Ikteb kompitu għal dan il-paragrafu - Madankollu, fil-21 ta' Ottubru 1937, Petlyakov ġie arrestat flimkien ma' Tupolev u d-direttorat kollu tat-TsAGI fuq akkużi maħluqa ta' sabotàġġ, spijunaġġ u ta' għajnuna lill-Partit Faxxista Russu. Ħafna mill- kollegi tiegħu ġew eżegwiti. Fl-1939 ġie mċaqlaq minn ħabs għal "sharashka" tal-NKVD għal disinjaturi tal-ajruplani ħdejn Moska, fejn kienu diġà ntbagħtu ħafna nies li kienu kienu membri tas-SAGI biex jaħdmu. Petlyakov ingħata l-kompitu li jiddisinja ġellieda ta' altitudni għolja, li wettaq b'suċċess. Madankollu, l-esperjenza operattiva fil-Gwerra Sovjetika-Finlandiża
Il-ġlied tal-1939-1940 wera li dan ma kienx dak li kienet teħtieġ il-Forza tal-Ajru Sovjetika, u Lavrentiy Beria, kap tal-NKVD u tas-sistema "sharashka", ordna li l-ġellied jiġi ddisinjat mill-ġdid bħala bombardier tal-għawm, bil-wegħda li Petlyakov u l-kollegi tiegħu jiġu rilaxxati meta jitlesta b'suċċess.