在1942年開始, 克魯格就能公開自己的德國共產黨成員身份, 在1944年和1945年期間, 他在瑞士勞工營中積極支持自由德國運動, 並擔任該運動的瑞士秘書, 直到它在1945年底解散. 這場戰爭已經結束.
德國的三分之二的西部被分割成四個軍事佔領區. 在1946年1月, 赫伯特克魯格返回德國, 在1946年至1948年間, 他擔任一名高級官員 ("Regierungsrat"), 負責涵蓋年輕人的福利在勞動部和福利在新啟動的赫塞州的地區. 在1946年12月舉行的地區選舉中, 共產黨表現不佳, 在1948年1月31日, 克魯格辭去政府職位.