Ikteb kontinwazzjoni għal dan il-paragrafu - Napoleon Bonaparte, meta sar l-Ewwel Konsul fl-1801, ffirma Konkordat mal-Papa, li jaqbel li jirrestawra proprjetajiet tal-knisja preċedenti, inkluż il-Panthéon. Il- Panthéon kien taħt il- ġurisdizzjoni tal- kanuniċi tal- Katidral taʼ Notre Dame de Paris. Ċelebrazzjonijiet taʼ avvenimenti importanti, bħall- rebħa taʼ Napuljun fil- Battalja taʼ Austerlitz
, kienu miżmuma hemm. Madankollu, il- kripta tal- knisja żammet il- funzjoni uffiċjali tagħha bħala l- post taʼ mistrieħ taʼ Franċiżi illustri. Daħla ġdida direttament għall-kripta nħolqot permezz tal-porċa tal-lvant (1809<unk>1811). L- artist Antoine-Jean Gros ġie kkummissjonat biex jiddekora l- ġewwa tal- kopola. Dan kien jgħaqqad l- aspetti sekulari u reliġjużi tal- knisja; kien juri lil Genevieve li kienet qed tittieħed fis- sema minn anġli, fil- preżenza taʼ mexxejja kbar taʼ Franza, minn Clovis I u Karlu l- Kbir sa Napuljun u l- Impress Josephine.