F'1856 Kekulé sar Privatdozent fl-Università ta' Heidelberg. Fl-1858 ġie impjegat bħala professur sħiħ fl-Università ta' Ghent, imbagħad fl-1867 ġie msejjaħ f'Bonn, fejn baqa' għall-bqija tal-karriera tiegħu. Ibbażat l-ideat tiegħu fuq dawk ta' predeċessuri bħal Williamson, Edward Frankland, William Odling, Auguste Laurent, Charles-Adolphe Wurtz u oħrajn, Kekulé kien il-formulatur ewlieni tat-teorija tal-istruttura kimika (1857<unk>58). Din it-teorija ġejja mill-idea tal-valenza atomika, speċjalment it-tetravalenza tal-karbonju (li Kekulé ħabbar fi tmiem l-1857) u l-abbiltà tal-atomi tal-karbonju li jgħaqqdu ma' xulxin (imħabbar f'artiklu ppubblikat fl-1858), għalkemm kien attiv bħala professur sħiħ fl-Università ta' Ghent, imbagħad fl-1867 ġie msejjaħ f'Bonn, fejn baqa' għall-bqija tal-karri
struttura kimika