在墨西哥1821年獨立後, 一大批西班牙軍隊持續佔領聖胡安德烏魯亞直到1825年. 這裡是前新西班牙殖民地的最後一座被西班牙人佔領的地點, 墨西哥的政府將他們趕出墨西哥, 這座城市是墨西哥對外國入侵和佔領的軍事和政治象徵, 在1836年, 法國在Veracruz戰役中轟炸了這個堡垒, 這場衝突是由墨西哥的法國公民為他被指控的受損的糕點店尋求賠償的結果; 在墨西哥-美國戰爭中, 美國圍攻了
德克薩斯共和國的爭議造成的衝突, 在1863年法國短暫佔領了這個城市, 這座堡垒在十九世紀的大部分時間裡都被用作監獄, 許多墨西哥知名政客在沒有掌權時都在此度過.