蘇萊曼一世在地中海地區的擴張政策卻在1565年在馬耳他停止了. 奧斯曼軍約有5萬人與聖約翰騎士及馬耳他6000人的駐<unk>隊作戰. 儘管馬耳他人強硬地抵抗, 這次的圍攻失敗 (土耳其人成功佔領了馬耳他主要島<unk>的戈佐島和聖埃爾莫堡, 但在其他地方失敗並撤退) 是蘇萊曼大帝在第一個奧斯曼圍攻維也納之後遭受的第二次和最後一次失败.
在1529年. 蘇萊曼一世於1566年在西格特瓦爾圍攻期間, 1571 年的勒潘托戰役 (由奧斯曼人於 1570 年攻佔威尼斯人控制的塞浦路斯引發) 是奧斯曼人在地中海海軍的另一個重大挫折,