Ikteb kontinwazzjoni għal dan il-paragrafu - Matul il-gwerra tal-1654-1667 mar-Russja u matul il-Gwerra l-Kbira tat-Tramuntana (1700-1721) Merkinė sofriet ħafna mill-armati Russi u Żvediżi u tilfet is-sinifikat strateġiku u ekonomiku tagħha. Merkinė inħaraq mill-ġdid mill-armata Russa matul l-Insurġenza tal-1794
li ppruvaw jeħilsu l-Komunita' Pollakka-Litwana mill-influwenza Russa. Fl-1794 il-port tax-xmara ta'l-inventarju tal-belt minn xmara Nemunas huwa msemmi, ukoll xmajjar Nemunas u Merkys ġew evalwati bħala adattati għan-navigazzjoni. F'dokumenti tas-seklu 19, Merkinė kien imsemmi bħala ċentru tal-kummerċ tax-xmara li fih kienu jinbnew vapuri tal-kummerċ tax-xmara.