Poslední fáze války ve Vietnamu proběhla za Schlesingerova funkčního období. Ačkoli všechny americké bojové síly opustily Jižní Vietnam na jaře roku 1973, Spojené státy nadále udržovaly vojenskou přítomnost v jiných oblastech jihovýchodní Asie. Někteří senátoři kritizovali Schlesingera a ostře ho zpochybňovali během jeho slyšení v červnu 1973 poté, co prohlásil, že doporučí obnovení amerických bombardování Severního Vietnamu a Laosu, pokud Severní Vietnam zahájí velkou ofenzivu proti Jižnímu Vietnamu. Nicméně, když Severní Vietnamci začali svou jarní ofenzívu v roce 1975, Spojené státy nemohly udělat mnoho, aby pomohly Jižním Vietnamcům, kteří se zcela zhroutili, když se Severní Vietnamci
Zajali Saigon koncem dubna. Schlesinger oznámil brzy ráno 29. dubna 1975 evakuaci z Saigonu vrtulníkem posledního amerického diplomatického, vojenského a civilního personálu.