Ikkompleta l-frażi li ġejja: "Wajxaklajun" tfisser "tmintax" fil-lingwa Chuj; dan ġie interpretat bħala li ġej mis-sit li oriġinarjament kien jikkonsisti minn tmintax-il munzell. Madankollu, din hija interpretazzjoni moderna, u huwa possibbli li l-isem oriġinarjament ġej minn isem tal-kalendarju Maya. Forma itwal tal-isem ġiet irreġistrata bħala Chonjab' Tepan Wajxaklajun; dan jittraduċi bħala "belt u tempju tmintax", minn "chonhap"' "belt", u "tepan" "knisja". Ismijiet alternattivi għas- sit jinkludu Yolk'u (li jfisser "fis- xemx") u El Calvario, xi kultant ikkuntrattat għal Carvao, jew Curvao. Fil-ħin tal-
Wara l-konkwista Spanjola tal-Gwatemala, Wajxaklajun ngħata l-isem Nahuatl "Ystapalan" (li jfisser "post tal-melħ"); dan aktar tard ġie modifikat għal "Ystatlan" ("abbundanza ta'melħ" fin-Nahuatl).