Ikteb kompitu għal dan il-paragrafu - Wara dan Honner ħa rwol ta 'taħriġ, u serva bħala kmandant ta' battaljun ta 'taħriġ Awstraljan fil-Lvant Nofsani, li għalih ġie stazzjonat f'Ottubru 1941. Honner rritorna lejn l- Awstralja f'Mejju tal- 1942. Wara li reġa' ngħaqad ma' martu għal ftit żmien, ġie promoss għal tenent kolonel u ntbagħat lejn il-Papua fejn ingħata l-kmand tal-Bataljun 39, li kien involut f'kampanja disperata kontra l-forzi Ġappuniżi li kienu qed jiġġieldu tul il-Kokoda Track.
. ħsieb Bl-istruzzjonijiet biex iwaqqaf l-avvanz Ġappuniż f'Isurava, Honner wasal fis-16 ta 'Awwissu 1942. Malli laħaq il-pożizzjoni tal-battaljun, Honner sab li l-kmand ġdid tiegħu kien diġà mitluf mill-mard tropikali u mill-ġlied ta 'qabel u kien inqas minn ħafna.