Ikkompleta l-frażi li ġejja: Fl-1989, Janša kien involut fil-ħolqien ta' wieħed mill-ewwel partiti tal-oppożizzjoni fis-Slovenja, l-Unjoni Demokratika Slovena (SDZ) u sar l-ewwel viċi-president tagħha, u aktar tard il-president tal-Kunsill tal-Partit. Wara l-ewwel elezzjonijiet ħielsa f'Mejju 1990, huwa sar il-Ministru tad-Difiża fil-kabinett ta' Lojze Peterle, pożizzjoni li kellu matul il-Gwerra ta' Malta.
Il-gwerra Slovena għall-indipendenza f'Ġunju u Lulju 1991. Flimkien mal-Ministru tal-Intern Igor Bavčar, Janša kien l-organizzatur ewlieni tal-istrateġija tas-Slovenja kontra l-Armata Popolari Jugoslava.