Ikteb kontinwazzjoni għal dan il-paragrafu - Happer mar fuq furlough medika fl-1855 u t-Tieni Gwerra Anglo-Ċiniża
jittardja l- Happer lura mill- furlough sa 1859. Madankollu, wara l-gwerra, it-trattati prodotti mill-gwerra ppromwovew aċċess ħieles u mingħajr restrizzjonijiet għal Canton. Dan wassal għal żieda taʼ missjunarji fil- Kanton b'żieda fil- konverżjonijiet għall- Kristjanità. Fl-1860, Happer waqqaf l-Ewwel Knisja Presbiteriana, għadd ta' skejjel b'internat u ta' kuljum, u skola ta' taħriġ li kienet taqdi lill-predikaturi, l-għalliema, u l-kolporturi ta' Canton. Happer kien il- pastor tal- ewwel Knisja Presbiteriana f'Canton, li twaqqfet fl- 1862. Permezz tal-istabbiliment ta' forom multipli ta' servizzi edukattivi, Happer wettaq il-missjoni tiegħu li jġib l-edukazzjoni għolja Kristjana fiċ-Ċina, għalkemm ħafna mill-istudenti tal-iskola ta' taħriġ kienu jinkludu dawk li kienu jaħdmu għall-knisja. Sabiex jilħaq il-mexxejja Ċiniżi tal-gvern permezz tal-edukazzjoni tal-Punent, mill-1865 u l-1867, Happer iddiriexxa l-Kulleġġ tal-Interpreti tal-gvern Ċiniż f'Canton u għallem l-Ingliż u l-matematika lill-istudenti li daħlu fis-servizzi tal-gvern bħala speċjalisti barranin. Billi introduċa t- tagħlim Kristjan fil- korsijiet tiegħu, hu kompla l- missjoni tiegħu taʼ l- evanġelizzazzjoni u osserva t- tkabbir gradwali tal- Presbiteriani taʼ Canton. Dan hu appoġġat mill- istatistika rrapportata mill- Missjoni taʼ Kanton li fl- 1866: 147 individwu kienu rreġistrati fi skejjel tal- missjoni.