředí pluku, ale jeho tuberkulóza mu bránila ve službě a byl poslán domů. Po krvavé bitvě u Šilohu
, znovu se pokusil žít v táboře jako válečný dopisovatel pro Charleston "Mercury", ale i to bylo krátkodobé, protože nebyl dost silný pro drsný úkol.