Kiernan insista li jingħaqad mal-klassijiet tal-ġlied, u f'dik il-kapaċità kien apparentement maħtur Majur fis-6 Missouri. F'Mejju taʼ l-1863 f'Port Gibson
, Missouri, kien midruba fil- pulmun tax- xellug u ħalla fuq il- post għall- mewt. Wara li ġie rkuprat u arrestat, hu ħarab lura lejn il-forzi tal-Unjoni u rriżenja mill-kariga tiegħu. Fl-1 ta 'Awwissu 1863 ġie kkummissjonat bħala Brigadier Ġenerali tal-Voluntiera mill-President Abraham Lincoln; li kmanda post f'Miliken's Bend fuq il-Mississippi. Madankollu, is-saħħa ħażina bħala riżultat tal-feriti tiegħu fil-battalja ġiegħlu jirriżenja fit-3 ta 'Frar 1864.