在1526年在摩哈茨戰役中殺害了弗拉迪斯拉斯的唯一兒子路易斯, 終結了雅吉隆王朝在波希米亞的統治, 波希米亞貴族的會議選出了他的姐夫, 奧地利的哈布斯堡大公費爾登登一世, 奧地利大公國與匈牙利王國一起組成哈布斯堡君主制, 在接下來的幾百年裡, 波希米亞的新教改革領地建立自治聯邦的試圖在1620年的白山戰役中被挫毀
接下來管理部位集中於維也納. 在1635年的布拉格和平協議中, 盧薩提亞被薩克森選民領取, 在1742年的布雷斯拉夫和平協議中, 普魯士王國在第一場斯里蘭斯戰爭後, 也將克拉德斯科的大部分西里西亞領取.