I te tau 1989, i uru a Janša ki te whakatū i tētahi o ngā rōpū whakahē tuatahi i Slovenia, te Slovenian Democratic Union (SDZ) ā, ka noho hei tumuaki tuarua tuatahi, ā, i muri mai hei tumuaki o te Kaunihera Pāti. Whai muri i nga pooti koreutu tuatahi i te marama o Mei 1990, ka noho ia hei Minita mo te Tiaki i roto i te tari a Lojze Peterle, he tuunga i mau i a ia i te pakanga a Slovenia mo te rangatiratanga
i Hune me Hōngongoi 1991. I te taha o te Minita mo nga Take o roto a Igor Bavčar, ko Janša te kaiwhakahaere matua o te rautaki a Slovenia ki te ope a te iwi Yugoslav.