Minn 1672 kien beda jirreġistra r-riċerka teoloġika tiegħu f'kotba li ma wera lil ħadd u li ġew eżaminati biss reċentement. Dawn juru għarfien estensiv taʼ kitbiet tal-knisja bikrija u juru li fil-kunflitt bejn Athanasius u Arius li ddefinixxa l-Kredo, huwa ħa l-parti taʼ Arius, it-telliefa, li ċaħad il-fehma konvenzjonali tat-Trinità. Newton "rikonoxxa lil Kristu bħala medjatur divin bejn Alla u l-bniedem, li kien subordinat lill-Missier li ħalaqtu".
kien eretiku