Skopri aktar dwar dan il-paragrafu - Fis-16 ta 'Settembru 2008, Puyol għamel il-ħames mitt logħba tiegħu għal Barċellona f'logħba tal-fażi tal-gruppi tal-Champions League kontra Sporting CP. Fl-istaġun tal-kampjonat, minkejja problemi ta 'korrimenti, deher f'28 logħba u għenhom jirbħu titlu ieħor tal-kampjonat. L-uniku gowl tiegħu kien kontra Real Madrid fil-"El Clásico" fis-Santiago Bernabéu fit-2 ta 'Mejju 2009 li ntemm b'rebħa qawwija ta' 6 × 2, u huwa ċċelebra l-gowl tiegħu billi kiseb il-bandla Katalana tiegħu quddiem il-partitarji tal-Madrid inkwinti. Huwa kien essenzjali għat-tim li rebaħ ukoll il-Copa del Rey tal-2009, il-Champions League tal-2009, il-Super Cup tal-UEFA tal-2009
u l-FIFA Club World Cup tal-2009 biex ikompli s-sesstuple mingħajr preċedent, li deher f'kważi 100 logħba uffiċjali.