Ikkompleta din il-frażi: Il-mandat ta' Trajkovski kien ikkaratterizzat minn tensjonijiet bejn il-Maċedonjani etniċi u l-minoranza etnika Albaniża kbira tar-Repubblika. Il-konsegwenzi tal-Gwerra tal-Kosovo wasslu għal xhur ta'
il-kunflitti armati vjolenti bejn il-forzi tas-sigurtà tal-Maċedonja u r-ribelli Albani li qed ifittxu titjib fl-istatus tagħhom bħala minoranza leġittima u b'mod ġenerali kundizzjonijiet ekonomiċi, amministrattivi u legali aħjar. Għalkemm il-poteri tiegħu kienu limitati u r-rwol tiegħu kien fil-biċċa l-kbira ċerimonjali, huwa ppresedut ftehim ta' paċi f'2001 li kien imdawwar min-NATO li temm il-vjolenza u evita gwerra ċivili f'saħħitha fir-Repubblika tal-Maċedonja. Huwa kien meqjus bħala moderat fid-djalogu etniku, u argumenta għal inklużjoni akbar tal-Albaniżi etniċi, u ġie kkreditat bħala figura ewlenija fis-soluzzjoni tal-kunflitt. Il-ħabib u l-konsulent ta 'Boris Trajkovski kien il-kap tal-istaff tiegħu Zoran Jolevski, li kien l-Ambaxxatur tal-Maċedonja fl-Istati Uniti tal-Amerika u n-negozjatur tal-isem tal-istat fit-tilwima dwar l-isem tal-Maċedonja.