Ikteb kontinwazzjoni għal dan il-paragrafu - Wara li mar Ġakarta, Latuharhary beda wkoll jaħdem għall-Ġappuniżi taħt id-Dipartiment tal-Affarijiet Interni biex jimmaniġġja l-Moluċani f'Java, u kellu r-responsabbiltà għall-azzjonijiet tagħhom. Fl-1944, grupp ta' Ambonese inkluż Latuharhary ġew arrestati mill-Kenpeitai u waslu Bogor minħabba li kienu suspettati ta' spijunaġġ għall-forzi Allati, u minħabba l-fatt li Latuharhary kien parzjalment uża l-pożizzjoni tiegħu fl-amministrazzjoni Ġappuniża għal skopijiet politiċi. Madankollu, martu u tnejn oħra reġgħu rnexxielhom jikkonvinċu lill- kmandant tal- Marina Ġappuniża biex jagħmel arranġamenti biex jitħallew. Fl- aħħar taʼ l- 1944, reġaʼ ġie arrestat wara li priġunier mill- Moluka ħarab minn ħabs. L-awtoritajiet Ġappuniżi dak iż-żmien kienu partikolarment suspettużi dwar Ambonese wara l-Battalja ta'Morotai.
u l-bumbardjar strateġiku ta' Ambon fl-1944, imsaħħaħ aktar mill-operazzjonijiet ta' spijunaġġ ta' l-Alleati fil-Moluċi mmexxija minn Ambonese Julius Tahija.