查爾斯在德國被加冕為國王後, 站在教皇列昂十世的立場, 在1521年的沃姆斯議會上宣佈馬丁路德為非法犯人. 羅姆巴第地區的衝突持續到帕維亞戰役 (1525年), 導致法國國王暫時被監禁. 羅馬被查理叛軍軍掠奪, 他們大部分是路德教徒. 查理五世在他的軍隊離開教宗國家後,
接下來他被教宗克利門七世加冕為義大利國王. 接下來他又在1535年吞并米蘭公國, 儘管如此, 在1540年代初的匈牙利和阿爾及爾遠征戰爭中失去布達, 查理五世與教宗保羅三世就組織特倫特公會 (1545年) 達成了協議. 路德教的斯馬爾卡爾德聯盟拒絕承認會議的有效性, 儘管法國的亨利二世對路德教的活動提供了新的支持,