Někteří zdroje připisují Čang Kai-šekovi odpovědnost za miliony mrtvých v rozptýlených masových smrtelných událostech způsobených čínskou nacionalistickou vládou. Je považován za částečně zodpovědného za povodně Žluté řeky v roce 1938.
, která zabila stovky tisíc čínských civilistů, aby odvrátila japonský postup. Toto obvinění obvykle pochází od Rudolpha Rummella, který se odvolával na nacionalistický režim jako celek, spíše než na Čang Kai-šeka zvlášť. Bez ohledu na to, nacionalistická vláda Číny byla Rummelem obviněna z masových vražd; tvrdil, že na základě různých tvrzení byla nacionalistická vláda Číny zodpovědná za 6 až 18,5 milionu úmrtí.