在第二次世界大戰的荷蘭東印度群島戰役中, 日本帝國於1942年初入侵馬魯庫島, 哈爾馬赫拉成為日本在卡奧灣的海軍基地. 兩年後, 美國與他們的盟友發動摩洛泰戰役,
在1944年8月轟炸島<unk>並於9月入侵. 日本帝國軍在摩洛泰島一直堅持到1945年, 在1944年下半年, 他們迅速建立了包括港口,兩條滑翔機場以及豐富的燃料庫的設施. 日本第二軍於1945年9月9日在摩洛泰戰場正式投降. 印尼空軍在摩洛泰島發現了最後一位戰爭中留守的日本人,