V lednu 1942 se Houghton stal zástupcem velitele 40 Commando a zúčastnil se neúspěšného spojeneckého náletu na Dieppe
19. srpna 1942. Stejně jako většina jeho jednotky, byl zajat Němci v fiasku. Jako válečný zajatec byl Houghton spoutan 411 dní a zůstal v zajetí po zbytek války. Následně mu byl udělen vojenský kříž za jeho statečnost v Dieppe a za jeho vytrvalost jako válečný zajatec.