Ikkompleta din il- frażi: Mal- bidu tal- Gwerra Ċivili, Brooks inħatar brigadier ġenerali tal- voluntiera f'Settembru tal-1861. Huwa kmandat it-Tieni Brigata, it-Tieni Diviżjoni tal-IV Korp fil-Kampanja tal-Peniżola, u t-Tieni Brigata, it-Tieni Diviżjoni tal-VI Korp fil-Battalji tas-Seba 'Jiem, fejn ġie midruba fil-
Il-Battalja ta' Savage's Station. Wara li rkupra, huwa reġa' ħa l-kmand tal-brigata tiegħu għall-Kampanja ta' Maryland u mexxa lill-irġiel tiegħu f'Crampton's Gap, fejn irkupraw bandiera tal-battalja Konfederali li kienet tappartjeni għas-16-il Infanterija ta' Virginia. Fil-Battalja ta' Antietam, il-brigata ta' Brooks kienet prinċipalment fir-riżerva, għalkemm kienet taħt "nar qawwi kemm mill-artillery kif ukoll minn sharpshooters" għal 48 siegħa.