她的名字源自母親的阿<unk>聖羅馬帝王伊莉奧諾拉 (Eleonora), 伊利奧諾拉的父母的婚姻是為了在主族滅絕後, 強化哥薩加王室內弗斯分支對曼圖瓦和蒙費拉特公爵的權利. 尼弗斯公爵是法國王國的附屬, 他不得不面對瓜斯塔拉公爵費蘭特二世的反對,
在此期間,嬰兒伊莉奧諾拉與她的父母和哥哥查爾斯離開曼圖瓦,但在簽署了切拉斯科和約 (1631年6月19日) 簽署後一年後返回,在該和約下承認了尼弗斯公爵查爾斯對曼圖瓦公國的權利 (作為已滅絕的主線的最親近的男性親戚) 和蒙特費拉特 (因為他的繼承人與瑪麗亞·冈薩加結婚,是主要的<unk>薩加線的最後存活的子孫和那個公國的繼承人,因為Gonzagas在1540年通過與Margherita Paleologa的婚姻獲得了它,因此女性可以證明可以繼承);然而一個月後 (1631年8月30日),伊莉奧諾拉的父親死於結核,並開始了公爵查爾斯和她的女<unk>之間的一系列政治衝突,結束了瑪麗亞·薩沃伊的母親瑪麗亞從曼圖瓦被驅逐.